/[MITgcm]/MITgcm/verification/testreport
ViewVC logotype

Diff of /MITgcm/verification/testreport

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Revision Graph Revision Graph | View Patch Patch

revision 1.93 by jmc, Wed Sep 5 16:09:31 2007 UTC revision 1.108 by jmc, Thu Dec 6 04:04:38 2007 UTC
# Line 17  usage() Line 17  usage()
17      echo "                             (DEF=\"-ieee\")"      echo "                             (DEF=\"-ieee\")"
18      echo "  (-of=|-optfile=)STRING   list of optfiles to use"      echo "  (-of=|-optfile=)STRING   list of optfiles to use"
19      echo "  (-a|-addr) STRING        list of email recipients"      echo "  (-a|-addr) STRING        list of email recipients"
20      echo "                             (DEF=\"edhill@mitgcm.org\")"      echo "                             (DEF=\"\" no email is sent)"
21      echo "  (-t|-tdir) STRING        list of group and/or exp. dirs to test"      echo "  (-t|-tdir) STRING        list of group and/or exp. dirs to test"
22      echo "                             (recognized groups: basic, tutorials)"      echo "                             (recognized groups: basic, tutorials)"
23      echo "                             (DEF=\"\" which test all)"      echo "                             (DEF=\"\" which test all)"
# Line 96  build_mpack() Line 96  build_mpack()
96    
97  testoutput_var()  testoutput_var()
98  {  {
99      # testoutput_var dir s1 label subdir extension      # testoutput_var dir s1 label subdir reference_output
100      #      #
101      #  compares 1 variable output selected from file $dir/$subdir/$OUTPUTFILE      #  compares 1 variable output selected from file $dir/$subdir/$OUTPUTFILE
102      #     with same output from reference file $dir/results/output.$extension      #     with same output from reference file $dir/results/$reference_output
103      #  using search strings s1 and text label      #  using search strings s1 and text label
104    
105      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
# Line 108  testoutput_var() Line 108  testoutput_var()
108      if [ -r $1/$4/$OUTPUTFILE ]; then      if [ -r $1/$4/$OUTPUTFILE ]; then
109          grep "$2" $1/$4/$OUTPUTFILE | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp1.txt          grep "$2" $1/$4/$OUTPUTFILE | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp1.txt
110          lncntA=`wc -l tmp1.txt | awk '{print $1}' `          lncntA=`wc -l tmp1.txt | awk '{print $1}' `
111          if [ $lncntA -lt 3 ]; then          if [ $lncntA -lt 2 ]; then
112              if [ $verbose -gt 0 ]; then              if [ $verbose -gt 0 ]; then
113                  echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2                  echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2
114              fi              fi
# Line 119  testoutput_var() Line 119  testoutput_var()
119          return 99          return 99
120      fi      fi
121      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
122          echo testoutput_var: grep "$2" $1/results/output.$5 1>&2          echo testoutput_var: grep "$2" $1/results/$5 1>&2
123      fi      fi
124      grep "$2" $1/results/output.$5 | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp2.txt      grep "$2" $1/results/$5 | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp2.txt
125      lncntB=`wc -l tmp2.txt | awk '{print $1}' `      lncntB=`wc -l tmp2.txt | awk '{print $1}' `
126      if [ $lncntB -lt 3 ]; then      if [ $lncntB -lt 2 ]; then
127          if [ $verbose -gt 0 ]; then          if [ $verbose -gt 0 ]; then
128              echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2              echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2
129          fi          fi
# Line 161  testoutput_var() Line 161  testoutput_var()
161      digits_of_similarity=`./tr_cmpnum < tmp4.txt`      digits_of_similarity=`./tr_cmpnum < tmp4.txt`
162      if [ $digits_of_similarity -eq 99 ]; then      if [ $digits_of_similarity -eq 99 ]; then
163          if [ $verbose -gt 0 ]; then          if [ $verbose -gt 0 ]; then
164              echo testoutput_var: No comparison was available for \"$2\" 1>&2              echo testoutput_var: No comparison was available for \"$3\" 1>&2
165          fi          fi
166          digits_of_similarity=99          digits_of_similarity=99
167      else      else
168          if [ $verbose -gt 0 ]; then          if [ $verbose -gt 0 ]; then
169              echo There were $digits_of_similarity decimal places of similarity for \"$2\" 1>&2              echo There were $digits_of_similarity decimal places of similarity for \"$3\" 1>&2
170          fi          fi
171      fi      fi
172      rm -f tmp1.txt tmp2.txt tmp3.txt tmp4.txt      rm -f tmp1.txt tmp2.txt tmp3.txt tmp4.txt
# Line 174  testoutput_var() Line 174  testoutput_var()
174      return $digits_of_similarity      return $digits_of_similarity
175  }  }
176    
 dashnum()  
