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revision 1.127 by jmc, Thu Jun 4 23:40:53 2009 UTC revision 1.195 by jmc, Sun Sep 22 23:35:56 2013 UTC
# Line 11  usage() Line 11  usage()
11      echo      echo
12      echo "where possible OPTIONS are:"      echo "where possible OPTIONS are:"
13      echo "  (-help|-h)               print usage"      echo "  (-help|-h)               print usage"
14        echo " ---- type of test : ----"
15        echo "  (-tlm)                   perform a Tangent Linear run"
16        echo "  (-adm|-ad)               perform an adjoint run"
17        echo "  (-oad)                   perform an OpenAD adjoint run"
18      echo "  (-mth)                   run multi-threaded (using eedata.mth)"      echo "  (-mth)                   run multi-threaded (using eedata.mth)"
19      echo "  (-mpi)                   compile and run using MPI"      echo "  (-mpi)                   use MPI to compile and run on 2 processors"
20      echo "  (-ieee|-noieee)          if possible, use IEEE compiler flags"      echo "  (-MPI)  NUMBER           use MPI to compile and run on max NUMBER procs"
21      echo "                             (DEF=\"-ieee\")"      echo "  (-mfile|-mf) STRING      MPI: file with list of possible machines to run on"
22        echo "  (-command|-c) STRING     command to run (e.g., if non-standard MPI setting)"
23        echo "                            DEF='mitgcmuv' or ='mpirun -np TR_NPROC mitgcmuv'"
24        echo " ---- testing options : ----"
25        echo "  (-optfile|-of) STRING    list of optfiles to use"
26        echo "  (-fast)                  use optfile default for compiler flags (no '-ieee')"
27        echo "                            DEF=off => use IEEE numerics option (if available)"
28        echo "  (-devel)                 use optfile developement flags (if available)"
29      echo "  (-gsl)                   compile with \"-gsl\" flag"      echo "  (-gsl)                   compile with \"-gsl\" flag"
30      echo "  (-of=|-optfile=)STRING   list of optfiles to use"      echo "  (-use_r4|-ur4)           if allowed, use real*4 type for '_RS' variable"
31      echo "  (-a|-addr) STRING        list of email recipients"      echo "  (-tdir|-t) STRING        list of group and/or exp. dirs to test"
     echo "                             (DEF=\"\" no email is sent)"  
     echo "  (-mpd|-mpackdir) DIR     location of the mpack utility"  
     echo "                             (DEF=\"../tools/mpack-1.6\")"  
     echo "  (-t|-tdir) STRING        list of group and/or exp. dirs to test"  
32      echo "                             (recognized groups: basic, tutorials)"      echo "                             (recognized groups: basic, tutorials)"
33      echo "                             (DEF=\"\" which test all)"      echo "                             (DEF=\"\" which test all)"
34      echo "  (-skd|-skipdir) STRING   list of exp. dirs to skip"      echo "                             (if list= 'start_from THIS_EXP' then"
35        echo "                              test THIS_EXP + all the following)"
36        echo "  (-skipdir|-skd) STRING   list of exp. dirs to skip"
37      echo "                             (DEF=\"\" which test all)"      echo "                             (DEF=\"\" which test all)"
38      echo "  (-b|-bash) STRING        preferred location of a \"bash\" or"      echo "  (-ts)                    provide timing information per timestep"
39      echo "                             Bourne-compatible \"sh\" shell"      echo "  (-papis)                 provide MFlop/s per timestep using PAPI"
40        echo "  (-pcls)                  provide MFlop/s per timestep using PCL"
41        echo " ---- system options : ----"
42        echo "  (-bash|-b) STRING        preferred location of a \"bash\" or \"sh\" shell"
43      echo "                             (DEF=\"\" for \"bash\")"      echo "                             (DEF=\"\" for \"bash\")"
44      echo "  (-adm|-ad)               perform an adjoint run"      echo "  (-ef) STRING             used as genmake2 \"-extra_flag\" argument"
45      echo "  (-oad)                   perform an OpenAD adjoint run"      echo "  (-makedepend|-md) STRING command to use for \"makedepend\""
46      echo "  (-command) STRING        command to run"      echo "  (-make|-m) STRING        command to use for \"make\""
     echo "                             (DEF=\"make output.txt\")"  
     echo "  (-m|-make) STRING        command to use for \"make\""  
47      echo "                             (DEF=\"make\")"      echo "                             (DEF=\"make\")"
48        echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"
49        echo " ---- output options : ----"
50        echo "  (-match) NUMBER          Matching Criteria (number of digits)"
51        echo "                             (DEF=\"$MATCH_CRIT\")"
52      echo "  (-odir) STRING           used to build output directory name"      echo "  (-odir) STRING           used to build output directory name"
53      echo "                             (DEF=\"hostname\")"      echo "                             (DEF=\"hostname\")"
54      echo "  (-ptr|-ptracers) STRING  specify which ptracers to test"      echo "  (-addr|-a) STRING        list of email recipients"
55      echo "                             (DEF=\"1 2 3 4 5\")"      echo "                             (DEF=\"\" no email is sent)"
56      echo "  (-match) NUMBER          Matching Criteria (number of digits)"      echo "  (-send)       STRING     sending command (instead of using mpack)"
57      echo "                             (DEF=\"12\")"      echo "  (-savdir|-sd) STRING     location to save output tar file to send (DEF='$SAVDIR')"
58      echo "  (-j) JOBS                use \"make -j JOBS\" for parallel builds"      echo "  (-mpackdir|-mpd) DIR     location of the mpack utility"
59      echo "  (-clean)                 *ONLY* run \"make CLEAN\""      echo "                             (DEF=\"../tools/mpack-1.6\")"
60        echo " -- do only some parts: --"
61        echo "  (-clean)                 *ONLY* run \"make CLEAN\" & clean run-dir"
62        echo "  (-norun|-nr)             skip the \"runmodel\" stage (stop after make)"
63        echo "  (-obj)                   only produces objects (=norun & no executable)"
64        echo "  (-runonly|-ro)           *ONLY* run stage (=\"-quick\" without make)"
65      echo "  (-quick|-q)              same as \"-nogenmake -noclean -nodepend\""      echo "  (-quick|-q)              same as \"-nogenmake -noclean -nodepend\""
66      echo "  (-nogenmake|-ng)         skip the genmake stage"      echo "  (-nogenmake|-ng)         skip the genmake stage"
67      echo "  (-noclean|-nc)           skip the \"make clean\" stage"      echo "  (-noclean|-nc)           skip the \"make clean\" stage"
68      echo "  (-nodepend|-nd)          skip the \"make depend\" stage"      echo "  (-nodepend|-nd)          skip the \"make depend\" stage"
69        echo "  (-postclean|-pc)         after each exp. test, clean build-dir & run-dir"
70        echo "  (-deloutp|-do)           delete output files after successful run"
71      echo "  (-deldir|-dd)            on success, delete the output directory"      echo "  (-deldir|-dd)            on success, delete the output directory"
     echo "  (-ts)                    provide timing information per timestep"  
     echo "  (-papis)                 provide MFlop/s per timestep using PAPI"  
     echo "  (-pcls)                  provide MFlop/s per timestep using PCL"  
72      echo      echo
73      echo "and where STRING can be a whitespace-delimited list"      echo "and where STRING can be a whitespace-delimited list"
74      echo "such as:"      echo "such as:"
# Line 104  testoutput_var() Line 122  testoutput_var()
122  {  {
123      # testoutput_var dir s1 label subdir reference_output      # testoutput_var dir s1 label subdir reference_output
124      #      #
125      #  compares 1 variable output selected from file $dir/$subdir/$OUTPUTFILE      #  compares 1 variable output selected from file $dir/$subdir/$OUTPUTFILE
126      #     with same output from reference file $dir/results/$reference_output      #     with same output from reference file $dir/$reference_output
127      #  using search strings s1 and text label      #  using search strings s1 and text label
128    
129      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
130          echo testoutput_var: grep "$2" $1/$4/$OUTPUTFILE 1>&2          echo testoutput_var: grep "$2" $1/$4/$OUTPUTFILE 1>&2
131      fi      fi
132      if [ -r $1/$4/$OUTPUTFILE ]; then      if [ -r $1/$4/$OUTPUTFILE ]; then
133          grep "$2" $1/$4/$OUTPUTFILE | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp1.txt          grep "$2" $1/$4/$OUTPUTFILE | sed 's/.*=//' | cat -n > ${TMP}a.txt
134          lncntA=`wc -l tmp1.txt | awk '{print $1}' `          lncntA=`wc -l ${TMP}a.txt | awk '{print $1}' `
135          if [ $lncntA -lt 2 ]; then          if [ $lncntA -lt 2 ]; then
136              if [ $verbose -gt 0 ]; then              if [ $verbose -gt 0 ]; then
137                  echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2                  echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2
138              fi              fi
139              return 99              rm -f ${TMP}a.txt ; return 99
140          fi          fi
141      else      else
142          echo testoutput_var: $OUTPUTFILE from model run was not readable 1>&2          echo testoutput_var: $OUTPUTFILE from model run was not readable 1>&2
143          return 99          return 99
144      fi      fi
145      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
146          echo testoutput_var: grep "$2" $1/results/$5 1>&2          echo testoutput_var: grep "$2" $1/$5 1>&2
147      fi      fi
148      grep "$2" $1/results/$5 | sed 's/.*=//' | cat -n > tmp2.txt      grep "$2" $1/$5 | sed 's/.*=//' | cat -n > ${TMP}b.txt
149      lncntB=`wc -l tmp2.txt | awk '{print $1}' `      lncntB=`wc -l ${TMP}b.txt | awk '{print $1}' `
150      if [ $lncntB -lt 2 ]; then      if [ $lncntB -lt 2 ]; then
151          if [ $verbose -gt 0 ]; then          if [ $verbose -gt 0 ]; then
152              echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2              echo Not enough lines of output when searching for "$2" 1>&2
153          fi          fi
154          return 99          rm -f ${TMP}a.txt ${TMP}b.txt ; return 99
155      fi      fi
156      if [ $lncntA -ne $lncntB ]; then      if [ $lncntA -ne $lncntB ]; then
157          if [ $verbose -gt 0 ]; then          if [ $verbose -gt 0 ]; then
158              echo Not same Nb of lines when searching for "$2" ":" $lncntA $lncntB 1>&2              echo Not same Nb of lines when searching for "$2" ":" $lncntA $lncntB 1>&2
159          fi          fi
160          return 99          rm -f ${TMP}a.txt ${TMP}b.txt ; return 99
161      fi      fi
162      has_nan=`cat tmp1.txt | grep -i nan | wc -l`      has_nan=`cat ${TMP}a.txt | grep -i nan | wc -l`
163      if [ $has_nan -gt 0  ] ; then      if [ $has_nan -gt 0  ] ; then
164          echo testoutput_var: $OUTPUTFILE contains $has_nan NaN values  1>&2          echo testoutput_var: $OUTPUTFILE contains $has_nan NaN values  1>&2
165          return 99          rm -f ${TMP}a.txt ${TMP}b.txt ; return 99
166      fi      fi
167      has_inf=`cat tmp1.txt | grep -i inf | wc -l`      has_inf=`cat ${TMP}a.txt | grep -i inf | wc -l`
168      if [ $has_inf -gt 0  ] ; then      if [ $has_inf -gt 0  ] ; then
169          echo testoutput_var: $OUTPUTFILE contains $has_inf Inf values  1>&2          echo testoutput_var: $OUTPUTFILE contains $has_inf Inf values  1>&2
170          return 99          rm -f ${TMP}a.txt ${TMP}b.txt ; return 99
171      fi      fi
172      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
173          echo testoutput_var: join tmp1.txt tmp2.txt 1>&2          echo testoutput_var: join ${TMP}a.txt ${TMP}b.txt 1>&2
174      fi      fi
175      join tmp1.txt tmp2.txt | awk '{print $1 " " $2 " " $3}' > tmp3.txt      # On the SGI O3K (*not* the O2K), "cat -n" inserts a ":" after the line number
176        join ${TMP}a.txt ${TMP}b.txt | awk '{print $1 " " $2 " " $3}' | sed -e 's|:||g' > ${TMP}c.txt
177      if [ $debug -gt 0 ]; then      if [ $debug -gt 0 ]; then
178          echo testoutput_var: compare_lines 1>&2          echo testoutput_var: compare_lines 1>&2
179      fi      fi
180      if [ $verbose -gt 1 ]; then      if [ $verbose -gt 1 ]; then
181          cat tmp3.txt 1>&2          cat ${TMP}c.txt 1>&2
182      fi      fi
183      echo "-1" >> tmp3.txt      echo "-1" >> ${TMP}c.txt
184      # On the SGI O3K (*not* the O2K), "cat -n" inserts a ":" after the line number      digits_of_similarity=`./tr_cmpnum < ${TMP}c.txt`
     cat tmp3.txt | sed -e 's|:||g' > tmp4.txt  
     digits_of_similarity=`./tr_cmpnum < tmp4.txt`  
185      if [ $digits_of_similarity -eq 99 ]; then      if [ $digits_of_similarity -eq 99 ]; then
186          if [ $verbose -gt 0 ]; then          if [ $verbose -gt 0 ]; then
187              echo testoutput_var: No comparison was available for \"$3\" 1>&2              echo testoutput_var: No comparison was available for \"$3\" 1>&2
# Line 175  testoutput_var() Line 192  testoutput_var()
192              echo There were $digits_of_similarity decimal places of similarity for \"$3\" 1>&2              echo There were $digits_of_similarity decimal places of similarity for \"$3\" 1>&2
193          fi          fi
194      fi      fi
195      rm -f tmp1.txt tmp2.txt tmp3.txt tmp4.txt      rm -f ${TMP}a.txt ${TMP}b.txt ${TMP}c.txt
196        
197      return $digits_of_similarity      return $digits_of_similarity
198  }  }
199    
# Line 186  testoutput_run() Line 203  testoutput_run()
203      #      #
204      #  test output from 1 run in "directory"      #  test output from 1 run in "directory"
205  # --> same processing for adjoint & forward test  # --> same processing for adjoint & forward test
206          # default list of output variables to be checked:          # default list of output variables to be checked:
207          #  1rst : main variable used to decide if it pass or FAIL          #  1rst : main variable used to decide if it pass or FAIL
208          #  others : number of matching digits to be printed in summary.txt          #  others : number of matching digits to be printed in summary.txt
209          listChk=$DEF_CHECK_LIST          listChk=$DEF_CHECK_LIST
210          #  load experiment-specific list from file "tr_checklist" (if it exist)          #  load experiment-specific list from file "tr_checklist" (if it exist)
211          if test -r $1/$2/tr_checklist ; then listChk=`cat $1/$2/tr_checklist` ; fi          if test -r $1/$2/tr_checklist ; then listChk=`cat $1/$2/tr_checklist` ; fi
212          sVar=`echo $listChk | awk '{print $1}'`          sVar=`echo $listChk | awk '{print $1}'`
213          # remove 1rst var and expand the list: + => min max mean s.d          # remove 1rst var and expand the list: + => min max mean s.d
214          listVar=`echo $listChk | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' \          listVar=`echo $listChk | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' \
