/[MITgcm]/MITgcm/verification/testreport
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revision 1.139 by jmc, Thu Apr 29 16:58:40 2010 UTC revision 1.149 by jmc, Tue Nov 16 17:09:15 2010 UTC
# Line 25  usage() Line 25  usage()
25      echo "  (-tdir|-t) STRING        list of group and/or exp. dirs to test"      echo "  (-tdir|-t) STRING        list of group and/or exp. dirs to test"
26      echo "                             (recognized groups: basic, tutorials)"      echo "                             (recognized groups: basic, tutorials)"
27      echo "                             (DEF=\"\" which test all)"      echo "                             (DEF=\"\" which test all)"
28        echo "                             (if list= 'start_from THIS_EXP' then"
29        echo "                              test THIS_EXP + all the following)"
30      echo "  (-skipdir|-skd) STRING   list of exp. dirs to skip"      echo "  (-skipdir|-skd) STRING   list of exp. dirs to skip"
31      echo "                             (DEF=\"\" which test all)"      echo "                             (DEF=\"\" which test all)"
32      echo "  (-bash|-b) STRING        preferred location of a \"bash\" or"      echo "  (-bash|-b) STRING        preferred location of a \"bash\" or"
# Line 33  usage() Line 35  usage()
35      echo "  (-adm|-ad)               perform an adjoint run"      echo "  (-adm|-ad)               perform an adjoint run"
36      echo "  (-oad)                   perform an OpenAD adjoint run"      echo "  (-oad)                   perform an OpenAD adjoint run"
37      echo "  (-command|-c) STRING     command to run"      echo "  (-command|-c) STRING     command to run"
38        echo "  (-makedepend|-md) STRING command to use for \"makedepend\""
39      echo "  (-make|-m) STRING        command to use for \"make\""      echo "  (-make|-m) STRING        command to use for \"make\""
40      echo "                             (DEF=\"make\")"      echo "                             (DEF=\"make\")"
41      echo "  (-odir) STRING           used to build output directory name"      echo "  (-odir) STRING           used to build output directory name"
# Line 40  usage() Line 43  usage()
43      echo "  (-ptracers|-ptr) STRING  specify which ptracers to test"      echo "  (-ptracers|-ptr) STRING  specify which ptracers to test"
44      echo "                             (DEF=\"1 2 3 4 5\")"      echo "                             (DEF=\"1 2 3 4 5\")"
45      echo "  (-match) NUMBER          Matching Criteria (number of digits)"      echo "  (-match) NUMBER          Matching Criteria (number of digits)"
46      echo "                             (DEF=\"12\")"      echo "                             (DEF=\"$MATCH_CRIT\")"
47      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"
48      echo "  (-clean)                 *ONLY* run \"make CLEAN\""      echo "  (-clean)                 *ONLY* run \"make CLEAN\""
49      echo "  (-norun|-nr)             skip the \"runmodel\" stage (stop after make)"      echo "  (-norun|-nr)             skip the \"runmodel\" stage (stop after make)"
# Line 317  genmakemodel() Line 320  genmakemodel()
320          (          (
321              cd $1;              cd $1;
322              command="$GENMAKE2  -ds -m $MAKE"              command="$GENMAKE2  -ds -m $MAKE"
323                if test "x$MKDEPEND" != x ; then
324                    command="$command -makedepend=$MKDEPEND"
325                fi
326              if test "x$ADM" = xt ; then              if test "x$ADM" = xt ; then
327                  command="$command --mods=../code_ad"                  command="$command --mods=../code_ad"
328              elif test "x$OADM" = xt ; then              elif test "x$OADM" = xt ; then
# Line 354  genmakemodel() Line 360  genmakemodel()
360              fi              fi
361              fi              fi
362              printf 'genmake ... '              printf 'genmake ... '
363              eval $command > make.log 2>&1              eval $command > genmake.tr_log 2>&1
364              RETVAL=$?              RETVAL=$?
365              #  Reduce the size of the testing emails!              #  Reduce the size of the testing emails!
