/[MITgcm]/MITgcm/verification/testreport
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revision 1.157 by jmc, Thu Jan 27 04:51:03 2011 UTC revision 1.172 by jmc, Wed May 2 14:30:28 2012 UTC
# Line 15  usage() Line 15  usage()
15      echo "  (-mpi)                   use MPI to compile and run on 2 processors"      echo "  (-mpi)                   use MPI to compile and run on 2 processors"
16      echo "  (-MPI)  NUMBER           use MPI to compile and run on max NUMBER procs"      echo "  (-MPI)  NUMBER           use MPI to compile and run on max NUMBER procs"
17      echo "  (-mfile|-mf) STRING      MPI: file with list of possible machines to run on"      echo "  (-mfile|-mf) STRING      MPI: file with list of possible machines to run on"
18      echo "  (-ieee/-noieee)          if possible, use IEEE compiler flags"      echo "  (-fast)                  use optfile default for compiler flags (no '-ieee')"
19      echo "                             (DEF=\"-ieee\")"      echo "                            DEF=off => use IEEE numerics option (if available)"
20        echo "  (-devel)                 use optfile developement flags (if available)"
21      echo "  (-gsl)                   compile with \"-gsl\" flag"      echo "  (-gsl)                   compile with \"-gsl\" flag"
22      echo "  (-use_r4|-ur4)           if allowed, use real*4 type for '_RS' variable"      echo "  (-use_r4|-ur4)           if allowed, use real*4 type for '_RS' variable"
23      echo "  (-optfile|-of) STRING    list of optfiles to use"      echo "  (-optfile|-of) STRING    list of optfiles to use"
# Line 47  usage() Line 48  usage()
48      echo "  (-match) NUMBER          Matching Criteria (number of digits)"      echo "  (-match) NUMBER          Matching Criteria (number of digits)"
49      echo "                             (DEF=\"$MATCH_CRIT\")"      echo "                             (DEF=\"$MATCH_CRIT\")"
50      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"
51        echo "  (-ef) STRING             used as genmake2 \"-extra_flag\" argument"
52      echo "  (-clean)                 *ONLY* run \"make CLEAN\" & clean run-dir"      echo "  (-clean)                 *ONLY* run \"make CLEAN\" & clean run-dir"
53      echo "  (-norun|-nr)             skip the \"runmodel\" stage (stop after make)"      echo "  (-norun|-nr)             skip the \"runmodel\" stage (stop after make)"
54        echo "  (-obj)                   only produces objects (=norun & no executable)"
55      echo "  (-runonly|-ro)           *ONLY* run stage (=\"-quick\" without make)"      echo "  (-runonly|-ro)           *ONLY* run stage (=\"-quick\" without make)"
56      echo "  (-quick|-q)              same as \"-nogenmake -noclean -nodepend\""      echo "  (-quick|-q)              same as \"-nogenmake -noclean -nodepend\""
57      echo "  (-nogenmake|-ng)         skip the genmake stage"      echo "  (-nogenmake|-ng)         skip the genmake stage"
# Line 238  testoutput_run() Line 241  testoutput_run()
241            listVar=" $sVar "`echo "$listVar " | sed "s/ $sVar / /g"`            listVar=" $sVar "`echo "$listVar " | sed "s/ $sVar / /g"`
242          fi          fi
243          if [ $debug -gt 0 ]; then echo "testoutput_run: listVar(M)='$listVar'" 1>&2 ; fi          if [ $debug -gt 0 ]; then echo "testoutput_run: listVar(M)='$listVar'" 1>&2 ; fi
         #- report to this experiment local summary file ---  
         echo "MACH='$MACH'" > $locDIR"/summary.txt"  
         echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $locDIR"/summary.txt"  
         echo "DATE='$DATE'" >> $locDIR"/summary.txt"  
         grep '(PID\.TID 0000\.0001)      n.. =' $1/$2/$OUTPUTFILE \  
          | sed 's/(PID.TID 0000.0001)     //' >> $locDIR"/summary.txt"  
244          echo "listVar='$listVar'" >> $locDIR"/summary.txt"          echo "listVar='$listVar'" >> $locDIR"/summary.txt"
245          #---          #---
246          allargs=""          allargs=""
# Line 254  testoutput_run() Line 251  testoutput_run()
251                    then echo testoutput_run: testoutput_var $1 cg2d_init_res 1>&2 ; fi                    then echo testoutput_run: testoutput_var $1 cg2d_init_res 1>&2 ; fi
252                    testoutput_var $1 "cg2d_init_res" "Press. Solver (cg2d)" $2 $3; yy=$?                    testoutput_var $1 "cg2d_init_res" "Press. Solver (cg2d)" $2 $3; yy=$?
