/[MITgcm]/MITgcm/verification/testreport

Diff of /MITgcm/verification/testreport

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-revision 1.65 by jmc,
Fri Feb  4 14:43:20 2005 UTC
+revision 1.77 by jmc,
Mon Mar 20 21:50:36 2006 UTC
 Line 27 
 usage()
      echo "                             (DEF=\"make output.txt\")"
      echo "  (-m|-make) STRING        command to use for \"make\""
      echo "                             (DEF=\"make\")"
+     echo "  (-odir) STRING           used to build output directory name"
+     echo "                             (DEF=\"hostname\")"
      echo "  (-ptracers|-ptr) STRING  specify which ptracers to test"
      echo "                             (DEF=\"1 2 3 4 5\")"
      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"
-Line 95 
 testoutput_for_prop()
+Line 97 
 testoutput_for_prop()
      fi
      if [ -r $1/$4/output.txt ]; then
          grep "$2" $1/$4/output.txt | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp1.txt
-         lncnt=`wc -l tmp1.txt | awk '{print $1}' `
+         lncntA=`wc -l tmp1.txt | awk '{print $1}' `
-         if [ $lncnt -lt 3 ]; then
+         if [ $lncntA -lt 3 ]; then
              if [ $verbose -gt 0 ]; then
                  echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2
              fi
-Line 110 
 testoutput_for_prop()
+Line 112 
 testoutput_for_prop()
          echo testoutput_for_prop: grep "$2" $1/results/output.txt$5 1>&2
      fi
      grep "$2" $1/results/output.txt$5 | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp2.txt
-     lncnt=`wc -l tmp2.txt | awk '{print $1}' `
+     lncntB=`wc -l tmp2.txt | awk '{print $1}' `
-     if [ $lncnt -lt 3 ]; then
+     if [ $lncntB -lt 3 ]; then
          if [ $verbose -gt 0 ]; then
              echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2
          fi
          return 99
      fi
+     if [ $lncntA -ne $lncntB ]; then
+         if [ $verbose -gt 0 ]; then
+             echo Not same Nb of lines when searching for "$2" ":" $lncntA $lncntB 1>&2
+         fi
+         return 99
+     fi
+     has_nan=`cat tmp1.txt | grep -i nan | wc -l`
+     if [ $has_nan -gt 0  ] ; then
+         echo testoutput_for_prop: output.txt contains $has_nan NaN values  1>&2
+         return 99
+     fi
+     has_inf=`cat tmp1.txt | grep -i inf | wc -l`
+     if [ $has_inf -gt 0  ] ; then
+         echo testoutput_for_prop: output.txt contains $has_inf Inf values  1>&2
+         return 99
+     fi
      if [ $debug -gt 0 ]; then
          echo testoutput_for_prop: join tmp1.txt tmp2.txt 1>&2
      fi
-Line 294 
 genmakemodel()
+Line 312 
 genmakemodel()
              if test "x$IEEE" != x ; then
                  command="$command -ieee"
              fi
+             if test "x$MPI" = xt ; then
+                 command="$command -mpi"
+             fi
              printf 'genmake ... ' 1>&2
              $command > make.log 2>&1
              RETVAL=$?
-Line 339 
 makeclean()
+Line 360 
 makeclean()
      fi
  }
+ postclean()
+ {
+     # postclean directory
+     if test "x$POSTCLEAN" = xt ; then
+         (
+             cd $1;
+             if test -r Makefile ; then
+                 $MAKE CLEAN >> /dev/null 2>&1
+             fi
+             exit 0
+         )
+     fi
+ }
  makedependmodel()
  {
      # makedependmodel directory
-Line 480 
 runmodel()
+Line 515 
 runmodel()
      #  (where "$COMMAND" is relative to "directory")
      (
          cd $1
-         printf 'runmodel ... ' 1>&2
+         printf 'runmodel in %s ...' $1 1>&2
          # make output.txt
          echo
          rm -f run.log
+         if test $OUTPUTFILE -ot $EXECUTABLE ; then
+            ( eval $COMMAND ) > run.log 2>&1
+            RETVAL=$?
+         else
+            echo " $OUTPUTFILE is up to date " > run.log 2>&1
+            RETVAL=0
+         fi
          # echo "COMMAND='$COMMAND'"
          # echo "pwd='"`pwd`"'"
-         ( eval $COMMAND ) > run.log 2>&1
-         RETVAL=$?
          if test "x$RETVAL" = x0 ; then
              tail run.log
              echo successful 1>&2
-Line 627 
 QUICK=f
+Line 667 
 QUICK=f
  NOGENMAKE=f
  NOCLEAN=f
  NODEPEND=f
+ POSTCLEAN=f
  BASH=
  OPTFILE=NONE
-Line 644 
 if test "x$CC" = x ; then
+Line 685 
 if test "x$CC" = x ; then
  fi
  JOBS=
  MPI=f
+ OUTDIR=
  DELDIR=
  ADM=
-Line 700 
 for ac_option ; do
+Line 742 
 for ac_option ; do
          -make=* | --make=*)
              MAKE=$ac_optarg ;;
+         -odir | --odir)
+             ac_prev=OUTDIR ;;
+         -odir=* | --odir=*)
+             OUTDIR=$ac_optarg ;;
          -ptracers | --ptracers | -ptr | --ptr)
              ac_prev=PTRACERS_NUM ;;
          -ptracers=* | --ptracers=* | -ptr=* | --ptr=*)
-Line 709 
 for ac_option ; do
+Line 756 
 for ac_option ; do
          -j=*) JOBS=$ac_optarg ;;
