/[MITgcm]/MITgcm_contrib/quarter_degree_global/README.txt
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revision 1.12 by dimitri, Sat Dec 11 19:52:33 2004 UTC revision 1.17 by dimitri, Tue Dec 14 01:08:40 2004 UTC
# Line 97  qsub job_altix Line 97  qsub job_altix
97    
98  module purge  module purge
99  module load modules scsl.1.5.0.0 intel-comp.8.0.070 mpt.1.11-85  module load modules scsl.1.5.0.0 intel-comp.8.0.070 mpt.1.11-85
100    setenv MPI_DSM_DISTRIBUTE
101  cd MITgcm  cd MITgcm
102  mkdir bin exe  mkdir bin exe
103  cd bin  cd bin
# Line 106  cd bin Line 107  cd bin
107  ../tools/genmake2 -of ../tools/build_options/linux_ia64_ifort+mpi_altix_nas  ../tools/genmake2 -of ../tools/build_options/linux_ia64_ifort+mpi_altix_nas
108  make depend  make depend
109  make -j 4  make -j 4
110    
111  cd ../exe  cd ../exe
112  \cp ../bin/mitgcmuv .  \cp ../bin/mitgcmuv .
113  \cp ../../MITgcm_contrib/quarter_degree_global/input/* .  \cp ../../MITgcm_contrib/quarter_degree_global/input/* .
# Line 116  modpickup_8 Line 118  modpickup_8
118  mpirun -v -a a2k c18 480 runon 4-483 mitgcmuv : c20 480 runon 4-483 mitgcmuv  mpirun -v -a a2k c18 480 runon 4-483 mitgcmuv : c20 480 runon 4-483 mitgcmuv
119  mpirun -v -a a2k c18 508 runon 4-511 mitgcmuv : c20 508 runon 4-511 mitgcmuv  mpirun -v -a a2k c18 508 runon 4-511 mitgcmuv : c20 508 runon 4-511 mitgcmuv
120    
121    on columbia18:
122    ln -sf /nobackup18/menemenl/eighth /tmp/eighth
123    
124    on columbia20:
125    ln -sf /nobackup20/menemenl/eighth /tmp/eighth
126    
127    cd ~/exe
128    \cp /tmp/eighth/MITgcm/exe/mitgcmuv960 .
129    \cp /tmp/eighth/MITgcm_contrib/quarter_degree_global/input/* .
130    \ln -sf /tmp/eighth/iter69/* .
131    \cp data.exf_clim_8 data.exf_clim
132    \cp data_SIO_8 data
133    \ln -sf /tmp/eighth/MITgcm/exe/pick* .
134    
135    mpirun -v -a a2k -d /tmp/eighth/MITgcm/exe c18 480 runon 4-511 mitgcmuv960 : c20 480 runon 4-511 mitgcmuv960
136    
137    
138    
139    
# Line 124  fails for 1/8 Line 142  fails for 1/8
142  >   viscA4GridMax=4.e-3,  >   viscA4GridMax=4.e-3,
143  >   viscC4Leith=0.05,  >   viscC4Leith=0.05,
144  >   deltat=300  >   deltat=300
145    fails:
 try  
146  <   viscA4GridMin=6.e-4,  <   viscA4GridMin=6.e-4,
147  <   viscA4GridMax=8.e-3,  <   viscA4GridMax=8.e-3,
148  <   viscC4Leith=0.1,  <   viscC4Leith=0.1,
149    starting at ????? try
150    <   viscA4GridMin=6.e-4,
151    <   viscA4GridMax=8.e-3,
152    <   viscC4Leith=0.2,
153    
154    
155    %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
156    
157    1/8 timing tests:
158    
159                                 columbia20
160                                 scsl.1.5.0.0
161                        c18      intel-comp.8.0.070
162    240-CPU             default  mpt.1.11-85
163    ------------------------------------------------
164    MAIN LOOP           7115     5066
165    EXF_GETFORCING      372      38
166    DO_OCEANIC_PHYS     1221     1272
167    STATEKPP            509      532
168    KPPMIX              370      374
169    DYNAMICS            1527     1429
170    SOLVE_FOR_PRESSURE  1804     206
171    BLOCKING_EXCHANGES  117      115
172    THERMODYNAMICS      1166     1100
173    DO_THE_MODEL_IO     173      177
174    WRITE_CHECKPOINT    341      333  
175    
176    
177                                 columbia20
178                                 scsl.1.5.0.0
179                        c18      intel-comp.8.0.070
180    480-CPU             default  mpt.1.11-85
181    ------------------------------------------------
182    MAIN LOOP           4024     2917
183    EXF_GETFORCING      218      33
184    DO_OCEANIC_PHYS     622      619
185    STATEKPP            269      265
186    KPPMIX              190      188
187    DYNAMICS            747      718
188    SOLVE_FOR_PRESSURE  966      119
189    BLOCKING_EXCHANGES  64       70
190    THERMODYNAMICS      553      582
191    DO_THE_MODEL_IO     178      156
192    WRITE_CHECKPOINT    364      332
193    
194    
195    
196                        240-CPU  480-CPU  960-CPU
197    ------------------------------------------------
198    MAIN LOOP           5066     2917     2227
199    EXF_GETFORCING      38       33       126
200    DO_OCEANIC_PHYS     1272     619      320
201    STATEKPP            532      265      138
202    KPPMIX              374      188      98
203    DYNAMICS            1429     718      313
204    SOLVE_FOR_PRESSURE  206      119      483
205    BLOCKING_EXCHANGES  115      70       53
206    THERMODYNAMICS      1100     582      294
207    DO_THE_MODEL_IO     177      156      131
208    WRITE_CHECKPOINT    333      332      302
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