253                    if [ $debug -gt 0 ] ; then echo testoutput_run: cg2dres=$yy 1>&2 ; fi ;;                    if [ $debug -gt 0 ] ; then echo testoutput_run: cg2dres=$yy 1>&2 ; fi ;;
254            'Cost') testoutput_var $1 "ADM  precision_derivative_cost" "ADM Cost" $2 $3; yy=$? ;;            'Cost') testoutput_var $1 "ADM  ref_cost_function" "ADM CostFct" $2 $3; yy=$? ;;
255            'Grad') testoutput_var $1 "ADM  precision_derivative_grad" "ADM Grad" $2 $3; yy=$? ;;           'AdGrd') testoutput_var $1 "ADM  adjoint_gradient"  "ADM Ad Grad" $2 $3; yy=$? ;;
256             'FDGrd') testoutput_var $1 "ADM  finite-diff_grad"  "ADM FD Grad" $2 $3; yy=$? ;;
257             'Tmn') testoutput_var $1 "dynstat_theta_min"  "Theta minimum"  $2 $3; yy=$? ;;             'Tmn') testoutput_var $1 "dynstat_theta_min"  "Theta minimum"  $2 $3; yy=$? ;;
258             'Tmx') testoutput_var $1 "dynstat_theta_max"  "Theta maximum"  $2 $3; yy=$? ;;             'Tmx') testoutput_var $1 "dynstat_theta_max"  "Theta maximum"  $2 $3; yy=$? ;;
259             'Tav') testoutput_var $1 "dynstat_theta_mean" "Theta mean"     $2 $3; yy=$? ;;             'Tav') testoutput_var $1 "dynstat_theta_mean" "Theta mean"     $2 $3; yy=$? ;;
# Line 292  testoutput_run() Line 290  testoutput_run()
290           'hSImx') testoutput_var $1 "seaice_heff_max"   "SIce Heff max"   $2 $3; yy=$? ;;           'hSImx') testoutput_var $1 "seaice_heff_max"   "SIce Heff max"   $2 $3; yy=$? ;;
291           'hSIav') testoutput_var $1 "seaice_heff_mean"  "SIce Heff mean"  $2 $3; yy=$? ;;           'hSIav') testoutput_var $1 "seaice_heff_mean"  "SIce Heff mean"  $2 $3; yy=$? ;;
292           'hSIsd') testoutput_var $1 "seaice_heff_sd"    "SIce Heff StDv"  $2 $3; yy=$? ;;           'hSIsd') testoutput_var $1 "seaice_heff_sd"    "SIce Heff StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
293             'uSImn') testoutput_var $1 "seaice_uice_min"   "SIce Uice min"   $2 $3; yy=$? ;;
294             'uSImx') testoutput_var $1 "seaice_uice_max"   "SIce Uice max"   $2 $3; yy=$? ;;
295             'uSIav') testoutput_var $1 "seaice_uice_mean"  "SIce Uice mean"  $2 $3; yy=$? ;;
296             'uSIsd') testoutput_var $1 "seaice_uice_sd"    "SIce Uice StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
297             'vSImn') testoutput_var $1 "seaice_vice_min"   "SIce Vice min"   $2 $3; yy=$? ;;
298             'vSImx') testoutput_var $1 "seaice_vice_max"   "SIce Vice max"   $2 $3; yy=$? ;;
299             'vSIav') testoutput_var $1 "seaice_vice_mean"  "SIce Vice mean"  $2 $3; yy=$? ;;
300             'vSIsd') testoutput_var $1 "seaice_vice_sd"    "SIce Vice StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
301          'AthSiG') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_G" "thSIc Area Global" $2 $3; yy=$? ;;          'AthSiG') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_G" "thSIc Area Global" $2 $3; yy=$? ;;
302          'AthSiS') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_S" "thSIc Area South"  $2 $3; yy=$? ;;          'AthSiS') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_S" "thSIc Area South"  $2 $3; yy=$? ;;
303          'AthSiN') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_N" "thSIc Area North"  $2 $3; yy=$? ;;          'AthSiN') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_N" "thSIc Area North"  $2 $3; yy=$? ;;
# Line 344  genmakemodel() Line 350  genmakemodel()
350              if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then              if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then
351                  command="$command -optfile=$OPTFILE"                  command="$command -optfile=$OPTFILE"
352              fi              fi
353              if test "x$IEEE" != x ; then              if test $OptLev = 1 ; then
354                  command="$command -ieee"                  command="$command -ieee"
355                fi
356                if test $OptLev = 0 ; then
357                    command="$command -devel"
358              fi              fi
359              if test "x$GSL" = xt ; then              if test "x$GSL" = xt ; then
360                  command="$command -gsl"                  command="$command -gsl"
# Line 360  genmakemodel() Line 369  genmakemodel()
369              if test "x$USE_R4" = xt ; then              if test "x$USE_R4" = xt ; then
370                  command="$command -use_r4"                  command="$command -use_r4"
371              fi              fi
372                if test "x$EXTRFLG" != x ; then
373                    command="$command -extra_flag $EXTRFLG"
374                fi
375              if test "x$TS" = xt ; then              if test "x$TS" = xt ; then
376                  command="$command -ts"                  command="$command -ts"
377              fi              fi
# Line 430  run_clean() Line 442  run_clean()
442              find . -name "*.data" -exec rm {} \;              find . -name "*.data" -exec rm {} \;
443              find . -name "fort.*" -exec rm {} \;              find . -name "fort.*" -exec rm {} \;
444              find . -type l -exec rm {} \;              find . -type l -exec rm {} \;
445              rm -f $EXECUTABLE $RUNLOG *.txt STD* *diagnostics.log datetime              #- should remove executable only if sym-link (alredy done above)
446                rm -f $RUNLOG *.txt STD* w2_tile_topology.????.log *diagnostics.log datetime
447              rm -rf mnc_test_*              rm -rf mnc_test_*
448              rm -f *_MIT_CE_000.opt0000 costfunction*0000              rm -f *_MIT_CE_000.opt0000 costfunction*0000
449              echo successful              echo successful
# Line 466  makemodel() Line 479  makemodel()
479  {  {
480      # makemodel directory      # makemodel directory
481      (      (
482        mk_fail=0
483      if test "x$NOMAKE" = xt ; then      if test "x$NOMAKE" = xt ; then
484          cd $1;          cd $1;
485          if test -x $EXECUTABLE ; then          if test -x $EXECUTABLE ; then
486              echo "make skipped!"              echo "make skipped!"