215                                 | sed 's/+//g' | sed "s/^$sVar//"`                                 | sed 's/+//g' | sed "s/^$sVar//"`
216          if [ $debug -gt 0 ]; then echo "testoutput_run: listVar(I)='$listVar'" 1>&2 ; fi          if [ $debug -gt 0 ]; then echo "testoutput_run: listVar(I)='$listVar'" 1>&2 ; fi
217          # check for ptracer output in reference_output file :          # set ref.outp file-name and, if compressed, uncompress it into subdir
218          outpref=$1/results/$3          refoutp=results/$3
219          ptr_mon="trcstat_ptracerXX_min trcstat_ptracerXX_max"          if test ! -r $1/results/$3 ; then
220          ptr_mon="$ptr_mon trcstat_ptracerXX_mean trcstat_ptracerXX_sd"            if test -r $1/results/${3}.gz ; then
221          for ii in $PTRACERS_NUM ; do              tmpNam1=$3
222                tmpNam2=`echo $tmpNam1 | sed 's/\..*\././'`
223                if test "x$tmpNam1" = "x$tmpNam2" ; then
224                    tmpNam1=`echo $tmpNam2 | sed 's/\./.std./'`
225                fi
226                refoutp=$2/$tmpNam1
227                if [ $debug -gt 0 ]; then
228                    echo "testoutput_run: gunzip 'results/$3.gz' into '$refoutp'" 1>&2
229                fi
230                gzip -cd $1/results/${3}.gz > $1/$refoutp
231              else
232                echo "missing reference output file '$3' (.gz) in '$1/results/'"
233              fi
234            fi
235            # check for ptracer output in reference_output file :
236            if test $KIND = 0 ; then
237              ptr_mon="trcstat_ptracerXX_min trcstat_ptracerXX_max"
238              ptr_mon="$ptr_mon trcstat_ptracerXX_mean trcstat_ptracerXX_sd"
239              for ii in $PTRACERS_NUM ; do
240              ptrfound=0              ptrfound=0
241              for jj in $ptr_mon ; do              for jj in $ptr_mon ; do
242                  name=`eval "echo $jj | sed -e 's|XX|0"$ii"|g'"`                  name=`eval "echo $jj | sed -e 's|XX|0"$ii"|g'"`
243                  tst=`grep $name $outpref | wc -l | awk '{print $1}'`                  tst=`grep $name $1/$refoutp | wc -l | awk '{print $1}'`
244                  if test ! "x$tst" = x0 ; then ptrfound=1 ; fi                  if test ! "x$tst" = x0 ; then ptrfound=1 ; fi
245              done              done
246              if test $ptrfound = '1' ; then              if test $ptrfound = '1' ; then
247                  eval "HAVE_PTR0"$ii"=t"                  eval "HAVE_PTR0"$ii"=t"
248              else              else
249                  eval "HAVE_PTR0"$ii"=f"                  eval "HAVE_PTR0"$ii"=f"
               if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; then  
250                # remove this ptr from the list of output variable to check                # remove this ptr from the list of output variable to check
251                # echo "-- ptr test=" $tst "number of var=" `echo $listVar | awk '{print NF}'` 1>&2                # echo "-- ptr test=" $tst "number of var=" `echo $listVar | awk '{print NF}'` 1>&2
252                  listVar=`echo "$listVar" | sed "s/ pt$ii..//g"`                  listVar=`echo "$listVar" | sed "s/ pt$ii..//g"`
               fi  
253              fi              fi
254          #   eval 'echo "HAVE_PTR0'$ii' = $HAVE_PTR0'$ii'"' 1>&2            # eval 'echo "HAVE_PTR0'$ii' = $HAVE_PTR0'$ii'"' 1>&2
255          done            done
256          tst=`echo $sVar $listVar | awk '{ for(i=2;i<=NF;i++){if($i==$1)t+=1}; print t }'`          fi
257          if test $tst != 1 ; then          tst=`echo $sVar $listVar | awk '{ for(i=2;i<=NF;i++){if($i==$1)t+=1}; print t }'`
258            if test $tst = 0 ; then echo "==> WARNING: selected var >$sVar< not found" 1>&2          if test $tst != 1 ; then
259                   else echo "==> WARNING: found selected var >$sVar< $tst times" 1>&2 ; fi            if test $tst = 0 ; then echo "==> WARNING: selected var >$sVar< not found" 1>&2
260            echo "==> WARNING: in checked list:" $listVar 1>&2                   else echo "==> WARNING: found selected var >$sVar< $tst times" 1>&2 ; fi
261          #- put it back once:            echo "==> WARNING: in checked list:" $listVar 1>&2
262            listVar=" $sVar "`echo "$listVar " | sed "s/ $sVar / /g"`          #- put it back once:
263          fi            listVar=" $sVar "`echo "$listVar " | sed "s/ $sVar / /g"`
264            fi
265          if [ $debug -gt 0 ]; then echo "testoutput_run: listVar(M)='$listVar'" 1>&2 ; fi          if [ $debug -gt 0 ]; then echo "testoutput_run: listVar(M)='$listVar'" 1>&2 ; fi
266          echo "listVar='$listVar'" > $CDIR"/summary.txt"          echo "listVar='$listVar'" >> $locDIR"/summary.txt"
267          allargs=""          #---
268          for xx in $listVar          allargs=""
269          do          for xx in $listVar
270            case $xx in          do
271              case $xx in
272             'PS')  if [ $debug -gt 0 ]             'PS')  if [ $debug -gt 0 ]
273                    then echo testoutput_run: testoutput_var $1 cg2d_init_res 1>&2 ; fi                    then echo testoutput_run: testoutput_var $1 cg2d_init_res 1>&2 ; fi
274                    testoutput_var $1 "cg2d_init_res" "Press. Solver (cg2d)" $2 $3; yy=$?                    testoutput_var $1 "cg2d_init_res" "Press. Solver (cg2d)" $2 $refoutp ; yy=$?
275                    if [ $debug -gt 0 ] ; then echo testoutput_run: cg2dres=$yy 1>&2 ; fi ;;                    if [ $debug -gt 0 ] ; then echo testoutput_run: cg2dres=$yy 1>&2 ; fi ;;
276            'Cost') testoutput_var $1 "ADM  precision_derivative_cost" "ADM Cost" $2 $3; yy=$? ;;            'Cost') testoutput_var $1 "ADM  ref_cost_function" "ADM CostFct" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
277            'Grad') testoutput_var $1 "ADM  precision_derivative_grad" "ADM Grad" $2 $3; yy=$? ;;           'AdGrd') testoutput_var $1 "ADM  adjoint_gradient"  "ADM Ad Grad" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
278             'Tmn') testoutput_var $1 "dynstat_theta_min"  "Theta minimum"  $2 $3; yy=$? ;;           'FDGrd') testoutput_var $1 "ADM  finite-diff_grad"  "ADM FD Grad" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
279             'Tmx') testoutput_var $1 "dynstat_theta_max"  "Theta maximum"  $2 $3; yy=$? ;;          'tlmCst') testoutput_var $1 "TLM  ref_cost_function" "TLM CostFct" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
280             'Tav') testoutput_var $1 "dynstat_theta_mean" "Theta mean"     $2 $3; yy=$? ;;          'tlmGrd') testoutput_var $1 "TLM  tangent-lin_grad"  "TLM TL Grad" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
281             'Tsd') testoutput_var $1 "dynstat_theta_sd"   "Theta Std.Dev"  $2 $3; yy=$? ;;          'fwdGrd') testoutput_var $1 "TLM  finite-diff_grad"  "TLM FD Grad" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
282             'Smn') testoutput_var $1 "dynstat_salt_min"  "Salt minimum"    $2 $3; yy=$? ;;             'Tmn') testoutput_var $1 "dynstat_theta_min"  "Theta minimum"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
283             'Smx') testoutput_var $1 "dynstat_salt_max"  "Salt maximum"    $2 $3; yy=$? ;;             'Tmx') testoutput_var $1 "dynstat_theta_max"  "Theta maximum"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
284             'Sav') testoutput_var $1 "dynstat_salt_mean" "Salt mean"       $2 $3; yy=$? ;;             'Tav') testoutput_var $1 "dynstat_theta_mean" "Theta mean"     $2 $refoutp ; yy=$? ;;
285             'Ssd') testoutput_var $1 "dynstat_salt_sd"   "Salt Std.Dev"    $2 $3; yy=$? ;;             'Tsd') testoutput_var $1 "dynstat_theta_sd"   "Theta Std.Dev"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
286             'Umn') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_min"  "U minimum"       $2 $3; yy=$? ;;             'Smn') testoutput_var $1 "dynstat_salt_min"  "Salt minimum"    $2 $refoutp ; yy=$? ;;
287             'Umx') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_max"  "U maximum"       $2 $3; yy=$? ;;             'Smx') testoutput_var $1 "dynstat_salt_max"  "Salt maximum"    $2 $refoutp ; yy=$? ;;
288             'Uav') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_mean" "U mean"          $2 $3; yy=$? ;;             'Sav') testoutput_var $1 "dynstat_salt_mean" "Salt mean"       $2 $refoutp ; yy=$? ;;
289             'Usd') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_sd"   "U Std.Dev"       $2 $3; yy=$? ;;             'Ssd') testoutput_var $1 "dynstat_salt_sd"   "Salt Std.Dev"    $2 $refoutp ; yy=$? ;;
290             'Vmn') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_min"  "V minimum"       $2 $3; yy=$? ;;             'Umn') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_min"  "U minimum"       $2 $refoutp ; yy=$? ;;
291             'Vmx') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_max"  "V maximum"       $2 $3; yy=$? ;;             'Umx') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_max"  "U maximum"       $2 $refoutp ; yy=$? ;;
292             'Vav') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_mean" "V mean"          $2 $3; yy=$? ;;             'Uav') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_mean" "U mean"          $2 $refoutp ; yy=$? ;;
293             'Vsd') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_sd"   "V Std.Dev"       $2 $3; yy=$? ;;             'Usd') testoutput_var $1 "dynstat_uvel_sd"   "U Std.Dev"       $2 $refoutp ; yy=$? ;;
294               'Vmn') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_min"  "V minimum"       $2 $refoutp ; yy=$? ;;
295               'Vmx') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_max"  "V maximum"       $2 $refoutp ; yy=$? ;;
296               'Vav') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_mean" "V mean"          $2 $refoutp ; yy=$? ;;
297               'Vsd') testoutput_var $1 "dynstat_vvel_sd"   "V Std.Dev"       $2 $refoutp ; yy=$? ;;
298          'pt1mn'|'pt2mn'|'pt3mn'|'pt4mn'|'pt5mn') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`          'pt1mn'|'pt2mn'|'pt3mn'|'pt4mn'|'pt5mn') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`
299             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_min"  "p0"$ii"_min"   $2 $3; yy=$? ;;             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_min"  "p0"$ii"_min"   $2 $refoutp ; yy=$? ;;
300          'pt1mx'|'pt2mx'|'pt3mx'|'pt4mx'|'pt5mx') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`          'pt1mx'|'pt2mx'|'pt3mx'|'pt4mx'|'pt5mx') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`
301             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_max"  "p0"$ii"_max"   $2 $3; yy=$? ;;             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_max"  "p0"$ii"_max"   $2 $refoutp ; yy=$? ;;
302          'pt1av'|'pt2av'|'pt3av'|'pt4av'|'pt5av') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`          'pt1av'|'pt2av'|'pt3av'|'pt4av'|'pt5av') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`
303             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_mean" "p0"$ii"_mean" $2 $3; yy=$? ;;             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_mean" "p0"$ii"_mean" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
304          'pt1sd'|'pt2sd'|'pt3sd'|'pt4sd'|'pt5sd') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`          'pt1sd'|'pt2sd'|'pt3sd'|'pt4sd'|'pt5sd') ii=`echo $xx | sed 's/pt//' | sed 's/..$//'`
305             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_sd"   "p0"$ii"_StDv"  $2 $3; yy=$? ;;             testoutput_var $1 "trcstat_ptracer0"$ii"_sd"   "p0"$ii"_StDv"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
306           'Qntmn') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_min" "Qnet minimum"  $2 $3; yy=$? ;;           'Qntmn') testoutput_var $1 "forcing_qnet_min" "Qnet minimum"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
307           'Qntmx') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_max" "Qnet maximum"  $2 $3; yy=$? ;;           'Qntmx') testoutput_var $1 "forcing_qnet_max" "Qnet maximum"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
308           'Qntav') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_mean" "Qnet mean"    $2 $3; yy=$? ;;           'Qntav') testoutput_var $1 "forcing_qnet_mean" "Qnet mean"       $2 $refoutp ; yy=$? ;;
309           'Qntsd') testoutput_var $1 "extforcing_qnet_sd"  "Qnet Std.Dev"  $2 $3; yy=$? ;;           'Qntsd') testoutput_var $1 "forcing_qnet_sd"  "Qnet Std.Dev"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
310           'aSImn') testoutput_var $1 "seaice_area_min"   "SIce Area min"   $2 $3; yy=$? ;;           'aSImn') testoutput_var $1 "seaice_area_min"   "SIce Area min"   $2 $refoutp ; yy=$? ;;
311           'aSImx') testoutput_var $1 "seaice_area_max"   "SIce Area max"   $2 $3; yy=$? ;;           'aSImx') testoutput_var $1 "seaice_area_max"   "SIce Area max"   $2 $refoutp ; yy=$? ;;
312           'aSIav') testoutput_var $1 "seaice_area_mean"  "SIce Area mean"  $2 $3; yy=$? ;;           'aSIav') testoutput_var $1 "seaice_area_mean"  "SIce Area mean"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
313           'aSIsd') testoutput_var $1 "seaice_area_sd"    "SIce Area StDv"  $2 $3; yy=$? ;;           'aSIsd') testoutput_var $1 "seaice_area_sd"    "SIce Area StDv"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
314           'hSImn') testoutput_var $1 "seaice_heff_min"   "SIce Heff min"   $2 $3; yy=$? ;;           'hSImn') testoutput_var $1 "seaice_heff_min"   "SIce Heff min"   $2 $refoutp ; yy=$? ;;
315           'hSImx') testoutput_var $1 "seaice_heff_max"   "SIce Heff max"   $2 $3; yy=$? ;;           'hSImx') testoutput_var $1 "seaice_heff_max"   "SIce Heff max"   $2 $refoutp ; yy=$? ;;
316           'hSIav') testoutput_var $1 "seaice_heff_mean"  "SIce Heff mean"  $2 $3; yy=$? ;;           'hSIav') testoutput_var $1 "seaice_heff_mean"  "SIce Heff mean"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
317           'hSIsd') testoutput_var $1 "seaice_heff_sd"    "SIce Heff StDv"  $2 $3; yy=$? ;;           'hSIsd') testoutput_var $1 "seaice_heff_sd"    "SIce Heff StDv"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
318          'AthSiG') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_G" "thSIc Area Global" $2 $3; yy=$? ;;           'uSImn') testoutput_var $1 "seaice_uice_min"   "SIce Uice min"   $2 $refoutp ; yy=$? ;;
319          'AthSiS') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_S" "thSIc Area South"  $2 $3; yy=$? ;;           'uSImx') testoutput_var $1 "seaice_uice_max"   "SIce Uice max"   $2 $refoutp ; yy=$? ;;
320          'AthSiN') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_N" "thSIc Area North"  $2 $3; yy=$? ;;           'uSIav') testoutput_var $1 "seaice_uice_mean"  "SIce Uice mean"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
321          'HthSiG') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_G" "thSIc H Global"    $2 $3; yy=$? ;;           'uSIsd') testoutput_var $1 "seaice_uice_sd"    "SIce Uice StDv"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
322          'HthSiS') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_S" "thSIc H South"     $2 $3; yy=$? ;;           'vSImn') testoutput_var $1 "seaice_vice_min"   "SIce Vice min"   $2 $refoutp ; yy=$? ;;
