/[MITgcm]/MITgcm_contrib/quarter_degree_global/README.txt
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revision 1.13 by dimitri, Mon Dec 13 05:40:39 2004 UTC revision 1.24 by dimitri, Thu Dec 16 00:02:30 2004 UTC
# Line 39  there is comparison output in Line 39  there is comparison output in
39    
40  ##########################################################################  ##########################################################################
41  # 1440x1088 204-cpu (120x12)x(64x17) 1/4-deg integration on altix with efc  # 1440x1088 204-cpu (120x12)x(64x17) 1/4-deg integration on altix with efc
42  # requires input files in sudirectory iter69 to be at same level as MITgcm  # requires input files in subdirectory iter69 to be at same level as MITgcm
43  # and MITgcm_contrib.  A copy of iter69 resides on columbia10:/nobackup10  # and MITgcm_contrib.  A copy of iter69 resides on columbia10:/nobackup10
44  # The integration length is 4018 days, 1992-2002.  # The integration length is 4018 days, 1992-2002.
45  # First three days need to be integrated using deltat=200.  # First three days need to be integrated using deltat=200.
# Line 49  mkdir bin exe Line 49  mkdir bin exe
49  cd bin  cd bin
50  \rm *  \rm *
51  \cp ../../MITgcm_contrib/quarter_degree_global/code/* .  \cp ../../MITgcm_contrib/quarter_degree_global/code/* .
52  ../tools/genmake2 -of ../tools/build_options/linux_ia64_efc+mpi_altix  ../tools/genmake2 -of ../tools/build_options/linux_ia64_ifort+mpi_altix_nas
53  make depend  make depend
54  make -j 4  make -j 4
55  cd ../exe  cd ../exe
# Line 97  qsub job_altix Line 97  qsub job_altix
97    
98  module purge  module purge
99  module load modules scsl.1.5.0.0 intel-comp.8.0.070 mpt.1.11-85  module load modules scsl.1.5.0.0 intel-comp.8.0.070 mpt.1.11-85
100    setenv MPI_DSM_DISTRIBUTE
101  cd MITgcm  cd MITgcm
102  mkdir bin exe  mkdir bin exe
103  cd bin  cd bin
# Line 131  cd ~/exe Line 132  cd ~/exe
132  \cp data_SIO_8 data  \cp data_SIO_8 data
133  \ln -sf /tmp/eighth/MITgcm/exe/pick* .  \ln -sf /tmp/eighth/MITgcm/exe/pick* .
134    
135  mpirun -v -a a2k -d /tmp/eighth/MITgcm/exe c18 480 runon 4-511 mitgcmuv960 : c20 480 runon 4-511 mitgcmuv960  mpirun -v -a a2k -d /tmp/eighth/MITgcm/exe c18 480 runon 4-511 mitgcmuv960 : \
136                                 c20 480 runon 4-511 mitgcmuv960 >&! output.txt &
137    
138    \cp data.test data
139    scp data:columbia17:/nobackup/menemenl/eighth/MITgcm/exe
140    scp data:columbia19:/nobackup/menemenl/eighth/MITgcm/exe
141    scp data:columbia20:/nobackup/menemenl/eighth/MITgcm/exe
142    mpirun -v -a a2k -d /nobackup/menemenl/eighth/MITgcm/exe \
143                     c18 480 runon 4-511 mitgcmuv1440 : \
144                     c19 480 runon 4-511 mitgcmuv1440 : \
145                     c20 480 runon 4-511 mitgcmuv1440   \
146                                >&! output.test1440
147    mkdir tests
148    mv STDOUT.0000 output.test1440 tests/stdout1440
149    \rm STD*
150    mpirun -v -a a2k -d /nobackup/menemenl/eighth/MITgcm/exe \
151                     c17 480 runon 4-511 mitgcmuv1920 : \
152                     c18 480 runon 4-511 mitgcmuv1920 : \
153                     c19 480 runon 4-511 mitgcmuv1920 : \
154                     c20 480 runon 4-511 mitgcmuv1920   \
155                                >&! output.test1920
156    mv STDOUT.0000 output.test1920 tests/stdout1920
157    \rm STD*
158    \cp data.run data
159    scp data:columbia17:/nobackup/menemenl/eighth/MITgcm/exe
160    scp data:columbia19:/nobackup/menemenl/eighth/MITgcm/exe
161    scp data:columbia20:/nobackup/menemenl/eighth/MITgcm/exe
162    mpirun -v -a a2k -d /nobackup/menemenl/eighth/MITgcm/exe \
163                     c17 480 runon 9-511 mitgcmuv1920 : \
164                     c18 480 runon 9-511 mitgcmuv1920 : \
165                     c19 480 runon 9-511 mitgcmuv1920 : \
166                     c20 480 runon 9-511 mitgcmuv1920   \
167                                >&! output.run
168    
169    
170    
171    
172    \cp data.test data
173    scp data columbia19:/nobackup/menemenl/eighth/MITgcm/exe
174    scp data columbia20:/nobackup/menemenl/eighth/MITgcm/exe
175    mpirun -v -a a2k -d /nobackup/menemenl/eighth/MITgcm/exe \
176                     c18 480 runon 9-511 mitgcmuv1440 : \
177                     c19 480 runon 9-511 mitgcmuv1440 : \
178                     c20 480 runon 9-511 mitgcmuv1440   \
179                                >&! output.test1440
180    mkdir tests
181    mv STDOUT.0000 output.test1440 tests/stdout1440
182    \rm STD*
183    \cp data.run data
184    scp data columbia17:/nobackup/menemenl/eighth/MITgcm/exe
