/[MITgcm]/MITgcm/verification/testreport
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revision 1.113 by jmc, Wed Mar 12 02:20:04 2008 UTC revision 1.132 by jmc, Thu Jan 14 23:17:42 2010 UTC
# Line 11  usage() Line 11  usage()
11      echo      echo
12      echo "where possible OPTIONS are:"      echo "where possible OPTIONS are:"
13      echo "  (-help|-h)               print usage"      echo "  (-help|-h)               print usage"
14      echo "  (-mth)                   run multi threaded (using eedata.mth)"      echo "  (-mth)                   run multi-threaded (using eedata.mth)"
15      echo "  (-mpi)                   compile and run using MPI"      echo "  (-mpi)                   compile and run using MPI"
16      echo "  (-ieee|-noieee)          if possible, use IEEE compiler flags"      echo "  (-ieee|-noieee)          if possible, use IEEE compiler flags"
17      echo "                             (DEF=\"-ieee\")"      echo "                             (DEF=\"-ieee\")"
# Line 30  usage() Line 30  usage()
30      echo "                             Bourne-compatible \"sh\" shell"      echo "                             Bourne-compatible \"sh\" shell"
31      echo "                             (DEF=\"\" for \"bash\")"      echo "                             (DEF=\"\" for \"bash\")"
32      echo "  (-adm|-ad)               perform an adjoint run"      echo "  (-adm|-ad)               perform an adjoint run"
33        echo "  (-oad)                   perform an OpenAD adjoint run"
34      echo "  (-command) STRING        command to run"      echo "  (-command) STRING        command to run"
35      echo "                             (DEF=\"make output.txt\")"      echo "                             (DEF=\"make output.txt\")"
36      echo "  (-m|-make) STRING        command to use for \"make\""      echo "  (-m|-make) STRING        command to use for \"make\""
# Line 179  testoutput_var() Line 180  testoutput_var()
180      return $digits_of_similarity      return $digits_of_similarity
181  }  }
182    
 check_for_add_mon_output()  
 {  
     # Check for additional types of monitor output  
     if test "x$1" = x ; then  
         return  
     fi  
   
     for ii in $PTRACERS_NUM ; do  
         eval "HAVE_PTR0"$ii"=f"  
     done  
   
     ptr_add="trcstat_ptracerXX_min trcstat_ptracerXX_max"  
     ptr_add="$ptr_add trcstat_ptracerXX_mean trcstat_ptracerXX_sd"  
     for ii in $PTRACERS_NUM ; do  
         for jj in $ptr_add ; do  
             name=`eval "echo $jj | sed -e 's|XX|0"$ii"|g'"`  
             tst=`grep $name $1 | wc -l | awk '{print $1}'`  
             if test ! "x$tst" = x0 ; then  
                 eval "HAVE_PTR0"$ii"=t"  
             fi  
         done  
         #  eval 'echo "HAVE_PTR0'$ii' = $HAVE_PTR0'$ii'"'  
     done  
 }  
   
183  testoutput_run()  testoutput_run()
184  {  {
185      # testoutput_run directory subdir reference_output      # testoutput_run directory subdir reference_output
# Line 221  testoutput_run() Line 197  testoutput_run()
197          listVar=`echo $listChk | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' \          listVar=`echo $listChk | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' \
198                                 | sed 's/+//g' | sed "s/^$sVar//"`                                 | sed 's/+//g' | sed "s/^$sVar//"`
199          if [ $debug -gt 0 ]; then echo "testoutput_run: listVar(I)='$listVar'" 1>&2 ; fi          if [ $debug -gt 0 ]; then echo "testoutput_run: listVar(I)='$listVar'" 1>&2 ; fi
200          for ii in 1 2 3 4 5 6 7 8 9 ; do          # check for ptracer output in reference_output file :
201            tst=`eval 'echo "$HAVE_PTR0'$ii'"'`          outpref=$1/results/$3
202           #echo "-- ptr test=" $tst "number of var=" `echo $listVar | awk '{print NF}'` 1>&2          ptr_mon="trcstat_ptracerXX_min trcstat_ptracerXX_max"
