/[MITgcm]/MITgcm/verification/testreport
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Diff of /MITgcm/verification/testreport

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revision 1.56 by edhill, Thu Dec 9 16:41:41 2004 UTC revision 1.77 by jmc, Mon Mar 20 21:50:36 2006 UTC
# Line 27  usage() Line 27  usage()
27      echo "                             (DEF=\"make output.txt\")"      echo "                             (DEF=\"make output.txt\")"
28      echo "  (-m|-make) STRING        command to use for \"make\""      echo "  (-m|-make) STRING        command to use for \"make\""
29      echo "                             (DEF=\"make\")"      echo "                             (DEF=\"make\")"
30        echo "  (-odir) STRING           used to build output directory name"
31        echo "                             (DEF=\"hostname\")"
32      echo "  (-ptracers|-ptr) STRING  specify which ptracers to test"      echo "  (-ptracers|-ptr) STRING  specify which ptracers to test"
33      echo "                             (DEF=\"1 2 3 4 5\")"      echo "                             (DEF=\"1 2 3 4 5\")"
34      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"
# Line 95  testoutput_for_prop() Line 97  testoutput_for_prop()
97      fi      fi
98      if [ -r $1/$4/output.txt ]; then      if [ -r $1/$4/output.txt ]; then
99          grep "$2" $1/$4/output.txt | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp1.txt          grep "$2" $1/$4/output.txt | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp1.txt
100          lncnt=`wc -l tmp1.txt | awk '{print $1}' `          lncntA=`wc -l tmp1.txt | awk '{print $1}' `
101          if [ $lncnt -lt 3 ]; then          if [ $lncntA -lt 3 ]; then
102              if [ $verbose -gt 0 ]; then              if [ $verbose -gt 0 ]; then
103                  echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2                  echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2
104              fi              fi
# Line 110  testoutput_for_prop() Line 112  testoutput_for_prop()
112          echo testoutput_for_prop: grep "$2" $1/results/output.txt$5 1>&2          echo testoutput_for_prop: grep "$2" $1/results/output.txt$5 1>&2
113      fi      fi
114      grep "$2" $1/results/output.txt$5 | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp2.txt      grep "$2" $1/results/output.txt$5 | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp2.txt
115      lncnt=`wc -l tmp2.txt | awk '{print $1}' `      lncntB=`wc -l tmp2.txt | awk '{print $1}' `
116      if [ $lncnt -lt 3 ]; then      if [ $lncntB -lt 3 ]; then
117          if [ $verbose -gt 0 ]; then          if [ $verbose -gt 0 ]; then
118              echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2              echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2
119          fi          fi
120          return 99          return 99
121      fi      fi
122        if [ $lncntA -ne $lncntB ]; then
123            if [ $verbose -gt 0 ]; then
124                echo Not same Nb of lines when searching for "$2" ":" $lncntA $lncntB 1>&2
125            fi
126            return 99
127        fi
128        has_nan=`cat tmp1.txt | grep -i nan | wc -l`
129        if [ $has_nan -gt 0  ] ; then
130            echo testoutput_for_prop: output.txt contains $has_nan NaN values  1>&2
131            return 99
132        fi
133        has_inf=`cat tmp1.txt | grep -i inf | wc -l`
134        if [ $has_inf -gt 0  ] ; then
135            echo testoutput_for_prop: output.txt contains $has_inf Inf values  1>&2
136            return 99
137        fi
138      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
139          echo testoutput_for_prop: join tmp1.txt tmp2.txt 1>&2          echo testoutput_for_prop: join tmp1.txt tmp2.txt 1>&2
140      fi      fi
# Line 294  genmakemodel() Line 312  genmakemodel()
312              if test "x$IEEE" != x ; then              if test "x$IEEE" != x ; then
313                  command="$command -ieee"                  command="$command -ieee"
314              fi              fi
315                if test "x$MPI" = xt ; then
316                    command="$command -mpi"
317                fi
318              printf 'genmake ... ' 1>&2              printf 'genmake ... ' 1>&2
