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revision 1.100 by jmc, Mon Sep 17 15:35:46 2007 UTC revision 1.117 by jmc, Tue Aug 19 18:29:12 2008 UTC
# Line 15  usage() Line 15  usage()
15      echo "  (-mpi)                   compile and run using MPI"      echo "  (-mpi)                   compile and run using MPI"
16      echo "  (-ieee|-noieee)          if possible, use IEEE compiler flags"      echo "  (-ieee|-noieee)          if possible, use IEEE compiler flags"
17      echo "                             (DEF=\"-ieee\")"      echo "                             (DEF=\"-ieee\")"
18        echo "  (-gsl)                   compile with \"-gsl\" flag"
19      echo "  (-of=|-optfile=)STRING   list of optfiles to use"      echo "  (-of=|-optfile=)STRING   list of optfiles to use"
20      echo "  (-a|-addr) STRING        list of email recipients"      echo "  (-a|-addr) STRING        list of email recipients"
21      echo "                             (DEF=\"edhill@mitgcm.org\")"      echo "                             (DEF=\"\" no email is sent)"
22        echo "  (-mpd|-mpackdir) DIR     location of the mpack utility"
23        echo "                             (DEF=\"../tools/mpack-1.6\")"
24      echo "  (-t|-tdir) STRING        list of group and/or exp. dirs to test"      echo "  (-t|-tdir) STRING        list of group and/or exp. dirs to test"
25      echo "                             (recognized groups: basic, tutorials)"      echo "                             (recognized groups: basic, tutorials)"
26      echo "                             (DEF=\"\" which test all)"      echo "                             (DEF=\"\" which test all)"
# Line 64  usage() Line 67  usage()
67  build_mpack()  build_mpack()
68  {  {
69      printf "building the mpack utility...  "      printf "building the mpack utility...  "
70      if test ! -x "$MPACKDIR/mpack" ; then      MPACK="$MPACKDIR/mpack"
71        if test ! -x $MPACK ; then
72          if test ! -d $MPACKDIR ; then          if test ! -d $MPACKDIR ; then
73              echo              echo
74              echo "Error: can't find \"$MPACKDIR\""              echo "Error: can't find \"$MPACKDIR\""
# Line 73  build_mpack() Line 77  build_mpack()
77              echo              echo
78              HAVE_MPACK=f              HAVE_MPACK=f
79          fi          fi
         printf "building mpack...  "  
80          if test "x$CC" = x ; then          if test "x$CC" = x ; then
81              export CC=cc              export CC=cc
82          fi          fi
83            printf "building mpack (using CC=$CC)...  "
84          ( cd $MPACKDIR && ./configure && $MAKE ) > tr_build_mpack.out 2>&1          ( cd $MPACKDIR && ./configure && $MAKE ) > tr_build_mpack.out 2>&1
85          RETVAL=$?          RETVAL=$?
86          if test "x$RETVAL" != x0 ; then          if test "x$RETVAL" != x0 ; then
# Line 87  build_mpack() Line 91  build_mpack()
91          else          else
92              rm -f tr_build_mpack.out              rm -f tr_build_mpack.out
93              HAVE_MPACK=t              HAVE_MPACK=t
94                echo "done"
95          fi          fi
96      else      else
97          HAVE_MPACK=t          HAVE_MPACK=t
98            echo "already exist"
99      fi      fi
     echo "OK"  
100  }  }
101    
102  testoutput_var()  testoutput_var()
# Line 174  testoutput_var() Line 179  testoutput_var()
179      return $digits_of_similarity      return $digits_of_similarity
180  }  }
181    
 dashnum()  