 {  
     # dashnum n1 n2 n3 ...  
     #  
     #  print numbers using %3i format or "--" if number = 99  
   
     for num in $@ ; do  
         if [ $num = 99 ]; then  
             printf ' --'  
         else  
             printf '%3i' $num  
         fi  
     done  
 }  
   
 testoutput_ad()  
 {  
     grep $3 $1/results_ad/output_adm.txt | awk '{print NR " " $5}' > t05.txt  
     grep $3 $1/$2/$OUTPUTFILE | awk '{print NR " " $5}' > t15.txt  
     grep $3 $1/results_ad/output_adm.txt | awk '{print NR " " $6}' > t06.txt  
     grep $3 $1/$2/$OUTPUTFILE | awk '{print NR " " $6}' > t16.txt  
     join t05.txt t15.txt > t5.txt  
     join t06.txt t16.txt > t6.txt  
     echo "-1" >> t5.txt  
     echo "-1" >> t6.txt  
     digits_5=`./tr_cmpnum < t5.txt`  
     digits_6=`./tr_cmpnum < t6.txt`  
     dashnum $digits_5 $digits_6  
     rm -f t[01][56].txt t[56].txt  
 }  
   
177  check_for_add_mon_output()  check_for_add_mon_output()
178  {  {
179      # Check for additional types of monitor output      # Check for additional types of monitor output
# Line 232  check_for_add_mon_output() Line 201  check_for_add_mon_output()
201    
202  testoutput_run()  testoutput_run()
203  {  {
204      # testoutput_run directory subdir extension      # testoutput_run directory subdir reference_output
205      #      #
206      #  test output from 1 run in "directory"      #  test output from 1 run in "directory"
207      if test "x$ADM" = x ; then  # --> same processing for adjoint & forward test
208          if [ $debug -gt 0 ]; then          # default list of output variables to be checked:
209              echo testoutput_run: testoutput_var $1 cg2d_init_res 1>&2          #  1rst : main variable used to decide if it pass or FAIL
210          fi          #  others : number of matching digits to be printed in summary.txt
211          testoutput_var $1 "cg2d_init_res" "cg2d init. residual" $2 $3; cg2dres=$?          listChk=$DEF_CHECK_LIST
212          if [ $debug -gt 0 ]; then          #  load experiment-specific list from file "tr_checklist" (if it exist)
213              echo testoutput_run: cg2dres=$cg2dres 1>&2          if test -r $1/$2/tr_checklist ; then listChk=`cat $1/$2/tr_checklist` ; fi
214          fi          sVar=`echo $listChk | awk '{print $1}'`
215          testoutput_var $1 "dynstat_theta_min" "theta minimum" $2 $3; tmin=$?          # remove 1rst var and expand the list: + => min max mean s.d
216          testoutput_var $1 "dynstat_theta_max" "theta maximum" $2 $3; tmax=$?          listVar=`echo $listChk | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' \
217          testoutput_var $1 "dynstat_theta_mean" "theta mean" $2 $3; tmean=$?                                 | sed 's/+//g' | sed "s/^$sVar//"`
218          testoutput_var $1 "dynstat_theta_sd" "theta s.d." $2 $3; tsd=$?          if [ $debug -gt 0 ]; then echo "testoutput_run: listVar(I)='$listVar'" 1>&2 ; fi
219          testoutput_var $1 "dynstat_salt_min" "salt minimum" $2 $3; smin=$?          for ii in 1 2 3 4 5 6 7 8 9 ; do
220          testoutput_var $1 "dynstat_salt_max" "salt maximum" $2 $3; smax=$?            tst=`eval 'echo "$HAVE_PTR0'$ii'"'`
221          testoutput_var $1 "dynstat_salt_mean" "salt mean" $2 $3; smean=$?           #echo "-- ptr test=" $tst "number of var=" `echo $listVar | awk '{print NF}'` 1>&2
222          testoutput_var $1 "dynstat_salt_sd" "salt s.d." $2 $3; ssd=$?            if test "x$tst" != xt ; then listVar=`echo "$listVar" | sed "s/ pt$ii..//g"` ; fi
223          testoutput_var $1 "dynstat_uvel_min" "U minimum" $2 $3; umin=$?          done
224          testoutput_var $1 "dynstat_uvel_max" "U maximum" $2 $3; umax=$?          tst=`echo $sVar $listVar | awk '{ for(i=2;i<=NF;i++){t+=($i==$1)}; print t }'`
225          testoutput_var $1 "dynstat_uvel_mean" "U mean" $2 $3; umean=$?          if test $tst != 1 ; then
226          testoutput_var $1 "dynstat_uvel_sd" "U s.d." $2 $3; usd=$?            if test $tst = 0 ; then echo "==> WARNING: selected var >$sVar< not found" 1>&2
227          testoutput_var $1 "dynstat_vvel_min" "V minimum" $2 $3; vmin=$?                   else echo "==> WARNING: found selected var >$sVar< $tst times" 1>&2 ; fi
228          testoutput_var $1 "dynstat_vvel_max" "V maximum" $2 $3; vmax=$?            echo "==> WARNING: in checked list:" $listVar 1>&2
229          testoutput_var $1 "dynstat_vvel_mean" "V mean" $2 $3; vmean=$?          #- put it back once:
230          testoutput_var $1 "dynstat_vvel_sd" "V s.d." $2 $3; vsd=$?            listVar=" $sVar "`echo "$listVar " | sed "s/ $sVar / /g"`
231            fi
232          #  This is for PTRACERS          if [ $debug -gt 0 ]; then echo "testoutput_run: listVar(M)='$listVar'" 1>&2 ; fi
233          for ii in $PTRACERS_NUM ; do          echo "listVar='$listVar'" > $CDIR"/summary.txt"
234              eval `echo "p0"$ii"_min=99"`          allargs=""
235              eval `echo "p0"$ii"_max=99"`          for xx in $listVar
236              eval `echo "p0"$ii"_mean=99"`          do
237              eval `echo "p0"$ii"_sd=99"`            case $xx in
238              tst=`eval 'echo "$HAVE_PTR0'$ii'"'`             'PS')  if [ $debug -gt 0 ]
239              #echo 'tst = '$tst                    then echo testoutput_run: testoutput_var $1 cg2d_init_res 1>&2 ; fi
240              if test "x$tst" = xt ; then                    testoutput_var $1 "cg2d_init_res" "Press. Solver (cg2d)" $2 $3; yy=$?
