/[MITgcm]/MITgcm/verification/testreport
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Diff of /MITgcm/verification/testreport

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revision 1.71 by jmc, Tue Aug 16 17:12:46 2005 UTC revision 1.80 by jmc, Thu Jun 8 21:39:35 2006 UTC
# Line 125  testoutput_for_prop() Line 125  testoutput_for_prop()
125          fi          fi
126          return 99          return 99
127      fi      fi
128      non_real_numb=`egrep -c -i 'NAN|INF' tmp1.txt`      has_nan=`cat tmp1.txt | grep -i nan | wc -l`
129      if [ $non_real_numb -gt 0 ]; then      if [ $has_nan -gt 0  ] ; then
130          echo testoutput_for_prop: output.txt has $non_real_numb not real numbers 1>&2          echo testoutput_for_prop: output.txt contains $has_nan NaN values  1>&2
131            return 99
132        fi
133        has_inf=`cat tmp1.txt | grep -i inf | wc -l`
134        if [ $has_inf -gt 0  ] ; then
135            echo testoutput_for_prop: output.txt contains $has_inf Inf values  1>&2
136          return 99          return 99
137      fi      fi
138      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
# Line 176  dashnum() Line 181  dashnum()
181    
182  testoutput_ad()  testoutput_ad()
183  {  {
184      grep $3 $1/results_ad/output.txt_adm | awk '{print NR " " $5}' > t05.txt      grep $3 $1/results_ad/output_adm.txt | awk '{print NR " " $5}' > t05.txt
185      grep $3 $1/$2/output.txt_adm | awk '{print NR " " $5}' > t15.txt      grep $3 $1/$2/output_adm.txt | awk '{print NR " " $5}' > t15.txt
186      grep $3 $1/results_ad/output.txt_adm | awk '{print NR " " $6}' > t06.txt      grep $3 $1/results_ad/output_adm.txt | awk '{print NR " " $6}' > t06.txt
187      grep $3 $1/$2/output.txt_adm | awk '{print NR " " $6}' > t16.txt      grep $3 $1/$2/output_adm.txt | awk '{print NR " " $6}' > t16.txt
188      join t05.txt t15.txt > t5.txt      join t05.txt t15.txt > t5.txt
189      join t06.txt t16.txt > t6.txt      join t06.txt t16.txt > t6.txt
190      echo "-1" >> t5.txt      echo "-1" >> t5.txt
# Line 299  genmakemodel() Line 304  genmakemodel()
304                  command="$command --mods=../code"                  command="$command --mods=../code"
305              else              else
306                  command="$command --mods=../code_ad"                  command="$command --mods=../code_ad"
                 command="$command -adof=../../../tools/adjoint_options/adjoint_staf"  
307              fi              fi
308              if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then              if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then
309                  command="$command --optfile=$OPTFILE"                  command="$command --optfile=$OPTFILE"
# Line 485  linkdata() Line 489  linkdata()
489                      fi                      fi
490                  done                  done
491              else              else
                 files=`( cd ../input ; ls -1 *.bin | grep -v CVS )`  
                 for i in $files ; do  
                     if test ! -d "../input/"$i ; then  
                         ln -sf "../input/"$i $i  
                     fi  
                 done  
492                  files=`( cd ../input_ad ; ls -1 | grep -v CVS )`                  files=`( cd ../input_ad ; ls -1 | grep -v CVS )`
493                  for i in $files ; do                  for i in $files ; do
494                      if test ! -d "../input_ad/"$i ; then                      if test ! -d "../input_ad/"$i ; then
495                          ln -sf "../input_ad/"$i $i                          ln -sf "../input_ad/"$i $i
496                      fi                      fi
497                  done                  done
498                    files=`( cd ../input ; ls -1 | grep -v CVS )`
499                    for i in $files ; do
500                        if test ! -d "../input/"$i ; then
501                         if test ! -r $i  ; then
502                            ln -sf "../input/"$i $i
503                         fi
504                        fi
505                    done
506              fi              fi
507          )          )
508      fi      fi
# Line 510  runmodel() Line 516  runmodel()
516      #  (where "$COMMAND" is relative to "directory")      #  (where "$COMMAND" is relative to "directory")
517      (      (
518          cd $1          cd $1
519          printf 'runmodel ... ' 1>&2          printf 'runmodel in %s ...' $1 1>&2
520          # make output.txt          # make output.txt
521          echo          echo
522          rm -f run.log          rm -f run.log
523            if test $OUTPUTFILE -ot $EXECUTABLE ; then
524               ( eval $COMMAND ) > run.log 2>&1
525               RETVAL=$?
526            else
527               echo " $OUTPUTFILE is up to date " > run.log 2>&1
528               RETVAL=0
529            fi
530          # echo "COMMAND='$COMMAND'"          # echo "COMMAND='$COMMAND'"
531          # echo "pwd='"`pwd`"'"          # echo "pwd='"`pwd`"'"
         ( eval $COMMAND ) > run.log 2>&1  
         RETVAL=$?  
