/[MITgcm]/MITgcm/verification/testreport

Diff of /MITgcm/verification/testreport

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-revision 1.162 by jmc,
Wed May 11 01:51:07 2011 UTC
+revision 1.170 by mlosch,
Thu Dec 22 12:55:05 2011 UTC
 Line 15 
 usage()
      echo "  (-mpi)                   use MPI to compile and run on 2 processors"
      echo "  (-MPI)  NUMBER           use MPI to compile and run on max NUMBER procs"
      echo "  (-mfile|-mf) STRING      MPI: file with list of possible machines to run on"
-     echo "  (-ieee/-noieee)          if possible, use IEEE compiler flags"
+     echo "  (-fast)                  use optfile default for compiler flags (no '-ieee')"
-     echo "                             (DEF=\"-ieee\")"
+     echo "                            DEF=off => use IEEE numerics option (if available)"
+     echo "  (-devel)                 use optfile developement flags (if available)"
      echo "  (-gsl)                   compile with \"-gsl\" flag"
      echo "  (-use_r4|-ur4)           if allowed, use real*4 type for '_RS' variable"
      echo "  (-optfile|-of) STRING    list of optfiles to use"
-Line 47 
 usage()
+Line 48 
 usage()
      echo "  (-match) NUMBER          Matching Criteria (number of digits)"
      echo "                             (DEF=\"$MATCH_CRIT\")"
      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"
+     echo "  (-ef) STRING             used as genmake2 \"-extra_flag\" argument"
      echo "  (-clean)                 *ONLY* run \"make CLEAN\" & clean run-dir"
      echo "  (-norun|-nr)             skip the \"runmodel\" stage (stop after make)"
+     echo "  (-obj)                   only produces objects (=norun & no executable)"
      echo "  (-runonly|-ro)           *ONLY* run stage (=\"-quick\" without make)"
      echo "  (-quick|-q)              same as \"-nogenmake -noclean -nodepend\""
      echo "  (-nogenmake|-ng)         skip the genmake stage"
-Line 248 
 testoutput_run()
+Line 251 
 testoutput_run()
                    then echo testoutput_run: testoutput_var $1 cg2d_init_res 1>&2 ; fi
                    testoutput_var $1 "cg2d_init_res" "Press. Solver (cg2d)" $2 $3; yy=$?
                    if [ $debug -gt 0 ] ; then echo testoutput_run: cg2dres=$yy 1>&2 ; fi ;;
-           'Cost') testoutput_var $1 "ADM  precision_derivative_cost" "ADM Cost" $2 $3; yy=$? ;;
+           'Cost') testoutput_var $1 "ADM  ref_cost_function" "ADM CostFct" $2 $3; yy=$? ;;
-           'Grad') testoutput_var $1 "ADM  precision_derivative_grad" "ADM Grad" $2 $3; yy=$? ;;
+          'AdGrd') testoutput_var $1 "ADM  adjoint_gradient"  "ADM Ad Grad" $2 $3; yy=$? ;;
+          'FDGrd') testoutput_var $1 "ADM  finite-diff_grad"  "ADM FD Grad" $2 $3; yy=$? ;;
             'Tmn') testoutput_var $1 "dynstat_theta_min"  "Theta minimum"  $2 $3; yy=$? ;;
             'Tmx') testoutput_var $1 "dynstat_theta_max"  "Theta maximum"  $2 $3; yy=$? ;;
             'Tav') testoutput_var $1 "dynstat_theta_mean" "Theta mean"     $2 $3; yy=$? ;;
-Line 286 
 testoutput_run()
+Line 290 
 testoutput_run()
           'hSImx') testoutput_var $1 "seaice_heff_max"   "SIce Heff max"   $2 $3; yy=$? ;;
           'hSIav') testoutput_var $1 "seaice_heff_mean"  "SIce Heff mean"  $2 $3; yy=$? ;;
           'hSIsd') testoutput_var $1 "seaice_heff_sd"    "SIce Heff StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
+          'uSImn') testoutput_var $1 "seaice_uice_min"   "SIce Uice min"   $2 $3; yy=$? ;;
+          'uSImx') testoutput_var $1 "seaice_uice_max"   "SIce Uice max"   $2 $3; yy=$? ;;
+          'uSIav') testoutput_var $1 "seaice_uice_mean"  "SIce Uice mean"  $2 $3; yy=$? ;;
+          'uSIsd') testoutput_var $1 "seaice_uice_sd"    "SIce Uice StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