487          else          else
488              echo "no executable!"              echo "no executable!"
489              return 2              mk_fail=3
490          fi          fi
491      else      else
492          cd $1;          cd $1;
493          if test -r Makefile ; then          if test -r Makefile ; then
494              printf 'make ... '              printf 'make ... '
495              if test "x$ADM" = xt ; then              if test "x$REPLMAKE" = x ; then
496                  $MAKE adall >> make.tr_log 2>&1                  $MAKE $TARG >> make.tr_log 2>&1
497              elif test "x$OADM" = xt ; then              else
498                  $MAKE adAll >> make.tr_log 2>&1                  $REPLMAKE $TARG >> make.tr_log 2>&1
             else  
                 if test "x$JOBS" = x ; then  
                     $MAKE >> make.tr_log 2>&1  
                 else  
                     $MAKE -j $JOBS >> make.tr_log 2>&1  
                 fi  
499              fi              fi
500              RETVAL=$?              RETVAL=$?
501              if test "x$RETVAL" != x0 ; then              if test "x$RETVAL" != x0 ; then
502                  tail make.tr_log                  tail make.tr_log
503                  echo failed                  echo failed
504                  cp make.tr_log genmake.log genmake.tr_log $CDIR                  cp genmake.log genmake.tr_log $CDIR
505                    tail -$NBLINES_MKLOG make.tr_log > $CDIR"/make.tr_log_tail"
506                  rm -f $EXECUTABLE                  rm -f $EXECUTABLE
507                  return 1                  mk_fail=1
508              else              else
509                  echo successful                  echo successful
510              fi              fi
511            else
512                echo "no Makefile !"
513                mk_fail=2
514          fi          fi
515      fi      fi
516        if test "x$ADM" = xt -a -f taf_ad.log ; then
517                head -1 taf_ad.log >> $CDIR"/summary.txt"
518                nerr=`grep -c 'TAF *.* ERROR ' taf_ad.log`
519                nwar=`grep -c 'TAF RECOMPUTATION *.* WARNING ' taf_ad.log`
520                echo " TAF reports $nerr Errors and $nwar Recomputation Warnings" \
521                                    >> $CDIR"/summary.txt"
522        fi
523        if test $mk_fail != 0 ; then return $mk_fail ; fi
524      )      )
525  }  }
526    
527  mk_mpi_size()  mk_mpi_size()
528  {  {
529      # mk_mpi_size input_file output_file proc_Nb      # mk_mpi_size input_file output_file proc_Nb prefer_to_split_X
530      #      #
531      # make new SIZE.h (=output_file) from SIZE.h_mpi (=input_file)      # make new SIZE.h (=output_file) from SIZE.h_mpi (=input_file)
532      #     for an MPI build with no more than proc_Nb processors ;      #     for an MPI build with no more than proc_Nb processors ;
# Line 515  mk_mpi_size() Line 535  mk_mpi_size()
535      inp=$1      inp=$1
536      out=$2      out=$2
537      np=$3      np=$3
538        dirX=$4
539      tmp=TTT.$$      tmp=TTT.$$
540    
541      px=`grep "^     & *nPx *=" $inp | sed "s/^     & *nPx *= *//" | sed 's/, *$//'`      px=`grep "^     & *nPx *=" $inp | sed "s/^     & *nPx *= *//" | sed 's/, *$//'`
# Line 532  mk_mpi_size() Line 553  mk_mpi_size()
553            if [ `expr $py % $j` -eq 0 ] ; then            if [ `expr $py % $j` -eq 0 ] ; then
554              ij=`expr $i \* $j`              ij=`expr $i \* $j`
555              if [ $ij -gt $pp ] ; then              if [ $ij -gt $pp ] ; then
556                    flag=1
557                elif [ $ij -eq $pp ] ; then
558                    flag=$dirX
559                else
560                    flag=0
561                fi
562                if test $flag = 1 ; then
563                if [ $ij -le $np ] ; then                if [ $ij -le $np ] ; then
564                  ix=$i ; jy=$j ; pp=$ij                  ix=$i ; jy=$j ; pp=$ij
565                  #echo "  ix,jy= $ix,$jy"                  #echo "  ix,jy= $ix,$jy"
# Line 682  runmodel() Line 710  runmodel()
710      (      (
711          cd $1          cd $1
712          printf 'runmodel in %s ... ' $1          printf 'runmodel in %s ... ' $1
713            if test "x$MPI" != x0 ; then
714                #- adjust the MPI run command with the right number of Procs
715                #echo '' ; echo "  COMMAND='$COMMAND'"
716                COMMAND=`echo $COMMAND | sed "s/ TR_NPROC / $LOC_NPROC /"`
717                if test "x$MPI_MFILE" != x ; then
718                  COMMAND=`echo $COMMAND | sed "s/ TR_MFILE / ..\/..\/$LOC_MFILE /"`
719                fi
720                #echo "  COMMAND='$COMMAND'"
721            fi
722          if test -L $EXECUTABLE ; then          if test -L $EXECUTABLE ; then
723            if test -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then            if test -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then
724              cmp $EXECUTABLE "../"$builddir"/"$EXECUTABLE > /dev/null 2>&1              cmp $EXECUTABLE "../"$builddir"/"$EXECUTABLE > /dev/null 2>&1
# Line 693  runmodel() Line 730  runmodel()
730              echo " link" $EXECUTABLE "from dir ../"$builddir > run.log_tmp              echo " link" $EXECUTABLE "from dir ../"$builddir > run.log_tmp
731              ln -sf "../"$builddir"/"$EXECUTABLE .              ln -sf "../"$builddir"/"$EXECUTABLE .
