/[MITgcm]/MITgcm_contrib/darwin2/pkg/monod/monod_init_vari.F
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Diff of /MITgcm_contrib/darwin2/pkg/monod/monod_init_vari.F

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revision 1.3 by jahn, Thu Sep 22 16:01:30 2011 UTC revision 1.6 by jahn, Thu Aug 23 21:48:25 2012 UTC
# Line 88  c test.................... Line 88  c test....................
88  c set up ecosystem coefficients  c set up ecosystem coefficients
89  c  c
90  c seed randomization  c seed randomization
91            _BEGIN_MASTER( myThid )
92    
93          CALL DARWIN_RANDOM_INIT(darwin_seed, myThid)          CALL DARWIN_RANDOM_INIT(darwin_seed, myThid)
94    
95  c initialize total number of functional groups tried  c initialize total number of functional groups tried
# Line 100  c initialize total number of functional Line 102  c initialize total number of functional
102  #endif  #endif
103           end do           end do
104    
105            _END_MASTER( myThid )
106    
107  c reduce amount of diaz  c reduce amount of diaz
108  #ifdef ALLOW_DIAZ  #ifdef ALLOW_DIAZ
109          do np = 1, npmax          do np = 1, npmax
# Line 120  c reduce amount of diaz Line 124  c reduce amount of diaz
124          enddo          enddo
125  #endif  #endif
126    
127            _BEGIN_MASTER( myThid )
128    
129  c initialize zooplankton  c initialize zooplankton
130           call MONOD_GENERATE_ZOO(MyThid)           call MONOD_GENERATE_ZOO(MyThid)
131    
# Line 179  c  no temp/nutrient limitation Line 185  c  no temp/nutrient limitation
185       &               (2*pcmax(np)))       &               (2*pcmax(np)))
186             enddo             enddo
187  #endif  #endif
            call MONOD_CHECK_CHL(myThid)  
188  #endif  #endif
189  #endif  #endif
190  c ANNA endif          _END_MASTER( myThid )
191    
192    #ifdef DYNAMIC_CHL
193    C this initializes fields...
194            call MONOD_CHECK_CHL(myThid)
195    #endif
196    
197           IF ( myProcId.EQ.0 .AND. myThid.EQ.1 ) THEN           IF ( myProcId.EQ.0 .AND. myThid.EQ.1 ) THEN
198  c write out initial phyto characteristics  c write out initial phyto characteristics
# Line 340  c set arrays to zero if first timestep Line 350  c set arrays to zero if first timestep
350       &                                    Nr,bi,bj,myThid)       &                                    Nr,bi,bj,myThid)
351             CALL TIMEAVE_RESET(Euave(1-OLx,1-OLy,1,1,1,i),             CALL TIMEAVE_RESET(Euave(1-OLx,1-OLy,1,1,1,i),
352       &                                    Nr,bi,bj,myThid)       &                                    Nr,bi,bj,myThid)
353               CALL TIMEAVE_RESET(Estave(1-OLx,1-OLy,1,1,1,i),
354         &                                    Nr,bi,bj,myThid)
355             CALL TIMEAVE_RESET(Eutave(1-OLx,1-OLy,1,1,1,i),             CALL TIMEAVE_RESET(Eutave(1-OLx,1-OLy,1,1,1,i),
356       &                                    Nr,bi,bj,myThid)       &                                    Nr,bi,bj,myThid)
357            enddo            enddo
358  #endif  #endif
359    #ifdef DAR_DIAG_IRR_AMPS
360              do i=1,tlam
361               CALL TIMEAVE_RESET(amp1ave(1-OLx,1-OLy,1,1,1,i),
362         &                                    Nr,bi,bj,myThid)
363               CALL TIMEAVE_RESET(amp2ave(1-OLx,1-OLy,1,1,1,i),
364         &                                    Nr,bi,bj,myThid)
365              enddo
366    #endif
367  #ifdef DAR_DIAG_ABSORP  #ifdef DAR_DIAG_ABSORP
368            do i=1,tlam            do i=1,tlam
369             CALL TIMEAVE_RESET(aave(1-OLx,1-OLy,1,1,1,i),             CALL TIMEAVE_RESET(aave(1-OLx,1-OLy,1,1,1,i),
# Line 368  c set arrays to zero if first timestep Line 388  c set arrays to zero if first timestep
388       &                                    Nr,bi,bj,myThid)       &                                    Nr,bi,bj,myThid)
389            enddo            enddo
390  #endif  #endif
391    #ifdef DAR_RADTRANS
392              CALL TIMEAVE_RESET(rmudave(1-OLx,1-OLy,1,1),
393         &                                   1,bi,bj,myThid)
394    #endif
395  c ANNA_TAVE  c ANNA_TAVE
396  #ifdef WAVES_DIAG_PCHL  #ifdef WAVES_DIAG_PCHL
397            do np=1,npmax            do np=1,npmax
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