/[MITgcm]/MITgcm/verification/testreport
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Diff of /MITgcm/verification/testreport

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revision 1.68 by edhill, Tue Jun 7 22:21:47 2005 UTC revision 1.79 by heimbach, Wed Jun 7 01:20:26 2006 UTC
# Line 27  usage() Line 27  usage()
27      echo "                             (DEF=\"make output.txt\")"      echo "                             (DEF=\"make output.txt\")"
28      echo "  (-m|-make) STRING        command to use for \"make\""      echo "  (-m|-make) STRING        command to use for \"make\""
29      echo "                             (DEF=\"make\")"      echo "                             (DEF=\"make\")"
30        echo "  (-odir) STRING           used to build output directory name"
31        echo "                             (DEF=\"hostname\")"
32      echo "  (-ptracers|-ptr) STRING  specify which ptracers to test"      echo "  (-ptracers|-ptr) STRING  specify which ptracers to test"
33      echo "                             (DEF=\"1 2 3 4 5\")"      echo "                             (DEF=\"1 2 3 4 5\")"
34      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"
# Line 123  testoutput_for_prop() Line 125  testoutput_for_prop()
125          fi          fi
126          return 99          return 99
127      fi      fi
128        has_nan=`cat tmp1.txt | grep -i nan | wc -l`
129        if [ $has_nan -gt 0  ] ; then
130            echo testoutput_for_prop: output.txt contains $has_nan NaN values  1>&2
131            return 99
132        fi
133        has_inf=`cat tmp1.txt | grep -i inf | wc -l`
134        if [ $has_inf -gt 0  ] ; then
135            echo testoutput_for_prop: output.txt contains $has_inf Inf values  1>&2
136            return 99
137        fi
138      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
139          echo testoutput_for_prop: join tmp1.txt tmp2.txt 1>&2          echo testoutput_for_prop: join tmp1.txt tmp2.txt 1>&2
140      fi      fi
# Line 169  dashnum() Line 181  dashnum()
181    
182  testoutput_ad()  testoutput_ad()
183  {  {
184      grep $3 $1/results_ad/output.txt_adm | awk '{print NR " " $5}' > t05.txt      grep $3 $1/results_ad/output_adm.txt | awk '{print NR " " $5}' > t05.txt
185      grep $3 $1/$2/output.txt_adm | awk '{print NR " " $5}' > t15.txt      grep $3 $1/$2/output_adm.txt | awk '{print NR " " $5}' > t15.txt
186      grep $3 $1/results_ad/output.txt_adm | awk '{print NR " " $6}' > t06.txt      grep $3 $1/results_ad/output_adm.txt | awk '{print NR " " $6}' > t06.txt
187      grep $3 $1/$2/output.txt_adm | awk '{print NR " " $6}' > t16.txt      grep $3 $1/$2/output_adm.txt | awk '{print NR " " $6}' > t16.txt
188      join t05.txt t15.txt > t5.txt      join t05.txt t15.txt > t5.txt
189      join t06.txt t16.txt > t6.txt      join t06.txt t16.txt > t6.txt
190      echo "-1" >> t5.txt      echo "-1" >> t5.txt
# Line 292  genmakemodel() Line 304  genmakemodel()
304                  command="$command --mods=../code"                  command="$command --mods=../code"
305              else              else
306                  command="$command --mods=../code_ad"                  command="$command --mods=../code_ad"
                 command="$command -adof=../../../tools/adjoint_options/adjoint_staf"  
307              fi              fi
308              if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then              if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then
309                  command="$command --optfile=$OPTFILE"                  command="$command --optfile=$OPTFILE"
# Line 503  runmodel() Line 514  runmodel()
514      #  (where "$COMMAND" is relative to "directory")      #  (where "$COMMAND" is relative to "directory")
515      (      (
516          cd $1          cd $1
517          printf 'runmodel ... ' 1>&2          printf 'runmodel in %s ...' $1 1>&2
518          # make output.txt          # make output.txt
519          echo          echo
520          rm -f run.log          rm -f run.log
521            if test $OUTPUTFILE -ot $EXECUTABLE ; then
522               ( eval $COMMAND ) > run.log 2>&1
523               RETVAL=$?
524            else
525               echo " $OUTPUTFILE is up to date " > run.log 2>&1
526               RETVAL=0
527            fi
528          # echo "COMMAND='$COMMAND'"          # echo "COMMAND='$COMMAND'"
529          # echo "pwd='"`pwd`"'"          # echo "pwd='"`pwd`"'"
         ( eval $COMMAND ) > run.log 2>&1  
         RETVAL=$?  
