/[MITgcm]/MITgcm_contrib/darwin2/pkg/monod/monod_forcing.F
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revision 1.9 by jahn, Mon Jul 30 15:21:51 2012 UTC revision 1.18 by jahn, Fri Jul 24 21:47:26 2015 UTC
# Line 92  c ANNA define variables for wavebands Line 92  c ANNA define variables for wavebands
92         _RL PARw_k(tlam,Nr)         _RL PARw_k(tlam,Nr)
93         _RL PARwup(tlam)         _RL PARwup(tlam)
94         _RL acdom_k(Nr,tlam)         _RL acdom_k(Nr,tlam)
95           _RL Ek_nll(npmax,tlam)
96           _RL EkoverE_nll(npmax,tlam)
97  #ifdef DAR_RADTRANS  #ifdef DAR_RADTRANS
98         integer iday,iyr,imon,isec,lp,wd,mydate(4)         integer iday,iyr,imon,isec,lp,wd,mydate(4)
99         _RL Edwsf(tlam),Eswsf(tlam)         _RL Edwsf(tlam),Eswsf(tlam)
100         _RL Edz(tlam,Nr),Esz(tlam,Nr),Euz(tlam,Nr),Eutop(tlam,Nr)         _RL Edz(tlam,Nr),Esz(tlam,Nr),Euz(tlam,Nr)
101           _RL Estop(tlam,Nr),Eutop(tlam,Nr)
102         _RL tirrq(nr)         _RL tirrq(nr)
103         _RL tirrwq(tlam,nr)         _RL tirrwq(tlam,nr)
104         _RL c1(tlam,nr), c2(tlam,nr)         _RL amp1(tlam,nr), amp2(tlam,nr)
105         _RL solz         _RL solz
106         _RL rmud         _RL rmud
107         _RL actot,bctot,bbctot         _RL actot,bctot,bbctot
108         _RL apart_k(Nr,tlam),bpart_k(Nr,tlam),bbpart_k(Nr,tlam)         _RL apart_k(Nr,tlam),bpart_k(Nr,tlam),bbpart_k(Nr,tlam)
109         _RL bt_k(Nr,tlam), bb_k(Nr,tlam)         _RL bt_k(Nr,tlam), bb_k(Nr,tlam)
110           _RL discEs, discEu
111           INTEGER idiscEs,jdiscEs,kdiscEs,ldiscEs
112           INTEGER idiscEu,jdiscEu,kdiscEu,ldiscEu
113  #else  #else
114         _RL PARwdn(tlam)         _RL PARwdn(tlam)
115  #endif  #endif
# Line 127  C      always need for diagnostics Line 133  C      always need for diagnostics
133  #ifdef GEIDER  #ifdef GEIDER
134        _RL phychl(npmax)        _RL phychl(npmax)
135        _RL phychl_k(npmax,Nr)        _RL phychl_k(npmax,Nr)
136          _RL Ekl(npmax)
137          _RL EkoverEl(npmax)
138          _RL chl2cl(npmax)
139  #ifdef DYNAMIC_CHL  #ifdef DYNAMIC_CHL
140        _RL dphychl(npmax)        _RL dphychl(npmax)
141        _RL chlup(npmax)        _RL chlup(npmax)
142          _RL accliml(npmax)
143  #endif  #endif
144  #endif  #endif
145  #ifdef ALLOW_CDOM  #ifdef ALLOW_CDOM
# Line 330  COJ Line 340  COJ
340          enddo          enddo
341         ENDDO         ENDDO
342         ENDDO         ENDDO
343    
344    #ifdef DAR_RADTRANS
345           idiscEs = 0
346           jdiscEs = 0
347           kdiscEs = 0
348           ldiscEs = 0
349           idiscEu = 0
350           jdiscEu = 0
351           kdiscEu = 0
352           ldiscEu = 0
353           discEs = 0.
354           discEu = 0.