 {  
     # dashnum n1 n2 n3 ...  
     #  
     #  print numbers using %3i format or "--" if number = 99  
   
     for num in $@ ; do  
         if [ $num = 99 ]; then  
             printf ' --'  
         else  
             printf '%3i' $num  
         fi  
     done  
 }  
   
 testoutput_ad()  
 {  
     grep $3 $1/results_ad/output_adm.txt | awk '{print NR " " $5}' > t05.txt  
     grep $3 $1/$2/$OUTPUTFILE | awk '{print NR " " $5}' > t15.txt  
     grep $3 $1/results_ad/output_adm.txt | awk '{print NR " " $6}' > t06.txt  
     grep $3 $1/$2/$OUTPUTFILE | awk '{print NR " " $6}' > t16.txt  
     join t05.txt t15.txt > t5.txt  
     join t06.txt t16.txt > t6.txt  
     echo "-1" >> t5.txt  
     echo "-1" >> t6.txt  
     digits_5=`./tr_cmpnum < t5.txt`  
     digits_6=`./tr_cmpnum < t6.txt`  
     dashnum $digits_5 $digits_6  
     rm -f t[01][56].txt t[56].txt  
 }  
   
 check_for_add_mon_output()  
 {  
     # Check for additional types of monitor output  
     if test "x$1" = x ; then  
         return  
     fi  
   
     for ii in $PTRACERS_NUM ; do  
         eval "HAVE_PTR0"$ii"=f"  
     done  
   
     ptr_add="trcstat_ptracerXX_min trcstat_ptracerXX_max"  
     ptr_add="$ptr_add trcstat_ptracerXX_mean trcstat_ptracerXX_sd"  
     for ii in $PTRACERS_NUM ; do  
         for jj in $ptr_add ; do  
             name=`eval "echo $jj | sed -e 's|XX|0"$ii"|g'"`  
             tst=`grep $name $1 | wc -l | awk '{print $1}'`  
             if test ! "x$tst" = x0 ; then  
                 eval "HAVE_PTR0"$ii"=t"  
             fi  
         done  
         #  eval 'echo "HAVE_PTR0'$ii' = $HAVE_PTR0'$ii'"'  
     done  
 }  
   
182  testoutput_run()  testoutput_run()
183  {  {
184      # testoutput_run directory subdir reference_output      # testoutput_run directory subdir reference_output
185      #      #
186      #  test output from 1 run in "directory"      #  test output from 1 run in "directory"
187  #   if test "x$ADM" = x ; then  # --> same processing for adjoint & forward test
188          # default list of output variables to be checked:          # default list of output variables to be checked:
189          #  1rst : main variable used to decide if it pass or FAIL          #  1rst : main variable used to decide if it pass or FAIL
190          #  others : number of matching digits to be printed in summary.txt          #  others : number of matching digits to be printed in summary.txt
# Line 247  testoutput_run() Line 196  testoutput_run()
196          listVar=`echo $listChk | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' \          listVar=`echo $listChk | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' \
197                                 | sed 's/+//g' | sed "s/^$sVar//"`                                 | sed 's/+//g' | sed "s/^$sVar//"`
198          if [ $debug -gt 0 ]; then echo "testoutput_run: listVar(I)='$listVar'" 1>&2 ; fi          if [ $debug -gt 0 ]; then echo "testoutput_run: listVar(I)='$listVar'" 1>&2 ; fi
199          for ii in 1 2 3 4 5 6 7 8 9 ; do          # check for ptracer output in reference_output file :
200            tst=`eval 'echo "$HAVE_PTR0'$ii'"'`          outpref=$1/results/$3
201           #echo "-- ptr test=" $tst "number of var=" `echo $listVar | awk '{print NF}'` 1>&2          ptr_mon="trcstat_ptracerXX_min trcstat_ptracerXX_max"
202            if test "x$tst" != xt ; then listVar=`echo "$listVar" | sed "s/ pt$ii..//g"` ; fi          ptr_mon="$ptr_mon trcstat_ptracerXX_mean trcstat_ptracerXX_sd"
203          done          for ii in $PTRACERS_NUM ; do
204          tst=`echo $sVar $listVar | awk '{ for(i=2;i<=NF;i++){t+=($i==$1)}; print t }'`              ptrfound=0
205                for jj in $ptr_mon ; do
206                    name=`eval "echo $jj | sed -e 's|XX|0"$ii"|g'"`
207                    tst=`grep $name $outpref | wc -l | awk '{print $1}'`
208                    if test ! "x$tst" = x0 ; then ptrfound=1 ; fi
209                done
210                if test $ptrfound = '1' ; then
211                    eval "HAVE_PTR0"$ii"=t"
212                else
213                    eval "HAVE_PTR0"$ii"=f"
214                  if test "x$ADM" = x ; then
215                  # remove this ptr from the list of output variable to check
216                  # echo "-- ptr test=" $tst "number of var=" `echo $listVar | awk '{print NF}'` 1>&2
217                    listVar=`echo "$listVar" | sed "s/ pt$ii..//g"`
218                  fi
219                fi
220            #   eval 'echo "HAVE_PTR0'$ii' = $HAVE_PTR0'$ii'"' 1>&2
221            done
222            tst=`echo $sVar $listVar | awk '{ for(i=2;i<=NF;i++){if($i==$1)t+=1}; print t }'`
223          if test $tst != 1 ; then          if test $tst != 1 ; then
224            if test $tst = 0 ; then echo "==> WARNING: selected var >$sVar< not found" 1>&2            if test $tst = 0 ; then echo "==> WARNING: selected var >$sVar< not found" 1>&2
225                   else echo "==> WARNING: found selected var >$sVar< $tst times" 1>&2 ; fi                   else echo "==> WARNING: found selected var >$sVar< $tst times" 1>&2 ; fi
# Line 270  testoutput_run() Line 237  testoutput_run()
237                    then echo testoutput_run: testoutput_var $1 cg2d_init_res 1>&2 ; fi                    then echo testoutput_run: testoutput_var $1 cg2d_init_res 1>&2 ; fi
238                    testoutput_var $1 "cg2d_init_res" "Press. Solver (cg2d)" $2 $3; yy=$?                    testoutput_var $1 "cg2d_init_res" "Press. Solver (cg2d)" $2 $3; yy=$?
