--- MITgcm/tools/genmake2	2013/08/11 05:01:47	1.257
+++ MITgcm/tools/genmake2	2013/08/16 16:36:32	1.258
@@ -1,6 +1,6 @@
 #! /usr/bin/env bash
 #
-# $Header: /home/ubuntu/mnt/e9_copy/MITgcm/tools/genmake2,v 1.257 2013/08/11 05:01:47 jmc Exp $
+# $Header: /home/ubuntu/mnt/e9_copy/MITgcm/tools/genmake2,v 1.258 2013/08/16 16:36:32 jmc Exp $
 # $Name:  $
 #
 # Makefile generator for MITgcm UV codes
@@ -3134,6 +3134,7 @@
 	cat \$(FLOWFILES) \$(AD_FILES) | sed -f \$(TOOLSDIR)/remove_comments_sed > ad_input_code.$FS
 
 ad_taf_output.$FS: ad_input_code.$FS
+	@-rm -f ad_input_code_ad.$FS
 	\$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ad_input_code.$FS
 	ls -l ad_input_code_ad.$FS
 	cat ad_input_code_ad.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_taf_output.$FS
@@ -3159,7 +3160,7 @@
 adtrick:
 	patch < \$(TOOLSDIR)/ad_taf_output.f.adtrick.diff
 
-adobj: ad_taf_output.o \$(OBJFILES)
+adobj: ad_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o)
 
 # ... FTL ...
 ftlall: ftl_exe_target
@@ -3182,6 +3183,7 @@
 	cat \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES) | sed -f \$(TOOLSDIR)/remove_comments_sed > ftl_input_code.$FS
 
 ftl_taf_output.$FS: ftl_input_code.$FS
+	@-rm -f ftl_input_code_tl.$FS
 	\$(TAF) \$(FTL_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ftl_input_code.$FS
 	ls -l ftl_input_code_tl.$FS
 	cat ftl_input_code_tl.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_taf_output.$FS