319              $command > make.log 2>&1              $command > make.log 2>&1
320              RETVAL=$?              RETVAL=$?
# Line 339  makeclean() Line 360  makeclean()
360      fi      fi
361  }  }
362    
363    postclean()
364    {
365        # postclean directory
366        if test "x$POSTCLEAN" = xt ; then
367            (
368                cd $1;
369                if test -r Makefile ; then
370                    $MAKE CLEAN >> /dev/null 2>&1
371                fi
372                exit 0
373            )
374        fi
375    }
376    
377  makedependmodel()  makedependmodel()
378  {  {
379      # makedependmodel directory      # makedependmodel directory
# Line 450  linkdata() Line 485  linkdata()
485              if test "x$ADM" = x ; then              if test "x$ADM" = x ; then
486                  files=`( cd ../input ; ls -1 | grep -v CVS )`                  files=`( cd ../input ; ls -1 | grep -v CVS )`
487                  for i in $files ; do                  for i in $files ; do
488                      if test ! -d "../input/"$i ; then                      if test ! -d "../input/"$i -a ! -f $i ; then
489                          ln -sf "../input/"$i $i                          ln -sf "../input/"$i $i
490                      fi                      fi
491                  done                  done
# Line 480  runmodel() Line 515  runmodel()
515      #  (where "$COMMAND" is relative to "directory")      #  (where "$COMMAND" is relative to "directory")
516      (      (
517          cd $1          cd $1
518          printf 'runmodel ... ' 1>&2          printf 'runmodel in %s ...' $1 1>&2
519          # make output.txt          # make output.txt
520          echo          echo
521          rm -f run.log          rm -f run.log
522            if test $OUTPUTFILE -ot $EXECUTABLE ; then
523               ( eval $COMMAND ) > run.log 2>&1
524               RETVAL=$?
525            else
526               echo " $OUTPUTFILE is up to date " > run.log 2>&1
527               RETVAL=0
528            fi
529          # echo "COMMAND='$COMMAND'"          # echo "COMMAND='$COMMAND'"
530          # echo "pwd='"`pwd`"'"          # echo "pwd='"`pwd`"'"
         ( eval $COMMAND ) > run.log 2>&1  
         RETVAL=$?  
531          if test "x$RETVAL" = x0 ; then          if test "x$RETVAL" = x0 ; then
532              tail run.log              tail run.log
533              echo successful 1>&2              echo successful 1>&2
# Line 520  createcodelet() Line 560  createcodelet()
560  int main( int argc, char** argv )  {  int main( int argc, char** argv )  {
561    int linnum,best,lncnt;    int linnum,best,lncnt;
562    double a,b,abave,relerr;    double a,b,abave,relerr;
563    best = -16;    best = -22;
564    lncnt = 0;    lncnt = 0;
565    while( 1 & (lncnt+=1) < 999 )  {    while( 1 & (lncnt+=1) < 999 )  {
566      scanf("%d", &linnum);      scanf("%d", &linnum);
# Line 529  int main( int argc, char** argv )  { Line 569  int main( int argc, char** argv )  {
569      abave = 0.5*(fabs(a)+fabs(b));      abave = 0.5*(fabs(a)+fabs(b));
570      if (abave > 0.0) {      if (abave > 0.0) {
571        relerr=fabs(a-b)/abave;        relerr=fabs(a-b)/abave;
572        if (relerr > 0.0) {        if (relerr > 0.0) { linnum = (int)rint(log10(relerr)); }
573          linnum = (int)log10(relerr);        else { linnum = -16 ; }
574          best = (best > linnum) ? best : linnum;        best = (best > linnum) ? best : linnum;
       }  
     }  
     else {  
       if (best == -16)  best = -22;  
575      }      }
576    }    }
577    if (lncnt == 999) best=-29;    if (lncnt == 999) best=-29;
# Line 543  int main( int argc, char** argv )  { Line 579  int main( int argc, char** argv )  {
579    return 0;    return 0;
580  }  }
581  EOF  EOF
582      cc -o tmp_cmpnum tmp_cmpnum.c -lm      $CC -o tmp_cmpnum tmp_cmpnum.c -lm
583    
584      if [ -x ./tmp_cmpnum ]; then      if [ -x ./tmp_cmpnum ]; then
585          echo "OK"          echo "OK"
586          return 0          return 0
587      else      else
588          echo          echo
589          echo "ERROR: failed to compile comparison code"          echo "ERROR: failed to compile comparison code -- please specify"
590            echo "  a C compiler using the CC environment variable."
