/[MITgcm]/MITgcm/verification/testreport
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revision 1.46 by jmc, Sun Jul 18 21:27:42 2004 UTC revision 1.82 by jmc, Sun Jun 18 21:20:51 2006 UTC
# Line 27  usage() Line 27  usage()
27      echo "                             (DEF=\"make output.txt\")"      echo "                             (DEF=\"make output.txt\")"
28      echo "  (-m|-make) STRING        command to use for \"make\""      echo "  (-m|-make) STRING        command to use for \"make\""
29      echo "                             (DEF=\"make\")"      echo "                             (DEF=\"make\")"
30        echo "  (-odir) STRING           used to build output directory name"
31        echo "                             (DEF=\"hostname\")"
32        echo "  (-ptracers|-ptr) STRING  specify which ptracers to test"
33        echo "                             (DEF=\"1 2 3 4 5\")"
34      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"
35      echo "  (-clean)                 *ONLY* run \"make CLEAN\""      echo "  (-clean)                 *ONLY* run \"make CLEAN\""
36      echo "  (-quick|-q)              same as \"-nogenmake -noclean -nodepend\""      echo "  (-quick|-q)              same as \"-nogenmake -noclean -nodepend\""
# Line 35  usage() Line 39  usage()
39      echo "  (-nodepend|-nd)          skip the \"make depend\" stage"      echo "  (-nodepend|-nd)          skip the \"make depend\" stage"
40      echo "  (-deldir|-dd)            on success, delete the output directory"      echo "  (-deldir|-dd)            on success, delete the output directory"
41      echo      echo
42      echo "and where STRING follows a whitespace-delimited format"      echo "and where STRING can be a whitespace-delimited list"
43      echo "such as:"      echo "such as:"
44        echo
45      echo "  -t 'exp0 exp2 exp3' "      echo "  -t 'exp0 exp2 exp3' "
46      echo "  -addr='abc@123.com testing@home.org'"      echo "  -addr='abc@123.com testing@home.org'"
47      echo      echo
48        echo "provided that the expression is properly quoted within the current"
49        echo "shell (note the use of single quotes to protect white space)."
50        echo
51      exit 1      exit 1
52  }  }
53    
# Line 89  testoutput_for_prop() Line 97  testoutput_for_prop()
97      fi      fi
98      if [ -r $1/$4/output.txt ]; then      if [ -r $1/$4/output.txt ]; then
99          grep "$2" $1/$4/output.txt | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp1.txt          grep "$2" $1/$4/output.txt | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp1.txt
100          lncnt=`wc -l tmp1.txt | awk '{print $1}' `          lncntA=`wc -l tmp1.txt | awk '{print $1}' `
101          if [ $lncnt -lt 3 ]; then          if [ $lncntA -lt 3 ]; then
102              if [ $verbose -gt 0 ]; then              if [ $verbose -gt 0 ]; then
103                  echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2                  echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2
104              fi              fi
# Line 104  testoutput_for_prop() Line 112  testoutput_for_prop()
112          echo testoutput_for_prop: grep "$2" $1/results/output.txt$5 1>&2          echo testoutput_for_prop: grep "$2" $1/results/output.txt$5 1>&2
113      fi      fi
114      grep "$2" $1/results/output.txt$5 | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp2.txt      grep "$2" $1/results/output.txt$5 | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp2.txt
115      lncnt=`wc -l tmp2.txt | awk '{print $1}' `      lncntB=`wc -l tmp2.txt | awk '{print $1}' `
116      if [ $lncnt -lt 3 ]; then      if [ $lncntB -lt 3 ]; then
117          if [ $verbose -gt 0 ]; then          if [ $verbose -gt 0 ]; then