239                    if [ $debug -gt 0 ] ; then echo testoutput_run: cg2dres=$yy 1>&2 ; fi ;;                    if [ $debug -gt 0 ] ; then echo testoutput_run: cg2dres=$yy 1>&2 ; fi ;;
240             'Cost') testoutput_var $1 "ADM  precision_derivative_cost" "ADM Cost" $2 $3; yy=$? ;;            'Cost') testoutput_var $1 "ADM  precision_derivative_cost" "ADM Cost" $2 $3; yy=$? ;;
241             'Grad') testoutput_var $1 "ADM  precision_derivative_grad" "ADM Grad" $2 $3; yy=$? ;;            'Grad') testoutput_var $1 "ADM  precision_derivative_grad" "ADM Grad" $2 $3; yy=$? ;;
242             'Tmn') testoutput_var $1 "dynstat_theta_min"  "Theta minimum"  $2 $3; yy=$? ;;             'Tmn') testoutput_var $1 "dynstat_theta_min"  "Theta minimum"  $2 $3; yy=$? ;;
243             'Tmx') testoutput_var $1 "dynstat_theta_max"  "Theta maximum"  $2 $3; yy=$? ;;             'Tmx') testoutput_var $1 "dynstat_theta_max"  "Theta maximum"  $2 $3; yy=$? ;;
244             'Tav') testoutput_var $1 "dynstat_theta_mean" "Theta mean"     $2 $3; yy=$? ;;             'Tav') testoutput_var $1 "dynstat_theta_mean" "Theta mean"     $2 $3; yy=$? ;;
# Line 296  testoutput_run() Line 263  testoutput_run()
263             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_mean" "p0"$ii"_mean" $2 $3; yy=$? ;;             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_mean" "p0"$ii"_mean" $2 $3; yy=$? ;;
264          'pt1sd'|'pt2sd'|'pt3sd'|'pt4sd'|'pt5sd') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`          'pt1sd'|'pt2sd'|'pt3sd'|'pt4sd'|'pt5sd') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`
265             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_sd"   "p0"$ii"_StDv"  $2 $3; yy=$? ;;             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_sd"   "p0"$ii"_StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
266             'Qntmn') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_min" "Qnet minimum"  $2 $3; yy=$? ;;
267             'Qntmx') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_max" "Qnet maximum"  $2 $3; yy=$? ;;
268             'Qntav') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_mean" "Qnet mean"    $2 $3; yy=$? ;;
269             'Qntsd') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_sd"  "Qnet Std.Dev"  $2 $3; yy=$? ;;
270             'aSImn') testoutput_var $1 "seaice_area_min"   "SIce Area min"   $2 $3; yy=$? ;;
271             'aSImx') testoutput_var $1 "seaice_area_max"   "SIce Area max"   $2 $3; yy=$? ;;
272             'aSIav') testoutput_var $1 "seaice_area_mean"  "SIce Area mean"  $2 $3; yy=$? ;;
273             'aSIsd') testoutput_var $1 "seaice_area_sd"    "SIce Area StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
274             'hSImn') testoutput_var $1 "seaice_heff_min"   "SIce Heff min"   $2 $3; yy=$? ;;
275             'hSImx') testoutput_var $1 "seaice_heff_max"   "SIce Hell max"   $2 $3; yy=$? ;;
276             'hSIav') testoutput_var $1 "seaice_heff_mean"  "SIce Hell mean"  $2 $3; yy=$? ;;
277             'hSIsd') testoutput_var $1 "seaice_heff_sd"    "SIce Hell StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
278            'AthSiG') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_G" "thSIc Area Global" $2 $3; yy=$? ;;
279            'AthSiS') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_S" "thSIc Area South"  $2 $3; yy=$? ;;
280            'AthSiN') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_N" "thSIc Area North"  $2 $3; yy=$? ;;
281            'HthSiG') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_G" "thSIc H Global"    $2 $3; yy=$? ;;
282            'HthSiS') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_S" "thSIc H South"     $2 $3; yy=$? ;;
283            'HthSiN') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_N" "thSIc H North"     $2 $3; yy=$? ;;
284                *) yy=99; echo "WARNING: asking for var=$xx : not recognized !" 1>&2 ;;                *) yy=99; echo "WARNING: asking for var=$xx : not recognized !" 1>&2 ;;
285            esac            esac
286            if test $xx = $sVar            if test $xx = $sVar