323          'HthSiN') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_N" "thSIc H North"     $2 $3; yy=$? ;;           'vSImx') testoutput_var $1 "seaice_vice_max"   "SIce Vice max"   $2 $refoutp ; yy=$? ;;
324                *) yy=99; echo "WARNING: asking for var=$xx : not recognized !" 1>&2 ;;           'vSIav') testoutput_var $1 "seaice_vice_mean"  "SIce Vice mean"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
325            esac           'vSIsd') testoutput_var $1 "seaice_vice_sd"    "SIce Vice StDv"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
326            if test $xx = $sVar          'AthSiG') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_G" "thSIc Area Global" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
327            then allargs="$allargs > $yy <"          'AthSiS') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_S" "thSIc Area South"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
328            else allargs="$allargs $yy"          'AthSiN') testoutput_var $1 "thSI_Ice_Area_N" "thSIc Area North"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
329            fi          'HthSiG') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_G" "thSIc H Glob-ave"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
330          done          'HthSiS') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_S" "thSIc H South-av"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
331            'HthSiN') testoutput_var $1 "thSI_IceH_ave_N" "thSIc H North-av"  $2 $refoutp ; yy=$? ;;
332            'HthMxS') testoutput_var $1 "thSI_IceH_max_S" "thSIc H South-max" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
333            'HthMxN') testoutput_var $1 "thSI_IceH_max_N" "thSIc H North-max" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
334            'StrmIc') testoutput_var $1 "STREAMICE_FP_ERR" "StreamIce Solver" $2 $refoutp ; yy=$? ;;
335                  *) yy=99; echo "WARNING: asking for var=$xx : not recognized !" 1>&2 ;;
336              esac
337              if test $xx = $sVar
338              then allargs="$allargs > $yy <"
339              else allargs="$allargs $yy"
340              fi
341            done
342    
343          nbVar=`echo $listVar | awk '{print NF}'`          nbVar=`echo $listVar | awk '{print NF}'`
344          if [ $nbVar -lt $LEN_CHECK_LIST ] ; then          if [ $nbVar -lt $LEN_CHECK_LIST ] ; then
345          #-- fill line (up to standard length) with dot:          #-- fill line (up to standard length) with dot:
346            adNul=`expr $LEN_CHECK_LIST - $nbVar | awk '{for(i=1;i<=$1;i++){print "."}}'`            adNul=`expr $LEN_CHECK_LIST - $nbVar | awk '{for(i=1;i<=$1;i++){print "."}}'`
347            echo $allargs $adNul            echo $allargs $adNul
348          else          else
349            echo $allargs            echo $allargs
350          fi          fi
351  # <-- same processing for adjoint & forward test  # <-- same processing for adjoint & forward test
352  }  }
353    
# Line 315  genmakemodel() Line 365  genmakemodel()
365          (          (
366              cd $1;              cd $1;
367              command="$GENMAKE2  -ds -m $MAKE"              command="$GENMAKE2  -ds -m $MAKE"
368              if test "x$ADM" = xt ; then              if test "x$MKDEPEND" != x ; then
369                    command="$command -makedepend=$MKDEPEND"
370                fi
371                if test $KIND = 1 -o $KIND = 2 ; then
372                  command="$command --mods=../code_ad"                  command="$command --mods=../code_ad"
373              elif test "x$OADM" = xt ; then              elif test $KIND = 4 ; then
374                  command="$command -adof ../../../tools/adjoint_options/adjoint_oad -mods '../code_oad ../../OpenAD/code_oad_all'"                  command="$command -adof ../../../tools/adjoint_options/adjoint_oad -mods ../code_oad"
375              else              else
376                  command="$command -mods=../code"                  command="$command -mods=../code"
377              fi              fi
378              if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then              if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then
379                  command="$command -optfile=$OPTFILE"                  command="$command -optfile=$OPTFILE"
380              fi              fi
381              if test "x$IEEE" != x ; then              if test $OptLev = 1 ; then
382                  command="$command -ieee"                  command="$command -ieee"
383              fi              fi
384                if test $OptLev = 0 ; then
385                    command="$command -devel"
386                fi
387              if test "x$GSL" = xt ; then              if test "x$GSL" = xt ; then
388                  command="$command -gsl"                  command="$command -gsl"
389              fi              fi
390              if test "x$MPI" = xt ; then              if test "x$MPI" != x0 ; then
391                  command="$command -mpi"                  command="$command -mpi"
392              fi              fi
393              if test "x$MULTI_THREAD" = xt ; then              if test "x$MULTI_THREAD" = xt ; then
394              #- run multi-threaded using OpenMP:              #- run multi-threaded using OpenMP:
395                  command="$command -omp"                  command="$command -omp"
396              fi              fi
397                if test "x$USE_R4" = xt ; then
398                    command="$command -use_r4"
399                fi
400                if test "x$EXTRFLG" != x ; then
401                    command="$command -extra_flag $EXTRFLG"
402                fi
403              if test "x$TS" = xt ; then              if test "x$TS" = xt ; then
404                  command="$command -ts"                  command="$command -ts"
405              fi              fi
406              if test "x$PAPIS" = xt ; then              if test "x$PAPIS" = xt ; then
407                  command="$command -papis"                  command="$command -papis"
408              else              else
409              if test "x$PCLS" = xt ; then              if test "x$PCLS" = xt ; then
410                  command="$command -pcls"                  command="$command -pcls"
411              fi              fi
412              fi              fi
413              printf 'genmake ... ' 1>&2              printf 'genmake ... '
414              # $command > make.log 2>&1              eval $command > genmake.tr_log 2>&1
             eval $command > make.log 2>&1  
415              RETVAL=$?              RETVAL=$?
416              #  Reduce the size of the testing emails!              #  Reduce the size of the testing emails!
417              head -100 Makefile > $CDIR/Makefile_head              head -100 Makefile > $CDIR/Makefile_head
418              if test "x$RETVAL" != x0 ; then              if test "x$RETVAL" != x0 ; then
419                  tail make.log                  tail genmake.tr_log
420                  echo "genmakemodel: genmake failed" 1>&2                  echo "genmakemodel: genmake failed"
421                  cp genmake_* make.log $CDIR                  cp genmake.log genmake_* genmake.tr_log $CDIR
422                  return 1                  return 1
423              else              else
424                  echo "successful" 1>&2                  echo "successful"
425              fi              fi
426          )          )
427      fi      fi
# Line 369  genmakemodel() Line 430  genmakemodel()
430  makeclean()  makeclean()
431  {  {
432      # makeclean directory      # makeclean directory
433        if test "x$NOGENMAKE" = xf ; then rm -f $1/make.tr_log ; fi
434      if test "x$NOCLEAN" = xt ; then      if test "x$NOCLEAN" = xt ; then
435          echo "make Clean skipped!"          echo "make Clean skipped!"
436      else      else
# Line 376  makeclean() Line 438  makeclean()
438              cd $1;              cd $1;
439              #if test -e $OUTPUTFILE ; then rm -f $OUTPUTFILE ; fi              #if test -e $OUTPUTFILE ; then rm -f $OUTPUTFILE ; fi
440              if test -r Makefile ; then              if test -r Makefile ; then
441                  printf 'clean build-dir: make Clean ... ' 2>&1                  printf 'clean build-dir: make Clean ... '
442                  $MAKE Clean >> make.log 2>&1                  $MAKE Clean >> make.tr_log 2>&1
443                  RETVAL=$?                  RETVAL=$?
444                  if test "x$RETVAL" != x0 ; then                  if test "x$RETVAL" != x0 ; then
445                      tail make.log                      tail make.tr_log
446                      echo "makeclean: \"make Clean\" failed" 1>&2                      echo "makeclean: \"make Clean\" failed"
447                      cp make.log $CDIR"/make.log"                      cp make.tr_log genmake.log genmake.tr_log $CDIR
448                      return 1                      return 1
449                  fi                  fi
450                  echo successful 1>&2                  echo successful
451              else              else
452                  echo ''                  echo ''
453              fi              fi
# Line 400  run_clean() Line 462  run_clean()
462      if test "x$NOCLEAN" = xt ; then      if test "x$NOCLEAN" = xt ; then
463          echo "run_clean skipped!"          echo "run_clean skipped!"
464      else      else
465          (        (
466              cd $1;          cd $1;
467              printf 'clean run-dir ... ' 2>&1          printf 'clean run-dir ... '
468              # part of what is done after "make clean" when doing "make CLEAN"          # part of what is done after "make clean" when doing "make CLEAN"
469              find . -name "*.meta" -exec rm {} \;          find . -name "*.meta" -exec rm {} \;
470              find . -name "*.data" -exec rm {} \;          find . -name "*.data" -exec rm {} \;
471              find . -name "fort.*" -exec rm {} \;          find . -name "fort.*" -exec rm {} \;
472              find . -type l -exec rm {} \;          find . -type l -exec rm {} \;
473              rm -f $EXECUTABLE *.txt STD* *diagnostics.log datetime          #- should remove executable only if sym-link (already done above)
474              rm -rf mnc_test_*          rm -f $RUNLOG *.txt STDOUT.* STDERR.* *diagnostics.log *.[0-9][0-9][0-9][0-9].log
475              rm -f *_MIT_CE_000.opt0000 costfunction*0000          rm -f datetime costfinal divided.ctrl snapshot* output_adm.*.diva_*
476              echo successful 1>&2          rm -f *_MIT_CE_000.opt0000 costfunction*0000
477              exit 0          rm -f oad_cp.[0-9][0-9][0-9].?????
478          )          rm -rf mnc_test_*
479            echo successful
480            exit 0
481          )
482      fi      fi
483  }  }
484    
# Line 425  makedependmodel() Line 490  makedependmodel()
490      else      else
491          (          (
492              cd $1;              cd $1;
493              printf 'make depend ... ' 1>&2              printf 'make depend ... '
494              $MAKE depend >> make.log 2>&1              $MAKE depend >> make.tr_log 2>&1
495              RETVAL=$?              RETVAL=$?
496              if test "x$RETVAL" != x0 ; then              if test "x$RETVAL" != x0 ; then
497                  tail make.log                  tail make.tr_log
498                  echo "makedependmodel: make depend failed" 1>&2                  echo "makedependmodel: make depend failed"
499                  cp make.log $CDIR"/make.log"                  cp make.tr_log genmake.log genmake.tr_log $CDIR
500                  return 1                  return 1
501              else              else
502                  echo successful 1>&2                  echo successful
503              fi              fi
504          )          )
505      fi      fi
# Line 444  makemodel() Line 509  makemodel()
509  {  {
510      # makemodel directory      # makemodel directory
511      (      (
512        mk_fail=0
513        if test "x$NOMAKE" = xt ; then
514            cd $1;
515            if test -x $EXECUTABLE ; then
516                echo "make skipped!"
517            else
518                echo "no executable!"
519                mk_fail=3
520            fi
521        else
522          cd $1;          cd $1;
523          if test -r Makefile ; then          if test -r Makefile ; then
524              printf 'make ... ' 1>&2              printf 'make ... '
525              if test "x$ADM" = xt ; then              if test "x$REPLMAKE" = x ; then
526                  $MAKE adall >> make.log 2>&1                  $MAKE $TARG >> make.tr_log 2>&1
527              elif test "x$OADM" = xt ; then              else
528                  $MAKE adAll >> make.log 2>&1                  $REPLMAKE $TARG >> make.tr_log 2>&1
             else  
                 if test "x$JOBS" = x ; then  
                     $MAKE >> make.log 2>&1  
                 else  
                     $MAKE -j $JOBS >> make.log 2>&1  
                 fi  
529              fi              fi
530              RETVAL=$?              RETVAL=$?
531              if test "x$RETVAL" != x0 ; then              if test "x$RETVAL" != x0 ; then
532                  tail make.log                  tail make.tr_log
533                  echo failed 1>&2                  echo failed
534                  cp make.log $CDIR"/make.log"                  cp genmake.log genmake.tr_log $CDIR
535                  return 1                  tail -$NBLINES_MKLOG make.tr_log > $CDIR"/make.tr_log_tail"
536                    rm -f $EXECUTABLE
537                    mk_fail=1
538              else              else
539                  echo successful 1>&2                  echo successful
540              fi              fi
541            else
542                echo "no Makefile !"
543                mk_fail=2
544          fi          fi
545        fi
546        if test $KIND = 1 -a -f taf_ftl.log ; then
547            head -1 taf_ftl.log >> $CDIR"/summary.txt"
548        fi
549        if test $KIND = 2 -a -f taf_ad.log ; then
550            head -1 taf_ad.log >> $CDIR"/summary.txt"
551            nerr=`grep -c 'TAF *.* ERROR ' taf_ad.log`
552            nwar=`grep -c 'TAF RECOMPUTATION *.* WARNING ' taf_ad.log`
553            if test -f taf_output ; then
554                n2er=`grep -c 'TAF *.* ERROR ' taf_output`
555                n3er=`grep -c '\*ERROR\* ' taf_output`
556                nerr=`expr $nerr + $n2er + $n3er`
557            fi
558            echo " TAF reports $nerr Errors and $nwar Recomputation Warnings" \
559                                    >> $CDIR"/summary.txt"
560        fi
561        if test $mk_fail != 0 ; then return $mk_fail ; fi
562      )      )
563  }  }
564    
565    mk_mpi_size()
566    {
567        # mk_mpi_size input_file output_file proc_Nb threads_Nb_X threads_Nb_Y
568        #
569        #  make new SIZE.h (=output_file) from SIZE.h_mpi (=input_file)
570        #     for an MPI build with no more than proc_Nb processors ;
571        #  ensure that enough tiles per proc (nSx,nSy) remain for the given
572        #     number of threads (nTx,nTy) ;
573        #  return the effective number of processors.