185    scp data columbia19:/nobackup/menemenl/eighth/MITgcm/exe
186    mpirun -v -a a2k -d /nobackup/menemenl/eighth/MITgcm/exe \
187                     c17 480 runon 9-511 mitgcmuv1440 : \
188                     c19 480 runon 9-511 mitgcmuv1440 : \
189                     c20 480 runon 9-511 mitgcmuv1440   \
190                                >&! output.run
191    
192    
193    
# Line 141  fails for 1/8 Line 197  fails for 1/8
197  >   viscA4GridMax=4.e-3,  >   viscA4GridMax=4.e-3,
198  >   viscC4Leith=0.05,  >   viscC4Leith=0.05,
199  >   deltat=300  >   deltat=300
200    fails:
201  try  <   viscA4GridMin=6.e-4,
202    <   viscA4GridMax=8.e-3,
203    <   viscC4Leith=0.1,
204    fails:
205  <   viscA4GridMin=6.e-4,  <   viscA4GridMin=6.e-4,
206  <   viscA4GridMax=8.e-3,  <   viscA4GridMax=8.e-3,
207    <   viscC4Leith=0.2,
208    fails:
209    <   viscA4GridMin=1.e-3,
210    <   viscA4GridMax=1.e-2,
211    <   viscC4Leith=0.2,
212    fails:
213    <   viscA4GridMin=1.e-3,
214    <   viscA4GridMax=1.e-2,
215    <   viscC4Leith=0.3,
216    fails:
217    <   viscA4GridMin=1.2e-3,
218    <   viscA4GridMax=1.6e-2,
219    <   viscC4Leith=0.2,
220    fails:
221    <   viscA4GridMin=1.2e-3,
222    <   viscA4GridMax=1.6e-2,
223    <   viscC4Leith=0.4,
224    fails
225    <   viscA4GridMin=1.2e-3,
226    <   viscA4GridMax=1.2e-2,
227    <   viscC4Leith=1.2,
228    fails:
229    <   viscA4GridMin=2e-3,
230    <   viscA4GridMax=1e-2,
231  <   viscC4Leith=0.1,  <   viscC4Leith=0.1,
232    fails:
233    <   viscA4GridMin=2e-3,
234    <   viscA4GridMax=1e-2,
235    <   viscC4Leith=0.2,
236    try:
237    <   viscA4GridMin=4e-3,
238    <   viscA4GridMax=8e-3,
239    <   viscC4Leith=0.2,
240    
241    
242    
243    %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
244    
245    1/8 timing tests:
246    
247                                 columbia20
248                                 scsl.1.5.0.0
249                        c18      intel-comp.8.0.070
250    240-CPU             default  mpt.1.11-85
251    ------------------------------------------------
252    MAIN LOOP           7115     5066
253    EXF_GETFORCING      372      38
254    DO_OCEANIC_PHYS     1221     1272
255    STATEKPP            509      532
256    KPPMIX              370      374
257    DYNAMICS            1527     1429
258    SOLVE_FOR_PRESSURE  1804     206
259    BLOCKING_EXCHANGES  117      115
260    THERMODYNAMICS      1166     1100
261    DO_THE_MODEL_IO     173      177
262    WRITE_CHECKPOINT    341      333  
263    
264    
265                                 columbia20
266                                 scsl.1.5.0.0
267                        c18      intel-comp.8.0.070
268    480-CPU             default  mpt.1.11-85
269                                          c19 default
270                                                   c17 default, other processes
271                                                            c19 new
272    -------------------------------------------------------------------------
273    MAIN LOOP           4024     2917     5379     8895     3571
274    EXF_GETFORCING      218      33       880      261      227
275    DO_OCEANIC_PHYS     622      619      621      913      620
276    STATEKPP            269      265      268      310      265
277    KPPMIX              190      188      189      291      189
278    DYNAMICS            747      718      745      1456     714
279    SOLVE_FOR_PRESSURE  966      119      1703     2748     900
280    BLOCKING_EXCHANGES  64       70       392      375      70
281    THERMODYNAMICS      553      582      566      1510     584
282    DO_THE_MODEL_IO     178      156      149      184      152
283    WRITE_CHECKPOINT    364      332      864      420      333
284    
285    
286    
287                        240-CPU  480-CPU  960-CPU  1440-CPU
288    -------------------------------------------------------
289    MAIN LOOP           5066     2917     2227     1551
290    EXF_GETFORCING      38       33       126      60
291    DO_OCEANIC_PHYS     1272     619      320      390
292    STATEKPP            532      265      138      181
293    KPPMIX              374      188      98       112
294    DYNAMICS            1429     718      313      319
295    SOLVE_FOR_PRESSURE  206      119      483      169
296    BLOCKING_EXCHANGES  115      70       53       29
297    THERMODYNAMICS      1100     582      294      279
298    DO_THE_MODEL_IO     177      156      131      202
299    WRITE_CHECKPOINT    333      332      302      524
Legend:
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changed lines
  Added in v.1.24
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