# Line 312  testoutput_run() Line 297  testoutput_run()
297          else          else
298            echo $allargs            echo $allargs
299          fi          fi
300    # <-- same processing for adjoint & forward test
 #   else  
 #       testoutput_ad $1 $2 "precision_grdchk_result"  
 #   fi  
301  }  }
302    
303  genmakemodel()  genmakemodel()
# Line 343  genmakemodel() Line 325  genmakemodel()
325              if test "x$IEEE" != x ; then              if test "x$IEEE" != x ; then
326                  command="$command -ieee"                  command="$command -ieee"
327              fi              fi
328                if test "x$GSL" = xt ; then
329                    command="$command -gsl"
330                fi
331              if test "x$MPI" = xt ; then              if test "x$MPI" = xt ; then
332                  command="$command -mpi"                  command="$command -mpi"
333              fi              fi
# Line 415  run_clean() Line 400  run_clean()
400              find . -type l -exec rm {} \;              find . -type l -exec rm {} \;
401              rm -f $EXECUTABLE *.txt STD* *diagnostics.log datetime              rm -f $EXECUTABLE *.txt STD* *diagnostics.log datetime
402              rm -rf mnc_test_*              rm -rf mnc_test_*
403                rm -f *_MIT_CE_000.opt0000 costfunction*0000
404              echo successful 1>&2              echo successful 1>&2
405              exit 0              exit 0
406          )          )
# Line 485  symlink_mpifiles() Line 471  symlink_mpifiles()
471      CODE_DIR=$dir/$code_dir      CODE_DIR=$dir/$code_dir
472            
473      # These are files that should replace their counter-part when using -mpi      # These are files that should replace their counter-part when using -mpi
474      MPI_FILES=`(cd $CODE_DIR; find . -name "*_mpi")`      MPI_FILES=`(cd $CODE_DIR; find . -name "*_mpi" -print)`
475    
476      #  Is this an MPI run?      #  Is this an MPI run?
477      if test "x$MPI" = xt ; then      if test "x$MPI" = xt ; then
# Line 543  linkdata() Line 529  linkdata()
529                      if test -h eedata ; then rm -f eedata ; fi                      if test -h eedata ; then rm -f eedata ; fi
530                  fi                  fi
531              fi              fi
532                prevDir='NONE'
533              for ldir in $* ; do              for ldir in $* ; do
534                  if test -d "../"$ldir ; then                  if test -d "../"$ldir -a $ldir != $prevDir ; then
535                      printf 'ldir='${ldir} 1>&2                      printf 'ldir='${ldir} 1>&2
536                      files=`( cd "../"$ldir ; ls -1 | grep -v CVS )`                      files=`( cd "../"$ldir ; ls -1 | grep -v CVS )`
537                      for i in $files ; do                      for i in $files ; do
# Line 560  linkdata() Line 547  linkdata()
547                      fi                      fi
548                      printf ' ; ' 1>&2                      printf ' ; ' 1>&2
549                  fi                  fi
550                    prevDir=$ldir
551              done              done
552          )          )
553      fi      fi
# Line 576  runmodel() Line 564  runmodel()
564          printf 'runmodel in %s ...' $1 1>&2          printf 'runmodel in %s ...' $1 1>&2
565          # make output.txt          # make output.txt
566          echo          echo
567            if test -L $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then
568                diff -q $EXECUTABLE "../"$builddir"/"$EXECUTABLE > /dev/null 2>&1
569                outD=$? ; if test $outD != 0 ; then rm -f $EXECUTABLE ; rm -f run.log ; fi
570            fi
571          if test ! -x $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then          if test ! -x $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then
572              echo " link" $EXECUTABLE "from dir ../"$builddir > run.log_00              echo " link" $EXECUTABLE "from dir ../"$builddir > run.log_00
573              ln -sf "../"$builddir"/"$EXECUTABLE .              ln -sf "../"$builddir"/"$EXECUTABLE .