574    
575        inp=$1
576        out=$2
577        np=$3
578        tx=$4
579        ty=$5
580        tmp=TTT.$$
581    
582        # dirX : select with direction to favor in MPI process repartition
583        #   dirX=1 : prefer to put more proc in X direction
584        #   dirX=0 : prefer to put more proc in Y direction
585        dirX=0
586    
587        px=`grep "^     & *nPx *=" $inp | sed "s/^     & *nPx *= *//" | sed 's/, *$//'`
588        py=`grep "^     & *nPy *=" $inp | sed "s/^     & *nPy *= *//" | sed 's/, *$//'`
589        sx=`grep "^     & *nSx *=" $inp | sed "s/^     & *nSx *= *//" | sed 's/, *$//'`
590        sy=`grep "^     & *nSy *=" $inp | sed "s/^     & *nSy *= *//" | sed 's/, *$//'`
591    
592        #- for each direction, assume # of threads is a multiple of total number of tiles
593        nx=$px
594        if [ `expr $sx % $tx` -ne 0 -a `expr $sx \* $px % $tx` -eq 0 ] ; then
595            nx=`expr $sx \* $px / $tx`
596            if [ $verbose -gt 1 ]; then
597                echo " change px from $px to $nx to accommodate $tx threads"
598            fi
599        fi
600        ny=$py
601        if [ `expr $sy % $ty` -ne 0 -a `expr $sy \* $py % $ty` -eq 0 ] ; then
602            ny=`expr $sy \* $py / $ty`
603            if [ $verbose -gt 1 ]; then
604                echo " change py from $py to $ny to accommodate $ty threads"
605            fi
606        fi
607        #- find the largest divisor of input_file proc Nb, but not larger than $np
608        pp=0
609        i=1
610        while [ $i -le $nx ] ; do
611          if [ `expr $nx % $i` -eq 0 ] ; then
612            j=1
613            while [ $j -le $ny ] ; do
614              if [ `expr $ny % $j` -eq 0 ] ; then
615                ij=`expr $i \* $j`
616                if [ $ij -gt $pp ] ; then
617                    flag=1
618                elif [ $ij -eq $pp ] ; then
619                    flag=$dirX
620                else
621                    flag=0
622                fi
623                if test $flag = 1 ; then
624                  if [ $ij -le $np ] ; then
625                    ix=$i ; jy=$j ; pp=$ij
626                    #echo "  ix,jy= $ix,$jy"
627                  fi
628                fi
629              fi
630              j=`expr $j + 1`
631            done
632          fi
633          i=`expr $i + 1`
634        done
635    
636        #- create new SIZE.h type file:
637        sx=`expr $sx \* $px / $ix`
638        sy=`expr $sy \* $py / $jy`
639        if [ $verbose -gt 1 ]; then
640            echo " px,py,np= $px,$py,$np : New MPI size: px,py= $ix,$jy : sx,sy= $sx,$sy"
641        fi
642        sed "/^     \& *nPx *=/s/[0-9]*,/$ix,/" $inp > $tmp
643        sed "/^     \& *nPy *=/s/[0-9]*,/$jy,/" $tmp > $out
644        sed "/^     \& *nSx *=/s/[0-9]*,/$sx,/" $out > $tmp
645        sed "/^     \& *nSy *=/s/[0-9]*,/$sy,/" $tmp > $out
646        rm -f $tmp
647        return $pp
648    }
649    
650  symlink_mpifiles()  symlink_mpifiles()
651  {  {
652      # Put special links so that MPI specific files are used      # Put special links so that MPI specific files are used
# Line 479  symlink_mpifiles() Line 655  symlink_mpifiles()
655    
656      dir=$1      dir=$1
657      code_dir=$2      code_dir=$2
658      BUILD_DIR=$dir/$3      build_dir=$dir/$3
659      CODE_DIR=$dir/$code_dir  
       
660      # These are files that should replace their counter-part when using -mpi      # These are files that should replace their counter-part when using -mpi
661      MPI_FILES=`(cd $CODE_DIR; find . -name "*_mpi" -print)`      MPI_FILES=`(cd $dir/$code_dir; find . -name "*_mpi" -print)`
662    
663      #  Is this an MPI run?      for ii in $MPI_FILES ; do
664      if test "x$MPI" = xt ; then          i=`echo $ii | sed 's:^\./::'`
665          # YES: We symbolically link these files to the build          name=`echo $i | sed 's:_mpi::'`
666          # dir so long as there is no real file in place          file="../$code_dir/$i"
667          for ii in $MPI_FILES ; do          if test $name = 'SIZE.h' ; then file="SIZE.h.mpi" ; fi
668              i=`echo $ii | sed 's:^\./::'`  
669              name=`echo $i | sed 's:_mpi::' `          #  Is this an MPI run?
670              cmp $CODE_DIR/$i $BUILD_DIR/$name > /dev/null 2>&1          if test "x$MPI" = x0 ; then
671              RETVAL=$?              # NO: We undo any _mpi symbolically linked files
672              if test "x$RETVAL" != x0 ; then              if test -L $build_dir/$name ; then
673                  if ! test -f $BUILD_DIR/$i ; then                  ( cd $build_dir ; cmp $name $file > /dev/null 2>&1 )
                     #echo Linking $name to $i  
                     (cd $BUILD_DIR; ln -sf ../$code_dir/$i $name)  
                 fi  
             fi  
         done  
     else  
         # NO: We undo any _mpi symbolically linked files  
         for ii in $MPI_FILES ; do  
             i=`echo $ii | sed 's:^\./::'`  
             name=`echo $i | sed 's:_mpi::' `  
             if test -L $BUILD_DIR/$name ; then  
                 cmp $BUILD_DIR/$name "../$code_dir/$name"_mpi > /dev/null 2>&1  
674                  RETVAL=$?                  RETVAL=$?
675                  if test "x$RETVAL" = x0 ; then                  if test "x$RETVAL" = x0 ; then
676                      #echo Un-linking $name from $linktarg                      if [ $verbose -gt 1 ]; then
677                      rm -f $BUILD_DIR/$name                          echo "  Un-linking $name from ../$code_dir" ; fi
678                        rm -f $build_dir/$name
679                  fi                  fi
680              fi              fi
681          done          else
682      fi              # YES: We symbolically link these files to the build
683                    # dir so long as there is no real file in place
684                ( cd $build_dir ; cmp $name $file > /dev/null 2>&1 )
685                RETVAL=$?
686                if [ $verbose -gt 1 ]; then echo "  cmp $name $file returns: $RETVAL" ; fi
687                if test "x$RETVAL" != x0 ; then
688                    if test -h $build_dir/$name ; then rm -f $build_dir/$name ; fi
689                    if test ! -r $build_dir/$name ; then
690                        if [ $verbose -gt 1 ]; then echo "  Linking $name to $file" ; fi
691                        (cd $build_dir; ln -sf $file $name)
692                    fi
693                fi
694            fi
695        done
696  }  }
697    
698  linkdata()  linkdata()
# Line 527  linkdata() Line 703  linkdata()
703      if test -d $1 ; then      if test -d $1 ; then
704          (          (
705              cd $1 ; shift              cd $1 ; shift
706              inpMPI=`(cd ../$1 ; find . -name "*.mpi" -print | sed 's:^\./::')`              echo 'linkdata from dirs:' $*
707                inpMPI=`(cd ../$1 ; find . -name "*.mpi" -print | sed 's:^\./::')`
708              for xx in $inpMPI ; do              for xx in $inpMPI ; do
709                if test -r "../"$1"/"$xx ; then                if test -r "../"$1"/"$xx ; then
710                  # found 1 _mpi sfx file in 1rst input dir and it is readable                  # found 1 _mpi sfx file in 1rst input dir and it is readable
711                  yy=`echo $xx | sed 's:\.mpi$::'`                  yy=`echo $xx | sed 's:\.mpi$::'`
712                  if test "x$MPI" = "xt" ; then                  if test "x$MPI" = "x0" ; then
713                  # mpi test: remove symbolic link & link _mpi sfx file                      # not mpi test: remove symbolic link
714                      if test -h $yy ; then rm -f $yy ; fi                      if test -h $yy ; then rm -f $yy ; fi
                     if test ! -r $yy ; then  
                         ln -sf "../"$1"/"$xx $yy ;  
                         printf "$xx " 1>&2  
                     fi  
715                  else                  else
716                  # not mpi test: remove symbolic link                      # mpi test: remove symbolic link & link .mpi sfx file
717                      if test -h $yy ; then rm -f $yy ; fi                      if test -h $yy ; then rm -f $yy ; fi
718                        if test ! -r $yy ; then
719                            ln -sf "../"$1"/"$xx $yy ;
720                            printf " $xx" 1>&2
721                        fi
722                  fi                  fi
723                fi                fi
724              done              done
# Line 550  linkdata() Line 727  linkdata()
727                  if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then                  if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
728                  # multi-threaded test: remove symbolic link & link eedata.mth                  # multi-threaded test: remove symbolic link & link eedata.mth
729                      if test -h eedata ; then rm -f eedata ; fi                      if test -h eedata ; then rm -f eedata ; fi
730                      if test ! -r eedata ; then                      if test ! -r eedata ; then
731                          ln -sf "../"$1"/eedata.mth" eedata ;                          ln -sf "../"$1"/eedata.mth" eedata ;
732                          printf 'eedata.mth ' 1>&2                          printf ' eedata.mth' 1>&2
733                      fi                      fi
734                  else                  else
735                  # not multi-threaded test: remove eedata symbolic link                  # not multi-threaded test: remove eedata symbolic link
# Line 562  linkdata() Line 739  linkdata()
739              prevDir='NONE'              prevDir='NONE'
740              for ldir in $* ; do              for ldir in $* ; do
741                  if test -d "../"$ldir -a $ldir != $prevDir ; then                  if test -d "../"$ldir -a $ldir != $prevDir ; then
742                      printf 'ldir='${ldir} 1>&2                      printf " ldir=${ldir}:" 1>&2
743                      files=`( cd "../"$ldir ; ls -1 | grep -v CVS )`                      files=`( cd "../"$ldir ; ls -1 | grep -v CVS )`
744                      for i in $files ; do                      for i in $files ; do
745                          if test ! -d "../"$ldir/$i ; then                          if test ! -d "../"$ldir/$i ; then
# Line 572  linkdata() Line 749  linkdata()
749                              fi                              fi
750                          fi                          fi
751                      done                      done
752                        printf ' ;' 1>&2
753                      if test -x "../"$ldir"/"prepare_run ; then                      if test -x "../"$ldir"/"prepare_run ; then
754                          "../"$ldir"/"prepare_run                          "../"$ldir"/"prepare_run 1>&2
755                        else
756                            echo '' 1>&2
757                      fi                      fi
                     printf ' ; ' 1>&2  
758                  fi                  fi
759                  prevDir=$ldir                  prevDir=$ldir
760              done              done
# Line 587  runmodel() Line 766  runmodel()
766  {  {
767      # runmodel directory      # runmodel directory
768      #      #
769      #  runs "$COMMAND in "directory"      #  runs $COMMAND in "directory"
770      #  (where "$COMMAND" is relative to "directory")      #  (where "$COMMAND" is relative to "directory")
771      (      (
772          cd $1          cd $1
773          printf 'runmodel in %s ...' $1 1>&2          printf 'runmodel in %s ... ' $1
774          # make output.txt          if test "x$MPI" != x0 ; then
775          echo              #- adjust the MPI run command with the right number of Procs
776          if test -L $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then              #echo '' ; echo "  COMMAND='$COMMAND'"
777              diff -q $EXECUTABLE "../"$builddir"/"$EXECUTABLE > /dev/null 2>&1              COMMAND=`echo $COMMAND | sed "s/ TR_NPROC / $LOC_NPROC /"`
778              outD=$? ; if test $outD != 0 ; then rm -f $EXECUTABLE ; fi              if test "x$MPI_MFILE" != x ; then
779                  COMMAND=`echo $COMMAND | sed "s/ TR_MFILE / ..\/..\/$LOC_MFILE /"`
780                fi
781                #echo "  COMMAND='$COMMAND'"
782            fi
783            if test -L $EXECUTABLE ; then
784              if test -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then
785                cmp $EXECUTABLE "../"$builddir"/"$EXECUTABLE > /dev/null 2>&1
786                outD=$? ; if test "x$outD" != x0 ; then rm -f $EXECUTABLE ; fi
787              else rm -f $EXECUTABLE
788              fi
789          fi          fi
790          if test ! -x $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then          if test ! -x $EXECUTABLE -a -x "../"$builddir"/"$EXECUTABLE ; then
791              echo " link" $EXECUTABLE "from dir ../"$builddir > run.log_tmp              echo " link" $EXECUTABLE "from dir ../"$builddir > run.log_tmp
792              ln -sf "../"$builddir"/"$EXECUTABLE .              ln -sf "../"$builddir"/"$EXECUTABLE .
