/[MITgcm]/MITgcm_contrib/mlosch/tools/genmake2_patch.diff
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Annotation of /MITgcm_contrib/mlosch/tools/genmake2_patch.diff

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Wed Dec 10 08:38:44 2014 UTC (10 years, 7 months ago) by mlosch
Branch: MAIN 
patch file that will patch your_genmake2 like this:
patch -p1 your_genmake2 genmake2_patch.diff
1 mlosch 1.1 --- /scratch/users/mlosch/MITgcm/tools/genmake2 2014-11-03 10:48:01.154070057 +0100
2     +++ genmake2 2014-12-10 09:23:33.121567223 +0100
3     @@ -3124,6 +3124,19 @@
4    
5     cat >>$MAKEFILE <<EOF
6    
7     +# ... Utilities ...
8     +remove_comments:
9     + sed -i.bak -f \$(TOOLSDIR)/remove_comments_sed \$(AD_FILES)
10     + @-rm -f \$(AD_FILES:.$FS=.$FS.bak)
11     +adj_sed:
12     + sed -i.bak -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed \$(AD_FILES:.$FS=_ad.$FS)
13     + @-rm -f \$(AD_FILES:.$FS=_ad.$FS.bak)
14     +ftl_sed:
15     + sed -i.bak -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed \$(AD_FILES:.$FS=_tl.$FS)
16     + @-rm -f \$(AD_FILES:.$FS=_tl.$FS.bak)
17     +adobjfiles: \$(AD_FILES:.$FS=_ad.o)
18     +ftlobjfiles: \$(AD_FILES:.$FS=_tl.o)
19     +
20     # ... AD ...
21     adall: ad_exe_target
22     adtaf: ad_taf_output.$FS
23     @@ -3144,19 +3157,25 @@
24     @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(FLOWFILES)
25     cat \$(FLOWFILES) \$(AD_FILES) | sed -f \$(TOOLSDIR)/remove_comments_sed > ad_input_code.$FS
26    
27     -ad_taf_output.$FS: ad_input_code.$FS
28     - @-rm -f ad_input_code_ad.$FS ; echo ''
29     - \$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ad_input_code.$FS
30     - ls -l ad_input_code_ad.$FS
31     - cat ad_input_code_ad.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_taf_output.$FS
32     +ad_taf_output.$FS: \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES)
33     + @$BASH\$(TOOLSDIR)/convert_cpp_cmd2defines "Adjoint version" -bAD_CONFIG_H -DALLOW_ADJOINT_RUN -UALLOW_TANGENTLINEAR_RUN > ad_config.template
34     + cmp ad_config.template AD_CONFIG.h || cat ad_config.template > AD_CONFIG.h
35     + @-rm -f ad_config.template
36     + @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(F77_PP_SRC_FILES)
37     + @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(FLOWFILES)
38     + @-rm -f \$(AD_FILES:.$FS=_ad.$FS) \$(AD_FILES:.$FS=_ad.o); echo ''
39     + \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) remove_comments
40     + \$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) \$(FLOWFILES) \$(AD_FILES)
41     + \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) adj_sed
42     + \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) adobjfiles
43     + cat \$(AD_FILES:.$FS=_ad.$FS) > ad_taf_output.$FS
44    
45     adtafonly:
46     - \$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ad_input_code.$FS
47     - ls -l ad_input_code_ad.$FS
48     - cat ad_input_code_ad.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_taf_output.$FS
49     + \$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) \$(FLOWFILES) \$(AD_FILES)
50     + cat \$(AD_FILES:.$FS=_ad.$FS) | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_taf_output.$FS
51    
52     -\$(EXE_AD): \$(SPECIAL_FILES) \$(H_SRC_FILES) ad_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(EMBEDDED_FILES)
53     - \$(LINK) -o \${EXE_AD} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) ad_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(LIBS)
54     +\$(EXE_AD): \$(SPECIAL_FILES) \$(H_SRC_FILES) ad_taf_output.$FS \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(EMBEDDED_FILES)
55     + \$(LINK) -o \${EXE_AD} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) \$(AD_FILES:.$FS=_ad.o) \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(LIBS)
56    
57     ad_tamc_output.$FS: ad_input_code.$FS
58     \$(TAMC) \$(AD_TAMC_FLAGS) \$(TAMC_EXTRA) ad_input_code.$FS
59     @@ -3171,7 +3190,7 @@
60     adtrick:
61     patch < \$(TOOLSDIR)/ad_taf_output.f.adtrick.diff
62    
63     -adobj: ad_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o)
64     +adobj: \$(AD_FILES:.$FS=_ad.o) \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o)
65    
66     # ... FTL ...
67     ftlall: ftl_exe_target
68     @@ -3193,19 +3212,25 @@
69     @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(AD_FLOW_FILES)
70     cat \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES) | sed -f \$(TOOLSDIR)/remove_comments_sed > ftl_input_code.$FS
71    
72     -ftl_taf_output.$FS: ftl_input_code.$FS
73     - @-rm -f ftl_input_code_tl.$FS ; echo ''
74     - \$(TAF) \$(FTL_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ftl_input_code.$FS
75     - ls -l ftl_input_code_tl.$FS
76     - cat ftl_input_code_tl.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_taf_output.$FS
77     +ftl_taf_output.$FS: \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES)
78     + @$BASH\$(TOOLSDIR)/convert_cpp_cmd2defines "TangLin version" -bAD_CONFIG_H -UALLOW_ADJOINT_RUN -DALLOW_TANGENTLINEAR_RUN > ad_config.template
79     + cmp ad_config.template AD_CONFIG.h || cat ad_config.template > AD_CONFIG.h
80     + @-rm -f ad_config.template
81     + @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(F77_PP_SRC_FILES)
82     + @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(AD_FLOW_FILES)
83     + @-rm -f \$(AD_FILES:.$FS=_tl.$FS) \$(AD_FILES:.$FS=_tl.o); echo ''
84     + \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) remove_comments
85     + \$(TAF) \$(FTL_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES)
86     + \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) ftl_sed
87     + \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) ftlobjfiles
88     + cat \$(AD_FILES:.$FS=_tl.$FS) > ftl_taf_output.$FS
89    
90     ftltafonly:
91     \$(TAF) \$(FTL_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ftl_input_code.$FS
92     - ls -l ftl_input_code_tl.$FS
93     - cat ftl_input_code_tl.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_taf_output.$FS
94     + cat \$(AD_FILES:.$FS=_tl.$FS) | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_taf_output.$FS
95    
96     -\$(EXE_FTL): \$(SPECIAL_FILES) \$(H_SRC_FILES) ftl_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(EMBEDDED_FILES)
97     - \$(LINK) -o \${EXE_FTL} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) ftl_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(LIBS)
98     +\$(EXE_FTL): \$(SPECIAL_FILES) \$(H_SRC_FILES) ftl_taf_output.$FS \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(EMBEDDED_FILES)
99     + \$(LINK) -o \${EXE_FTL} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) \$(AD_FILES:.$FS=_tl.o) \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(LIBS)
100    
101     ftl_tamc_output.$FS: ftl_input_code.$FS
102     \$(TAMC) \$(FTL_TAMC_FLAGS) \$(TAMC_EXTRA) ftl_input_code.$FS
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