530          if test "x$RETVAL" = x0 ; then          if test "x$RETVAL" = x0 ; then
531              tail run.log              tail run.log
532              echo successful 1>&2              echo successful 1>&2
# Line 518  runmodel() Line 534  runmodel()
534              # if test "x$ADM" = x ; then              # if test "x$ADM" = x ; then
535              #   cp output.txt $CDIR"/output.txt"              #   cp output.txt $CDIR"/output.txt"
536              # else              # else
537              #   cp output.txt_adm $CDIR"/output.txt_adm"              #   cp output_adm.txt $CDIR"/output_adm.txt"
538              # fi              # fi
539              if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi              if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi
540              return 0              return 0
# Line 668  if test "x$CC" = x ; then Line 684  if test "x$CC" = x ; then
684  fi  fi
685  JOBS=  JOBS=
686  MPI=f  MPI=f
687    OUTDIR=
688  DELDIR=  DELDIR=
689    
690  ADM=  ADM=
# Line 724  for ac_option ; do Line 741  for ac_option ; do
741          -make=* | --make=*)          -make=* | --make=*)
742              MAKE=$ac_optarg ;;              MAKE=$ac_optarg ;;
743    
744            -odir | --odir)
745                ac_prev=OUTDIR ;;
746            -odir=* | --odir=*)
747                OUTDIR=$ac_optarg ;;
748    
749          -ptracers | --ptracers | -ptr | --ptr)          -ptracers | --ptracers | -ptr | --ptr)
750              ac_prev=PTRACERS_NUM ;;              ac_prev=PTRACERS_NUM ;;
751          -ptracers=* | --ptracers=* | -ptr=* | --ptr=*)          -ptracers=* | --ptracers=* | -ptr=* | --ptr=*)
# Line 733  for ac_option ; do Line 755  for ac_option ; do
755          -j=*) JOBS=$ac_optarg ;;          -j=*) JOBS=$ac_optarg ;;
756    
757          -clean | --clean)          -clean | --clean)
758              CLEANUP=t ;;              CLEANUP=t ; DELDIR=t ;;
759    
760          -quick | --quick | -q | --q)          -quick | --quick | -q | --q)
761              QUICK=t ;;              QUICK=t ;;
# Line 788  if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM Line 810  if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM
810      OPTFILE=$MITGCM_OF      OPTFILE=$MITGCM_OF
811  fi  fi
812    
813    if test "x$ADM" = xt ; then
814        EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"
815        OUTPUTFILE="output_adm.txt"
816    else
817        EXECUTABLE="mitgcmuv"
818        OUTPUTFILE="output.txt"
819    fi
820    
821  if test "x$ADM" = xt -a "x$COMMAND" = x ; then  if test "x$ADM" = xt -a "x$COMMAND" = x ; then
822      COMMAND="./mitgcmuv_ad > output.txt_adm 2>&1"      COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"
823  fi  fi
824    
825  if test "x$COMMAND" = x ; then  if test "x$COMMAND" = x ; then
826      COMMAND="$MAKE output.txt"      COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"
827  fi  fi
828    
829  echo "OK"  #echo "OK"
830    echo "OK (COMMAND= $COMMAND )"
831    
832  #  create the FORTRAN comparison code  #  create the FORTRAN comparison code
833  createcodelet  createcodelet
# Line 813  MACH=`hostname` Line 844  MACH=`hostname`
844  UNAMEA=`uname -a`  UNAMEA=`uname -a`
845  DATE=`date +%Y%m%d`  DATE=`date +%Y%m%d`
846  BASE="tr_"$MACH"_"$DATE"_"  BASE="tr_"$MACH"_"$DATE"_"
847    if test "x$OUTDIR" != x ; then
848        BASE="tr_"$OUTDIR"_"$DATE"_"
849    fi
850  DNUM=0  DNUM=0
851  DRESULTS="$BASE$DNUM"  DRESULTS="$BASE$DNUM"
852  while test -e $DRESULTS ; do  while test -e $DRESULTS ; do
# Line 915  for dir in $TESTDIRS ; do Line 949  for dir in $TESTDIRS ; do
949      if test "x$ADM" = x ; then      if test "x$ADM" = x ; then
950          fout=$dir"/results/output.txt"          fout=$dir"/results/output.txt"
951      else      else
952          fout=$dir"/results_ad/output.txt_adm"          fout=$dir"/results_ad/output_adm.txt"
953      fi      fi
954      if test ! -r $fout ; then      if test ! -r $fout ; then
955          echo "can't read \"$fout\" -- skipping $dir"          echo "can't read \"$fout\" -- skipping $dir"