203            if test "x$tst" != xt ; then listVar=`echo "$listVar" | sed "s/ pt$ii..//g"` ; fi          ptr_mon="$ptr_mon trcstat_ptracerXX_mean trcstat_ptracerXX_sd"
204          done          for ii in $PTRACERS_NUM ; do
205          tst=`echo $sVar $listVar | awk '{ for(i=2;i<=NF;i++){t+=($i==$1)}; print t }'`              ptrfound=0
206                for jj in $ptr_mon ; do
207                    name=`eval "echo $jj | sed -e 's|XX|0"$ii"|g'"`
208                    tst=`grep $name $outpref | wc -l | awk '{print $1}'`
209                    if test ! "x$tst" = x0 ; then ptrfound=1 ; fi
210                done
211                if test $ptrfound = '1' ; then
212                    eval "HAVE_PTR0"$ii"=t"
213                else
214                    eval "HAVE_PTR0"$ii"=f"
215                  if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; then
216                  # remove this ptr from the list of output variable to check
217                  # echo "-- ptr test=" $tst "number of var=" `echo $listVar | awk '{print NF}'` 1>&2
218                    listVar=`echo "$listVar" | sed "s/ pt$ii..//g"`
219                  fi
220                fi
221            #   eval 'echo "HAVE_PTR0'$ii' = $HAVE_PTR0'$ii'"' 1>&2
222            done
223            tst=`echo $sVar $listVar | awk '{ for(i=2;i<=NF;i++){if($i==$1)t+=1}; print t }'`
224          if test $tst != 1 ; then          if test $tst != 1 ; then
225            if test $tst = 0 ; then echo "==> WARNING: selected var >$sVar< not found" 1>&2            if test $tst = 0 ; then echo "==> WARNING: selected var >$sVar< not found" 1>&2
226                   else echo "==> WARNING: found selected var >$sVar< $tst times" 1>&2 ; fi                   else echo "==> WARNING: found selected var >$sVar< $tst times" 1>&2 ; fi
# Line 270  testoutput_run() Line 264  testoutput_run()
264             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_mean" "p0"$ii"_mean" $2 $3; yy=$? ;;             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_mean" "p0"$ii"_mean" $2 $3; yy=$? ;;
265          'pt1sd'|'pt2sd'|'pt3sd'|'pt4sd'|'pt5sd') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`          'pt1sd'|'pt2sd'|'pt3sd'|'pt4sd'|'pt5sd') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`
266             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_sd"   "p0"$ii"_StDv"  $2 $3; yy=$? ;;             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_sd"   "p0"$ii"_StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
267           'Qntmn') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_min" "Qnet minimum"  $2 $3; yy=$? ;;           'Qntmn') testoutput_var $1 "forcing_qnet_min" "Qnet minimum"  $2 $3; yy=$? ;;
268           'Qntmx') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_max" "Qnet maximum"  $2 $3; yy=$? ;;           'Qntmx') testoutput_var $1 "forcing_qnet_max" "Qnet maximum"  $2 $3; yy=$? ;;
269           'Qntav') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_mean" "Qnet mean"    $2 $3; yy=$? ;;           'Qntav') testoutput_var $1 "forcing_qnet_mean" "Qnet mean"       $2 $3; yy=$? ;;
270           'Qntsd') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_sd"  "Qnet Std.Dev"  $2 $3; yy=$? ;;           'Qntsd') testoutput_var $1 "forcing_qnet_sd"  "Qnet Std.Dev"  $2 $3; yy=$? ;;
271           'aSImn') testoutput_var $1 "seaice_area_min"   "SIce Area min"   $2 $3; yy=$? ;;           'aSImn') testoutput_var $1 "seaice_area_min"   "SIce Area min"   $2 $3; yy=$? ;;
272           'aSImx') testoutput_var $1 "seaice_area_max"   "SIce Area max"   $2 $3; yy=$? ;;           'aSImx') testoutput_var $1 "seaice_area_max"   "SIce Area max"   $2 $3; yy=$? ;;
273           'aSIav') testoutput_var $1 "seaice_area_mean"  "SIce Area mean"  $2 $3; yy=$? ;;           'aSIav') testoutput_var $1 "seaice_area_mean"  "SIce Area mean"  $2 $3; yy=$? ;;
