/[MITgcm]/MITgcm/verification/testreport
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revision 1.122 by jmc, Wed Apr 15 22:22:36 2009 UTC revision 1.134 by jmc, Sun Jan 17 21:52:01 2010 UTC
# Line 43  usage() Line 43  usage()
43      echo "                             (DEF=\"12\")"      echo "                             (DEF=\"12\")"
44      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"
45      echo "  (-clean)                 *ONLY* run \"make CLEAN\""      echo "  (-clean)                 *ONLY* run \"make CLEAN\""
46        echo "  (-norun|-nr)             skip the \"runmodel\" stage (stop after make)"
47      echo "  (-quick|-q)              same as \"-nogenmake -noclean -nodepend\""      echo "  (-quick|-q)              same as \"-nogenmake -noclean -nodepend\""
48      echo "  (-nogenmake|-ng)         skip the genmake stage"      echo "  (-nogenmake|-ng)         skip the genmake stage"
49      echo "  (-noclean|-nc)           skip the \"make clean\" stage"      echo "  (-noclean|-nc)           skip the \"make clean\" stage"
# Line 264  testoutput_run() Line 265  testoutput_run()
265             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_mean" "p0"$ii"_mean" $2 $3; yy=$? ;;             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_mean" "p0"$ii"_mean" $2 $3; yy=$? ;;
266          'pt1sd'|'pt2sd'|'pt3sd'|'pt4sd'|'pt5sd') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`          'pt1sd'|'pt2sd'|'pt3sd'|'pt4sd'|'pt5sd') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`
267             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_sd"   "p0"$ii"_StDv"  $2 $3; yy=$? ;;             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_sd"   "p0"$ii"_StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
268           'Qntmn') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_min" "Qnet minimum"  $2 $3; yy=$? ;;           'Qntmn') testoutput_var $1 "forcing_qnet_min" "Qnet minimum"  $2 $3; yy=$? ;;
269           'Qntmx') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_max" "Qnet maximum"  $2 $3; yy=$? ;;           'Qntmx') testoutput_var $1 "forcing_qnet_max" "Qnet maximum"  $2 $3; yy=$? ;;
270           'Qntav') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_mean" "Qnet mean"    $2 $3; yy=$? ;;           'Qntav') testoutput_var $1 "forcing_qnet_mean" "Qnet mean"       $2 $3; yy=$? ;;
271           'Qntsd') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_sd"  "Qnet Std.Dev"  $2 $3; yy=$? ;;           'Qntsd') testoutput_var $1 "forcing_qnet_sd"  "Qnet Std.Dev"  $2 $3; yy=$? ;;
272           'aSImn') testoutput_var $1 "seaice_area_min"   "SIce Area min"   $2 $3; yy=$? ;;           'aSImn') testoutput_var $1 "seaice_area_min"   "SIce Area min"   $2 $3; yy=$? ;;
273           'aSImx') testoutput_var $1 "seaice_area_max"   "SIce Area max"   $2 $3; yy=$? ;;           'aSImx') testoutput_var $1 "seaice_area_max"   "SIce Area max"   $2 $3; yy=$? ;;
274           'aSIav') testoutput_var $1 "seaice_area_mean"  "SIce Area mean"  $2 $3; yy=$? ;;           'aSIav') testoutput_var $1 "seaice_area_mean"  "SIce Area mean"  $2 $3; yy=$? ;;
275           'aSIsd') testoutput_var $1 "seaice_area_sd"    "SIce Area StDv"  $2 $3; yy=$? ;;           'aSIsd') testoutput_var $1 "seaice_area_sd"    "SIce Area StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
276           'hSImn') testoutput_var $1 "seaice_heff_min"   "SIce Heff min"   $2 $3; yy=$? ;;           'hSImn') testoutput_var $1 "seaice_heff_min"   "SIce Heff min"   $2 $3; yy=$? ;;
277           'hSImx') testoutput_var $1 "seaice_heff_max"   "SIce Hell max"   $2 $3; yy=$? ;;           'hSImx') testoutput_var $1 "seaice_heff_max"   "SIce Heff max"   $2 $3; yy=$? ;;
278           'hSIav') testoutput_var $1 "seaice_heff_mean"  "SIce Hell mean"  $2 $3; yy=$? ;;           'hSIav') testoutput_var $1 "seaice_heff_mean"  "SIce Heff mean"  $2 $3; yy=$? ;;
279           'hSIsd') testoutput_var $1 "seaice_heff_sd"    "SIce Hell StDv"  $2 $3; yy=$? ;;           'hSIsd') testoutput_var $1 "seaice_heff_sd"    "SIce Heff StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
