/[MITgcm]/MITgcm/verification/testreport

Diff of /MITgcm/verification/testreport

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-revision 1.49 by edhill,
Tue Nov 23 21:25:24 2004 UTC
+revision 1.67 by jmc,
Sun Feb  6 16:58:08 2005 UTC
 Line 27 
 usage()
      echo "                             (DEF=\"make output.txt\")"
      echo "  (-m|-make) STRING        command to use for \"make\""
      echo "                             (DEF=\"make\")"
+     echo "  (-ptracers|-ptr) STRING  specify which ptracers to test"
+     echo "                             (DEF=\"1 2 3 4 5\")"
      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"
      echo "  (-clean)                 *ONLY* run \"make CLEAN\""
      echo "  (-quick|-q)              same as \"-nogenmake -noclean -nodepend\""
-Line 35 
 usage()
+Line 37 
 usage()
      echo "  (-nodepend|-nd)          skip the \"make depend\" stage"
      echo "  (-deldir|-dd)            on success, delete the output directory"
      echo
-     echo "and where STRING follows a whitespace-delimited format"
+     echo "and where STRING can be a whitespace-delimited list"
      echo "such as:"
+     echo
      echo "  -t 'exp0 exp2 exp3' "
      echo "  -addr='abc@123.com testing@home.org'"
      echo
+     echo "provided that the expression is properly quoted within the current"
+     echo "shell (note the use of single quotes to protect white space)."
+     echo
      exit 1
  }
-Line 89 
 testoutput_for_prop()
+Line 95 
 testoutput_for_prop()
      fi
      if [ -r $1/$4/output.txt ]; then
          grep "$2" $1/$4/output.txt | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp1.txt
-         lncnt=`wc -l tmp1.txt | awk '{print $1}' `
+         lncntA=`wc -l tmp1.txt | awk '{print $1}' `
-         if [ $lncnt -lt 3 ]; then
+         if [ $lncntA -lt 3 ]; then
              if [ $verbose -gt 0 ]; then
                  echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2
              fi
-Line 104 
 testoutput_for_prop()
+Line 110 
 testoutput_for_prop()
          echo testoutput_for_prop: grep "$2" $1/results/output.txt$5 1>&2
      fi
      grep "$2" $1/results/output.txt$5 | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp2.txt
-     lncnt=`wc -l tmp2.txt | awk '{print $1}' `
+     lncntB=`wc -l tmp2.txt | awk '{print $1}' `
-     if [ $lncnt -lt 3 ]; then
+     if [ $lncntB -lt 3 ]; then
          if [ $verbose -gt 0 ]; then
              echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2
          fi
          return 99
      fi
+     if [ $lncntA -ne $lncntB ]; then
+         if [ $verbose -gt 0 ]; then
+             echo Not same Nb of lines when searching for "$2" ":" $lncntA $lncntB 1>&2
+         fi
+         return 99
+     fi
      if [ $debug -gt 0 ]; then
          echo testoutput_for_prop: join tmp1.txt tmp2.txt 1>&2
      fi
-Line 178 
 check_for_add_mon_output()
+Line 190 
 check_for_add_mon_output()
          return
      fi
+     for ii in $PTRACERS_NUM ; do
+         eval "HAVE_PTR0"$ii"=f"
+     done
      ptr_add="trcstat_ptracerXX_min trcstat_ptracerXX_max"
      ptr_add="$ptr_add trcstat_ptracerXX_mean trcstat_ptracerXX_sd"
-     for ii in 1 2 3 4 5 ; do
+     for ii in $PTRACERS_NUM ; do
          for jj in $ptr_add ; do
              name=`eval "echo $jj | sed -e 's|XX|0"$ii"|g'"`
              tst=`grep $name $1 | wc -l | awk '{print $1}'`
-Line 222 
 testoutput()
+Line 238 
 testoutput()
          testoutput_for_prop $1 "dynstat_vvel_mean" "V mean" $2 $3; vmean=$?
          testoutput_for_prop $1 "dynstat_vvel_sd" "V s.d." $2 $3; vsd=$?
-         for ii in 1 2 3 4 5 ; do
+         #  This is for PTRACERS
-             testoutput_for_prop $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_min"  "p0"$ii"_min"  $2 $3
+         for ii in $PTRACERS_NUM ; do
-             RETVAL=$? ; eval `echo "p0"$ii"_min="$RETVAL`
+             eval `echo "p0"$ii"_min=99"`
-             testoutput_for_prop $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_max"  "p0"$ii"_max"  $2 $3
+             eval `echo "p0"$ii"_max=99"`
-             RETVAL=$? ; eval `echo "p0"$ii"_max="$RETVAL`
+             eval `echo "p0"$ii"_mean=99"`
-             testoutput_for_prop $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_mean" "p0"$ii"_mean" $2 $3
+             eval `echo "p0"$ii"_sd=99"`
-             RETVAL=$? ; eval `echo "p0"$ii"_mean="$RETVAL`