118              echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2              echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2
119          fi          fi
120          return 99          return 99
121      fi      fi
122        if [ $lncntA -ne $lncntB ]; then
123            if [ $verbose -gt 0 ]; then
124                echo Not same Nb of lines when searching for "$2" ":" $lncntA $lncntB 1>&2
125            fi
126            return 99
127        fi
128        has_nan=`cat tmp1.txt | grep -i nan | wc -l`
129        if [ $has_nan -gt 0  ] ; then
130            echo testoutput_for_prop: output.txt contains $has_nan NaN values  1>&2
131            return 99
132        fi
133        has_inf=`cat tmp1.txt | grep -i inf | wc -l`
134        if [ $has_inf -gt 0  ] ; then
135            echo testoutput_for_prop: output.txt contains $has_inf Inf values  1>&2
136            return 99
137        fi
138      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
139          echo testoutput_for_prop: join tmp1.txt tmp2.txt 1>&2          echo testoutput_for_prop: join tmp1.txt tmp2.txt 1>&2
140      fi      fi
# Line 157  dashnum() Line 181  dashnum()
181    
182  testoutput_ad()  testoutput_ad()
183  {  {
184      grep $3 $1/results_ad/output.txt_adm | awk '{print NR " " $5}' > t05.txt      grep $3 $1/results_ad/output_adm.txt | awk '{print NR " " $5}' > t05.txt
185      grep $3 $1/$2/output.txt_adm | awk '{print NR " " $5}' > t15.txt      grep $3 $1/$2/output_adm.txt | awk '{print NR " " $5}' > t15.txt
186      grep $3 $1/results_ad/output.txt_adm | awk '{print NR " " $6}' > t06.txt      grep $3 $1/results_ad/output_adm.txt | awk '{print NR " " $6}' > t06.txt
187      grep $3 $1/$2/output.txt_adm | awk '{print NR " " $6}' > t16.txt      grep $3 $1/$2/output_adm.txt | awk '{print NR " " $6}' > t16.txt
188      join t05.txt t15.txt > t5.txt      join t05.txt t15.txt > t5.txt
189      join t06.txt t16.txt > t6.txt      join t06.txt t16.txt > t6.txt
190      echo "-1" >> t5.txt      echo "-1" >> t5.txt
# Line 171  testoutput_ad() Line 195  testoutput_ad()
195      rm -f t[01][56].txt t[56].txt      rm -f t[01][56].txt t[56].txt
196  }  }
197    
198    check_for_add_mon_output()
199    {
200        # Check for additional types of monitor output
201        if test "x$1" = x ; then
202            return
203        fi
204    
205        for ii in $PTRACERS_NUM ; do
206            eval "HAVE_PTR0"$ii"=f"
207        done
208    
209        ptr_add="trcstat_ptracerXX_min trcstat_ptracerXX_max"
210        ptr_add="$ptr_add trcstat_ptracerXX_mean trcstat_ptracerXX_sd"
211        for ii in $PTRACERS_NUM ; do
212            for jj in $ptr_add ; do
213                name=`eval "echo $jj | sed -e 's|XX|0"$ii"|g'"`
214                tst=`grep $name $1 | wc -l | awk '{print $1}'`
215                if test ! "x$tst" = x0 ; then
216                    eval "HAVE_PTR0"$ii"=t"
217                fi
218            done
219            #  eval 'echo "HAVE_PTR0'$ii' = $HAVE_PTR0'$ii'"'
220        done
221    }
222    
223  testoutput()  testoutput()
224  {  {
225      # testoutput directory subdir extension      # testoutput directory subdir extension
# Line 200  testoutput() Line 249  testoutput()
249          testoutput_for_prop $1 "dynstat_vvel_max" "V maximum" $2 $3; vmax=$?          testoutput_for_prop $1 "dynstat_vvel_max" "V maximum" $2 $3; vmax=$?
250          testoutput_for_prop $1 "dynstat_vvel_mean" "V mean" $2 $3; vmean=$?          testoutput_for_prop $1 "dynstat_vvel_mean" "V mean" $2 $3; vmean=$?
251          testoutput_for_prop $1 "dynstat_vvel_sd" "V s.d." $2 $3; vsd=$?          testoutput_for_prop $1 "dynstat_vvel_sd" "V s.d." $2 $3; vsd=$?