280          'AthSiG') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_G" "thSIc Area Global" $2 $3; yy=$? ;;          'AthSiG') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_G" "thSIc Area Global" $2 $3; yy=$? ;;
281          'AthSiS') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_S" "thSIc Area South"  $2 $3; yy=$? ;;          'AthSiS') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_S" "thSIc Area South"  $2 $3; yy=$? ;;
282          'AthSiN') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_N" "thSIc Area North"  $2 $3; yy=$? ;;          'AthSiN') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_N" "thSIc Area North"  $2 $3; yy=$? ;;
# Line 320  genmakemodel() Line 321  genmakemodel()
321              elif test "x$OADM" = xt ; then              elif test "x$OADM" = xt ; then
322                  command="$command -adof ../../../tools/adjoint_options/adjoint_oad -mods '../code_oad ../../OpenAD/code_oad_all'"                  command="$command -adof ../../../tools/adjoint_options/adjoint_oad -mods '../code_oad ../../OpenAD/code_oad_all'"
323              else              else
324                  command="$command --mods=../code"                  command="$command -mods=../code"
325              fi              fi
326              if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then              if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then
327                  command="$command --optfile=$OPTFILE"                  command="$command -optfile=$OPTFILE"
328              fi              fi
329              if test "x$IEEE" != x ; then              if test "x$IEEE" != x ; then
330                  command="$command -ieee"                  command="$command -ieee"
# Line 385  makeclean() Line 386  makeclean()
386                      cp make.log $CDIR"/make.log"                      cp make.log $CDIR"/make.log"
387                      return 1                      return 1
388                  fi                  fi
389                    echo successful 1>&2
390                else
391                    echo ''
392              fi              fi
             echo successful 1>&2  
393              exit 0              exit 0
394          )          )
395      fi      fi
# Line 461  makemodel() Line 464  makemodel()
464                  tail make.log                  tail make.log
465                  echo failed 1>&2                  echo failed 1>&2
466                  cp make.log $CDIR"/make.log"                  cp make.log $CDIR"/make.log"
467                    rm -f $EXECUTABLE
468                  return 1                  return 1
469              else              else
470                  echo successful 1>&2                  echo successful 1>&2
# Line 525  linkdata() Line 529  linkdata()
529      if test -d $1 ; then      if test -d $1 ; then
530          (          (
531              cd $1 ; shift              cd $1 ; shift
532                inpMPI=`(cd ../$1 ; find . -name "*.mpi" -print | sed 's:^\./::')`
533                for xx in $inpMPI ; do
534                  if test -r "../"$1"/"$xx ; then
535                    # found 1 _mpi sfx file in 1rst input dir and it is readable
536                    yy=`echo $xx | sed 's:\.mpi$::'`
537                    if test "x$MPI" = "xt" ; then
538                    # mpi test: remove symbolic link & link _mpi sfx file
539                        if test -h $yy ; then rm -f $yy ; fi
540                        if test ! -r $yy ; then
541                            ln -sf "../"$1"/"$xx $yy ;
542                            printf "$xx " 1>&2
543                        fi
544                    else
545                    # not mpi test: remove symbolic link
546                        if test -h $yy ; then rm -f $yy ; fi
547                    fi
548                  fi
549                done
550              if test -r "../"$1"/eedata.mth" ; then              if test -r "../"$1"/eedata.mth" ; then
