/[MITgcm]/MITgcm/verification/testreport
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Diff of /MITgcm/verification/testreport

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revision 1.2 by edhill, Mon Sep 1 16:50:27 2003 UTC revision 1.20 by edhill, Wed Nov 26 15:04:42 2003 UTC
# Line 1  Line 1 
1  #!/bin/bash  #! /usr/bin/env bash
2  #  #
3  #  $Header$  #  $Header$
4    #  $Name$
5  #  #
6    
7  usage()  usage()
# Line 10  usage() Line 11  usage()
11      echo      echo
12      echo "where possible OPTIONS are:"      echo "where possible OPTIONS are:"
13      echo "  (-help|-h)               print usage"      echo "  (-help|-h)               print usage"
14      echo "  (-optfile=|-of=)STRING   list of genmake2 \"optfiles\""      echo "  (-mpi)                   use MPI input files"
15      echo "  (-a|-addr)STRING         list of email recipients"      echo "  (-ieee|-noieee)          if possible, use IEEE compiler flags"
16      echo "  (-t|-tdir)STRING         list of \"test\" dirs"      echo "                             (DEF=\"noieee\")"
17        echo "  (-optfile=|-of=)STRING   list of optfiles to use"
18        echo "  (-a|-addr) STRING        list of email recipients"
19        echo "                             (DEF=\"edhill@mitgcm.org\")"
20        echo "  (-t|-tdir) STRING        list of test dirs to use"
21        echo "                             (DEF=\"\" which builds all)"
22        echo "  (-b|-bash) STRING        preferred location of a \"bash\" or"
23        echo "                             Bourne-compatible \"sh\" shell"
24        echo "                             (DEF=\"\" for \"bash\")"
25        echo "  (-command) STRING        command to run"
26        echo "                             (DEF=\"make output.txt\")"
27        echo "  (-m|-make) STRING        command to use for \"make\""
28        echo "                             (DEF=\"make\")"
29        echo "  (-clean)                 *ONLY* run \"make CLEAN\""
30        echo "  (-quick|-q)              same as \"-nogenmake -noclean -nodepend\""
31        echo "  (-nogenmake|-ng)         skip the genmake stage"
32        echo "  (-noclean|-nc)           skip the \"make clean\" stage"
33        echo "  (-nodepend|-nd)          skip the \"make depend\" stage"
34        echo
35        echo "and where STRING follows a whitespace-delimited format"
36        echo "such as:"
37        echo "  -t 'exp0 exp2 exp3' "
38        echo "  -addr='abc@123.com testing@home.org'"
39      echo      echo
40      exit 1      exit 1
41  }  }
# Line 23  build_mpack() Line 46  build_mpack()
46      echo -n "building the mpack utility...  "      echo -n "building the mpack utility...  "
47      if test ! -x "$MPACKDIR/mpack" ; then      if test ! -x "$MPACKDIR/mpack" ; then
48          if test ! -d $MPACKDIR ; then          if test ! -d $MPACKDIR ; then
49                echo
50              echo "Error: can't find \"$MPACKDIR\""              echo "Error: can't find \"$MPACKDIR\""
51              echo "  are you sure this program is being run in the correct "              echo "  are you sure this program is being run in the correct "
52              echo "  (that is, \"MITGCM_ROOT\verification\") directory?"              echo "  (that is, \"MITGCM_ROOT\verification\") directory?"
53              exit 1              echo
54                HAVE_MPACK=f
55          fi          fi
56          echo -n "building mpack...  "          echo -n "building mpack...  "
57          ( cd $MPACKDIR && ./configure && make ) > build_mpack.out 2>&1          ( cd $MPACKDIR && ./configure && $MAKE ) > build_mpack.out 2>&1