366              head -100 Makefile > $CDIR/Makefile_head              head -100 Makefile > $CDIR/Makefile_head
367              if test "x$RETVAL" != x0 ; then              if test "x$RETVAL" != x0 ; then
368                  tail make.log                  tail genmake.tr_log
369                  echo "genmakemodel: genmake failed"                  echo "genmakemodel: genmake failed"
370                  cp genmake_* make.log $CDIR                  cp genmake.log genmake_* genmake.tr_log $CDIR
371                  return 1                  return 1
372              else              else
373                  echo "successful"                  echo "successful"
# Line 373  genmakemodel() Line 379  genmakemodel()
379  makeclean()  makeclean()
380  {  {
381      # makeclean directory      # makeclean directory
382        if test "x$NODEPEND" = xf ; then rm -f $1/make.tr_log ; fi
383      if test "x$NOCLEAN" = xt ; then      if test "x$NOCLEAN" = xt ; then
384          echo "make Clean skipped!"          echo "make Clean skipped!"
385      else      else
# Line 381  makeclean() Line 388  makeclean()
388              #if test -e $OUTPUTFILE ; then rm -f $OUTPUTFILE ; fi              #if test -e $OUTPUTFILE ; then rm -f $OUTPUTFILE ; fi
389              if test -r Makefile ; then              if test -r Makefile ; then
390                  printf 'clean build-dir: make Clean ... '                  printf 'clean build-dir: make Clean ... '
391                  $MAKE Clean >> make.log 2>&1                  rm -f Makefile.old
392                    $MAKE Clean >> make.tr_log 2>&1
393                  RETVAL=$?                  RETVAL=$?
394                  if test "x$RETVAL" != x0 ; then                  if test "x$RETVAL" != x0 ; then
395                      tail make.log                      tail make.tr_log
396                      echo "makeclean: \"make Clean\" failed"                      echo "makeclean: \"make Clean\" failed"
397                      cp make.log $CDIR"/make.log"                      cp make.tr_log genmake.log genmake.tr_log $CDIR
398                      return 1                      return 1
399                  fi                  fi
400                  echo successful                  echo successful
# Line 412  run_clean() Line 420  run_clean()
420              find . -name "*.data" -exec rm {} \;              find . -name "*.data" -exec rm {} \;
421              find . -name "fort.*" -exec rm {} \;              find . -name "fort.*" -exec rm {} \;
422              find . -type l -exec rm {} \;              find . -type l -exec rm {} \;
423              rm -f $EXECUTABLE *.txt STD* *diagnostics.log datetime              rm -f $EXECUTABLE $RUNLOG *.txt STD* *diagnostics.log datetime
424              rm -rf mnc_test_*              rm -rf mnc_test_*
425              rm -f *_MIT_CE_000.opt0000 costfunction*0000              rm -f *_MIT_CE_000.opt0000 costfunction*0000
426              echo successful              echo successful
# Line 430  makedependmodel() Line 438  makedependmodel()
438          (          (
439              cd $1;              cd $1;
440              printf 'make depend ... '              printf 'make depend ... '
441              $MAKE depend >> make.log 2>&1              $MAKE depend >> make.tr_log 2>&1
442              RETVAL=$?              RETVAL=$?
443              if test "x$RETVAL" != x0 ; then              if test "x$RETVAL" != x0 ; then
444                  tail make.log                  tail make.tr_log
445                  echo "makedependmodel: make depend failed"                  echo "makedependmodel: make depend failed"
446                  cp make.log $CDIR"/make.log"                  cp make.tr_log genmake.log genmake.tr_log $CDIR
447                  return 1                  return 1
448              else              else
449                  echo successful                  echo successful
# Line 461  makemodel() Line 469  makemodel()
469          if test -r Makefile ; then          if test -r Makefile ; then
470              printf 'make ... '              printf 'make ... '
471              if test "x$ADM" = xt ; then              if test "x$ADM" = xt ; then
472                  $MAKE adall >> make.log 2>&1                  $MAKE adall >> make.tr_log 2>&1
473              elif test "x$OADM" = xt ; then              elif test "x$OADM" = xt ; then
474                  $MAKE adAll >> make.log 2>&1                  $MAKE adAll >> make.tr_log 2>&1
475              else              else
476                  if test "x$JOBS" = x ; then                  if test "x$JOBS" = x ; then
477                      $MAKE >> make.log 2>&1                      $MAKE >> make.tr_log 2>&1
478                  else                  else
479                      $MAKE -j $JOBS >> make.log 2>&1                      $MAKE -j $JOBS >> make.tr_log 2>&1