274           'aSIsd') testoutput_var $1 "seaice_area_sd"    "SIce Area StDv"  $2 $3; yy=$? ;;           'aSIsd') testoutput_var $1 "seaice_area_sd"    "SIce Area StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
275           'hSImn') testoutput_var $1 "seaice_heff_min"   "SIce Heff min"   $2 $3; yy=$? ;;           'hSImn') testoutput_var $1 "seaice_heff_min"   "SIce Heff min"   $2 $3; yy=$? ;;
276           'hSImx') testoutput_var $1 "seaice_heff_max"   "SIce Hell max"   $2 $3; yy=$? ;;           'hSImx') testoutput_var $1 "seaice_heff_max"   "SIce Heff max"   $2 $3; yy=$? ;;
277           'hSIav') testoutput_var $1 "seaice_heff_mean"  "SIce Hell mean"  $2 $3; yy=$? ;;           'hSIav') testoutput_var $1 "seaice_heff_mean"  "SIce Heff mean"  $2 $3; yy=$? ;;
278           'hSIsd') testoutput_var $1 "seaice_heff_sd"    "SIce Hell StDv"  $2 $3; yy=$? ;;           'hSIsd') testoutput_var $1 "seaice_heff_sd"    "SIce Heff StDv"  $2 $3; yy=$? ;;
279          'AthSiG') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_G" "thSIc Area Global" $2 $3; yy=$? ;;          'AthSiG') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_G" "thSIc Area Global" $2 $3; yy=$? ;;
280          'AthSiS') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_S" "thSIc Area South"  $2 $3; yy=$? ;;          'AthSiS') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_S" "thSIc Area South"  $2 $3; yy=$? ;;
281          'AthSiN') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_N" "thSIc Area North"  $2 $3; yy=$? ;;          'AthSiN') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_N" "thSIc Area North"  $2 $3; yy=$? ;;
# Line 321  genmakemodel() Line 315  genmakemodel()
315          (          (
316              cd $1;              cd $1;
317              command="$GENMAKE2  -ds -m $MAKE"              command="$GENMAKE2  -ds -m $MAKE"
318              if test "x$ADM" = x ; then              if test "x$ADM" = xt ; then
                 command="$command --mods=../code"  
             else  
319                  command="$command --mods=../code_ad"                  command="$command --mods=../code_ad"
320                elif test "x$OADM" = xt ; then
321                    command="$command -adof ../../../tools/adjoint_options/adjoint_oad -mods '../code_oad ../../OpenAD/code_oad_all'"
322                else
323                    command="$command -mods=../code"
324              fi              fi
325              if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then              if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then
326                  command="$command --optfile=$OPTFILE"                  command="$command -optfile=$OPTFILE"
327              fi              fi
328              if test "x$IEEE" != x ; then              if test "x$IEEE" != x ; then
329                  command="$command -ieee"                  command="$command -ieee"
# Line 338  genmakemodel() Line 334  genmakemodel()
334              if test "x$MPI" = xt ; then              if test "x$MPI" = xt ; then
335                  command="$command -mpi"                  command="$command -mpi"
336              fi              fi
337                if test "x$MULTI_THREAD" = xt ; then
338                #- run multi-threaded using OpenMP:
339                    command="$command -omp"
340                fi
341              if test "x$TS" = xt ; then              if test "x$TS" = xt ; then
342                  command="$command -ts"                  command="$command -ts"
343              fi              fi
# Line 349  genmakemodel() Line 349  genmakemodel()
349              fi              fi
350              fi              fi
351              printf 'genmake ... ' 1>&2              printf 'genmake ... ' 1>&2
352              $command > make.log 2>&1              # $command > make.log 2>&1
353                eval $command > make.log 2>&1
354              RETVAL=$?              RETVAL=$?
355              #  Reduce the size of the testing emails!              #  Reduce the size of the testing emails!
