/[MITgcm]/MITgcm/verification/testreport
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Diff of /MITgcm/verification/testreport

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revision 1.2 by edhill, Mon Sep 1 16:50:27 2003 UTC revision 1.131 by jmc, Sat Jan 2 01:53:49 2010 UTC
# Line 1  Line 1 
1  #!/bin/bash  #! /usr/bin/env bash
2  #  #
3  #  $Header$  #  $Header$
4    #  $Name$
5  #  #
6    
7  usage()  usage()
# Line 10  usage() Line 11  usage()
11      echo      echo
12      echo "where possible OPTIONS are:"      echo "where possible OPTIONS are:"
13      echo "  (-help|-h)               print usage"      echo "  (-help|-h)               print usage"
14      echo "  (-optfile=|-of=)STRING   list of genmake2 \"optfiles\""      echo "  (-mth)                   run multi-threaded (using eedata.mth)"
15      echo "  (-a|-addr)STRING         list of email recipients"      echo "  (-mpi)                   compile and run using MPI"
16      echo "  (-t|-tdir)STRING         list of \"test\" dirs"      echo "  (-ieee|-noieee)          if possible, use IEEE compiler flags"
17        echo "                             (DEF=\"-ieee\")"
18        echo "  (-gsl)                   compile with \"-gsl\" flag"
19        echo "  (-of=|-optfile=)STRING   list of optfiles to use"
20        echo "  (-a|-addr) STRING        list of email recipients"
21        echo "                             (DEF=\"\" no email is sent)"
22        echo "  (-mpd|-mpackdir) DIR     location of the mpack utility"
23        echo "                             (DEF=\"../tools/mpack-1.6\")"
24        echo "  (-t|-tdir) STRING        list of group and/or exp. dirs to test"
25        echo "                             (recognized groups: basic, tutorials)"
26        echo "                             (DEF=\"\" which test all)"
27        echo "  (-skd|-skipdir) STRING   list of exp. dirs to skip"
28        echo "                             (DEF=\"\" which test all)"
29        echo "  (-b|-bash) STRING        preferred location of a \"bash\" or"
30        echo "                             Bourne-compatible \"sh\" shell"
31        echo "                             (DEF=\"\" for \"bash\")"
32        echo "  (-adm|-ad)               perform an adjoint run"
33        echo "  (-oad)                   perform an OpenAD adjoint run"
34        echo "  (-command) STRING        command to run"
35        echo "                             (DEF=\"make output.txt\")"
36        echo "  (-m|-make) STRING        command to use for \"make\""
37        echo "                             (DEF=\"make\")"
38        echo "  (-odir) STRING           used to build output directory name"
39        echo "                             (DEF=\"hostname\")"
40        echo "  (-ptr|-ptracers) STRING  specify which ptracers to test"
41        echo "                             (DEF=\"1 2 3 4 5\")"
42        echo "  (-match) NUMBER          Matching Criteria (number of digits)"
43        echo "                             (DEF=\"12\")"
44        echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"
45        echo "  (-clean)                 *ONLY* run \"make CLEAN\""
46        echo "  (-quick|-q)              same as \"-nogenmake -noclean -nodepend\""
47        echo "  (-nogenmake|-ng)         skip the genmake stage"
48        echo "  (-noclean|-nc)           skip the \"make clean\" stage"
49        echo "  (-nodepend|-nd)          skip the \"make depend\" stage"
50        echo "  (-deldir|-dd)            on success, delete the output directory"
51        echo "  (-ts)                    provide timing information per timestep"
52        echo "  (-papis)                 provide MFlop/s per timestep using PAPI"
53        echo "  (-pcls)                  provide MFlop/s per timestep using PCL"
54        echo
55        echo "and where STRING can be a whitespace-delimited list"
56        echo "such as:"
57        echo
58        echo "  -t 'exp0 exp2 exp3' "
59        echo "  -addr='abc@123.com testing@home.org'"
60        echo
61        echo "provided that the expression is properly quoted within the current"
62        echo "shell (note the use of single quotes to protect white space)."
63      echo      echo
64      exit 1      exit 1
65  }  }
# Line 20  usage() Line 67  usage()
67  #  build the mpack utility  #  build the mpack utility
68  build_mpack()  build_mpack()
69  {  {
70      echo -n "building the mpack utility...  "      printf "building the mpack utility...  "
71      if test ! -x "$MPACKDIR/mpack" ; then      MPACK="$MPACKDIR/mpack"
72        if test ! -x $MPACK ; then
73          if test ! -d $MPACKDIR ; then          if test ! -d $MPACKDIR ; then
74                echo
75              echo "Error: can't find \"$MPACKDIR\""              echo "Error: can't find \"$MPACKDIR\""
76              echo "  are you sure this program is being run in the correct "              echo "  are you sure this program is being run in the correct "
77              echo "  (that is, \"MITGCM_ROOT\verification\") directory?"              echo "  (that is, \"MITGCM_ROOT\verification\") directory?"
78              exit 1              echo
79                HAVE_MPACK=f
80            fi
81            if test "x$CC" = x ; then
82                export CC=cc
83          fi          fi
84          echo -n "building mpack...  "          printf "building mpack (using CC=$CC)...  "
85          ( cd $MPACKDIR && ./configure && make ) > build_mpack.out 2>&1          ( cd $MPACKDIR && ./configure && $MAKE ) > tr_build_mpack.out 2>&1
86          RETVAL=$?          RETVAL=$?
87          if test "x$RETVAL" != x0 ; then          if test "x$RETVAL" != x0 ; then
88              echo              echo
89              echo "Error building the mpack tools at: $MPACK_DIR"              echo "Error building the mpack tools at: $MPACK_DIR"
90              exit 1              echo
91                HAVE_MPACK=f
92            else
93                rm -f tr_build_mpack.out
94                HAVE_MPACK=t
95                echo "done"
96          fi          fi
97        else
98            HAVE_MPACK=t
99            echo "already exist"
100      fi      fi
     echo "OK"  
 }  
   
 compare_lines()  
 {  
     # use codelet to compare lines  
     if [ $verbose -gt 1 ]; then  
         cat tmp3.txt 1>&2  
     fi  
     return `./a.out < tmp3.txt`  
101  }  }
102    
103  testoutput_for_prop()  testoutput_var()
104  {  {
105      # testoutput_for_prop dir s1 label subdir      # testoutput_var dir s1 label subdir reference_output
106      #      #
107      #  compares files in $dir/$subdir/output.txt and $dir/results/output.txt      #  compares 1 variable output selected from file $dir/$subdir/$OUTPUTFILE
108      #  using search strings s1 and text label      #     with same output from reference file $dir/results/$reference_output
109        #  using search strings s1 and text label
110    
111      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
112          echo testoutput_for_prop: grep "$2" $1/$4/output.txt 1>&2          echo testoutput_var: grep "$2" $1/$4/$OUTPUTFILE 1>&2
113      fi      fi
114      if [ -r $1/$4/output.txt ]; then      if [ -r $1/$4/$OUTPUTFILE ]; then
115          grep "$2" $1/$4/output.txt | sed 's/.*=//' | nl > tmp1.txt          grep "$2" $1/$4/$OUTPUTFILE | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp1.txt
116          lncnt=`wc -l tmp1.txt | awk '{print $1}' `          lncntA=`wc -l tmp1.txt | awk '{print $1}' `
117          if [ $lncnt -lt 3 ]; then          if [ $lncntA -lt 2 ]; then
118              if [ $verbose -gt 0 ]; then              if [ $verbose -gt 0 ]; then
119                  echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2                  echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2
120              fi              fi
121              return 99              return 99
122          fi          fi
123      else      else
124          echo testoutput_for_prop: output.txt from model run was not readable 1>&2          echo testoutput_var: $OUTPUTFILE from model run was not readable 1>&2
125          return 99          return 99
126      fi      fi
127      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
128          echo testoutput_for_prop: grep "$2" $1/results/output.txt 1>&2          echo testoutput_var: grep "$2" $1/results/$5 1>&2
129      fi      fi
130      grep "$2" $1/results/output.txt | sed 's/.*=//' | nl > tmp2.txt      grep "$2" $1/results/$5 | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp2.txt
131      lncnt=`wc -l tmp2.txt | awk '{print $1}' `      lncntB=`wc -l tmp2.txt | awk '{print $1}' `
132      if [ $lncnt -lt 3 ]; then      if [ $lncntB -lt 2 ]; then
133          if [ $verbose -gt 0 ]; then          if [ $verbose -gt 0 ]; then
134              echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2              echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2
135          fi          fi
136          return 99          return 99
137      fi      fi
138        if [ $lncntA -ne $lncntB ]; then
139            if [ $verbose -gt 0 ]; then
140                echo Not same Nb of lines when searching for "$2" ":" $lncntA $lncntB 1>&2
141            fi
142            return 99
143        fi
144        has_nan=`cat tmp1.txt | grep -i nan | wc -l`
145        if [ $has_nan -gt 0  ] ; then
146            echo testoutput_var: $OUTPUTFILE contains $has_nan NaN values  1>&2
147            return 99
148        fi
149        has_inf=`cat tmp1.txt | grep -i inf | wc -l`
150        if [ $has_inf -gt 0  ] ; then
151            echo testoutput_var: $OUTPUTFILE contains $has_inf Inf values  1>&2
152            return 99
153        fi
154      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
155          echo testoutput_for_prop: join tmp1.txt tmp2.txt 1>&2          echo testoutput_var: join tmp1.txt tmp2.txt 1>&2
156      fi      fi
157      join tmp1.txt tmp2.txt | awk '{print $1 " " $2 " " $3}' > tmp3.txt      join tmp1.txt tmp2.txt | awk '{print $1 " " $2 " " $3}' > tmp3.txt
158      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
159          echo testoutput_for_prop: compare_lines 1>&2          echo testoutput_var: compare_lines 1>&2
160      fi      fi
161      compare_lines      if [ $verbose -gt 1 ]; then
162      digits_of_similarity=$?          cat tmp3.txt 1>&2
163        fi
164        echo "-1" >> tmp3.txt