732          fi          fi
         if test "x$MPI" != x0 ; then  
             #- adjust the MPI run command with the right number of Procs  
             #echo '' ; echo "  COMMAND='$COMMAND'"  
             COMMAND=`echo $COMMAND | sed "s/ TR_NPROC / $LOC_NPROC /"`  
             if test "x$MPI_MFILE" != x ; then  
               COMMAND=`echo $COMMAND | sed "s/ TR_MFILE / ..\/..\/$LOC_MFILE /"`  
             fi  
             #echo "  COMMAND='$COMMAND'"  
         fi  
733          if test ! -x $EXECUTABLE ; then          if test ! -x $EXECUTABLE ; then
734              rm -f $RUNLOG ; touch $RUNLOG              rm -f $RUNLOG ; touch $RUNLOG
735              if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi              if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi
# Line 711  runmodel() Line 739  runmodel()
739          else          else
740            if test ! -f $OUTPUTFILE -o $OUTPUTFILE -ot $EXECUTABLE ; then            if test ! -f $OUTPUTFILE -o $OUTPUTFILE -ot $EXECUTABLE ; then
741              # output do not exist or is older than executable:              # output do not exist or is older than executable:
742              rm -f $RUNLOG ; touch $RUNLOG              rm -f $OUTPUTFILE $RUNLOG ; touch $RUNLOG
743              if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi              if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi
744              ( eval $COMMAND ) >> $RUNLOG 2>&1              ( eval $COMMAND ) >> $RUNLOG 2>&1
745              RETVAL=$?              RETVAL=$?
# Line 730  runmodel() Line 758  runmodel()
758            fi            fi
759          fi          fi
760          rm -f run.log_tmp          rm -f run.log_tmp
761            #- in all cases where OutputFile exists, report SIZE (and AD time)
762            if test -f $OUTPUTFILE ; then
763              grep '(PID\.TID 0000\.0001)      n.. =' $OUTPUTFILE \
764                    | sed 's/(PID.TID 0000.0001)     //' >> $CDIR"/summary.txt"
765              if test "x$ADM" = xt ; then
766                grep -A3 'Seconds in section "ALL' $OUTPUTFILE >> $CDIR"/summary.txt"
767              fi
768            fi
769            if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi
770          if [ $RETVAL -eq 0 -a $ENDVAL -gt 0 ] ; then          if [ $RETVAL -eq 0 -a $ENDVAL -gt 0 ] ; then
771              echo successful              echo successful
772              printf '=> output from running in %s :\n' $1 1>&2              printf '=> output from running in %s :\n' $1 1>&2
773              tail $RUNLOG | sed 's/^.*/> &/g' 1>&2              tail $RUNLOG | sed 's/^.*/> &/g' 1>&2