551              # found eedata.mth in 1rst input dir and it is readable              # found eedata.mth in 1rst input dir and it is readable
552                  if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then                  if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
# Line 574  runmodel() Line 596  runmodel()
596          printf 'runmodel in %s ...' $1 1>&2          printf 'runmodel in %s ...' $1 1>&2
597          # make output.txt          # make output.txt
598          echo          echo
599          if test -L $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then          if test -L $EXECUTABLE ; then
600              if test -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then
601              diff -q $EXECUTABLE "../"$builddir"/"$EXECUTABLE > /dev/null 2>&1              diff -q $EXECUTABLE "../"$builddir"/"$EXECUTABLE > /dev/null 2>&1
602              outD=$? ; if test $outD != 0 ; then rm -f $EXECUTABLE ; fi              outD=$? ; if test $outD != 0 ; then rm -f $EXECUTABLE ; fi
603              else rm -f $EXECUTABLE
604              fi
605          fi          fi
606          if test ! -x $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then          if test ! -x $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then
607              echo " link" $EXECUTABLE "from dir ../"$builddir > run.log_tmp              echo " link" $EXECUTABLE "from dir ../"$builddir > run.log_tmp
# Line 610  runmodel() Line 635  runmodel()
635              ENDVAL=`cat $RUNLOG | grep -v 'ABNORMAL END' | grep -c 'NORMAL END'`              ENDVAL=`cat $RUNLOG | grep -v 'ABNORMAL END' | grep -c 'NORMAL END'`
636          fi          fi
637          rm -f run.log_tmp          rm -f run.log_tmp
         #if test "x$RETVAL" = x0 ; then  
638          if [ $RETVAL -eq 0 -a $ENDVAL -gt 0 ] ; then          if [ $RETVAL -eq 0 -a $ENDVAL -gt 0 ] ; then
639              tail $RUNLOG              tail $RUNLOG
640              echo successful 1>&2              echo successful 1>&2
# Line 618  runmodel() Line 642  runmodel()
642              #cp $OUTPUTFILE $CDIR"/"$OUTPUTFILE              #cp $OUTPUTFILE $CDIR"/"$OUTPUTFILE
643              if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi              if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi
644              return 0              return 0
645            elif [ $RETVAL -ne 0 -a $ENDVAL -gt 0 ] ; then
646                #-- for some weird cases (run is finihed but with error code)
647                tail $RUNLOG
648                echo finished with error '(run:' $RETVAL ' end:' $ENDVAL ')' 1>&2
649                return 0
650          else          else
651              tail $RUNLOG              tail $RUNLOG
652              echo failed '(run:' $RETVAL ' end:' $ENDVAL ')' 1>&2              echo failed '(run:' $RETVAL ' end:' $ENDVAL ')' 1>&2
# Line 722  scandirs() Line 751  scandirs()
751  }  }
752    
753    
754    check_eedata()
755    {
756        # check_eedata size.h eedata
757        if [ $# -eq 2 ] ; then
758          if test -f $1 -a -f $2 ; then
759          sx=`grep "^     & *nSx *=" $1 | sed "s/^     & *nSx *=//" | sed 's/, *$//'`
760          nx=`grep "^ *nTx *=" $2 | tail -1 | sed 's/^ *nTx *= *//' | sed "s/, *$//"`
761          if test "x$nx" = x ; then
762            rx=10
763          else
764            rx=`expr $sx % $nx`
765          fi
766          sy=`grep "^     & *nSy *=" $1 | sed "s/^     & *nSy *=//" | sed 's/, *$//'`
767          ny=`grep "^ *nTy *=" $2 | tail -1 | sed 's/^ *nTy *= *//' | sed "s/, *$//"`
768          if test "x$ny" = x ; then
769            ry=20
770          else
771            ry=`expr $sy % $ny`
772          fi
773          echo `expr $rx + $ry`
774        else
775          echo '-1'
776          fi
777        else
778          echo '-2'
779        fi
780    
781    }
782    
783  ###############################################################################  ###############################################################################