165        # On the SGI O3K (*not* the O2K), "cat -n" inserts a ":" after the line number
166        cat tmp3.txt | sed -e 's|:||g' > tmp4.txt
167        digits_of_similarity=`./tr_cmpnum < tmp4.txt`
168      if [ $digits_of_similarity -eq 99 ]; then      if [ $digits_of_similarity -eq 99 ]; then
169          if [ $verbose -gt 0 ]; then          if [ $verbose -gt 0 ]; then
170              echo testoutput_for_prop: No comparison was available for \"$2\" 1>&2              echo testoutput_var: No comparison was available for \"$3\" 1>&2
171          fi          fi
172          digits_of_similarity=99          digits_of_similarity=99
173      else      else
174          if [ $verbose -gt 0 ]; then          if [ $verbose -gt 0 ]; then
175              echo There were $digits_of_similarity decimal places of similarity for \"$2\" 1>&2              echo There were $digits_of_similarity decimal places of similarity for \"$3\" 1>&2
176          fi          fi
177      fi      fi
178      rm tmp1.txt tmp2.txt tmp3.txt      rm -f tmp1.txt tmp2.txt tmp3.txt tmp4.txt
179            
180      return $digits_of_similarity      return $digits_of_similarity
181  }  }
182    
183  dashnum()  testoutput_run()
184  {  {
185      # dashnum n1 n2 n3 ...      # testoutput_run directory subdir reference_output
186      #      #
187      #  print numbers using %3i format or "--" if number = 99      #  test output from 1 run in "directory"
188    # --> same processing for adjoint & forward test
189            # default list of output variables to be checked:
190            #  1rst : main variable used to decide if it pass or FAIL
191            #  others : number of matching digits to be printed in summary.txt
192            listChk=$DEF_CHECK_LIST
193            #  load experiment-specific list from file "tr_checklist" (if it exist)
194            if test -r $1/$2/tr_checklist ; then listChk=`cat $1/$2/tr_checklist` ; fi
195            sVar=`echo $listChk | awk '{print $1}'`
196            # remove 1rst var and expand the list: + => min max mean s.d
197            listVar=`echo $listChk | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' \
198                                   | sed 's/+//g' | sed "s/^$sVar//"`
199            if [ $debug -gt 0 ]; then echo "testoutput_run: listVar(I)='$listVar'" 1>&2 ; fi
200            # check for ptracer output in reference_output file :
201            outpref=$1/results/$3
202            ptr_mon="trcstat_ptracerXX_min trcstat_ptracerXX_max"
203            ptr_mon="$ptr_mon trcstat_ptracerXX_mean trcstat_ptracerXX_sd"
204            for ii in $PTRACERS_NUM ; do
205                ptrfound=0
206                for jj in $ptr_mon ; do
207                    name=`eval "echo $jj | sed -e 's|XX|0"$ii"|g'"`
208                    tst=`grep $name $outpref | wc -l | awk '{print $1}'`
209                    if test ! "x$tst" = x0 ; then ptrfound=1 ; fi
210                done
211                if test $ptrfound = '1' ; then
212                    eval "HAVE_PTR0"$ii"=t"
213                else
214                    eval "HAVE_PTR0"$ii"=f"
215                  if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; then
216                  # remove this ptr from the list of output variable to check
217                  # echo "-- ptr test=" $tst "number of var=" `echo $listVar | awk '{print NF}'` 1>&2
218                    listVar=`echo "$listVar" | sed "s/ pt$ii..//g"`
219                  fi
220                fi
221            #   eval 'echo "HAVE_PTR0'$ii' = $HAVE_PTR0'$ii'"' 1>&2
222            done
223            tst=`echo $sVar $listVar | awk '{ for(i=2;i<=NF;i++){if($i==$1)t+=1}; print t }'`
224            if test $tst != 1 ; then
225              if test $tst = 0 ; then echo "==> WARNING: selected var >$sVar< not found" 1>&2
226                     else echo "==> WARNING: found selected var >$sVar< $tst times" 1>&2 ; fi
227              echo "==> WARNING: in checked list:" $listVar 1>&2
228            #- put it back once:
229              listVar=" $sVar "`echo "$listVar " | sed "s/ $sVar / /g"`
230            fi
231            if [ $debug -gt 0 ]; then echo "testoutput_run: listVar(M)='$listVar'" 1>&2 ; fi
232            echo "listVar='$listVar'" > $CDIR"/summary.txt"
233            allargs=""
234            for xx in $listVar
235            do
236              case $xx in
237               'PS')  if [ $debug -gt 0 ]
238                      then echo testoutput_run: testoutput_var $1 cg2d_init_res 1>&2 ; fi
239                      testoutput_var $1 "cg2d_init_res" "Press. Solver (cg2d)" $2 $3; yy=$?
240                      if [ $debug -gt 0 ] ; then echo testoutput_run: cg2dres=$yy 1>&2 ; fi ;;
241              'Cost') testoutput_var $1 "ADM  precision_derivative_cost" "ADM Cost" $2 $3; yy=$? ;;
242              'Grad') testoutput_var $1 "ADM  precision_derivative_grad" "ADM Grad" $2 $3; yy=$? ;;
243               'Tmn') testoutput_var $1 "dynstat_theta_min"  "Theta minimum"  $2 $3; yy=$? ;;
244               'Tmx') testoutput_var $1 "dynstat_theta_max"  "Theta maximum"  $2 $3; yy=$? ;;
245               'Tav') testoutput_var $1 "dynstat_theta_mean" "Theta mean"     $2 $3; yy=$? ;;
246               'Tsd') testoutput_var $1 "dynstat_theta_sd"   "Theta Std.Dev"  $2 $3; yy=$? ;;
247               'Smn') testoutput_var $1 "dynstat_salt_min"  "Salt minimum"    $2 $3; yy=$? ;;
248               'Smx') testoutput_var $1 "dynstat_salt_max"  "Salt maximum"    $2 $3; yy=$? ;;
249               'Sav') testoutput_var $1 "dynstat_salt_mean" "Salt mean"       $2 $3; yy=$? ;;
250               'Ssd') testoutput_var $1 "dynstat_salt_sd"   "Salt Std.Dev"    $2 $3; yy=$? ;;
251               'Umn') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_min"  "U minimum"       $2 $3; yy=$? ;;
252               'Umx') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_max"  "U maximum"       $2 $3; yy=$? ;;
253               'Uav') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_mean" "U mean"          $2 $3; yy=$? ;;
254               'Usd') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_sd"   "U Std.Dev"       $2 $3; yy=$? ;;
255               'Vmn') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_min"  "V minimum"       $2 $3; yy=$? ;;
256               'Vmx') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_max"  "V maximum"       $2 $3; yy=$? ;;
257               'Vav') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_mean" "V mean"          $2 $3; yy=$? ;;
258               'Vsd') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_sd"   "V Std.Dev"       $2 $3; yy=$? ;;
259            'pt1mn'|'pt2mn'|'pt3mn'|'pt4mn'|'pt5mn') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`
260               testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_min"  "p0"$ii"_min"   $2 $3; yy=$? ;;
261            'pt1mx'|'pt2mx'|'pt3mx'|'pt4mx'|'pt5mx') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`
262               testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_max"  "p0"$ii"_max"   $2 $3; yy=$? ;;
263            'pt1av'|'pt2av'|'pt3av'|'pt4av'|'pt5av') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`
264               testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_mean" "p0"$ii"_mean" $2 $3; yy=$? ;;
265            'pt1sd'|'pt2sd'|'pt3sd'|'pt4sd'|'pt5sd') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`
266               testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_sd"   "p0"$ii"_StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
267             'Qntmn') testoutput_var $1 "forcing_qnet_min" "Qnet minimum"  $2 $3; yy=$? ;;
268             'Qntmx') testoutput_var $1 "forcing_qnet_max" "Qnet maximum"  $2 $3; yy=$? ;;
269             'Qntav') testoutput_var $1 "forcing_qnet_mean" "Qnet mean"       $2 $3; yy=$? ;;
270             'Qntsd') testoutput_var $1 "forcing_qnet_sd"  "Qnet Std.Dev"  $2 $3; yy=$? ;;
271             'aSImn') testoutput_var $1 "seaice_area_min"   "SIce Area min"   $2 $3; yy=$? ;;
272             'aSImx') testoutput_var $1 "seaice_area_max"   "SIce Area max"   $2 $3; yy=$? ;;
273             'aSIav') testoutput_var $1 "seaice_area_mean"  "SIce Area mean"  $2 $3; yy=$? ;;
274             'aSIsd') testoutput_var $1 "seaice_area_sd"    "SIce Area StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
275             'hSImn') testoutput_var $1 "seaice_heff_min"   "SIce Heff min"   $2 $3; yy=$? ;;
276             'hSImx') testoutput_var $1 "seaice_heff_max"   "SIce Heff max"   $2 $3; yy=$? ;;
277             'hSIav') testoutput_var $1 "seaice_heff_mean"  "SIce Heff mean"  $2 $3; yy=$? ;;
278             'hSIsd') testoutput_var $1 "seaice_heff_sd"    "SIce Heff StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
279            'AthSiG') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_G" "thSIc Area Global" $2 $3; yy=$? ;;
280            'AthSiS') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_S" "thSIc Area South"  $2 $3; yy=$? ;;
281            'AthSiN') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_N" "thSIc Area North"  $2 $3; yy=$? ;;
282            'HthSiG') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_G" "thSIc H Global"    $2 $3; yy=$? ;;
283            'HthSiS') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_S" "thSIc H South"     $2 $3; yy=$? ;;
284            'HthSiN') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_N" "thSIc H North"     $2 $3; yy=$? ;;
285                  *) yy=99; echo "WARNING: asking for var=$xx : not recognized !" 1>&2 ;;
286              esac
287              if test $xx = $sVar
288              then allargs="$allargs > $yy <"
289              else allargs="$allargs $yy"
290              fi
291            done
292    
293            nbVar=`echo $listVar | awk '{print NF}'`
294            if [ $nbVar -lt $LEN_CHECK_LIST ] ; then
295            #-- fill line (up to standard length) with dot:
296              adNul=`expr $LEN_CHECK_LIST - $nbVar | awk '{for(i=1;i<=$1;i++){print "."}}'`
297              echo $allargs $adNul
298            else
299              echo $allargs
300            fi
301    # <-- same processing for adjoint & forward test
302    }
303    
304      for num in $@ ; do  genmakemodel()
305          if [ $num = 99 ]; then  {
306              printf ' --'      # genmakemodel directory
307        if test "x$NOGENMAKE" = xt ; then
308            echo "genmake skipped!"