             # === Reduce the size of the testing emails!  
             #cp $OUTPUTFILE $CDIR"/"$OUTPUTFILE  
             if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi  
774              return 0              return 0
775          elif [ $RETVAL -ne 0 -a $ENDVAL -gt 0 ] ; then          elif [ $RETVAL -ne 0 -a $ENDVAL -gt 0 ] ; then
776              #-- for some weird cases (run is finihed but with error code)              #-- for some weird cases (run is finihed but with error code)
# Line 749  runmodel() Line 783  runmodel()
783              printf '=> output from running in %s :\n' $1 1>&2              printf '=> output from running in %s :\n' $1 1>&2
784              tail $RUNLOG | sed 's/^.*/> &/g' 1>&2              tail $RUNLOG | sed 's/^.*/> &/g' 1>&2
785              cp $RUNLOG $CDIR"/"$RUNLOG              cp $RUNLOG $CDIR"/"$RUNLOG
             if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi  
786              return 1              return 1
787          fi          fi
788      )      )
# Line 851  scandirs() Line 884  scandirs()
884    
885  check_eedata()  check_eedata()
886  {  {
887      # check_eedata size.h eedata      # check_eedata eedata size.h
888      if [ $# -eq 2 ] ; then      if [ $# -eq 2 ] ; then
889        if test -f $1 -a -f $2 ; then       if test -f $1 -a -f $2 ; then
890        sx=`grep "^     & *nSx *=" $1 | sed "s/^     & *nSx *=//" | sed 's/, *$//'`        nx=`grep "^ *nTx *=" $1 | tail -1 | sed 's/^ *nTx *= *//' | sed "s/, *$//"`
891        nx=`grep "^ *nTx *=" $2 | tail -1 | sed 's/^ *nTx *= *//' | sed "s/, *$//"`        sx=`grep "^     & *nSx *=" $2 | sed "s/^     & *nSx *=//" | sed 's/, *$//'`
892        if test "x$nx" = x ; then        if test "x$nx" = x ; then
893          rx=10          rx=10
894        else        else
895          rx=`expr $sx % $nx`          rx=`expr $sx % $nx`
896        fi        fi
897        sy=`grep "^     & *nSy *=" $1 | sed "s/^     & *nSy *=//" | sed 's/, *$//'`        ny=`grep "^ *nTy *=" $1 | tail -1 | sed 's/^ *nTy *= *//' | sed "s/, *$//"`
898        ny=`grep "^ *nTy *=" $2 | tail -1 | sed 's/^ *nTy *= *//' | sed "s/, *$//"`        sy=`grep "^     & *nSy *=" $2 | sed "s/^     & *nSy *=//" | sed 's/, *$//'`
899        if test "x$ny" = x ; then        if test "x$ny" = x ; then
900          ry=20          ry=20
901        else        else
902          ry=`expr $sy % $ny`          ry=`expr $sy % $ny`
903        fi        fi
904        echo `expr $rx + $ry`        echo `expr $rx + $ry`
905      else       else
906        echo '-1'        echo '-1'
907        fi       fi
908        elif [ $# -eq 1 ] ; then
909         if test -f $1 ; then
910          nx=`grep "^ *nTx *=" $1 | tail -1 | sed 's/^ *nTx *= *//' | sed "s/, *$//"`
911          if test "x$nx" = x ; then nx=1 ; fi
912          ny=`grep "^ *nTy *=" $1 | tail -1 | sed 's/^ *nTy *= *//' | sed "s/, *$//"`
913          if test "x$ny" = x ; then ny=1 ; fi
914         #echo $nx $ny
915          echo $nx
916         else
917          echo '-1'
918         fi
919      else      else
920        echo '-2'        echo '-2'
921      fi      fi
# Line 884  check_eedata() Line 928  check_eedata()
928  #  Default properties  #  Default properties
929  debug=0  debug=0
930  verbose=1  verbose=1
931    NBLINES_MKLOG=16000
932    
933  IEEE=true  OptLev=1
 if test "x$MITGCM_IEEE" != x ; then  
     IEEE=$MITGCM_IEEE  
 fi  
934  GSL=f  GSL=f
935    
936  CLEANUP=f  CLEANUP=f
# Line 913  MKDEPEND= Line 955  MKDEPEND=
955  if test "x$MAKE" = x ; then  if test "x$MAKE" = x ; then
956      MAKE=make      MAKE=make
957  fi  fi
958    REPLMAKE=
959  if test "x$CC" = x ; then  if test "x$CC" = x ; then
960      CC=cc      CC=cc
961  fi  fi
962  JOBS=  JOBS=
963    TARG=
964  MPI=0  MPI=0
965  MPI_MFILE=  MPI_MFILE=
966  MULTI_THREAD=f  MULTI_THREAD=f
967  OUTDIR=  OUTDIR=
968  DELDIR=  DELDIR=
969  USE_R4=  USE_R4=
970    EXTRFLG=
971    
972  ADM=  ADM=
973  OADM=  OADM=
# Line 975  for ac_option ; do Line 1020  for ac_option ; do
1020          -make | --make | -m | --m) ac_prev=MAKE ;;          -make | --make | -m | --m) ac_prev=MAKE ;;
1021          -make=* | --make=* | -m=* | --m=*) MAKE=$ac_optarg ;;          -make=* | --make=* | -m=* | --m=*) MAKE=$ac_optarg ;;
1022    
1023            -repl_mk | --repl_mk ) ac_prev=REPLMAKE ;;
1024            -repl_mk=* | --repl_mk=*) REPLMAKE=$ac_optarg ;;
1025    
1026          -odir | --odir) ac_prev=OUTDIR ;;          -odir | --odir) ac_prev=OUTDIR ;;
1027          -odir=* | --odir=*) OUTDIR=$ac_optarg ;;          -odir=* | --odir=*) OUTDIR=$ac_optarg ;;
1028    
# Line 987  for ac_option ; do Line 1035  for ac_option ; do
1035          -j | --j) ac_prev=JOBS ;;          -j | --j) ac_prev=JOBS ;;
