/[MITgcm]/MITgcm/verification/testreport
ViewVC logotype

Diff of /MITgcm/verification/testreport

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Revision Graph Revision Graph | View Patch Patch

revision 1.166 by jmc, Fri Aug 19 22:24:26 2011 UTC revision 1.208 by jmc, Fri May 20 19:34:38 2016 UTC
# Line 11  usage() Line 11  usage()
11      echo      echo
12      echo "where possible OPTIONS are:"      echo "where possible OPTIONS are:"
13      echo "  (-help|-h)               print usage"      echo "  (-help|-h)               print usage"
14        echo " ---- type of test : ----"
15        echo "  (-tlm)                   perform a Tangent Linear run"
16        echo "  (-adm|-ad)               perform an adjoint run"
17        echo "  (-oad)                   perform an OpenAD adjoint run"
18      echo "  (-mth)                   run multi-threaded (using eedata.mth)"      echo "  (-mth)                   run multi-threaded (using eedata.mth)"
19      echo "  (-mpi)                   use MPI to compile and run on 2 processors"      echo "  (-mpi)                   use MPI to compile and run on 2 processors"
20      echo "  (-MPI)  NUMBER           use MPI to compile and run on max NUMBER procs"      echo "  (-MPI)  NUMBER           use MPI to compile and run on max NUMBER procs"
21      echo "  (-mfile|-mf) STRING      MPI: file with list of possible machines to run on"      echo "  (-mfile|-mf) STRING      MPI: file with list of possible machines to run on"
22        echo "  (-command|-c) STRING     command to run (e.g., if non-standard MPI setting)"
23        echo "                            DEF='mitgcmuv' or ='mpirun -np TR_NPROC mitgcmuv'"
24        echo " ---- testing options : ----"
25        echo "  (-optfile|-of) STRING    optfile to use"
26      echo "  (-fast)                  use optfile default for compiler flags (no '-ieee')"      echo "  (-fast)                  use optfile default for compiler flags (no '-ieee')"
27      echo "                            DEF=off => use IEEE numerics option (if available)"      echo "                            DEF=off => use IEEE numerics option (if available)"
28      echo "  (-devel)                 use optfile developement flags (if available)"      echo "  (-devel)                 use optfile developement flags (if available)"
29      echo "  (-gsl)                   compile with \"-gsl\" flag"      echo "  (-gsl)                   compile with \"-gsl\" flag"
30      echo "  (-use_r4|-ur4)           if allowed, use real*4 type for '_RS' variable"      echo "  (-use_r4|-ur4)           if allowed, use real*4 type for '_RS' variable"
     echo "  (-optfile|-of) STRING    list of optfiles to use"  
     echo "  (-addr|-a) STRING        list of email recipients"  
     echo "                             (DEF=\"\" no email is sent)"  
     echo "  (-mpackdir|-mpd) DIR     location of the mpack utility"  
     echo "                             (DEF=\"../tools/mpack-1.6\")"  
31      echo "  (-tdir|-t) STRING        list of group and/or exp. dirs to test"      echo "  (-tdir|-t) STRING        list of group and/or exp. dirs to test"
32      echo "                             (recognized groups: basic, tutorials)"      echo "                             (recognized groups: basic, tutorials)"
33      echo "                             (DEF=\"\" which test all)"      echo "                             (DEF=\"\" which test all)"
# Line 32  usage() Line 35  usage()
35      echo "                              test THIS_EXP + all the following)"      echo "                              test THIS_EXP + all the following)"
36      echo "  (-skipdir|-skd) STRING   list of exp. dirs to skip"      echo "  (-skipdir|-skd) STRING   list of exp. dirs to skip"
37      echo "                             (DEF=\"\" which test all)"      echo "                             (DEF=\"\" which test all)"
38      echo "  (-bash|-b) STRING        preferred location of a \"bash\" or"      echo "  (-ts)                    provide timing information per timestep"
39      echo "                             Bourne-compatible \"sh\" shell"      echo "  (-papis)                 provide MFlop/s per timestep using PAPI"
40        echo "  (-pcls)                  provide MFlop/s per timestep using PCL"
41        echo " ---- system options : ----"
42        echo "  (-bash|-b) STRING        preferred location of a \"bash\" or \"sh\" shell"
43      echo "                             (DEF=\"\" for \"bash\")"      echo "                             (DEF=\"\" for \"bash\")"
44      echo "  (-adm|-ad)               perform an adjoint run"      echo "  (-ef) STRING             used as genmake2 \"-extra_flag\" argument"
45      echo "  (-oad)                   perform an OpenAD adjoint run"      echo "  (-ncad)                  use genmake2 option \"-nocat4ad\" (-ncad)"
46      echo "  (-command|-c) STRING     command to run"      echo "  (-small_f)               make target small_f before making target all"
47      echo "  (-makedepend|-md) STRING command to use for \"makedepend\""      echo "  (-makedepend|-md) STRING command to use for \"makedepend\""
48      echo "  (-make|-m) STRING        command to use for \"make\""      echo "  (-make|-m) STRING        command to use for \"make\""
49      echo "                             (DEF=\"make\")"      echo "                             (DEF=\"make\")"
50      echo "  (-odir) STRING           used to build output directory name"      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"
51      echo "                             (DEF=\"hostname\")"      echo " ---- output options : ----"
 #   echo "  (-ptracers|-ptr) STRING  specify which ptracers to test"  
 #   echo "                             (DEF=\"1 2 3 4 5\")"  
52      echo "  (-match) NUMBER          Matching Criteria (number of digits)"      echo "  (-match) NUMBER          Matching Criteria (number of digits)"
53      echo "                             (DEF=\"$MATCH_CRIT\")"      echo "                             (DEF=\"$MATCH_CRIT\")"
54      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"      echo "  (-odir) STRING           used to build output directory name"
55      echo "  (-ef) STRING             used as genmake2 \"-extra_flag\" argument"      echo "                             (DEF=\"hostname\")"
56        echo "  (-addr|-a) STRING        list of email recipients"
57        echo "                             (DEF=\"\" no email is sent)"
58        echo "  (-send)       STRING     sending command (instead of using mpack)"
59        echo "  (-savdir|-sd) STRING     location to save output tar file to send (DEF='$SAVDIR')"
60        echo "  (-mpackdir|-mpd) DIR     location of the mpack utility"
61        echo "                             (DEF=\"../tools/mpack-1.6\")"
62        echo " -- do only some parts: --"
63      echo "  (-clean)                 *ONLY* run \"make CLEAN\" & clean run-dir"      echo "  (-clean)                 *ONLY* run \"make CLEAN\" & clean run-dir"
64      echo "  (-norun|-nr)             skip the \"runmodel\" stage (stop after make)"      echo "  (-norun|-nr)             skip the \"runmodel\" stage (stop after make)"
65      echo "  (-obj)                   only produces objects (=norun & no executable)"      echo "  (-obj)                   only produces objects (=norun & no executable)"
# Line 60  usage() Line 71  usage()
71      echo "  (-postclean|-pc)         after each exp. test, clean build-dir & run-dir"      echo "  (-postclean|-pc)         after each exp. test, clean build-dir & run-dir"
72      echo "  (-deloutp|-do)           delete output files after successful run"      echo "  (-deloutp|-do)           delete output files after successful run"
73      echo "  (-deldir|-dd)            on success, delete the output directory"      echo "  (-deldir|-dd)            on success, delete the output directory"
     echo "  (-ts)                    provide timing information per timestep"  
     echo "  (-papis)                 provide MFlop/s per timestep using PAPI"  
     echo "  (-pcls)                  provide MFlop/s per timestep using PCL"  
74      echo      echo
75      echo "and where STRING can be a whitespace-delimited list"      echo "and where STRING can be a whitespace-delimited list"
76      echo "such as:"      echo "such as:"
# Line 117  testoutput_var() Line 125  testoutput_var()
125      # testoutput_var dir s1 label subdir reference_output      # testoutput_var dir s1 label subdir reference_output
126      #      #
127      #  compares 1 variable output selected from file $dir/$subdir/$OUTPUTFILE      #  compares 1 variable output selected from file $dir/$subdir/$OUTPUTFILE
128      #     with same output from reference file $dir/results/$reference_output      #     with same output from reference file $dir/$reference_output
129      #  using search strings s1 and text label      #  using search strings s1 and text label
130    
131      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
132          echo testoutput_var: grep "$2" $1/$4/$OUTPUTFILE 1>&2          echo testoutput_var: grep "$2" $1/$4/$OUTPUTFILE 1>&2
133      fi      fi
134      if [ -r $1/$4/$OUTPUTFILE ]; then      if [ -r $1/$4/$OUTPUTFILE ]; then
135          grep "$2" $1/$4/$OUTPUTFILE | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp1.txt          grep "$2" $1/$4/$OUTPUTFILE | sed 's/.*=//' | nl > ${TMP}a.txt
136          lncntA=`wc -l tmp1.txt | awk '{print $1}' `          lncntA=`wc -l ${TMP}a.txt | awk '{print $1}' `
137          if [ $lncntA -lt 2 ]; then          if [ $lncntA -lt 2 ]; then
138              if [ $verbose -gt 0 ]; then              if [ $verbose -gt 0 ]; then
139                  echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2                  echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2
140              fi              fi
141              return 99              rm -f ${TMP}a.txt ; return 99
142          fi          fi
143      else      else
144          echo testoutput_var: $OUTPUTFILE from model run was not readable 1>&2          echo testoutput_var: $OUTPUTFILE from model run was not readable 1>&2
145          return 99          return 99
146      fi      fi
147      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
148          echo testoutput_var: grep "$2" $1/results/$5 1>&2          echo testoutput_var: grep "$2" $1/$5 1>&2
149      fi      fi
150      grep "$2" $1/results/$5 | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp2.txt      grep "$2" $1/$5 | sed 's/.*=//' | nl > ${TMP}b.txt
151      lncntB=`wc -l tmp2.txt | awk '{print $1}' `      lncntB=`wc -l ${TMP}b.txt | awk '{print $1}' `
152      if [ $lncntB -lt 2 ]; then      if [ $lncntB -lt 2 ]; then