309        else
310            if test "x$BASH" = x ; then
311                GENMAKE2="../../../tools/genmake2"
312          else          else
313              printf '%3i' $num              GENMAKE2="$BASH ../../../tools/genmake2 -bash $BASH"
314          fi          fi
315      done          (
316                cd $1;
317                command="$GENMAKE2  -ds -m $MAKE"
318                if test "x$ADM" = xt ; then
319                    command="$command --mods=../code_ad"
320                elif test "x$OADM" = xt ; then
321                    command="$command -adof ../../../tools/adjoint_options/adjoint_oad -mods '../code_oad ../../OpenAD/code_oad_all'"
322                else
323                    command="$command -mods=../code"
324                fi
325                if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then
326                    command="$command -optfile=$OPTFILE"
327                fi
328                if test "x$IEEE" != x ; then
329                    command="$command -ieee"
330                fi
331                if test "x$GSL" = xt ; then
332                    command="$command -gsl"
333                fi
334                if test "x$MPI" = xt ; then
335                    command="$command -mpi"
336                fi
337                if test "x$MULTI_THREAD" = xt ; then
338                #- run multi-threaded using OpenMP:
339                    command="$command -omp"
340                fi
341                if test "x$TS" = xt ; then
342                    command="$command -ts"
343                fi
344                if test "x$PAPIS" = xt ; then
345                    command="$command -papis"
346                else
347                if test "x$PCLS" = xt ; then
348                    command="$command -pcls"
349                fi
350                fi
351                printf 'genmake ... ' 1>&2
352                # $command > make.log 2>&1
353                eval $command > make.log 2>&1
354                RETVAL=$?
355                #  Reduce the size of the testing emails!
356                head -100 Makefile > $CDIR/Makefile_head
357                if test "x$RETVAL" != x0 ; then
358                    tail make.log
359                    echo "genmakemodel: genmake failed" 1>&2
360                    cp genmake_* make.log $CDIR
361                    return 1
362                else
363                    echo "successful" 1>&2
364                fi
365            )
366        fi
367  }  }
368    
369  testoutput()  makeclean()
370  {  {
371      # testoutput diretory subdir      # makeclean directory
372      #      if test "x$NOCLEAN" = xt ; then
373      #  test output in "directory"          echo "make Clean skipped!"
374        else
375      if [ $debug -gt 0 ]; then          (
376          echo testoutput: testoutput_for_prop $1 cg2d_init_res 1>&2              cd $1;
377      fi              #if test -e $OUTPUTFILE ; then rm -f $OUTPUTFILE ; fi
378      testoutput_for_prop $1 "cg2d_init_res" "cg2d init. residual" $2; cg2dres=$?              if test -r Makefile ; then
379      if [ $debug -gt 0 ]; then                  printf 'clean build-dir: make Clean ... ' 2>&1
380          echo testoutput: cg2dres=$cg2dres 1>&2                  $MAKE Clean >> make.log 2>&1
381                    RETVAL=$?
382                    if test "x$RETVAL" != x0 ; then
383                        tail make.log
384                        echo "makeclean: \"make Clean\" failed" 1>&2
385                        cp make.log $CDIR"/make.log"
386                        return 1
387                    fi
388                    echo successful 1>&2
389                else
390                    echo ''
391                fi
392                exit 0
393            )
394      fi      fi
       
     testoutput_for_prop $1 "dynstat_theta_min" "theta minimum" $2; tmin=$?  
     testoutput_for_prop $1 "dynstat_theta_max" "theta maximum" $2; tmax=$?  
     testoutput_for_prop $1 "dynstat_theta_mean" "theta mean" $2; tmean=$?  
     testoutput_for_prop $1 "dynstat_theta_sd" "theta s.d." $2; tsd=$?  
     testoutput_for_prop $1 "dynstat_salt_min" "salt minimum" $2; smin=$?  
     testoutput_for_prop $1 "dynstat_salt_max" "salt maximum" $2; smax=$?  
     testoutput_for_prop $1 "dynstat_salt_mean" "salt mean" $2; smean=$?  
     testoutput_for_prop $1 "dynstat_salt_sd" "salt s.d." $2; ssd=$?  
     testoutput_for_prop $1 "dynstat_uvel_min" "U minimum" $2; umin=$?  
     testoutput_for_prop $1 "dynstat_uvel_max" "U maximum" $2; umax=$?  
     testoutput_for_prop $1 "dynstat_uvel_mean" "U mean" $2; umean=$?  
     testoutput_for_prop $1 "dynstat_uvel_sd" "U s.d." $2; usd=$?  
     testoutput_for_prop $1 "dynstat_vvel_min" "V minimum" $2; vmin=$?  
     testoutput_for_prop $1 "dynstat_vvel_max" "V maximum" $2; vmax=$?  
     testoutput_for_prop $1 "dynstat_vvel_mean" "V mean" $2; vmean=$?  
     testoutput_for_prop $1 "dynstat_vvel_sd" "V s.d." $2; vsd=$?  
       
     dashnum $cg2dres $tmin $tmax $tmean $tsd $smin $smax $smean $ssd \  
         $umin $umax $umean $usd $vmin $vmax $vmean $vsd  
395  }  }
396    
397  genmakemodel()  run_clean()
398  {  {
399      # genmakemodel directory      # run_clean directory
400      GENMAKE2="../../../tools/genmake2"      if test "x$NOCLEAN" = xt ; then
401      (          echo "run_clean skipped!"
402          cd $1;      else
403          printf 'genmake ... ' 1>&2          (
404          # ../../../tools/genmake -ieee -mods=../code > make.log 2>&1              cd $1;
405          $GENMAKE2  -ds --mods=../code "--optfile="$OPTFILE > make.log 2>&1              printf 'clean run-dir ... ' 2>&1
406          RETVAL=$?              # part of what is done after "make clean" when doing "make CLEAN"
407          for i in gm_state gm_optfile gm_local Makefile ; do              find . -name "*.meta" -exec rm {} \;
408              if test -r $i ; then              find . -name "*.data" -exec rm {} \;
409                  cp $i $CDIR              find . -name "fort.*" -exec rm {} \;
410              fi              find . -type l -exec rm {} \;
411          done              rm -f $EXECUTABLE *.txt STD* *diagnostics.log datetime
412          if test "x$RETVAL" != x0 ; then              rm -rf mnc_test_*
413              tail make.log              rm -f *_MIT_CE_000.opt0000 costfunction*0000
414              echo "genmakemodel: genmake failed" 1>&2              echo successful 1>&2
415              cp make.log $CDIR              exit 0
416              return 1          )
417          else      fi
             echo "succesful" 1>&2  
         fi  
     )  
418  }  }
419    
420  makeclean()  makedependmodel()
421  {  {
422      # makeclean directory      # makedependmodel directory
423      (      if test "x$NODEPEND" = xt ; then
424          cd $1;          echo "make depend skipped!"