793          fi          fi
794          if test ! -x $EXECUTABLE ; then          if test ! -x $EXECUTABLE ; then
795                  rm -f $RUNLOG ; touch $RUNLOG              rm -f $RUNLOG ; touch $RUNLOG
796                  if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi              if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi
797                  echo " no executable:" $EXECUTABLE >> $RUNLOG              echo " no executable:" $EXECUTABLE >> $RUNLOG
798                  RETVAL=8              RETVAL=8
799                  ENDVAL=-1              ENDVAL=-1
800          else          else
801              if test ! -f $OUTPUTFILE -o $OUTPUTFILE -ot $EXECUTABLE ; then            if test ! -f $OUTPUTFILE -o $OUTPUTFILE -ot $EXECUTABLE ; then
802                # output do not exist or is older than executable:              # output do not exist or is older than executable:
803                  rm -f $RUNLOG ; touch $RUNLOG              rm -f $OUTPUTFILE $RUNLOG ; touch $RUNLOG
804                  if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi              if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi
805                  ( eval $COMMAND ) >> $RUNLOG 2>&1          #- Divided Adjoint Run:
806                  RETVAL=$?          #  get the number of additional runs (add_DIVA_runs) from file "run_ADM_DIVA"
807              else              if test $KIND = 2 -a -f run_ADM_DIVA ; then
808                  RETVAL=0                adm_diva_nb=`sed -n '/^ *add_DIVA_runs\>.*=/p' run_ADM_DIVA | sed 's/ //g'`
809                  if test -f $RUNLOG ; then                echo " Divided Adjoint Run: $adm_diva_nb" >> $RUNLOG
810                      if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi                eval "let $adm_diva_nb"
811                      echo "---------->> $OUTPUTFILE is up to date " >> $RUNLOG 2>&1                if [ $add_DIVA_runs -ge 1 ] ; then
812                  else                  rm -f costf* divided.ctrl snapshot*
813                      touch $RUNLOG                  echo -n "(add_DIVA_runs=$add_DIVA_runs) ... "
814                      if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi                  for ii in `seq 1 $add_DIVA_runs` ; do
815                      echo "---------->> $OUTPUTFILE is up to date " >> $RUNLOG 2>&1                    ( eval $COMMAND ) >> $RUNLOG 2>&1
816                      echo " no previous $RUNLOG: assume NORMAL END" >> $RUNLOG 2>&1                    echo " additional DIVA run # $ii : done" >> $RUNLOG
817                  fi                    mv -f $OUTPUTFILE ${OUTPUTFILE}.diva_${ii}
818                    done
819                  fi
820                fi
821            #- special DIVA processing ends here
822                ( eval $COMMAND ) >> $RUNLOG 2>&1
823                RETVAL=$?
824                ENDVAL=`tail $OUTPUTFILE | grep -c 'PROGRAM MAIN: Execution ended Normally'`
825                if [ $POSTCLEAN -eq 1 -a $ENDVAL -gt 0 ] ; then
826                    find . -name "*.meta" -exec rm {} \;
827                    find . -name "*.data" -exec rm {} \;
828                    rm -rf mnc_test_*
829              fi              fi
830              ENDVAL=`cat $RUNLOG | grep -v 'ABNORMAL END' | grep -c 'NORMAL END'`            else
831                RETVAL=0
832                ENDVAL=`tail $OUTPUTFILE | grep -c 'PROGRAM MAIN: Execution ended Normally'`
833                touch $RUNLOG
834                if test -f run.log_tmp ; then cat run.log_tmp >> $RUNLOG ; fi
835                echo "---------->> $OUTPUTFILE is up to date " >> $RUNLOG 2>&1
836              fi
837          fi          fi
838          rm -f run.log_tmp          rm -f run.log_tmp
839          #if test "x$RETVAL" = x0 ; then          #- in all cases where OutputFile exists, report SIZE and time
840            if test -f $OUTPUTFILE ; then
841              grep '(PID\.TID 0000\.0001)      n.. =' $OUTPUTFILE \
842                    | sed 's/(PID.TID 0000.0001)   //' >> $CDIR"/summary.txt"
843              grep -A3 'Seconds in section "ALL' $OUTPUTFILE \
844                    | sed 's/(PID.TID 0000.0001)   //' >> $CDIR"/summary.txt"
845            fi
846            if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi
847          if [ $RETVAL -eq 0 -a $ENDVAL -gt 0 ] ; then          if [ $RETVAL -eq 0 -a $ENDVAL -gt 0 ] ; then
848              tail $RUNLOG              echo successful
849              echo successful 1>&2              printf '=> output from running in %s :\n' $1 1>&2
850              # === Reduce the size of the testing emails!              tail $RUNLOG | sed 's/^.*/> &/g' 1>&2
851              #cp $OUTPUTFILE $CDIR"/"$OUTPUTFILE              return 0
852              if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi          elif [ $RETVAL -ne 0 -a $ENDVAL -gt 0 ] ; then
853                #-- for some weird cases (run is finihed but with error code)
854                echo 'finished with error (run:' $RETVAL ' end:' $ENDVAL ')'
855                printf '=> output from running in %s :\n' $1 1>&2
856                tail $RUNLOG | sed 's/^.*/> &/g' 1>&2
857              return 0              return 0
858          else          else
859              tail $RUNLOG              echo 'failed (run:' $RETVAL ' end:' $ENDVAL ')'
860              echo failed '(run:' $RETVAL ' end:' $ENDVAL ')' 1>&2              printf '=> output from running in %s :\n' $1 1>&2
861                tail $RUNLOG | sed 's/^.*/> &/g' 1>&2
862              cp $RUNLOG $CDIR"/"$RUNLOG              cp $RUNLOG $CDIR"/"$RUNLOG
             if test -s STDERR.0000 ; then cp STDERR.0000 $CDIR"/STDERR.0000" ; fi  
863              return 1              return 1
864          fi          fi
865      )      )
# Line 692  EOF Line 909  EOF
909          return 0          return 0
910      else      else
911          echo          echo
912          echo "ERROR: failed to compile comparison code -- please specify"          echo "ERROR: failed to compile comparison code -- please specify"
913          echo "  a C compiler using the CC environment variable."          echo "  a C compiler using the CC environment variable."
914          exit 1          exit 1
915      fi      fi
# Line 711  formatresults() Line 928  formatresults()
928      printf '%3s' $listPrt      printf '%3s' $listPrt
929  #   line below does not work on hp-ux_ia64 : do those substitutions later on  #   line below does not work on hp-ux_ia64 : do those substitutions later on
930  #   printf '%3s' $listPrt | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</'  #   printf '%3s' $listPrt | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</'
931        
932      if [ $xx = '..' ]; then      if [ $xx = '..' ]; then
933          printf ' N/O '          printf ' N/O '
934      elif [ $xx = '--' ]; then      elif [ $xx = '--' ]; then
# Line 726  formatresults() Line 943  formatresults()
943          fi          fi
944      fi      fi
945      printf '  %s' $nm      printf '  %s' $nm
946        if test $KIND = 2 ; then
947            #-- apppend taf repport summary:
948            tafrep=`grep -c '^ TAF reports ' $CDIR/summary.txt`
949            if test $tafrep = 1 ; then
950                grep '^ TAF reports ' $CDIR/summary.txt | awk '{printf "  (e=%i, w=%i)",$3,$6}'
951            fi
952        fi
953      printf '\n'      printf '\n'
954        
955  }  }
956    
957  scandirs()  scandirs()
958  {  {
959      if [ $# -eq 1 ]; then      if [ $# -eq 1 ]; then
960          for arg in * ; do          for arg in * ; do
961              test -f $arg/$1 && echo $arg             #test -f $arg/$1 && echo $arg
962                test -f $arg/$1 -o -f $arg/$1.gz && echo $arg
963          done          done
964      else      else
965          echo $*          echo $*
# Line 744  scandirs() Line 969  scandirs()
969    
970  check_eedata()  check_eedata()
971  {  {
972      # check_eedata size.h eedata      # check_eedata eedata size.h
973      if [ $# -eq 2 ] ; then      if [ $# -eq 2 ] ; then
974        if test -f $1 -a -f $2 ; then       if test -f $1 -a -f $2 ; then
975        sx=`grep "^     & *nSx *=" $1 | sed "s/^     & *nSx *=//" | sed 's/, *$//'`        nx=`grep "^ *nTx *=" $1 | tail -1 | sed 's/^ *nTx *= *//' | sed "s/, *$//"`
976        nx=`grep "^ *nTx *=" $2 | tail -1 | sed 's/^ *nTx *= *//' | sed "s/, *$//"`        sx=`grep "^     & *nSx *=" $2 | sed "s/^     & *nSx *=//" | sed 's/, *$//'`
977        if test "x$nx" = x ; then        if test "x$nx" = x ; then
978          rx=10          rx=10
979        else        else
980          rx=`expr $sx % $nx`          rx=`expr $sx % $nx`
981        fi        fi
982        sy=`grep "^     & *nSy *=" $1 | sed "s/^     & *nSy *=//" | sed 's/, *$//'`        ny=`grep "^ *nTy *=" $1 | tail -1 | sed 's/^ *nTy *= *//' | sed "s/, *$//"`
983        ny=`grep "^ *nTy *=" $2 | tail -1 | sed 's/^ *nTy *= *//' | sed "s/, *$//"`        sy=`grep "^     & *nSy *=" $2 | sed "s/^     & *nSy *=//" | sed 's/, *$//'`
984        if test "x$ny" = x ; then        if test "x$ny" = x ; then
985          ry=20          ry=20
986        else        else
987          ry=`expr $sy % $ny`          ry=`expr $sy % $ny`
988        fi        fi
989        echo `expr $rx + $ry`        echo `expr $rx + $ry`
990      else       else
991        echo '-1'        echo '-1'
992        fi       fi
993        elif [ $# -eq 1 ] ; then
994         if test -f $1 ; then
995          nx=`grep "^ *nTx *=" $1 | tail -1 | sed 's/^ *nTx *= *//' | sed "s/, *$//"`
996          if test "x$nx" = x ; then nx=1 ; fi
997          ny=`grep "^ *nTy *=" $1 | tail -1 | sed 's/^ *nTy *= *//' | sed "s/, *$//"`
998          if test "x$ny" = x ; then ny=1 ; fi
999         #echo $nx $ny
1000          echo $nx
1001         else
1002          echo '-1'
1003         fi
1004      else      else
1005        echo '-2'        echo '-2'
1006      fi      fi
# Line 777  check_eedata() Line 1013  check_eedata()
1013  #  Default properties  #  Default properties
1014  debug=0  debug=0
1015  verbose=1  verbose=1
1016  clean=0  NBLINES_MKLOG=16000
1017    
1018  IEEE=true  OptLev=1
 if test "x$MITGCM_IEEE" != x ; then  
     IEEE=$MITGCM_IEEE  
 fi  
1019  GSL=f  GSL=f
1020    
1021  CLEANUP=f  CLEANUP=f
1022    NORUN=f
1023  QUICK=f  QUICK=f
1024    NOMAKE=f
1025  NOGENMAKE=f  NOGENMAKE=f
1026  NOCLEAN=f  NOCLEAN=f
1027  NODEPEND=f  NODEPEND=f
1028  POSTCLEAN=f  POSTCLEAN=0
1029    
1030  BASH=  BASH=
1031  OPTFILE=NONE  OPTFILE=NONE
# Line 800  SKIPDIRS= Line 1035  SKIPDIRS=
1035  MPACKDIR="../tools/mpack-1.6"  MPACKDIR="../tools/mpack-1.6"
1036  HAVE_MPACK=  HAVE_MPACK=
1037  MPACK=  MPACK=
1038    SENDCMD=
1039    SAVDIR='.'
1040  COMMAND=  COMMAND=
1041    MKDEPEND=
1042  if test "x$MAKE" = x ; then  if test "x$MAKE" = x ; then
1043      MAKE=make      MAKE=make
1044  fi  fi
1045    REPLMAKE=
1046  if test "x$CC" = x ; then  if test "x$CC" = x ; then
1047      CC=cc      CC=cc
1048  fi  fi
1049  JOBS=  JOBS=
1050  MPI=f  TARG=
1051    MPI=0
1052    MPI_MFILE=
1053  MULTI_THREAD=f  MULTI_THREAD=f
1054  OUTDIR=  OUTDIR=
1055  DELDIR=  DELDIR=
1056    USE_R4=
1057    EXTRFLG=
1058    
1059  ADM=  #- type of testing (KIND):
1060  OADM=  #   KIND=0 : forward (= default) ;  KIND=1 : Tangent Linear with TAF ;
1061    #   KIND=2 : Adjoint with TAF ;     KIND=4 : Adjoint with OpenAD
1062    KIND=0
1063    
1064  # list of pTracers to check for monitor output  # list of pTracers to check for monitor output
1065  PTRACERS_NUM="1 2 3 4 5"  PTRACERS_NUM="1 2 3 4 5"
1066    
1067  MATCH_CRIT=13  MATCH_CRIT=10
1068    
1069  printf "parsing options...  "  printf "parsing options...  "
1070    
# Line 834  for ac_option ; do Line 1079  for ac_option ; do
1079      fi      fi
1080    
1081      ac_optarg=`expr "x$ac_option" : 'x[^=]*=\(.*\)'`      ac_optarg=`expr "x$ac_option" : 'x[^=]*=\(.*\)'`
1082        
1083      case $ac_option in      case $ac_option in
1084                    
1085          -help | --help | -h | --h)          -help | --help | -h | --h) usage ;;
1086              usage ;;  
1087                    -optfile | --optfile | -of | --of) ac_prev=OPTFILE ;;
1088          -optfile | --optfile | -of | --of)          -optfile=* | --optfile=* | -of=* | --of=*) OPTFILE=$ac_optarg ;;
1089              ac_prev=OPTFILE ;;  
1090          -optfile=* | --optfile=* | -of=* | --of=*)          -addr | --addr | -a | --a) ac_prev=ADDRESSES ;;
1091              OPTFILE=$ac_optarg ;;          -addr=* | --addr=* | -a=* | --a=*) ADDRESSES=$ac_optarg ;;
1092                    -mpackdir | --mpackdir | -mpd | --mpd) ac_prev=MPACKDIR ;;
1093          -addr | --addr | -a | --a)          -mpackdir=* | --mpackdir=* | -mpd=* | --mpd=*) MPACKDIR=$ac_optarg ;;
1094              ac_prev=ADDRESSES ;;  
1095          -addr=* | --addr=*)          -send | --send ) ac_prev=SENDCMD ;;
1096              ADDRESSES=$ac_optarg ;;          -send=* | --send=* ) SENDCMD=$ac_optarg ;;
1097          -mpackdir | --mpackdir | -mpd | --mpd)          -savdir | --savdir | -sd | --sd ) ac_prev=SAVDIR ;;
1098              ac_prev=MPACKDIR ;;          -savdir=* | --savdir=* | -sd=* | --sd=* ) SAVDIR=$ac_optarg ;;
1099          -mpackdir=* | --mpackdir=* | -mpd=* | --mpd=*)  
1100              MPACKDIR=$ac_optarg ;;          -tdir | --tdir | -t | --t) ac_prev=TESTDIRS ;;