153          if [ $verbose -gt 0 ]; then          if [ $verbose -gt 0 ]; then
154              echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2              echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2
155          fi          fi
156          return 99          rm -f ${TMP}a.txt ${TMP}b.txt ; return 99
157      fi      fi
158      if [ $lncntA -ne $lncntB ]; then      if [ $lncntA -ne $lncntB ]; then
159          if [ $verbose -gt 0 ]; then          if [ $verbose -gt 0 ]; then
160              echo Not same Nb of lines when searching for "$2" ":" $lncntA $lncntB 1>&2              echo Not same Nb of lines when searching for "$2" ":" $lncntA $lncntB 1>&2
161          fi          fi
162          return 99          rm -f ${TMP}a.txt ${TMP}b.txt ; return 99
163      fi      fi
164      has_nan=`cat tmp1.txt | grep -i nan | wc -l`      has_nan=`cat ${TMP}a.txt | grep -i nan | wc -l`
165      if [ $has_nan -gt 0  ] ; then      if [ $has_nan -gt 0  ] ; then
166          echo testoutput_var: $OUTPUTFILE contains $has_nan NaN values  1>&2          echo testoutput_var: $OUTPUTFILE contains $has_nan NaN values  1>&2
167          return 99          rm -f ${TMP}a.txt ${TMP}b.txt ; return 99
168      fi      fi
169      has_inf=`cat tmp1.txt | grep -i inf | wc -l`      has_inf=`cat ${TMP}a.txt | grep -i inf | wc -l`
170      if [ $has_inf -gt 0  ] ; then      if [ $has_inf -gt 0  ] ; then
171          echo testoutput_var: $OUTPUTFILE contains $has_inf Inf values  1>&2          echo testoutput_var: $OUTPUTFILE contains $has_inf Inf values  1>&2
172          return 99          rm -f ${TMP}a.txt ${TMP}b.txt ; return 99
173      fi      fi
174      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
175          echo testoutput_var: join tmp1.txt tmp2.txt 1>&2          echo testoutput_var: join ${TMP}a.txt ${TMP}b.txt 1>&2
176      fi      fi
177      join tmp1.txt tmp2.txt | awk '{print $1 " " $2 " " $3}' > tmp3.txt      # On the SGI O3K (*not* the O2K), "cat -n" inserts a ":" after the line number
178        join ${TMP}a.txt ${TMP}b.txt | awk '{print $1 " " $2 " " $3}' | sed -e 's|:||g' > ${TMP}c.txt
179      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
180          echo testoutput_var: compare_lines 1>&2          echo testoutput_var: compare_lines 1>&2
181      fi      fi
182      if [ $verbose -gt 1 ]; then      if [ $verbose -gt 1 ]; then
183          cat tmp3.txt 1>&2          cat ${TMP}c.txt 1>&2
184      fi      fi
185      echo "-1" >> tmp3.txt      echo "-1" >> ${TMP}c.txt
186      # On the SGI O3K (*not* the O2K), "cat -n" inserts a ":" after the line number      digits_of_similarity=`./tr_cmpnum < ${TMP}c.txt`
     cat tmp3.txt | sed -e 's|:||g' > tmp4.txt  
     digits_of_similarity=`./tr_cmpnum < tmp4.txt`  
187      if [ $digits_of_similarity -eq 99 ]; then      if [ $digits_of_similarity -eq 99 ]; then
188          if [ $verbose -gt 0 ]; then          if [ $verbose -gt 0 ]; then
189              echo testoutput_var: No comparison was available for \"$3\" 1>&2              echo testoutput_var: No comparison was available for \"$3\" 1>&2
# Line 187  testoutput_var() Line 194  testoutput_var()
194              echo There were $digits_of_similarity decimal places of similarity for \"$3\" 1>&2              echo There were $digits_of_similarity decimal places of similarity for \"$3\" 1>&2
195          fi          fi
196      fi      fi
197      rm -f tmp1.txt tmp2.txt tmp3.txt tmp4.txt      rm -f ${TMP}a.txt ${TMP}b.txt ${TMP}c.txt
198    
199      return $digits_of_similarity      return $digits_of_similarity
200  }  }
# Line 198  testoutput_run() Line 205  testoutput_run()
205      #      #
206      #  test output from 1 run in "directory"      #  test output from 1 run in "directory"
207  # --> same processing for adjoint & forward test  # --> same processing for adjoint & forward test
208          # default list of output variables to be checked:          # default list of output variables to be checked:
209          #  1rst : main variable used to decide if it pass or FAIL          #  1rst : main variable used to decide if it pass or FAIL
210          #  others : number of matching digits to be printed in summary.txt          #  others : number of matching digits to be printed in summary.txt
211          listChk=$DEF_CHECK_LIST          listChk=$DEF_CHECK_LIST
212          #  load experiment-specific list from file "tr_checklist" (if it exist)          #  load experiment-specific list from file "tr_checklist" (if it exist)
213          if test -r $1/$2/tr_checklist ; then listChk=`cat $1/$2/tr_checklist` ; fi          if test -r $1/$2/tr_checklist ; then listChk=`cat $1/$2/tr_checklist` ; fi
214          sVar=`echo $listChk | awk '{print $1}'`          sVar=`echo $listChk | awk '{print $1}'`
215          # remove 1rst var and expand the list: + => min max mean s.d          # remove 1rst var and expand the list: + => min max mean s.d
216          listVar=`echo $listChk | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' \          listVar=`echo $listChk | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' \
217                                 | sed 's/+//g' | sed "s/^$sVar//"`                                 | sed 's/+//g' | sed "s/^$sVar//"`
218          if [ $debug -gt 0 ]; then echo "testoutput_run: listVar(I)='$listVar'" 1>&2 ; fi          if [ $debug -gt 0 ]; then echo "testoutput_run: listVar(I)='$listVar'" 1>&2 ; fi
219          # check for ptracer output in reference_output file :          # set ref.outp file-name and, if compressed, uncompress it into subdir
220          outpref=$1/results/$3          refoutp=results/$3
221          ptr_mon="trcstat_ptracerXX_min trcstat_ptracerXX_max"          if test ! -r $1/results/$3 ; then
222          ptr_mon="$ptr_mon trcstat_ptracerXX_mean trcstat_ptracerXX_sd"            if test -r $1/results/${3}.gz ; then
223          for ii in $PTRACERS_NUM ; do              tmpNam1=$3
224                tmpNam2=`echo $tmpNam1 | sed 's/\..*\././'`
225                if test "x$tmpNam1" = "x$tmpNam2" ; then
226                    tmpNam1=`echo $tmpNam2 | sed 's/\./.std./'`
227                fi
228                refoutp=$2/$tmpNam1
229                if [ $debug -gt 0 ]; then
230                    echo "testoutput_run: gunzip 'results/$3.gz' into '$refoutp'" 1>&2
231                fi
232                gzip -cd $1/results/${3}.gz > $1/$refoutp
233              else
234                echo "missing reference output file '$3' (.gz) in '$1/results/'"
235              fi
236            fi
237            # check for ptracer output in reference_output file :
238            if test $KIND = 0 ; then
239              ptr_mon="trcstat_ptracerXX_min trcstat_ptracerXX_max"
240              ptr_mon="$ptr_mon trcstat_ptracerXX_mean trcstat_ptracerXX_sd"
241              for ii in $PTRACERS_NUM ; do
242              ptrfound=0              ptrfound=0
243              for jj in $ptr_mon ; do              for jj in $ptr_mon ; do
244                  name=`eval "echo $jj | sed -e 's|XX|0"$ii"|g'"`                  name=`eval "echo $jj | sed -e 's|XX|0"$ii"|g'"`
245                  tst=`grep $name $outpref | wc -l | awk '{print $1}'`                  tst=`grep $name $1/$refoutp | wc -l | awk '{print $1}'`
246                  if test ! "x$tst" = x0 ; then ptrfound=1 ; fi                  if test ! "x$tst" = x0 ; then ptrfound=1 ; fi
247              done              done
248              if test $ptrfound = '1' ; then              if test $ptrfound = '1' ; then
249                  eval "HAVE_PTR0"$ii"=t"                  eval "HAVE_PTR0"$ii"=t"
250              else              else
251                  eval "HAVE_PTR0"$ii"=f"                  eval "HAVE_PTR0"$ii"=f"
               if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; then  
252                # remove this ptr from the list of output variable to check                # remove this ptr from the list of output variable to check
253                # echo "-- ptr test=" $tst "number of var=" `echo $listVar | awk '{print NF}'` 1>&2                # echo "-- ptr test=" $tst "number of var=" `echo $listVar | awk '{print NF}'` 1>&2
254                  listVar=`echo "$listVar" | sed "s/ pt$ii..//g"`                  listVar=`echo "$listVar" | sed "s/ pt$ii..//g"`
               fi  
255              fi              fi
256          #   eval 'echo "HAVE_PTR0'$ii' = $HAVE_PTR0'$ii'"' 1>&2            # eval 'echo "HAVE_PTR0'$ii' = $HAVE_PTR0'$ii'"' 1>&2
257          done            done
258          tst=`echo $sVar $listVar | awk '{ for(i=2;i<=NF;i++){if($i==$1)t+=1}; print t }'`          fi
259          if test $tst != 1 ; then          tst=`echo $sVar $listVar | awk '{ for(i=2;i<=NF;i++){if($i==$1)t+=1}; print t }'`
260            if test $tst = 0 ; then echo "==> WARNING: selected var >$sVar< not found" 1>&2          if test $tst != 1 ; then
261                   else echo "==> WARNING: found selected var >$sVar< $tst times" 1>&2 ; fi            if test $tst = 0 ; then echo "==> WARNING: selected var >$sVar< not found" 1>&2
262            echo "==> WARNING: in checked list:" $listVar 1>&2                   else echo "==> WARNING: found selected var >$sVar< $tst times" 1>&2 ; fi
263          #- put it back once:            echo "==> WARNING: in checked list:" $listVar 1>&2
264            listVar=" $sVar "`echo "$listVar " | sed "s/ $sVar / /g"`          #- put it back once:
265          fi            listVar=" $sVar "`echo "$listVar " | sed "s/ $sVar / /g"`
266            fi
267          if [ $debug -gt 0 ]; then echo "testoutput_run: listVar(M)='$listVar'" 1>&2 ; fi          if [ $debug -gt 0 ]; then echo "testoutput_run: listVar(M)='$listVar'" 1>&2 ; fi
268          echo "listVar='$listVar'" >> $locDIR"/summary.txt"          echo "listVar='$listVar'" >> $locDIR"/summary.txt"
269          #---          #---
270          allargs=""          allargs=""
271          for xx in $listVar          for xx in $listVar
272          do          do
273            case $xx in           #ii=`echo $xx | sed 's/^pt[0-9][0-9]*..$/XXX/'`        #- any ptr number
274              ii=`echo $xx | sed 's/^pt[1-9]..$/XXX/'`              #- 1 to 9 ptr number
275              if test $ii != 'XXX' ; then
276              #- all except ptracer stats:
277                case $xx in
278             'PS')  if [ $debug -gt 0 ]             'PS')  if [ $debug -gt 0 ]
279                    then echo testoutput_run: testoutput_var $1 cg2d_init_res 1>&2 ; fi                    then echo testoutput_run: testoutput_var $1 cg2d_init_res 1>&2 ; fi
280                    testoutput_var $1 "cg2d_init_res" "Press. Solver (cg2d)" $2 $3; yy=$?                    testoutput_var $1 "cg2d_init_res" "Press. Solver (cg2d)" $2 $refoutp ; yy=$?