252          dashnum $cg2dres $tmin $tmax $tmean $tsd $smin $smax $smean $ssd \  
253              $umin $umax $umean $usd $vmin $vmax $vmean $vsd          #  This is for PTRACERS
254            for ii in $PTRACERS_NUM ; do
255                eval `echo "p0"$ii"_min=99"`
256                eval `echo "p0"$ii"_max=99"`
257                eval `echo "p0"$ii"_mean=99"`
258                eval `echo "p0"$ii"_sd=99"`
259                tst=`eval 'echo "$HAVE_PTR0'$ii'"'`
260                #echo 'tst = '$tst
261                if test "x$tst" = xt ; then
262                    a="trcstat_ptracer0"
263                    testoutput_for_prop $1 "$a"$ii"_min"  "p0"$ii"_min"  $2 $3
264                    RETVAL=$? ; eval `echo "p0"$ii"_min="$RETVAL`
265                    testoutput_for_prop $1 "$a"$ii"_max"  "p0"$ii"_max"  $2 $3
266                    RETVAL=$? ; eval `echo "p0"$ii"_max="$RETVAL`
267                    testoutput_for_prop $1 "$a"$ii"_mean" "p0"$ii"_mean" $2 $3
268                    RETVAL=$? ; eval `echo "p0"$ii"_mean="$RETVAL`
269                    testoutput_for_prop $1 "$a"$ii"_sd"   "p0"$ii"_sd"   $2 $3
270                    RETVAL=$? ; eval `echo "p0"$ii"_sd="$RETVAL`
271                fi
272            done
273    
274            allargs="$cg2dres $tmin $tmax $tmean $tsd $smin $smax $smean $ssd"
275            allargs="$allargs $umin $umax $umean $usd $vmin $vmax $vmean $vsd"
276            allargs="$allargs $p01_min $p01_max $p01_mean $p01_sd"
277            allargs="$allargs $p02_min $p02_max $p02_mean $p02_sd"
278            allargs="$allargs $p03_min $p03_max $p03_mean $p03_sd"
279            allargs="$allargs $p04_min $p04_max $p04_mean $p04_sd"
280            allargs="$allargs $p05_min $p05_max $p05_mean $p05_sd"
281    
282            eval "dashnum $allargs"
283    
284      else      else
285          testoutput_ad $1 $2 "precision_grdchk_result"          testoutput_ad $1 $2 "precision_grdchk_result"
286      fi      fi
# Line 225  genmakemodel() Line 304  genmakemodel()
304                  command="$command --mods=../code"                  command="$command --mods=../code"
305              else              else
306                  command="$command --mods=../code_ad"                  command="$command --mods=../code_ad"
                 command="$command -adof=../../../tools/adjoint_options/adjoint_staf"  
307              fi              fi
308              if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then              if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then
309                  command="$command --optfile=$OPTFILE"                  command="$command --optfile=$OPTFILE"
# Line 233  genmakemodel() Line 311  genmakemodel()
311              if test "x$IEEE" != x ; then              if test "x$IEEE" != x ; then
312                  command="$command -ieee"                  command="$command -ieee"
313              fi              fi
314                if test "x$MPI" = xt ; then
315                    command="$command -mpi"
316                fi
317              printf 'genmake ... ' 1>&2              printf 'genmake ... ' 1>&2
318              $command > make.log 2>&1              $command > make.log 2>&1
319              RETVAL=$?              RETVAL=$?
320              #  Reduce the size of the testing emails!              #  Reduce the size of the testing emails!