425          rm -f output.txt      else
426          printf 'make CLEAN ... ' 2>&1          (
427          if test -r Makefile ; then              cd $1;
428              make CLEAN >> make.log 2>&1              printf 'make depend ... ' 1>&2
429                $MAKE depend >> make.log 2>&1
430              RETVAL=$?              RETVAL=$?
431              if test "x$RETVAL" != x0 ; then              if test "x$RETVAL" != x0 ; then
432                  tail make.log                  tail make.log
433                  echo "makeclean: \"make CLEAN\" failed" 1>&2                  echo "makedependmodel: make depend failed" 1>&2
434                  cp make.log $CDIR"/make.log"                  cp make.log $CDIR"/make.log"
435                  return 1                  return 1
436                else
437                    echo successful 1>&2
438              fi              fi
439          fi          )
440          echo succesful 1>&2      fi
         exit 0  
     )  
 }  
   
 makedependmodel()  
 {  
     # makedependmodel directory  
     (  
         cd $1;  
         printf 'make depend ... ' 1>&2  
         make depend >> make.log 2>&1  
         RETVAL=$?  
         if test "x$RETVAL" != x0 ; then  
             tail make.log  
             echo "makedependmodel: make depend failed" 1>&2  
             cp make.log $CDIR"/make.log"  
             return 1  
         else  
             echo succesful 1>&2  
         fi  
     )  
441  }  }
442    
443  makemodel()  makemodel()
# Line 231  makemodel() Line 447  makemodel()
447          cd $1;          cd $1;
448          if test -r Makefile ; then          if test -r Makefile ; then
449              printf 'make ... ' 1>&2              printf 'make ... ' 1>&2
450              make >> make.log 2>&1              if test "x$ADM" = xt ; then
451                    $MAKE adall >> make.log 2>&1
452                elif test "x$OADM" = xt ; then
453                    $MAKE adAll >> make.log 2>&1
454                else
455                    if test "x$JOBS" = x ; then
456                        $MAKE >> make.log 2>&1
457                    else
458                        $MAKE -j $JOBS >> make.log 2>&1
459                    fi
460                fi
461              RETVAL=$?              RETVAL=$?
462              if test "x$RETVAL" != x0 ; then              if test "x$RETVAL" != x0 ; then
463                  tail make.log                  tail make.log
464                  echo failed 1>&2                  echo failed 1>&2
465                  cp make.log $CDIR"/make.log"                  cp make.log $CDIR"/make.log"
466                    rm -f $EXECUTABLE
467                  return 1                  return 1
468              else              else
469                  echo succesful 1>&2                  echo successful 1>&2
470              fi              fi
471          fi          fi
472      )      )
473  }  }
474    
475    symlink_mpifiles()
476    {
477        # Put special links so that MPI specific files are used
478        # This MUST be invoked between makeclean and makelinks because
479        # the Makefile will link to non-mpi files by default
480    
481        dir=$1
482        code_dir=$2
483        BUILD_DIR=$dir/$3
484        CODE_DIR=$dir/$code_dir
485        
486        # These are files that should replace their counter-part when using -mpi
487        MPI_FILES=`(cd $CODE_DIR; find . -name "*_mpi" -print)`
488    
489        #  Is this an MPI run?
490        if test "x$MPI" = xt ; then
491            # YES: We symbolically link these files to the build
492            # dir so long as there is no real file in place
493            for ii in $MPI_FILES ; do
494                i=`echo $ii | sed 's:^\./::'`
495                name=`echo $i | sed 's:_mpi::' `
496                cmp $CODE_DIR/$i $BUILD_DIR/$name > /dev/null 2>&1
497                RETVAL=$?
498                if test "x$RETVAL" != x0 ; then
499                    if ! test -f $BUILD_DIR/$i ; then
500                        #echo Linking $name to $i
501                        (cd $BUILD_DIR; ln -sf ../$code_dir/$i $name)
502                    fi
503                fi
504            done
505        else
506            # NO: We undo any _mpi symbolically linked files
507            for ii in $MPI_FILES ; do
508                i=`echo $ii | sed 's:^\./::'`
509                name=`echo $i | sed 's:_mpi::' `
510                if test -L $BUILD_DIR/$name ; then
511                    cmp $BUILD_DIR/$name "../$code_dir/$name"_mpi > /dev/null 2>&1
512                    RETVAL=$?
513                    if test "x$RETVAL" = x0 ; then
514                        #echo Un-linking $name from $linktarg
515                        rm -f $BUILD_DIR/$name
516                    fi
517                fi
518            done
519        fi
520        
521    }
522    
523  linkdata()  linkdata()
524  {  {
525      # linkdata flag      # linkdata run_dir input_dir_1 input_dir_2 ...
526      #      #
527      # symbolically link data files to run directory      # symbolically link data files to run directory
528      if [ $1 -ne 0 ]; then      if test -d $1 ; then
529          ( cd $2 ;  ln -sf ../input/* . )          (
530                cd $1 ; shift
531                inpMPI=`(cd ../$1 ; find . -name "*.mpi" -print | sed 's:^\./::')`
532                for xx in $inpMPI ; do
533                  if test -r "../"$1"/"$xx ; then
534                    # found 1 _mpi sfx file in 1rst input dir and it is readable
535                    yy=`echo $xx | sed 's:\.mpi$::'`
536                    if test "x$MPI" = "xt" ; then
537                    # mpi test: remove symbolic link & link _mpi sfx file
538                        if test -h $yy ; then rm -f $yy ; fi
539                        if test ! -r $yy ; then
540                            ln -sf "../"$1"/"$xx $yy ;
541                            printf "$xx " 1>&2
542                        fi
543                    else
544                    # not mpi test: remove symbolic link
545                        if test -h $yy ; then rm -f $yy ; fi
546                    fi
547                  fi
548                done
549                if test -r "../"$1"/eedata.mth" ; then
550                # found eedata.mth in 1rst input dir and it is readable
551                    if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
552                    # multi-threaded test: remove symbolic link & link eedata.mth
553                        if test -h eedata ; then rm -f eedata ; fi
554                        if test ! -r eedata ; then
555                            ln -sf "../"$1"/eedata.mth" eedata ;
556                            printf 'eedata.mth ' 1>&2
557                        fi
558                    else
559                    # not multi-threaded test: remove eedata symbolic link
560                        if test -h eedata ; then rm -f eedata ; fi
561                    fi
562                fi
563                prevDir='NONE'
564                for ldir in $* ; do
565                    if test -d "../"$ldir -a $ldir != $prevDir ; then
566                        printf 'ldir='${ldir} 1>&2
567                        files=`( cd "../"$ldir ; ls -1 | grep -v CVS )`
568                        for i in $files ; do
569                            if test ! -d "../"$ldir/$i ; then
570                                if test ! -r $i  ; then
571                                    printf ' '$i 1>&2
572                                    ln -sf "../"$ldir"/"$i $i
573                                fi
574                            fi
575                        done
576                        if test -x "../"$ldir"/"prepare_run ; then
577                            "../"$ldir"/"prepare_run
578                        fi
579                        printf ' ; ' 1>&2
580                    fi
581                    prevDir=$ldir
582                done
583            )
584      fi      fi
585  }  }
586    
587  runmodel()  runmodel()
588  {  {
589      # runmodel directory exe      # runmodel directory
590      #      #
591      #  runs the model "exe" in "directory" (exe is relative to directory)      #  runs "$COMMAND in "directory"
592        #  (where "$COMMAND" is relative to "directory")
593      (      (
594          cd $1          cd $1
595          if [ -x $2 ]; then          printf 'runmodel in %s ...' $1 1>&2
596              if [ $quick -eq 0 ]; then          # make output.txt
597                  rm -f output.txt          echo
598              fi          if test -L $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then
599              printf 'runmodel: ' 1>&2              diff -q $EXECUTABLE "../"$builddir"/"$EXECUTABLE > /dev/null 2>&1
600              make output.txt              outD=$? ; if test $outD != 0 ; then rm -f $EXECUTABLE ; fi
601              RETVAL=$?          fi
602              if test "x$RETVAL" = x0 ; then          if test ! -x $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then
603                  cp output.txt $CDIR"/output.txt"              echo " link" $EXECUTABLE "from dir ../"$builddir > run.log_tmp
604                  return 0              ln -sf "../"$builddir"/"$EXECUTABLE .