281                    if [ $debug -gt 0 ] ; then echo testoutput_run: cg2dres=$yy 1>&2 ; fi ;;                    if [ $debug -gt 0 ] ; then echo testoutput_run: cg2dres=$yy 1>&2 ; fi ;;
282            'Cost') testoutput_var $1 "ADM  precision_derivative_cost" "ADM Cost" $2 $3; yy=$? ;;            'Cost') testoutput_var $1 "ADM  ref_cost_function" "ADM CostFct" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
283            'Grad') testoutput_var $1 "ADM  precision_derivative_grad" "ADM Grad" $2 $3; yy=$? ;;           'AdGrd') testoutput_var $1 "ADM  adjoint_gradient"  "ADM Ad Grad" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
284             'Tmn') testoutput_var $1 "dynstat_theta_min"  "Theta minimum"  $2 $3; yy=$? ;;           'FDGrd') testoutput_var $1 "ADM  finite-diff_grad"  "ADM FD Grad" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
285             'Tmx') testoutput_var $1 "dynstat_theta_max"  "Theta maximum"  $2 $3; yy=$? ;;          'tlmCst') testoutput_var $1 "TLM  ref_cost_function" "TLM CostFct" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
286             'Tav') testoutput_var $1 "dynstat_theta_mean" "Theta mean"     $2 $3; yy=$? ;;          'tlmGrd') testoutput_var $1 "TLM  tangent-lin_grad"  "TLM TL Grad" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
287             'Tsd') testoutput_var $1 "dynstat_theta_sd"   "Theta Std.Dev"  $2 $3; yy=$? ;;          'fwdGrd') testoutput_var $1 "TLM  finite-diff_grad"  "TLM FD Grad" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
288             'Smn') testoutput_var $1 "dynstat_salt_min"  "Salt minimum"    $2 $3; yy=$? ;;             'Tmn') testoutput_var $1 "dynstat_theta_min"  "Theta minimum"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
289             'Smx') testoutput_var $1 "dynstat_salt_max"  "Salt maximum"    $2 $3; yy=$? ;;             'Tmx') testoutput_var $1 "dynstat_theta_max"  "Theta maximum"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
290             'Sav') testoutput_var $1 "dynstat_salt_mean" "Salt mean"       $2 $3; yy=$? ;;             'Tav') testoutput_var $1 "dynstat_theta_mean" "Theta mean"     $2 $refoutp ; yy=$? ;;
291             'Ssd') testoutput_var $1 "dynstat_salt_sd"   "Salt Std.Dev"    $2 $3; yy=$? ;;             'Tsd') testoutput_var $1 "dynstat_theta_sd"   "Theta Std.Dev"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
292             'Umn') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_min"  "U minimum"       $2 $3; yy=$? ;;             'Smn') testoutput_var $1 "dynstat_salt_min"  "Salt minimum"    $2 $refoutp ; yy=$? ;;
293             'Umx') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_max"  "U maximum"       $2 $3; yy=$? ;;             'Smx') testoutput_var $1 "dynstat_salt_max"  "Salt maximum"    $2 $refoutp ; yy=$? ;;
294             'Uav') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_mean" "U mean"          $2 $3; yy=$? ;;             'Sav') testoutput_var $1 "dynstat_salt_mean" "Salt mean"       $2 $refoutp ; yy=$? ;;
295             'Usd') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_sd"   "U Std.Dev"       $2 $3; yy=$? ;;             'Ssd') testoutput_var $1 "dynstat_salt_sd"   "Salt Std.Dev"    $2 $refoutp ; yy=$? ;;
296             'Vmn') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_min"  "V minimum"       $2 $3; yy=$? ;;             'Umn') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_min"  "U minimum"       $2 $refoutp ; yy=$? ;;
297             'Vmx') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_max"  "V maximum"       $2 $3; yy=$? ;;             'Umx') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_max"  "U maximum"       $2 $refoutp ; yy=$? ;;
298             'Vav') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_mean" "V mean"          $2 $3; yy=$? ;;             'Uav') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_mean" "U mean"          $2 $refoutp ; yy=$? ;;
299             'Vsd') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_sd"   "V Std.Dev"       $2 $3; yy=$? ;;             'Usd') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_sd"   "U Std.Dev"       $2 $refoutp ; yy=$? ;;
300          'pt1mn'|'pt2mn'|'pt3mn'|'pt4mn'|'pt5mn') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`             'Vmn') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_min"  "V minimum"       $2 $refoutp ; yy=$? ;;
301             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_min"  "p0"$ii"_min"   $2 $3; yy=$? ;;             'Vmx') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_max"  "V maximum"       $2 $refoutp ; yy=$? ;;
302          'pt1mx'|'pt2mx'|'pt3mx'|'pt4mx'|'pt5mx') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`             'Vav') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_mean" "V mean"          $2 $refoutp ; yy=$? ;;
303             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_max"  "p0"$ii"_max"   $2 $3; yy=$? ;;             'Vsd') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_sd"   "V Std.Dev"       $2 $refoutp ; yy=$? ;;
304          'pt1av'|'pt2av'|'pt3av'|'pt4av'|'pt5av') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`           'Qntmn') testoutput_var $1 "forcing_qnet_min" "Qnet minimum"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
305             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_mean" "p0"$ii"_mean" $2 $3; yy=$? ;;           'Qntmx') testoutput_var $1 "forcing_qnet_max" "Qnet maximum"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
306          'pt1sd'|'pt2sd'|'pt3sd'|'pt4sd'|'pt5sd') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`           'Qntav') testoutput_var $1 "forcing_qnet_mean" "Qnet mean"       $2 $refoutp ; yy=$? ;;
307             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_sd"   "p0"$ii"_StDv"  $2 $3; yy=$? ;;           'Qntsd') testoutput_var $1 "forcing_qnet_sd"  "Qnet Std.Dev"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
308           'Qntmn') testoutput_var $1 "forcing_qnet_min" "Qnet minimum"  $2 $3; yy=$? ;;           'aSImn') testoutput_var $1 "seaice_area_min"   "SIce Area min"   $2 $refoutp ; yy=$? ;;
309           'Qntmx') testoutput_var $1 "forcing_qnet_max" "Qnet maximum"  $2 $3; yy=$? ;;           'aSImx') testoutput_var $1 "seaice_area_max"   "SIce Area max"   $2 $refoutp ; yy=$? ;;
310           'Qntav') testoutput_var $1 "forcing_qnet_mean" "Qnet mean"       $2 $3; yy=$? ;;           'aSIav') testoutput_var $1 "seaice_area_mean"  "SIce Area mean"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
311           'Qntsd') testoutput_var $1 "forcing_qnet_sd"  "Qnet Std.Dev"  $2 $3; yy=$? ;;           'aSIsd') testoutput_var $1 "seaice_area_sd"    "SIce Area StDv"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
312           'aSImn') testoutput_var $1 "seaice_area_min"   "SIce Area min"   $2 $3; yy=$? ;;           'hSImn') testoutput_var $1 "seaice_heff_min"   "SIce Heff min"   $2 $refoutp ; yy=$? ;;
313           'aSImx') testoutput_var $1 "seaice_area_max"   "SIce Area max"   $2 $3; yy=$? ;;           'hSImx') testoutput_var $1 "seaice_heff_max"   "SIce Heff max"   $2 $refoutp ; yy=$? ;;
314           'aSIav') testoutput_var $1 "seaice_area_mean"  "SIce Area mean"  $2 $3; yy=$? ;;           'hSIav') testoutput_var $1 "seaice_heff_mean"  "SIce Heff mean"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
315           'aSIsd') testoutput_var $1 "seaice_area_sd"    "SIce Area StDv"  $2 $3; yy=$? ;;           'hSIsd') testoutput_var $1 "seaice_heff_sd"    "SIce Heff StDv"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
316           'hSImn') testoutput_var $1 "seaice_heff_min"   "SIce Heff min"   $2 $3; yy=$? ;;           'uSImn') testoutput_var $1 "seaice_uice_min"   "SIce Uice min"   $2 $refoutp ; yy=$? ;;
317           'hSImx') testoutput_var $1 "seaice_heff_max"   "SIce Heff max"   $2 $3; yy=$? ;;           'uSImx') testoutput_var $1 "seaice_uice_max"   "SIce Uice max"   $2 $refoutp ; yy=$? ;;
318           'hSIav') testoutput_var $1 "seaice_heff_mean"  "SIce Heff mean"  $2 $3; yy=$? ;;           'uSIav') testoutput_var $1 "seaice_uice_mean"  "SIce Uice mean"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
319           'hSIsd') testoutput_var $1 "seaice_heff_sd"    "SIce Heff StDv"  $2 $3; yy=$? ;;           'uSIsd') testoutput_var $1 "seaice_uice_sd"    "SIce Uice StDv"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
320          'AthSiG') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_G" "thSIc Area Global" $2 $3; yy=$? ;;           'vSImn') testoutput_var $1 "seaice_vice_min"   "SIce Vice min"   $2 $refoutp ; yy=$? ;;
321          'AthSiS') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_S" "thSIc Area South"  $2 $3; yy=$? ;;           'vSImx') testoutput_var $1 "seaice_vice_max"   "SIce Vice max"   $2 $refoutp ; yy=$? ;;
322          'AthSiN') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_N" "thSIc Area North"  $2 $3; yy=$? ;;           'vSIav') testoutput_var $1 "seaice_vice_mean"  "SIce Vice mean"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
323          'HthSiG') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_G" "thSIc H Global"    $2 $3; yy=$? ;;           'vSIsd') testoutput_var $1 "seaice_vice_sd"    "SIce Vice StDv"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
324          'HthSiS') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_S" "thSIc H South"     $2 $3; yy=$? ;;          'AthSiG') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_G" "thSIc Area Global" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
325          'HthSiN') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_N" "thSIc H North"     $2 $3; yy=$? ;;          'AthSiS') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_S" "thSIc Area South"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
326                *) yy=99; echo "WARNING: asking for var=$xx : not recognized !" 1>&2 ;;          'AthSiN') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_N" "thSIc Area North"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
327            esac          'HthSiG') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_G" "thSIc H Glob-ave"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
328            if test $xx = $sVar          'HthSiS') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_S" "thSIc H South-av"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
329            then allargs="$allargs > $yy <"          'HthSiN') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_N" "thSIc H North-av"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
330            else allargs="$allargs $yy"          'HthMxS') testoutput_var $1 "thSI_IceH_max_S" "thSIc H South-max" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
331            'HthMxN') testoutput_var $1 "thSI_IceH_max_N" "thSIc H North-max" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
332             'sbo_M') testoutput_var $1 "sbo_mass"          "SBO mass"        $2 $refoutp ; yy=$? ;;
333             'sboFW') testoutput_var $1 "sbo_mass_fw"       "SBO m-FW"        $2 $refoutp ; yy=$? ;;
334             'sboAc') testoutput_var $1 "sbo_zoamc"         "SBO AM-C"        $2 $refoutp ; yy=$? ;;
335             'sboAp') testoutput_var $1 "sbo_zoamp"         "SBO AM-P"        $2 $refoutp ; yy=$? ;;
336            'StrmIc') testoutput_var $1 "STREAMICE_FP_ERR" "StreamIce Solver" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
337                  *) yy=99; echo "WARNING: asking for var=$xx : not recognized !" 1>&2 ;;
338                esac
339              else
340              #- ptracers stats:
341                nn=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`
342                ii=`echo $xx | sed 's/^pt[0-9]*//'`
343                case $ii in
344                'mn') testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$nn"_min"  "p0"$nn"_min"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
345                'mx') testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$nn"_max"  "p0"$nn"_max"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
346                'av') testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$nn"_mean" "p0"$nn"_mean" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
347                'sd') testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$nn"_sd"   "p0"$nn"_StDv" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
348                esac
349            fi            fi
350          done            if test $xx = $sVar
351              then allargs="$allargs > $yy <"
352              else allargs="$allargs $yy"
353              fi
354            done
355    
356          nbVar=`echo $listVar | awk '{print NF}'`          nbVar=`echo $listVar | awk '{print NF}'`
357          if [ $nbVar -lt $LEN_CHECK_LIST ] ; then          if [ $nbVar -lt $LEN_CHECK_LIST ] ; then
358          #-- fill line (up to standard length) with dot:          #-- fill line (up to standard length) with dot:
359            adNul=`expr $LEN_CHECK_LIST - $nbVar | awk '{for(i=1;i<=$1;i++){print "."}}'`            adNul=`expr $LEN_CHECK_LIST - $nbVar | awk '{for(i=1;i<=$1;i++){print "."}}'`
360            echo $allargs $adNul            echo $allargs $adNul
361          else          else
362            echo $allargs            echo $allargs
363          fi          fi
364  # <-- same processing for adjoint & forward test  # <-- same processing for adjoint & forward test
# Line 331  genmakemodel() Line 381  genmakemodel()
381              if test "x$MKDEPEND" != x ; then              if test "x$MKDEPEND" != x ; then
382                  command="$command -makedepend=$MKDEPEND"                  command="$command -makedepend=$MKDEPEND"
383              fi              fi
384              if test "x$ADM" = xt ; then              if test $KIND = 4 ; then
385                  command="$command --mods=../code_ad"                  command="$command -oad -mods=../$code_dir"
             elif test "x$OADM" = xt ; then  
                 command="$command -adof ../../../tools/adjoint_options/adjoint_oad -mods '../code_oad ../../OpenAD/code_oad_all'"  
386              else              else
387                  command="$command -mods=../code"                  command="$command -mods=../$code_dir"
388              fi              fi
389              if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then              if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then
390                  command="$command -optfile=$OPTFILE"                  command="$command -optfile=$OPTFILE"
391              fi              fi
392              if test $OptLev = 1 ; then              if test $OptLev = 1 ; then
393                  command="$command -ieee"                  command="$command -ieee"
394              fi              fi
395              if test $OptLev = 0 ; then              if test $OptLev = 0 ; then
396                  command="$command -devel"                  command="$command -devel"
397              fi              fi
# Line 363  genmakemodel() Line 411  genmakemodel()
411              if test "x$EXTRFLG" != x ; then              if test "x$EXTRFLG" != x ; then
412                  command="$command -extra_flag $EXTRFLG"                  command="$command -extra_flag $EXTRFLG"
413              fi              fi
414                if test "x$NOCATAD" = xt ; then
415                    command="$command -nocat4ad"
416                fi
417              if test "x$TS" = xt ; then              if test "x$TS" = xt ; then
418                  command="$command -ts"                  command="$command -ts"
419              fi              fi
# Line 393  genmakemodel() Line 444  genmakemodel()
444  makeclean()  makeclean()
445  {  {
446      # makeclean directory      # makeclean directory
447      if test "x$NODEPEND" = xf ; then rm -f $1/make.tr_log ; fi      if test "x$NOGENMAKE" = xf ; then rm -f $1/make.tr_log ; fi
448      if test "x$NOCLEAN" = xt ; then      if test "x$NOCLEAN" = xt ; then
449          echo "make Clean skipped!"          echo "make Clean skipped!"