241                  a="trcstat_ptracer0"                    if [ $debug -gt 0 ] ; then echo testoutput_run: cg2dres=$yy 1>&2 ; fi ;;
242                  testoutput_var $1 "$a"$ii"_min"  "p0"$ii"_min"  $2 $3            'Cost') testoutput_var $1 "ADM  precision_derivative_cost" "ADM Cost" $2 $3; yy=$? ;;
243                  RETVAL=$? ; eval `echo "p0"$ii"_min="$RETVAL`            'Grad') testoutput_var $1 "ADM  precision_derivative_grad" "ADM Grad" $2 $3; yy=$? ;;
244                  testoutput_var $1 "$a"$ii"_max"  "p0"$ii"_max"  $2 $3             'Tmn') testoutput_var $1 "dynstat_theta_min"  "Theta minimum"  $2 $3; yy=$? ;;
245                  RETVAL=$? ; eval `echo "p0"$ii"_max="$RETVAL`             'Tmx') testoutput_var $1 "dynstat_theta_max"  "Theta maximum"  $2 $3; yy=$? ;;
246                  testoutput_var $1 "$a"$ii"_mean" "p0"$ii"_mean" $2 $3             'Tav') testoutput_var $1 "dynstat_theta_mean" "Theta mean"     $2 $3; yy=$? ;;
247                  RETVAL=$? ; eval `echo "p0"$ii"_mean="$RETVAL`             'Tsd') testoutput_var $1 "dynstat_theta_sd"   "Theta Std.Dev"  $2 $3; yy=$? ;;
248                  testoutput_var $1 "$a"$ii"_sd"   "p0"$ii"_sd"   $2 $3             'Smn') testoutput_var $1 "dynstat_salt_min"  "Salt minimum"    $2 $3; yy=$? ;;
249                  RETVAL=$? ; eval `echo "p0"$ii"_sd="$RETVAL`             'Smx') testoutput_var $1 "dynstat_salt_max"  "Salt maximum"    $2 $3; yy=$? ;;
250              fi             'Sav') testoutput_var $1 "dynstat_salt_mean" "Salt mean"       $2 $3; yy=$? ;;
251          done             'Ssd') testoutput_var $1 "dynstat_salt_sd"   "Salt Std.Dev"    $2 $3; yy=$? ;;
252               'Umn') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_min"  "U minimum"       $2 $3; yy=$? ;;
253          allargs="$cg2dres $tmin $tmax $tmean $tsd $smin $smax $smean $ssd"             'Umx') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_max"  "U maximum"       $2 $3; yy=$? ;;
254          allargs="$allargs $umin $umax $umean $usd $vmin $vmax $vmean $vsd"             'Uav') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_mean" "U mean"          $2 $3; yy=$? ;;
255          allargs="$allargs $p01_min $p01_max $p01_mean $p01_sd"             'Usd') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_sd"   "U Std.Dev"       $2 $3; yy=$? ;;
256          allargs="$allargs $p02_min $p02_max $p02_mean $p02_sd"             'Vmn') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_min"  "V minimum"       $2 $3; yy=$? ;;
257          allargs="$allargs $p03_min $p03_max $p03_mean $p03_sd"             'Vmx') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_max"  "V maximum"       $2 $3; yy=$? ;;
258          allargs="$allargs $p04_min $p04_max $p04_mean $p04_sd"             'Vav') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_mean" "V mean"          $2 $3; yy=$? ;;
259          allargs="$allargs $p05_min $p05_max $p05_mean $p05_sd"             'Vsd') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_sd"   "V Std.Dev"       $2 $3; yy=$? ;;
260            'pt1mn'|'pt2mn'|'pt3mn'|'pt4mn'|'pt5mn') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`
261          eval "dashnum $allargs"             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_min"  "p0"$ii"_min"   $2 $3; yy=$? ;;
262            'pt1mx'|'pt2mx'|'pt3mx'|'pt4mx'|'pt5mx') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`
263      else             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_max"  "p0"$ii"_max"   $2 $3; yy=$? ;;
264          testoutput_ad $1 $2 "precision_grdchk_result"          'pt1av'|'pt2av'|'pt3av'|'pt4av'|'pt5av') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`
265      fi             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_mean" "p0"$ii"_mean" $2 $3; yy=$? ;;
266            'pt1sd'|'pt2sd'|'pt3sd'|'pt4sd'|'pt5sd') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`
267               testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_sd"   "p0"$ii"_StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
268             'Qntmn') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_min" "Qnet minimum"  $2 $3; yy=$? ;;
269             'Qntmx') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_max" "Qnet maximum"  $2 $3; yy=$? ;;
270             'Qntav') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_mean" "Qnet mean"    $2 $3; yy=$? ;;
271             'Qntsd') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_sd"  "Qnet Std.Dev"  $2 $3; yy=$? ;;
272             'aSImn') testoutput_var $1 "seaice_area_min"   "SIce Area min"   $2 $3; yy=$? ;;
273             'aSImx') testoutput_var $1 "seaice_area_max"   "SIce Area max"   $2 $3; yy=$? ;;