355    #endif
356  c  c
357  c bio-chemical time loop  c bio-chemical time loop
358  c--------------------------------------------------  c--------------------------------------------------
# Line 399  C        always fill; this will be the s Line 422  C        always fill; this will be the s
422  C        way it won't blow up for weird diagnostics periods.  C        way it won't blow up for weird diagnostics periods.
423  C        we fill before updating, so the diag is the one used in this time  C        we fill before updating, so the diag is the one used in this time
424  C        step  C        step
425           CALL DIAGNOSTICS_FILL(           IF ( useDiagnostics ) THEN
426              CALL DIAGNOSTICS_FILL(
427       &         PARday(1-Olx,1-Oly,1,bi,bj,PARiprev),'PARday  ',       &         PARday(1-Olx,1-Oly,1,bi,bj,PARiprev),'PARday  ',
428       &         0,Nr,2,bi,bj,myThid )       &         0,Nr,2,bi,bj,myThid )
429             ENDIF
430  #endif  #endif
431  #endif /* ALLOW_PAR_DAY */  #endif /* ALLOW_PAR_DAY */
432    
# Line 482  c ------------ GET INCIDENT NON-SPECTRAL Line 507  c ------------ GET INCIDENT NON-SPECTRAL
507    
508  #else /* not USE_QSW */  #else /* not USE_QSW */
509    
510           lite = sfac(j)*maskC(i,j,1,bi,bj)/86400*1 _d 6  C        convert W/m2 to uEin/s/m2
511             lite = sfac(j)*parconv*maskC(i,j,1,bi,bj)
512    
513  #endif /* not USE_QSW */  #endif /* not USE_QSW */
514  #endif /* not READ_PAR */  #endif /* not READ_PAR */
# Line 625  c           add water and CDOM Line 651  c           add water and CDOM
651              bt_k(k,ilam) = bw(ilam) + bctot + bpart_k(k,ilam)              bt_k(k,ilam) = bw(ilam) + bctot + bpart_k(k,ilam)
652              bb_k(k,ilam) = darwin_bbw*bw(ilam)+bbctot+bbpart_k(k,ilam)              bb_k(k,ilam) = darwin_bbw*bw(ilam)+bbctot+bbpart_k(k,ilam)
653              bb_k(k,ilam) = MAX(darwin_bbmin, bb_k(k,ilam))              bb_k(k,ilam) = MAX(darwin_bbmin, bb_k(k,ilam))
654    c           initialize output variables
655                Edz(ilam,k) = 0.0
656                Esz(ilam,k) = 0.0
657                Euz(ilam,k) = 0.0
658                Estop(ilam,k) = 0.0
659                Eutop(ilam,k) = 0.0
660                amp1(ilam,k) = 0.0
661                amp2(ilam,k) = 0.0
662            ENDDO            ENDDO
663           ENDDO           ENDDO
664    
665  #ifdef DAR_RADTRANS_ITERATIVE           IF (darwin_radtrans_niter.GE.0) THEN
666           call MONOD_RADTRANS_ITER(             call MONOD_RADTRANS_ITER(
667       I                dz_k,rmud,Edwsf,Eswsf,a_k,bt_k,bb_k,       I                dz_k,rmud,Edwsf,Eswsf,a_k,bt_k,bb_k,
668       I                darwin_radtrans_kmax,darwin_radtrans_niter,       I                darwin_radtrans_kmax,darwin_radtrans_niter,
669       O                Edz,Esz,Euz,Eutop,       O                Edz,Esz,Euz,Eutop,
670       O                tirrq,tirrwq,       O                tirrq,tirrwq,
671       O                c1,c2,       O                amp1,amp2,
672       I                myThid)       I                myThid)
673  #else           ELSEIF (darwin_radtrans_niter.EQ.-1) THEN
674  c dzlocal ?????  c dzlocal ?????