356              head -100 Makefile > $CDIR/Makefile_head              head -100 Makefile > $CDIR/Makefile_head
# Line 384  makeclean() Line 385  makeclean()
385                      cp make.log $CDIR"/make.log"                      cp make.log $CDIR"/make.log"
386                      return 1                      return 1
387                  fi                  fi
388                    echo successful 1>&2
389                else
390                    echo ''
391              fi              fi
             echo successful 1>&2  
392              exit 0              exit 0
393          )          )
394      fi      fi
# Line 444  makemodel() Line 447  makemodel()
447          cd $1;          cd $1;
448          if test -r Makefile ; then          if test -r Makefile ; then
449              printf 'make ... ' 1>&2              printf 'make ... ' 1>&2
450              if test "x$ADM" = x ; then              if test "x$ADM" = xt ; then
451                    $MAKE adall >> make.log 2>&1
452                elif test "x$OADM" = xt ; then
453                    $MAKE adAll >> make.log 2>&1
454                else
455                  if test "x$JOBS" = x ; then                  if test "x$JOBS" = x ; then
456                      $MAKE >> make.log 2>&1                      $MAKE >> make.log 2>&1
457                  else                  else
458                      $MAKE -j $JOBS >> make.log 2>&1                      $MAKE -j $JOBS >> make.log 2>&1
459                  fi                  fi
             else  
                 $MAKE adall >> make.log 2>&1  
460              fi              fi
461              RETVAL=$?              RETVAL=$?
462              if test "x$RETVAL" != x0 ; then              if test "x$RETVAL" != x0 ; then
463                  tail make.log                  tail make.log
464                  echo failed 1>&2                  echo failed 1>&2
465                  cp make.log $CDIR"/make.log"                  cp make.log $CDIR"/make.log"
466                    rm -f $EXECUTABLE
467                  return 1                  return 1
468              else              else
469                  echo successful 1>&2                  echo successful 1>&2
# Line 522  linkdata() Line 528  linkdata()
528      if test -d $1 ; then      if test -d $1 ; then
529          (          (
530              cd $1 ; shift              cd $1 ; shift
531                inpMPI=`(cd ../$1 ; find . -name "*.mpi" -print | sed 's:^\./::')`
532                for xx in $inpMPI ; do
533                  if test -r "../"$1"/"$xx ; then
534                    # found 1 _mpi sfx file in 1rst input dir and it is readable
535                    yy=`echo $xx | sed 's:\.mpi$::'`
536                    if test "x$MPI" = "xt" ; then
537                    # mpi test: remove symbolic link & link _mpi sfx file
538                        if test -h $yy ; then rm -f $yy ; fi
539                        if test ! -r $yy ; then
540                            ln -sf "../"$1"/"$xx $yy ;
541                            printf "$xx " 1>&2
542                        fi
543                    else
544                    # not mpi test: remove symbolic link
545                        if test -h $yy ; then rm -f $yy ; fi
546                    fi
547                  fi
548                done
549              if test -r "../"$1"/eedata.mth" ; then              if test -r "../"$1"/eedata.mth" ; then
550              # found eedata.mth in 1rst input dir and it is readable              # found eedata.mth in 1rst input dir and it is readable
551                  if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then                  if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
# Line 573  runmodel() Line 597  runmodel()
597          echo          echo
598          if test -L $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then          if test -L $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then
599              diff -q $EXECUTABLE "../"$builddir"/"$EXECUTABLE > /dev/null 2>&1              diff -q $EXECUTABLE "../"$builddir"/"$EXECUTABLE > /dev/null 2>&1
600              outD=$? ; if test $outD != 0 ; then rm -f $EXECUTABLE ; rm -f run.log ; fi              outD=$? ; if test $outD != 0 ; then rm -f $EXECUTABLE ; fi
601          fi          fi
602          if test ! -x $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then          if test ! -x $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then
603              echo " link" $EXECUTABLE "from dir ../"$builddir > run.log_00              echo " link" $EXECUTABLE "from dir ../"$builddir > run.log_tmp
604              ln -sf "../"$builddir"/"$EXECUTABLE .              ln -sf "../"$builddir"/"$EXECUTABLE .