591          exit 1          exit 1
592      fi      fi
593  }  }
# Line 630  QUICK=f Line 667  QUICK=f
667  NOGENMAKE=f  NOGENMAKE=f
668  NOCLEAN=f  NOCLEAN=f
669  NODEPEND=f  NODEPEND=f
670    POSTCLEAN=f
671    
672  BASH=  BASH=
673  OPTFILE=NONE  OPTFILE=NONE
# Line 639  MPACKDIR="../tools/mpack-1.6" Line 677  MPACKDIR="../tools/mpack-1.6"
677  HAVE_MPACK=  HAVE_MPACK=
678  MPACK="$MPACKDIR/mpack"  MPACK="$MPACKDIR/mpack"
679  COMMAND=  COMMAND=
680  MAKE=make  if test "x$MAKE" = x ; then
681        MAKE=make
682    fi
683    if test "x$CC" = x ; then
684        CC=cc
685    fi
686  JOBS=  JOBS=
687  MPI=f  MPI=f
688    OUTDIR=
689  DELDIR=  DELDIR=
690    
691  ADM=  ADM=
# Line 698  for ac_option ; do Line 742  for ac_option ; do
742          -make=* | --make=*)          -make=* | --make=*)
743              MAKE=$ac_optarg ;;              MAKE=$ac_optarg ;;
744    
745            -odir | --odir)
746                ac_prev=OUTDIR ;;
747            -odir=* | --odir=*)
748                OUTDIR=$ac_optarg ;;
749    
750          -ptracers | --ptracers | -ptr | --ptr)          -ptracers | --ptracers | -ptr | --ptr)
751              ac_prev=PTRACERS_NUM ;;              ac_prev=PTRACERS_NUM ;;
752          -ptracers=* | --ptracers=* | -ptr=* | --ptr=*)          -ptracers=* | --ptracers=* | -ptr=* | --ptr=*)
# Line 707  for ac_option ; do Line 756  for ac_option ; do
756          -j=*) JOBS=$ac_optarg ;;          -j=*) JOBS=$ac_optarg ;;
757    
758          -clean | --clean)          -clean | --clean)
759              CLEANUP=t ;;              CLEANUP=t ; DELDIR=t ;;
760    
761          -quick | --quick | -q | --q)          -quick | --quick | -q | --q)
762              QUICK=t ;;              QUICK=t ;;
# Line 718  for ac_option ; do Line 767  for ac_option ; do
767          -nodepend | --nodepend | -nd | --nd)          -nodepend | --nodepend | -nd | --nd)
768              NODEPEND=t ;;              NODEPEND=t ;;
769    
770            -postclean | --postclean | -pc | --pc)
771                POSTCLEAN=t ;;
772    
773          -mpi) MPI=t ;;          -mpi) MPI=t ;;
774    
775          -adm | -ad) ADM=t ;;          -adm | -ad) ADM=t ;;
# Line 759  if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM Line 811  if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM
811      OPTFILE=$MITGCM_OF      OPTFILE=$MITGCM_OF
812  fi  fi
813    
814    if test "x$ADM" = xt ; then
815        EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"
816        OUTPUTFILE="output.txt_adm"
817    else
818        EXECUTABLE="mitgcmuv"
819        OUTPUTFILE="output.txt"
820    fi
821    
822  if test "x$ADM" = xt -a "x$COMMAND" = x ; then  if test "x$ADM" = xt -a "x$COMMAND" = x ; then
823      COMMAND="./mitgcmuv_ad > output.txt_adm 2>&1"      COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"
824  fi  fi
825    
826  if test "x$COMMAND" = x ; then  if test "x$COMMAND" = x ; then
827      COMMAND="$MAKE output.txt"      COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"
828  fi  fi
829    
830  echo "OK"  #echo "OK"
831    echo "OK (COMMAND= $COMMAND )"
832    
833  #  create the FORTRAN comparison code  #  create the FORTRAN comparison code
834  createcodelet  createcodelet
# Line 784  MACH=`hostname` Line 845  MACH=`hostname`
845  UNAMEA=`uname -a`  UNAMEA=`uname -a`
846  DATE=`date +%Y%m%d`  DATE=`date +%Y%m%d`
847  BASE="tr_"$MACH"_"$DATE"_"  BASE="tr_"$MACH"_"$DATE"_"
848    if test "x$OUTDIR" != x ; then
849        BASE="tr_"$OUTDIR"_"$DATE"_"
850    fi
851  DNUM=0  DNUM=0
852  DRESULTS="$BASE$DNUM"  DRESULTS="$BASE$DNUM"
853  while test -e $DRESULTS ; do  while test -e $DRESULTS ; do
# Line 873  for dir in $TESTDIRS ; do Line 937  for dir in $TESTDIRS ; do
937          if test -r $dir/input/Makefile ; then          if test -r $dir/input/Makefile ; then
938              ( cd $dir/input ; make CLEAN )              ( cd $dir/input ; make CLEAN )
939          fi          fi
940            (
941                cd $dir
942                rm -rf tr_run.*
943            )
944          continue          continue
945      fi      fi
946    
# Line 937  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1005  for dir in $TESTDIRS ; do
1005      echo "Experiment:  $dir"      echo "Experiment:  $dir"
1006      echo      echo
1007      unset genmake makedepend make run      unset genmake makedepend make run
1008      results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'      results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'
1009    
1010      #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir combination      #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir combination
1011      rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir      rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir
# Line 969  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1037  for dir in $TESTDIRS ; do
1037          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"
1038    
1039          for ex in $extra_runs ; do          for ex in $extra_runs ; do
1040              test -e "$dir/tr_run.$ex" && rm -rf "$dir/tr_run.$ex"              unset run
1041              mkdir "$dir/tr_run.$ex"              results='-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --'
1042              links=`( cd "$dir/input" > /dev/null 2>&1 ; ls -1 | grep -v CVS )`              #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir.ex combination
1043                rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir"."$ex
1044                mkdir $rel_CDIR
1045                CDIR=`pwd`"/$rel_CDIR"
1046                test ! -e "$dir/tr_run.$ex" && mkdir "$dir/tr_run.$ex"
1047                for ldir in input.$ex input ; do
1048                    (
1049                        cd "$dir/$ldir" > /dev/null 2>&1
1050                        ls -1 2>/dev/null \
1051                            | sed -e 's|^CVS$||g' | sed -e 's|^output.txt$||g'
1052                    ) > tr_exrun_links
1053                    (
1054                        cd "$dir/tr_run.$ex"
1055                        cat ../../tr_exrun_links | while read i ; do
1056                            if test ! "x$i" = x ; then
1057                                test ! -r $i  &&  ln -s "../"$ldir"/"$i $i
1058                            fi
1059                        done
1060                    )
1061                    test -e tr_exrun_links  &&  rm -f tr_exrun_links
1062                done
1063                ldir=build
1064              (              (
1065                  cd "$dir/tr_run.$ex"                  cd $dir/tr_run.$ex
1066                  for i in $links; do                  test ! -e mitgcmuv  &&  ln -s "../"$ldir"/"mitgcmuv .
                     ln -s ../input/$i $i  
                 done  
             )  
             links=`( cd "$dir/input.$ex" > /dev/null 2>&1 ; ls -1 | grep -v CVS )`  
             (  
                 cd "$dir/tr_run.$ex"  
                 for i in $links; do  
                     test -e $i  &&  rm -f $i  
                     ln -s ../input.$ex/$i $i  
                 done  
                 ln -s ../$builddir/mitgcmuv mitgcmuv  
1067              )              )
1068              runmodel $dir/tr_run.$ex && run=Y \              runmodel $dir/tr_run.$ex && run=Y \
1069                  && results=`testoutput $dir tr_run.$ex "."$ex`                  && results=`testoutput $dir tr_run.$ex "."$ex`
# Line 998  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1076  for dir in $TESTDIRS ; do
1076              echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"
1077              echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"
1078              echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
1079              echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"              echo "tdir='$dir.$ex'" >> $CDIR"/summary.txt"
1080          done          done
1081      else      else
1082          fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`          fres=`printf '%s %s %s %s' ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N}`
# Line 1010  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1088  for dir in $TESTDIRS ; do
1088          echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"
1089          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"
1090          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"          echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"
1091            grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/$rundir/$OUTPUTFILE \
1092                               >> $CDIR"/summary.txt"
1093      fi      fi
1094    
1095        postclean $dir/$builddir
1096            
1097      echo "-------------------------------------------------------------------------------"      echo "-------------------------------------------------------------------------------"
1098            
# Line 1052  fi Line 1134  fi
1134  rm -f tmp_cmpnum.c tmp_cmpnum  rm -f tmp_cmpnum.c tmp_cmpnum
1135    
1136  if test "x$CLEANUP" != xt ; then  if test "x$CLEANUP" != xt ; then
1137      cat $SUMMARY      cat $SUMMARY | sed 's/ -- -- -- --//g'
1138      if test -e tr_out.txt ; then      if test -e tr_out.txt ; then
1139          mv tr_out.txt tr_out.txt.old          mv tr_out.txt tr_out.txt.old
1140      fi      fi
1141      cat $SUMMARY > tr_out.txt      cat $SUMMARY | sed 's/ -- -- -- --//g' > tr_out.txt
1142  fi  fi
1143    
1144  if test "x$DELDIR" = xt ; then  if test "x$DELDIR" = xt ; then

Legend:
Removed from v.1.56  
changed lines
  Added in v.1.77

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