450      else      else
# Line 425  run_clean() Line 476  run_clean()
476      if test "x$NOCLEAN" = xt ; then      if test "x$NOCLEAN" = xt ; then
477          echo "run_clean skipped!"          echo "run_clean skipped!"
478      else      else
479          (        (
480              cd $1;          cd $1;
481              printf 'clean run-dir ... '          printf 'clean run-dir ... '
482              # part of what is done after "make clean" when doing "make CLEAN"          # part of what is done after "make clean" when doing "make CLEAN"
483              find . -name "*.meta" -exec rm {} \;          find . -name "*.meta" -exec rm {} \;
484              find . -name "*.data" -exec rm {} \;          find . -name "*.data" -exec rm {} \;
485              find . -name "fort.*" -exec rm {} \;          find . -name "fort.*" -exec rm {} \;
486              find . -type l -exec rm {} \;          find . -type l -exec rm {} \;
487              #- should remove executable only if sym-link (alredy done above)          #- should remove executable only if sym-link (already done above)
488              rm -f $RUNLOG *.txt STD* *diagnostics.log datetime          rm -f $RUNLOG *.txt STDOUT.* STDERR.* *diagnostics.log *.[0-9][0-9][0-9][0-9].log
489              rm -rf mnc_test_*          rm -f datetime costfinal divided.ctrl snapshot* output_adm.*.diva_*
490              rm -f *_MIT_CE_000.opt0000 costfunction*0000          rm -f *_MIT_CE_000.opt0000 costfunction*0000
491              echo successful          rm -f oad_cp.[0-9][0-9][0-9].?????
492              exit 0          rm -rf mnc_test_*
493          )          echo successful
494            exit 0
495          )
496      fi      fi
497  }  }
498    
# Line 482  makemodel() Line 535  makemodel()
535      else      else
536          cd $1;          cd $1;
537          if test -r Makefile ; then          if test -r Makefile ; then
538              printf 'make ... '              if test "x$MKSMALLF" = xt ; then
539              if test "x$ADM" = xt ; then                  printf 'make small_f ... '
540                  $MAKE adall >> make.tr_log 2>&1                  $MAKE_CMD small_f >> make.tr_log 2>&1
541              elif test "x$OADM" = xt ; then                  RETVAL=$?
542                  $MAKE adAll >> make.tr_log 2>&1                  if test "x$RETVAL" != x0 ; then
543              else                      tail make.tr_log
544                  if test "x$JOBS" = x ; then                      echo failed
545                      $MAKE $TARG >> make.tr_log 2>&1                      cp genmake.log genmake.tr_log $CDIR
546                        tail -$NBLINES_MKLOG make.tr_log > $CDIR"/make.tr_log_tail"
547                        rm -f $EXECUTABLE
548                        mk_fail=1
549                  else                  else
550                      $MAKE -j $JOBS $TARG >> make.tr_log 2>&1                      echo successful
551                  fi                  fi
552              fi              fi
553                printf 'make ... '
554                $MAKE_CMD $TARG >> make.tr_log 2>&1
555              RETVAL=$?              RETVAL=$?
556              if test "x$RETVAL" != x0 ; then              if test "x$RETVAL" != x0 ; then
557                  tail make.tr_log                  tail make.tr_log
# Line 510  makemodel() Line 568  makemodel()
568              mk_fail=2              mk_fail=2
569          fi          fi
570      fi      fi
571      if test "x$ADM" = xt -a -f taf_ad.log ; then      if test $KIND = 1 -a -f taf_ftl.log ; then
572              head -1 taf_ad.log >> $CDIR"/summary.txt"          head -1 taf_ftl.log >> $CDIR"/summary.txt"
573              nerr=`grep -c 'TAF *.* ERROR ' taf_ad.log`      fi
574              nwar=`grep -c 'TAF RECOMPUTATION *.* WARNING ' taf_ad.log`      if test $KIND = 2 -a -f taf_ad.log ; then
575              echo " TAF reports $nerr Errors and $nwar Recomputation Warnings" \          head -1 taf_ad.log >> $CDIR"/summary.txt"
576            nerr=`grep -c 'TAF *.* ERROR ' taf_ad.log`
577            nwar=`grep -c 'TAF RECOMPUTATION *.* WARNING ' taf_ad.log`
578            if test -f taf_output ; then
579                n2er=`grep -c 'TAF *.* ERROR ' taf_output`
580                n3er=`grep -c '\*ERROR\* ' taf_output`
581                nerr=`expr $nerr + $n2er + $n3er`
582            fi
583            echo " TAF reports $nerr Errors and $nwar Recomputation Warnings" \
584                                  >> $CDIR"/summary.txt"                                  >> $CDIR"/summary.txt"
585      fi      fi
586      if test $mk_fail != 0 ; then return $mk_fail ; fi      if test $mk_fail != 0 ; then return $mk_fail ; fi
# Line 523  makemodel() Line 589  makemodel()
589    
590  mk_mpi_size()  mk_mpi_size()
591  {  {
592      # mk_mpi_size input_file output_file proc_Nb prefer_to_split_X      # mk_mpi_size input_file output_file proc_Nb threads_Nb_X threads_Nb_Y
593      #      #
594      # make new SIZE.h (=output_file) from SIZE.h_mpi (=input_file)      #  make new SIZE.h (=output_file) from SIZE.h_mpi (=input_file)
595      #     for an MPI build with no more than proc_Nb processors ;      #     for an MPI build with no more than proc_Nb processors ;
596      # return the effective number of processors.      #  ensure that enough tiles per proc (nSx,nSy) remain for the given
597        #     number of threads (nTx,nTy) ;
598        #  return the effective number of processors.
599    
600      inp=$1      inp=$1
601      out=$2      out=$2
602      np=$3      np=$3
603      dirX=$4      tx=$4
604        ty=$5
605      tmp=TTT.$$      tmp=TTT.$$
606    
607        # dirX : select with direction to favor in MPI process repartition
608        #   dirX=1 : prefer to put more proc in X direction
609        #   dirX=0 : prefer to put more proc in Y direction
610        dirX=0
611    
612      px=`grep "^     & *nPx *=" $inp | sed "s/^     & *nPx *= *//" | sed 's/, *$//'`      px=`grep "^     & *nPx *=" $inp | sed "s/^     & *nPx *= *//" | sed 's/, *$//'`
613      py=`grep "^     & *nPy *=" $inp | sed "s/^     & *nPy *= *//" | sed 's/, *$//'`      py=`grep "^     & *nPy *=" $inp | sed "s/^     & *nPy *= *//" | sed 's/, *$//'`
614      sx=`grep "^     & *nSx *=" $inp | sed "s/^     & *nSx *= *//" | sed 's/, *$//'`      sx=`grep "^     & *nSx *=" $inp | sed "s/^     & *nSx *= *//" | sed 's/, *$//'`
615      sy=`grep "^     & *nSy *=" $inp | sed "s/^     & *nSy *= *//" | sed 's/, *$//'`      sy=`grep "^     & *nSy *=" $inp | sed "s/^     & *nSy *= *//" | sed 's/, *$//'`
616    
617        #- for each direction, assume # of threads is a multiple of total number of tiles
618        nx=$px
619        if [ `expr $sx % $tx` -ne 0 -a `expr $sx \* $px % $tx` -eq 0 ] ; then
620            nx=`expr $sx \* $px / $tx`
621            if [ $verbose -gt 1 ]; then
622                echo " change px from $px to $nx to accommodate $tx threads"
623            fi
624        fi
625        ny=$py
626        if [ `expr $sy % $ty` -ne 0 -a `expr $sy \* $py % $ty` -eq 0 ] ; then
627            ny=`expr $sy \* $py / $ty`
628            if [ $verbose -gt 1 ]; then
629                echo " change py from $py to $ny to accommodate $ty threads"
630            fi
631        fi
632      #- find the largest divisor of input_file proc Nb, but not larger than $np      #- find the largest divisor of input_file proc Nb, but not larger than $np
633      pp=0      pp=0
634      i=1      i=1
635      while [ $i -le $px ] ; do      while [ $i -le $nx ] ; do
636        if [ `expr $px % $i` -eq 0 ] ; then        if [ `expr $nx % $i` -eq 0 ] ; then
637          j=1          j=1
638          while [ $j -le $py ] ; do          while [ $j -le $ny ] ; do
639            if [ `expr $py % $j` -eq 0 ] ; then            if [ `expr $ny % $j` -eq 0 ] ; then
640              ij=`expr $i \* $j`              ij=`expr $i \* $j`
641              if [ $ij -gt $pp ] ; then              if [ $ij -gt $pp ] ; then
642                  flag=1                  flag=1
# Line 640  linkdata() Line 729  linkdata()
729          (          (
730              cd $1 ; shift              cd $1 ; shift
731              echo 'linkdata from dirs:' $*              echo 'linkdata from dirs:' $*
732              inpMPI=`(cd ../$1 ; find . -name "*.mpi" -print | sed 's:^\./::')`              inpMPI=`(cd ../$1 ; find . -name "*.mpi" -print | sed 's:^\./::')`
733              for xx in $inpMPI ; do              for xx in $inpMPI ; do
734                if test -r "../"$1"/"$xx ; then                if test -r "../"$1"/"$xx ; then
735                  # found 1 _mpi sfx file in 1rst input dir and it is readable                  # found 1 _mpi sfx file in 1rst input dir and it is readable
736                  yy=`echo $xx | sed 's:\.mpi$::'`                  yy=`echo $xx | sed 's:\.mpi$::'`
737                  if test "x$MPI" = "x0" ; then                  if test "x$MPI" = "x0" ; then
738                      # not mpi test: remove symbolic link                      # not mpi test: remove symbolic link
# Line 675  linkdata() Line 764  linkdata()
764              prevDir='NONE'              prevDir='NONE'
765              for ldir in $* ; do              for ldir in $* ; do
766                  if test -d "../"$ldir -a $ldir != $prevDir ; then                  if test -d "../"$ldir -a $ldir != $prevDir ; then
767                      printf " ldir=${ldir}:" 1>&2                      printf " ldir=${ldir}:" 1>&2
768                      files=`( cd "../"$ldir ; ls -1 | grep -v CVS )`                      files=`( cd "../"$ldir ; ls -1 | grep -v CVS )`
769                      for i in $files ; do                      for i in $files ; do
770                          if test ! -d "../"$ldir/$i ; then                          if test ! -d "../"$ldir/$i ; then
# Line 710  runmodel() Line 799  runmodel()
799          if test "x$MPI" != x0 ; then          if test "x$MPI" != x0 ; then
800              #- adjust the MPI run command with the right number of Procs              #- adjust the MPI run command with the right number of Procs
801              #echo '' ; echo "  COMMAND='$COMMAND'"              #echo '' ; echo "  COMMAND='$COMMAND'"
802              COMMAND=`echo $COMMAND | sed "s/ TR_NPROC / $LOC_NPROC /"`              COMMAND=`echo $COMMAND | sed "s/ TR_NPROC/ $LOC_NPROC/"`
803              if test "x$MPI_MFILE" != x ; then              if test "x$MPI_MFILE" != x ; then
804                COMMAND=`echo $COMMAND | sed "s/ TR_MFILE / ..\/..\/$LOC_MFILE /"`                COMMAND=`echo $COMMAND | sed "s/ TR_MFILE / ..\/..\/$LOC_MFILE /"`
805              fi              fi
# Line 723  runmodel() Line 812  runmodel()
812            else rm -f $EXECUTABLE            else rm -f $EXECUTABLE
813            fi            fi
814          fi          fi
815          if test ! -x $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then          if test ! -x $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then
816              echo " link" $EXECUTABLE "from dir ../"$builddir > run.log_tmp              echo " link" $EXECUTABLE "from dir ../"$builddir > run.log_tmp
817              ln -sf "../"$builddir"/"$EXECUTABLE .              ln -sf "../"$builddir"/"$EXECUTABLE .