675           call MONOD_RADTRANS(             call MONOD_RADTRANS(
676       I                drF,rmud,Edwsf,Eswsf,a_k,bt_k,bb_k,       I                drF,rmud,Edwsf,Eswsf,a_k,bt_k,bb_k,
677       O                Edz,Esz,Euz,Eutop,       O                Edz,Esz,Euz,Eutop,
678       O                tirrq,tirrwq,       O                tirrq,tirrwq,
679       I                myThid)       I                myThid)
680             ELSE
681               call MONOD_RADTRANS_DIRECT(
682         I                dz_k,rmud,Edwsf,Eswsf,a_k,bt_k,bb_k,
683         I                darwin_radtrans_kmax,
684         O                Edz,Esz,Euz,Estop,Eutop,
685         O                tirrq,tirrwq,
686         O                amp1,amp2,
687         I                myThid)
688    #ifdef DAR_CHECK_IRR_CONT
689               IF( dz_k(1) .GT. 0.0 )THEN
690               DO ilam = 1,tlam
691               IF(Eswsf(ilam).GE.darwin_radmodThresh .OR.
692         &        Edwsf(ilam).GE.darwin_radmodThresh ) THEN
693                IF(ABS(Estop(ilam,1)-Eswsf(ilam)) .GT. discEs )THEN
694                  discEs = ABS(Estop(ilam,1)-Eswsf(ilam))
695                  idiscEs = i
696                  jdiscEs = j
697                  kdiscEs = 1
698                  ldiscEs = ilam
699                ENDIF
700                DO k=1,darwin_radtrans_kmax-1
701                 IF(ABS(Estop(ilam,k+1)-Esz(ilam,k)) .GT. discEs)THEN
702                  discEs = ABS(Estop(ilam,k+1)-Esz(ilam,k))
703                  idiscEs = i
704                  jdiscEs = j
705                  kdiscEs = k+1
706                  ldiscEs = ilam
707                 ENDIF
708                 IF(ABS(Eutop(ilam,k+1)-Euz(ilam,k)) .GT. discEu)THEN
709                  discEu = ABS(Eutop(ilam,k+1)-Euz(ilam,k))
710                  idiscEu = i
711                  jdiscEu = j
712                  kdiscEu = k+1
713                  ldiscEu = ilam
714                 ENDIF
715                ENDDO
716               ENDIF
717               ENDDO
718               ENDIF
719  #endif  #endif
720             ENDIF
721  c  c
722  c uses chl from prev timestep (as wavebands does)  c uses chl from prev timestep (as wavebands does)
723  c keep like this in case need to consider upwelling irradiance as affecting the grid box above  c keep like this in case need to consider upwelling irradiance as affecting the grid box above
# Line 820  c taking from igsm dic run - fed through Line 894  c taking from igsm dic run - fed through
894  c               pCO2local=surfaceForcingT(i,j,bi,bj)  c               pCO2local=surfaceForcingT(i,j,bi,bj)
895  c or from darwin carbon module  c or from darwin carbon module
896  #ifdef ALLOW_CARBON  #ifdef ALLOW_CARBON
897    #ifdef pH_3D
898                   pCO2local=pCO2(i,j,k,bi,bj)
899    #else
900                 pCO2local=pCO2(i,j,bi,bj)                 pCO2local=pCO2(i,j,bi,bj)
901    #endif
902  #else  #else
903                 pCO2local=280. _d -6                 pCO2local=280. _d -6
904  #endif  #endif
# Line 899  c set other arguments to zero Line 977  c set other arguments to zero
977                  NfixPl(np)=0. _d 0                  NfixPl(np)=0. _d 0
978  #endif  #endif
979  #endif  #endif
980    #ifdef DAR_DIAG_PARW
981                    chl2cl(np)=0. _d 0