+             tst=`eval 'echo "$HAVE_PTR0'$ii'"'`
-             testoutput_for_prop $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_sd"   "p0"$ii"_sd"   $2 $3
+             #echo 'tst = '$tst
-             RETVAL=$? ; eval `echo "p0"$ii"_sd="$RETVAL`
+             if test "x$tst" = xt ; then
+                 a="trcstat_ptracer0"
+                 testoutput_for_prop $1 "$a"$ii"_min"  "p0"$ii"_min"  $2 $3
+                 RETVAL=$? ; eval `echo "p0"$ii"_min="$RETVAL`
+                 testoutput_for_prop $1 "$a"$ii"_max"  "p0"$ii"_max"  $2 $3
+                 RETVAL=$? ; eval `echo "p0"$ii"_max="$RETVAL`
+                 testoutput_for_prop $1 "$a"$ii"_mean" "p0"$ii"_mean" $2 $3
+                 RETVAL=$? ; eval `echo "p0"$ii"_mean="$RETVAL`
+                 testoutput_for_prop $1 "$a"$ii"_sd"   "p0"$ii"_sd"   $2 $3
+                 RETVAL=$? ; eval `echo "p0"$ii"_sd="$RETVAL`
+             fi
          done
          allargs="$cg2dres $tmin $tmax $tmean $tsd $smin $smax $smean $ssd"
-Line 274 
 genmakemodel()
+Line 300 
 genmakemodel()
              if test "x$IEEE" != x ; then
                  command="$command -ieee"
              fi
+             if test "x$MPI" = xt ; then
+                 command="$command -mpi"
+             fi
              printf 'genmake ... ' 1>&2
              $command > make.log 2>&1
              RETVAL=$?
-Line 430 
 linkdata()
+Line 459 
 linkdata()
              if test "x$ADM" = x ; then
                  files=`( cd ../input ; ls -1 | grep -v CVS )`
                  for i in $files ; do
-                     if test ! -d "../input/"$i ; then
+                     if test ! -d "../input/"$i -a ! -f $i ; then
                          ln -sf "../input/"$i $i
                      fi
                  done
-Line 499 
 createcodelet()
+Line 528 
 createcodelet()
  #include <math.h>
  int main( int argc, char** argv )  {
    int linnum,best,lncnt;
-   double a,b,diff;
+   double a,b,abave,relerr;
-   best = -16;
+   best = -22;
    lncnt = 0;
    while( 1 & (lncnt+=1) < 999 )  {
      scanf("%d", &linnum);
      if (linnum == -1)  break;
      scanf("%lf", &a);  scanf("%lf", &b);
-     diff = 0.5*(fabs(a)+fabs(b));
+     abave = 0.5*(fabs(a)+fabs(b));
-     if (diff > 1.e-12) {
+     if (abave > 0.0) {
-       diff=fabs(a-b)/diff;
+       relerr=fabs(a-b)/abave;
-       if (diff > 0.0) {
+       if (relerr > 0.0) { linnum = (int)rint(log10(relerr)); }
-         linnum = (int)log10(diff);
+       else { linnum = -16 ; }
-         best = (best > linnum) ? best : linnum;
+       best = (best > linnum) ? best : linnum;
-       }
-       else {
-         if (best == -16 && diff != 0)  best = -22;
-       }
      }
    }
    if (lncnt == 999) best=-29;
-Line 523 
 int main( int argc, char** argv )  {
+Line 548 
 int main( int argc, char** argv )  {
    return 0;
  }
  EOF
-     cc -o tmp_cmpnum tmp_cmpnum.c -lm
+     $CC -o tmp_cmpnum tmp_cmpnum.c -lm
      if [ -x ./tmp_cmpnum ]; then
          echo "OK"
          return 0
      else
          echo
-         echo "ERROR: failed to compile comparison code"
+         echo "ERROR: failed to compile comparison code -- please specify"
+         echo "  a C compiler using the CC environment variable."
          exit 1
      fi
  }
-Line 619 
 MPACKDIR="../tools/mpack-1.6"
+Line 645 
 MPACKDIR="../tools/mpack-1.6"
  HAVE_MPACK=
  MPACK="$MPACKDIR/mpack"
  COMMAND=
- MAKE=make
+ if test "x$MAKE" = x ; then
+     MAKE=make
+ fi
+ if test "x$CC" = x ; then
+     CC=cc
+ fi
  JOBS=
  MPI=f
  DELDIR=
-Line 627 
 DELDIR=
+Line 658 
 DELDIR=
  ADM=
  # Additional monitor types
- # HAVE_PTR01=
+ PTRACERS_NUM="1 2 3 4 5"
- # HAVE_PTR02=
- # HAVE_PTR03=
- # HAVE_PTR04=
- # HAVE_PTR05=
  printf "parsing options...  "
-Line 682 
 for ac_option ; do
+Line 709 
 for ac_option ; do
          -make=* | --make=*)
              MAKE=$ac_optarg ;;
+         -ptracers | --ptracers | -ptr | --ptr)
+             ac_prev=PTRACERS_NUM ;;
+         -ptracers=* | --ptracers=* | -ptr=* | --ptr=*)
+             PTRACERS_NUM=$ac_optarg ;;
          -j) ac_prev=JOBS ;;
          -j=*) JOBS=$ac_optarg ;;
-Line 813 
 if test "x$ADM" = x ; then
+Line 845 
 if test "x$ADM" = x ; then
      line_2="E p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  ."
      line_3="N n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d"