1036          -j=* | --j=*) JOBS=$ac_optarg ;;          -j=* | --j=*) JOBS=$ac_optarg ;;
1037    
1038            -ef | --ef) ac_prev=EXTRFLG ;;
1039            -ef=* | --ef=*) EXTRFLG=$ac_optarg ;;
1040    
1041          -clean | --clean) CLEANUP=t ; DELDIR=t ;;          -clean | --clean) CLEANUP=t ; DELDIR=t ;;
1042    
1043          -norun | --norun | -nr | --nr) NORUN=t ;;          -norun | --norun | -nr | --nr) NORUN=t ;;
1044            -obj | --obj ) TARG='obj' ; NORUN=t ;;
1045          -runonly | --runonly | -ro | --ro) QUICK=t ; NOMAKE=t ;;          -runonly | --runonly | -ro | --ro) QUICK=t ; NOMAKE=t ;;
1046          -quick | --quick | -q | --q) QUICK=t ;;          -quick | --quick | -q | --q) QUICK=t ;;
1047          -nogenmake | --nogenmake | -ng | --ng) NOGENMAKE=t ;;          -nogenmake | --nogenmake | -ng | --ng) NOGENMAKE=t ;;
# Line 1011  for ac_option ; do Line 1063  for ac_option ; do
1063          -adm | -ad) ADM=t ;;          -adm | -ad) ADM=t ;;
1064          -oad) OADM=t; NODEPEND=t ;;          -oad) OADM=t; NODEPEND=t ;;
1065    
1066          -ieee) IEEE=true ;;          -ieee)   echo "Warning: ignore option '-ieee' (already the default)"
1067          -noieee) IEEE= ;;                   printf " ... " ;;
1068            -noieee) echo "Warning: will use option '-fast' instead of '-noieee' (obsolete)"
1069                     printf " ... " ; OptLev=`expr $OptLev \* 2` ;;
1070            -fast)  OptLev=`expr $OptLev \* 2` ;;
1071            -devel) OptLev=0 ;;
1072          -gsl) GSL=t ;;          -gsl) GSL=t ;;
1073    
1074          -verbose) verbose=2 ;;          -verbose) verbose=2 ;;
# Line 1061  fi Line 1117  fi
1117    
1118  #- setting for forward or ADM testing  #- setting for forward or ADM testing
1119  if test "x$ADM" = xt ; then  if test "x$ADM" = xt ; then
1120        if test "x$TARG" = xobj ; then TARG=adobj ; else TARG=adall ; fi
1121      code_dir=code_ad      code_dir=code_ad
1122      inputdir=input_ad      inputdir=input_ad
1123      ref_outp="output_adm.txt"      ref_outp="output_adm.txt"
1124      EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"      EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"
1125  elif test "x$OADM" = xt ; then  elif test "x$OADM" = xt ; then
1126        TARG=adAll
1127      code_dir=code_oad      code_dir=code_oad
1128      inputdir=input_oad      inputdir=input_oad
1129      ref_outp="output_oadm.txt"      ref_outp="output_oadm.txt"
1130      EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"      EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"
1131  else  else
1132        if test "x$JOBS" != x ; then TARG="-j $JOBS $TARG" ; fi
1133      code_dir=code      code_dir=code
1134      inputdir=input      inputdir=input
1135      ref_outp="output.txt"      ref_outp="output.txt"
# Line 1149  if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; the Line 1208  if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; the
1208      ii=`echo $EMPTY_RESULTS | awk '{print NF}'`      ii=`echo $EMPTY_RESULTS | awk '{print NF}'`
1209      EMPTY_RESULTS=$EMPTY_RESULTS`expr $LEN_CHECK_LIST - $ii | awk 'BEGIN{FS=":"}{for(i=1;i<=$1;i++){printf "  ."}}'`      EMPTY_RESULTS=$EMPTY_RESULTS`expr $LEN_CHECK_LIST - $ii | awk 'BEGIN{FS=":"}{for(i=1;i<=$1;i++){printf "  ."}}'`
1210  else  else
1211      DEF_CHECK_LIST='Grad Cost Grad'      DEF_CHECK_LIST='AdGrd Cost AdGrd FDGrd'
1212      EMPTY_RESULTS='.. ..'      EMPTY_RESULTS='.. .. ..'
1213      LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`      LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`
1214  fi  fi
1215    
# Line 1236  if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; the Line 1295  if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; the
1295      else line_0="default "$MATCH_CRIT ; fi      else line_0="default "$MATCH_CRIT ; fi
1296         line_0="$line_0  ----T-----  ----S-----  ----U-----  ----V-----"         line_0="$line_0  ----T-----  ----S-----  ----U-----  ----V-----"
1297      line_1="G D M    c        m  s        m  s        m  s        m  s"      line_1="G D M    c        m  s        m  s        m  s        m  s"
1298      line_2="E p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  ."      line_2="e p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  ."
1299      line_3="N n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d"      line_3="n n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d"
1300      line_4="2 d e n  d  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  ."      line_4="2 d e n  d  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  ."
