Contents of /MITgcm_contrib/heimbach/OpenAD/code_shallow_openad/RefTrans/update,bash

if [ -n "$BATCHMODE" ]  
then
  fileList='ad_input_code.w2f.canon.xb.x2w.w2f.rs.pp.f all_mods.xb.x2w.w2f.pp.f m.out'
else
  fileList='ad_input_code_sf.f ad_input_code_sf.w2f.f ad_input_code_sf.w2f.canon.f ad_input_code_sf.w2f.canon.xaif ad_input_code_sf.w2f.canon.xb.xaif ad_input_code_sf.w2f.canon.xb.x2w.w2f.f ad_input_code_sf.w2f.canon.xb.x2w.w2f.rs.f ad_input_code_sf.w2f.canon.xb.x2w.w2f.rs.pp.f ad_input_code.w2f.canon.xb.x2w.w2f.rs.pp.f all_mods.xb.x2w.w2f.pp.f m.out'
fi
for i in `echo ${fileList}`
do 
  gunzip -c ${i}.gz > ${i}
  echo "$i old reference (<) vs new file (>)"
  echo "------------------------------------------------------------------------------" 
      echo "copying"
      cp ../../../../../MITgcm/verification/OpenAD/build_shallow_openad3/$i $i
      gzip -f ${i}
done
1	if [ -n "$BATCHMODE" ]
2	then
3	fileList='ad_input_code.w2f.canon.xb.x2w.w2f.rs.pp.f all_mods.xb.x2w.w2f.pp.f m.out'
4	else
5	fileList='ad_input_code_sf.f ad_input_code_sf.w2f.f ad_input_code_sf.w2f.canon.f ad_input_code_sf.w2f.canon.xaif ad_input_code_sf.w2f.canon.xb.xaif ad_input_code_sf.w2f.canon.xb.x2w.w2f.f ad_input_code_sf.w2f.canon.xb.x2w.w2f.rs.f ad_input_code_sf.w2f.canon.xb.x2w.w2f.rs.pp.f ad_input_code.w2f.canon.xb.x2w.w2f.rs.pp.f all_mods.xb.x2w.w2f.pp.f m.out'
6	fi
7	for i in `echo ${fileList}`
8	do
9	gunzip -c ${i}.gz > ${i}
10	echo "$i old reference (<) vs new file (>)"
11	echo "------------------------------------------------------------------------------"
12	echo "copying"
13	cp ../../../../../MITgcm/verification/OpenAD/build_shallow_openad3/$i $i
14	gzip -f ${i}
15	done