# Line 630  createcodelet() Line 622  createcodelet()
622  {  {
623      # create codelet for comparing model output      # create codelet for comparing model output
624    
625      printf "creating the comparison code...  "      printf "creating the comparison code (using CC=$CC)...  "
626      cat > tr_cmpnum.c <<EOF      cat > tr_cmpnum.c <<EOF
627  #include <stdio.h>  #include <stdio.h>
628  #include <math.h>  #include <math.h>
# Line 727  scandirs() Line 719  scandirs()
719  debug=0  debug=0
720  verbose=1  verbose=1
721  clean=0  clean=0
 expts=''  
 # ieee=1  
722    
723  IEEE=true  IEEE=true
724  if test "x$MITGCM_IEEE" != x ; then  if test "x$MITGCM_IEEE" != x ; then
725      IEEE=$MITGCM_IEEE      IEEE=$MITGCM_IEEE
726  fi  fi
727    GSL=f
728    
729  CLEANUP=f  CLEANUP=f
730  QUICK=f  QUICK=f
# Line 750  TESTDIRS= Line 740  TESTDIRS=
740  SKIPDIRS=  SKIPDIRS=
741  MPACKDIR="../tools/mpack-1.6"  MPACKDIR="../tools/mpack-1.6"
742  HAVE_MPACK=  HAVE_MPACK=
743  MPACK="$MPACKDIR/mpack"  MPACK=
744  COMMAND=  COMMAND=
745  if test "x$MAKE" = x ; then  if test "x$MAKE" = x ; then
746      MAKE=make      MAKE=make
# Line 766  DELDIR= Line 756  DELDIR=
756    
757  ADM=  ADM=
758    
759  # Additional monitor types  # list of pTracers to check for monitor output
760  PTRACERS_NUM="1 2 3 4 5"  PTRACERS_NUM="1 2 3 4 5"
761    
762  MATCH_CRIT=13  MATCH_CRIT=13
# Line 799  for ac_option ; do Line 789  for ac_option ; do
789              ac_prev=ADDRESSES ;;              ac_prev=ADDRESSES ;;
790          -addr=* | --addr=*)          -addr=* | --addr=*)
791              ADDRESSES=$ac_optarg ;;              ADDRESSES=$ac_optarg ;;
792            -mpackdir | --mpackdir | -mpd | --mpd)
793                ac_prev=MPACKDIR ;;
794            -mpackdir=* | --mpackdir=* | -mpd=* | --mpd=*)
795                MPACKDIR=$ac_optarg ;;
796    
797          -tdir | --tdir | -t | --t)          -tdir | --tdir | -t | --t)
798              ac_prev=TESTDIRS ;;              ac_prev=TESTDIRS ;;
# Line 864  for ac_option ; do Line 858  for ac_option ; do
858    
859          -ieee) IEEE=true ;;          -ieee) IEEE=true ;;
860          -noieee) IEEE= ;;          -noieee) IEEE= ;;
861            -gsl) GSL=t ;;
862    
863          -verbose) verbose=2 ;;          -verbose) verbose=2 ;;
864          -debug) debug=1 ;;          -debug) debug=1 ;;
# Line 900  fi Line 895  fi
895  #- setting for forward or ADM testing  #- setting for forward or ADM testing
896  if test "x$ADM" = xt ; then  if test "x$ADM" = xt ; then
897      code_dir=code_ad      code_dir=code_ad
898      input_dirs='input_ad input'      inputdir=input_ad
899      ref_outp="output_adm.txt"      ref_outp="output_adm.txt"
900      EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"      EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"
901  else  else
902      code_dir=code      code_dir=code
903      input_dirs='input'      inputdir=input
904      ref_outp="output.txt"      ref_outp="output.txt"
905      EXECUTABLE="mitgcmuv"      EXECUTABLE="mitgcmuv"
906  fi  fi
907    
908  if test "x$TESTDIRS" = x ; then  if test "x$TESTDIRS" = x ; then
909  #   if test "x$ADM" = xt ; then      LIST=`scandirs results/$ref_outp`
 #       LIST=`scandirs results_ad/$ref_outp`  
 #   else  
         LIST=`scandirs results/$ref_outp`  
 #   fi  
910  else  else
911      #- expand group of experiments:      #- expand group of experiments:
912      LIST=" "      LIST=" "
# Line 967  if test "x$MPI" = xt ; then Line 958  if test "x$MPI" = xt ; then
958      OUTPUTFILE="STDOUT.0000"      OUTPUTFILE="STDOUT.0000"
959  fi  fi
960    
 #echo "OK"  
961  echo "OK (COMMAND= $COMMAND )"  echo "OK (COMMAND= $COMMAND )"
962    
963  # set the Default List of output variables to be checked:  # set the Default List of output variables to be checked:
# Line 981  if test "x$ADM" = x ; then Line 971  if test "x$ADM" = x ; then
971      ii=`echo $EMPTY_RESULTS | awk '{print NF}'`      ii=`echo $EMPTY_RESULTS | awk '{print NF}'`
972      EMPTY_RESULTS=$EMPTY_RESULTS`expr $LEN_CHECK_LIST - $ii | awk 'BEGIN{FS=":"}{for(i=1;i<=$1;i++){printf "  ."}}'`      EMPTY_RESULTS=$EMPTY_RESULTS`expr $LEN_CHECK_LIST - $ii | awk 'BEGIN{FS=":"}{for(i=1;i<=$1;i++){printf "  ."}}'`