274             'aSIav') testoutput_var $1 "seaice_area_mean"  "SIce Area mean"  $2 $3; yy=$? ;;
275             'aSIsd') testoutput_var $1 "seaice_area_sd"    "SIce Area StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
276             'hSImn') testoutput_var $1 "seaice_heff_min"   "SIce Heff min"   $2 $3; yy=$? ;;
277             'hSImx') testoutput_var $1 "seaice_heff_max"   "SIce Hell max"   $2 $3; yy=$? ;;
278             'hSIav') testoutput_var $1 "seaice_heff_mean"  "SIce Hell mean"  $2 $3; yy=$? ;;
279             'hSIsd') testoutput_var $1 "seaice_heff_sd"    "SIce Hell StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
280            'AthSiG') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_G" "thSIc Area Global" $2 $3; yy=$? ;;
281            'AthSiS') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_S" "thSIc Area South"  $2 $3; yy=$? ;;
282            'AthSiN') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_N" "thSIc Area North"  $2 $3; yy=$? ;;
283            'HthSiG') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_G" "thSIc H Global"    $2 $3; yy=$? ;;
284            'HthSiS') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_S" "thSIc H South"     $2 $3; yy=$? ;;
285            'HthSiN') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_N" "thSIc H North"     $2 $3; yy=$? ;;
286                  *) yy=99; echo "WARNING: asking for var=$xx : not recognized !" 1>&2 ;;
287              esac
288              if test $xx = $sVar
289              then allargs="$allargs > $yy <"
290              else allargs="$allargs $yy"
291              fi
292            done
293    
294            nbVar=`echo $listVar | awk '{print NF}'`
295            if [ $nbVar -lt $LEN_CHECK_LIST ] ; then
296            #-- fill line (up to standard length) with dot:
297              adNul=`expr $LEN_CHECK_LIST - $nbVar | awk '{for(i=1;i<=$1;i++){print "."}}'`
298              echo $allargs $adNul
299            else
300              echo $allargs
301            fi
302    # <-- same processing for adjoint & forward test
303  }  }
304    
305  genmakemodel()  genmakemodel()
# Line 393  run_clean() Line 399  run_clean()
399              find . -type l -exec rm {} \;              find . -type l -exec rm {} \;
400              rm -f $EXECUTABLE *.txt STD* *diagnostics.log datetime              rm -f $EXECUTABLE *.txt STD* *diagnostics.log datetime
401              rm -rf mnc_test_*              rm -rf mnc_test_*
402                rm -f *_MIT_CE_000.opt0000 costfunction*0000
403              echo successful 1>&2              echo successful 1>&2
404              exit 0              exit 0
405          )          )
# Line 521  linkdata() Line 528  linkdata()
528                      if test -h eedata ; then rm -f eedata ; fi                      if test -h eedata ; then rm -f eedata ; fi
529                  fi                  fi
530              fi              fi
531                prevDir='NONE'
532              for ldir in $* ; do              for ldir in $* ; do
533                  if test -d "../"$ldir ; then                  if test -d "../"$ldir -a $ldir != $prevDir ; then
534                      printf 'ldir='${ldir} 1>&2                      printf 'ldir='${ldir} 1>&2
535                      files=`( cd "../"$ldir ; ls -1 | grep -v CVS )`                      files=`( cd "../"$ldir ; ls -1 | grep -v CVS )`
536                      for i in $files ; do                      for i in $files ; do
# Line 538  linkdata() Line 546  linkdata()
546                      fi                      fi
547                      printf ' ; ' 1>&2                      printf ' ; ' 1>&2
548                  fi                  fi
549                    prevDir=$ldir
550              done              done
551          )          )
552      fi      fi
# Line 554  runmodel() Line 563  runmodel()
563          printf 'runmodel in %s ...' $1 1>&2          printf 'runmodel in %s ...' $1 1>&2
564          # make output.txt          # make output.txt
565          echo          echo
566            if test -L $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then
567                diff -q $EXECUTABLE "../"$builddir"/"$EXECUTABLE > /dev/null 2>&1
568                outD=$? ; if test $outD != 0 ; then rm -f $EXECUTABLE ; rm -f run.log ; fi
569            fi
570          if test ! -x $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then          if test ! -x $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then
571              echo " link" $EXECUTABLE "from dir ../"$builddir > run.log_00              echo " link" $EXECUTABLE "from dir ../"$builddir > run.log_00
572              ln -sf "../"$builddir"/"$EXECUTABLE .              ln -sf "../"$builddir"/"$EXECUTABLE .
