/[MITgcm]/MITgcm/verification/testreport
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revision 1.88 by jmc, Tue Aug 29 00:18:35 2006 UTC revision 1.92 by jmc, Wed Sep 5 01:46:37 2007 UTC
# Line 15  usage() Line 15  usage()
15      echo "  (-mpi)                   compile and run using MPI"      echo "  (-mpi)                   compile and run using MPI"
16      echo "  (-ieee|-noieee)          if possible, use IEEE compiler flags"      echo "  (-ieee|-noieee)          if possible, use IEEE compiler flags"
17      echo "                             (DEF=\"-ieee\")"      echo "                             (DEF=\"-ieee\")"
18      echo "  (-optfile=|-of=)STRING   list of optfiles to use"      echo "  (-of=|-optfile=)STRING   list of optfiles to use"
19      echo "  (-a|-addr) STRING        list of email recipients"      echo "  (-a|-addr) STRING        list of email recipients"
20      echo "                             (DEF=\"edhill@mitgcm.org\")"      echo "                             (DEF=\"edhill@mitgcm.org\")"
21      echo "  (-t|-tdir) STRING        list of group and/or exp. dirs to test"      echo "  (-t|-tdir) STRING        list of group and/or exp. dirs to test"
22      echo "                             (recognized groups: basic, tutorials)"      echo "                             (recognized groups: basic, tutorials)"
23      echo "                             (DEF=\"\" which test all)"      echo "                             (DEF=\"\" which test all)"
24        echo "  (-skd|-skipdir) STRING   list of exp. dirs to skip"
25        echo "                             (DEF=\"\" which test all)"
26      echo "  (-b|-bash) STRING        preferred location of a \"bash\" or"      echo "  (-b|-bash) STRING        preferred location of a \"bash\" or"
27      echo "                             Bourne-compatible \"sh\" shell"      echo "                             Bourne-compatible \"sh\" shell"
28      echo "                             (DEF=\"\" for \"bash\")"      echo "                             (DEF=\"\" for \"bash\")"
# Line 31  usage() Line 33  usage()
33      echo "                             (DEF=\"make\")"      echo "                             (DEF=\"make\")"
34      echo "  (-odir) STRING           used to build output directory name"      echo "  (-odir) STRING           used to build output directory name"
35      echo "                             (DEF=\"hostname\")"      echo "                             (DEF=\"hostname\")"
36      echo "  (-ptracers|-ptr) STRING  specify which ptracers to test"      echo "  (-ptr|-ptracers) STRING  specify which ptracers to test"
37      echo "                             (DEF=\"1 2 3 4 5\")"      echo "                             (DEF=\"1 2 3 4 5\")"
38        echo "  (-match) NUMBER          Matching Criteria (number of digits)"
39        echo "                             (DEF=\"12\")"
40      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"
41      echo "  (-clean)                 *ONLY* run \"make CLEAN\""      echo "  (-clean)                 *ONLY* run \"make CLEAN\""
42      echo "  (-quick|-q)              same as \"-nogenmake -noclean -nodepend\""      echo "  (-quick|-q)              same as \"-nogenmake -noclean -nodepend\""
# Line 40  usage() Line 44  usage()
44      echo "  (-noclean|-nc)           skip the \"make clean\" stage"      echo "  (-noclean|-nc)           skip the \"make clean\" stage"
45      echo "  (-nodepend|-nd)          skip the \"make depend\" stage"      echo "  (-nodepend|-nd)          skip the \"make depend\" stage"
46      echo "  (-deldir|-dd)            on success, delete the output directory"      echo "  (-deldir|-dd)            on success, delete the output directory"
47        echo "  (-ts)                    provide timing information per timestep"