605          fi          fi
606          if test ! -x $EXECUTABLE ; then          if test ! -x $EXECUTABLE ; then
607                  rm -f run.log ; touch run.log                  rm -f $RUNLOG ; touch $RUNLOG
608                  if test -f run.log_00 ; then cat run.log_00 >> run.log ; fi                  if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi
609                  echo " no executable:" $EXECUTABLE >> run.log                  echo " no executable:" $EXECUTABLE >> $RUNLOG
610                  RETVAL=8                  RETVAL=8
611                  ENDVAL=-1                  ENDVAL=-1
612          else          else
613              if test ! -f $OUTPUTFILE -o $OUTPUTFILE -ot $EXECUTABLE ; then              if test ! -f $OUTPUTFILE -o $OUTPUTFILE -ot $EXECUTABLE ; then
614                # output do not exist or is older than executable:                # output do not exist or is older than executable:
615                  rm -f run.log ; touch run.log                  rm -f $RUNLOG ; touch $RUNLOG
616                  if test -f run.log_00 ; then cat run.log_00 >> run.log ; fi                  if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi
617                  ( eval $COMMAND ) >> run.log 2>&1                  ( eval $COMMAND ) >> $RUNLOG 2>&1
618                  RETVAL=$?                  RETVAL=$?
619              else              else
620                  RETVAL=0                  RETVAL=0
621                  if test -f run.log ; then                  if test -f $RUNLOG ; then
622                      if test -f run.log_00 ; then cat run.log_00 >> run.log ; fi                      if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi
623                      echo "---------->> $OUTPUTFILE is up to date " >> run.log 2>&1                      echo "---------->> $OUTPUTFILE is up to date " >> $RUNLOG 2>&1
624                  else                  else
625                      touch run.log                      touch $RUNLOG
626                      if test -f run.log_00 ; then cat run.log_00 >> run.log ; fi                      if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi
627                      echo "---------->> $OUTPUTFILE is up to date " >> run.log 2>&1                      echo "---------->> $OUTPUTFILE is up to date " >> $RUNLOG 2>&1
628                      echo " no previous run.log: assume NORMAL END" >> run.log 2>&1                      echo " no previous $RUNLOG: assume NORMAL END" >> $RUNLOG 2>&1
629                  fi                  fi
630              fi              fi
631              ENDVAL=`cat run.log | grep -v 'ABNORMAL END' | grep -c 'NORMAL END'`              ENDVAL=`cat $RUNLOG | grep -v 'ABNORMAL END' | grep -c 'NORMAL END'`
632          fi          fi
633          rm -f run.log_00          rm -f run.log_tmp
         #if test "x$RETVAL" = x0 ; then  
634          if [ $RETVAL -eq 0 -a $ENDVAL -gt 0 ] ; then          if [ $RETVAL -eq 0 -a $ENDVAL -gt 0 ] ; then
635              tail run.log              tail $RUNLOG
636              echo successful 1>&2              echo successful 1>&2
637              # === Reduce the size of the testing emails!              # === Reduce the size of the testing emails!
638              #cp $OUTPUTFILE $CDIR"/"$OUTPUTFILE              #cp $OUTPUTFILE $CDIR"/"$OUTPUTFILE
639              if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi              if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi
640              return 0              return 0
641            elif [ $RETVAL -ne 0 -a $ENDVAL -gt 0 ] ; then
642                #-- for some weird cases (run is finihed but with error code)
643                tail $RUNLOG
644                echo finished with error '(run:' $RETVAL ' end:' $ENDVAL ')' 1>&2
645                return 0
646          else          else
647              tail run.log              tail $RUNLOG
648              echo failed '(run:' $RETVAL ' end:' $ENDVAL ')' 1>&2              echo failed '(run:' $RETVAL ' end:' $ENDVAL ')' 1>&2
649              cp run.log $CDIR"/run.log"              cp $RUNLOG $CDIR"/"$RUNLOG