# Line 565  runmodel() Line 578  runmodel()
578                  RETVAL=8                  RETVAL=8
579                  ENDVAL=-1                  ENDVAL=-1
580          else          else
581              if test $OUTPUTFILE -ot $EXECUTABLE ; then              if test ! -f $OUTPUTFILE -o $OUTPUTFILE -ot $EXECUTABLE ; then
582                  # output do not exist or is older than executable:
583                  rm -f run.log ; touch run.log                  rm -f run.log ; touch run.log
584                  if test -f run.log_00 ; then cat run.log_00 >> run.log ; fi                  if test -f run.log_00 ; then cat run.log_00 >> run.log ; fi
585                  ( eval $COMMAND ) >> run.log 2>&1                  ( eval $COMMAND ) >> run.log 2>&1
# Line 616  int main( int argc, char** argv )  { Line 630  int main( int argc, char** argv )  {
630    double a,b,abave,relerr;    double a,b,abave,relerr;
631    best = -22;    best = -22;
632    lncnt = 0;    lncnt = 0;
633    while( 1 & (lncnt+=1) < 999 )  {    while( 1 & ( (lncnt+=1) < 999 ) )  {
634      scanf("%d", &linnum);      scanf("%d", &linnum);
635      if (linnum == -1)  break;      if (linnum == -1)  break;
636      scanf("%lf", &a);  scanf("%lf", &b);      scanf("%lf", &a);  scanf("%lf", &b);
# Line 660  formatresults() Line 674  formatresults()
674      nm=$1      nm=$1
675      printf '%s %s %s %s' $2 $3 $4 $5      printf '%s %s %s %s' $2 $3 $4 $5
676      shift; shift; shift; shift; shift;      shift; shift; shift; shift; shift;
677      printf '%3s' $@      listPrt=$@
678        listRes=`echo $listPrt | sed 's/>//' | sed 's/<//'`
679        xx=`echo $listPrt | sed 's/.*>//' | sed 's/<.*//' | awk '{print $1}'`
680        printf '%3s' $listPrt
681    #   line below does not work on hp-ux_ia64 : do those substitutions later on
682    #   printf '%3s' $listPrt | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</'
683            
684      if [ $1 = '--' ]; then      if [ $xx = '..' ]; then
685            printf ' N/O '
686        elif [ $xx = '--' ]; then
687            printf ' N/O '
688        elif [ $xx = 99 ]; then
689          printf ' N/O '          printf ' N/O '
690      else      else
691          if [ $1 -ge $MATCH_CRIT ]; then          if [ $xx -ge $MATCH_CRIT ]; then
692              printf ' pass'              printf ' pass'
693          else          else
694              printf ' FAIL'              printf ' FAIL'
# Line 680  scandirs() Line 703  scandirs()
703  {  {
704      if [ $# -eq 1 ]; then      if [ $# -eq 1 ]; then
705          for arg in * ; do          for arg in * ; do
706              test -d $arg/$1 && echo $arg              test -f $arg/$1 && echo $arg
707          done          done
708      else      else
709          echo $*          echo $*
# Line 865  if test "x$QUICK" = xt ; then Line 888  if test "x$QUICK" = xt ; then
888      NODEPEND=t      NODEPEND=t
889  fi  fi
890    
891    #- setting for forward or ADM testing
892    if test "x$ADM" = xt ; then
893        code_dir=code_ad
894        inputdir=input_ad
895        ref_outp="output_adm.txt"
896        EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"
897    else
898        code_dir=code
899        inputdir=input
900        ref_outp="output.txt"
901        EXECUTABLE="mitgcmuv"
902    fi
903    
904  if test "x$TESTDIRS" = x ; then  if test "x$TESTDIRS" = x ; then
905      if test "x$ADM" = xt ; then      LIST=`scandirs results/$ref_outp`
         LIST=`scandirs results_ad`  
     else  
         LIST=`scandirs results`  
     fi  
906  else  else
907      #- expand group of experiments:      #- expand group of experiments:
908      LIST=" "      LIST=" "
# Line 914  if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM Line 946  if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM
946      OPTFILE=$MITGCM_OF      OPTFILE=$MITGCM_OF
947  fi  fi
948    
949  if test "x$ADM" = xt ; then  OUTPUTFILE=$ref_outp
     EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"  
     OUTPUTFILE="output_adm.txt"  
 else  
     EXECUTABLE="mitgcmuv"  
     OUTPUTFILE="output.txt"  
 fi  
   
950  if test "x$COMMAND" = x ; then  if test "x$COMMAND" = x ; then
951      COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"      COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"
952  fi  fi
# Line 929  if test "x$MPI" = xt ; then Line 954  if test "x$MPI" = xt ; then
954      OUTPUTFILE="STDOUT.0000"      OUTPUTFILE="STDOUT.0000"
955  fi  fi
956    
 #echo "OK"  
957  echo "OK (COMMAND= $COMMAND )"  echo "OK (COMMAND= $COMMAND )"
958    
959    # set the Default List of output variables to be checked:
960    #  (use default or load experiment-specific list from file "tr_checklist")