982    #endif
983    #ifdef DAR_DIAG_EK
984                    Ekl(np)=0. _d 0
985                    EkoverEl(np)=0. _d 0
986                    do ilam=1,tlam
987                      Ek_nll(np,ilam)=0. _d 0
988                      EkoverE_nll(np,ilam)=0. _d 0
989                    enddo
990    #endif
991               enddo               enddo
992    
993    
# Line 968  c ANNA pass extra variables if WAVEBANDS Line 1057  c ANNA pass extra variables if WAVEBANDS
1057  #endif  #endif
1058  #ifdef GEIDER  #ifdef GEIDER
1059       O                       phychl,       O                       phychl,
1060    #ifdef DAR_DIAG_EK
1061         I                       Ekl, EkoverEl,
1062    #endif
1063    #ifdef DAR_DIAG_PARW
1064         I                       chl2cl,
1065    #endif
1066  #ifdef DYNAMIC_CHL  #ifdef DYNAMIC_CHL
1067       I                       dphychl,       I                       dphychl,
1068       I                       chlup,       I                       chlup,
1069    #ifdef DAR_DIAG_EK
1070         O                       accliml,
1071    #endif
1072  #endif  #endif
1073  #ifdef ALLOW_CDOM  #ifdef ALLOW_CDOM
1074       O                       dcdoml,       O                       dcdoml,
# Line 978  c ANNA pass extra variables if WAVEBANDS Line 1076  c ANNA pass extra variables if WAVEBANDS
1076  #endif  #endif
1077  #ifdef WAVEBANDS  #ifdef WAVEBANDS
1078       I                       PARw_k(1,k),       I                       PARw_k(1,k),
1079    #ifdef DAR_DIAG_EK
1080         I                       Ek_nll, EkoverE_nll,
1081    #endif
1082  #endif  #endif
1083  #endif  #endif
1084  #ifdef ALLOW_PAR_DAY  #ifdef ALLOW_PAR_DAY
# Line 1121  c ---- end steph's alternative Line 1222  c ---- end steph's alternative
1222                  dfetl=dfetl+fet_flx(i,j,k,bi,bj)                  dfetl=dfetl+fet_flx(i,j,k,bi,bj)
1223                  dsil=dsil+si_flx(i,j,k,bi,bj)                  dsil=dsil+si_flx(i,j,k,bi,bj)
1224  #endif  #endif
1225  c  
1226    #ifdef ALLOW_OBCS
1227              IF (useOBCS) THEN
1228                dpo4l  = dpo4l *maskInC(i,j,bi,bj)
1229                dno3l  = dno3l *maskInC(i,j,bi,bj)
1230                dfetl  = dfetl *maskInC(i,j,bi,bj)
1231                dsil   = dsil  *maskInC(i,j,bi,bj)
1232                ddopl  = ddopl *maskInC(i,j,bi,bj)
1233                ddonl  = ddonl *maskInC(i,j,bi,bj)
1234                ddofel = ddofel*maskInC(i,j,bi,bj)
1235                dpopl  = dpopl *maskInC(i,j,bi,bj)
1236                dponl  = dponl *maskInC(i,j,bi,bj)
1237                dpofel = dpofel*maskInC(i,j,bi,bj)
1238                dpsil  = dpsil *maskInC(i,j,bi,bj)
1239                dnh4l  = dnh4l *maskInC(i,j,bi,bj)
1240                dno2l  = dno2l *maskInC(i,j,bi,bj)
1241                DO nz = 1,nzmax
1242                 dzoop (nz) = dzoop (nz)*maskInC(i,j,bi,bj)
1243                 dzoon (nz) = dzoon (nz)*maskInC(i,j,bi,bj)
1244                 dzoofe(nz) = dzoofe(nz)*maskInC(i,j,bi,bj)
1245                 dzoosi(nz) = dzoosi(nz)*maskInC(i,j,bi,bj)
1246                ENDDO
1247                DO np = 1,npmax
1248                 dPhy(np) = dPhy(np)*maskInC(i,j,bi,bj)
1249    #ifdef GEIDER
1250    #ifdef DYNAMIC_CHL
1251                 dphychl(np) = dphychl(np)*maskInC(i,j,bi,bj)