973  else  else
974      DEF_CHECK_LIST='Cost Cost Grad'      DEF_CHECK_LIST='Grad Cost Grad'
975      EMPTY_RESULTS='.. ..'      EMPTY_RESULTS='.. ..'
976      LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`      LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`
977  fi  fi
# Line 989  fi Line 979  fi
979  #  create the FORTRAN comparison code  #  create the FORTRAN comparison code
980  createcodelet  createcodelet
981    
982  #  build the mpack utility  #  build the mpack utility (if ADDRESSES = NONE, do it to test the build)
983  if test "x$ADDRESSES" = xNONE -o "x$ADDRESSES" = x ; then  if test "x$ADDRESSES" = x ; then
984      echo "skipping mpack build"      echo "skipping mpack build"
985  else  else
986      build_mpack      build_mpack
987  fi  fi
988    
989  #  Create a uniquely named directory to store results  #  Create a uniquely named directory to store results
990    CMDLINE=$0
991    for xx in "$@" ; do CMDLINE="$CMDLINE '$xx'" ; done
992  MACH=`hostname`  MACH=`hostname`
993  UNAMEA=`uname -a`  UNAMEA=`uname -a`
994  DATE=`date +%Y%m%d`  DATE=`date +%Y%m%d`
# Line 1017  if test "x$RETVAL" != x0 ; then Line 1009  if test "x$RETVAL" != x0 ; then
1009      exit 1      exit 1
1010  fi  fi
1011  SUMMARY="$DRESULTS/summary.txt"  SUMMARY="$DRESULTS/summary.txt"
 printf "Start time:  " >> $SUMMARY  
1012  start_date=`date`  start_date=`date`
1013  echo $start_date > $SUMMARY  echo $start_date > $SUMMARY
1014    echo 'run:' $CMDLINE >> $SUMMARY
1015    echo 'on :' $UNAMEA  >> $SUMMARY
1016    
1017  of_path=  of_path=
1018  if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then  if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then
# Line 1059  if test "x$ADM" = x ; then Line 1052  if test "x$ADM" = x ; then
1052      line_3="N n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d"      line_3="N n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d"
1053      line_4="2 d e n  d  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  ."      line_4="2 d e n  d  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  ."
1054      for ii in $PTRACERS_NUM ; do      for ii in $PTRACERS_NUM ; do
         #  tst=`eval 'echo $HAVE_PTR0'$ii`  
         #  if test "x$tst" = xt ; then  
1055          line_0="$line_0  --PTR 0"$ii"--"          line_0="$line_0  --PTR 0"$ii"--"
1056          line_1="$line_1        m  s"          line_1="$line_1        m  s"
1057          line_2="$line_2  m  m  e  ."          line_2="$line_2  m  m  e  ."
1058          line_3="$line_3  i  a  a  d"          line_3="$line_3  i  a  a  d"
1059          line_4="$line_4  n  x  n  ."          line_4="$line_4  n  x  n  ."
         #  fi  
1060      done      done
1061      echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY      echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY
1062      echo "$line_1" | tee -a $SUMMARY      echo "$line_1" | tee -a $SUMMARY
# Line 1078  else Line 1068  else
1068      echo "ADJOINT=true" >> $SUMMARY      echo "ADJOINT=true" >> $SUMMARY
1069      echo >> $SUMMARY      echo >> $SUMMARY
1070      if [ $MATCH_CRIT -lt 10 ] ;      if [ $MATCH_CRIT -lt 10 ] ;
1071      then line_0="default  "$MATCH_CRIT ;      then line_0="default     "$MATCH_CRIT ;
1072      else line_0="default "$MATCH_CRIT ; fi      else line_0="default    "$MATCH_CRIT ; fi
1073      echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY      echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY
1074      cat << EOF | tee -a $SUMMARY      cat << EOF | tee -a $SUMMARY
1075  G D M    C  G  G D M    C  G
# Line 1093  fi Line 1083  fi
1083  #  ...and each test directory...  #  ...and each test directory...
1084  for dir in $TESTDIRS ; do  for dir in $TESTDIRS ; do
1085            
1086        # set builddir & rundir:
1087        builddir="build"
1088        if test ! -d $dir/$builddir ; then mkdir $dir/$builddir ; fi
1089        rundir="run"
1090        if test ! -d $dir/$rundir ; then
1091            rundir=$builddir
1092        fi
1093        CODE_DIR=$dir/$code_dir
1094        BUILD_DIR=$dir/$builddir
1095    
1096      #  Cleanup only!      #  Cleanup only!