605            fi
606            if test ! -x $EXECUTABLE ; then
607                    rm -f $RUNLOG ; touch $RUNLOG
608                    if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi
609                    echo " no executable:" $EXECUTABLE >> $RUNLOG
610                    RETVAL=8
611                    ENDVAL=-1
612            else
613                if test ! -f $OUTPUTFILE -o $OUTPUTFILE -ot $EXECUTABLE ; then
614                  # output do not exist or is older than executable:
615                    rm -f $RUNLOG ; touch $RUNLOG
616                    if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi
617                    ( eval $COMMAND ) >> $RUNLOG 2>&1
618                    RETVAL=$?
619              else              else
620                  return 1                  RETVAL=0
621                    if test -f $RUNLOG ; then
622                        if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi
623                        echo "---------->> $OUTPUTFILE is up to date " >> $RUNLOG 2>&1
624                    else
625                        touch $RUNLOG
626                        if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi
627                        echo "---------->> $OUTPUTFILE is up to date " >> $RUNLOG 2>&1
628                        echo " no previous $RUNLOG: assume NORMAL END" >> $RUNLOG 2>&1
629                    fi
630              fi              fi
631                ENDVAL=`cat $RUNLOG | grep -v 'ABNORMAL END' | grep -c 'NORMAL END'`
632            fi
633            rm -f run.log_tmp
634            #if test "x$RETVAL" = x0 ; then
635            if [ $RETVAL -eq 0 -a $ENDVAL -gt 0 ] ; then
636                tail $RUNLOG
637                echo successful 1>&2
638                # === Reduce the size of the testing emails!
639                #cp $OUTPUTFILE $CDIR"/"$OUTPUTFILE
640                if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi
641                return 0
642            else
643                tail $RUNLOG
644                echo failed '(run:' $RETVAL ' end:' $ENDVAL ')' 1>&2
645                cp $RUNLOG $CDIR"/"$RUNLOG
646                if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi
647                return 1
648          fi          fi
649      )      )
650  }  }
# Line 283  createcodelet() Line 653  createcodelet()
653  {  {
654      # create codelet for comparing model output      # create codelet for comparing model output
655    
656      echo -n "creating the comparison code...  "      printf "creating the comparison code (using CC=$CC)...  "
657      cat > tmp_cmpnum.f <<EOFA      cat > tr_cmpnum.c <<EOF
658        program cmpnum  #include <stdio.h>
659        implicit none  #include <math.h>
660        real*8 a,b,diff  int main( int argc, char** argv )  {
661        integer linnum,best    int linnum,cmplin,best,lncnt;
662        best=-16    double a,b,abave,relerr;
663    99  read(*,*,end=70,err=60) linnum,a,b    best = -22;
664        diff=0.5*(abs(a)+abs(b))    lncnt = 0;
665  c     print *,a,b,diff,abs(a-b)/diff    while( 1 & ( (lncnt+=1) < 999 ) )  {
666        if (diff.gt.1.e-12) then      scanf("%d", &linnum);
667          diff=abs(a-b)/diff      if (linnum == -1)  break;
668          if (diff.gt.0.) then      scanf("%lf", &a);  scanf("%lf", &b);
669  c         print *,int(log10(diff)),diff      abave = 0.5*(fabs(a)+fabs(b));
670            linnum=int(log10(diff))      if ( abave == abave ) {
671            best=max(best,linnum)        if (abave > 0.0) {
672          endif          relerr=fabs(a-b)/abave;
673        else          if (relerr > 0.0) { cmplin = (int)rint(log10(relerr)); }
674          if (best.eq.-16.and.diff.ne.0.) best=-22          else { cmplin = -16 ; }
675        endif          best = (best > cmplin) ? best : cmplin; }
676        goto 99        else { cmplin = -22 ; }
677    60  stop 'cmpnum: An error occured reading a,b'     /* printf("%d ; %lf ; %lf\n",cmplin,a,b); */
678    70  print *,-best        }
679        end     else {
680  EOFA     /* printf("%lf ; %lf ; %lf\n",abave,a,b); */
681          break; }
682      }
683      if (lncnt == 999) best=-29;
684      if (linnum != -1) best=-99;
685      printf("%d\n", -best);
686      return 0;
687    }
688    EOF
689        $CC -o tr_cmpnum tr_cmpnum.c -lm
690    
691      f77 tmp_cmpnum.f      if [ -x ./tr_cmpnum ]; then
     if [ -x ./a.out ]; then  
692          echo "OK"          echo "OK"
693          return 0          return 0
694      else      else
695          echo          echo
696          echo "createcodelet: failed to compile codelet" | tee          echo "ERROR: failed to compile comparison code -- please specify"
697            echo "  a C compiler using the CC environment variable."
698          exit 1          exit 1
699      fi      fi
700  }  }
# Line 327  formatresults() Line 706  formatresults()
706      nm=$1      nm=$1
707      printf '%s %s %s %s' $2 $3 $4 $5      printf '%s %s %s %s' $2 $3 $4 $5
708      shift; shift; shift; shift; shift;      shift; shift; shift; shift; shift;
709      printf '%3s' $@      listPrt=$@
710        listRes=`echo $listPrt | sed 's/>//' | sed 's/<//'`
711        xx=`echo $listPrt | sed 's/.*>//' | sed 's/<.*//' | awk '{print $1}'`
712        printf '%3s' $listPrt
713    #   line below does not work on hp-ux_ia64 : do those substitutions later on
714    #   printf '%3s' $listPrt | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</'
715            
716      if [ $1 = '--' ]; then      if [ $xx = '..' ]; then
717            printf ' N/O '
718        elif [ $xx = '--' ]; then
719            printf ' N/O '
720        elif [ $xx = 99 ]; then
721          printf ' N/O '          printf ' N/O '
722      else      else
723          if [ $1 -gt 12 ]; then          if [ $xx -ge $MATCH_CRIT ]; then
724              printf ' pass'              printf ' pass'
725          else          else
726              printf ' FAIL'              printf ' FAIL'
# Line 343  formatresults() Line 731  formatresults()
731            
732  }  }
733    
734  show_help()  scandirs()
735  {  {
736      cat - << EOF      if [ $# -eq 1 ]; then
737  $0 [-help] [-quick] [-verbose] dir1 [dir2] [...]          for arg in * ; do
738   -help      Show this help message              test -f $arg/$1 && echo $arg
739   -quick     Skip "genmake" and "make depend" if the Makefile exists          done
740   -quiet     Reduce the amount of output      else
741   -verbose   Produce copious amounts of output          echo $*
742   -debug     Produce even more output which will mean nothing to most      fi
  -force     Do "make CLEAN" before compiling. This forces a complete rebuild.  
  -clean     Do "make CLEAN" after compiling and testing.  
  -noieee    By default, $0 uses the -ieee option for genmake. This turns it off.  
  -cleanup   Aggresively removes all model output, executables and object files  
             and then exits. Use with care.  