48        echo "  (-papis)                 provide MFlop/s per timestep using PAPI"
49        echo "  (-pcls)                  provide MFlop/s per timestep using PCL"
50      echo      echo
51      echo "and where STRING can be a whitespace-delimited list"      echo "and where STRING can be a whitespace-delimited list"
52      echo "such as:"      echo "such as:"
# Line 150  testoutput_for_prop() Line 157  testoutput_for_prop()
157      echo "-1" >> tmp3.txt      echo "-1" >> tmp3.txt
158      # On the SGI O3K (*not* the O2K), "cat -n" inserts a ":" after the line number      # On the SGI O3K (*not* the O2K), "cat -n" inserts a ":" after the line number
159      cat tmp3.txt | sed -e 's|:||g' > tmp4.txt      cat tmp3.txt | sed -e 's|:||g' > tmp4.txt
160      digits_of_similarity=`./tmp_cmpnum < tmp4.txt`      digits_of_similarity=`./tr_cmpnum < tmp4.txt`
161      if [ $digits_of_similarity -eq 99 ]; then      if [ $digits_of_similarity -eq 99 ]; then
162          if [ $verbose -gt 0 ]; then          if [ $verbose -gt 0 ]; then
163              echo testoutput_for_prop: No comparison was available for \"$2\" 1>&2              echo testoutput_for_prop: No comparison was available for \"$2\" 1>&2
# Line 191  testoutput_ad() Line 198  testoutput_ad()
198      join t06.txt t16.txt > t6.txt      join t06.txt t16.txt > t6.txt
199      echo "-1" >> t5.txt      echo "-1" >> t5.txt
200      echo "-1" >> t6.txt      echo "-1" >> t6.txt
201      digits_5=`./tmp_cmpnum < t5.txt`      digits_5=`./tr_cmpnum < t5.txt`
202      digits_6=`./tmp_cmpnum < t6.txt`      digits_6=`./tr_cmpnum < t6.txt`
203      dashnum $digits_5 $digits_6      dashnum $digits_5 $digits_6
204      rm -f t[01][56].txt t[56].txt      rm -f t[01][56].txt t[56].txt
205  }  }
# Line 316  genmakemodel() Line 323  genmakemodel()
323              if test "x$MPI" = xt ; then              if test "x$MPI" = xt ; then
324                  command="$command -mpi"                  command="$command -mpi"
325              fi              fi
326                if test "x$TS" = xt ; then
327                    command="$command -ts"
328                fi
329                if test "x$PAPIS" = xt ; then
330                    command="$command -papis"
331                else
332                if test "x$PCLS" = xt ; then
333                    command="$command -pcls"
334                fi
335                fi
336              printf 'genmake ... ' 1>&2              printf 'genmake ... ' 1>&2
337              $command > make.log 2>&1              $command > make.log 2>&1
338              RETVAL=$?              RETVAL=$?
# Line 590  createcodelet() Line 607  createcodelet()
607      # create codelet for comparing model output      # create codelet for comparing model output
608    
609      printf "creating the comparison code...  "      printf "creating the comparison code...  "
610      cat > tmp_cmpnum.c <<EOF      cat > tr_cmpnum.c <<EOF
611  #include <stdio.h>  #include <stdio.h>
612  #include <math.h>  #include <math.h>
613  int main( int argc, char** argv )  {  int main( int argc, char** argv )  {
614    int linnum,best,lncnt;    int linnum,cmplin,best,lncnt;
615    double a,b,abave,relerr;    double a,b,abave,relerr;
616    best = -22;    best = -22;
617    lncnt = 0;    lncnt = 0;
# Line 603  int main( int argc, char** argv )  { Line 620  int main( int argc, char** argv )  {
620      if (linnum == -1)  break;      if (linnum == -1)  break;
621      scanf("%lf", &a);  scanf("%lf", &b);      scanf("%lf", &a);  scanf("%lf", &b);
622      abave = 0.5*(fabs(a)+fabs(b));      abave = 0.5*(fabs(a)+fabs(b));
623      if (abave > 0.0) {      if ( abave == abave ) {
624        relerr=fabs(a-b)/abave;        if (abave > 0.0) {
625        if (relerr > 0.0) { linnum = (int)rint(log10(relerr)); }          relerr=fabs(a-b)/abave;
626        else { linnum = -16 ; }          if (relerr > 0.0) { cmplin = (int)rint(log10(relerr)); }
