/[MITgcm]/MITgcm_contrib/mlosch/tools/genmake2_patch.diff
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1 --- /scratch/users/mlosch/MITgcm/tools/genmake2 2014-11-03 10:48:01.154070057 +0100
2 +++ genmake2 2014-12-10 09:23:33.121567223 +0100
3 @@ -3124,6 +3124,19 @@
4
5 cat >>$MAKEFILE <<EOF
6
7 +# ... Utilities ...
8 +remove_comments:
9 + sed -i.bak -f \$(TOOLSDIR)/remove_comments_sed \$(AD_FILES)
10 + @-rm -f \$(AD_FILES:.$FS=.$FS.bak)
11 +adj_sed:
12 + sed -i.bak -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed \$(AD_FILES:.$FS=_ad.$FS)
13 + @-rm -f \$(AD_FILES:.$FS=_ad.$FS.bak)
14 +ftl_sed:
15 + sed -i.bak -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed \$(AD_FILES:.$FS=_tl.$FS)
16 + @-rm -f \$(AD_FILES:.$FS=_tl.$FS.bak)
17 +adobjfiles: \$(AD_FILES:.$FS=_ad.o)
18 +ftlobjfiles: \$(AD_FILES:.$FS=_tl.o)
19 +
20 # ... AD ...
21 adall: ad_exe_target
22 adtaf: ad_taf_output.$FS
23 @@ -3144,19 +3157,25 @@
24 @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(FLOWFILES)
25 cat \$(FLOWFILES) \$(AD_FILES) | sed -f \$(TOOLSDIR)/remove_comments_sed > ad_input_code.$FS
26
27 -ad_taf_output.$FS: ad_input_code.$FS
28 - @-rm -f ad_input_code_ad.$FS ; echo ''
29 - \$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ad_input_code.$FS
30 - ls -l ad_input_code_ad.$FS
31 - cat ad_input_code_ad.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_taf_output.$FS
32 +ad_taf_output.$FS: \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES)
33 + @$BASH\$(TOOLSDIR)/convert_cpp_cmd2defines "Adjoint version" -bAD_CONFIG_H -DALLOW_ADJOINT_RUN -UALLOW_TANGENTLINEAR_RUN > ad_config.template
34 + cmp ad_config.template AD_CONFIG.h || cat ad_config.template > AD_CONFIG.h
35 + @-rm -f ad_config.template
36 + @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(F77_PP_SRC_FILES)
37 + @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(FLOWFILES)
38 + @-rm -f \$(AD_FILES:.$FS=_ad.$FS) \$(AD_FILES:.$FS=_ad.o); echo ''
39 + \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) remove_comments
40 + \$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) \$(FLOWFILES) \$(AD_FILES)
41 + \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) adj_sed
42 + \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) adobjfiles
43 + cat \$(AD_FILES:.$FS=_ad.$FS) > ad_taf_output.$FS
44
45 adtafonly:
46 - \$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ad_input_code.$FS
47 - ls -l ad_input_code_ad.$FS
48 - cat ad_input_code_ad.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_taf_output.$FS
49 + \$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) \$(FLOWFILES) \$(AD_FILES)
50 + cat \$(AD_FILES:.$FS=_ad.$FS) | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_taf_output.$FS
51
52 -\$(EXE_AD): \$(SPECIAL_FILES) \$(H_SRC_FILES) ad_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(EMBEDDED_FILES)
53 - \$(LINK) -o \${EXE_AD} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) ad_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(LIBS)
54 +\$(EXE_AD): \$(SPECIAL_FILES) \$(H_SRC_FILES) ad_taf_output.$FS \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(EMBEDDED_FILES)
55 + \$(LINK) -o \${EXE_AD} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) \$(AD_FILES:.$FS=_ad.o) \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(LIBS)
56
57 ad_tamc_output.$FS: ad_input_code.$FS
58 \$(TAMC) \$(AD_TAMC_FLAGS) \$(TAMC_EXTRA) ad_input_code.$FS
59 @@ -3171,7 +3190,7 @@
60 adtrick:
61 patch < \$(TOOLSDIR)/ad_taf_output.f.adtrick.diff
62
63 -adobj: ad_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o)
64 +adobj: \$(AD_FILES:.$FS=_ad.o) \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o)
65
66 # ... FTL ...
67 ftlall: ftl_exe_target
68 @@ -3193,19 +3212,25 @@
69 @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(AD_FLOW_FILES)
70 cat \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES) | sed -f \$(TOOLSDIR)/remove_comments_sed > ftl_input_code.$FS
71
72 -ftl_taf_output.$FS: ftl_input_code.$FS
73 - @-rm -f ftl_input_code_tl.$FS ; echo ''
74 - \$(TAF) \$(FTL_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ftl_input_code.$FS
75 - ls -l ftl_input_code_tl.$FS
76 - cat ftl_input_code_tl.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_taf_output.$FS
77 +ftl_taf_output.$FS: \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES)
78 + @$BASH\$(TOOLSDIR)/convert_cpp_cmd2defines "TangLin version" -bAD_CONFIG_H -UALLOW_ADJOINT_RUN -DALLOW_TANGENTLINEAR_RUN > ad_config.template
79 + cmp ad_config.template AD_CONFIG.h || cat ad_config.template > AD_CONFIG.h
80 + @-rm -f ad_config.template
81 + @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(F77_PP_SRC_FILES)
82 + @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(AD_FLOW_FILES)
83 + @-rm -f \$(AD_FILES:.$FS=_tl.$FS) \$(AD_FILES:.$FS=_tl.o); echo ''
84 + \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) remove_comments
85 + \$(TAF) \$(FTL_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES)
86 + \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) ftl_sed
87 + \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) ftlobjfiles
88 + cat \$(AD_FILES:.$FS=_tl.$FS) > ftl_taf_output.$FS
89
90 ftltafonly:
91 \$(TAF) \$(FTL_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ftl_input_code.$FS
92 - ls -l ftl_input_code_tl.$FS
93 - cat ftl_input_code_tl.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_taf_output.$FS
94 + cat \$(AD_FILES:.$FS=_tl.$FS) | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_taf_output.$FS
95
96 -\$(EXE_FTL): \$(SPECIAL_FILES) \$(H_SRC_FILES) ftl_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(EMBEDDED_FILES)
97 - \$(LINK) -o \${EXE_FTL} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) ftl_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(LIBS)
98 +\$(EXE_FTL): \$(SPECIAL_FILES) \$(H_SRC_FILES) ftl_taf_output.$FS \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(EMBEDDED_FILES)
99 + \$(LINK) -o \${EXE_FTL} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) \$(AD_FILES:.$FS=_tl.o) \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(LIBS)
100
101 ftl_tamc_output.$FS: ftl_input_code.$FS
102 \$(TAMC) \$(FTL_TAMC_FLAGS) \$(TAMC_EXTRA) ftl_input_code.$FS
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