58          RETVAL=$?          RETVAL=$?
59          if test "x$RETVAL" != x0 ; then          if test "x$RETVAL" != x0 ; then
60              echo              echo
61              echo "Error building the mpack tools at: $MPACK_DIR"              echo "Error building the mpack tools at: $MPACK_DIR"
62              exit 1              echo
63                HAVE_MPACK=f
64            else
65                HAVE_MPACK=t
66          fi          fi
67        else
68            HAVE_MPACK=t
69      fi      fi
70      echo "OK"      echo "OK"
71  }  }
# Line 60  testoutput_for_prop() Line 90  testoutput_for_prop()
90          echo testoutput_for_prop: grep "$2" $1/$4/output.txt 1>&2          echo testoutput_for_prop: grep "$2" $1/$4/output.txt 1>&2
91      fi      fi
92      if [ -r $1/$4/output.txt ]; then      if [ -r $1/$4/output.txt ]; then
93          grep "$2" $1/$4/output.txt | sed 's/.*=//' | nl > tmp1.txt          grep "$2" $1/$4/output.txt | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp1.txt
94          lncnt=`wc -l tmp1.txt | awk '{print $1}' `          lncnt=`wc -l tmp1.txt | awk '{print $1}' `
95          if [ $lncnt -lt 3 ]; then          if [ $lncnt -lt 3 ]; then
96              if [ $verbose -gt 0 ]; then              if [ $verbose -gt 0 ]; then
# Line 75  testoutput_for_prop() Line 105  testoutput_for_prop()
105      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
106          echo testoutput_for_prop: grep "$2" $1/results/output.txt 1>&2          echo testoutput_for_prop: grep "$2" $1/results/output.txt 1>&2
107      fi      fi
108      grep "$2" $1/results/output.txt | sed 's/.*=//' | nl > tmp2.txt      grep "$2" $1/results/output.txt | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp2.txt
109      lncnt=`wc -l tmp2.txt | awk '{print $1}' `      lncnt=`wc -l tmp2.txt | awk '{print $1}' `
110      if [ $lncnt -lt 3 ]; then      if [ $lncnt -lt 3 ]; then
111          if [ $verbose -gt 0 ]; then          if [ $verbose -gt 0 ]; then
# Line 135  testoutput() Line 165  testoutput()
165      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
166          echo testoutput: cg2dres=$cg2dres 1>&2          echo testoutput: cg2dres=$cg2dres 1>&2
167      fi      fi
       
168      testoutput_for_prop $1 "dynstat_theta_min" "theta minimum" $2; tmin=$?      testoutput_for_prop $1 "dynstat_theta_min" "theta minimum" $2; tmin=$?
169      testoutput_for_prop $1 "dynstat_theta_max" "theta maximum" $2; tmax=$?      testoutput_for_prop $1 "dynstat_theta_max" "theta maximum" $2; tmax=$?
170      testoutput_for_prop $1 "dynstat_theta_mean" "theta mean" $2; tmean=$?      testoutput_for_prop $1 "dynstat_theta_mean" "theta mean" $2; tmean=$?
# Line 160  testoutput() Line 189  testoutput()
189  genmakemodel()  genmakemodel()
190  {  {
191      # genmakemodel directory      # genmakemodel directory
192      GENMAKE2="../../../tools/genmake2"      if test "x$NOGENMAKE" = xt ; then
193      (          echo "genmake skipped!"
194          cd $1;      else
195          printf 'genmake ... ' 1>&2          GENMAKE2="$BASH ../../../tools/genmake2"
196          # ../../../tools/genmake -ieee -mods=../code > make.log 2>&1          (
197          $GENMAKE2  -ds --mods=../code "--optfile="$OPTFILE > make.log 2>&1              cd $1;
198          RETVAL=$?              command="$GENMAKE2  -ds -m $MAKE --mods=../code"
199          for i in gm_state gm_optfile gm_local Makefile ; do              if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then
200              if test -r $i ; then                  command="$command --optfile=$OPTFILE"
201                  cp $i $CDIR                  # echo "  command=\"$command\""
202              fi              fi
203          done              if test "x$IEEE" != x ; then
204          if test "x$RETVAL" != x0 ; then                  command="$command -ieee"
205              tail make.log              fi
206              echo "genmakemodel: genmake failed" 1>&2              # echo "command: \"$command\""
207              cp make.log $CDIR              printf 'genmake ... ' 1>&2
208              return 1              $command > make.log 2>&1
209          else              RETVAL=$?