1301      for ii in $PTRACERS_NUM ; do      for ii in $PTRACERS_NUM ; do
1302          line_0="$line_0  --PTR 0"$ii"--"          line_0="$line_0  --PTR 0"$ii"--"
# Line 1260  else Line 1319  else
1319      else line_0="default    "$MATCH_CRIT ; fi      else line_0="default    "$MATCH_CRIT ; fi
1320      echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY      echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY
1321      cat << EOF | tee -a $SUMMARY      cat << EOF | tee -a $SUMMARY
1322  G D M    C  G  G D M    C  A  F
1323  E p a R  o  r  e p a R  o  d  D
1324  N n k u  s  a  n n k u  s  G  G
1325  2 d e n  t  d  2 d e n  t  r  r
1326    
1327  EOF  EOF
1328  fi  fi
# Line 1315  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1374  for dir in $TESTDIRS ; do
1374    
1375      # Check for specific files for particular type of run      # Check for specific files for particular type of run
1376    
1377        if test ! -r $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi"  -a "x$MPI" != "x0" ; then
1378            echo "can't find \"$CODE_DIR/SIZE.h_mpi\" -- skipping $dir"
1379            continue
1380        fi
1381        if test ! -r $dir"/input/eedata.mth" -a "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
1382            echo "can't find \"$dir/input/eedata.mth\" -- skipping $dir"
1383            continue
1384        fi
1385    
1386      if test "x$MPI" != "x0" ; then      if test "x$MPI" != "x0" ; then
1387          if test -r $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" ; then          prefer_X=0
1388              #- create new SIZE.h with no more than '$MPI' Procs          if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
1389              mk_mpi_size $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" $BUILD_DIR"/tr_size.mpi" $MPI              retv=`check_eedata $dir"/input/eedata.mth"`
1390              LOC_NPROC=$?              if test $retv = 1 ; then prefer_X=1 ; fi
1391              (   cd $BUILD_DIR          fi
1392                  if test -r SIZE.h.mpi ; then          #- create new SIZE.h with no more than '$MPI' Procs
1393                      cmp tr_size.mpi SIZE.h.mpi > /dev/null 2>&1 ; RETVAL=$?          mk_mpi_size $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" $BUILD_DIR"/tr_size.mpi" $MPI $prefer_X
1394                  else RETVAL=1          LOC_NPROC=$?
1395                  fi          (   cd $BUILD_DIR
1396                  if test "x$RETVAL" = x0 ; then              if test -r SIZE.h.mpi ; then
1397                      rm -f tr_size.mpi                  cmp tr_size.mpi SIZE.h.mpi > /dev/null 2>&1 ; RETVAL=$?
1398                  else              else RETVAL=1
1399                      rm -f SIZE.h.mpi ; mv tr_size.mpi SIZE.h.mpi              fi
1400                  fi              if test "x$RETVAL" = x0 ; then
1401              )                  rm -f tr_size.mpi
1402          else              else
1403              echo "can't find \"$CODE_DIR/SIZE.h_mpi\" -- skipping $dir"                  rm -f SIZE.h.mpi ; mv tr_size.mpi SIZE.h.mpi
1404              continue              fi
1405          fi          )
1406          if test "x$MPI_MFILE" != x ; then          if test "x$MPI_MFILE" != x ; then
1407              #- create new MPI machine-file with the right number of Procs              #- create new MPI machine-file with the right number of Procs
1408              rm -f $LOC_MFILE              rm -f $LOC_MFILE
# Line 1350  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1418  for dir in $TESTDIRS ; do
1418                  echo " new LOC_MFILE=$LOC_MFILE : $nl procs for LOC_NPROC=$LOC_NPROC"                  echo " new LOC_MFILE=$LOC_MFILE : $nl procs for LOC_NPROC=$LOC_NPROC"
1419              fi              fi
1420          fi          fi
1421      fi          if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
1422      if test ! -r $dir"/input/eedata.mth" -a "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then              retv=`check_eedata $dir"/input/eedata.mth" $BUILD_DIR"/SIZE.h.mpi"`
1423          echo "can't find \"$dir/input/eedata.mth\" -- skipping $dir"              if test $retv != 0 ; then
1424          continue                  echo "input/eedata.mth tiling misfit -- skipping $dir"
1425      fi                  continue
1426      if test "x$MPI" != "x0" -a "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then              fi
         retv=`check_eedata $BUILD_DIR"/SIZE.h.mpi" $dir"/input/eedata.mth"`  
         if test $retv != 0 ; then  
             echo "input/eedata.mth tiling misfit -- skipping $dir"  
             continue  
1427          fi          fi
1428      fi      fi
1429    
# Line 1379  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1443  for dir in $TESTDIRS ; do
1443                if test "x$MPI" = "x0" ; then                if test "x$MPI" = "x0" ; then
1444                  extra_runs="$extra_runs $name"                  extra_runs="$extra_runs $name"
1445                else                else
1446                  retv=`check_eedata $BUILD_DIR"/SIZE.h.mpi" $dir"/"$exd"/eedata.mth"`                  retv=`check_eedata $dir"/"$exd"/eedata.mth" $BUILD_DIR"/SIZE.h.mpi"`
1447                  if test $retv = 0 ; then                  if test $retv = 0 ; then
1448                      extra_runs="$extra_runs $name"                      extra_runs="$extra_runs $name"
1449                  else                  else
# Line 1404  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1468  for dir in $TESTDIRS ; do
1468      unset genmake makedepend make run      unset genmake makedepend make run
1469      results=$EMPTY_RESULTS      results=$EMPTY_RESULTS
1470    
