--- MITgcm/tools/genmake2	2005/03/11 07:25:17	1.120
+++ MITgcm/tools/genmake2	2005/03/22 19:45:03	1.121
@@ -1,6 +1,6 @@
 #! /usr/bin/env bash
 #
-# $Header: /home/ubuntu/mnt/e9_copy/MITgcm/tools/genmake2,v 1.120 2005/03/11 07:25:17 mlosch Exp $
+# $Header: /home/ubuntu/mnt/e9_copy/MITgcm/tools/genmake2,v 1.121 2005/03/22 19:45:03 edhill Exp $
 #
 # Makefile generator for MITgcm UV codes
 #   created  by cnh 03/98
@@ -1826,7 +1826,10 @@
 	cat $i/$j >> ad_files
     done
 done
-
+if test ! "x"$FS = "x.f" ; then
+    cat ad_files | sed -e "s/\.f/$FS/g" > ad_files_f
+    mv -f ad_files_f ad_files
+fi
 
 echo
 echo "===  Creating the Makefile  ==="
@@ -2151,31 +2154,31 @@
 
 # ... AD ...
 adall: ad_taf
-adtaf: ad_taf_output.f
-adtamc: ad_tamc_output.f
+adtaf: ad_taf_output.$FS
+adtamc: ad_tamc_output.$FS
 
-ad_input_code.f: \$(AD_FILES) \$(HEADERFILES)
+ad_input_code.$FS: \$(AD_FILES) \$(HEADERFILES)
 	@$BASH\$(TOOLSDIR)/convert_cpp_cmd2defines "Warning - this file is automatically generated - do NOT edit" -DALLOW_ADJOINT_RUN -UALLOW_TANGENTLINEAR_RUN -UALLOW_ECCO_OPTIMIZATION > ad_config.template
 	cmp ad_config.template AD_CONFIG.h || cat ad_config.template > AD_CONFIG.h
 	-rm -f ad_config.template
 	@make \$(F77FILES)
 	@make \$(AD_FLOW_FILES)
-	cat \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES) > ad_input_code.f
+	cat \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES) > ad_input_code.$FS
 
-ad_taf_output.f: ad_input_code.f
-	\$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ad_input_code.f
-	cat ad_input_code_ad.f | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_taf_output.f
+ad_taf_output.$FS: ad_input_code.$FS
+	\$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ad_input_code.$FS
+	cat ad_input_code_ad.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_taf_output.$FS
 
 adtafonly:
-	\$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ad_input_code.f
-	cat ad_input_code_ad.f | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_taf_output.f
+	\$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ad_input_code.$FS
+	cat ad_input_code_ad.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_taf_output.$FS
 
 ad_taf: ad_taf_output.o \$(OBJFILES)
 	\$(LINK) -o ${EXE_AD} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) \$(OBJFILES) ad_taf_output.o \$(LIBS) 
 
-ad_tamc_output.f: ad_input_code.f
-	\$(TAMC) \$(AD_TAMC_FLAGS) \$(TAMC_EXTRA) ad_input_code.f
-	cat ad_input_code_ad.f | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_tamc_output.f
+ad_tamc_output.$FS: ad_input_code.$FS
+	\$(TAMC) \$(AD_TAMC_FLAGS) \$(TAMC_EXTRA) ad_input_code.$FS
+	cat ad_input_code_ad.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_tamc_output.$FS
 
 ad_tamc: ad_tamc_output.o \$(OBJFILES)
 	\$(LINK) -o ${EXE_AD} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) \$(OBJFILES) ad_tamc_output.o \$(LIBS) 
@@ -2188,38 +2191,38 @@
 
 # ... FTL ...
 ftlall: ftl_taf
-ftltaf: ftl_taf_output.f
-ftltamc: ftl_tamc_output.f
+ftltaf: ftl_taf_output.$FS
+ftltamc: ftl_tamc_output.$FS
 