1101            -tdir=* | --tdir=* | -t=* | --t=*) TESTDIRS=$ac_optarg ;;
1102          -tdir | --tdir | -t | --t)          -skipdir | --skipdir | -skd | --skd) ac_prev=SKIPDIRS ;;
1103              ac_prev=TESTDIRS ;;          -skipdir=* | --skipdir=* | -skd=* | --skd=*) SKIPDIRS=$ac_optarg ;;
1104          -tdir=* | --tdir=*)  
1105              TESTDIRS=$ac_optarg ;;          -bash | --bash | -b | --b) ac_prev=BASH ;;
1106            -bash=* | --bash=* | -b=* | --b=*) BASH=$ac_optarg ;;
1107          -skipdir | --skipdir | -skd | --skd)  
1108              ac_prev=SKIPDIRS ;;          -command | --command | -c | --c) ac_prev=COMMAND ;;
1109          -skipdir=* | --skipdir=*)          -command=* | --command=* | -c=* | --c=*) COMMAND=$ac_optarg ;;
1110              SKIPDIRS=$ac_optarg ;;  
1111            -makedepend | --makedepend | -md | --md) ac_prev=MKDEPEND ;;
1112          -bash | --bash | -b | --b)          -makedepend=* | --makedepend=* | -md=* | --md=*) MKDEPEND=$ac_optarg ;;
1113              ac_prev=BASH ;;  
1114          -bash=* | --bash=*)          -make | --make | -m | --m) ac_prev=MAKE ;;
1115              BASH=$ac_optarg ;;          -make=* | --make=* | -m=* | --m=*) MAKE=$ac_optarg ;;
1116    
1117          -command | --command | -c | --c)          -repl_mk | --repl_mk ) ac_prev=REPLMAKE ;;
1118              ac_prev=COMMAND ;;          -repl_mk=* | --repl_mk=*) REPLMAKE=$ac_optarg ;;
1119          -command=* | --command=*)  
1120              COMMAND=$ac_optarg ;;          -odir | --odir) ac_prev=OUTDIR ;;
1121            -odir=* | --odir=*) OUTDIR=$ac_optarg ;;
1122          -make | --make | -m | --m)  
1123              ac_prev=MAKE ;;          -ptracers | --ptracers | -ptr | --ptr) ac_prev=PTRACERS_NUM ;;
1124          -make=* | --make=*)          -ptracers=* | --ptracers=* | -ptr=* | --ptr=*) PTRACERS_NUM=$ac_optarg ;;
             MAKE=$ac_optarg ;;  
   
         -odir | --odir)  
             ac_prev=OUTDIR ;;  
         -odir=* | --odir=*)  
             OUTDIR=$ac_optarg ;;  
   
         -ptracers | --ptracers | -ptr | --ptr)  
             ac_prev=PTRACERS_NUM ;;  
         -ptracers=* | --ptracers=* | -ptr=* | --ptr=*)  
             PTRACERS_NUM=$ac_optarg ;;  
1125    
1126          -match | --match ) ac_prev=MATCH_CRIT ;;          -match | --match ) ac_prev=MATCH_CRIT ;;
1127          -match=* | --match=* ) MATCH_CRIT=$ac_optarg ;;          -match=* | --match=* ) MATCH_CRIT=$ac_optarg ;;
1128    
1129          -j) ac_prev=JOBS ;;          -j | --j) ac_prev=JOBS ;;
1130          -j=*) JOBS=$ac_optarg ;;          -j=* | --j=*) JOBS=$ac_optarg ;;
1131    
1132          -clean | --clean)          -ef | --ef) ac_prev=EXTRFLG ;;
1133              CLEANUP=t ; DELDIR=t ;;          -ef=* | --ef=*) EXTRFLG=$ac_optarg ;;
1134    
1135          -quick | --quick | -q | --q)          -clean | --clean) CLEANUP=t ; DELDIR=t ;;
             QUICK=t ;;  
         -nogenmake | --nogenmake | -ng | --ng)  
             NOGENMAKE=t ;;  
         -noclean | --noclean | -nc | --nc)  
             NOCLEAN=t ;;  
         -nodepend | --nodepend | -nd | --nd)  
             NODEPEND=t ;;  
1136    
1137          -postclean | --postclean | -pc | --pc)          -norun | --norun | -nr | --nr) NORUN=t ;;
1138              POSTCLEAN=t ;;          -obj | --obj ) TARG='obj' ; NORUN=t ;;
1139            -runonly | --runonly | -ro | --ro) QUICK=t ; NOMAKE=t ;;
1140            -quick | --quick | -q | --q) QUICK=t ;;
1141            -nogenmake | --nogenmake | -ng | --ng) NOGENMAKE=t ;;
1142            -noclean | --noclean | -nc | --nc) NOCLEAN=t ;;
1143            -nodepend | --nodepend | -nd | --nd) NODEPEND=t ;;
1144    
1145            -postclean | --postclean | -pc | --pc) POSTCLEAN=2 ;;
1146            -deloutp | --deloutp | -do | --do) POSTCLEAN=1 ;;
1147    
1148            -mpi | --mpi) MPI=2 ;;
1149            -MPI | --MPI) ac_prev=MPI ;;
1150            -MPI=* | --MPI=*) MPI=$ac_optarg ;;
1151    
1152          -mpi) MPI=t ;;          -mfile | --mfile | -mf | --mf) ac_prev=MPI_MFILE ;;
1153            -mfile=* | --mfile=* | -mf=* | --mf=*) MPI_MFILE=$ac_optarg ;;
1154    
1155          -mth) MULTI_THREAD=t ;;          -mth) MULTI_THREAD=t ;;
1156    
1157          -adm | -ad) ADM=t ;;          -tlm) if test $KIND = 0 ; then KIND=1 ; else
1158                    echo "Error: '-tlm', '-adm' and '-oad' are exclusive" ; usage
1159          -oad) OADM=t; NODEPEND=t ;;                fi ;;
1160            -adm | -ad) if test $KIND = 0 ; then KIND=2 ; else
1161          -ieee) IEEE=true ;;                  echo "Error: '-tlm', '-adm' and '-oad' are exclusive" ; usage
1162          -noieee) IEEE= ;;                fi ;;
1163          -gsl) GSL=t ;;          -oad) if test $KIND = 0 ; then KIND=4 ; NODEPEND=t ; else
1164                    echo "Error: '-tlm', '-adm' and '-oad' are exclusive" ; usage
1165                  fi ;;
1166    
1167            -ieee)   echo "Warning: ignore option '-ieee' (already the default)"
1168                     printf " ... " ;;
1169            -noieee) echo "Warning: will use option '-fast' instead of '-noieee' (obsolete)"
1170                     printf " ... " ; OptLev=`expr $OptLev \* 2` ;;
1171            -fast)  OptLev=`expr $OptLev \* 2` ;;
1172            -devel) OptLev=0 ;;
1173            -gsl) GSL=t ;;
1174    
1175          -verbose) verbose=2 ;;          -verbose) verbose=2 ;;
1176          -debug) debug=1 ;;          -debug) debug=1 ;;
# Line 928  for ac_option ; do Line 1178  for ac_option ; do
1178    
1179          -deldir | -dd) DELDIR=t ;;          -deldir | -dd) DELDIR=t ;;
1180    
1181          -ts) TS=t;;          -use_r4|-ur4) USE_R4=t ;;
1182    
1183            -ts) TS=t;;
1184          -papis) PAPIS=t;;          -papis) PAPIS=t;;
   
1185          -pcls) PCL=t;;          -pcls) PCL=t;;
1186    
1187          -*)          -*) echo "Error: unrecognized option: "$ac_option
1188              echo "Error: unrecognized option: "$ac_option              usage ;;
1189              usage          *)  echo "Error: unrecognized argument: "$ac_option
1190              ;;              usage ;;
1191            
         *)  
             echo "Error: unrecognized argument: "$ac_option  
             usage  
             ;;  
           
1192       esac       esac
1193        
1194  done  done
1195    
1196  if test "x$QUICK" = xt ; then  if test "x$QUICK" = xt ; then
# Line 954  if test "x$QUICK" = xt ; then Line 1199  if test "x$QUICK" = xt ; then
1199      NODEPEND=t      NODEPEND=t
1200  fi  fi
1201    
1202    #- check length of MPI machine file:
1203    if test "x$MPI" != x0 -a "x$MPI_MFILE" != x ; then
1204        if test -r $MPI_MFILE ; then
1205            nl=`wc -l $MPI_MFILE | awk '{print $1}'`
1206            if [ $nl -lt $MPI ] ; then
1207              echo "Error: need at least $MPI nodes (currently only $nl) in MPI_MFILE=$MPI_FILE"
1208              usage
1209            fi
1210            if [ $verbose -gt 1 ]; then
1211                echo " MPI_MFILE=$MPI_MFILE : $nl procs for MPI=$MPI run"
1212            fi
1213        else
1214              echo "Error: cannot access MPI_MFILE=$MPI_FILE"
1215              usage
1216        fi
1217    fi
1218    
1219  #- setting for forward or ADM testing  #- setting for forward or ADM testing
1220  if test "x$ADM" = xt ; then  if test $KIND = 1 ; then
1221        TARG=ftlall
1222        code_dir=code_ad
1223        inputdir=input_ad
1224        ref_outp="output_tlm.txt"
1225        EXECUTABLE="mitgcmuv_ftl"
1226    elif test $KIND = 2 ; then
1227        if test "x$TARG" = xobj ; then TARG=adobj ; else TARG=adall ; fi
1228      code_dir=code_ad      code_dir=code_ad
1229      inputdir=input_ad      inputdir=input_ad
1230      ref_outp="output_adm.txt"      ref_outp="output_adm.txt"
1231      EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"      EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"
1232  elif test "x$OADM" = xt ; then  elif test $KIND = 4 ; then
1233        TARG=adAll
1234      code_dir=code_oad      code_dir=code_oad
1235      inputdir=input_oad      inputdir=input_oad
1236      ref_outp="output_oadm.txt"      ref_outp="output_oadm.txt"
1237      EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"      EXECUTABLE="mitgcmuv_ad"
1238  else  else
1239        if test "x$JOBS" != x ; then TARG="-j $JOBS $TARG" ; fi
1240      code_dir=code      code_dir=code
1241      inputdir=input      inputdir=input
1242      ref_outp="output.txt"      ref_outp="output.txt"
1243      EXECUTABLE="mitgcmuv"      EXECUTABLE="mitgcmuv"
1244  fi  fi
1245    
1246    xx=`echo $TESTDIRS | awk '{print $1}'`
1247  if test "x$TESTDIRS" = x ; then  if test "x$TESTDIRS" = x ; then
1248      LIST=`scandirs results/$ref_outp`      LIST=`scandirs results/$ref_outp`
1249    elif test $xx = 'start_from' ; then
1250        xx=`echo $TESTDIRS | awk '{print $2}'`
1251        LIST=`scandirs results/$ref_outp | sed -n "/$xx/,$ p"`
1252  else  else
1253      #- expand group of experiments:      #- expand group of experiments:
1254      LIST=" "      LIST=" "
# Line 988  else Line 1263  else
1263                   LIST=${LIST}" "`ls | grep 'tutorial_'` ;;                   LIST=${LIST}" "`ls | grep 'tutorial_'` ;;
1264          *)       LIST=${LIST}" "$xx ;;          *)       LIST=${LIST}" "$xx ;;
1265        esac        esac
1266      done      done
1267  fi  fi
1268  #echo 'LIST='${LIST}'<'  #echo 'LIST='${LIST}'<'
1269  #- skip dirs, remove duplicate and non-directory:  #- skip dirs, remove duplicate and non-directory:
# Line 1005  do Line 1280  do
1280              echo ""; echo -n " -- skip \"$xx\" (not a directory !)"              echo ""; echo -n " -- skip \"$xx\" (not a directory !)"
1281          fi          fi
1282      else      else
1283          if test $count = 1 ; then echo -n ", \"$xx\""          if test $count = 1 ; then echo -n ", \"$xx\""
1284          else count=1 ; echo "" ;  echo -n " skip: \"$xx\""          else count=1 ; echo "" ;  echo -n " skip: \"$xx\""
1285          fi          fi
1286      fi      fi
1287  done  done
1288  if test $count = 1 ; then echo "" ; echo -n " ... " ; fi  if test $count = 1 ; then echo "" ; echo -n " ... " ; fi
1289  #echo 'TESTDIRS='${TESTDIRS}'<'  #echo 'TESTDIRS='${TESTDIRS}'<'
1290    
# Line 1017  if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM Line 1292  if test "x$OPTFILE" = xNONE -a "x$MITGCM
1292      OPTFILE=$MITGCM_OF      OPTFILE=$MITGCM_OF
1293  fi  fi
1294    
1295  RUNLOG="run.log"  LOC_MFILE='tr_mpi_mfile'
1296  OUTPUTFILE=$ref_outp  RUNLOG="run.tr_log"
1297  if test "x$COMMAND" = x ; then  if test "x$MPI" = x0 ; then
1298      COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE"    OUTPUTFILE=$ref_outp
1299  fi    if test "x$COMMAND" = x ; then COMMAND="./$EXECUTABLE > $OUTPUTFILE" ; fi
1300  if test "x$MPI" = xt ; then  else
1301      OUTPUTFILE="STDOUT.0000"    OUTPUTFILE="STDOUT.0000"
1302      if test "x$COMMAND" = x ; then COMMAND="mpirun -v -np TR_NPROC ./$EXECUTABLE" ; fi
1303  fi  fi
1304    
1305  echo "OK (COMMAND= $COMMAND )"  echo "OK (COMMAND='$COMMAND')"
1306    
1307    TMP=./tr_$$
1308    #- try to put temporary files in system-local /tmp dir
1309    #TMP=/tmp/tr_$$
1310    #touch $TMP ; retVal=$?
1311    #if [ $retVal -eq 0 ] ; then
1312    #  if test ! -r $TMP ; then TMP=./tr_$$ ; fi
1313    #else
1314    #  TMP=./tr_$$
1315    #fi
1316    #rm -f $TMP
1317    #if [ $verbose -gt 1 ]; then echo " temp files: $TMP" ; fi
1318    
1319  # set the Default List of output variables to be checked:  # set the Default List of output variables to be checked:
1320  #  (use default or load experiment-specific list from file "tr_checklist")  #  (use default or load experiment-specific list from file "tr_checklist")
1321  # content : 1rst = main variable used to decide if it pass or FAIL  # content : 1rst = main variable used to decide if it pass or FAIL
1322  #         others = number of matching digits to be printed in summary.txt  #         others = number of matching digits to be printed in summary.txt
1323  if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; then  if test $KIND = 1 ; then
1324        DEF_CHECK_LIST='tlmGrd tlmCst tlmGrd fwdGrd'
1325        EMPTY_RESULTS='.. .. ..'
1326        LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`
1327    elif test $KIND = 2 -o $KIND = 4 ; then
1328        DEF_CHECK_LIST='AdGrd Cost AdGrd FDGrd'
1329        EMPTY_RESULTS='.. .. ..'
1330        LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`
1331    else
1332      DEF_CHECK_LIST='PS PS T+ S+ U+ V+ pt1+ pt2+ pt3+ pt4+ pt5+'      DEF_CHECK_LIST='PS PS T+ S+ U+ V+ pt1+ pt2+ pt3+ pt4+ pt5+'
1333      EMPTY_RESULTS='.. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. ..'      EMPTY_RESULTS='.. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. ..'
1334      LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`      LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`
1335      ii=`echo $EMPTY_RESULTS | awk '{print NF}'`      ii=`echo $EMPTY_RESULTS | awk '{print NF}'`
1336      EMPTY_RESULTS=$EMPTY_RESULTS`expr $LEN_CHECK_LIST - $ii | awk 'BEGIN{FS=":"}{for(i=1;i<=$1;i++){printf "  ."}}'`      EMPTY_RESULTS=$EMPTY_RESULTS`expr $LEN_CHECK_LIST - $ii | awk 'BEGIN{FS=":"}{for(i=1;i<=$1;i++){printf "  ."}}'`
 else  
     DEF_CHECK_LIST='Grad Cost Grad'  
     EMPTY_RESULTS='.. ..'  
