/[MITgcm]/MITgcm_contrib/darwin2/pkg/quota/QUOTA.h
ViewVC logotype

Diff of /MITgcm_contrib/darwin2/pkg/quota/QUOTA.h

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Revision Graph Revision Graph | View Patch Patch

revision 1.1 by jahn, Wed Apr 13 18:56:25 2011 UTC revision 1.3 by benw, Tue May 19 14:32:43 2015 UTC
# Line 33  c graz_pref(npmax,npmax)       - size ratio ba Line 33  c graz_pref(npmax,npmax)       - size ratio ba
33  c graz(npmax)                   - maximum grazing rate of predator  c graz(npmax)                   - maximum grazing rate of predator
34  c kg(npmax)                     - 1/2 saturation prey biomass for grazing  c kg(npmax)                     - 1/2 saturation prey biomass for grazing
35  c hollingtype                   - exponent of Holling grazing function  c hollingtype                   - exponent of Holling grazing function
36    c ns                            - exponent of prey switching function
37  c ass_eff                       - maximum assimilation efficiency  c ass_eff                       - maximum assimilation efficiency
38    c hill                          - assimilation shape parameter
39    c Lambda                        - grazing refuge parameter
40  c assim_graz(npmax,npmax)       - assimilation efficiency of grazing  c assim_graz(npmax,npmax)       - assimilation efficiency of grazing
41  c beta_graz(iomax-iChl,npmax)   - fraction of sloppy feeding to DOM  c beta_graz(iomax-iChl,npmax)   - fraction of sloppy feeding to DOM
42  c kexc(iimax,npmax)             - biomass specific excretion rate  c kexc(iimax,npmax)             - biomass specific excretion rate
# Line 42  c beta_mort(iomax-iChl,npmax)   - fracti Line 45  c beta_mort(iomax-iChl,npmax)   - fracti
45  c respiration(npmax)            - respiration rate  c respiration(npmax)            - respiration rate
46  c  c
47  c biosink(npmax)                - plankton sinking rate  c biosink(npmax)                - plankton sinking rate
48  c bioswim(npmax)                - plankton swimming rate  c motility(npmax)               - ability to avoid sinking
49  c orgsink(iimax,komax)          - organic matter sinking rate  c orgsink(iimax,komax)          - organic matter sinking rate
50  c remin(iomax-iChl,komax)       - organic matter remineralisation rate  c remin(iomax-iChl,komax)       - organic matter remineralisation rate
51  c amm2nrite                     - ammonium to nitrite oxidation rate  c amm2nrite                     - ammonium to nitrite oxidation rate
# Line 53  c Line 56  c
56  c use_NO3(npmax)                - nitrate use on/off  c use_NO3(npmax)                - nitrate use on/off
57  c use_Si(npmax)                 - silicate use on/off  c use_Si(npmax)                 - silicate use on/off
58  c autotrophy(npmax)             - degree of autotrophy (1 = pure auto, 0 = pure hetero)  c autotrophy(npmax)             - degree of autotrophy (1 = pure auto, 0 = pure hetero)
59  c pft(npmax)                    - phytoplankton functional type  c pft(npmax)                    - phytoplankton functional type
60  c 1=prochlorococcus, 2=synechococcus, 3=small eukaryotes,  c 1=prochlorococcus, 2=synechococcus, 3=small eukaryotes,
61  c 4=diatoms, 5=dinoflagellates, 6=generic grazers  c 4=diatoms, 5=dinoflagellates, 6=generic grazers
62  c  c
# Line 66  c Line 69  c
69       &          alphachl,chl2nmax,       &          alphachl,chl2nmax,
70       &          pp_opt,pp_sig,graz_pref,       &          pp_opt,pp_sig,graz_pref,
71       &          graz,kg,       &          graz,kg,
72       &          ass_eff,assim_graz,beta_graz,       &          ass_eff,hill,Lambda,
73         &          assim_graz,beta_graz,
74       &          kexc,       &          kexc,
75       &          kmort,beta_mort,       &          kmort,beta_mort,
76       &          respiration,       &          respiration,
77       &          biosink,bioswim,orgsink,       &          biosink,orgsink,motility,
78       &          remin,       &          remin,
79       &          autotrophy,       &          autotrophy,
80       &          pft,       &          pft,
# Line 83  c Line 87  c
87       &          tempmax, temprange, tempnorm, tempdecay,       &          tempmax, temprange, tempnorm, tempdecay,
88       &          ngrowfac, ilight,       &          ngrowfac, ilight,
89       &          PAR0,       &          PAR0,
90    #ifdef IRON_SED_SOURCE
91         &          depthfesed,fesedflux,fesedflux_pcm,
92    #endif
93    #ifdef PART_SCAV
94         &          scav_rat, scav_inter, scav_exp,
95    #endif
96       &          nsource,ngroups,       &          nsource,ngroups,
97       &          use_NO3,use_Si,       &          use_NO3,use_Si,