627        best = (best > linnum) ? best : linnum;          else { cmplin = -16 ; }
628      }          best = (best > cmplin) ? best : cmplin; }
629          else { cmplin = -22 ; }
630       /* printf("%d ; %lf ; %lf\n",cmplin,a,b); */
631          }
632       else {
633       /* printf("%lf ; %lf ; %lf\n",abave,a,b); */
634          break; }
635    }    }
636    if (lncnt == 999) best=-29;    if (lncnt == 999) best=-29;
637      if (linnum != -1) best=-99;
638    printf("%d\n", -best);    printf("%d\n", -best);
639    return 0;    return 0;
640  }  }
641  EOF  EOF
642      $CC -o tmp_cmpnum tmp_cmpnum.c -lm      $CC -o tr_cmpnum tr_cmpnum.c -lm
643    
644      if [ -x ./tmp_cmpnum ]; then      if [ -x ./tr_cmpnum ]; then
645          echo "OK"          echo "OK"
646          return 0          return 0
647      else      else
# Line 640  formatresults() Line 664  formatresults()
664      if [ $1 = '--' ]; then      if [ $1 = '--' ]; then
665          printf ' N/O '          printf ' N/O '
666      else      else
667          if [ $1 -gt 12 ]; then          if [ $1 -ge $MATCH_CRIT ]; then
668              printf ' pass'              printf ' pass'
669          else          else
670              printf ' FAIL'              printf ' FAIL'
# Line 651  formatresults() Line 675  formatresults()
675            
676  }  }
677    
 show_help()  
 {  
     cat - << EOF  
 $0 [-help] [-quick] [-verbose] dir1 [dir2] [...]  
   
  -help|-h      Show this help message  
  -quiet     Reduce the amount of output  
  -verbose   Produce copious amounts of output  
  -debug     Produce even more output which will mean nothing to most  
  -force     Do "make CLEAN" before compiling. This forces a complete rebuild.  
  -clean     Do "make CLEAN" after compiling and testing.  
  -cleanup   Aggresively removes all model output, executables and object files  
             and then exits. Use with care.  
   
 Normal usage:  
  $0 *       Configure, compile, run and analyze in all experiment directories  
 EOF  
 }  
   
678  scandirs()  scandirs()
679  {  {
680      if [ $# -eq 1 ]; then      if [ $# -eq 1 ]; then
# Line 709  BASH= Line 714  BASH=
714  OPTFILE=NONE  OPTFILE=NONE
715  ADDRESSES=  ADDRESSES=
716  TESTDIRS=  TESTDIRS=
717    SKIPDIRS=
718  MPACKDIR="../tools/mpack-1.6"  MPACKDIR="../tools/mpack-1.6"
719  HAVE_MPACK=  HAVE_MPACK=
720  MPACK="$MPACKDIR/mpack"  MPACK="$MPACKDIR/mpack"
# Line 730  ADM= Line 736  ADM=
736  # Additional monitor types  # Additional monitor types
737  PTRACERS_NUM="1 2 3 4 5"  PTRACERS_NUM="1 2 3 4 5"
738    
739    MATCH_CRIT=13
740    
741  printf "parsing options...  "  printf "parsing options...  "
742    
743  ac_prev=  ac_prev=
# Line 764  for ac_option ; do Line 772  for ac_option ; do
772          -tdir=* | --tdir=*)          -tdir=* | --tdir=*)
773              TESTDIRS=$ac_optarg ;;              TESTDIRS=$ac_optarg ;;
774    
775            -skipdir | --skipdir | -skd | --skd)
776                ac_prev=SKIPDIRS ;;
777            -skipdir=* | --skipdir=*)
778                SKIPDIRS=$ac_optarg ;;
779    
780          -bash | --bash | -b | --b)          -bash | --bash | -b | --b)
781              ac_prev=BASH ;;              ac_prev=BASH ;;
782          -bash=* | --bash=*)          -bash=* | --bash=*)
# Line 789  for ac_option ; do Line 802  for ac_option ; do
802          -ptracers=* | --ptracers=* | -ptr=* | --ptr=*)          -ptracers=* | --ptracers=* | -ptr=* | --ptr=*)
803              PTRACERS_NUM=$ac_optarg ;;              PTRACERS_NUM=$ac_optarg ;;
804    
805            -match | --match ) ac_prev=MATCH_CRIT ;;
806            -match=* | --match=* ) MATCH_CRIT=$ac_optarg ;;
807    
808          -j) ac_prev=JOBS ;;          -j) ac_prev=JOBS ;;
809          -j=*) JOBS=$ac_optarg ;;          -j=*) JOBS=$ac_optarg ;;
810    