210              echo "succesful" 1>&2              for i in genmake_state genmake_optfile genmake_local Makefile ; do
211          fi                  if test -r $i ; then
212      )                      cp $i $CDIR
213                    fi
214                done
215                if test "x$RETVAL" != x0 ; then
216                    tail make.log
217                    echo "genmakemodel: genmake failed" 1>&2
218                    cp make.log $CDIR
219                    return 1
220                else
221                    echo "successful" 1>&2
222                fi
223            )
224        fi
225  }  }
226    
227  makeclean()  makeclean()
228  {  {
229      # makeclean directory      # makeclean directory
230      (      if test "x$NOCLEAN" = xt ; then
231          cd $1;          echo "make CLEAN skipped!"
232          rm -f output.txt      else
233          printf 'make CLEAN ... ' 2>&1          (
234          if test -r Makefile ; then              cd $1;
235              make CLEAN >> make.log 2>&1              if test -e output.txt ; then
236              RETVAL=$?                  rm -f output.txt
             if test "x$RETVAL" != x0 ; then  
                 tail make.log  
                 echo "makeclean: \"make CLEAN\" failed" 1>&2  
                 cp make.log $CDIR"/make.log"  
                 return 1  
237              fi              fi
238          fi              printf 'make CLEAN ... ' 2>&1
239          echo succesful 1>&2              if test -r Makefile ; then
240          exit 0                  $MAKE CLEAN >> make.log 2>&1
241      )                  RETVAL=$?
242                    if test "x$RETVAL" != x0 ; then
243                        tail make.log
244                        echo "makeclean: \"make CLEAN\" failed" 1>&2
245                        cp make.log $CDIR"/make.log"
246                        return 1
247                    fi
248                fi
249                echo successful 1>&2
250                exit 0
251            )
252        fi
253  }  }
254    
255  makedependmodel()  makedependmodel()
256  {  {
257      # makedependmodel directory      # makedependmodel directory
258      (      if test "x$NODEPEND" = xt ; then
259          cd $1;          echo "make depend skipped!"
260          printf 'make depend ... ' 1>&2      else
261          make depend >> make.log 2>&1          (
262          RETVAL=$?              cd $1;
263          if test "x$RETVAL" != x0 ; then              printf 'make depend ... ' 1>&2
264              tail make.log              $MAKE depend >> make.log 2>&1
265              echo "makedependmodel: make depend failed" 1>&2              RETVAL=$?
266              cp make.log $CDIR"/make.log"              if test "x$RETVAL" != x0 ; then
267              return 1                  tail make.log
268          else                  echo "makedependmodel: make depend failed" 1>&2
269              echo succesful 1>&2                  cp make.log $CDIR"/make.log"
270          fi                  return 1
271      )              else
272                    echo successful 1>&2
273                fi
274            )
275        fi
276  }  }
277    
278  makemodel()  makemodel()
# Line 231  makemodel() Line 282  makemodel()
282          cd $1;          cd $1;
283          if test -r Makefile ; then          if test -r Makefile ; then
284              printf 'make ... ' 1>&2              printf 'make ... ' 1>&2
285              make >> make.log 2>&1              $MAKE >> make.log 2>&1
286              RETVAL=$?              RETVAL=$?
287              if test "x$RETVAL" != x0 ; then              if test "x$RETVAL" != x0 ; then
288                  tail make.log                  tail make.log
# Line 239  makemodel() Line 290  makemodel()
290                  cp make.log $CDIR"/make.log"                  cp make.log $CDIR"/make.log"
291                  return 1                  return 1
292              else              else
293                  echo succesful 1>&2                  echo successful 1>&2
294              fi              fi
295          fi          fi
296      )      )
# Line 250  linkdata() Line 301  linkdata()
301      # linkdata flag      # linkdata flag
302      #      #
303      # symbolically link data files to run directory      # symbolically link data files to run directory
304      if [ $1 -ne 0 ]; then      if test "x$1" = x1 ; then
305          ( cd $2 ;  ln -sf ../input/* . )          (
306                cd $2
307                files=`( cd ../input ; ls -1 | grep -v CVS )`
308                for i in $files ; do
309                    if test ! -d "../input/"$i ; then
310                        ln -sf "../input/"$i $i
311                    fi
312                done
313            )
314      fi      fi
315  }  }
316    
317  runmodel()  runmodel()
318  {  {
319      # runmodel directory exe      # runmodel directory
320      #      #
321      #  runs the model "exe" in "directory" (exe is relative to directory)      #  runs "$COMMAND" in "directory"
322        #  (where "$COMMAND" is relative to "directory")
323      (      (
324          cd $1          cd $1
325          if [ -x $2 ]; then          printf 'runmodel ... ' 1>&2
326              if [ $quick -eq 0 ]; then          # make output.txt
327                  rm -f output.txt          $COMMAND >> run.log 2>&1
328              fi          RETVAL=$?