98       &          hollingtype       &          hollingtype,ns
99    
100           _RL vmaxi(iimax,npmax)           _RL vmaxi(iimax,npmax)
101           _RL kn(iimax,npmax)           _RL kn(iimax,npmax)
# Line 100  c Line 110  c
110           _RL graz_pref(npmax,npmax)           _RL graz_pref(npmax,npmax)
111           _RL graz(npmax)           _RL graz(npmax)
112           _RL kg(npmax)           _RL kg(npmax)
113           _RL ass_eff           _RL ass_eff,hill,Lambda
114           _RL assim_graz(npmax,npmax)           _RL assim_graz(npmax,npmax)
115           _RL beta_graz(iomax-iChl,npmax)           _RL beta_graz(iomax-iChl,npmax)
116           _RL kexc(iimax,npmax)           _RL kexc(iimax,npmax)
# Line 108  c Line 118  c
118           _RL beta_mort(iomax-iChl,npmax)           _RL beta_mort(iomax-iChl,npmax)
119           _RL respiration(npmax)           _RL respiration(npmax)
120           _RL biosink(npmax)           _RL biosink(npmax)
121           _RL bioswim(npmax)           _RL motility(npmax)
122           _RL orgsink(komax)           _RL orgsink(komax)
123           _RL remin(iomax-iChl,komax)           _RL remin(iomax-iChl,komax)
124  c  c
# Line 128  c Line 138  c
138           _RL tempcoeff2_small, tempcoeff3           _RL tempcoeff2_small, tempcoeff3
139           _RL tempmax, temprange, tempnorm,tempdecay           _RL tempmax, temprange, tempnorm,tempdecay
140           _RL ngrowfac,ilight           _RL ngrowfac,ilight
141  c  #ifdef IRON_SED_SOURCE
142             _RL depthfesed, fesedflux, fesedflux_pcm
143    #endif
144    #ifdef PART_SCAV
145             _RL scav_rat, scav_inter, scav_exp
146    #endif
147           INTEGER hollingtype           INTEGER hollingtype
148             INTEGER ns
149           INTEGER pft(npmax)           INTEGER pft(npmax)
150           INTEGER nsource(npmax)           INTEGER nsource(npmax)
151           INTEGER ngroups           INTEGER ngroups
# Line 151  c        Note, while most errors are rel Line 167  c        Note, while most errors are rel
167       &          a_prdpry,    b_prdpry,       &          a_prdpry,    b_prdpry,
168       &          a_kexc,      b_kexc,       &          a_kexc,      b_kexc,
169       &          a_biosink,   b_biosink,       &          a_biosink,   b_biosink,
      &          a_bioswim,   b_bioswim,  
170       &          a_mort,      b_mort,       &          a_mort,      b_mort,
171       &          a_beta_graz, b_beta_graz,       &          a_beta_graz, b_beta_graz,
172       &          a_beta_mort, b_beta_mort,       &          a_beta_mort, b_beta_mort,
# Line 167  c        Note, while most errors are rel Line 182  c        Note, while most errors are rel
182       &          ae_prdpry,   be_prdpry,       &          ae_prdpry,   be_prdpry,
183       &          ae_kexc,     be_kexc,       &          ae_kexc,     be_kexc,
184       &          ae_biosink,  be_biosink,       &          ae_biosink,  be_biosink,
      &          ae_bioswim,  be_bioswim,  
185       &          ae_mort,     be_mort,       &          ae_mort,     be_mort,
186       &          ae_beta_graz,be_beta_graz,       &          ae_beta_graz,be_beta_graz,
187       &          ae_beta_mort,be_beta_mort       &          ae_beta_mort,be_beta_mort
# Line 185  c        Note, while most errors are rel Line 199  c        Note, while most errors are rel
199           _RL a_prdpry       ,b_prdpry           _RL a_prdpry       ,b_prdpry
200           _RL a_kexc(iomax)  ,b_kexc(iomax)           _RL a_kexc(iomax)  ,b_kexc(iomax)
201           _RL a_biosink      ,b_biosink           _RL a_biosink      ,b_biosink
          _RL a_bioswim      ,b_bioswim  
202           _RL a_mort         ,b_mort           _RL a_mort         ,b_mort
203           _RL a_beta_graz(iomax-iChl)           _RL a_beta_graz(iomax-iChl)
204           _RL b_beta_graz(iomax-iChl)           _RL b_beta_graz(iomax-iChl)
# Line 203  c        Note, while most errors are rel Line 216  c        Note, while most errors are rel
216           _RL ae_prdpry      ,be_prdpry           _RL ae_prdpry      ,be_prdpry
217           _RL ae_kexc(iomax) ,be_kexc(iomax)           _RL ae_kexc(iomax) ,be_kexc(iomax)
218           _RL ae_biosink     ,be_biosink           _RL ae_biosink     ,be_biosink
          _RL ae_bioswim     ,be_bioswim  
219           _RL ae_mort        ,be_mort           _RL ae_mort        ,be_mort
220           _RL ae_beta_graz(iomax-iChl)           _RL ae_beta_graz(iomax-iChl)
221           _RL be_beta_graz(iomax-iChl)           _RL be_beta_graz(iomax-iChl)
Legend:
Removed from v.1.1  
changed lines
  Added in v.1.3
  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.22