   
 Normal usage:  
  $0 *       Configure, compile, run and analyze in all experiment directories  
 EOF  
743  }  }
744    
745  scandirs()  
746    check_eedata()
747  {  {
748      if [ $# -eq 0 ]; then      # check_eedata size.h eedata
749          for arg in * ; do      if [ $# -eq 2 ] ; then
750              test -d $arg/input && echo $arg        if test -f $1 -a -f $2 ; then
751          done        sx=`grep "^     & *nSx *=" $1 | sed "s/^     & *nSx *=//" | sed 's/, *$//'`
752          nx=`grep "^ *nTx *=" $2 | tail -1 | sed 's/^ *nTx *= *//' | sed "s/, *$//"`
753          if test "x$nx" = x ; then
754            rx=10
755          else
756            rx=`expr $sx % $nx`
757          fi
758          sy=`grep "^     & *nSy *=" $1 | sed "s/^     & *nSy *=//" | sed 's/, *$//'`
759          ny=`grep "^ *nTy *=" $2 | tail -1 | sed 's/^ *nTy *= *//' | sed "s/, *$//"`
760          if test "x$ny" = x ; then
761            ry=20
762          else
763            ry=`expr $sy % $ny`
764          fi
765          echo `expr $rx + $ry`
766        else
767          echo '-1'
768          fi
769      else      else
770          echo $*        echo '-2'
771      fi      fi
 }  
772    
773    }
774    
775  ###############################################################################  ###############################################################################
 ###############################################################################  
 ###############################################################################  
776    
777    
778  #  Default properties  #  Default properties
779  debug=0  debug=0
780  verbose=1  verbose=1
 quick=0  
781  clean=0  clean=0
 ieee=1  
 expts=''  
782    
783  OPTFILES=  IEEE=true
784  ADDRESSES=edhill@mitgcm.org  if test "x$MITGCM_IEEE" != x ; then
785        IEEE=$MITGCM_IEEE
786    fi
787    GSL=f
788    
789    CLEANUP=f
790    QUICK=f
791    NOGENMAKE=f
792    NOCLEAN=f
793    NODEPEND=f
794    POSTCLEAN=f
795    
796    BASH=
797    OPTFILE=NONE
798    ADDRESSES=
799  TESTDIRS=  TESTDIRS=
800    SKIPDIRS=
801  MPACKDIR="../tools/mpack-1.6"  MPACKDIR="../tools/mpack-1.6"
802  MPACK="$MPACKDIR/mpack"  HAVE_MPACK=
803    MPACK=
804    COMMAND=
805    if test "x$MAKE" = x ; then
806        MAKE=make
807    fi
808    if test "x$CC" = x ; then
809        CC=cc
810    fi
811    JOBS=
812    MPI=f
813    MULTI_THREAD=f
814    OUTDIR=
815    DELDIR=
816    
817    ADM=
818    OADM=
819    
820    # list of pTracers to check for monitor output
821    PTRACERS_NUM="1 2 3 4 5"
822    
823  echo -n "parsing options...  "  MATCH_CRIT=13
824    
825    printf "parsing options...  "
826    
827  ac_prev=  ac_prev=
828  for ac_option ; do  for ac_option ; do
# Line 414  for ac_option ; do Line 842  for ac_option ; do
842              usage ;;              usage ;;
843                    
844          -optfile | --optfile | -of | --of)          -optfile | --optfile | -of | --of)
845              ac_prev=OPTFILES ;;              ac_prev=OPTFILE ;;
846          -optfile=* | --optfile=* | -of=* | --of=*)          -optfile=* | --optfile=* | -of=* | --of=*)
847              OPTFILES=$ac_optarg ;;              OPTFILE=$ac_optarg ;;
848                    
849          -addr | --addr | -a | --a)          -addr | --addr | -a | --a)
850              ac_prev=ADDRESSES ;;              ac_prev=ADDRESSES ;;
851          -addr=* | --addr=*)          -addr=* | --addr=*)
852              ADDRESSES=$ac_optarg ;;              ADDRESSES=$ac_optarg ;;
853            -mpackdir | --mpackdir | -mpd | --mpd)
854                ac_prev=MPACKDIR ;;
855            -mpackdir=* | --mpackdir=* | -mpd=* | --mpd=*)
856                MPACKDIR=$ac_optarg ;;
857    
858          -tdir | --tdir | -t | --t)          -tdir | --tdir | -t | --t)
859              ac_prev=TESTDIRS ;;              ac_prev=TESTDIRS ;;
860          -tdir=* | --tdir=*)          -tdir=* | --tdir=*)
861              TESTDIRS=$ac_optarg ;;              TESTDIRS=$ac_optarg ;;
862    
863          -quick) quick=1 ;;          -skipdir | --skipdir | -skd | --skd)
864                ac_prev=SKIPDIRS ;;
865            -skipdir=* | --skipdir=*)
866                SKIPDIRS=$ac_optarg ;;
867    
868            -bash | --bash | -b | --b)
869                ac_prev=BASH ;;
870            -bash=* | --bash=*)
871                BASH=$ac_optarg ;;
872    
873            -command | --command | -c | --c)
874                ac_prev=COMMAND ;;
875            -command=* | --command=*)
876                COMMAND=$ac_optarg ;;
877    
878            -make | --make | -m | --m)
879                ac_prev=MAKE ;;
880            -make=* | --make=*)
881                MAKE=$ac_optarg ;;
882    
883            -odir | --odir)
884                ac_prev=OUTDIR ;;
885            -odir=* | --odir=*)
886                OUTDIR=$ac_optarg ;;
887    
888            -ptracers | --ptracers | -ptr | --ptr)
889                ac_prev=PTRACERS_NUM ;;
890            -ptracers=* | --ptracers=* | -ptr=* | --ptr=*)
891                PTRACERS_NUM=$ac_optarg ;;
892    
893            -match | --match ) ac_prev=MATCH_CRIT ;;
894            -match=* | --match=* ) MATCH_CRIT=$ac_optarg ;;
895    
896            -j) ac_prev=JOBS ;;
897            -j=*) JOBS=$ac_optarg ;;
898    
899            -clean | --clean)
900                CLEANUP=t ; DELDIR=t ;;
901    
902            -quick | --quick | -q | --q)
903                QUICK=t ;;
904            -nogenmake | --nogenmake | -ng | --ng)
905                NOGENMAKE=t ;;
906            -noclean | --noclean | -nc | --nc)
907                NOCLEAN=t ;;
908            -nodepend | --nodepend | -nd | --nd)
909                NODEPEND=t ;;
910    
911            -postclean | --postclean | -pc | --pc)
912                POSTCLEAN=t ;;
913    
914            -mpi) MPI=t ;;
915    
916            -mth) MULTI_THREAD=t ;;
917    
918            -adm | -ad) ADM=t ;;
919    
920            -oad) OADM=t; NODEPEND=t ;;
921    
922            -ieee) IEEE=true ;;
923            -noieee) IEEE= ;;
924            -gsl) GSL=t ;;
925    
926          -verbose) verbose=2 ;;          -verbose) verbose=2 ;;
927          -debug) debug=1 ;;          -debug) debug=1 ;;
         -clean) clean=1 ;;  
         -noieee) ieee=0 ;;  
928          -quiet) verbose=0 ;;          -quiet) verbose=0 ;;
929    
930            -deldir | -dd) DELDIR=t ;;
931    
932            -ts) TS=t;;
933    
934            -papis) PAPIS=t;;
935    
936            -pcls) PCL=t;;
937    
938          -*)          -*)
939              echo "Error: unrecognized option: "$ac_option              echo "Error: unrecognized option: "$ac_option
940              usage              usage
# Line 449  for ac_option ; do Line 949  for ac_option ; do
949            
950  done  done
951    
952    if test "x$QUICK" = xt ; then
953        NOGENMAKE=t
954        NOCLEAN=t
955        NODEPEND=t
956    fi
957    
958    #- setting for forward or ADM testing
959    if test "x$ADM" = xt ; then
960        code_dir=code_ad
961        inputdir=input_ad
962        ref_outp="output_adm.txt"
963        EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"
964    elif test "x$OADM" = xt ; then
965        code_dir=code_oad
966        inputdir=input_oad
967        ref_outp="output_oadm.txt"
968        EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"
969    else
970        code_dir=code
971        inputdir=input
972        ref_outp="output.txt"
973        EXECUTABLE="mitgcmuv"
974    fi
975    
976  if test "x$TESTDIRS" = x ; then  if test "x$TESTDIRS" = x ; then
977      TESTDIRS=`scandirs`      LIST=`scandirs results/$ref_outp`
978    else
979        #- expand group of experiments:
980        LIST=" "
981        for xx in $TESTDIRS
982        do
983          case $xx in
984            'basic') LIST=${LIST}" aim.5l_cs hs94.128x64x5 ideal_2D_oce"
985                     LIST=${LIST}" lab_sea tutorial_baroclinic_gyre"
986                     LIST=${LIST}" tutorial_global_oce_latlon tutorial_plume_on_slope"
987                    ;;
988            'tutorials')
989                     LIST=${LIST}" "`ls | grep 'tutorial_'` ;;
990            *)       LIST=${LIST}" "$xx ;;
991          esac
992        done
993    fi
994    #echo 'LIST='${LIST}'<'
995    #- skip dirs, remove duplicate and non-directory:
996    TESTDIRS=" "
997    count=0
998    for xx in $LIST
999    do
1000        yy=`echo $SKIPDIRS | grep -c $xx`
1001        if test $yy = 0 ; then
1002            if test -d $xx ; then
1003                yy=`echo $TESTDIRS | grep -c $xx`
1004                if test $yy = 0 ; then TESTDIRS=${TESTDIRS}" "$xx ; fi
1005            else count=1 ;
1006                echo ""; echo -n " -- skip \"$xx\" (not a directory !)"
1007            fi
1008        else
1009            if test $count = 1 ; then echo -n ", \"$xx\""
1010            else count=1 ; echo "" ;  echo -n " skip: \"$xx\""
1011            fi
1012        fi
1013    done
1014    if test $count = 1 ; then echo "" ; echo -n " ... " ; fi
1015    #echo 'TESTDIRS='${TESTDIRS}'<'
1016    
1017    if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM_OF" != x ; then
1018        OPTFILE=$MITGCM_OF
1019  fi  fi
1020    
1021  echo "OK"  RUNLOG="run.log"
1022    OUTPUTFILE=$ref_outp
1023    if test "x$COMMAND" = x ; then
1024        COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"
1025    fi
1026    if test "x$MPI" = xt ; then
1027        OUTPUTFILE="STDOUT.0000"
1028    fi
1029    
1030    echo "OK (COMMAND= $COMMAND )"
1031    
1032    # set the Default List of output variables to be checked:
1033    #  (use default or load experiment-specific list from file "tr_checklist")
1034    # content : 1rst = main variable used to decide if it pass or FAIL
1035    #         others = number of matching digits to be printed in summary.txt
1036    if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; then
1037        DEF_CHECK_LIST='PS PS T+ S+ U+ V+ pt1+ pt2+ pt3+ pt4+ pt5+'
1038        EMPTY_RESULTS='.. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. ..'
1039        LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`
1040        ii=`echo $EMPTY_RESULTS | awk '{print NF}'`
1041        EMPTY_RESULTS=$EMPTY_RESULTS`expr $LEN_CHECK_LIST - $ii | awk 'BEGIN{FS=":"}{for(i=1;i<=$1;i++){printf "  ."}}'`