961    # content : 1rst = main variable used to decide if it pass or FAIL
962    #         others = number of matching digits to be printed in summary.txt
963    if test "x$ADM" = x ; then
964        DEF_CHECK_LIST='PS PS T+ S+ U+ V+ pt1+ pt2+ pt3+ pt4+ pt5+'
965        EMPTY_RESULTS='.. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. ..'
966        LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`
967        ii=`echo $EMPTY_RESULTS | awk '{print NF}'`
968        EMPTY_RESULTS=$EMPTY_RESULTS`expr $LEN_CHECK_LIST - $ii | awk 'BEGIN{FS=":"}{for(i=1;i<=$1;i++){printf "  ."}}'`
969    else
970        DEF_CHECK_LIST='Grad Cost Grad'
971        EMPTY_RESULTS='.. ..'
972        LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`
973    fi
974    
975  #  create the FORTRAN comparison code  #  create the FORTRAN comparison code
976  createcodelet  createcodelet
977    
# Line 996  echo Line 1036  echo
1036  echo >> $SUMMARY  echo >> $SUMMARY
1037  if test "x$ADM" = x ; then  if test "x$ADM" = x ; then
1038      if [ $MATCH_CRIT -lt 10 ] ;      if [ $MATCH_CRIT -lt 10 ] ;
1039      then line_0="      "$MATCH_CRIT ;      then line_0="default  "$MATCH_CRIT ;
1040      else line_0="     "$MATCH_CRIT ; fi      else line_0="default "$MATCH_CRIT ; fi
1041      line_0="   $line_0  ----T-----  ----S-----  ----U-----  ----V-----"         line_0="$line_0  ----T-----  ----S-----  ----U-----  ----V-----"
1042  #   line_0="            ----T-----  ----S-----  ----U-----  ----V-----"  #   line_0="            ----T-----  ----S-----  ----U-----  ----V-----"
1043      line_1="G D M    c        m  s        m  s        m  s        m  s"      line_1="G D M    c        m  s        m  s        m  s        m  s"
1044      line_2="E p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  ."      line_2="E p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  ."
# Line 1023  if test "x$ADM" = x ; then Line 1063  if test "x$ADM" = x ; then
1063  else  else
1064      echo "ADJOINT=true" >> $SUMMARY      echo "ADJOINT=true" >> $SUMMARY
1065      echo >> $SUMMARY      echo >> $SUMMARY
1066        if [ $MATCH_CRIT -lt 10 ] ;
1067        then line_0="default     "$MATCH_CRIT ;
1068        else line_0="default    "$MATCH_CRIT ; fi
1069        echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY
1070      cat << EOF | tee -a $SUMMARY      cat << EOF | tee -a $SUMMARY
1071  G D M    C  G  G D M    C  G
1072  E p a R  o  r  E p a R  o  r
# Line 1035  fi Line 1079  fi
1079  #  ...and each test directory...  #  ...and each test directory...
1080  for dir in $TESTDIRS ; do  for dir in $TESTDIRS ; do
1081            
1082        # set builddir & rundir:
1083        builddir="build"
1084        if test ! -d $dir/$builddir ; then mkdir $dir/$builddir ; fi
1085        rundir="run"
1086        if test ! -d $dir/$rundir ; then
1087            rundir=$builddir
1088        fi
1089        CODE_DIR=$dir/$code_dir
1090        BUILD_DIR=$dir/$builddir
1091    
1092      #  Cleanup only!      #  Cleanup only!