784    
785    
# Line 737  fi Line 795  fi
795  GSL=f  GSL=f
796    
797  CLEANUP=f  CLEANUP=f
798    NORUN=f
799  QUICK=f  QUICK=f
800  NOGENMAKE=f  NOGENMAKE=f
801  NOCLEAN=f  NOCLEAN=f
# Line 849  for ac_option ; do Line 908  for ac_option ; do
908          -clean | --clean)          -clean | --clean)
909              CLEANUP=t ; DELDIR=t ;;              CLEANUP=t ; DELDIR=t ;;
910    
911            -norun | --norun | -nr | --nr)
912                NORUN=t ;;
913          -quick | --quick | -q | --q)          -quick | --quick | -q | --q)
914              QUICK=t ;;              QUICK=t ;;
915          -nogenmake | --nogenmake | -ng | --ng)          -nogenmake | --nogenmake | -ng | --ng)
# Line 996  else Line 1057  else
1057  fi  fi
1058    
1059  #  create the FORTRAN comparison code  #  create the FORTRAN comparison code
1060  createcodelet  if test -x tr_cmpnum ; then
1061        echo "skipping comparison code build"
1062    else
1063        createcodelet
1064    fi
1065    
1066  #  build the mpack utility (if ADDRESSES = NONE, do it to test the build)  #  build the mpack utility (if ADDRESSES = NONE, do it to test the build)
1067  if test "x$ADDRESSES" = x ; then  if test "x$ADDRESSES" = x ; then
# Line 1121  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1186  for dir in $TESTDIRS ; do
1186    
1187      #  Cleanup only!      #  Cleanup only!
1188      if test "x$CLEANUP" = xt ; then      if test "x$CLEANUP" = xt ; then
1189          if test -r $BUILD_DIR/Makefile ; then          echo -n '  --- dir:' $BUILD_DIR ': '
1190              echo '  ------  clean dir:' $dir/$builddir          makeclean $BUILD_DIR
1191              ( cd $BUILD_DIR ; make CLEAN )          rm -f $BUILD_DIR/$EXECUTABLE
         fi  
1192          if test -d $dir/$rundir/CVS ; then          if test -d $dir/$rundir/CVS ; then
1193              echo '  ------  clean dir:' $dir/$rundir              echo -n '  --- dir:' $dir/$rundir ': '
1194              run_clean $dir/$rundir              run_clean $dir/$rundir
1195          fi          fi
1196          (          trdir=`( cd $dir ; find . -type d -name "tr_run.*" -print | sed 's/^.\///')`
1197              cd $dir          ttd=`echo $trdir | wc -w`
1198              rm -rf tr_run.*          if test $ttd != 0 ; then
1199          )              echo '  --- rm dir:' $trdir
1200                ( cd $dir ; rm -rf $trdir )
1201            fi
1202          continue          continue
1203      fi      fi
1204    
# Line 1154  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1220  for dir in $TESTDIRS ; do
1220          echo "can't find \"$dir/input/eedata.mth\" -- skipping $dir"          echo "can't find \"$dir/input/eedata.mth\" -- skipping $dir"
1221          continue          continue
1222      fi      fi
1223        if test "x$MPI" = "xt" -a "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
1224          retv=`check_eedata $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" $dir"/input/eedata.mth"`
1225          if test $retv != 0 ; then
1226            echo "input/eedata.mth tiling misfit -- skipping $dir"
1227            continue
1228          fi
1229        fi
1230    
1231      #  Check whether there are "extra runs" for this testdir      #  Check whether there are "extra runs" for this testdir
1232      extra_runs=      extra_runs=
1233      ex_run_dirs=`( cd $dir ; echo $inputdir.* )`      if test "x$NORUN" = xf ; then
1234            ex_run_dirs=`( cd $dir ; echo $inputdir.* )`
1235        fi
1236      #echo "ex_run_dirs='$ex_run_dirs'"      #echo "ex_run_dirs='$ex_run_dirs'"
1237      for exd in $ex_run_dirs ; do      for exd in $ex_run_dirs ; do
1238          name=`echo $exd | sed -e "s/$inputdir\.//"`          name=`echo $exd | sed -e "s/$inputdir\.//"`
1239          refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${name}./"`          refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${name}./"`
1240          outf="$dir/results/$refExOut"          outf="$dir/results/$refExOut"