          -clean | --clean)
-             CLEANUP=t ;;
+             CLEANUP=t ; DELDIR=t ;;
          -quick | --quick | -q | --q)
              QUICK=t ;;
-Line 720 
 for ac_option ; do
+Line 767 
 for ac_option ; do
          -nodepend | --nodepend | -nd | --nd)
              NODEPEND=t ;;
+         -postclean | --postclean | -pc | --pc)
+             POSTCLEAN=t ;;
          -mpi) MPI=t ;;
          -adm | -ad) ADM=t ;;
-Line 761 
 if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM
+Line 811 
 if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM
      OPTFILE=$MITGCM_OF
  fi
+ if test "x$ADM" = xt ; then
+     EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"
+     OUTPUTFILE="output.txt_adm"
+ else
+     EXECUTABLE="mitgcmuv"
+     OUTPUTFILE="output.txt"
+ fi
  if test "x$ADM" = xt -a "x$COMMAND" = x ; then
-     COMMAND="./mitgcmuv_ad > output.txt_adm 2>&1"
+     COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"
  fi
  if test "x$COMMAND" = x ; then
-     COMMAND="$MAKE output.txt"
+     COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"
  fi
- echo "OK"
+ #echo "OK"
+ echo "OK (COMMAND= $COMMAND )"
  #  create the FORTRAN comparison code
  createcodelet
-Line 786 
 MACH=`hostname`
+Line 845 
 MACH=`hostname`
  UNAMEA=`uname -a`
  DATE=`date +%Y%m%d`
  BASE="tr_"$MACH"_"$DATE"_"
+ if test "x$OUTDIR" != x ; then
+     BASE="tr_"$OUTDIR"_"$DATE"_"
+ fi
  DNUM=0
  DRESULTS="$BASE$DNUM"
  while test -e $DRESULTS ; do
-Line 943 
 for dir in $TESTDIRS ; do
+Line 1005 
 for dir in $TESTDIRS ; do
      echo "Experiment:  $dir"
      echo
      unset genmake makedepend make run
-     results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'
+     results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'
      #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir combination
      rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir
-Line 975 
 for dir in $TESTDIRS ; do
+Line 1037 
 for dir in $TESTDIRS ; do
          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"
          for ex in $extra_runs ; do
+             unset run
+             results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'
+             #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir.ex combination
+             rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir"."$ex
+             mkdir $rel_CDIR
+             CDIR=`pwd`"/$rel_CDIR"
              test ! -e "$dir/tr_run.$ex" && mkdir "$dir/tr_run.$ex"
              for ldir in input.$ex input ; do
                  (
-Line 994 
 for dir in $TESTDIRS ; do
+Line 1062 
 for dir in $TESTDIRS ; do
              done
              ldir=build
              (
-                 cd "$dir/$ldir" > /dev/null 2>&1
+                 cd $dir/tr_run.$ex
-                 ls -1 Makefile *.[fFhco] mitgcmuv  2>/dev/null \
+                 test ! -e mitgcmuv  &&  ln -s "../"$ldir"/"mitgcmuv .
-                     | sed -e 's|^CVS$||g' | sed -e 's|^output.txt$||g'
-             ) > tr_exrun_links
-             (
-                 cd "$dir/tr_run.$ex"
-                     cat ../../tr_exrun_links | while read i ; do
-                         if test ! "x$i" = x ; then
-                             test ! -r $i  &&  ln -s "../"$ldir"/"$i $i
-                         fi
-                     done
              )
-             test -e tr_exrun_links  &&  rm -f tr_exrun_links
              runmodel $dir/tr_run.$ex && run=Y \
                  && results=`testoutput $dir tr_run.$ex "."$ex`
              fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`
-Line 1018 
 for dir in $TESTDIRS ; do
+Line 1076 
 for dir in $TESTDIRS ; do
              echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"
              echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"
              echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
-             echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"
+             echo "tdir='$dir.$ex'" >> $CDIR"/summary.txt"
          done
      else
          fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`
-Line 1030 
 for dir in $TESTDIRS ; do
+Line 1088 
 for dir in $TESTDIRS ; do
          echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"
          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"
+         grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/$rundir/$OUTPUTFILE \
+                            >> $CDIR"/summary.txt"
      fi
+     postclean $dir/$builddir
      echo "-------------------------------------------------------------------------------"

 Legend:



Removed from v.1.65
 


changed lines


 
Added in v.1.77
 Legend:



Removed from v.1.65
 


changed lines


 
Added in v.1.77
-Removed from v.1.65
+Added in v.1.77

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