329              printf 'runmodel: ' 1>&2          if test "x$RETVAL" = x0 ; then
330              make output.txt              echo successful 1>&2
331              RETVAL=$?              cp output.txt $CDIR"/output.txt"
332              if test "x$RETVAL" = x0 ; then              return 0
333                  cp output.txt $CDIR"/output.txt"          else
334                  return 0              tail run.log
335              else              echo failed 1>&2
336                  return 1              cp run.log $CDIR"/run.log"
337              fi              return 1
338          fi          fi
339      )      )
340  }  }
# Line 315  EOFA Line 375  EOFA
375          return 0          return 0
376      else      else
377          echo          echo
378          echo "createcodelet: failed to compile codelet" | tee          echo "createcodelet: failed to compile codelet"
379          exit 1          exit 1
380      fi      fi
381  }  }
# Line 347  show_help() Line 407  show_help()
407  {  {
408      cat - << EOF      cat - << EOF
409  $0 [-help] [-quick] [-verbose] dir1 [dir2] [...]  $0 [-help] [-quick] [-verbose] dir1 [dir2] [...]
410   -help      Show this help message  
411   -quick     Skip "genmake" and "make depend" if the Makefile exists   -help|-h      Show this help message
412   -quiet     Reduce the amount of output   -quiet     Reduce the amount of output
413   -verbose   Produce copious amounts of output   -verbose   Produce copious amounts of output
414   -debug     Produce even more output which will mean nothing to most   -debug     Produce even more output which will mean nothing to most
415   -force     Do "make CLEAN" before compiling. This forces a complete rebuild.   -force     Do "make CLEAN" before compiling. This forces a complete rebuild.
416   -clean     Do "make CLEAN" after compiling and testing.   -clean     Do "make CLEAN" after compiling and testing.
  -noieee    By default, $0 uses the -ieee option for genmake. This turns it off.  
417   -cleanup   Aggresively removes all model output, executables and object files   -cleanup   Aggresively removes all model output, executables and object files
418              and then exits. Use with care.              and then exits. Use with care.
419    
# Line 383  scandirs() Line 442  scandirs()
442  #  Default properties  #  Default properties
443  debug=0  debug=0
444  verbose=1  verbose=1
 quick=0  
445  clean=0  clean=0
 ieee=1  
446  expts=''  expts=''
447    # ieee=1
448    
449  OPTFILES=  IEEE=
450  ADDRESSES=edhill@mitgcm.org  if test "x$MITGCM_IEEE" != x ; then
451        IEEE=$MITGCM_IEEE
452    fi
453    
454    
455    CLEANUP=f
456    QUICK=f
457    NOGENMAKE=f
458    NOCLEAN=f
459    NODEPEND=f
460    
461    BASH=
462    OPTFILE=NONE
463    ADDRESSES=
464  TESTDIRS=  TESTDIRS=
465  MPACKDIR="../tools/mpack-1.6"  MPACKDIR="../tools/mpack-1.6"
466    HAVE_MPACK=
467  MPACK="$MPACKDIR/mpack"  MPACK="$MPACKDIR/mpack"
468    COMMAND="make output.txt"
469    MAKE=make
470    MPI=f
471    
472  echo -n "parsing options...  "  echo -n "parsing options...  "
473    
# Line 414  for ac_option ; do Line 489  for ac_option ; do
489              usage ;;              usage ;;
490                    
491          -optfile | --optfile | -of | --of)          -optfile | --optfile | -of | --of)
492              ac_prev=OPTFILES ;;              ac_prev=OPTFILE ;;
493          -optfile=* | --optfile=* | -of=* | --of=*)          -optfile=* | --optfile=* | -of=* | --of=*)
494              OPTFILES=$ac_optarg ;;              OPTFILE=$ac_optarg ;;
495                    
496          -addr | --addr | -a | --a)          -addr | --addr | -a | --a)
497              ac_prev=ADDRESSES ;;              ac_prev=ADDRESSES ;;
# Line 428  for ac_option ; do Line 503  for ac_option ; do
503          -tdir=* | --tdir=*)          -tdir=* | --tdir=*)