480                  fi                  fi
481              fi              fi
482              RETVAL=$?              RETVAL=$?
483              if test "x$RETVAL" != x0 ; then              if test "x$RETVAL" != x0 ; then
484                  tail make.log                  tail make.tr_log
485                  echo failed                  echo failed
486                  cp make.log $CDIR"/make.log"                  cp make.tr_log genmake.log genmake.tr_log $CDIR
487                  rm -f $EXECUTABLE                  rm -f $EXECUTABLE
488                  return 1                  return 1
489              else              else
# Line 829  MPACKDIR="../tools/mpack-1.6" Line 837  MPACKDIR="../tools/mpack-1.6"
837  HAVE_MPACK=  HAVE_MPACK=
838  MPACK=  MPACK=
839  COMMAND=  COMMAND=
840    MKDEPEND=
841  if test "x$MAKE" = x ; then  if test "x$MAKE" = x ; then
842      MAKE=make      MAKE=make
843  fi  fi
# Line 848  OADM= Line 857  OADM=
857  # list of pTracers to check for monitor output  # list of pTracers to check for monitor output
858  PTRACERS_NUM="1 2 3 4 5"  PTRACERS_NUM="1 2 3 4 5"
859    
860  MATCH_CRIT=13  MATCH_CRIT=10
861    
862  printf "parsing options...  "  printf "parsing options...  "
863    
# Line 903  for ac_option ; do Line 912  for ac_option ; do
912          -command=* | --command=* | -c=* | --c=*)          -command=* | --command=* | -c=* | --c=*)
913              COMMAND=$ac_optarg ;;              COMMAND=$ac_optarg ;;
914    
915            -makedepend | --makedepend | -md | --md)
916                ac_prev=MKDEPEND ;;
917            -makedepend=* | --makedepend=* | -md=* | --md=*)
918                MKDEPEND=$ac_optarg ;;
919    
920          -make | --make | -m | --m)          -make | --make | -m | --m)
921              ac_prev=MAKE ;;              ac_prev=MAKE ;;
922          -make=* | --make=* | -m=* | --m=*)          -make=* | --make=* | -m=* | --m=*)
# Line 1005  else Line 1019  else
1019      EXECUTABLE="mitgcmuv"      EXECUTABLE="mitgcmuv"
1020  fi  fi
1021    
1022    xx=`echo $TESTDIRS | awk '{print $1}'`
1023  if test "x$TESTDIRS" = x ; then  if test "x$TESTDIRS" = x ; then
1024      LIST=`scandirs results/$ref_outp`      LIST=`scandirs results/$ref_outp`
1025    elif test $xx = 'start_from' ; then
1026        xx=`echo $TESTDIRS | awk '{print $2}'`
1027        LIST=`scandirs results/$ref_outp | sed -n "/$xx/,$ p"`
1028  else  else
1029      #- expand group of experiments:      #- expand group of experiments:
1030      LIST=" "      LIST=" "
# Line 1050  if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM Line 1068  if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM
1068      OPTFILE=$MITGCM_OF      OPTFILE=$MITGCM_OF
1069  fi  fi
1070    
1071  RUNLOG="run.log"  RUNLOG="run.tr_log"
1072  OUTPUTFILE=$ref_outp  OUTPUTFILE=$ref_outp
1073  if test "x$COMMAND" = x ; then  if test "x$COMMAND" = x ; then
1074      COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"      COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"
# Line 1199  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1217  for dir in $TESTDIRS ; do
1217      builddir="build"      builddir="build"
1218      if test ! -d $dir/$builddir ; then mkdir $dir/$builddir ; fi      if test ! -d $dir/$builddir ; then mkdir $dir/$builddir ; fi
1219      rundir="run"      rundir="run"
1220        pfxdir="tr_$rundir"
1221      if test ! -d $dir/$rundir ; then      if test ! -d $dir/$rundir ; then
1222          rundir=$builddir          rundir=$builddir
1223      fi      fi
# Line 1209  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1228  for dir in $TESTDIRS ; do
1228      if test "x$CLEANUP" = xt ; then      if test "x$CLEANUP" = xt ; then
1229          echo -n '  --- dir:' $BUILD_DIR ': '          echo -n '  --- dir:' $BUILD_DIR ': '
1230          makeclean $BUILD_DIR          makeclean $BUILD_DIR
1231          rm -f $BUILD_DIR/$EXECUTABLE          (   cd $BUILD_DIR
1232                rm -f $EXECUTABLE *.bak