650              if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi              if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi
651              return 1              return 1
652          fi          fi
# Line 719  scandirs() Line 747  scandirs()
747  }  }
748    
749    
750    check_eedata()
751    {
752        # check_eedata size.h eedata
753        if [ $# -eq 2 ] ; then
754          if test -f $1 -a -f $2 ; then
755          sx=`grep "^     & *nSx *=" $1 | sed "s/^     & *nSx *=//" | sed 's/, *$//'`
756          nx=`grep "^ *nTx *=" $2 | tail -1 | sed 's/^ *nTx *= *//' | sed "s/, *$//"`
757          if test "x$nx" = x ; then
758            rx=10
759          else
760            rx=`expr $sx % $nx`
761          fi
762          sy=`grep "^     & *nSy *=" $1 | sed "s/^     & *nSy *=//" | sed 's/, *$//'`
763          ny=`grep "^ *nTy *=" $2 | tail -1 | sed 's/^ *nTy *= *//' | sed "s/, *$//"`
764          if test "x$ny" = x ; then
765            ry=20
766          else
767            ry=`expr $sy % $ny`
768          fi
769          echo `expr $rx + $ry`
770        else
771          echo '-1'
772          fi
773        else
774          echo '-2'
775        fi
776    
777    }
778    
779  ###############################################################################  ###############################################################################
780    
781    
# Line 762  OUTDIR= Line 819  OUTDIR=
819  DELDIR=  DELDIR=
820    
821  ADM=  ADM=
822    OADM=
823    
824  # Additional monitor types  # list of pTracers to check for monitor output
825  PTRACERS_NUM="1 2 3 4 5"  PTRACERS_NUM="1 2 3 4 5"
826    
827  MATCH_CRIT=13  MATCH_CRIT=13
# Line 863  for ac_option ; do Line 921  for ac_option ; do
921    
922          -adm | -ad) ADM=t ;;          -adm | -ad) ADM=t ;;
923    
924            -oad) OADM=t; NODEPEND=t ;;
925    
926          -ieee) IEEE=true ;;          -ieee) IEEE=true ;;
927          -noieee) IEEE= ;;          -noieee) IEEE= ;;
928          -gsl) GSL=t ;;          -gsl) GSL=t ;;
# Line 905  if test "x$ADM" = xt ; then Line 965  if test "x$ADM" = xt ; then
965      inputdir=input_ad      inputdir=input_ad
966      ref_outp="output_adm.txt"      ref_outp="output_adm.txt"
967      EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"      EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"
968    elif test "x$OADM" = xt ; then
969        code_dir=code_oad
970        inputdir=input_oad
971        ref_outp="output_oadm.txt"
972        EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"
973  else  else
974      code_dir=code      code_dir=code
975      inputdir=input      inputdir=input
# Line 957  if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM Line 1022  if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM
1022      OPTFILE=$MITGCM_OF      OPTFILE=$MITGCM_OF
1023  fi  fi
1024    
1025    RUNLOG="run.log"
1026  OUTPUTFILE=$ref_outp  OUTPUTFILE=$ref_outp
1027  if test "x$COMMAND" = x ; then  if test "x$COMMAND" = x ; then
1028      COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"      COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"
# Line 971  echo "OK (COMMAND= $COMMAND )" Line 1037  echo "OK (COMMAND= $COMMAND )"
1037  #  (use default or load experiment-specific list from file "tr_checklist")  #  (use default or load experiment-specific list from file "tr_checklist")
1038  # content : 1rst = main variable used to decide if it pass or FAIL  # content : 1rst = main variable used to decide if it pass or FAIL
1039  #         others = number of matching digits to be printed in summary.txt  #         others = number of matching digits to be printed in summary.txt
1040  if test "x$ADM" = x ; then  if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; then
1041      DEF_CHECK_LIST='PS PS T+ S+ U+ V+ pt1+ pt2+ pt3+ pt4+ pt5+'      DEF_CHECK_LIST='PS PS T+ S+ U+ V+ pt1+ pt2+ pt3+ pt4+ pt5+'
1042      EMPTY_RESULTS='.. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. ..'      EMPTY_RESULTS='.. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. ..'