532          if test "x$RETVAL" = x0 ; then          if test "x$RETVAL" = x0 ; then
533              tail run.log              tail run.log
534              echo successful 1>&2              echo successful 1>&2
# Line 525  runmodel() Line 536  runmodel()
536              # if test "x$ADM" = x ; then              # if test "x$ADM" = x ; then
537              #   cp output.txt $CDIR"/output.txt"              #   cp output.txt $CDIR"/output.txt"
538              # else              # else
539              #   cp output.txt_adm $CDIR"/output.txt_adm"              #   cp output_adm.txt $CDIR"/output_adm.txt"
540              # fi              # fi
541              if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi              if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi
542              return 0              return 0
# Line 801  if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM Line 812  if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM
812      OPTFILE=$MITGCM_OF      OPTFILE=$MITGCM_OF
813  fi  fi
814    
815    if test "x$ADM" = xt ; then
816        EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"
817        OUTPUTFILE="output_adm.txt"
818    else
819        EXECUTABLE="mitgcmuv"
820        OUTPUTFILE="output.txt"
821    fi
822    
823  if test "x$ADM" = xt -a "x$COMMAND" = x ; then  if test "x$ADM" = xt -a "x$COMMAND" = x ; then
824      COMMAND="./mitgcmuv_ad > output.txt_adm 2>&1"      COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"
825  fi  fi
826    
827  if test "x$COMMAND" = x ; then  if test "x$COMMAND" = x ; then
828      COMMAND="$MAKE output.txt"      COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"
829  fi  fi
830    
831  echo "OK"  #echo "OK"
832    echo "OK (COMMAND= $COMMAND )"
833    
834  #  create the FORTRAN comparison code  #  create the FORTRAN comparison code
835  createcodelet  createcodelet
# Line 931  for dir in $TESTDIRS ; do Line 951  for dir in $TESTDIRS ; do
951      if test "x$ADM" = x ; then      if test "x$ADM" = x ; then
952          fout=$dir"/results/output.txt"          fout=$dir"/results/output.txt"
953      else      else
954          fout=$dir"/results_ad/output.txt_adm"          fout=$dir"/results_ad/output_adm.txt"
955      fi      fi
956      if test ! -r $fout ; then      if test ! -r $fout ; then
957          echo "can't read \"$fout\" -- skipping $dir"          echo "can't read \"$fout\" -- skipping $dir"
# Line 986  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1006  for dir in $TESTDIRS ; do
1006      echo "Experiment:  $dir"      echo "Experiment:  $dir"
1007      echo      echo
1008      unset genmake makedepend make run      unset genmake makedepend make run
1009      results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'      results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'
1010    
1011      #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir combination      #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir combination
1012      rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir      rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir
# Line 1018  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1038  for dir in $TESTDIRS ; do
1038          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"
1039    
1040          for ex in $extra_runs ; do          for ex in $extra_runs ; do
1041                unset run
1042                results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'
1043                #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir.ex combination
1044                rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir"."$ex
1045                mkdir $rel_CDIR
1046                CDIR=`pwd`"/$rel_CDIR"
1047              test ! -e "$dir/tr_run.$ex" && mkdir "$dir/tr_run.$ex"              test ! -e "$dir/tr_run.$ex" && mkdir "$dir/tr_run.$ex"
1048              for ldir in input.$ex input ; do              for ldir in input.$ex input ; do
1049                  (                  (
# Line 1037  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1063  for dir in $TESTDIRS ; do
1063              done              done
1064              ldir=build              ldir=build
1065              (              (
1066                  cd "$dir/$ldir" > /dev/null 2>&1                  cd $dir/tr_run.$ex
1067                  ls -1 Makefile *.[fFhco] mitgcmuv  2>/dev/null \                  test ! -e mitgcmuv  &&  ln -s "../"$ldir"/"mitgcmuv .
                     | sed -e 's|^CVS$||g' | sed -e 's|^output.txt$||g'  
             ) > tr_exrun_links  
             (  
                 cd "$dir/tr_run.$ex"  
                     cat ../../tr_exrun_links | while read i ; do  
                         if test ! "x$i" = x ; then  
                             test ! -r $i  &&  ln -s "../"$ldir"/"$i $i  
                         fi  
                     done  
1068              )              )
             test -e tr_exrun_links  &&  rm -f tr_exrun_links  
1069              runmodel $dir/tr_run.$ex && run=Y \              runmodel $dir/tr_run.$ex && run=Y \
1070                  && results=`testoutput $dir tr_run.$ex "."$ex`                  && results=`testoutput $dir tr_run.$ex "."$ex`
1071              fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`              fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`
# Line 1061  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1077  for dir in $TESTDIRS ; do
1077              echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"
1078              echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"
1079              echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
1080              echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "tdir='$dir.$ex'" >> $CDIR"/summary.txt"
1081          done          done
1082      else      else
1083          fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`          fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`
# Line 1073  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1089  for dir in $TESTDIRS ; do
1089          echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"
1090          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
1091          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"
1092            grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/$rundir/$OUTPUTFILE \
1093                               >> $CDIR"/summary.txt"
1094      fi      fi
1095    
1096      postclean $dir/$builddir      postclean $dir/$builddir
Legend:
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changed lines
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