+          'vSImn') testoutput_var $1 "seaice_vice_min"   "SIce Vice min"   $2 $3; yy=$? ;;
+          'vSImx') testoutput_var $1 "seaice_vice_max"   "SIce Vice max"   $2 $3; yy=$? ;;
+          'vSIav') testoutput_var $1 "seaice_vice_mean"  "SIce Vice mean"  $2 $3; yy=$? ;;
+          'vSIsd') testoutput_var $1 "seaice_vice_sd"    "SIce Vice StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
          'AthSiG') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_G" "thSIc Area Global" $2 $3; yy=$? ;;
          'AthSiS') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_S" "thSIc Area South"  $2 $3; yy=$? ;;
          'AthSiN') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_N" "thSIc Area North"  $2 $3; yy=$? ;;
-Line 338 
 genmakemodel()
+Line 350 
 genmakemodel()
              if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then
                  command="$command -optfile=$OPTFILE"
              fi
-             if test "x$IEEE" != x ; then
+             if test $OptLev = 1 ; then
                  command="$command -ieee"
+             fi
+             if test $OptLev = 0 ; then
+                 command="$command -devel"
              fi
              if test "x$GSL" = xt ; then
                  command="$command -gsl"
-Line 354 
 genmakemodel()
+Line 369 
 genmakemodel()
              if test "x$USE_R4" = xt ; then
                  command="$command -use_r4"
              fi
+             if test "x$EXTRFLG" != x ; then
+                 command="$command -extra_flag $EXTRFLG"
+             fi
              if test "x$TS" = xt ; then
                  command="$command -ts"
              fi
-Line 474 
 makemodel()
+Line 492 
 makemodel()
          cd $1;
          if test -r Makefile ; then
              printf 'make ... '
-             if test "x$ADM" = xt ; then
+             $MAKE $TARG >> make.tr_log 2>&1
-                 $MAKE adall >> make.tr_log 2>&1
-             elif test "x$OADM" = xt ; then
-                 $MAKE adAll >> make.tr_log 2>&1
-             else
-                 if test "x$JOBS" = x ; then
-                     $MAKE >> make.tr_log 2>&1
-                 else
-                     $MAKE -j $JOBS >> make.tr_log 2>&1
-                 fi
-             fi
              RETVAL=$?
              if test "x$RETVAL" != x0 ; then
                  tail make.tr_log
                  echo failed
-                 cp make.tr_log genmake.log genmake.tr_log $CDIR
+                 cp genmake.log genmake.tr_log $CDIR
+                 tail -$NBLINES_MKLOG make.tr_log > $CDIR"/make.tr_log_tail"
                  rm -f $EXECUTABLE
                  mk_fail=1
              else
-Line 915 
 check_eedata()
+Line 924 
 check_eedata()
  #  Default properties
  debug=0
  verbose=1
+ NBLINES_MKLOG=16000
  IEEE=true
  if test "x$MITGCM_IEEE" != x ; then
      IEEE=$MITGCM_IEEE
  fi
+ OptLev=1
  GSL=f
  CLEANUP=f
-Line 948 
 if test "x$CC" = x ; then
+Line 959 
 if test "x$CC" = x ; then
      CC=cc
  fi
  JOBS=
+ TARG=
  MPI=0
  MPI_MFILE=
  MULTI_THREAD=f
  OUTDIR=
  DELDIR=
  USE_R4=
+ EXTRFLG=
  ADM=
  OADM=
-Line 1018 
 for ac_option ; do
+Line 1031 
 for ac_option ; do
          -j | --j) ac_prev=JOBS ;;
          -j=* | --j=*) JOBS=$ac_optarg ;;
+         -ef | --ef) ac_prev=EXTRFLG ;;
+         -ef=* | --ef=*) EXTRFLG=$ac_optarg ;;
          -clean | --clean) CLEANUP=t ; DELDIR=t ;;
          -norun | --norun | -nr | --nr) NORUN=t ;;
+         -obj | --obj ) TARG='obj' ; NORUN=t ;;
          -runonly | --runonly | -ro | --ro) QUICK=t ; NOMAKE=t ;;
          -quick | --quick | -q | --q) QUICK=t ;;
          -nogenmake | --nogenmake | -ng | --ng) NOGENMAKE=t ;;
-Line 1042 
 for ac_option ; do
+Line 1059 
 for ac_option ; do
          -adm | -ad) ADM=t ;;
          -oad) OADM=t; NODEPEND=t ;;