504              TESTDIRS=$ac_optarg ;;              TESTDIRS=$ac_optarg ;;
505    
506          -quick) quick=1 ;;          -bash | --bash | -b | --b)
507                ac_prev=BASH ;;
508            -bash=* | --bash=*)
509                BASH=$ac_optarg ;;
510    
511            -command | --command | -c | --c)
512                ac_prev=COMMAND ;;
513            -command=* | --command=*)
514                COMMAND=$ac_optarg ;;
515    
516            -make | --make | -m | --m)
517                ac_prev=MAKE ;;
518            -make=* | --make=*)
519                MAKE=$ac_optarg ;;
520    
521            -clean | --clean)
522                CLEANUP=t ;;
523    
524            -quick | --quick | -q | --q)
525                QUICK=t ;;
526            -nogenmake | --nogenmake | -ng | --ng)
527                NOGENMAKE=t ;;
528            -noclean | --noclean | -nc | --nc)
529                NOCLEAN=t ;;
530            -nodepend | --nodepend | -nd | --nd)
531                NODEPEND=t ;;
532    
533            -mpi) MPI=t ;;
534    
535            -ieee) IEEE=true ;;
536            -noieee) IEEE= ;;
537    
538          -verbose) verbose=2 ;;          -verbose) verbose=2 ;;
539          -debug) debug=1 ;;          -debug) debug=1 ;;
         -clean) clean=1 ;;  
         -noieee) ieee=0 ;;  
540          -quiet) verbose=0 ;;          -quiet) verbose=0 ;;
541    
542          -*)          -*)
# Line 449  for ac_option ; do Line 553  for ac_option ; do
553            
554  done  done
555    
556    if test "x$QUICK" = xt ; then
557        NOGENMAKE=t
558        NOCLEAN=t
559        NODEPEND=t
560    fi
561    
562  if test "x$TESTDIRS" = x ; then  if test "x$TESTDIRS" = x ; then
563      TESTDIRS=`scandirs`      TESTDIRS=`scandirs`
564  fi  fi
565    
566    if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM_OF" != x ; then
567        OPTFILE=$MITGCM_OF
568    fi
569    
570  echo "OK"  echo "OK"
571    
572  #  create the FORTRAN comparison code  #  create the FORTRAN comparison code
# Line 475  done Line 589  done
589  mkdir $DRESULTS  mkdir $DRESULTS
590  RETVAL=$?  RETVAL=$?
591  if test "x$RETVAL" != x0 ; then  if test "x$RETVAL" != x0 ; then
592      echo "Error: can't create results directory \"./$DRESULTS\""      echo "ERROR: Can't create results directory \"./$DRESULTS\""
593      exit 1      exit 1
594  fi  fi
595  SUMMARY="$DRESULTS/summary.txt"  SUMMARY="$DRESULTS/summary.txt"
596  date > $SUMMARY  echo -n "Start time:  " >> $SUMMARY
597  cat << EOF >> $SUMMARY  start_date=`date`
598    echo $start_date > $SUMMARY
599    cat << EOF | tee -a $SUMMARY
600                  T           S           U           V                  T           S           U           V
601  G D M    c        m  s        m  s        m  s        m  s  G D M    c        m  s        m  s        m  s        m  s
602  E p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  E p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .
# Line 491  EOF Line 607  EOF
607    
608  NDIR=0  NDIR=0
609    
610  #  For each optfile...  of_path=
611  for OPTFILE in $OPTFILES ; do  if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then
612        if test -r $OPTFILE ; then
613      OPTFILE=`pwd`"/$OPTFILE"          # get the path
614      if test ! -r $OPTFILE ; then          path=${OPTFILE%/*}
615          echo "Error: can't read optfile \"$OPTFILE\""          if test "x$path" = x ; then
616          exit 1              of_path=`pwd`
     fi  
     echo  
     echo "OPTFILE=$OPTFILE" >> $SUMMARY  
     echo >> $SUMMARY  
       
     #  ...and each test directory...  
     for dir in $TESTDIRS ; do  
           
         #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir combination  
         CDIR=$DRESULTS"/"$DRESULTS"_"$NDIR  
         mkdir $CDIR  
         CDIR=`pwd`"/$CDIR"  
   