1042    else
1043        DEF_CHECK_LIST='Grad Cost Grad'
1044        EMPTY_RESULTS='.. ..'
1045        LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`
1046    fi
1047    
1048  #  create the FORTRAN comparison code  #  create the FORTRAN comparison code
1049  createcodelet  createcodelet
1050    
1051  #  build the mpack utility  #  build the mpack utility (if ADDRESSES = NONE, do it to test the build)
1052  build_mpack  if test "x$ADDRESSES" = x ; then
1053        echo "skipping mpack build"
1054    else
1055        build_mpack
1056    fi
1057    
1058  #  Create a uniquely named directory to store results  #  Create a uniquely named directory to store results
1059    CMDLINE=$0
1060    for xx in "$@" ; do nw=`echo $xx | wc -w`
1061        if test $nw = '1' ; then CMDLINE="$CMDLINE $xx"
1062                            else CMDLINE="$CMDLINE '$xx'" ; fi
1063    done
1064    #for xx in "$@" ; do CMDLINE="$CMDLINE '$xx'" ; done
1065  MACH=`hostname`  MACH=`hostname`
1066  UNAMEA=`uname -a`  UNAMEA=`uname -a`
1067  DATE=`date +%Y%m%d`  DATE=`date +%Y%m%d`
1068  BASE=$MACH"_"$DATE"_"  BASE="tr_"$MACH"_"$DATE"_"
1069    if test "x$OUTDIR" != x ; then
1070        BASE="tr_"$OUTDIR"_"$DATE"_"
1071    else
1072        short_name=`hostname | sed 's/\..*$//'`
1073        BASE="tr_"$short_name"_"$DATE"_"
1074    fi
1075  DNUM=0  DNUM=0
1076  DRESULTS="$BASE$DNUM"  DRESULTS="$BASE$DNUM"
1077  while test -e $DRESULTS ; do  while test -e $DRESULTS ; do
# Line 475  done Line 1081  done
1081  mkdir $DRESULTS  mkdir $DRESULTS
1082  RETVAL=$?  RETVAL=$?
1083  if test "x$RETVAL" != x0 ; then  if test "x$RETVAL" != x0 ; then
1084      echo "Error: can't create results directory \"./$DRESULTS\""      echo "ERROR: Can't create results directory \"./$DRESULTS\""
1085      exit 1      exit 1
1086  fi  fi
1087  SUMMARY="$DRESULTS/summary.txt"  SUMMARY="$DRESULTS/summary.txt"
1088  date > $SUMMARY  start_date=`date`
1089  cat << EOF >> $SUMMARY  echo $start_date > $SUMMARY
1090                  T           S           U           V  echo 'run:' $CMDLINE >> $SUMMARY
1091  G D M    c        m  s        m  s        m  s        m  s  echo 'on :' $UNAMEA  >> $SUMMARY
1092  E p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  
1093  N n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  of_path=
1094  2 d e n  d  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  .  if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then
1095        if test -r $OPTFILE ; then
1096            # get the path
1097            path=${OPTFILE%/*}
1098            if test "x$path" = x ; then
1099                of_path=`pwd`
1100            else
1101                of_path=`( cd $path > /dev/null 2>&1 ; pwd )`
1102            fi
1103            file=${OPTFILE##*/}
1104            OPTFILE=$of_path/$file
1105            cp $OPTFILE $DRESULTS
1106            echo >> $SUMMARY
1107            echo "  OPTFILE=$OPTFILE" >> $SUMMARY
1108        else
1109            echo | tee $SUMMARY
1110            echo "ERROR: can't read OPTFILE=\"$OPTFILE\"" | tee $SUMMARY
1111            exit 1
1112        fi
1113    else
1114        echo >> $SUMMARY
1115        echo "No \"OPTFILE\" was explicitly specified by testreport," >> $SUMMARY
1116        echo "   so the genmake default will be used." >> $SUMMARY
1117    fi
1118    echo
1119    echo >> $SUMMARY
1120    if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; then
1121        if [ $MATCH_CRIT -lt 10 ] ;
1122        then line_0="default  "$MATCH_CRIT ;
1123        else line_0="default "$MATCH_CRIT ; fi
1124           line_0="$line_0  ----T-----  ----S-----  ----U-----  ----V-----"
1125    #   line_0="            ----T-----  ----S-----  ----U-----  ----V-----"
1126        line_1="G D M    c        m  s        m  s        m  s        m  s"
1127        line_2="E p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  ."
1128        line_3="N n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d"
1129        line_4="2 d e n  d  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  ."
1130        for ii in $PTRACERS_NUM ; do
1131            line_0="$line_0  --PTR 0"$ii"--"
1132            line_1="$line_1        m  s"
1133            line_2="$line_2  m  m  e  ."
1134            line_3="$line_3  i  a  a  d"
1135            line_4="$line_4  n  x  n  ."
1136        done
1137        echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY
1138        echo "$line_1" | tee -a $SUMMARY
1139        echo "$line_2" | tee -a $SUMMARY
1140        echo "$line_3" | tee -a $SUMMARY
1141        echo "$line_4" | tee -a $SUMMARY
1142        echo " "       | tee -a $SUMMARY
1143    else
1144        echo "ADJOINT=true" >> $SUMMARY
1145        echo >> $SUMMARY
1146        if [ $MATCH_CRIT -lt 10 ] ;
1147        then line_0="default     "$MATCH_CRIT ;
1148        else line_0="default    "$MATCH_CRIT ; fi
1149        echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY
1150        cat << EOF | tee -a $SUMMARY
1151    G D M    C  G
1152    E p a R  o  r
1153    N n k u  s  a
1154    2 d e n  t  d
1155    
1156  EOF  EOF
1157    fi
1158    
1159  NDIR=0  #  ...and each test directory...
1160    for dir in $TESTDIRS ; do
1161        
1162        # set builddir & rundir:
1163        builddir="build"
1164        if test ! -d $dir/$builddir ; then mkdir $dir/$builddir ; fi
1165        rundir="run"
1166        if test ! -d $dir/$rundir ; then
1167            rundir=$builddir
1168        fi
1169        CODE_DIR=$dir/$code_dir
1170        BUILD_DIR=$dir/$builddir
1171    
1172  #  For each optfile...      #  Cleanup only!
1173  for OPTFILE in $OPTFILES ; do      if test "x$CLEANUP" = xt ; then
1174            echo -n '  --- dir:' $BUILD_DIR ': '
1175            makeclean $BUILD_DIR
1176            rm -f $BUILD_DIR/$EXECUTABLE
1177            if test -d $dir/$rundir/CVS ; then
1178                echo -n '  --- dir:' $dir/$rundir ': '
1179                run_clean $dir/$rundir
1180            fi
1181            trdir=`( cd $dir ; find . -type d -name "tr_run.*" -print | sed 's/^.\///')`
1182            ttd=`echo $trdir | wc -w`
1183            if test $ttd != 0 ; then
1184                echo '  --- rm dir:' $trdir
1185                ( cd $dir ; rm -rf $trdir )
1186            fi
1187            continue
1188        fi
1189    
1190      OPTFILE=`pwd`"/$OPTFILE"      #  Verify that the testdir exists and contains previous
1191      if test ! -r $OPTFILE ; then      #  results in the correct location--or skip this directory!
1192          echo "Error: can't read optfile \"$OPTFILE\""      fout=$dir"/results/"$ref_outp
1193          exit 1      if test ! -r $fout ; then
1194            echo "can't read \"$fout\" -- skipping $dir"
1195            continue
1196      fi      fi
     echo  
     echo "OPTFILE=$OPTFILE" >> $SUMMARY  
     echo >> $SUMMARY  
       