1233                rm -f genmake_state genmake_*optfile genmake.log
1234                rm -f genmake.tr_log make.tr_log
1235            )
1236          if test -d $dir/$rundir/CVS ; then          if test -d $dir/$rundir/CVS ; then
1237              echo -n '  --- dir:' $dir/$rundir ': '              echo -n '  --- dir:' $dir/$rundir ': '
1238              run_clean $dir/$rundir              run_clean $dir/$rundir
1239          fi          fi
1240          trdir=`( cd $dir ; find . -type d -name "tr_run.*" -print | sed 's/^.\///')`          trdir=`( cd $dir ; find . -type d -name "$pfxdir.*" -print | sed 's/^.\///')`
1241          ttd=`echo $trdir | wc -w`          ttd=`echo $trdir | wc -w`
1242          if test $ttd != 0 ; then          if test $ttd != 0 ; then
1243              echo '  --- rm dir:' $trdir              echo '  --- rm dir:' $trdir
# Line 1309  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1332  for dir in $TESTDIRS ; do
1332              && makedependmodel $dir/$builddir && makedepend=Y \              && makedependmodel $dir/$builddir && makedepend=Y \
1333              && makemodel $dir/$builddir && make=Y \              && makemodel $dir/$builddir && make=Y \
1334              && run_clean $dir/$rundir \              && run_clean $dir/$rundir \
1335              && linkdata $dir/$rundir $inputdir input \              && linkdata $dir/$rundir $inputdir \
1336              && runmodel $dir/$rundir && run=Y \              && runmodel $dir/$rundir && run=Y \
1337              && results=`testoutput_run $dir $rundir $ref_outp`              && results=`testoutput_run $dir $rundir $ref_outp`
1338      fi      fi
# Line 1339  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1362  for dir in $TESTDIRS ; do
1362              locDIR=$DRESULTS"/"$dir"."$ex              locDIR=$DRESULTS"/"$dir"."$ex
1363              mkdir $locDIR              mkdir $locDIR
1364              CDIR=`pwd`"/$locDIR"              CDIR=`pwd`"/$locDIR"
1365              test ! -e "$dir/tr_run.$ex" && mkdir "$dir/tr_run.$ex"              test ! -e "$dir/$pfxdir.$ex" && mkdir "$dir/$pfxdir.$ex"
1366              run_clean $dir/tr_run.$ex              run_clean $dir/$pfxdir.$ex
1367              linkdata $dir/tr_run.$ex $inputdir.$ex $inputdir input              linkdata $dir/$pfxdir.$ex $inputdir.$ex $inputdir
1368              runmodel $dir/tr_run.$ex && run=Y \              runmodel $dir/$pfxdir.$ex && run=Y \
1369              && results=`testoutput_run $dir tr_run.$ex $refExOut`              && results=`testoutput_run $dir $pfxdir.$ex $refExOut`
1370              fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`              fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`
1371              fres="$fres.$ex"              fres="$fres.$ex"
1372              echo 1>&2              echo 1>&2
# Line 1356  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1379  for dir in $TESTDIRS ; do
1379              echo "tdir='$dir.$ex'" >> $locDIR"/summary.txt"              echo "tdir='$dir.$ex'" >> $locDIR"/summary.txt"
1380              if test "x$ADM" = xt ; then              if test "x$ADM" = xt ; then
1381                  head -1 $dir/$builddir/taf_ad.log >> $locDIR"/summary.txt"                  head -1 $dir/$builddir/taf_ad.log >> $locDIR"/summary.txt"
1382                  grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/tr_run.$ex/$OUTPUTFILE \                  grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/$pfxdir.$ex/$OUTPUTFILE \
1383                                     >> $locDIR"/summary.txt"                                     >> $locDIR"/summary.txt"
1384              fi              fi
1385              if test "x$POSTCLEAN" = xt ; then              if test "x$POSTCLEAN" = xt ; then
1386                  run_clean $dir/tr_run.$ex                  run_clean $dir/$pfxdir.$ex
1387              fi              fi
1388          done          done
1389    
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