1097      if test "x$CLEANUP" = xt ; then      if test "x$CLEANUP" = xt ; then
1098          if test -r $dir/build/Makefile ; then          if test -r $BUILD_DIR/Makefile ; then
1099              echo '  ------  clean dir:' $dir/build              echo '  ------  clean dir:' $dir/$builddir
1100              ( cd $dir/build ; make CLEAN )              ( cd $BUILD_DIR ; make CLEAN )
1101          fi          fi
1102          if test -d $dir/run/CVS ; then          if test -d $dir/$rundir/CVS ; then
1103              echo '  ------  clean dir:' $dir/run              echo '  ------  clean dir:' $dir/$rundir
1104              run_clean $dir/run              run_clean $dir/$rundir
1105          fi          fi
1106          (          (
1107              cd $dir              cd $dir
# Line 1112  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1112  for dir in $TESTDIRS ; do
1112    
1113      #  Verify that the testdir exists and contains previous      #  Verify that the testdir exists and contains previous
1114      #  results in the correct location--or skip this directory!      #  results in the correct location--or skip this directory!
1115      fout=      fout=$dir"/results/"$ref_outp
     if test "x$ADM" = x ; then  
         fout=$dir"/results/"$ref_outp  
     else  
         fout=$dir"/results_ad/"$ref_outp  
     fi  
1116      if test ! -r $fout ; then      if test ! -r $fout ; then
1117          echo "can't read \"$fout\" -- skipping $dir"          echo "can't read \"$fout\" -- skipping $dir"
1118          continue          continue
1119      fi      fi
     if test "x$ADM" = x ; then  
         check_for_add_mon_output  $fout  
     fi  
1120    
1121      # Check for additional types of monitor output      # Check for specific files for particular type of run
   
     builddir="build"  
     if test ! -d $dir/$builddir ; then mkdir $dir/$builddir ; fi  
     rundir="run"  
     if test ! -d $dir/$rundir ; then  
         rundir=$builddir  
     fi  
     CODE_DIR=$dir/$code_dir  
     BUILD_DIR=$dir/$builddir  
1122    
1123      if test ! -r $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" -a "x$MPI" = "xt" ; then      if test ! -r $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" -a "x$MPI" = "xt" ; then
1124          echo "can't find \"$CODE_DIR/SIZE.h_mpi\" -- skipping $dir"          echo "can't find \"$CODE_DIR/SIZE.h_mpi\" -- skipping $dir"
# Line 1148  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1131  for dir in $TESTDIRS ; do
1131    
1132      #  Check whether there are "extra runs" for this testdir      #  Check whether there are "extra runs" for this testdir
1133      extra_runs=      extra_runs=
1134      if test "x$ADM" = x ; then      ex_run_dirs=`( cd $dir ; echo $inputdir.* )`
1135          ex_run_dirs=`( cd $dir ; echo input.* )`      #echo "ex_run_dirs='$ex_run_dirs'"
1136          #echo "ex_run_dirs='$ex_run_dirs'"      for exd in $ex_run_dirs ; do
1137          for exd in $ex_run_dirs ; do          name=`echo $exd | sed -e "s/$inputdir\.//"`
1138              name=`echo $exd | sed -e 's/input.//g'`          refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${name}./"`
1139              outf="$dir/results/output.$name.txt"          outf="$dir/results/$refExOut"
1140              if test -f $outf -a -r $outf ; then          if test -f $outf -a -r $outf ; then
1141                  if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then              if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
1142                      if test -r $dir"/"$exd"/eedata.mth" ; then                  if test -r $dir"/"$exd"/eedata.mth" ; then
                         extra_runs="$extra_runs $name"  
                     #else echo $dir"/"$exd"/eedata.mth: not found"  
                     fi  
                 else  
1143                      extra_runs="$extra_runs $name"                      extra_runs="$extra_runs $name"
1144                    #else echo $dir"/"$exd"/eedata.mth: not found"
1145                  fi                  fi
1146                else
1147                    extra_runs="$extra_runs $name"
1148              fi              fi
1149          done          fi
1150      fi      done
1151    
1152      echo "-------------------------------------------------------------------------------"      echo "-------------------------------------------------------------------------------"
1153      echo      echo
# Line 1194  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1176  for dir in $TESTDIRS ; do
1176              && symlink_mpifiles $dir $code_dir $builddir \              && symlink_mpifiles $dir $code_dir $builddir \
1177              && makedependmodel $dir/$builddir && makedepend=Y \              && makedependmodel $dir/$builddir && makedepend=Y \
1178              && makemodel $dir/$builddir && make=Y \              && makemodel $dir/$builddir && make=Y \
1179              && linkdata $dir/$rundir $input_dirs \              && linkdata $dir/$rundir $inputdir input \
1180              && runmodel $dir/$rundir && run=Y \              && runmodel $dir/$rundir && run=Y \
1181              && results=`testoutput_run $dir $rundir $ref_outp`              && results=`testoutput_run $dir $rundir $ref_outp`
1182      fi      fi
1183            
1184      echo      echo
 #   if test "x$ADM" = x ; then  
1185          fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`          fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`
1186          echo          echo