     LEN_CHECK_LIST=`echo $DEF_CHECK_LIST | sed 's/ [a-zA-Z0-9]*+/&mn &mx &av &sd/g' | awk '{print NF-1}'`  
1337  fi  fi
1338    
1339  #  create the FORTRAN comparison code  #  create the FORTRAN comparison code
1340  createcodelet  if test "x$CLEANUP" = xt -o -x tr_cmpnum ; then
1341        echo "skipping comparison code build"
1342    else
1343        createcodelet
1344    fi
1345    
1346  #  build the mpack utility (if ADDRESSES = NONE, do it to test the build)  #  build the mpack utility (if ADDRESSES = NONE, do it to test the build)
1347  if test "x$ADDRESSES" = x ; then  if test "x$ADDRESSES" = x -o "x$SENDCMD" != x ; then
1348      echo "skipping mpack build"      echo "skipping mpack build"
1349  else  else
1350      build_mpack      build_mpack
1351        if test "x$HAVE_MPACK" = xt ; then SENDCMD=$MPACK ; fi
1352  fi  fi
1353    
1354  #  Create a uniquely named directory to store results  #  Create a uniquely named directory to store results
1355  CMDLINE=$0  CMDLINE=$0
1356  for xx in "$@" ; do nw=`echo $xx | wc -w`  for xx in "$@" ; do nw=`echo $xx | wc -w`
1357      if test $nw = '1' ; then CMDLINE="$CMDLINE $xx"      if test $nw = '1' ; then CMDLINE="$CMDLINE $xx" ; else
1358                          else CMDLINE="$CMDLINE '$xx'" ; fi        nb=`echo $xx | grep -c '='`
1359          if test $nb = 0 ; then CMDLINE="$CMDLINE '$xx'"
1360          else yy=`echo "$xx'" | sed "s/=/='/"` ;
1361                                 CMDLINE="$CMDLINE $yy" ; fi
1362        fi
1363  done  done
1364  #for xx in "$@" ; do CMDLINE="$CMDLINE '$xx'" ; done  #for xx in "$@" ; do CMDLINE="$CMDLINE '$xx'" ; done
1365  MACH=`hostname`  MACH=`hostname`
# Line 1105  if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then Line 1406  if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then
1406          echo >> $SUMMARY          echo >> $SUMMARY
1407          echo "  OPTFILE=$OPTFILE" >> $SUMMARY          echo "  OPTFILE=$OPTFILE" >> $SUMMARY
1408      else      else
1409          echo | tee $SUMMARY          echo | tee -a $SUMMARY
1410          echo "ERROR: can't read OPTFILE=\"$OPTFILE\"" | tee $SUMMARY          echo "ERROR: can't read OPTFILE=\"$OPTFILE\"" | tee -a $SUMMARY
1411          exit 1          exit 1
1412      fi      fi
1413  else  else
1414      echo >> $SUMMARY      echo >> $SUMMARY
1415      echo "No \"OPTFILE\" was explicitly specified by testreport," >> $SUMMARY      echo "No \"OPTFILE\" was specified ; genmake2 found and uses:" >> $SUMMARY
1416      echo "   so the genmake default will be used." >> $SUMMARY      #-note: to be filled later after 1rst run
1417  fi  fi
1418  echo  echo
1419  echo >> $SUMMARY  echo >> $SUMMARY
1420  if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; then  if test $KIND = 0 ; then
1421      if [ $MATCH_CRIT -lt 10 ] ;      line_0=`printf '%s %2i' 'default' $MATCH_CRIT`
     then line_0="default  "$MATCH_CRIT ;  
     else line_0="default "$MATCH_CRIT ; fi  
1422         line_0="$line_0  ----T-----  ----S-----  ----U-----  ----V-----"         line_0="$line_0  ----T-----  ----S-----  ----U-----  ----V-----"
 #   line_0="            ----T-----  ----S-----  ----U-----  ----V-----"  
1423      line_1="G D M    c        m  s        m  s        m  s        m  s"      line_1="G D M    c        m  s        m  s        m  s        m  s"
1424      line_2="E p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  ."      line_2="e p a R  g  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  .  m  m  e  ."
1425      line_3="N n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d"      line_3="n n k u  2  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d  i  a  a  d"
1426      line_4="2 d e n  d  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  ."      line_4="2 d e n  d  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  .  n  x  n  ."
1427      for ii in $PTRACERS_NUM ; do      for ii in $PTRACERS_NUM ; do
1428          line_0="$line_0  --PTR 0"$ii"--"          line_0="$line_0  --PTR 0"$ii"--"
# Line 1133  if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; the Line 1431  if test "x$ADM" = x -a "x$OADM" = x; the
1431          line_3="$line_3  i  a  a  d"          line_3="$line_3  i  a  a  d"
1432          line_4="$line_4  n  x  n  ."          line_4="$line_4  n  x  n  ."
1433      done      done
1434    else
1435        line_0=`printf '%s %2i' 'default   ' $MATCH_CRIT`
1436      if test $KIND = 1 ; then
1437       #echo "TANGLIN=true" >> $SUMMARY
1438        echo "TangLin generated by TAF" >> $SUMMARY
1439      elif test $KIND = 3 ; then
1440        echo "TangLin generated by OpenAD" >> $SUMMARY
1441      elif test $KIND = 2 ; then
1442       #echo "ADJOINT=true" >> $SUMMARY
1443        echo "Adjoint generated by TAF" >> $SUMMARY
1444      else
1445        echo "Adjoint generated by OpenAD" >> $SUMMARY
1446      fi
1447      if test $KIND = 1 -o $KIND = 3 ; then
1448        line_1="G D M    C  T  F"
1449        line_2="e p a R  o  L  D"
1450      else
1451        line_1="G D M    C  A  F"
1452        line_2="e p a R  o  d  D"
1453      fi
1454        line_3="n n k u  s  G  G"
1455        line_4="2 d e n  t  r  r"
1456        echo >> $SUMMARY
1457    fi
1458    if test "x$CLEANUP" != xt ; then
1459      echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY      echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY
1460      echo "$line_1" | tee -a $SUMMARY      echo "$line_1" | tee -a $SUMMARY
1461      echo "$line_2" | tee -a $SUMMARY      echo "$line_2" | tee -a $SUMMARY
1462      echo "$line_3" | tee -a $SUMMARY      echo "$line_3" | tee -a $SUMMARY
1463      echo "$line_4" | tee -a $SUMMARY      echo "$line_4" | tee -a $SUMMARY
1464      echo " "       | tee -a $SUMMARY      echo ""        | tee -a $SUMMARY
 else  
     echo "ADJOINT=true" >> $SUMMARY  
     echo >> $SUMMARY  
     if [ $MATCH_CRIT -lt 10 ] ;  
     then line_0="default     "$MATCH_CRIT ;  
     else line_0="default    "$MATCH_CRIT ; fi  
     echo "$line_0" | tee -a $SUMMARY  
     cat << EOF | tee -a $SUMMARY  
 G D M    C  G  
 E p a R  o  r  
 N n k u  s  a  
 2 d e n  t  d  
   
 EOF  
1465  fi  fi
1466    echo "-------------------------------------------------------------------------------"
1467    
1468  #  ...and each test directory...  #  ...and each test directory...
1469  for dir in $TESTDIRS ; do  for dir in $TESTDIRS ; do
1470        
1471      # set builddir & rundir:      # set builddir & rundir:
1472      builddir="build"      builddir="build"
1473      if test ! -d $dir/$builddir ; then mkdir $dir/$builddir ; fi      if test ! -d $dir/$builddir ; then mkdir $dir/$builddir ; fi
1474      rundir="run"      rundir="run"
1475        pfxdir="tr_$rundir"
1476      if test ! -d $dir/$rundir ; then      if test ! -d $dir/$rundir ; then
1477          rundir=$builddir          rundir=$builddir
1478      fi      fi
# Line 1172  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1483  for dir in $TESTDIRS ; do
1483      if test "x$CLEANUP" = xt ; then      if test "x$CLEANUP" = xt ; then
1484          echo -n '  --- dir:' $BUILD_DIR ': '          echo -n '  --- dir:' $BUILD_DIR ': '
1485          makeclean $BUILD_DIR          makeclean $BUILD_DIR
1486            (   cd $BUILD_DIR
1487                rm -f $EXECUTABLE *.bak
1488                rm -f genmake_state genmake_*optfile genmake.log
1489                rm -f SIZE.h.mpi genmake.tr_log make.tr_log
1490                rm -rf mpi_headers
1491            )
1492          if test -d $dir/$rundir/CVS ; then          if test -d $dir/$rundir/CVS ; then
1493              echo -n '  --- dir:' $dir/$rundir ': '              echo -n '  --- dir:' $dir/$rundir ': '
1494              run_clean $dir/$rundir              run_clean $dir/$rundir
1495          fi          fi
1496          trdir=`( cd $dir ; find . -type d -name "tr_run.*" -print | sed 's/^.\///')`          trdir=`( cd $dir ; find . -type d -name "$pfxdir.*" -print | sed 's/^.\///')`
1497          ttd=`echo $trdir | wc -w`          ttd=`echo $trdir | wc -w`
1498          if test $ttd != 0 ; then          if test $ttd != 0 ; then
1499              echo '  --- rm dir:' $trdir              echo '  --- rm dir:' $trdir
# Line 1185  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1502  for dir in $TESTDIRS ; do
1502          continue          continue
1503      fi      fi
1504    
1505      #  Verify that the testdir exists and contains previous      #  Verify that the testdir exists and contains previous
1506      #  results in the correct location--or skip this directory!      #  results in the correct location--or skip this directory!
1507      fout=$dir"/results/"$ref_outp      fout=$dir"/results/"$ref_outp
1508      if test ! -r $fout ; then     #if test ! -r $fout ; then
1509        if test ! -r $fout -a ! -r ${fout}.gz ; then
1510          echo "can't read \"$fout\" -- skipping $dir"          echo "can't read \"$fout\" -- skipping $dir"
1511          continue          continue
1512      fi      fi
1513    
1514      # Check for specific files for particular type of run      # Check for specific files for particular type of run
1515    
1516      if test ! -r $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" -a "x$MPI" = "xt" ; then      if test ! -r $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi"  -a "x$MPI" != "x0" ; then
1517          echo "can't find \"$CODE_DIR/SIZE.h_mpi\" -- skipping $dir"          echo "can't find \"$CODE_DIR/SIZE.h_mpi\" -- skipping $dir"
1518          continue          continue
1519      fi      fi
# Line 1203  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1521  for dir in $TESTDIRS ; do
1521          echo "can't find \"$dir/input/eedata.mth\" -- skipping $dir"          echo "can't find \"$dir/input/eedata.mth\" -- skipping $dir"
1522          continue          continue
1523      fi      fi
1524      if test "x$MPI" = "xt" -a "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then  
1525        retv=`check_eedata $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" $dir"/input/eedata.mth"`      if test "x$MPI" != "x0" ; then
1526        if test $retv != 0 ; then          ntx=1 ; nty=1
1527          echo "input/eedata.mth tiling misfit -- skipping $dir"          if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
1528          continue            ff=$dir"/input/eedata.mth"
1529        fi            ntx=`grep "^ *nTx *=" $ff | tail -1 | sed 's/^ *nTx *= *//' | sed "s/, *$//"`
1530              nty=`grep "^ *nTy *=" $ff | tail -1 | sed 's/^ *nTy *= *//' | sed "s/, *$//"`
1531              if test "x$ntx" = x ; then ntx=1 ; fi
1532              if test "x$nty" = x ; then nty=1 ; fi
1533            fi
1534            #- create new SIZE.h with no more than '$MPI' Procs
1535            mk_mpi_size $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" $BUILD_DIR"/tr_size.mpi" $MPI $ntx $nty
1536            LOC_NPROC=$?
1537            (   cd $BUILD_DIR
1538                if test -r SIZE.h.mpi ; then
1539                    cmp tr_size.mpi SIZE.h.mpi > /dev/null 2>&1 ; RETVAL=$?