321              #  cp Makefile $CDIR              head -100 Makefile > $CDIR/Makefile_head
322              if test "x$RETVAL" != x0 ; then              if test "x$RETVAL" != x0 ; then
323                  tail make.log                  tail make.log
324                  echo "genmakemodel: genmake failed" 1>&2                  echo "genmakemodel: genmake failed" 1>&2
# Line 278  makeclean() Line 359  makeclean()
359      fi      fi
360  }  }
361    
362    postclean()
363    {
364        # postclean directory
365        if test "x$POSTCLEAN" = xt ; then
366            (
367                cd $1;
368                if test -r Makefile ; then
369                    $MAKE CLEAN >> /dev/null 2>&1
370                fi
371                exit 0
372            )
373        fi
374    }
375    
376  makedependmodel()  makedependmodel()
377  {  {
378      # makedependmodel directory      # makedependmodel directory
# Line 389  linkdata() Line 484  linkdata()
484              if test "x$ADM" = x ; then              if test "x$ADM" = x ; then
485                  files=`( cd ../input ; ls -1 | grep -v CVS )`                  files=`( cd ../input ; ls -1 | grep -v CVS )`
486                  for i in $files ; do                  for i in $files ; do
487                      if test ! -d "../input/"$i ; then                      if test ! -d "../input/"$i -a ! -f $i ; then
488                          ln -sf "../input/"$i $i                          ln -sf "../input/"$i $i
489                      fi                      fi
490                  done                  done
491              else              else
                 files=`( cd ../input ; ls -1 *.bin | grep -v CVS )`  
                 for i in $files ; do  
                     if test ! -d "../input/"$i ; then  
                         ln -sf "../input/"$i $i  
                     fi  
                 done  
492                  files=`( cd ../input_ad ; ls -1 | grep -v CVS )`                  files=`( cd ../input_ad ; ls -1 | grep -v CVS )`
493                  for i in $files ; do                  for i in $files ; do
494                      if test ! -d "../input_ad/"$i ; then                      if test ! -d "../input_ad/"$i ; then
495                          ln -sf "../input_ad/"$i $i                          ln -sf "../input_ad/"$i $i
496                      fi                      fi
497                  done                  done
498                    if test -d "../input" ; then
499                      files=`( cd ../input ; ls -1 | grep -v CVS )`
500                      for i in $files ; do
501                        if test ! -d "../input/"$i ; then
502                         if test ! -r $i  ; then
503                            ln -sf "../input/"$i $i
504                         fi
505                        fi
506                      done
507                    fi
508              fi              fi
509          )          )
510      fi      fi
# Line 419  runmodel() Line 518  runmodel()
518      #  (where "$COMMAND" is relative to "directory")      #  (where "$COMMAND" is relative to "directory")
519      (      (
520          cd $1          cd $1
521          printf 'runmodel ... ' 1>&2          printf 'runmodel in %s ...' $1 1>&2
522          # make output.txt          # make output.txt
523          echo          echo
524          rm -f run.log          rm -f run.log
525            if test $OUTPUTFILE -ot $EXECUTABLE ; then
526               ( eval $COMMAND ) > run.log 2>&1
527               RETVAL=$?
528            else
529               echo " $OUTPUTFILE is up to date " > run.log 2>&1
530               RETVAL=0
531            fi
532          # echo "COMMAND='$COMMAND'"          # echo "COMMAND='$COMMAND'"
533          # echo "pwd='"`pwd`"'"          # echo "pwd='"`pwd`"'"
         ( eval $COMMAND ) > run.log 2>&1  
         RETVAL=$?  