1187          echo "$fres" | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</' >> $SUMMARY          echo "$fres" | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</' >> $SUMMARY
# Line 1210  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1191  for dir in $TESTDIRS ; do
1191          echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"
1192          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
1193          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"
1194            if test "x$ADM" = xt ; then
1195                head -1 $dir/$builddir/taf_ad.log >> $CDIR"/summary.txt"
1196                grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/$rundir/$OUTPUTFILE \
1197                                    >> $CDIR"/summary.txt"
1198            fi
1199    
1200          for ex in $extra_runs ; do          for ex in $extra_runs ; do
1201              unset run              unset run
1202              results=$EMPTY_RESULTS              results=$EMPTY_RESULTS
1203                #  reference output file
1204                refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${ex}./g"`
1205              #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir.ex combination              #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir.ex combination
1206              rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir"."$ex              rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir"."$ex
1207              mkdir $rel_CDIR              mkdir $rel_CDIR
1208              CDIR=`pwd`"/$rel_CDIR"              CDIR=`pwd`"/$rel_CDIR"
1209              test ! -e "$dir/tr_run.$ex" && mkdir "$dir/tr_run.$ex"              test ! -e "$dir/tr_run.$ex" && mkdir "$dir/tr_run.$ex"
1210              run_clean $dir/tr_run.$ex              run_clean $dir/tr_run.$ex
1211              linkdata $dir/tr_run.$ex input.$ex input              linkdata $dir/tr_run.$ex $inputdir.$ex $inputdir input
1212              runmodel $dir/tr_run.$ex && run=Y \              runmodel $dir/tr_run.$ex && run=Y \
1213                  && results=`testoutput_run $dir tr_run.$ex "output.${ex}.txt"`              && results=`testoutput_run $dir tr_run.$ex $refExOut`
1214              fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`              fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`
1215              fres="$fres.$ex"              fres="$fres.$ex"
1216              echo              echo
# Line 1233  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1221  for dir in $TESTDIRS ; do
1221              echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"
1222              echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
1223              echo "tdir='$dir.$ex'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "tdir='$dir.$ex'" >> $CDIR"/summary.txt"
1224                if test "x$ADM" = xt ; then
1225                    head -1 $dir/$builddir/taf_ad.log >> $CDIR"/summary.txt"
1226                    grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/tr_run.$ex/$OUTPUTFILE \
1227                                       >> $CDIR"/summary.txt"
1228                fi
1229              if test "x$POSTCLEAN" = xt ; then              if test "x$POSTCLEAN" = xt ; then
1230                  run_clean $dir/tr_run.$ex                  run_clean $dir/tr_run.$ex
1231              fi              fi
1232          done          done
 #   else  
 #       fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`  
 #       fres=$fres"$results   $dir"  
 #       echo  
 #       echo "$fres" >> $SUMMARY  
 #       touch $CDIR"/summary.txt"  
 #       echo "fresults='$fres'" >> $CDIR"/summary.txt"  
 #       echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"  
 #       echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"  
 #       echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"  
 #       echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"  
 #   fi  
     if test "x$ADM" = xt ; then  
         grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/$rundir/$OUTPUTFILE \  
                            >> $CDIR"/summary.txt"  
     fi  
1233    
1234      #postclean $dir/$builddir      #postclean $dir/$builddir
1235      if test "x$POSTCLEAN" = xt ; then      if test "x$POSTCLEAN" = xt ; then
# Line 1265  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1242  for dir in $TESTDIRS ; do
1242  done  done
1243    
1244  printf "Start time:  " >> $SUMMARY  printf "Start time:  " >> $SUMMARY
1245  echo $start_date >> $SUMMARY  echo "$start_date" >> $SUMMARY
1246  printf "End time:    " >> $SUMMARY  printf "End time:    " >> $SUMMARY
1247  date >> $SUMMARY  date >> $SUMMARY
1248    
# Line 1299  fi Line 1276  fi
1276  rm -f tr_cmpnum.c tr_cmpnum  rm -f tr_cmpnum.c tr_cmpnum
1277    
1278  if test "x$CLEANUP" != xt ; then  if test "x$CLEANUP" != xt ; then
1279      cat $SUMMARY | sed 's/  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.//'      cat $SUMMARY | sed 's/ \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \. //'
1280      if test -e tr_out.txt ; then      if test -e tr_out.txt ; then
1281          mv tr_out.txt tr_out.txt.old          mv tr_out.txt tr_out.txt.old
1282      fi      fi
1283      cat $SUMMARY | sed '/^[YN] [YN] [YN] [YN]/ s/  \.//g' > tr_out.txt      cat $SUMMARY | sed '/^[YN] [YN] [YN] [YN]/ s/ \. //g' > tr_out.txt
1284  fi  fi
1285    
1286  if test "x$DELDIR" = xt ; then  if test "x$DELDIR" = xt ; then

Legend:
Removed from v.1.100  
changed lines
  Added in v.1.117

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