1540                else RETVAL=1
1541                fi
1542                if test "x$RETVAL" = x0 ; then
1543                    rm -f tr_size.mpi
1544                else
1545                    rm -f SIZE.h.mpi ; mv tr_size.mpi SIZE.h.mpi
1546                fi
1547            )
1548            if test "x$MPI_MFILE" != x ; then
1549                #- create new MPI machine-file with the right number of Procs
1550                rm -f $LOC_MFILE
1551                cat $MPI_MFILE | sort | uniq | head -$LOC_NPROC > $LOC_MFILE
1552                nl=`wc -l $LOC_MFILE | awk '{print $1}'`
1553                if [ $nl -lt $LOC_NPROC ] ; then
1554                    rm -f $LOC_MFILE
1555                    cat $MPI_MFILE | head -$LOC_NPROC > $LOC_MFILE
1556                    #sed -n "1,$LOC_NPROC p" $MPI_MFILE > $LOC_MFILE
1557                fi
1558                if [ $verbose -gt 1 ]; then
1559                    nl=`wc -l $LOC_MFILE | awk '{print $1}'`
1560                    echo " new LOC_MFILE=$LOC_MFILE : $nl procs for LOC_NPROC=$LOC_NPROC"
1561                fi
1562            fi
1563            if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
1564                retv=`check_eedata $dir"/input/eedata.mth" $BUILD_DIR"/SIZE.h.mpi"`
1565                if test $retv != 0 ; then
1566                    echo "input/eedata.mth tiling misfit -- skipping $dir"
1567                    continue
1568                fi
1569            fi
1570      fi      fi
1571    
1572      #  Check whether there are "extra runs" for this testdir      #  Check whether there are "extra runs" for this testdir
1573      extra_runs=      extra_runs=
1574      ex_run_dirs=`( cd $dir ; echo $inputdir.* )`      if test "x$NORUN" = xf ; then
1575            ex_run_dirs=`( cd $dir ; ls -d $inputdir.* 2> /dev/null )`
1576        fi
1577      #echo "ex_run_dirs='$ex_run_dirs'"      #echo "ex_run_dirs='$ex_run_dirs'"
1578      for exd in $ex_run_dirs ; do      for exd in $ex_run_dirs ; do
1579          name=`echo $exd | sed -e "s/$inputdir\.//"`          name=`echo $exd | sed -e "s/$inputdir\.//"`
1580          refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${name}./"`          refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${name}./"`
1581          outf="$dir/results/$refExOut"          outf="$dir/results/$refExOut"
1582          if test -f $outf -a -r $outf ; then          if test -r $outf -o -r ${outf}.gz ; then
1583            if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then            if test "x$MULTI_THREAD" = "xt" ; then
1584              if test -r $dir"/"$exd"/eedata.mth" ; then              if test -r $dir"/"$exd"/eedata.mth" ; then
1585                if test "x$MPI" = "xt" ; then                if test "x$MPI" = "x0" ; then
1586                  retv=`check_eedata $CODE_DIR"/SIZE.h_mpi" $dir"/"$exd"/eedata.mth"`                  extra_runs="$extra_runs $name"
1587                  else
1588                    retv=`check_eedata $dir"/"$exd"/eedata.mth" $BUILD_DIR"/SIZE.h.mpi"`
1589                  if test $retv = 0 ; then                  if test $retv = 0 ; then
1590                      extra_runs="$extra_runs $name"                      extra_runs="$extra_runs $name"
1591                  else                  else
1592                      echo $exd"/eedata.mth tiling misfit -- skipping $dir"                      echo $exd"/eedata.mth tiling misfit -- skipping $dir"
1593                  fi                  fi
               else  
                 extra_runs="$extra_runs $name"  
1594                fi                fi
1595              #else echo $dir"/"$exd"/eedata.mth: not found"              #else echo $dir"/"$exd"/eedata.mth: not found"
1596              fi              fi
# Line 1240  for dir in $TESTDIRS ; do Line 1600  for dir in $TESTDIRS ; do
1600          fi          fi
1601      done      done
1602    
     echo "-------------------------------------------------------------------------------"  
1603      echo      echo
1604      if test "x$extra_runs" = "x" ; then      if test "x$extra_runs" = "x" ; then
1605         echo "Experiment:  $dir"          echo "Experiment:  $dir"
1606      else      else
1607         echo "Experiment:  $dir ; extra_runs=$extra_runs"          echo "Experiment:  $dir ; extra_runs=$extra_runs"
1608      fi      fi
1609      echo      echo
1610      unset genmake makedepend make run      unset genmake makedepend make run
1611      results=$EMPTY_RESULTS      results=$EMPTY_RESULTS
1612    
1613      #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir combination      #  Create an output dir & summary.txt file for each tested experiment (tdir)
1614      rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir      locDIR=$DRESULTS"/"$dir
1615      mkdir $rel_CDIR      mkdir $locDIR
1616      CDIR=`pwd`"/$rel_CDIR"      #- report to this experiment local summary file ---
1617            echo "DATE='$DATE' ; tdir='$dir'" > $locDIR"/summary.txt"
1618      if test "x$CLEANUP" = xt ; then      echo "MACH='$MACH'" >> $locDIR"/summary.txt"
1619          echo '====>>> this is to check that we never go through this part <<< ==='      echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $locDIR"/summary.txt"
1620          makeclean $dir/$builddir \      CDIR=`pwd`"/$locDIR"
1621              && run_clean $dir/$rundir  
1622        if test "x$NORUN" = xt ; then
1623                run=N
1624            genmakemodel $dir/$builddir && genmake=Y \
1625                && makeclean $dir/$builddir \
1626                && symlink_mpifiles $dir $code_dir $builddir \
1627                && makedependmodel $dir/$builddir && makedepend=Y \
1628                && makemodel $dir/$builddir && make=Y
1629      else      else
1630          genmakemodel $dir/$builddir && genmake=Y \          genmakemodel $dir/$builddir && genmake=Y \
1631              && makeclean $dir/$builddir \              && makeclean $dir/$builddir \
1632              && run_clean $dir/$rundir \              && symlink_mpifiles $dir $code_dir $builddir \
             && symlink_mpifiles $dir $code_dir $builddir \  
1633              && makedependmodel $dir/$builddir && makedepend=Y \              && makedependmodel $dir/$builddir && makedepend=Y \
1634              && makemodel $dir/$builddir && make=Y \              && makemodel $dir/$builddir && make=Y \
1635              && linkdata $dir/$rundir $inputdir input \              && run_clean $dir/$rundir \
1636                && linkdata $dir/$rundir $inputdir \
1637              && runmodel $dir/$rundir && run=Y \              && runmodel $dir/$rundir && run=Y \
1638              && results=`testoutput_run $dir $rundir $ref_outp`              && results=`testoutput_run $dir $rundir $ref_outp`
1639      fi      fi
1640            #echo "results='$results'"
1641      echo  
1642          fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`          fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`
1643          echo          echo 1>&2
1644          echo "$fres" | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</' >> $SUMMARY          echo "$fres" | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</' >> $SUMMARY
1645          touch $CDIR"/summary.txt"          echo "fresults='$fres'" | sed 's/ 99/ --/g' >> $locDIR"/summary.txt"
         echo "fresults='$fres'" | sed 's/ 99/ --/g' >> $CDIR"/summary.txt"  
         echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"  
         echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"  
         echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"  
         echo "tdir='$dir'" >> $CDIR"/summary.txt"  
         if test "x$ADM" = xt ; then  
             head -1 $dir/$builddir/taf_ad.log >> $CDIR"/summary.txt"  
             grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/$rundir/$OUTPUTFILE \  
                                 >> $CDIR"/summary.txt"  
         fi  
1646    
1647          for ex in $extra_runs ; do          for ex in $extra_runs ; do
1648              unset run              unset run
1649              results=$EMPTY_RESULTS              results=$EMPTY_RESULTS
1650              #  reference output file              #  reference output file
1651              refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${ex}./g"`              refExOut=`echo $ref_outp | sed "s/\./.${ex}./g"`
1652              #  Create an output dir for each OPTFILE/tdir.ex combination              #  Create an output dir & summary.txt file for each extra run (tdir.ex)
1653              rel_CDIR=$DRESULTS"/"$dir"."$ex              locDIR=$DRESULTS"/"$dir"."$ex
1654              mkdir $rel_CDIR              mkdir $locDIR
1655              CDIR=`pwd`"/$rel_CDIR"              #- report to this experiment local summary file ---
1656              test ! -e "$dir/tr_run.$ex" && mkdir "$dir/tr_run.$ex"              echo "DATE='$DATE' ; tdir='$dir.$ex'" > $locDIR"/summary.txt"
1657              run_clean $dir/tr_run.$ex              #echo "MACH='$MACH'" >> $locDIR"/summary.txt"
1658              linkdata $dir/tr_run.$ex $inputdir.$ex $inputdir input              #echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $locDIR"/summary.txt"
1659              runmodel $dir/tr_run.$ex && run=Y \              CDIR=`pwd`"/$locDIR"
1660              && results=`testoutput_run $dir tr_run.$ex $refExOut`              test ! -e "$dir/$pfxdir.$ex" && mkdir "$dir/$pfxdir.$ex"
1661              fres=`formatresults $dir ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`              run_clean $dir/$pfxdir.$ex
1662              fres="$fres.$ex"              linkdata $dir/$pfxdir.$ex $inputdir.$ex $inputdir
1663              echo              runmodel $dir/$pfxdir.$ex && run=Y \
1664                && results=`testoutput_run $dir $pfxdir.$ex $refExOut`
1665                fres=`formatresults $dir.$ex ${genmake:-N} ${makedepend:-N} ${make:-N} ${run:-N} $results`
1666                echo 1>&2
1667              echo "$fres" | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</' >> $SUMMARY              echo "$fres" | sed 's/ 99/ --/g' | sed 's/  > />/' | sed 's/  < /</' >> $SUMMARY
1668              touch $CDIR"/summary.txt"              echo "fresults='$fres'" | sed 's/ 99/ --/g' >> $locDIR"/summary.txt"
1669              echo "fresults='$fres'" | sed 's/ 99/ --/g' >> $CDIR"/summary.txt"              if test "x$POSTCLEAN" = x2 ; then
1670              echo "MACH='$MACH'" >> $CDIR"/summary.txt"                  run_clean $dir/$pfxdir.$ex
             echo "UNAMEA='$UNAMEA'" >> $CDIR"/summary.txt"  
             echo "DATE='$DATE'" >> $CDIR"/summary.txt"  
             echo "tdir='$dir.$ex'" >> $CDIR"/summary.txt"  
             if test "x$ADM" = xt ; then  
                 head -1 $dir/$builddir/taf_ad.log >> $CDIR"/summary.txt"  
                 grep -A3 'Seconds in section "ALL' $dir/tr_run.$ex/$OUTPUTFILE \  
                                    >> $CDIR"/summary.txt"  
             fi  
             if test "x$POSTCLEAN" = xt ; then  
                 run_clean $dir/tr_run.$ex  
1671              fi              fi
1672          done          done
1673    
1674        if test ! -f $DRESULTS"/"genmake_state ; then
1675            if test -f $dir/$builddir/Makefile ; then
1676                mkOpt=`grep '^# OPTFILE=' $dir/$builddir/Makefile 2>/dev/null | head -1 | sed 's/^# //'`
1677                echo "from '$dir/$builddir/Makefile', extract:" > $DRESULTS/genmake_state
1678                sed -n '/^# executed by:/,+1 p' $dir/$builddir/Makefile >> $DRESULTS/genmake_state
1679                echo " $mkOpt" >> $DRESULTS/genmake_state
1680                if test "x$OPTFILE" = xNONE ; then
1681                    eval $mkOpt
1682                    sed "/^No \"OPTFILE\" was specified ; genmake2/a\  OPTFILE=${OPTFILE}"\
1683                            $SUMMARY > tmp.tr_log
1684                    RETVAL=$?
1685                    if test "x$RETVAL" = x0 ; then
1686                        cp -f tmp.tr_log $SUMMARY
1687                    fi
1688                    rm -f tmp.tr_log
1689                fi
1690                gmkLog=$dir/$builddir/genmake.log
1691                if test -r $gmkLog ; then
1692                    grep '^Get compiler version using:' $gmkLog > /dev/null 2>&1
1693                    RETVAL=$?
1694                    if test "x$RETVAL" = x0 ; then
1695                      echo -n "from '$gmkLog', " >> $DRESULTS/genmake_state
1696                      echo "extract compiler version:"   >> $DRESULTS/genmake_state
1697                      sed -n '/Get compiler version/,/<-- compiler version/p' \
1698                         $gmkLog | grep -v '^... compiler version ' > tmp.tr_log
1699                      sed -n '1p' tmp.tr_log >> $DRESULTS/genmake_state
1700                      sed -n '2,/^$/p' tmp.tr_log | sed '/^$/d' | sed 's/^./ &/' \
1701                                             >> $DRESULTS/genmake_state
1702                      rm -f tmp.tr_log
1703                    fi
1704                    echo -n "from '$gmkLog', " >> $DRESULTS/genmake_state
1705                    echo "get NETCDF & LAPACK settings:" >> $DRESULTS/genmake_state
1706                    sed -n '/set HAVE_NETCDF=/p' $gmkLog >> $DRESULTS/genmake_state
1707                    sed -n '/set HAVE_LAPACK=/p' $gmkLog >> $DRESULTS/genmake_state
1708                fi
1709            fi
1710        fi
1711      #postclean $dir/$builddir      #postclean $dir/$builddir
1712      if test "x$POSTCLEAN" = xt ; then      if test "x$POSTCLEAN" = x2 ; then
1713          makeclean $dir/$builddir \          makeclean $dir/$builddir \
1714              && run_clean $dir/$rundir              && run_clean $dir/$rundir
1715      fi      fi
1716            if test "x$MPI" != x0 -a "x$MPI_MFILE" != x ; then rm -f $LOC_MFILE ; fi
1717    
1718      echo "-------------------------------------------------------------------------------"      echo "-------------------------------------------------------------------------------"
1719        
1720  done  done
1721    
1722  printf "Start time:  " >> $SUMMARY  printf "Start time:  " >> $SUMMARY
# Line 1342  date >> $SUMMARY Line 1729  date >> $SUMMARY
1729  if test "x$ADDRESSES" = xNONE -o "x$ADDRESSES" = x ; then  if test "x$ADDRESSES" = xNONE -o "x$ADDRESSES" = x ; then
1730      echo "No results email was sent."      echo "No results email was sent."
1731  else  else
1732      if test "x$HAVE_MPACK" = xt ; then      if test "x$SENDCMD" != x ; then
1733          tar -cf $DRESULTS".tar" $DRESULTS > /dev/null 2>&1 \          if [ $verbose -gt 1 ]; then
1734              && gzip $DRESULTS".tar" \             echo " run: $SENDCMD -s MITgcm-test -m 3555000 ${SAVDIR}/${DRESULTS}".tar.gz" $ADDRESSES"
1735              && $MPACK -s MITgcm-test -m 3555000 $DRESULTS".tar.gz" $ADDRESSES          fi
1736            tar -cf ${SAVDIR}/${DRESULTS}".tar" $DRESULTS > /dev/null 2>&1 \
1737                && gzip ${SAVDIR}/${DRESULTS}".tar" \
1738                && $SENDCMD -s MITgcm-test -m 3555000 ${SAVDIR}/${DRESULTS}".tar.gz" $ADDRESSES
1739          RETVAL=$?          RETVAL=$?
1740          if test "x$RETVAL" != x0 ; then          if test "x$RETVAL" != x0 ; then
1741              echo              echo
# Line 1358  else Line 1748  else
1748              echo "An email containing results was sent to the following addresses:"              echo "An email containing results was sent to the following addresses:"
1749              echo "  \"$ADDRESSES\""              echo "  \"$ADDRESSES\""
1750              echo              echo
1751                test -f ${SAVDIR}/${DRESULTS}".tar" &&  rm -f ${SAVDIR}/${DRESULTS}".tar"
1752                test -f ${SAVDIR}/${DRESULTS}".tar.gz" &&  rm -f ${SAVDIR}/${DRESULTS}".tar.gz"
1753          fi          fi
         test -f $DRESULTS".tar"  &&  rm -f $DRESULTS".tar"  
         test -f $DRESULTS".tar.gz"  &&  rm -f $DRESULTS".tar.gz"  
1754      fi      fi
1755  fi  fi
1756    
1757  rm -f tr_cmpnum.c tr_cmpnum  if test "x$QUICK" = xf -a "x$NORUN" = xf ; then
1758        rm -f tr_cmpnum.c tr_cmpnum
1759    fi
1760    
1761  if test "x$CLEANUP" != xt ; then  if test "x$CLEANUP" != xt ; then
1762      cat $SUMMARY | sed 's/ \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \. //'      cat $SUMMARY | sed 's/ \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \.  \. //'
1763      if test -e tr_out.txt ; then      if test -e tr_out.txt ; then
1764          mv tr_out.txt tr_out.txt.old          mv tr_out.txt tr_out.txt.old
1765      fi      fi
1766      cat $SUMMARY | sed '/^[YN] [YN] [YN] [YN]/ s/ \. //g' > tr_out.txt      cat $SUMMARY | sed '/^[YN] [YN] [YN] [YN]/ s/ \. //g' > tr_out.txt
1767  fi  fi
# Line 1377  fi Line 1769  fi
1769  if test "x$DELDIR" = xt ; then  if test "x$DELDIR" = xt ; then
1770      rm -rf $DRESULTS      rm -rf $DRESULTS
1771  fi  fi
1772    echo "======== End of testreport execution ========"

Legend:
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changed lines
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