818          fi          fi
819          if test ! -x $EXECUTABLE ; then          if test ! -x $EXECUTABLE ; then
820              rm -f $RUNLOG ; touch $RUNLOG              rm -f $RUNLOG ; touch $RUNLOG
821              if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi              if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi
822              echo " no executable:" $EXECUTABLE >> $RUNLOG              echo " no executable:" $EXECUTABLE >> $RUNLOG
823              RETVAL=8              RETVAL=8
824              ENDVAL=-1              ENDVAL=-1
825          else          else
826            if test ! -f $OUTPUTFILE -o $OUTPUTFILE -ot $EXECUTABLE ; then            if test ! -f $OUTPUTFILE -o $OUTPUTFILE -ot $EXECUTABLE ; then
827              # output do not exist or is older than executable:              # output do not exist or is older than executable:
828              rm -f $OUTPUTFILE $RUNLOG ; touch $RUNLOG              rm -f $OUTPUTFILE $RUNLOG ; touch $RUNLOG
829              if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi              if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi
830            #- Divided Adjoint Run:
831            #  get the number of additional runs (add_DIVA_runs) from file "run_ADM_DIVA"
832                if test $KIND = 2 -a -f run_ADM_DIVA ; then
833                  adm_diva_nb=`sed -n '/^ *add_DIVA_runs\>.*=/p' run_ADM_DIVA | sed 's/ //g'`
834                  echo " Divided Adjoint Run: $adm_diva_nb" >> $RUNLOG
835                  eval "let $adm_diva_nb"
836                  if [ $add_DIVA_runs -ge 1 ] ; then
837                    rm -f costf* divided.ctrl snapshot*
838                    echo -n "(add_DIVA_runs=$add_DIVA_runs) ... "
839                    for ii in `seq 1 $add_DIVA_runs` ; do
840                      ( eval $COMMAND ) >> $RUNLOG 2>&1
841                      echo " additional DIVA run # $ii : done" >> $RUNLOG
842                      mv -f $OUTPUTFILE ${OUTPUTFILE}.diva_${ii}
843                    done
844                  fi
845                fi
846            #- special DIVA processing ends here
847              ( eval $COMMAND ) >> $RUNLOG 2>&1              ( eval $COMMAND ) >> $RUNLOG 2>&1
848              RETVAL=$?              RETVAL=$?
849              ENDVAL=`tail $OUTPUTFILE | grep -c 'PROGRAM MAIN: Execution ended Normally'`              ENDVAL=`tail $OUTPUTFILE | grep -c 'PROGRAM MAIN: Execution ended Normally'`
# Line 751  runmodel() Line 857  runmodel()
857              ENDVAL=`tail $OUTPUTFILE | grep -c 'PROGRAM MAIN: Execution ended Normally'`              ENDVAL=`tail $OUTPUTFILE | grep -c 'PROGRAM MAIN: Execution ended Normally'`
858              touch $RUNLOG              touch $RUNLOG
859              if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi              if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi
860              echo "---------->> $OUTPUTFILE is up to date " >> $RUNLOG 2>&1              echo "---------->> $OUTPUTFILE is up to date " >> $RUNLOG 2>&1
861            fi            fi
862          fi          fi
863          rm -f run.log_tmp          rm -f run.log_tmp
864          #- in all cases where OutputFile exists, report SIZE (and AD time)          #- in all cases where OutputFile exists, report SIZE and time
865          if test -f $OUTPUTFILE ; then          if test -f $OUTPUTFILE ; then
866            grep '(PID\.TID 0000\.0001)      n.. =' $OUTPUTFILE \            grep '(PID\.TID 0000\.0001)      n.. =' $OUTPUTFILE \
867                  | sed 's/(PID.TID 0000.0001)     //' >> $CDIR"/summary.txt"                  | sed 's/(PID.TID 0000.0001)   //' >> $CDIR"/summary.txt"
868            if test "x$ADM" = xt ; then  #         grep -A3 'Seconds in section "ALL' $OUTPUTFILE \
869              grep -A3 'Seconds in section "ALL' $OUTPUTFILE >> $CDIR"/summary.txt"  #               | sed 's/(PID.TID 0000.0001)   //' >> $CDIR"/summary.txt"
870            fi  #         some implementations of grep cannot do contextual searches so we
871    #         replace the above with a sed command
872              cat $OUTPUTFILE | sed -n '/Seconds in section "ALL/{N
873              N
874              N
875              p
876              }' | sed 's/(PID.TID 0000.0001)   //' >> $CDIR"/summary.txt"
877          fi          fi
878          if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi          if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi
879          if [ $RETVAL -eq 0 -a $ENDVAL -gt 0 ] ; then          if [ $RETVAL -eq 0 -a $ENDVAL -gt 0 ] ; then
# Line 863  formatresults() Line 975  formatresults()
975          fi          fi
976      fi      fi
977      printf '  %s' $nm      printf '  %s' $nm
978        if test $KIND = 2 ; then
979            #-- apppend taf repport summary:
980            tafrep=`grep -c '^ TAF reports ' $CDIR/summary.txt`
981            if test $tafrep = 1 ; then
982                grep '^ TAF reports ' $CDIR/summary.txt | awk '{printf "  (e=%i, w=%i)",$3,$6}'
983            fi
984        fi
985      printf '\n'      printf '\n'
986    
987  }  }
# Line 871  scandirs() Line 990  scandirs()
990  {  {
991      if [ $# -eq 1 ]; then      if [ $# -eq 1 ]; then
992          for arg in * ; do          for arg in * ; do
993              test -f $arg/$1 && echo $arg             #test -f $arg/$1 && echo $arg