      line_4="2 d e n  d  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  ."
-     for ii in 1 2 3 4 5 ; do
+     for ii in $PTRACERS_NUM ; do
          #  tst=`eval 'echo $HAVE_PTR0'$ii`
          #  if test "x$tst" = xt ; then
          line_0="$line_0  --PTR 0"$ii"--"
-Line 852 
 for dir in $TESTDIRS ; do
+Line 884 
 for dir in $TESTDIRS ; do
          if test -r $dir/input/Makefile ; then
              ( cd $dir/input ; make CLEAN )
          fi
+         (
+             cd $dir
+             rm -rf tr_run.*
+         )
          continue
      fi
-Line 867 
 for dir in $TESTDIRS ; do
+Line 903 
 for dir in $TESTDIRS ; do
          echo "can't read \"$fout\" -- skipping $dir"
          continue
      fi
+     if test "x$ADM" = x ; then
+         check_for_add_mon_output  $fout
+     fi
      # Check for additional types of monitor output
-     check_for_add_mon_output  $fout
      builddir="input"
      rundir="input"
-Line 945 
 for dir in $TESTDIRS ; do
+Line 983 
 for dir in $TESTDIRS ; do
          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"
-         OLD_COMMAND=$COMMAND
-         COMMAND="./mitgcmuv > output.txt"
          for ex in $extra_runs ; do
-             test -e "$dir/tr_run.$ex" && rm -rf "$dir/tr_run.$ex"
+             test ! -e "$dir/tr_run.$ex" && mkdir "$dir/tr_run.$ex"
-             mkdir "$dir/tr_run.$ex"
+             for ldir in input.$ex input ; do
-             links=`( cd "$dir/input" > /dev/null 2>&1 ; ls -1 | grep -v CVS )`
+                 (
+                     cd "$dir/$ldir" > /dev/null 2>&1
+                     ls -1 2>/dev/null \
+                         | sed -e 's|^CVS$||g' | sed -e 's|^output.txt$||g'
+                 ) > tr_exrun_links
+                 (
+                     cd "$dir/tr_run.$ex"
+                     cat ../../tr_exrun_links | while read i ; do
+                         if test ! "x$i" = x ; then
+                             test ! -r $i  &&  ln -s "../"$ldir"/"$i $i
+                         fi
+                     done
+                 )
+                 test -e tr_exrun_links  &&  rm -f tr_exrun_links
+             done
+             ldir=build
+             (
+                 cd "$dir/$ldir" > /dev/null 2>&1
+                 ls -1 Makefile *.[fFhco] mitgcmuv  2>/dev/null \
+                     | sed -e 's|^CVS$||g' | sed -e 's|^output.txt$||g'
+             ) > tr_exrun_links
              (
                  cd "$dir/tr_run.$ex"
-                 for i in $links; do
+                     cat ../../tr_exrun_links | while read i ; do
-                     ln -s ../input/$i $i
+                         if test ! "x$i" = x ; then
-                 done
+                             test ! -r $i  &&  ln -s "../"$ldir"/"$i $i
-             )
+                         fi
-             links=`( cd "$dir/input.$ex" > /dev/null 2>&1 ; ls -1 | grep -v CVS )`
+                     done
-             (
-                 cd "$dir/tr_run.$ex"
-                 for i in $links; do
-                     test -e $i  &&  rm -f $i
-                     ln -s ../input.$ex/$i $i
-                 done
-                 ln -s ../$builddir/mitgcmuv mitgcmuv
              )
+             test -e tr_exrun_links  &&  rm -f tr_exrun_links
              runmodel $dir/tr_run.$ex && run=Y \
                  && results=`testoutput $dir tr_run.$ex "."$ex`
              fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`
-Line 979 
 for dir in $TESTDIRS ; do
+Line 1029 
 for dir in $TESTDIRS ; do
              echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
              echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"
          done
-         COMMAND=$OLD_COMMAND
      else
          fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`
          fres=$fres"$results   $dir"
-Line 1032 
 fi
+Line 1081 
 fi
  rm -f tmp_cmpnum.c tmp_cmpnum
  if test "x$CLEANUP" != xt ; then
-     cat $SUMMARY
+     cat $SUMMARY | sed 's/ -- -- -- --//g'
      if test -e tr_out.txt ; then
          mv tr_out.txt tr_out.txt.old
      fi
-     cat $SUMMARY > tr_out.txt
+     cat $SUMMARY | sed 's/ -- -- -- --//g' > tr_out.txt
  fi
  if test "x$DELDIR" = xt ; then

 Legend:



Removed from v.1.49
 


changed lines


 
Added in v.1.67
 Legend:



Removed from v.1.49
 


changed lines


 
Added in v.1.67
-Removed from v.1.49
+Added in v.1.67

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