534          if test "x$RETVAL" = x0 ; then          if test "x$RETVAL" = x0 ; then
535              tail run.log              tail run.log
536              echo successful 1>&2              echo successful 1>&2
# Line 434  runmodel() Line 538  runmodel()
538              # if test "x$ADM" = x ; then              # if test "x$ADM" = x ; then
539              #   cp output.txt $CDIR"/output.txt"              #   cp output.txt $CDIR"/output.txt"
540              # else              # else
541              #   cp output.txt_adm $CDIR"/output.txt_adm"              #   cp output_adm.txt $CDIR"/output_adm.txt"
542              # fi              # fi
543                if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi
544              return 0              return 0
545          else          else
546              tail run.log              tail run.log
547              echo failed 1>&2              echo failed 1>&2
548              cp run.log $CDIR"/run.log"              cp run.log $CDIR"/run.log"
549                if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi
550              return 1              return 1
551          fi          fi
552      )      )
# Line 456  createcodelet() Line 562  createcodelet()
562  #include <math.h>  #include <math.h>
563  int main( int argc, char** argv )  {  int main( int argc, char** argv )  {
564    int linnum,best,lncnt;    int linnum,best,lncnt;
565    double a,b,diff;    double a,b,abave,relerr;
566    best = -16;    best = -22;
567    lncnt = 0;    lncnt = 0;
568    while( 1 & (lncnt+=1) < 999 )  {    while( 1 & (lncnt+=1) < 999 )  {
569      scanf("%d", &linnum);      scanf("%d", &linnum);
570      if (linnum == -1)  break;      if (linnum == -1)  break;
571      scanf("%lf", &a);  scanf("%lf", &b);      scanf("%lf", &a);  scanf("%lf", &b);
572      diff = 0.5*(fabs(a)+fabs(b));      abave = 0.5*(fabs(a)+fabs(b));
573      if (diff > 1.e-12) {      if (abave > 0.0) {
574        diff=fabs(a-b)/diff;        relerr=fabs(a-b)/abave;
575        if (diff > 0.0) {        if (relerr > 0.0) { linnum = (int)rint(log10(relerr)); }
576          linnum = (int)log10(diff);        else { linnum = -16 ; }
577          best = (best > linnum) ? best : linnum;        best = (best > linnum) ? best : linnum;
       }  
       else {  
         if (best == -16 && diff != 0)  best = -22;  
       }  
578      }      }
579    }    }
580    if (lncnt == 999) best=-29;    if (lncnt == 999) best=-29;
# Line 480  int main( int argc, char** argv )  { Line 582  int main( int argc, char** argv )  {
582    return 0;    return 0;
583  }  }
584  EOF  EOF
585      cc -o tmp_cmpnum tmp_cmpnum.c -lm      $CC -o tmp_cmpnum tmp_cmpnum.c -lm
586    
587      if [ -x ./tmp_cmpnum ]; then      if [ -x ./tmp_cmpnum ]; then
588          echo "OK"          echo "OK"
589          return 0          return 0
590      else      else
591          echo          echo
592          echo "ERROR: failed to compile comparison code"          echo "ERROR: failed to compile comparison code -- please specify"
593            echo "  a C compiler using the CC environment variable."
594          exit 1          exit 1
595      fi      fi
596  }  }
# Line 536  EOF Line 639  EOF
639    
640  scandirs()  scandirs()
641  {  {
642      if [ $# -eq 0 ]; then      if [ $# -eq 1 ]; then
643          for arg in * ; do          for arg in * ; do
644              test -d $arg/input && echo $arg              test -d $arg/$1 && echo $arg
645          done          done
646      else      else
647          echo $*          echo $*
648      fi      fi
649  }  }
650    
# Line 567  QUICK=f Line 670  QUICK=f
670  NOGENMAKE=f  NOGENMAKE=f
671  NOCLEAN=f  NOCLEAN=f
672  NODEPEND=f  NODEPEND=f
673    POSTCLEAN=f
674    
675  BASH=  BASH=
676  OPTFILE=NONE  OPTFILE=NONE
# Line 576  MPACKDIR="../tools/mpack-1.6" Line 680  MPACKDIR="../tools/mpack-1.6"
680  HAVE_MPACK=  HAVE_MPACK=
681  MPACK="$MPACKDIR/mpack"  MPACK="$MPACKDIR/mpack"
682  COMMAND=  COMMAND=
683  MAKE=make  if test "x$MAKE" = x ; then
684        MAKE=make
685    fi
686    if test "x$CC" = x ; then