         #  ...configue, make, run, and compare the output.  
         echo "-------------------------------------------------------------------------------"  
         echo  
         echo "Experiment:  $dir"  
         echo  
         unset genmake makedepend make run  
         results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'  
         ( cd $dir/input; rm -f *.{o,f,c,F} *.[f,F]90 work* output.txt Make* make.log; )  
         if [ -r $dir/build ]; then  
             seperatebuilddir=1  
             builddir=build  
             rundir=build  
             ( cd $dir/build; ln -sf ../input/* . )  
617          else          else
618              seperatebuilddir=0              of_path=`( cd $path > /dev/null 2>&1 ; pwd )`
             builddir=input  
             rundir=input  
619          fi          fi
620            file=${OPTFILE##*/}
621            OPTFILE=$of_path/$file
622        else
623            echo
624            echo "WARNING: can't read OPTFILE=\"$OPTFILE\" but will try to use it..."
625        fi
626    fi
627    echo
628    echo "OPTFILE=$OPTFILE" >> $SUMMARY
629    echo >> $SUMMARY
630    
631          #  Verify that the testdir exists and contains previous  #  ...and each test directory...
632          #  results in the correct location--or skip this directory!  for dir in $TESTDIRS ; do
633          if test ! -r $dir"/results/output.txt" ; then      
634              echo | tee $SUMMARY      #  Cleanup only!
635              echo "can't read \"$dir/results/output.txt\" -- skipping $dir" \      if test "x$CLEANUP" = xt ; then
636                  | tee $SUMMARY          if test -r $dir/build/Makefile ; then
637              continue              ( cd $dir/build ; make CLEAN )
638          fi          fi
639            if test -r $dir/input/Makefile ; then
640                ( cd $dir/input ; make CLEAN )
641            fi
642            continue
643        fi
644    
645        #  Verify that the testdir exists and contains previous
646        #  results in the correct location--or skip this directory!
647        if test ! -r $dir"/results/output.txt" ; then
648            echo "can't read \"$dir/results/output.txt\" -- skipping $dir"
649            continue
650        fi
651    
652        echo "-------------------------------------------------------------------------------"
653        echo
654        echo "Experiment:  $dir"
655        echo
656        unset genmake makedepend make run
657        results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'
658    
659        builddir="input"
660        rundir="input"
661        use_seperate_build=0
662        if test -d $dir/build -a -r $dir/build ; then
663            builddir="build"
664            rundir="build"
665            use_seperate_build=1
666            linkdata $use_seperate_build $dir/$rundir
667        fi
668        
669        CODE_DIR=$dir/code
670        BUILD_DIR=$dir/$builddir
671        MPI_FILES="CPP_EEOPTIONS.h_mpi SIZE.h_mpi"
672        NOMPI_FILES="CPP_EEOPTIONS.h_nompi SIZE.h_nompi"
673    
674        #  Is this an MPI run?
675        if test "x$MPI" = xt ; then
676            FILES=$MPI_FILES
677            endings="_mpi"
678        else
679            FILES=$NOMPI_FILES
680            endings="_nompi"
681        fi
682        
683        #  Check to see that we have the files
684        have_files=t
685        for i in $FILES ; do
686            if test ! -r $CODE_DIR/$i ; then
687                echo "Warning: can't read file $CODE_DIR/$i"
688                have_files=f
689            fi
690        done
691        if test "x$have_files" != xt -a "x$MPI" = xt ; then
692            echo "Skipping $dir due to lack of input files (see above warning)"
693            continue
694        fi
695        
696        #  If we have the $FILES and they differ, copy the $FILES to $BUILD_DIR
697        if test "x$have_files" = xt ; then
698            for i in $FILES ; do
699                sstr="s|$endings||"
