11 |
216-CPU code and input used for integrating cube37 |
216-CPU code and input used for integrating cube37 |
12 |
using "June 10, 2006" MITgcm code. |
using "June 10, 2006" MITgcm code. |
13 |
|
|
14 |
|
for online T/S profile diagnostics all that is needed is |
15 |
|
profiles_init_fixed |
16 |
|
profiles_inloop |
17 |
|
see pkg/ecco/ecco_cost_init_fixed.F |
18 |
|
pkg/ecco/cost_averagesfields.F |
19 |
|
|
20 |
|
|
21 |
########################################################################## |
########################################################################## |
22 |
########################################################################## |
########################################################################## |
77 |
|
|
78 |
########################################################################## |
########################################################################## |
79 |
########################################################################## |
########################################################################## |
80 |
# 32*32*6*15, 17-tile, 1-cpu cube sphere experiment |
# 510*510*6*50, 216-cpu cube sphere on altix with ifort and pkg/diagnostics |
81 |
|
# requires input files in sudirectories run_template and ncep_rgau |
82 |
|
# these can be obained from lou:/u/menemenl/cube |
83 |
|
|
84 |
cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code |
cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code |
85 |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* . |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* . |
86 |
\cp ../code_alt/code.176t_8x4/* . |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/s216t_85x85/* . |
87 |
|
\cp SIZE.h_216 SIZE.h |
88 |
|
\cp packages.conf_hr packages.conf |
89 |
|
|
90 |
cd ../build |
cd ../build |
91 |
\rm * |
\rm * |
92 |
../../../tools/genmake2 -mods=../code |
../../../tools/genmake2 -mods=../code -of |
93 |
|
../../../tools/build_options/linux_ia\ |
94 |
|
64_ifort+mpi_altix_nas |
95 |
make depend |
make depend |
96 |
make |
make -j |
97 |
|
|
98 |
cd .. |
cd .. |
99 |
mkdir run |
mkdir run |
100 |
cd run |
cd run |
101 |
\rm * |
\rm * |
|
\cp ../../tutorial_held_suarez_cs/input/grid* . |
|
102 |
\cp ../input/* . |
\cp ../input/* . |
103 |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* . |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* . |
104 |
../build/mitgcmuv >& output.txt |
ln -sf ../../../../run_template/* . |
105 |
|
\rm pickup* data.pkg data.seaice data.exf_clim data.exf data bathy_Hmin50.bin |
106 |
|
\rm *192_94* *cs32* *.m lev* tren* job_c* job_altix150 job_altix92_54t |
107 |
|
ln -sf ../../../../run_template/pickup.0000000216.cube38 pickup.0000000216 |
108 |
|
ln -sf ../../../../run_template/pickup_seaice.0000000216.cube38 |
109 |
|
pickup_seaice.\ |
110 |
|
0000000216 |
111 |
|
\cp ../build/mitgcmuv . |
112 |
|
qsub job_altix |
113 |
|
|
114 |
|
|
115 |
########################################################################## |
########################################################################## |
116 |
########################################################################## |
########################################################################## |
117 |
# 32*32*6*15, 2-cpu cube sphere on the altices with ifort |
# 32*32*6*15, 17-tile, 1-cpu cube sphere experiment |
118 |
|
|
119 |
cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code |
cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code |
120 |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* . |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* . |
121 |
\cp ../../../utils/exch2/code-mods/s12t_16x32/* . |
\cp ../code_alt/code.176t_8x4/* . |
|
\cp SIZE.h_mpi SIZE.h |
|
|
|
|
122 |
cd ../build |
cd ../build |
123 |
\rm * |
\rm * |
124 |
../../../tools/genmake2 -mods=../code -of ../../../tools/build_options/linux_ia64_ifort+mpi_altix_nas |
../../../tools/genmake2 -mods=../code |
125 |
make depend |
make depend |
126 |
make -j |
make |
|
|
|
127 |
cd .. |
cd .. |
128 |
mkdir run |
mkdir run |
129 |
cd run |
cd run |
131 |
\cp ../../tutorial_held_suarez_cs/input/grid* . |
\cp ../../tutorial_held_suarez_cs/input/grid* . |
132 |
\cp ../input/* . |
\cp ../input/* . |
133 |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* . |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* . |
134 |
mpirun -np 2 ../build/mitgcmuv |
../build/mitgcmuv >& output.txt |
135 |
|
|
136 |
|
|
137 |
########################################################################## |
########################################################################## |
138 |
########################################################################## |
########################################################################## |
139 |
# 510*510*6*50, 54-tile, 54-cpu cube sphere on the altices with efc |
# 32*32*6*15, 2-cpu cube sphere on the altices with ifort |
|
# starting with pickup file from end of 1992 |
|
|
# requires input files in sudirectories run_template and ncep_rgau |
|
140 |
|
|
141 |
cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code |
cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code |
142 |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* . |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* . |
143 |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/s54t_170x170/* . |
\cp ../../../utils/exch2/code-mods/s12t_16x32/* . |
144 |
\cp packages.conf_hr packages.conf |