687        CC=cc
688    fi
689  JOBS=  JOBS=
690  MPI=f  MPI=f
691    OUTDIR=
692  DELDIR=  DELDIR=
693    
694  ADM=  ADM=
695    
696    # Additional monitor types
697    PTRACERS_NUM="1 2 3 4 5"
698    
699  printf "parsing options...  "  printf "parsing options...  "
700    
701  ac_prev=  ac_prev=
# Line 632  for ac_option ; do Line 745  for ac_option ; do
745          -make=* | --make=*)          -make=* | --make=*)
746              MAKE=$ac_optarg ;;              MAKE=$ac_optarg ;;
747    
748            -odir | --odir)
749                ac_prev=OUTDIR ;;
750            -odir=* | --odir=*)
751                OUTDIR=$ac_optarg ;;
752    
753            -ptracers | --ptracers | -ptr | --ptr)
754                ac_prev=PTRACERS_NUM ;;
755            -ptracers=* | --ptracers=* | -ptr=* | --ptr=*)
756                PTRACERS_NUM=$ac_optarg ;;
757    
758          -j) ac_prev=JOBS ;;          -j) ac_prev=JOBS ;;
759          -j=*) JOBS=$ac_optarg ;;          -j=*) JOBS=$ac_optarg ;;
760    
761          -clean | --clean)          -clean | --clean)
762              CLEANUP=t ;;              CLEANUP=t ; DELDIR=t ;;
763    
764          -quick | --quick | -q | --q)          -quick | --quick | -q | --q)
765              QUICK=t ;;              QUICK=t ;;
# Line 647  for ac_option ; do Line 770  for ac_option ; do
770          -nodepend | --nodepend | -nd | --nd)          -nodepend | --nodepend | -nd | --nd)
771              NODEPEND=t ;;              NODEPEND=t ;;
772    
773            -postclean | --postclean | -pc | --pc)
774                POSTCLEAN=t ;;
775    
776          -mpi) MPI=t ;;          -mpi) MPI=t ;;
777    
778          -adm | -ad) ADM=t ;;          -adm | -ad) ADM=t ;;
# Line 681  if test "x$QUICK" = xt ; then Line 807  if test "x$QUICK" = xt ; then
807  fi  fi
808    
809  if test "x$TESTDIRS" = x ; then  if test "x$TESTDIRS" = x ; then
810      TESTDIRS=`scandirs`      if test "x$ADM" = xt ; then
811            TESTDIRS=`scandirs results_ad`
812        else
813            TESTDIRS=`scandirs results`
814        fi
815  fi  fi
816    
817  if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM_OF" != x ; then  if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM_OF" != x ; then
818      OPTFILE=$MITGCM_OF      OPTFILE=$MITGCM_OF
819  fi  fi
820    
821    if test "x$ADM" = xt ; then
822        EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"
823        OUTPUTFILE="output_adm.txt"
824    else
825        EXECUTABLE="mitgcmuv"
826        OUTPUTFILE="output.txt"
827    fi
828    
829  if test "x$ADM" = xt -a "x$COMMAND" = x ; then  if test "x$ADM" = xt -a "x$COMMAND" = x ; then
830      COMMAND="./mitgcmuv_ad > output.txt_adm 2>&1"      COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"
831  fi  fi
832    
833  if test "x$COMMAND" = x ; then  if test "x$COMMAND" = x ; then
834      COMMAND="$MAKE output.txt"      COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"
835  fi  fi
836    
837  echo "OK"  #echo "OK"
838    echo "OK (COMMAND= $COMMAND )"
839    
840  #  create the FORTRAN comparison code  #  create the FORTRAN comparison code
841  createcodelet  createcodelet
# Line 713  MACH=`hostname` Line 852  MACH=`hostname`
852  UNAMEA=`uname -a`  UNAMEA=`uname -a`
853  DATE=`date +%Y%m%d`  DATE=`date +%Y%m%d`
854  BASE="tr_"$MACH"_"$DATE"_"  BASE="tr_"$MACH"_"$DATE"_"
855    if test "x$OUTDIR" != x ; then
856        BASE="tr_"$OUTDIR"_"$DATE"_"
857    fi
858  DNUM=0  DNUM=0
859  DRESULTS="$BASE$DNUM"  DRESULTS="$BASE$DNUM"
860  while test -e $DRESULTS ; do  while test -e $DRESULTS ; do
# Line 758  fi Line 900  fi
900  echo  echo
901  echo >> $SUMMARY  echo >> $SUMMARY
902  if test "x$ADM" = x ; then  if test "x$ADM" = x ; then
903      cat << EOF | tee -a $SUMMARY      line_0="            ----T-----  ----S-----  ----U-----  ----V-----"
904                  T           S           U           V      line_1="G D M    c        m  s        m  s        m  s        m  s"
905  G D M    c        m  s        m  s        m  s        m  s      line_2="E p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  ."