     #  ...and each test directory...  
     for dir in $TESTDIRS ; do  
           
         #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir combination  
         CDIR=$DRESULTS"/"$DRESULTS"_"$NDIR  
         mkdir $CDIR  
         CDIR=`pwd`"/$CDIR"  
1197    
1198          #  ...configue, make, run, and compare the output.      # Check for specific files for particular type of run
         echo "-------------------------------------------------------------------------------"  
         echo  
         echo "Experiment:  $dir"  
         echo  
         unset genmake makedepend make run  
         results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'  
         ( cd $dir/input; rm -f *.{o,f,c,F} *.[f,F]90 work* output.txt Make* make.log; )  
         if [ -r $dir/build ]; then  
             seperatebuilddir=1  
             builddir=build  
             rundir=build  
             ( cd $dir/build; ln -sf ../input/* . )  
         else  
             seperatebuilddir=0  
             builddir=input  
             rundir=input  
         fi  
1199    
1200          #  Verify that the testdir exists and contains previous      if test ! -r $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" -a "x$MPI" = "xt" ; then
1201          #  results in the correct location--or skip this directory!          echo "can't find \"$CODE_DIR/SIZE.h_mpi\" -- skipping $dir"
1202          if test ! -r $dir"/results/output.txt" ; then          continue
1203              echo | tee $SUMMARY      fi
1204              echo "can't read \"$dir/results/output.txt\" -- skipping $dir" \      if test ! -r $dir"/input/eedata.mth" -a "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
1205                  | tee $SUMMARY          echo "can't find \"$dir/input/eedata.mth\" -- skipping $dir"
1206              continue          continue
1207        fi
1208        if test "x$MPI" = "xt" -a "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
1209          retv=`check_eedata $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" $dir"/input/eedata.mth"`
1210          if test $retv != 0 ; then
1211            echo "input/eedata.mth tiling misfit -- skipping $dir"
1212            continue
1213          fi
1214        fi
1215    
1216        #  Check whether there are "extra runs" for this testdir
1217        extra_runs=
1218        ex_run_dirs=`( cd $dir ; echo $inputdir.* )`
1219        #echo "ex_run_dirs='$ex_run_dirs'"
1220        for exd in $ex_run_dirs ; do
1221            name=`echo $exd | sed -e "s/$inputdir\.//"`
1222            refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${name}./"`
1223            outf="$dir/results/$refExOut"
1224            if test -f $outf -a -r $outf ; then
1225              if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
1226                if test -r $dir"/"$exd"/eedata.mth" ; then
1227                  if test "x$MPI" = "xt" ; then
1228                    retv=`check_eedata $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" $dir"/"$exd"/eedata.mth"`
1229                    if test $retv = 0 ; then
1230                        extra_runs="$extra_runs $name"
1231                    else
1232                        echo $exd"/eedata.mth tiling misfit -- skipping $dir"
1233                    fi
1234                  else
1235                    extra_runs="$extra_runs $name"
1236                  fi
1237                #else echo $dir"/"$exd"/eedata.mth: not found"
1238                fi
1239              else
1240                extra_runs="$extra_runs $name"
1241              fi
1242          fi          fi
1243        done
1244    
1245        echo "-------------------------------------------------------------------------------"
1246        echo
1247        if test "x$extra_runs" = "x" ; then
1248           echo "Experiment:  $dir"
1249        else
1250           echo "Experiment:  $dir ; extra_runs=$extra_runs"
1251        fi
1252        echo
1253        unset genmake makedepend make run
1254        results=$EMPTY_RESULTS
1255    
1256        #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir combination
1257        rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir
1258        mkdir $rel_CDIR
1259        CDIR=`pwd`"/$rel_CDIR"
1260        
1261        if test "x$CLEANUP" = xt ; then
1262            echo '====>>> this is to check that we never go through this part <<< ==='
1263            makeclean $dir/$builddir \
1264                && run_clean $dir/$rundir
1265        else
1266          genmakemodel $dir/$builddir && genmake=Y \          genmakemodel $dir/$builddir && genmake=Y \
1267              && makeclean $dir/$builddir \              && makeclean $dir/$builddir \
1268                && run_clean $dir/$rundir \
1269                && symlink_mpifiles $dir $code_dir $builddir \
1270              && makedependmodel $dir/$builddir && makedepend=Y \              && makedependmodel $dir/$builddir && makedepend=Y \
1271              && makemodel $dir/$builddir && make=Y \              && makemodel $dir/$builddir && make=Y \
1272              && linkdata $seperatebuilddir $dir/$rundir \              && linkdata $dir/$rundir $inputdir input \
1273              && runmodel $dir/$builddir mitgcmuv && run=Y \              && runmodel $dir/$rundir && run=Y \
1274              && results=`testoutput $dir $rundir`              && results=`testoutput_run $dir $rundir $ref_outp`
1275          echo      fi
1276          formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} \      
1277              ${run:-N} $results      echo
1278            fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`
1279          echo          echo
1280          formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} \          echo "$fres" | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</' >> $SUMMARY
1281              ${run:-N} $results >> $SUMMARY          touch $CDIR"/summary.txt"
1282          echo "fresults='" > $CDIR"/summary.txt"          echo "fresults='$fres'" | sed 's/ 99/ --/g' >> $CDIR"/summary.txt"
         formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} \  
             ${run:-N} $results >> $CDIR"/summary.txt"  
         echo "'" >> $CDIR"/summary.txt"  
1283          echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"
1284          echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"
1285          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
1286          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"
1287            if test "x$ADM" = xt ; then
1288                head -1 $dir/$builddir/taf_ad.log >> $CDIR"/summary.txt"
1289                grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/$rundir/$OUTPUTFILE \
1290                                    >> $CDIR"/summary.txt"
1291            fi
1292    
1293          (          for ex in $extra_runs ; do
1294              cd $DRESULTS              unset run
1295              tar -cf $NDIR".tar" $DRESULTS"_"$NDIR > /dev/null 2>&1              results=$EMPTY_RESULTS
1296              gzip $NDIR".tar"              #  reference output file
1297          )              refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${ex}./g"`
1298                #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir.ex combination
1299                rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir"."$ex
1300                mkdir $rel_CDIR
1301                CDIR=`pwd`"/$rel_CDIR"
1302                test ! -e "$dir/tr_run.$ex" && mkdir "$dir/tr_run.$ex"
1303                run_clean $dir/tr_run.$ex
1304                linkdata $dir/tr_run.$ex $inputdir.$ex $inputdir input
1305                runmodel $dir/tr_run.$ex && run=Y \
1306                && results=`testoutput_run $dir tr_run.$ex $refExOut`
1307                fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`
1308                fres="$fres.$ex"
1309                echo
1310                echo "$fres" | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</' >> $SUMMARY
1311                touch $CDIR"/summary.txt"
1312                echo "fresults='$fres'" | sed 's/ 99/ --/g' >> $CDIR"/summary.txt"
1313                echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"
1314                echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"
1315                echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
1316                echo "tdir='$dir.$ex'" >> $CDIR"/summary.txt"
1317                if test "x$ADM" = xt ; then
1318                    head -1 $dir/$builddir/taf_ad.log >> $CDIR"/summary.txt"
1319                    grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/tr_run.$ex/$OUTPUTFILE \
1320                                       >> $CDIR"/summary.txt"
1321                fi
1322                if test "x$POSTCLEAN" = xt ; then
1323                    run_clean $dir/tr_run.$ex
1324                fi
1325            done
1326    
1327          $MPACK -s MITgcm-test -m 1000000 $DRESULTS"/"$NDIR".tar.gz" $ADDRESSES      #postclean $dir/$builddir
1328        if test "x$POSTCLEAN" = xt ; then
1329            makeclean $dir/$builddir \
1330                && run_clean $dir/$rundir
1331        fi
1332        
1333        echo "-------------------------------------------------------------------------------"
1334        
1335    done
1336    
1337    printf "Start time:  " >> $SUMMARY
1338    echo "$start_date" >> $SUMMARY
1339    printf "End time:    " >> $SUMMARY
1340    date >> $SUMMARY
1341    
1342    #  If addresses were supplied and mpack built successfully, then try
1343    #  to send email using mpack.
1344    if test "x$ADDRESSES" = xNONE -o "x$ADDRESSES" = x ; then
1345        echo "No results email was sent."
1346    else
1347        if test "x$HAVE_MPACK" = xt ; then
1348            tar -cf $DRESULTS".tar" $DRESULTS > /dev/null 2>&1 \
1349                && gzip $DRESULTS".tar" \
1350                && $MPACK -s MITgcm-test -m 3555000 $DRESULTS".tar.gz" $ADDRESSES
1351          RETVAL=$?          RETVAL=$?
1352          if test "x$RETVAL" != x0 ; then          if test "x$RETVAL" != x0 ; then
1353              echo "Warning: \"$MPACK\" failed -- please contact <edhill@mitgcm.org>"              echo
1354                echo "Warning: The tar, gzip, & mpack step failed.  Please send email"
1355                echo "  to <MITgcm-support@mitgcm.org> for help.  You may copy the "
1356                echo "  summary of results from the directory \"$DRESULTS\"."
1357                echo
1358          else          else
1359              rm -f $DRESULTS"/"$NDIR".tar*"              echo
1360                echo "An email containing results was sent to the following addresses:"
1361                echo "  \"$ADDRESSES\""
1362                echo
1363                test -f $DRESULTS".tar"  &&  rm -f $DRESULTS".tar"
1364                test -f $DRESULTS".tar.gz"  &&  rm -f $DRESULTS".tar.gz"
1365          fi          fi
1366        fi
1367    fi
1368    
1369          NDIR=$(( $NDIR + 1 ))  rm -f tr_cmpnum.c tr_cmpnum
           
     done  
 done  
1370    
1371  rm tmp_cmpnum.f a.out  if test "x$CLEANUP" != xt ; then
1372        cat $SUMMARY | sed 's/ \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \. //'
1373        if test -e tr_out.txt ; then
1374            mv tr_out.txt tr_out.txt.old
1375        fi
1376        cat $SUMMARY | sed '/^[YN] [YN] [YN] [YN]/ s/ \. //g' > tr_out.txt
1377    fi
1378    
1379  cat $SUMMARY  if test "x$DELDIR" = xt ; then
1380        rm -rf $DRESULTS
1381    fi
1382    

Legend:
Removed from v.1.2  
changed lines
  Added in v.1.131

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