1471      #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir combination      #  Create an output dir & summary.txt file for each tested experiment (tdir)
1472      locDIR=$DRESULTS"/"$dir      locDIR=$DRESULTS"/"$dir
1473      mkdir $locDIR      mkdir $locDIR
1474        #- report to this experiment local summary file ---
1475        echo "DATE='$DATE' ; tdir='$dir'" > $locDIR"/summary.txt"
1476        echo "MACH='$MACH'" >> $locDIR"/summary.txt"
1477        echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $locDIR"/summary.txt"
1478      CDIR=`pwd`"/$locDIR"      CDIR=`pwd`"/$locDIR"
1479    
1480      if test "x$NORUN" = xt ; then      if test "x$NORUN" = xt ; then
# Line 1432  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1500  for dir in $TESTDIRS ; do
1500          fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`          fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`
1501          echo 1>&2          echo 1>&2
1502          echo "$fres" | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</' >> $SUMMARY          echo "$fres" | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</' >> $SUMMARY
         touch $locDIR"/summary.txt"  
1503          echo "fresults='$fres'" | sed 's/ 99/ --/g' >> $locDIR"/summary.txt"          echo "fresults='$fres'" | sed 's/ 99/ --/g' >> $locDIR"/summary.txt"
         echo "tdir='$dir'" >> $locDIR"/summary.txt"  
         if test "x$ADM" = xt ; then  
             head -1 $dir/$builddir/taf_ad.log >> $locDIR"/summary.txt"  
             nerr=`grep -c 'TAF *.* ERROR ' $dir/$builddir/taf_ad.log`  
             nwar=`grep -c 'TAF RECOMPUTATION *.* WARNING ' $dir/$builddir/taf_ad.log`  
             echo " TAF reports $nerr Errors and $nwar Recomputation Warnings" \  
                                 >> $locDIR"/summary.txt"  
             grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/$rundir/$OUTPUTFILE \  
                                 >> $locDIR"/summary.txt"  
         fi  
1504    
1505          for ex in $extra_runs ; do          for ex in $extra_runs ; do
1506              unset run              unset run
1507              results=$EMPTY_RESULTS              results=$EMPTY_RESULTS
1508              #  reference output file              #  reference output file
1509              refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${ex}./g"`              refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${ex}./g"`
1510              #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir.ex combination              #  Create an output dir & summary.txt file for each extra run (tdir.ex)
1511              locDIR=$DRESULTS"/"$dir"."$ex              locDIR=$DRESULTS"/"$dir"."$ex
1512              mkdir $locDIR              mkdir $locDIR
1513                #- report to this experiment local summary file ---
1514                echo "DATE='$DATE' ; tdir='$dir.$ex'" > $locDIR"/summary.txt"
1515                #echo "MACH='$MACH'" >> $locDIR"/summary.txt"
1516                #echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $locDIR"/summary.txt"
1517              CDIR=`pwd`"/$locDIR"              CDIR=`pwd`"/$locDIR"
1518              test ! -e "$dir/$pfxdir.$ex" && mkdir "$dir/$pfxdir.$ex"              test ! -e "$dir/$pfxdir.$ex" && mkdir "$dir/$pfxdir.$ex"
1519              run_clean $dir/$pfxdir.$ex              run_clean $dir/$pfxdir.$ex
# Line 1463  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1524  for dir in $TESTDIRS ; do
1524              fres="$fres.$ex"              fres="$fres.$ex"
1525              echo 1>&2              echo 1>&2
1526              echo "$fres" | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</' >> $SUMMARY              echo "$fres" | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</' >> $SUMMARY
             touch $locDIR"/summary.txt"  
1527              echo "fresults='$fres'" | sed 's/ 99/ --/g' >> $locDIR"/summary.txt"              echo "fresults='$fres'" | sed 's/ 99/ --/g' >> $locDIR"/summary.txt"
             echo "tdir='$dir.$ex'" >> $locDIR"/summary.txt"  
             if test "x$ADM" = xt ; then  
                 grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/$pfxdir.$ex/$OUTPUTFILE \  
                                    >> $locDIR"/summary.txt"  
             fi  
1528              if test "x$POSTCLEAN" = x2 ; then              if test "x$POSTCLEAN" = x2 ; then
1529                  run_clean $dir/$pfxdir.$ex                  run_clean $dir/$pfxdir.$ex
1530              fi              fi
# Line 1497  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1552  for dir in $TESTDIRS ; do
1552              if test "x$RETVAL" = x0 ; then              if test "x$RETVAL" = x0 ; then
1553                  echo "from '$gmkLog', extract compiler version:" >> $DRESULTS/genmake_state                  echo "from '$gmkLog', extract compiler version:" >> $DRESULTS/genmake_state
1554                  sed -n '/Get compiler version/,/<-- compiler version/p' $gmkLog \                  sed -n '/Get compiler version/,/<-- compiler version/p' $gmkLog \
1555                         | grep -v '^... compiler version ' > tr_1.tmp_log                          | grep -v '^... compiler version ' > tr_1.tmp_log
1556                  sed -n '1,/^$/p' tr_1.tmp_log | sed '/^$/d' | sed 's/^./ &/' \                  sed -n '1p' tr_1.tmp_log >> $DRESULTS/genmake_state
1557                    sed -n '2,/^$/p' tr_1.tmp_log | sed '/^$/d' | sed 's/^./ &/' \
1558                          >> $DRESULTS/genmake_state                          >> $DRESULTS/genmake_state
1559                  rm -f tr_1.tmp_log                  rm -f tr_1.tmp_log
1560              fi              fi
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