1241          if test -f $outf -a -r $outf ; then          if test -f $outf -a -r $outf ; then
1242              if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then            if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
1243                  if test -r $dir"/"$exd"/eedata.mth" ; then              if test -r $dir"/"$exd"/eedata.mth" ; then
1244                  if test "x$MPI" = "xt" ; then
1245                    retv=`check_eedata $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" $dir"/"$exd"/eedata.mth"`
1246                    if test $retv = 0 ; then
1247                      extra_runs="$extra_runs $name"                      extra_runs="$extra_runs $name"
1248                  #else echo $dir"/"$exd"/eedata.mth: not found"                  else
1249                        echo $exd"/eedata.mth tiling misfit -- skipping $dir"
1250                  fi                  fi
1251              else                else
1252                  extra_runs="$extra_runs $name"                  extra_runs="$extra_runs $name"
1253                  fi
1254                #else echo $dir"/"$exd"/eedata.mth: not found"
1255              fi              fi
1256              else
1257                extra_runs="$extra_runs $name"
1258              fi
1259          fi          fi
1260      done      done
1261    
# Line 1191  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1275  for dir in $TESTDIRS ; do
1275      mkdir $rel_CDIR      mkdir $rel_CDIR
1276      CDIR=`pwd`"/$rel_CDIR"      CDIR=`pwd`"/$rel_CDIR"
1277            
1278      if test "x$CLEANUP" = xt ; then      if test "x$NORUN" = xt ; then
1279          echo '====>>> this is to check that we never go through this part <<< ==='              run=N
1280          makeclean $dir/$builddir \          genmakemodel $dir/$builddir && genmake=Y \
1281              && run_clean $dir/$rundir              && makeclean $dir/$builddir \
1282                && run_clean $dir/$rundir \
1283                && symlink_mpifiles $dir $code_dir $builddir \
1284                && makedependmodel $dir/$builddir && makedepend=Y \
1285                && makemodel $dir/$builddir && make=Y
1286      else      else
1287          genmakemodel $dir/$builddir && genmake=Y \          genmakemodel $dir/$builddir && genmake=Y \
1288              && makeclean $dir/$builddir \              && makeclean $dir/$builddir \
# Line 1207  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1295  for dir in $TESTDIRS ; do
1295              && results=`testoutput_run $dir $rundir $ref_outp`              && results=`testoutput_run $dir $rundir $ref_outp`
1296      fi      fi
1297            
1298        #echo "results='$results'"
1299      echo      echo
1300          fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`          fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`
1301          echo          echo
# Line 1293  else Line 1382  else
1382              echo "An email containing results was sent to the following addresses:"              echo "An email containing results was sent to the following addresses:"
1383              echo "  \"$ADDRESSES\""              echo "  \"$ADDRESSES\""
1384              echo              echo
1385                test -f $DRESULTS".tar"  &&  rm -f $DRESULTS".tar"
1386                test -f $DRESULTS".tar.gz"  &&  rm -f $DRESULTS".tar.gz"
1387          fi          fi
         test -f $DRESULTS".tar"  &&  rm -f $DRESULTS".tar"  
         test -f $DRESULTS".tar.gz"  &&  rm -f $DRESULTS".tar.gz"  
1388      fi      fi
1389  fi  fi
1390    
1391  rm -f tr_cmpnum.c tr_cmpnum  if test "x$QUICK" = xf -a "x$NORUN" = xf ; then
1392        rm -f tr_cmpnum.c tr_cmpnum
1393    fi
1394    
1395  if test "x$CLEANUP" != xt ; then  if test "x$CLEANUP" != xt ; then
1396      cat $SUMMARY | sed 's/ \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \. //'      cat $SUMMARY | sed 's/ \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \. //'
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