994                test -f $arg/$1 -o -f $arg/$1.gz && echo $arg
995          done          done
996      else      else
997          echo $*          echo $*
# Line 927  debug=0 Line 1047  debug=0
1047  verbose=1  verbose=1
1048  NBLINES_MKLOG=16000  NBLINES_MKLOG=16000
1049    
 IEEE=true  
 if test "x$MITGCM_IEEE" != x ; then  
     IEEE=$MITGCM_IEEE  
 fi  
1050  OptLev=1  OptLev=1
1051  GSL=f  GSL=f
1052    
# Line 951  SKIPDIRS= Line 1067  SKIPDIRS=
1067  MPACKDIR="../tools/mpack-1.6"  MPACKDIR="../tools/mpack-1.6"
1068  HAVE_MPACK=  HAVE_MPACK=
1069  MPACK=  MPACK=
1070    SENDCMD=
1071    SAVDIR='.'
1072  COMMAND=  COMMAND=
1073  MKDEPEND=  MKDEPEND=
1074  if test "x$MAKE" = x ; then  if test "x$MAKE" = x ; then
1075      MAKE=make      MAKE=make
1076  fi  fi
1077    MAKE_CMD=
1078  if test "x$CC" = x ; then  if test "x$CC" = x ; then
1079      CC=cc      CC=cc
1080  fi  fi
# Line 968  OUTDIR= Line 1087  OUTDIR=
1087  DELDIR=  DELDIR=
1088  USE_R4=  USE_R4=
1089  EXTRFLG=  EXTRFLG=
1090    NOCATAD=
1091    MKSMALLF=
1092    
1093  ADM=  #- type of testing (KIND):
1094  OADM=  #   KIND=0 : forward (= default) ;  KIND=1 : Tangent Linear with TAF ;
1095    #   KIND=2 : Adjoint with TAF ;     KIND=4 : Adjoint with OpenAD
1096    KIND=0
1097    
1098  # list of pTracers to check for monitor output  # list of pTracers to check for monitor output
1099  PTRACERS_NUM="1 2 3 4 5"  PTRACERS_NUM="1 2 3 4 5"
# Line 1003  for ac_option ; do Line 1126  for ac_option ; do
1126          -mpackdir | --mpackdir | -mpd | --mpd) ac_prev=MPACKDIR ;;          -mpackdir | --mpackdir | -mpd | --mpd) ac_prev=MPACKDIR ;;
1127          -mpackdir=* | --mpackdir=* | -mpd=* | --mpd=*) MPACKDIR=$ac_optarg ;;          -mpackdir=* | --mpackdir=* | -mpd=* | --mpd=*) MPACKDIR=$ac_optarg ;;
1128    
1129            -send | --send ) ac_prev=SENDCMD ;;
1130            -send=* | --send=* ) SENDCMD=$ac_optarg ;;
1131            -savdir | --savdir | -sd | --sd ) ac_prev=SAVDIR ;;
1132            -savdir=* | --savdir=* | -sd=* | --sd=* ) SAVDIR=$ac_optarg ;;
1133    
1134          -tdir | --tdir | -t | --t) ac_prev=TESTDIRS ;;          -tdir | --tdir | -t | --t) ac_prev=TESTDIRS ;;
1135          -tdir=* | --tdir=* | -t=* | --t=*) TESTDIRS=$ac_optarg ;;          -tdir=* | --tdir=* | -t=* | --t=*) TESTDIRS=$ac_optarg ;;
1136          -skipdir | --skipdir | -skd | --skd) ac_prev=SKIPDIRS ;;          -skipdir | --skipdir | -skd | --skd) ac_prev=SKIPDIRS ;;
# Line 1020  for ac_option ; do Line 1148  for ac_option ; do
1148          -make | --make | -m | --m) ac_prev=MAKE ;;          -make | --make | -m | --m) ac_prev=MAKE ;;
1149          -make=* | --make=* | -m=* | --m=*) MAKE=$ac_optarg ;;          -make=* | --make=* | -m=* | --m=*) MAKE=$ac_optarg ;;
1150    
1151            -repl_mk | --repl_mk ) ac_prev=MAKE_CMD ;;
1152            -repl_mk=* | --repl_mk=*) MAKE_CMD=$ac_optarg ;;
1153    
1154          -odir | --odir) ac_prev=OUTDIR ;;          -odir | --odir) ac_prev=OUTDIR ;;
1155          -odir=* | --odir=*) OUTDIR=$ac_optarg ;;          -odir=* | --odir=*) OUTDIR=$ac_optarg ;;
1156    
# Line 1057  for ac_option ; do Line 1188  for ac_option ; do
1188    
1189          -mth) MULTI_THREAD=t ;;          -mth) MULTI_THREAD=t ;;
1190    
1191          -adm | -ad) ADM=t ;;          -tlm) if test $KIND = 0 ; then KIND=1 ; else
1192          -oad) OADM=t; NODEPEND=t ;;                  echo "Error: '-tlm', '-adm' and '-oad' are exclusive" ; usage
1193                  fi ;;
1194            -adm | -ad) if test $KIND = 0 ; then KIND=2 ; else
1195                    echo "Error: '-tlm', '-adm' and '-oad' are exclusive" ; usage
1196                  fi ;;
1197            -oad) if test $KIND = 0 ; then KIND=4 ; NODEPEND=t ; else
1198                    echo "Error: '-tlm', '-adm' and '-oad' are exclusive" ; usage
1199                  fi ;;
1200            -ncad) NOCATAD=t ;;
1201            -small_f) MKSMALLF=t ;;
1202    
1203          -ieee)   echo "Warning: ignore option '-ieee' (already the default)"          -ieee)   echo "Warning: ignore option '-ieee' (already the default)"
1204                   printf " ... " ;;                   printf " ... " ;;
1205          -noieee) echo "Warning: will use option '-fast' instead of '-noieee' (obsolete)"          -noieee) echo "Warning: will use option '-fast' instead of '-noieee' (obsolete)"
1206                   printf " ... " ; OptLev=`expr $OptLev \* 2` ;;                   printf " ... " ; OptLev=`expr $OptLev \* 2` ;;
1207          -fast)  OptLev=`expr $OptLev \* 2` ;;          -fast)  OptLev=`expr $OptLev \* 2` ;;
1208          -devel) OptLev=0 ;;          -devel) OptLev=0 ;;
1209          -gsl) GSL=t ;;          -gsl) GSL=t ;;
# Line 1078  for ac_option ; do Line 1218  for ac_option ; do
1218    
1219          -ts) TS=t;;          -ts) TS=t;;
1220          -papis) PAPIS=t;;          -papis) PAPIS=t;;
1221          -pcls) PCL=t;;          -pcls) PCLS=t;;
1222    
1223          -*) echo "Error: unrecognized option: "$ac_option          -*) echo "Error: unrecognized option: "$ac_option
1224              usage ;;              usage ;;
# Line 1094  if test "x$QUICK" = xt ; then Line 1234  if test "x$QUICK" = xt ; then
1234      NOCLEAN=t      NOCLEAN=t
1235      NODEPEND=t      NODEPEND=t
1236  fi  fi
1237    if test "x$MAKE_CMD" = x ; then MAKE_CMD=$MAKE ; fi
1238    
1239  #- check length of MPI machine file:  #- check length of MPI machine file:
1240  if test "x$MPI" != x0 -a "x$MPI_MFILE" != x ; then  if test "x$MPI" != x0 -a "x$MPI_MFILE" != x ; then
1241      if test -r $MPI_MFILE ; then      if test -r $MPI_MFILE ; then
1242          nl=`wc -l $MPI_MFILE | awk '{print $1}'`          nl=`wc -l $MPI_MFILE | awk '{print $1}'`
1243          if [ $nl -lt $MPI ] ; then          if [ $nl -lt $MPI ] ; then
1244            echo "Error: need at least $MPI nodes (currently only $nl) in MPI_MFILE=$MPI_FILE"            echo "Error: need at least $MPI nodes (currently only $nl) in MPI_MFILE=$MPI_FILE"
1245            usage            usage
1246          fi          fi
1247          if [ $verbose -gt 1 ]; then          if [ $verbose -gt 1 ]; then
1248              echo " MPI_MFILE=$MPI_MFILE : $nl procs for MPI=$MPI run"              echo " MPI_MFILE=$MPI_MFILE : $nl procs for MPI=$MPI run"
1249          fi          fi
1250      else      else
1251            echo "Error: cannot access MPI_MFILE=$MPI_FILE"            echo "Error: cannot access MPI_MFILE=$MPI_FILE"
1252            usage            usage
1253      fi      fi
1254  fi  fi
1255    
1256  #- setting for forward or ADM testing  #- setting for forward or ADM testing
1257  if test "x$ADM" = xt ; then  if test $KIND = 1 ; then
1258        TARG=ftlall
1259        code_dir=code_ad
1260        inputdir=input_ad
1261        ref_outp="output_tlm.txt"
1262        EXECUTABLE="mitgcmuv_ftl"
1263    elif test $KIND = 2 ; then
1264        if test "x$TARG" = xobj ; then TARG=adobj ; else TARG=adall ; fi
1265      code_dir=code_ad      code_dir=code_ad
1266      inputdir=input_ad      inputdir=input_ad
1267      ref_outp="output_adm.txt"      ref_outp="output_adm.txt"
1268      EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"      EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"
1269  elif test "x$OADM" = xt ; then  elif test $KIND = 4 ; then
1270        TARG=adAll
1271      code_dir=code_oad      code_dir=code_oad
1272      inputdir=input_oad      inputdir=input_oad
1273      ref_outp="output_oadm.txt"      ref_outp="output_oadm.txt"
# Line 1129  else Line 1278  else
1278      ref_outp="output.txt"      ref_outp="output.txt"
1279      EXECUTABLE="mitgcmuv"      EXECUTABLE="mitgcmuv"
1280  fi  fi
1281    if test "x$JOBS" != x ; then TARG="-j $JOBS $TARG" ; fi
1282    
1283  xx=`echo $TESTDIRS | awk '{print $1}'`  xx=`echo $TESTDIRS | awk '{print $1}'`
1284  if test "x$TESTDIRS" = x ; then  if test "x$TESTDIRS" = x ; then
# Line 1167  do Line 1317  do
1317              echo ""; echo -n " -- skip \"$xx\" (not a directory !)"              echo ""; echo -n " -- skip \"$xx\" (not a directory !)"
1318          fi          fi
1319      else      else
1320          if test $count = 1 ; then echo -n ", \"$xx\""          if test $count = 1 ; then echo -n ", \"$xx\""
1321          else count=1 ; echo "" ;  echo -n " skip: \"$xx\""          else count=1 ; echo "" ;  echo -n " skip: \"$xx\""
1322          fi          fi
1323      fi      fi
# Line 1175  done Line 1325  done
1325  if test $count = 1 ; then echo "" ; echo -n " ... " ; fi  if test $count = 1 ; then echo "" ; echo -n " ... " ; fi
1326  #echo 'TESTDIRS='${TESTDIRS}'<'  #echo 'TESTDIRS='${TESTDIRS}'<'
1327    
 if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM_OF" != x ; then  
     OPTFILE=$MITGCM_OF  
 fi  
   
1328  LOC_MFILE='tr_mpi_mfile'  LOC_MFILE='tr_mpi_mfile'
1329  RUNLOG="run.tr_log"  RUNLOG="run.tr_log"
1330  OUTPUTFILE=$ref_outp  if test "x$MPI" = x0 ; then
1331  if test "x$COMMAND" = x ; then    OUTPUTFILE=$ref_outp
1332      COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"    if test "x$COMMAND" = x ; then COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE" ; fi
1333  fi  else
1334  if test "x$MPI" != x0 ; then    OUTPUTFILE="STDOUT.0000"
1335      OUTPUTFILE="STDOUT.0000"    if test "x$COMMAND" = x ; then COMMAND="mpirun -np TR_NPROC ./$EXECUTABLE" ; fi
1336  fi  fi
1337    
1338  echo "OK (COMMAND= $COMMAND )"  echo "OK (COMMAND='$COMMAND')"
1339    
1340    #TMP=./tr_$$
1341    #- try to put temporary files in system-local /tmp dir
1342    TMP=/tmp/tr_${USER}_$$
1343    touch $TMP ; retVal=$?
1344    if [ $retVal -eq 0 ] ; then
1345      if test ! -r $TMP ; then TMP=./tr_$$ ; fi
1346    else
1347      TMP=./tr_$$
1348    fi
1349    rm -f $TMP
1350    if [ $verbose -gt 1 ]; then echo " temp files: $TMP" ; fi
1351    
1352  # set the Default List of output variables to be checked:  # set the Default List of output variables to be checked:
1353  #  (use default or load experiment-specific list from file "tr_checklist")  #  (use default or load experiment-specific list from file "tr_checklist")
1354  # content : 1rst = main variable used to decide if it pass or FAIL  # content : 1rst = main variable used to decide if it pass or FAIL
1355  #         others = number of matching digits to be printed in summary.txt  #         others = number of matching digits to be printed in summary.txt
1356  if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; then  if test $KIND = 1 ; then
1357        DEF_CHECK_LIST='tlmGrd tlmCst tlmGrd fwdGrd'
1358        EMPTY_RESULTS='.. .. ..'
1359        LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`
1360    elif test $KIND = 2 -o $KIND = 4 ; then
1361        DEF_CHECK_LIST='AdGrd Cost AdGrd FDGrd'
1362        EMPTY_RESULTS='.. .. ..'
1363        LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`
1364    else
1365      DEF_CHECK_LIST='PS PS T+ S+ U+ V+ pt1+ pt2+ pt3+ pt4+ pt5+'      DEF_CHECK_LIST='PS PS T+ S+ U+ V+ pt1+ pt2+ pt3+ pt4+ pt5+'
1366      EMPTY_RESULTS='.. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. ..'      EMPTY_RESULTS='.. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. ..'
1367      LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`      LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`
1368      ii=`echo $EMPTY_RESULTS | awk '{print NF}'`      ii=`echo $EMPTY_RESULTS | awk '{print NF}'`
1369      EMPTY_RESULTS=$EMPTY_RESULTS`expr $LEN_CHECK_LIST - $ii | awk 'BEGIN{FS=":"}{for(i=1;i<=$1;i++){printf "  ."}}'`      EMPTY_RESULTS=$EMPTY_RESULTS`expr $LEN_CHECK_LIST - $ii | awk 'BEGIN{FS=":"}{for(i=1;i<=$1;i++){printf "  ."}}'`
 else  
     DEF_CHECK_LIST='Grad Cost Grad'  
     EMPTY_RESULTS='.. ..'  
     LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`  
1370  fi  fi
1371    
1372  #  create the FORTRAN comparison code  #  create the FORTRAN comparison code
1373  if test -x tr_cmpnum ; then  if test "x$CLEANUP" = xt -o -x tr_cmpnum ; then
1374      echo "skipping comparison code build"      echo "skipping comparison code build"
1375  else  else
1376      createcodelet      createcodelet
1377  fi  fi
1378    
1379  #  build the mpack utility (if ADDRESSES = NONE, do it to test the build)  #  build the mpack utility (if ADDRESSES = NONE, do it to test the build)
1380  if test "x$ADDRESSES" = x ; then  if test "x$ADDRESSES" = x -o "x$SENDCMD" != x ; then
1381      echo "skipping mpack build"      echo "skipping mpack build"
1382  else  else
1383      build_mpack      build_mpack
1384        if test "x$HAVE_MPACK" = xt ; then SENDCMD=$MPACK ; fi
1385  fi  fi
1386    
1387  #  Create a uniquely named directory to store results  #  Create a uniquely named directory to store results
1388  CMDLINE=$0  CMDLINE=$0
1389  for xx in "$@" ; do nw=`echo $xx | wc -w`  for xx in "$@" ; do nw=`echo $xx | wc -w`
1390      if test $nw = '1' ; then CMDLINE="$CMDLINE $xx"      if test $nw = '1' ; then CMDLINE="$CMDLINE $xx" ; else
1391                          else CMDLINE="$CMDLINE '$xx'" ; fi        nb=`echo $xx | grep -c '='`
1392          if test $nb = 0 ; then CMDLINE="$CMDLINE '$xx'"
1393          else yy=`echo "$xx'" | sed "s/=/='/"` ;
1394                                 CMDLINE="$CMDLINE $yy" ; fi
1395        fi
1396  done  done
 #for xx in "$@" ; do CMDLINE="$CMDLINE '$xx'" ; done  
1397  MACH=`hostname`  MACH=`hostname`
1398  UNAMEA=`uname -a`  UNAMEA=`uname -a`
1399  DATE=`date +%Y%m%d`  DATE=`date +%Y%m%d`
# Line 1235  BASE="tr_"$MACH"_"$DATE"_" Line 1401  BASE="tr_"$MACH"_"$DATE"_"
1401  if test "x$OUTDIR" != x ; then  if test "x$OUTDIR" != x ; then
1402      BASE="tr_"$OUTDIR"_"$DATE"_"      BASE="tr_"$OUTDIR"_"$DATE"_"
1403  else  else
1404      short_name=`hostname | sed 's/\..*$//'`     #short_name=`hostname -s | tr '[:upper:]' '[:lower:]'`
1405       # hostname -s is not universal (does work on AIX system)
1406        short_name=`hostname | sed 's/\..*$//' | tr '[:upper:]' '[:lower:]'`
1407      BASE="tr_"$short_name"_"$DATE"_"      BASE="tr_"$short_name"_"$DATE"_"
1408  fi  fi
1409  DNUM=0  DNUM=0
# Line 1272  if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then Line 1440  if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then
1440          echo >> $SUMMARY          echo >> $SUMMARY
1441          echo "  OPTFILE=$OPTFILE" >> $SUMMARY          echo "  OPTFILE=$OPTFILE" >> $SUMMARY
1442      else      else
1443          echo | tee $SUMMARY          echo | tee -a $SUMMARY
1444          echo "ERROR: can't read OPTFILE=\"$OPTFILE\"" | tee $SUMMARY          echo "ERROR: can't read OPTFILE=\"$OPTFILE\"" | tee -a $SUMMARY
1445          exit 1          exit 1
1446      fi      fi
1447  else  else
# Line 1283  else Line 1451  else
1451  fi  fi
1452  echo  echo
1453  echo >> $SUMMARY  echo >> $SUMMARY
1454  if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; then  if test $KIND = 0 ; then
1455      if [ $MATCH_CRIT -lt 10 ] ;      line_0=`printf '%s %2i' 'default' $MATCH_CRIT`
     then line_0="default  "$MATCH_CRIT ;  
     else line_0="default "$MATCH_CRIT ; fi  
1456         line_0="$line_0  ----T-----  ----S-----  ----U-----  ----V-----"         line_0="$line_0  ----T-----  ----S-----  ----U-----  ----V-----"
1457      line_1="G D M    c        m  s        m  s        m  s        m  s"      line_1="G D M    c        m  s        m  s        m  s        m  s"
1458      line_2="E p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  ."      line_2="e p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  ."
1459      line_3="N n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d"      line_3="n n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d"
1460      line_4="2 d e n  d  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  ."      line_4="2 d e n  d  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  ."
1461      for ii in $PTRACERS_NUM ; do      for ii in $PTRACERS_NUM ; do
1462          line_0="$line_0  --PTR 0"$ii"--"          line_0="$line_0  --PTR 0"$ii"--"
# Line 1299  if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; the Line 1465  if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; the
1465          line_3="$line_3  i  a  a  d"          line_3="$line_3  i  a  a  d"
1466          line_4="$line_4  n  x  n  ."          line_4="$line_4  n  x  n  ."
1467      done      done
1468    else
1469        line_0=`printf '%s %2i' 'default   ' $MATCH_CRIT`
1470      if test $KIND = 1 ; then
1471       #echo "TANGLIN=true" >> $SUMMARY
1472        echo "TangLin generated by TAF" >> $SUMMARY
1473      elif test $KIND = 3 ; then
1474        echo "TangLin generated by OpenAD" >> $SUMMARY
1475      elif test $KIND = 2 ; then
1476       #echo "ADJOINT=true" >> $SUMMARY
1477        echo "Adjoint generated by TAF" >> $SUMMARY
1478      else
1479        echo "Adjoint generated by OpenAD" >> $SUMMARY
1480      fi
1481      if test $KIND = 1 -o $KIND = 3 ; then
1482        line_1="G D M    C  T  F"
1483        line_2="e p a R  o  L  D"
1484      else
1485        line_1="G D M    C  A  F"
1486        line_2="e p a R  o  d  D"
1487      fi
1488        line_3="n n k u  s  G  G"
1489        line_4="2 d e n  t  r  r"
1490        echo >> $SUMMARY
1491    fi
1492    if test "x$CLEANUP" != xt ; then
1493      echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY      echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY
1494      echo "$line_1" | tee -a $SUMMARY      echo "$line_1" | tee -a $SUMMARY
1495      echo "$line_2" | tee -a $SUMMARY      echo "$line_2" | tee -a $SUMMARY
1496      echo "$line_3" | tee -a $SUMMARY      echo "$line_3" | tee -a $SUMMARY
1497      echo "$line_4" | tee -a $SUMMARY      echo "$line_4" | tee -a $SUMMARY
1498      echo " "       | tee -a $SUMMARY      echo ""        | tee -a $SUMMARY
 else  
     echo "ADJOINT=true" >> $SUMMARY  
     echo >> $SUMMARY  
     if [ $MATCH_CRIT -lt 10 ] ;  
     then line_0="default     "$MATCH_CRIT ;  
     else line_0="default    "$MATCH_CRIT ; fi  
     echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY  
     cat << EOF | tee -a $SUMMARY  
 G D M    C  G  
 E p a R  o  r  
 N n k u  s  a  
 2 d e n  t  d  
   
 EOF  
1499  fi  fi
1500  echo "-------------------------------------------------------------------------------"  echo "-------------------------------------------------------------------------------"
1501    
# Line 1344  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1521  for dir in $TESTDIRS ; do
1521              rm -f $EXECUTABLE *.bak              rm -f $EXECUTABLE *.bak
1522              rm -f genmake_state genmake_*optfile genmake.log              rm -f genmake_state genmake_*optfile genmake.log
1523              rm -f SIZE.h.mpi genmake.tr_log make.tr_log              rm -f SIZE.h.mpi genmake.tr_log make.tr_log
1524                rm -rf mpi_headers
1525          )          )
1526          if test -d $dir/$rundir/CVS ; then          if test -d $dir/$rundir/CVS ; then
1527              echo -n '  --- dir:' $dir/$rundir ': '              echo -n '  --- dir:' $dir/$rundir ': '
1528              run_clean $dir/$rundir              run_clean $dir/$rundir
1529          fi          fi
1530          trdir=`( cd $dir ; find . -type d -name "$pfxdir.*" -print | sed 's/^.\///')`          trdir=`( cd $dir ; find . -type d -name "$pfxdir.*" -print | sed 's/^.\///')`
# Line 1361  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1539  for dir in $TESTDIRS ; do
1539      #  Verify that the testdir exists and contains previous      #  Verify that the testdir exists and contains previous
1540      #  results in the correct location--or skip this directory!      #  results in the correct location--or skip this directory!
1541      fout=$dir"/results/"$ref_outp      fout=$dir"/results/"$ref_outp
1542      if test ! -r $fout ; then     #if test ! -r $fout ; then
1543        if test ! -r $fout -a ! -r ${fout}.gz ; then
1544          echo "can't read \"$fout\" -- skipping $dir"          echo "can't read \"$fout\" -- skipping $dir"
1545          continue          continue
1546      fi      fi
# Line 1378  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1557  for dir in $TESTDIRS ; do
1557      fi      fi
1558    
1559      if test "x$MPI" != "x0" ; then      if test "x$MPI" != "x0" ; then
1560          prefer_X=0          ntx=1 ; nty=1
1561          if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then          if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
1562              retv=`check_eedata $dir"/input/eedata.mth"`            ff=$dir"/input/eedata.mth"
1563              if test $retv = 1 ; then prefer_X=1 ; fi            ntx=`grep "^ *nTx *=" $ff | tail -1 | sed 's/^ *nTx *= *//' | sed "s/, *$//"`
1564              nty=`grep "^ *nTy *=" $ff | tail -1 | sed 's/^ *nTy *= *//' | sed "s/, *$//"`
1565              if test "x$ntx" = x ; then ntx=1 ; fi
1566              if test "x$nty" = x ; then nty=1 ; fi
1567          fi          fi
1568          #- create new SIZE.h with no more than '$MPI' Procs          #- create new SIZE.h with no more than '$MPI' Procs
1569          mk_mpi_size $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" $BUILD_DIR"/tr_size.mpi" $MPI $prefer_X          mk_mpi_size $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" $BUILD_DIR"/tr_size.mpi" $MPI $ntx $nty