\cp SIZE.h_mpi SIZE.h |
145 |
|
|
146 |
cd ../build |
cd ../build |
147 |
\rm * |
\rm * |
148 |
../../../tools/genmake2 -mods=../code -of ../../../tools/build_options/linux_ia64_efc+mpi_altix |
../../../tools/genmake2 -mods=../code -of ../../../tools/build_options/linux_ia64_ifort+mpi_altix_nas |
149 |
make depend |
make depend |
150 |
make -j |
make -j |
151 |
|
|
153 |
mkdir run |
mkdir run |
154 |
cd run |
cd run |
155 |
\rm * |
\rm * |
156 |
|
\cp ../../tutorial_held_suarez_cs/input/grid* . |
157 |
\cp ../input/* . |
\cp ../input/* . |
158 |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* . |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* . |
159 |
qsub job_altix92_54t |
mpirun -np 2 ../build/mitgcmuv |
160 |
|
|
161 |
|
|
162 |
########################################################################## |
########################################################################## |
163 |
########################################################################## |
########################################################################## |
164 |
# 510*510*6*50, 216-cpu cube sphere on altix with ifort and pkg/diagnostics |
# 510*510*6*50, 54-tile, 54-cpu cube sphere on the altices with efc |
165 |
|
# starting with pickup file from end of 1992 |
166 |
# requires input files in sudirectories run_template and ncep_rgau |
# requires input files in sudirectories run_template and ncep_rgau |
|
# these can be obained from lou:/u/menemenl/cube |
|
167 |
|
|
168 |
cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code |
cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code |
169 |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* . |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* . |
170 |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/s216t_85x85/* . |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/s54t_170x170/* . |
|
\cp SIZE.h_216 SIZE.h |
|
171 |
\cp packages.conf_hr packages.conf |
\cp packages.conf_hr packages.conf |
172 |
|
|
173 |
cd ../build |
cd ../build |
174 |
\rm * |
\rm * |
175 |
../../../tools/genmake2 -mods=../code -of ../../../tools/build_options/linux_ia64_ifort+mpi_altix_nas |
../../../tools/genmake2 -mods=../code -of ../../../tools/build_options/linux_ia64_efc+mpi_altix |
176 |
make depend |
make depend |
177 |
make -j |
make -j |
178 |
|
|
182 |
\rm * |
\rm * |
183 |
\cp ../input/* . |
\cp ../input/* . |
184 |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* . |
\cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* . |
185 |
ln -sf ../../../../run_template/* . |
qsub job_altix92_54t |
|
\rm pickup* data.pkg data.seaice data.exf_clim data.exf data bathy_Hmin50.bin |
|
|
\rm *192_94* *cs32* *.m lev* tren* job_c* job_altix150 job_altix92_54t |
|
|
ln -sf ../../../../run_template/pickup.0000000216.cube38 pickup.0000000216 |
|
|
ln -sf ../../../../run_template/pickup_seaice.0000000216.cube38 pickup_seaice.0000000216 |
|
|
\cp ../build/mitgcmuv . |
|
|
qsub job_altix |
|
186 |
|
|
187 |
|
|
188 |
########################################################################## |
########################################################################## |
216 |
qsub job_altix150 |
qsub job_altix150 |
217 |
|
|
218 |
|
|
|
|
|
|
|
|
219 |
########################################################################## |
########################################################################## |
220 |
########################################################################## |
########################################################################## |
221 |
# 510*510*6*50, 1500-tile, 375-cpu, excludes land |
# 510*510*6*50, 1500-tile, 375-cpu, excludes land |
248 |
job_c20_375cpu < /dev/null >&! output.run & |
job_c20_375cpu < /dev/null >&! output.run & |
249 |
|
|
250 |
|
|
|
|
|
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|
251 |
########################################################################## |
########################################################################## |
252 |
########################################################################## |
########################################################################## |
253 |
# 510*510*6*50, 1500-tile, 375-cpu, excludes land |
# 510*510*6*50, 1500-tile, 375-cpu, excludes land |
312 |
job_c19_500cpu < /dev/null >&! output.run & |
job_c19_500cpu < /dev/null >&! output.run & |
313 |
|
|
314 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
315 |
########################################################################## |
########################################################################## |
316 |
########################################################################## |
########################################################################## |
317 |
# 510*510*6*50, 216-cpu cube sphere on cosmos |
# 510*510*6*50, 216-cpu cube sphere on cosmos |
347 |
bsub < job_cosmos |
bsub < job_cosmos |
348 |
|
|
349 |
|
|
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350 |
########################################################################## |
########################################################################## |
351 |
########################################################################## |
########################################################################## |
352 |
# 510*510*6*50, 216-tile, 54-cpu cube sphere on the altices with efc |
# 510*510*6*50, 216-tile, 54-cpu cube sphere on the altices with efc |