# Line 822  for ac_option ; do Line 838  for ac_option ; do
838    
839          -deldir | -dd) DELDIR=t ;;          -deldir | -dd) DELDIR=t ;;
840    
841            -ts) TS=t;;
842    
843            -papis) PAPIS=t;;
844    
845            -pcls) PCL=t;;
846    
847          -*)          -*)
848              echo "Error: unrecognized option: "$ac_option              echo "Error: unrecognized option: "$ac_option
849              usage              usage
# Line 844  fi Line 866  fi
866    
867  if test "x$TESTDIRS" = x ; then  if test "x$TESTDIRS" = x ; then
868      if test "x$ADM" = xt ; then      if test "x$ADM" = xt ; then
869          TESTDIRS=`scandirs results_ad`          LIST=`scandirs results_ad`
870      else      else
871          TESTDIRS=`scandirs results`          LIST=`scandirs results`
872      fi      fi
873  else  else
874      #- expand group of experiments:      #- expand group of experiments:
# Line 863  else Line 885  else
885          *)       LIST=${LIST}" "$xx ;;          *)       LIST=${LIST}" "$xx ;;
886        esac        esac
887      done      done
888      #echo 'LIST='${LIST}'<'  fi
889      #- remove duplicate and non-directory:  #echo 'LIST='${LIST}'<'
890      TESTDIRS=" "  #- skip dirs, remove duplicate and non-directory:
891      for xx in $LIST  TESTDIRS=" "
892      do  count=0
893    for xx in $LIST
894    do
895        yy=`echo $SKIPDIRS | grep -c $xx`
896        if test $yy = 0 ; then
897          if test -d $xx ; then          if test -d $xx ; then
898              yy=`echo $TESTDIRS | grep -c $xx`              yy=`echo $TESTDIRS | grep -c $xx`
899              if test $yy = 0 ; then TESTDIRS=${TESTDIRS}" "$xx ; fi              if test $yy = 0 ; then TESTDIRS=${TESTDIRS}" "$xx ; fi
900          else          else count=1 ;
901              echo " -- skip \"$xx\" : not a directory !"              echo ""; echo -n " -- skip \"$xx\" (not a directory !)"
902          fi          fi
903      done      else
904  fi          if test $count = 1 ; then echo -n ", \"$xx\""
905            else count=1 ; echo "" ;  echo -n " skip: \"$xx\""
906            fi
907        fi
908    done
909    if test $count = 1 ; then echo "" ; echo -n " ... " ; fi
910  #echo 'TESTDIRS='${TESTDIRS}'<'  #echo 'TESTDIRS='${TESTDIRS}'<'
911    
912  if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM_OF" != x ; then  if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM_OF" != x ; then
# Line 963  fi Line 994  fi
994  echo  echo
995  echo >> $SUMMARY  echo >> $SUMMARY
996  if test "x$ADM" = x ; then  if test "x$ADM" = x ; then
997      line_0="            ----T-----  ----S-----  ----U-----  ----V-----"      if [ $MATCH_CRIT -lt 10 ] ;
998        then line_0="      "$MATCH_CRIT ;
999        else line_0="     "$MATCH_CRIT ; fi
1000        line_0="   $line_0  ----T-----  ----S-----  ----U-----  ----V-----"
1001    #   line_0="            ----T-----  ----S-----  ----U-----  ----V-----"
1002      line_1="G D M    c        m  s        m  s        m  s        m  s"      line_1="G D M    c        m  s        m  s        m  s        m  s"
1003      line_2="E p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  ."      line_2="E p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  ."
1004      line_3="N n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d"      line_3="N n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d"
# Line 1208  else Line 1243  else
1243      fi      fi
1244  fi  fi
1245    
1246  # rm -f tmp_cmpnum.f a.out  rm -f tr_cmpnum.c tr_cmpnum
 rm -f tmp_cmpnum.c tmp_cmpnum  
1247    
1248  if test "x$CLEANUP" != xt ; then  if test "x$CLEANUP" != xt ; then
1249      cat $SUMMARY | sed 's/ -- -- -- --//g'      cat $SUMMARY | sed 's/ -- -- -- --//g'
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changed lines
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