1252    #endif
1253    #endif
1254                ENDDO
1255    #ifdef ALLOW_CDOM
1256                dcdoml = dcdoml*maskInC(i,j,bi,bj)
1257    #endif
1258    #ifdef ALLOW_CARBON
1259                ddicl = ddicl*maskInC(i,j,bi,bj)
1260                ddocl = ddocl*maskInC(i,j,bi,bj)
1261                dpocl = dpocl*maskInC(i,j,bi,bj)
1262                dpicl = dpicl*maskInC(i,j,bi,bj)
1263                dalkl = dalkl*maskInC(i,j,bi,bj)
1264                do2l  = do2l *maskInC(i,j,bi,bj)
1265                DO nz = 1,nzmax
1266                 dzoocl(nz) = dzoocl(nz)*maskInC(i,j,bi,bj)
1267                ENDDO
1268    #endif
1269              ENDIF
1270    #endif
1271    
1272  c now update main tracer arrays  c now update main tracer arrays
1273            dtplankton = PTRACERS_dTLev(k)/float(nsubtime)            dtplankton = PTRACERS_dTLev(k)/float(nsubtime)
1274            Ptr(i,j,k,bi,bj,iPO4 ) = Ptr(i,j,k,bi,bj,iPO4) +            Ptr(i,j,k,bi,bj,iPO4 ) = Ptr(i,j,k,bi,bj,iPO4) +
# Line 1316  c    &                       deltaTclock Line 1463  c    &                       deltaTclock
1463       &                           phychl(np)*dtplankton       &                           phychl(np)*dtplankton
1464               enddo               enddo
1465  #endif  #endif
1466    #ifdef DAR_DIAG_PARW
1467                do ilam=1,tlam
1468                   PARwave(i,j,k,bi,bj,ilam)=PARwave(i,j,k,bi,bj,ilam)+
1469         &                           PARw_k(ilam,k)*dtplankton
1470                enddo
1471                do np=1,npmax
1472                  chl2cave(i,j,k,bi,bj,np)=chl2cave(i,j,k,bi,bj,np)+
1473         &                          chl2cl(np)*dtplankton
1474                enddo
1475    #endif
1476  #ifdef DAR_DIAG_ACDOM  #ifdef DAR_DIAG_ACDOM
1477  c            print*,'acdom',k,acdom_k(k,darwin_diag_acdom_ilam)  c            print*,'acdom',k,acdom_k(k,darwin_diag_acdom_ilam)
1478               aCDOMave(i,j,k,bi,bj)=aCDOMave(i,j,k,bi,bj)+               aCDOMave(i,j,k,bi,bj)=aCDOMave(i,j,k,bi,bj)+
# Line 1337  Coj            no Eu at surface (yet) Line 1494  Coj            no Eu at surface (yet)
1494                 Euave(i,j,k,bi,bj,ilam)=Euave(i,j,k,bi,bj,ilam)+                 Euave(i,j,k,bi,bj,ilam)=Euave(i,j,k,bi,bj,ilam)+
1495       &                                 Euz(ilam,k-1)*dtplankton       &                                 Euz(ilam,k-1)*dtplankton
1496                endif                endif
1497                  Estave(i,j,k,bi,bj,ilam)=Estave(i,j,k,bi,bj,ilam)+
1498         &                                 Estop(ilam,k)*dtplankton
1499                Eutave(i,j,k,bi,bj,ilam)=Eutave(i,j,k,bi,bj,ilam)+                Eutave(i,j,k,bi,bj,ilam)=Eutave(i,j,k,bi,bj,ilam)+
1500       &                                 Eutop(ilam,k)*dtplankton       &                                 Eutop(ilam,k)*dtplankton
1501               enddo               enddo
1502  #endif  #endif
1503  #ifdef DAR_DIAG_IRR_AMPS  #ifdef DAR_DIAG_IRR_AMPS
1504               do ilam = 1,tlam               do ilam = 1,tlam
1505                 c1ave(i,j,k,bi,bj,ilam)=c1ave(i,j,k,bi,bj,ilam)+                 amp1ave(i,j,k,bi,bj,ilam)=amp1ave(i,j,k,bi,bj,ilam)+
1506       &                                 c1(ilam,k)*dtplankton       &                                 amp1(ilam,k)*dtplankton