1043      LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`      LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`
# Line 995  fi Line 1061  fi
1061    
1062  #  Create a uniquely named directory to store results  #  Create a uniquely named directory to store results
1063  CMDLINE=$0  CMDLINE=$0
1064  for xx in "$@" ; do CMDLINE="$CMDLINE '$xx'" ; done  for xx in "$@" ; do nw=`echo $xx | wc -w`
1065        if test $nw = '1' ; then CMDLINE="$CMDLINE $xx"
1066                            else CMDLINE="$CMDLINE '$xx'" ; fi
1067    done
1068    #for xx in "$@" ; do CMDLINE="$CMDLINE '$xx'" ; done
1069  MACH=`hostname`  MACH=`hostname`
1070  UNAMEA=`uname -a`  UNAMEA=`uname -a`
1071  DATE=`date +%Y%m%d`  DATE=`date +%Y%m%d`
1072  BASE="tr_"$MACH"_"$DATE"_"  BASE="tr_"$MACH"_"$DATE"_"
1073  if test "x$OUTDIR" != x ; then  if test "x$OUTDIR" != x ; then
1074      BASE="tr_"$OUTDIR"_"$DATE"_"      BASE="tr_"$OUTDIR"_"$DATE"_"
1075    else
1076        short_name=`hostname | sed 's/\..*$//'`
1077        BASE="tr_"$short_name"_"$DATE"_"
1078  fi  fi
1079  DNUM=0  DNUM=0
1080  DRESULTS="$BASE$DNUM"  DRESULTS="$BASE$DNUM"
# Line 1048  else Line 1121  else
1121  fi  fi
1122  echo  echo
1123  echo >> $SUMMARY  echo >> $SUMMARY
1124  if test "x$ADM" = x ; then  if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; then
1125      if [ $MATCH_CRIT -lt 10 ] ;      if [ $MATCH_CRIT -lt 10 ] ;
1126      then line_0="default  "$MATCH_CRIT ;      then line_0="default  "$MATCH_CRIT ;
1127      else line_0="default "$MATCH_CRIT ; fi      else line_0="default "$MATCH_CRIT ; fi
# Line 1059  if test "x$ADM" = x ; then Line 1132  if test "x$ADM" = x ; then
1132      line_3="N n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d"      line_3="N n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d"
1133      line_4="2 d e n  d  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  ."      line_4="2 d e n  d  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  ."
1134      for ii in $PTRACERS_NUM ; do      for ii in $PTRACERS_NUM ; do
         #  tst=`eval 'echo $HAVE_PTR0'$ii`  
         #  if test "x$tst" = xt ; then  
1135          line_0="$line_0  --PTR 0"$ii"--"          line_0="$line_0  --PTR 0"$ii"--"
1136          line_1="$line_1        m  s"          line_1="$line_1        m  s"
1137          line_2="$line_2  m  m  e  ."          line_2="$line_2  m  m  e  ."
1138          line_3="$line_3  i  a  a  d"          line_3="$line_3  i  a  a  d"
1139          line_4="$line_4  n  x  n  ."          line_4="$line_4  n  x  n  ."
         #  fi  
1140      done      done
1141      echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY      echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY
1142      echo "$line_1" | tee -a $SUMMARY      echo "$line_1" | tee -a $SUMMARY
# Line 1105  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1175  for dir in $TESTDIRS ; do
1175    
1176      #  Cleanup only!      #  Cleanup only!