# Line 970  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1004  for dir in $TESTDIRS ; do
1004      echo "Experiment:  $dir"      echo "Experiment:  $dir"
1005      echo      echo
1006      unset genmake makedepend make run      unset genmake makedepend make run
1007      results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'      results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'
1008    
1009      #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir combination      #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir combination
1010      rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir      rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir
# Line 1002  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1036  for dir in $TESTDIRS ; do
1036          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"
1037    
1038          for ex in $extra_runs ; do          for ex in $extra_runs ; do
1039                unset run
1040                results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'
1041                #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir.ex combination
1042                rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir"."$ex
1043                mkdir $rel_CDIR
1044                CDIR=`pwd`"/$rel_CDIR"
1045              test ! -e "$dir/tr_run.$ex" && mkdir "$dir/tr_run.$ex"              test ! -e "$dir/tr_run.$ex" && mkdir "$dir/tr_run.$ex"
1046              for ldir in input.$ex input ; do              for ldir in input.$ex input ; do
1047                  (                  (
# Line 1021  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1061  for dir in $TESTDIRS ; do
1061              done              done
1062              ldir=build              ldir=build
1063              (              (
1064                  cd "$dir/$ldir" > /dev/null 2>&1                  cd $dir/tr_run.$ex
1065                  ls -1 Makefile *.[fFhco] mitgcmuv  2>/dev/null \                  test ! -e mitgcmuv  &&  ln -s "../"$ldir"/"mitgcmuv .
                     | sed -e 's|^CVS$||g' | sed -e 's|^output.txt$||g'  
             ) > tr_exrun_links  
             (  
                 cd "$dir/tr_run.$ex"  
                     cat ../../tr_exrun_links | while read i ; do  
                         if test ! "x$i" = x ; then  
                             test ! -r $i  &&  ln -s "../"$ldir"/"$i $i  
                         fi  
                     done  
1066              )              )
             test -e tr_exrun_links  &&  rm -f tr_exrun_links  
1067              runmodel $dir/tr_run.$ex && run=Y \              runmodel $dir/tr_run.$ex && run=Y \
1068                  && results=`testoutput $dir tr_run.$ex "."$ex`                  && results=`testoutput $dir tr_run.$ex "."$ex`
1069              fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`              fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`
# Line 1045  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1075  for dir in $TESTDIRS ; do
1075              echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"
1076              echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"
1077              echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
1078              echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "tdir='$dir.$ex'" >> $CDIR"/summary.txt"
1079          done          done
1080      else      else
1081          fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`          fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`
# Line 1057  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1087  for dir in $TESTDIRS ; do
1087          echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"
1088          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
1089          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"
1090            grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/$rundir/$OUTPUTFILE \
1091                               >> $CDIR"/summary.txt"
1092      fi      fi
1093    
1094      postclean $dir/$builddir      postclean $dir/$builddir
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