700                name=`echo $i | sed -e $sstr `
701                cmp $CODE_DIR/$i $BUILD_DIR/$name > /dev/null 2>&1
702                RETVAL=$?
703                if test "x$RETVAL" != x0 ; then
704                    cp $CODE_DIR/$i $BUILD_DIR/$name
705                fi
706            done
707        fi
708        
709        #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir combination
710        rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir
711        mkdir $rel_CDIR
712        CDIR=`pwd`"/$rel_CDIR"
713        
714        if test "x$CLEANUP" = xt ; then
715            makeclean $dir/$builddir
716        else
717          genmakemodel $dir/$builddir && genmake=Y \          genmakemodel $dir/$builddir && genmake=Y \
718              && makeclean $dir/$builddir \              && makeclean $dir/$builddir \
719              && makedependmodel $dir/$builddir && makedepend=Y \              && makedependmodel $dir/$builddir && makedepend=Y \
720              && makemodel $dir/$builddir && make=Y \              && makemodel $dir/$builddir && make=Y \
721              && linkdata $seperatebuilddir $dir/$rundir \              && linkdata $use_seperate_build $dir/$rundir \
722              && runmodel $dir/$builddir mitgcmuv && run=Y \              && runmodel $dir/$rundir && run=Y \
723              && results=`testoutput $dir $rundir`              && results=`testoutput $dir $rundir`
724          echo      fi
725          formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} \      
726              ${run:-N} $results      echo
727          echo      formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} \
728          formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} \          ${run:-N} $results
729              ${run:-N} $results >> $SUMMARY      echo
730          echo "fresults='" > $CDIR"/summary.txt"      formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} \
731          formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} \          ${run:-N} $results >> $SUMMARY
732              ${run:-N} $results >> $CDIR"/summary.txt"      echo "fresults='" > $CDIR"/summary.txt"
733          echo "'" >> $CDIR"/summary.txt"      formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} \
734          echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"          ${run:-N} $results >> $CDIR"/summary.txt"
735          echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"      echo "'" >> $CDIR"/summary.txt"
736          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"      echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"
737          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"      echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"
738        echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
739          (      echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"
740              cd $DRESULTS      
741              tar -cf $NDIR".tar" $DRESULTS"_"$NDIR > /dev/null 2>&1      echo "-------------------------------------------------------------------------------"
742              gzip $NDIR".tar"      
743          )      NDIR=$(( $NDIR + 1 ))
744        
745    done
746    
747          $MPACK -s MITgcm-test -m 1000000 $DRESULTS"/"$NDIR".tar.gz" $ADDRESSES  echo -n "Start time:  " >> $SUMMARY
748    echo $start_date >> $SUMMARY
749    echo -n "End time:    " >> $SUMMARY
750    date >> $SUMMARY
751    
752    #  If addresses were supplied and mpack built successfully, then try
753    #  to send email using mpack.
754    if test "x$ADDRESSES" = xNONE -o "x$ADDRESSES" = x ; then
755        echo "No results email was sent."
756    else
757        if test "x$HAVE_MPACK" = xt ; then
758            tar -cf $DRESULTS".tar" $DRESULTS > /dev/null 2>&1 \
759                && gzip $DRESULTS".tar" \
760                && $MPACK -s MITgcm-test -m 1500000 $DRESULTS".tar.gz" $ADDRESSES
761          RETVAL=$?          RETVAL=$?
762          if test "x$RETVAL" != x0 ; then          if test "x$RETVAL" != x0 ; then
763              echo "Warning: \"$MPACK\" failed -- please contact <edhill@mitgcm.org>"              echo
764                echo "Warning: The tar, gzip, & mpack step failed.  Please send email"
765                echo "  to <MITgcm-support@mitgcm.org> for help.  You may copy the "
766                echo "  summary of results from the directory \"$DRESULTS\"."
767                echo
768          else          else
769              rm -f $DRESULTS"/"$NDIR".tar*"              echo
770                echo "An email containing results was sent to the following addresses:"
771                echo "  \"$ADDRESSES\""
772                echo
773          fi          fi
774            test -f $DRESULTS".tar"  &&  rm -f $DRESULTS".tar"
775          NDIR=$(( $NDIR + 1 ))          test -f $DRESULTS".tar.gz"  &&  rm -f $DRESULTS".tar.gz"
776                fi
777      done  fi
 done  
778    
779  rm tmp_cmpnum.f a.out  rm tmp_cmpnum.f a.out
780    
781  cat $SUMMARY  if test "x$CLEANUP" != xt ; then
782        cat $SUMMARY
783        if test -e tr.out ; then
784            mv tr.out tr.out.old
785        fi
786        cat $SUMMARY > tr.out
787    fi
788    
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