1507                 c2ave(i,j,k,bi,bj,ilam)=c2ave(i,j,k,bi,bj,ilam)+                 amp2ave(i,j,k,bi,bj,ilam)=amp2ave(i,j,k,bi,bj,ilam)+
1508       &                                 c2(ilam,k)*dtplankton       &                                 amp2(ilam,k)*dtplankton
1509               enddo               enddo
1510  #endif  #endif
1511  #ifdef DAR_DIAG_ABSORP  #ifdef DAR_DIAG_ABSORP
# Line 1379  Coj            no Eu at surface (yet) Line 1538  Coj            no Eu at surface (yet)
1538       &                                 rmud*dtplankton       &                                 rmud*dtplankton
1539               endif               endif
1540  #endif  #endif
1541    #ifdef DAR_DIAG_EK
1542                do np=1,npmax
1543                 Ekave(i,j,k,bi,bj,np)=Ekave(i,j,k,bi,bj,np)+
1544         &                        Ekl(np)*dtplankton
1545                 EkoverEave(i,j,k,bi,bj,np)=EkoverEave(i,j,k,bi,bj,np)+
1546         &                        EkoverEl(np)*dtplankton
1547                 acclimave(i,j,k,bi,bj,np)=acclimave(i,j,k,bi,bj,np)+
1548         &                        accliml(np)*dtplankton
1549                 do ilam=1,tlam
1550                    Ek_nlave(i,j,k,bi,bj,np,ilam)=
1551         &                        Ek_nlave(i,j,k,bi,bj,np,ilam)+
1552         &                        Ek_nll(np,ilam)*dtplankton
1553                    EkoverE_nlave(i,j,k,bi,bj,np,ilam)=
1554         &                        EkoverE_nlave(i,j,k,bi,bj,np,ilam)+
1555         &                        EkoverE_nll(np,ilam)*dtplankton
1556                 enddo
1557                enddo
1558    #endif
1559  #ifdef DAR_DIAG_RSTAR  #ifdef DAR_DIAG_RSTAR
1560               do np=1,npmax               do np=1,npmax
1561                 Rstarave(i,j,k,bi,bj,np)=Rstarave(i,j,k,bi,bj,np)+                 Rstarave(i,j,k,bi,bj,np)=Rstarave(i,j,k,bi,bj,np)+
# Line 1424  Coj            no Eu at surface (yet) Line 1601  Coj            no Eu at surface (yet)
1601       &                              FluxCO2(i,j,bi,bj)*dtplankton       &                              FluxCO2(i,j,bi,bj)*dtplankton
1602                SUROave(i,j,bi,bj)   =SUROave(i,j,bi,bj)+                SUROave(i,j,bi,bj)   =SUROave(i,j,bi,bj)+
1603       &                              flxO2(i,j)*dtplankton       &                              flxO2(i,j)*dtplankton
1604                 endif
1605    #ifdef pH_3D
1606                  pCO2ave(i,j,k,bi,bj)   =pCO2ave(i,j,k,bi,bj)+
1607         &                              pCO2(i,j,k,bi,bj)*dtplankton
1608                  pHave(i,j,k,bi,bj)     =pHave(i,j,k,bi,bj)+
1609         &                              pH(i,j,k,bi,bj)*dtplankton
1610    #else
1611                 if (k.eq.1) then
1612                pCO2ave(i,j,bi,bj)   =pCO2ave(i,j,bi,bj)+                pCO2ave(i,j,bi,bj)   =pCO2ave(i,j,bi,bj)+
1613       &                              pCO2(i,j,bi,bj)*dtplankton       &                              pCO2(i,j,bi,bj)*dtplankton
1614                pHave(i,j,bi,bj)     =pHave(i,j,bi,bj)+                pHave(i,j,bi,bj)     =pHave(i,j,bi,bj)+
1615       &                              pH(i,j,bi,bj)*dtplankton       &                              pH(i,j,bi,bj)*dtplankton
1616               endif               endif