-ftl_input_code.f: \$(AD_FILES) \$(HEADERFILES)
+ftl_input_code.$FS: \$(AD_FILES) \$(HEADERFILES)
 	@$BASH\$(TOOLSDIR)/convert_cpp_cmd2defines "Warning - this file is automatically generated - do NOT edit" -UALLOW_ADJOINT_RUN -DALLOW_TANGENTLINEAR_RUN -UALLOW_ECCO_OPTIMIZATION > ftl_config.template
 	cmp ftl_config.template AD_CONFIG.h || cat ftl_config.template > AD_CONFIG.h
 	-rm -f ftl_config.template
 	@make \$(F77FILES)
 	@make \$(AD_FLOW_FILES)
-	cat \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES) > ftl_input_code.f
+	cat \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES) > ftl_input_code.$FS
 
-ftl_taf_output.f: ftl_input_code.f
-	\$(TAF) \$(FTL_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ftl_input_code.f
-	cat ftl_input_code_ftl.f | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_taf_output.f
+ftl_taf_output.$FS: ftl_input_code.$FS
+	\$(TAF) \$(FTL_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ftl_input_code.$FS
+	cat ftl_input_code_ftl.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_taf_output.$FS
 
 ftltafonly:
-	\$(TAF) \$(FTL_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ftl_input_code.f
-	cat ftl_input_code_ftl.f | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_taf_output.f
+	\$(TAF) \$(FTL_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ftl_input_code.$FS
+	cat ftl_input_code_ftl.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_taf_output.$FS
 
 ftl_taf: ftl_taf_output.o \$(OBJFILES)
 	\$(LINK) -o ${EXE_FTL} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) \$(OBJFILES) ftl_taf_output.o \$(LIBS) 
 
-ftl_tamc_output.f: ftl_input_code.f
-	\$(TAMC) \$(FTL_TAMC_FLAGS) \$(TAMC_EXTRA) ftl_input_code.f
-	cat ftl_input_code_ftl.f | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_tamc_output.f
+ftl_tamc_output.$FS: ftl_input_code.$FS
+	\$(TAMC) \$(FTL_TAMC_FLAGS) \$(TAMC_EXTRA) ftl_input_code.$FS
+	cat ftl_input_code_ftl.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_tamc_output.$FS
 
 ftl_tamc: ftl_tamc_output.o \$(OBJFILES)
 	\$(LINK) -o ${EXE_FTL} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) \$(OBJFILES) ftl_tamc_output.o \$(LIBS) 
 
 
 # ... SVD ...
-svdtaf: ad_taf_output.f ftl_taf_output.f
+svdtaf: ad_taf_output.$FS ftl_taf_output.$FS
 	@echo "--->>> Only ran TAF to generate SVD code!    <<<---"
 	@echo "--->>> Do make svdall afterwards to compile. <<<---"
 svdall: svd_touch svd_taf
@@ -2235,9 +2238,9 @@
 	@echo "--->>> Only COMPILE svd code! <<<---"
 	@echo "--->>> Assumes you previously <<<---"
 	@echo "--->>> did make svdtaf        <<<---"
-	touch ad_taf_output.f ftl_taf_output.f
-	\$(FC) \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) -c ad_taf_output.f
-	\$(FC) \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) -c ftl_taf_output.f
+	touch ad_taf_output.$FS ftl_taf_output.$FS
+	\$(FC) \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) -c ad_taf_output.$FS
+	\$(FC) \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) -c ftl_taf_output.$FS
 	@$BASH\$(TOOLSDIR)/convert_cpp_cmd2defines "Warning - this file is automatically generated - do NOT edit" -UALLOW_ADJOINT_RUN -DALLOW_TANGENTLINEAR_RUN -UALLOW_ECCO_OPTIMIZATION > ftl_config.template
 	cmp ftl_config.template AD_CONFIG.h || cat ftl_config.template > AD_CONFIG.h
 	-rm -f ftl_config.template