1177      if test "x$CLEANUP" = xt ; then      if test "x$CLEANUP" = xt ; then
1178          if test -r $BUILD_DIR/Makefile ; then          echo -n '  --- dir:' $BUILD_DIR ': '
1179              echo '  ------  clean dir:' $dir/build          makeclean $BUILD_DIR
1180              ( cd $BUILD_DIR ; make CLEAN )          rm -f $BUILD_DIR/$EXECUTABLE
         fi  
1181          if test -d $dir/$rundir/CVS ; then          if test -d $dir/$rundir/CVS ; then
1182              echo '  ------  clean dir:' $dir/$rundir              echo -n '  --- dir:' $dir/$rundir ': '
1183              run_clean $dir/$rundir              run_clean $dir/$rundir
1184          fi          fi
1185          (          trdir=`( cd $dir ; find . -type d -name "tr_run.*" -print | sed 's/^.\///')`
1186              cd $dir          ttd=`echo $trdir | wc -w`
1187              rm -rf tr_run.*          if test $ttd != 0 ; then
1188          )              echo '  --- rm dir:' $trdir
1189                ( cd $dir ; rm -rf $trdir )
1190            fi
1191          continue          continue
1192      fi      fi
1193    
# Line 1127  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1198  for dir in $TESTDIRS ; do
1198          echo "can't read \"$fout\" -- skipping $dir"          echo "can't read \"$fout\" -- skipping $dir"
1199          continue          continue
1200      fi      fi
     if test "x$ADM" = x ; then  
         check_for_add_mon_output  $fout  
     fi  
1201    
1202      # Check for additional types of monitor output      # Check for specific files for particular type of run
1203    
1204      if test ! -r $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" -a "x$MPI" = "xt" ; then      if test ! -r $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" -a "x$MPI" = "xt" ; then
1205          echo "can't find \"$CODE_DIR/SIZE.h_mpi\" -- skipping $dir"          echo "can't find \"$CODE_DIR/SIZE.h_mpi\" -- skipping $dir"
# Line 1141  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1209  for dir in $TESTDIRS ; do
1209          echo "can't find \"$dir/input/eedata.mth\" -- skipping $dir"          echo "can't find \"$dir/input/eedata.mth\" -- skipping $dir"
1210          continue          continue
1211      fi      fi
1212        if test "x$MPI" = "xt" -a "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
1213          retv=`check_eedata $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" $dir"/input/eedata.mth"`
1214          if test $retv != 0 ; then
1215            echo "input/eedata.mth tiling misfit -- skipping $dir"
1216            continue
1217          fi
1218        fi
1219    
1220      #  Check whether there are "extra runs" for this testdir      #  Check whether there are "extra runs" for this testdir
1221      extra_runs=      extra_runs=
# Line 1151  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1226  for dir in $TESTDIRS ; do
1226          refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${name}./"`          refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${name}./"`
1227          outf="$dir/results/$refExOut"          outf="$dir/results/$refExOut"
1228          if test -f $outf -a -r $outf ; then          if test -f $outf -a -r $outf ; then
1229              if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then            if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
1230                  if test -r $dir"/"$exd"/eedata.mth" ; then              if test -r $dir"/"$exd"/eedata.mth" ; then
1231                  if test "x$MPI" = "xt" ; then
1232                    retv=`check_eedata $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" $dir"/"$exd"/eedata.mth"`
1233                    if test $retv = 0 ; then
1234                      extra_runs="$extra_runs $name"                      extra_runs="$extra_runs $name"
1235                  #else echo $dir"/"$exd"/eedata.mth: not found"                  else
1236                        echo $exd"/eedata.mth tiling misfit -- skipping $dir"
1237                  fi                  fi
1238              else                else
1239                  extra_runs="$extra_runs $name"                  extra_runs="$extra_runs $name"
1240                  fi
1241                #else echo $dir"/"$exd"/eedata.mth: not found"
1242              fi              fi
1243              else
1244                extra_runs="$extra_runs $name"
1245              fi
1246          fi          fi
1247      done      done
1248    
# Line 1255  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1339  for dir in $TESTDIRS ; do
1339  done  done
1340    
1341  printf "Start time:  " >> $SUMMARY  printf "Start time:  " >> $SUMMARY
1342  echo $start_date >> $SUMMARY  echo "$start_date" >> $SUMMARY
1343  printf "End time:    " >> $SUMMARY  printf "End time:    " >> $SUMMARY
1344  date >> $SUMMARY  date >> $SUMMARY
1345    
# Line 1280  else Line 1364  else
1364              echo "An email containing results was sent to the following addresses:"              echo "An email containing results was sent to the following addresses:"
1365              echo "  \"$ADDRESSES\""              echo "  \"$ADDRESSES\""
1366              echo              echo
1367                test -f $DRESULTS".tar"  &&  rm -f $DRESULTS".tar"
1368                test -f $DRESULTS".tar.gz"  &&  rm -f $DRESULTS".tar.gz"
1369          fi          fi
         test -f $DRESULTS".tar"  &&  rm -f $DRESULTS".tar"  
         test -f $DRESULTS".tar.gz"  &&  rm -f $DRESULTS".tar.gz"  
1370      fi      fi
1371  fi  fi
1372    
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