1617  #endif  #endif
1618    #endif
1619            endif              endif  
1620  c end if hFac>0  c end if hFac>0
1621    
# Line 1484  C       reset the other slot for averagi Line 1670  C       reset the other slot for averagi
1670  C itistime  C itistime
1671  #endif  #endif
1672    
1673    #ifdef DAR_CHECK_IRR_CONT
1674           i = myXGlobalLo-1+(bi-1)*sNx+idiscEs
1675           j = myYGlobalLo-1+(bj-1)*sNy+jdiscEs
1676           write(6,'(I4.4,X,A,4(X,I4),1PE24.16)')myProcId,'max Es disc',
1677         &                                   i,j,kdiscEs,ldiscEs,discEs
1678           i = myXGlobalLo-1+(bi-1)*sNx+idiscEu
1679           j = myYGlobalLo-1+(bj-1)*sNy+jdiscEu
1680           write(6,'(I4.4,X,A,4(X,I4),1PE24.16)')myProcId,'max Eu disc',
1681         &                                   i,j,kdiscEu,ldiscEu,discEu
1682    #endif
1683    
1684  COJ fill diagnostics  COJ fill diagnostics
1685  #ifdef ALLOW_DIAGNOSTICS  #ifdef ALLOW_DIAGNOSTICS
1686         IF ( useDiagnostics ) THEN         IF ( useDiagnostics ) THEN
# Line 1563  c ANNA end TAVE Line 1760  c ANNA end TAVE
1760       &                         0,1,2,bi,bj,myThid )       &                         0,1,2,bi,bj,myThid )
1761          CALL DIAGNOSTICS_FILL( flxO2(1-Olx,1-Oly), 'DICOFLX ',          CALL DIAGNOSTICS_FILL( flxO2(1-Olx,1-Oly), 'DICOFLX ',
1762       &                         0,1,2,bi,bj,myThid )       &                         0,1,2,bi,bj,myThid )
1763    #ifdef pH_3D
1764            CALL DIAGNOSTICS_FILL( pCO2(1-Olx,1-Oly,1,bi,bj), 'DICPCO2 ',
1765         &                         0,Nr,2,bi,bj,myThid )
1766            CALL DIAGNOSTICS_FILL( pH(1-Olx,1-Oly,1,bi,bj), 'DICPHAV ',
1767         &                         0,Nr,2,bi,bj,myThid )
1768    #else
1769          CALL DIAGNOSTICS_FILL( pCO2(1-Olx,1-Oly,bi,bj), 'DICPCO2 ',          CALL DIAGNOSTICS_FILL( pCO2(1-Olx,1-Oly,bi,bj), 'DICPCO2 ',
1770       &                         0,1,2,bi,bj,myThid )       &                         0,1,2,bi,bj,myThid )
1771          CALL DIAGNOSTICS_FILL( pH(1-Olx,1-Oly,bi,bj), 'DICPHAV ',          CALL DIAGNOSTICS_FILL( pH(1-Olx,1-Oly,bi,bj), 'DICPHAV ',
1772       &                         0,1,2,bi,bj,myThid )       &                         0,1,2,bi,bj,myThid )
1773    #endif
1774  #endif /* ALLOW_CARBON */  #endif /* ALLOW_CARBON */
1775         ENDIF         ENDIF
1776  #endif /* ALLOW_DIAGNOSTICS */  #endif /* ALLOW_DIAGNOSTICS */
# Line 1579  c determine iron partitioning  - solve f Line 1783  c determine iron partitioning  - solve f
1783  c  c
1784  #ifdef ALLOW_TIMEAVE  #ifdef ALLOW_TIMEAVE
1785  c save averages  c save averages
1786         do k=1,nR           dar_timeave(bi,bj) = dar_timeave(bi,bj) + dtplankton
          dar_timeave(bi,bj,k)=dar_timeave(bi,bj,k)  
      &                         +dtplankton  
1787  #ifdef ALLOW_CARBON  #ifdef ALLOW_CARBON
1788           dic_timeave(bi,bj,k)=dic_timeave(bi,bj,k)           dic_timeave(bi,bj) = dic_timeave(bi,bj) + dtplankton
      &                         +dtplankton  
1789  #endif  #endif
        enddo  
1790  #endif  #endif
1791  c  c
1792  c -----------------------------------------------------  c -----------------------------------------------------
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