1093      if test "x$CLEANUP" = xt ; then      if test "x$CLEANUP" = xt ; then
1094          if test -r $dir/build/Makefile ; then          if test -r $BUILD_DIR/Makefile ; then
1095              echo '  ------  clean dir:' $dir/build              echo '  ------  clean dir:' $dir/build
1096              ( cd $dir/build ; make CLEAN )              ( cd $BUILD_DIR ; make CLEAN )
1097          fi          fi
1098          if test -d $dir/run/CVS ; then          if test -d $dir/$rundir/CVS ; then
1099              echo '  ------  clean dir:' $dir/run              echo '  ------  clean dir:' $dir/$rundir
1100              run_clean $dir/run              run_clean $dir/$rundir
1101          fi          fi
1102          (          (
1103              cd $dir              cd $dir
# Line 1054  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1108  for dir in $TESTDIRS ; do
1108    
1109      #  Verify that the testdir exists and contains previous      #  Verify that the testdir exists and contains previous
1110      #  results in the correct location--or skip this directory!      #  results in the correct location--or skip this directory!
1111      fout=      fout=$dir"/results/"$ref_outp
     if test "x$ADM" = x ; then  
         fout=$dir"/results/output.txt"  
     else  
         fout=$dir"/results_ad/output_adm.txt"  
     fi  
1112      if test ! -r $fout ; then      if test ! -r $fout ; then
1113          echo "can't read \"$fout\" -- skipping $dir"          echo "can't read \"$fout\" -- skipping $dir"
1114          continue          continue
# Line 1070  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1119  for dir in $TESTDIRS ; do
1119    
1120      # Check for additional types of monitor output      # Check for additional types of monitor output
1121    
     builddir="build"  
     if test ! -d $dir/$builddir ; then mkdir $dir/$builddir ; fi  
     rundir="run"  
    #rundir=$builddir  
     if test ! -d $dir/$rundir ; then  
         rundir=$builddir  
     fi  
       
     if test "x$ADM" = x ; then  
         code_dir=code  
         CODE_DIR=$dir/code  
         input_dirs='input'  
     else  
         code_dir=code_ad  
         CODE_DIR=$dir/code_ad  
         input_dirs='input_ad input'  
     fi  
     BUILD_DIR=$dir/$builddir  
   
1122      if test ! -r $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" -a "x$MPI" = "xt" ; then      if test ! -r $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" -a "x$MPI" = "xt" ; then
1123          echo "can't find \"$CODE_DIR/SIZE.h_mpi\" -- skipping $dir"          echo "can't find \"$CODE_DIR/SIZE.h_mpi\" -- skipping $dir"
1124          continue          continue
# Line 1100  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1130  for dir in $TESTDIRS ; do
1130    
1131      #  Check whether there are "extra runs" for this testdir      #  Check whether there are "extra runs" for this testdir
1132      extra_runs=      extra_runs=
1133      if test "x$ADM" = x ; then      ex_run_dirs=`( cd $dir ; echo $inputdir.* )`
1134          ex_run_dirs=`( cd $dir ; echo input.* )`      #echo "ex_run_dirs='$ex_run_dirs'"
1135          #echo "ex_run_dirs='$ex_run_dirs'"      for exd in $ex_run_dirs ; do
1136          for exd in $ex_run_dirs ; do          name=`echo $exd | sed -e "s/$inputdir\.//"`
1137              name=`echo $exd | sed -e 's/input.//g'`          refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${name}./"`
1138              outf="$dir/results/output.$name.txt"          outf="$dir/results/$refExOut"
1139              if test -f $outf -a -r $outf ; then          if test -f $outf -a -r $outf ; then
1140                  if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then              if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
1141                      if test -r $dir"/"$exd"/eedata.mth" ; then                  if test -r $dir"/"$exd"/eedata.mth" ; then
                         extra_runs="$extra_runs $name"  
                     #else echo $dir"/"$exd"/eedata.mth: not found"  
                     fi  
                 else  
1142                      extra_runs="$extra_runs $name"                      extra_runs="$extra_runs $name"
1143                    #else echo $dir"/"$exd"/eedata.mth: not found"
1144                  fi                  fi
1145                else
1146                    extra_runs="$extra_runs $name"
1147              fi              fi
1148          done          fi
1149      fi      done
1150    
1151      echo "-------------------------------------------------------------------------------"      echo "-------------------------------------------------------------------------------"
1152      echo      echo
# Line 1128  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1157  for dir in $TESTDIRS ; do
1157      fi      fi
1158      echo      echo
1159      unset genmake makedepend make run      unset genmake makedepend make run
1160      results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'      results=$EMPTY_RESULTS
1161    
1162      #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir combination      #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir combination
1163      rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir      rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir
# Line 1146  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1175  for dir in $TESTDIRS ; do
1175              && symlink_mpifiles $dir $code_dir $builddir \              && symlink_mpifiles $dir $code_dir $builddir \
1176              && makedependmodel $dir/$builddir && makedepend=Y \              && makedependmodel $dir/$builddir && makedepend=Y \
1177              && makemodel $dir/$builddir && make=Y \              && makemodel $dir/$builddir && make=Y \
1178              && linkdata $dir/$rundir $input_dirs \              && linkdata $dir/$rundir $inputdir input \
1179              && runmodel $dir/$rundir && run=Y \              && runmodel $dir/$rundir && run=Y \