-         -ieee) IEEE=true ;;
+         -ieee)   echo "Warning: ignore option '-ieee' (already the default)"
-         -noieee) IEEE= ;;
+                  printf " ... " ;;
+         -noieee) echo "Warning: will use option '-fast' instead of '-noieee' (obsolete)"
+                  printf " ... " ; OptLev=`expr $OptLev \* 2` ;;
+         -fast)  OptLev=`expr $OptLev \* 2` ;;
+         -devel) OptLev=0 ;;
          -gsl) GSL=t ;;
          -verbose) verbose=2 ;;
-Line 1092 
 fi
+Line 1113 
 fi
  #- setting for forward or ADM testing
  if test "x$ADM" = xt ; then
+     if test "x$TARG" = xobj ; then TARG=adobj ; else TARG=adall ; fi
      code_dir=code_ad
      inputdir=input_ad
      ref_outp="output_adm.txt"
      EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"
  elif test "x$OADM" = xt ; then
+     TARG=adAll
      code_dir=code_oad
      inputdir=input_oad
      ref_outp="output_oadm.txt"
      EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"
  else
+     if test "x$JOBS" != x ; then TARG="-j $JOBS $TARG" ; fi
      code_dir=code
      inputdir=input
      ref_outp="output.txt"
-Line 1180 
 if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; the
+Line 1204 
 if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; the
      ii=`echo $EMPTY_RESULTS | awk '{print NF}'`
      EMPTY_RESULTS=$EMPTY_RESULTS`expr $LEN_CHECK_LIST - $ii | awk 'BEGIN{FS=":"}{for(i=1;i<=$1;i++){printf "  ."}}'`
  else
-     DEF_CHECK_LIST='Grad Cost Grad'
+     DEF_CHECK_LIST='AdGrd Cost AdGrd FDGrd'
-     EMPTY_RESULTS='.. ..'
+     EMPTY_RESULTS='.. .. ..'
      LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`
  fi
-Line 1267 
 if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; the
+Line 1291 
 if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; the
      else line_0="default "$MATCH_CRIT ; fi
         line_0="$line_0  ----T-----  ----S-----  ----U-----  ----V-----"
      line_1="G D M    c        m  s        m  s        m  s        m  s"
-     line_2="E p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  ."
+     line_2="e p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  ."
-     line_3="N n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d"
+     line_3="n n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d"
      line_4="2 d e n  d  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  ."
      for ii in $PTRACERS_NUM ; do
          line_0="$line_0  --PTR 0"$ii"--"
-Line 1291 
 else
+Line 1315 
 else
      else line_0="default    "$MATCH_CRIT ; fi
      echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY
      cat << EOF | tee -a $SUMMARY
- G D M    C  G
+ G D M    C  A  F
- E p a R  o  r
+ e p a R  o  d  D
- N n k u  s  a
+ n n k u  s  G  G
-d e n  t  d
+d e n  t  r  r
  EOF
  fi
-Line 1524 
 for dir in $TESTDIRS ; do
+Line 1548 
 for dir in $TESTDIRS ; do
              if test "x$RETVAL" = x0 ; then
                  echo "from '$gmkLog', extract compiler version:" >> $DRESULTS/genmake_state
                  sed -n '/Get compiler version/,/<-- compiler version/p' $gmkLog \
-                        | grep -v '^... compiler version ' > tr_1.tmp_log
+                         | grep -v '^... compiler version ' > tr_1.tmp_log
-                 sed -n '1,/^$/p' tr_1.tmp_log | sed '/^$/d' | sed 's/^./ &/' \
+                 sed -n '1p' tr_1.tmp_log >> $DRESULTS/genmake_state
+                 sed -n '2,/^$/p' tr_1.tmp_log | sed '/^$/d' | sed 's/^./ &/' \
                          >> $DRESULTS/genmake_state
                  rm -f tr_1.tmp_log
              fi

 Legend:



Removed from v.1.162
 


changed lines


 
Added in v.1.170
 Legend:



Removed from v.1.162
 


changed lines


 
Added in v.1.170
-Removed from v.1.162
+Added in v.1.170

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