906  E p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .      line_3="N n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d"
907  N n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d      line_4="2 d e n  d  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  ."
908  2 d e n  d  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  .      for ii in $PTRACERS_NUM ; do
909            #  tst=`eval 'echo $HAVE_PTR0'$ii`
910  EOF          #  if test "x$tst" = xt ; then
911            line_0="$line_0  --PTR 0"$ii"--"
912            line_1="$line_1        m  s"
913            line_2="$line_2  m  m  e  ."
914            line_3="$line_3  i  a  a  d"
915            line_4="$line_4  n  x  n  ."
916            #  fi
917        done
918        echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY
919        echo "$line_1" | tee -a $SUMMARY
920        echo "$line_2" | tee -a $SUMMARY
921        echo "$line_3" | tee -a $SUMMARY
922        echo "$line_4" | tee -a $SUMMARY
923        echo " "       | tee -a $SUMMARY
924  else  else
925      echo "ADJOINT=true" >> $SUMMARY      echo "ADJOINT=true" >> $SUMMARY
926      echo >> $SUMMARY      echo >> $SUMMARY
# Line 789  for dir in $TESTDIRS ; do Line 944  for dir in $TESTDIRS ; do
944          if test -r $dir/input/Makefile ; then          if test -r $dir/input/Makefile ; then
945              ( cd $dir/input ; make CLEAN )              ( cd $dir/input ; make CLEAN )
946          fi          fi
947            (
948                cd $dir
949                rm -rf tr_run.*
950            )
951          continue          continue
952      fi      fi
953    
# Line 798  for dir in $TESTDIRS ; do Line 957  for dir in $TESTDIRS ; do
957      if test "x$ADM" = x ; then      if test "x$ADM" = x ; then
958          fout=$dir"/results/output.txt"          fout=$dir"/results/output.txt"
959      else      else
960          fout=$dir"/results_ad/output.txt_adm"          fout=$dir"/results_ad/output_adm.txt"
961      fi      fi
962      if test ! -r $fout ; then      if test ! -r $fout ; then
963          echo "can't read \"$fout\" -- skipping $dir"          echo "can't read \"$fout\" -- skipping $dir"
964          continue          continue
965      fi      fi
966        if test "x$ADM" = x ; then
967            check_for_add_mon_output  $fout
968        fi
969    
970        # Check for additional types of monitor output
971    
972      builddir="input"      builddir="input"
973      rundir="input"      rundir="input"
# Line 848  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1012  for dir in $TESTDIRS ; do
1012      echo "Experiment:  $dir"      echo "Experiment:  $dir"
1013      echo      echo
1014      unset genmake makedepend make run      unset genmake makedepend make run
1015      results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'      results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'
1016    
1017      #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir combination      #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir combination
1018      rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir      rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir
# Line 879  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1043  for dir in $TESTDIRS ; do
1043          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
1044          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"
1045    
         OLD_COMMAND=$COMMAND  
         COMMAND="./mitgcmuv > output.txt"  
1046          for ex in $extra_runs ; do          for ex in $extra_runs ; do
1047              test -e "$dir/tr_run.$ex" && rm -rf "$dir/tr_run.$ex"              unset run
1048              mkdir "$dir/tr_run.$ex"              results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'
1049              links=`( cd "$dir/input" > /dev/null 2>&1 ; ls -1 | grep -v CVS )`              #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir.ex combination
1050                rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir"."$ex
1051                mkdir $rel_CDIR