1180              && results=`testoutput_run $dir $rundir "txt"`              && results=`testoutput_run $dir $rundir $ref_outp`
1181      fi      fi
1182            
1183      echo      echo
     if test "x$ADM" = x ; then  
1184          fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`          fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`
1185          echo          echo
1186          echo "$fres" >> $SUMMARY          echo "$fres" | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</' >> $SUMMARY
1187          echo "fresults='$fres'" > $CDIR"/summary.txt"          touch $CDIR"/summary.txt"
1188            echo "fresults='$fres'" | sed 's/ 99/ --/g' >> $CDIR"/summary.txt"
1189          echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"
1190          echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"
1191          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
1192          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"
1193            if test "x$ADM" = xt ; then
1194                head -1 $dir/$builddir/taf_ad.log >> $CDIR"/summary.txt"
1195                grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/$rundir/$OUTPUTFILE \
1196                                    >> $CDIR"/summary.txt"
1197            fi
1198    
1199          for ex in $extra_runs ; do          for ex in $extra_runs ; do
1200              unset run              unset run
1201              results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'              results=$EMPTY_RESULTS
1202                #  reference output file
1203                refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${ex}./g"`
1204              #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir.ex combination              #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir.ex combination
1205              rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir"."$ex              rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir"."$ex
1206              mkdir $rel_CDIR              mkdir $rel_CDIR
1207              CDIR=`pwd`"/$rel_CDIR"              CDIR=`pwd`"/$rel_CDIR"
1208              test ! -e "$dir/tr_run.$ex" && mkdir "$dir/tr_run.$ex"              test ! -e "$dir/tr_run.$ex" && mkdir "$dir/tr_run.$ex"
1209              run_clean $dir/tr_run.$ex              run_clean $dir/tr_run.$ex
1210              linkdata $dir/tr_run.$ex input.$ex input              linkdata $dir/tr_run.$ex $inputdir.$ex $inputdir input
1211              runmodel $dir/tr_run.$ex && run=Y \              runmodel $dir/tr_run.$ex && run=Y \
1212                  && results=`testoutput_run $dir tr_run.$ex ${ex}".txt"`              && results=`testoutput_run $dir tr_run.$ex $refExOut`
             fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`  
1213              fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`              fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`
1214              fres="$fres.$ex"              fres="$fres.$ex"
1215              echo              echo
1216              echo "$fres" >> $SUMMARY              echo "$fres" | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</' >> $SUMMARY
1217              echo "fresults='$fres'" > $CDIR"/summary.txt"              touch $CDIR"/summary.txt"
1218                echo "fresults='$fres'" | sed 's/ 99/ --/g' >> $CDIR"/summary.txt"
1219              echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"
1220              echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"
1221              echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
1222              echo "tdir='$dir.$ex'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "tdir='$dir.$ex'" >> $CDIR"/summary.txt"
1223                if test "x$ADM" = xt ; then
1224                    head -1 $dir/$builddir/taf_ad.log >> $CDIR"/summary.txt"
1225                    grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/tr_run.$ex/$OUTPUTFILE \
1226                                       >> $CDIR"/summary.txt"
1227                fi
1228              if test "x$POSTCLEAN" = xt ; then              if test "x$POSTCLEAN" = xt ; then
1229                  run_clean $dir/tr_run.$ex                  run_clean $dir/tr_run.$ex
1230              fi              fi
1231          done          done
     else  
         fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`  
         fres=$fres"$results   $dir"  
         echo  
         echo "$fres" >> $SUMMARY  
         echo "fresults='$fres'" > $CDIR"/summary.txt"  
         echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"  
         echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"  
         echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"  
         echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"  
         grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/$rundir/$OUTPUTFILE \  
                            >> $CDIR"/summary.txt"  
     fi  
1232    
1233      #postclean $dir/$builddir      #postclean $dir/$builddir
1234      if test "x$POSTCLEAN" = xt ; then      if test "x$POSTCLEAN" = xt ; then
# Line 1247  fi Line 1275  fi
1275  rm -f tr_cmpnum.c tr_cmpnum  rm -f tr_cmpnum.c tr_cmpnum
1276    
1277  if test "x$CLEANUP" != xt ; then  if test "x$CLEANUP" != xt ; then
1278      cat $SUMMARY | sed 's/ -- -- -- --//g'      cat $SUMMARY | sed 's/ \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \. //'
1279      if test -e tr_out.txt ; then      if test -e tr_out.txt ; then
1280          mv tr_out.txt tr_out.txt.old          mv tr_out.txt tr_out.txt.old
1281      fi      fi
1282      cat $SUMMARY | sed 's/ -- -- -- --//g' > tr_out.txt      cat $SUMMARY | sed '/^[YN] [YN] [YN] [YN]/ s/ \. //g' > tr_out.txt
1283  fi  fi
1284    
1285  if test "x$DELDIR" = xt ; then  if test "x$DELDIR" = xt ; then
Legend:
Removed from v.1.93  
changed lines
  Added in v.1.108
  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.22