1570          LOC_NPROC=$?          LOC_NPROC=$?
1571          (   cd $BUILD_DIR          (   cd $BUILD_DIR
1572              if test -r SIZE.h.mpi ; then              if test -r SIZE.h.mpi ; then
# Line 1424  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1606  for dir in $TESTDIRS ; do
1606      #  Check whether there are "extra runs" for this testdir      #  Check whether there are "extra runs" for this testdir
1607      extra_runs=      extra_runs=
1608      if test "x$NORUN" = xf ; then      if test "x$NORUN" = xf ; then
1609          ex_run_dirs=`( cd $dir ; echo $inputdir.* )`          ex_run_dirs=`( cd $dir ; ls -d $inputdir.* 2> /dev/null )`
1610      fi      fi
1611      #echo "ex_run_dirs='$ex_run_dirs'"      #echo "ex_run_dirs='$ex_run_dirs'"
1612      for exd in $ex_run_dirs ; do      for exd in $ex_run_dirs ; do
1613          name=`echo $exd | sed -e "s/$inputdir\.//"`          name=`echo $exd | sed -e "s/$inputdir\.//"`
1614          refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${name}./"`          refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${name}./"`
1615          outf="$dir/results/$refExOut"          outf="$dir/results/$refExOut"
1616          if test -f $outf -a -r $outf ; then          if test -r $outf -o -r ${outf}.gz ; then
1617            if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then            if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
1618              if test -r $dir"/"$exd"/eedata.mth" ; then              if test -r $dir"/"$exd"/eedata.mth" ; then
1619                if test "x$MPI" = "x0" ; then                if test "x$MPI" = "x0" ; then
# Line 1454  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1636  for dir in $TESTDIRS ; do
1636    
1637      echo      echo
1638      if test "x$extra_runs" = "x" ; then      if test "x$extra_runs" = "x" ; then
1639         echo "Experiment:  $dir"          echo "Experiment:  $dir"
1640      else      else
1641         echo "Experiment:  $dir ; extra_runs=$extra_runs"          echo "Experiment:  $dir ; extra_runs=$extra_runs"
1642      fi      fi
1643      echo      echo
1644      unset genmake makedepend make run      unset genmake makedepend make run
# Line 1475  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1657  for dir in $TESTDIRS ; do
1657              run=N              run=N
1658          genmakemodel $dir/$builddir && genmake=Y \          genmakemodel $dir/$builddir && genmake=Y \
1659              && makeclean $dir/$builddir \              && makeclean $dir/$builddir \
1660              && symlink_mpifiles $dir $code_dir $builddir \              && symlink_mpifiles $dir $code_dir $builddir \
1661              && makedependmodel $dir/$builddir && makedepend=Y \              && makedependmodel $dir/$builddir && makedepend=Y \
1662              && makemodel $dir/$builddir && make=Y              && makemodel $dir/$builddir && make=Y
1663      else      else
1664          genmakemodel $dir/$builddir && genmake=Y \          genmakemodel $dir/$builddir && genmake=Y \
1665              && makeclean $dir/$builddir \              && makeclean $dir/$builddir \
1666              && symlink_mpifiles $dir $code_dir $builddir \              && symlink_mpifiles $dir $code_dir $builddir \
1667              && makedependmodel $dir/$builddir && makedepend=Y \              && makedependmodel $dir/$builddir && makedepend=Y \
1668              && makemodel $dir/$builddir && make=Y \              && makemodel $dir/$builddir && make=Y \
1669              && run_clean $dir/$rundir \              && run_clean $dir/$rundir \
# Line 1493  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1675  for dir in $TESTDIRS ; do
1675    
1676          fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`          fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`
1677          echo 1>&2          echo 1>&2
1678          echo "$fres" | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</' >> $SUMMARY          echo "$fres" | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</' >> $SUMMARY
1679          echo "fresults='$fres'" | sed 's/ 99/ --/g' >> $locDIR"/summary.txt"          echo "fresults='$fres'" | sed 's/ 99/ --/g' >> $locDIR"/summary.txt"
1680    
1681          for ex in $extra_runs ; do          for ex in $extra_runs ; do
1682              unset run              unset run
1683              results=$EMPTY_RESULTS              results=$EMPTY_RESULTS
1684              #  reference output file              #  reference output file
1685              refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${ex}./g"`              refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${ex}./g"`
1686              #  Create an output dir & summary.txt file for each extra run (tdir.ex)              #  Create an output dir & summary.txt file for each extra run (tdir.ex)
# Line 1514  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1696  for dir in $TESTDIRS ; do
1696              linkdata $dir/$pfxdir.$ex $inputdir.$ex $inputdir              linkdata $dir/$pfxdir.$ex $inputdir.$ex $inputdir
1697              runmodel $dir/$pfxdir.$ex && run=Y \              runmodel $dir/$pfxdir.$ex && run=Y \
1698              && results=`testoutput_run $dir $pfxdir.$ex $refExOut`              && results=`testoutput_run $dir $pfxdir.$ex $refExOut`
1699              fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`              fres=`formatresults $dir.$ex ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`
             fres="$fres.$ex"  
1700              echo 1>&2              echo 1>&2
1701              echo "$fres" | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</' >> $SUMMARY              echo "$fres" | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</' >> $SUMMARY
1702              echo "fresults='$fres'" | sed 's/ 99/ --/g' >> $locDIR"/summary.txt"              echo "fresults='$fres'" | sed 's/ 99/ --/g' >> $locDIR"/summary.txt"
# Line 1524  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1705  for dir in $TESTDIRS ; do
1705              fi              fi
1706          done          done
1707    
1708      if test -f $DRESULTS"/"genmake_state ; then : ; else      if test ! -f $DRESULTS"/"genmake_state ; then
1709          if test -f $dir/$builddir/Makefile ; then          if test -f $dir/$builddir/Makefile ; then
1710              mkOpt=`grep '^# OPTFILE=' $dir/$builddir/Makefile 2>/dev/null | head -1 | sed 's/^# //'`              mkOpt=`grep '^# OPTFILE=' $dir/$builddir/Makefile 2>/dev/null | head -1 | sed 's/^# //'`
1711              echo "from '$dir/$builddir/Makefile', extract:" > $DRESULTS/genmake_state              echo "from '$dir/$builddir/Makefile', extract:" > $DRESULTS/genmake_state
1712              sed -n '/^# executed by:/,+1 p' $dir/$builddir/Makefile >> $DRESULTS/genmake_state  #           sed -n '/^# executed by:/,+1 p' $dir/$builddir/Makefile >> $DRESULTS/genmake_state
1713    # bsd-sed cannot do the above code
1714                cat $dir/$builddir/Makefile | \
1715                    sed -n '/^# executed by:/{N
1716                                              p
1717                                              }' >> $DRESULTS/genmake_state
1718              echo " $mkOpt" >> $DRESULTS/genmake_state              echo " $mkOpt" >> $DRESULTS/genmake_state
1719              if test "x$OPTFILE" = xNONE ; then              if test "x$OPTFILE" = xNONE ; then
1720                  eval $mkOpt                  eval $mkOpt
1721                  sed "/^No \"OPTFILE\" was specified ; genmake2/a\  OPTFILE=${OPTFILE}"\  #               sed "/^No \"OPTFILE\" was specified ; genmake2/a\  OPTFILE=${OPTFILE}"\
1722                          $SUMMARY > tr_0.tmp_log  #                       $SUMMARY > tmp.tr_log
1723    # bsd-sed requires a newline after "a\":
1724                    sed "/^No \"OPTFILE\" was specified ; genmake2/a\\
1725                             OPTFILE=${OPTFILE}" $SUMMARY > tmp.tr_log
1726                  RETVAL=$?                  RETVAL=$?
1727                  if test "x$RETVAL" = x0 ; then rm -f $SUMMARY                  if test "x$RETVAL" = x0 ; then
1728                          cp tr_0.tmp_log $SUMMARY                      cp -f tmp.tr_log $SUMMARY
                 else rm -f tr_0.tmp_log  
1729                  fi                  fi
1730                    rm -f tmp.tr_log
1731              fi              fi
1732              gmkLog=$dir/$builddir/genmake.log              gmkLog=$dir/$builddir/genmake.log
1733              grep '^Get compiler version using:' $gmkLog > /dev/null 2>&1              if test -r $gmkLog ; then
1734              RETVAL=$?                  grep '^Get compiler version using:' $gmkLog > /dev/null 2>&1
1735              if test "x$RETVAL" = x0 ; then                  RETVAL=$?
1736                  echo "from '$gmkLog', extract compiler version:" >> $DRESULTS/genmake_state                  if test "x$RETVAL" = x0 ; then
1737                  sed -n '/Get compiler version/,/<-- compiler version/p' $gmkLog \                    echo -n "from '$gmkLog', " >> $DRESULTS/genmake_state
1738                          | grep -v '^... compiler version ' > tr_1.tmp_log                    echo "extract compiler version:"   >> $DRESULTS/genmake_state
1739                  sed -n '1p' tr_1.tmp_log >> $DRESULTS/genmake_state                    sed -n '/Get compiler version/,/<-- compiler version/p' \
1740                  sed -n '2,/^$/p' tr_1.tmp_log | sed '/^$/d' | sed 's/^./ &/' \                       $gmkLog | grep -v '^... compiler version ' > tmp.tr_log
1741                          >> $DRESULTS/genmake_state                    sed -n '1p' tmp.tr_log >> $DRESULTS/genmake_state
1742                  rm -f tr_1.tmp_log                    sed -n '2,/^$/p' tmp.tr_log | sed '/^$/d' | sed 's/^./ &/' \
1743                                             >> $DRESULTS/genmake_state
1744                      rm -f tmp.tr_log
1745                    fi
1746                fi
1747                gmkLog=$dir/$builddir/genmake_state
1748                if test -r $gmkLog ; then
1749                    echo -n "from '$gmkLog', "      >> $DRESULTS/genmake_state
1750                    echo "get genmake settings:"    >> $DRESULTS/genmake_state
1751                    sed -n '/^HAVE_/p' $gmkLog | sed 's/^./ &/' \
1752                                                    >> $DRESULTS/genmake_state
1753              fi              fi
1754          fi          fi
1755      fi      fi
1756      #postclean $dir/$builddir      #postclean $dir/$builddir
1757      if test "x$POSTCLEAN" = x2 ; then      if test "x$POSTCLEAN" = x2 ; then
1758          makeclean $dir/$builddir \          makeclean $dir/$builddir \
1759              && run_clean $dir/$rundir              && run_clean $dir/$rundir
1760      fi      fi
1761      if test "x$MPI" != x0 -a "x$MPI_MFILE" != x ; then rm -f $LOC_MFILE ; fi      if test "x$MPI" != x0 -a "x$MPI_MFILE" != x ; then rm -f $LOC_MFILE ; fi
1762    
# Line 1575  date >> $SUMMARY Line 1774  date >> $SUMMARY
1774  if test "x$ADDRESSES" = xNONE -o "x$ADDRESSES" = x ; then  if test "x$ADDRESSES" = xNONE -o "x$ADDRESSES" = x ; then
1775      echo "No results email was sent."      echo "No results email was sent."
1776  else  else
1777      if test "x$HAVE_MPACK" = xt ; then      if test "x$SENDCMD" != x ; then
1778          tar -cf $DRESULTS".tar" $DRESULTS > /dev/null 2>&1 \          if [ $verbose -gt 1 ]; then
1779              && gzip $DRESULTS".tar" \             echo " run: $SENDCMD -s MITgcm-test -m 3555000 ${SAVDIR}/${DRESULTS}".tar.gz" $ADDRESSES"
1780              && $MPACK -s MITgcm-test -m 3555000 $DRESULTS".tar.gz" $ADDRESSES          fi
1781            tar -cf ${SAVDIR}/${DRESULTS}".tar" $DRESULTS > /dev/null 2>&1 \
1782                && gzip ${SAVDIR}/${DRESULTS}".tar" \
1783                && $SENDCMD -s MITgcm-test -m 3555000 ${SAVDIR}/${DRESULTS}".tar.gz" $ADDRESSES
1784          RETVAL=$?          RETVAL=$?
1785          if test "x$RETVAL" != x0 ; then          if test "x$RETVAL" != x0 ; then
1786              echo              echo
# Line 1591  else Line 1793  else
1793              echo "An email containing results was sent to the following addresses:"              echo "An email containing results was sent to the following addresses:"
1794              echo "  \"$ADDRESSES\""              echo "  \"$ADDRESSES\""
1795              echo              echo
1796              test -f $DRESULTS".tar"  &&  rm -f $DRESULTS".tar"              test -f ${SAVDIR}/${DRESULTS}".tar" &&  rm -f ${SAVDIR}/${DRESULTS}".tar"
1797              test -f $DRESULTS".tar.gz"  &&  rm -f $DRESULTS".tar.gz"              test -f ${SAVDIR}/${DRESULTS}".tar.gz" &&  rm -f ${SAVDIR}/${DRESULTS}".tar.gz"
1798          fi          fi
1799      fi      fi
1800  fi  fi
# Line 1604  fi Line 1806  fi
1806  if test "x$CLEANUP" != xt ; then  if test "x$CLEANUP" != xt ; then
1807      cat $SUMMARY | sed 's/ \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \. //'      cat $SUMMARY | sed 's/ \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \. //'
1808      if test -e tr_out.txt ; then      if test -e tr_out.txt ; then
1809          mv tr_out.txt tr_out.txt.old          mv tr_out.txt tr_out.txt.old
1810      fi      fi
1811      cat $SUMMARY | sed '/^[YN] [YN] [YN] [YN]/ s/ \. //g' > tr_out.txt      cat $SUMMARY | sed '/^[YN] [YN] [YN] [YN]/ s/ \. //g' > tr_out.txt
1812  fi  fi
# Line 1612  fi Line 1814  fi
1814  if test "x$DELDIR" = xt ; then  if test "x$DELDIR" = xt ; then
1815      rm -rf $DRESULTS      rm -rf $DRESULTS
1816  fi  fi
1817    echo "======== End of testreport execution ========"

Legend:
Removed from v.1.166  
changed lines
  Added in v.1.208

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.22