1052                CDIR=`pwd`"/$rel_CDIR"
1053                test ! -e "$dir/tr_run.$ex" && mkdir "$dir/tr_run.$ex"
1054                for ldir in input.$ex input ; do
1055                    (
1056                        cd "$dir/$ldir" > /dev/null 2>&1
1057                        ls -1 2>/dev/null \
1058                            | sed -e 's|^CVS$||g' | sed -e 's|^output.txt$||g'
1059                    ) > tr_exrun_links
1060                    (
1061                        cd "$dir/tr_run.$ex"
1062                        cat ../../tr_exrun_links | while read i ; do
1063                            if test ! "x$i" = x ; then
1064                                test ! -r $i  &&  ln -s "../"$ldir"/"$i $i
1065                            fi
1066                        done
1067                    )
1068                    test -e tr_exrun_links  &&  rm -f tr_exrun_links
1069                done
1070                ldir=build
1071              (              (
1072                  cd "$dir/tr_run.$ex"                  cd $dir/tr_run.$ex
1073                  for i in $links; do                  test ! -e mitgcmuv  &&  ln -s "../"$ldir"/"mitgcmuv .
                     ln -s ../input/$i $i  
                 done  
             )  
             links=`( cd "$dir/input.$ex" > /dev/null 2>&1 ; ls -1 | grep -v CVS )`  
             (  
                 cd "$dir/tr_run.$ex"  
                 for i in $links; do  
                     test -e $i  &&  rm -f $i  
                     ln -s ../input.$ex/$i $i  
                 done  
                 ln -s ../$builddir/mitgcmuv mitgcmuv  
1074              )              )
1075              runmodel $dir/tr_run.$ex && run=Y \              runmodel $dir/tr_run.$ex && run=Y \
1076                  && results=`testoutput $dir tr_run.$ex "."$ex`                  && results=`testoutput $dir tr_run.$ex "."$ex`
# Line 911  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1083  for dir in $TESTDIRS ; do
1083              echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"
1084              echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"
1085              echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
1086              echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "tdir='$dir.$ex'" >> $CDIR"/summary.txt"
1087          done          done
         COMMAND=$OLD_COMMAND  
1088      else      else
1089          fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`          fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`
1090          fres=$fres"$results   $dir"          fres=$fres"$results   $dir"
# Line 924  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1095  for dir in $TESTDIRS ; do
1095          echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"
1096          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
1097          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"
1098            grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/$rundir/$OUTPUTFILE \
1099                               >> $CDIR"/summary.txt"
1100      fi      fi
1101    
1102        postclean $dir/$builddir
1103            
1104      echo "-------------------------------------------------------------------------------"      echo "-------------------------------------------------------------------------------"
1105            
# Line 966  fi Line 1141  fi
1141  rm -f tmp_cmpnum.c tmp_cmpnum  rm -f tmp_cmpnum.c tmp_cmpnum
1142    
1143  if test "x$CLEANUP" != xt ; then  if test "x$CLEANUP" != xt ; then
1144      cat $SUMMARY      cat $SUMMARY | sed 's/ -- -- -- --//g'
1145      if test -e tr_out.txt ; then      if test -e tr_out.txt ; then
1146          mv tr_out.txt tr_out.txt.old          mv tr_out.txt tr_out.txt.old
1147      fi      fi
1148      cat $SUMMARY > tr_out.txt      cat $SUMMARY | sed 's/ -- -- -- --//g' > tr_out.txt
1149  fi  fi
1150    
1151  if test "x$DELDIR" = xt ; then  if test "x$DELDIR" = xt ; then
Legend:
Removed from v.1.46  
changed lines
  Added in v.1.82
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