/[MITgcm]/MITgcm/tools/genmake2
ViewVC logotype

Diff of /MITgcm/tools/genmake2

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Revision Graph Revision Graph | View Patch Patch

revision 1.260 by jmc, Thu Aug 22 01:10:53 2013 UTC revision 1.270 by jmc, Tue Feb 24 17:34:54 2015 UTC
# Line 19  Usage: "$0" [OPTIONS] Line 19  Usage: "$0" [OPTIONS]
19      -help | --help | -h | --h      -help | --help | -h | --h
20            Print this help message and exit.            Print this help message and exit.
21    
22        -oad | --oad
23              Generate a Makefile for an OpenAD built
24    
25        -nocat4ad | -dog4ad | -ncad | -dad
26              do not concatenate (cat) source code sent to TAF
27              resulting in compilation of multiple files
28    
29      -adoptfile NAME | --adoptfile NAME | -adof NAME | --adof NAME      -adoptfile NAME | --adoptfile NAME | -adof NAME | --adof NAME
30        -adoptfile=NAME | --adoptfile=NAME | -adof=NAME | --adof=NAME        -adoptfile=NAME | --adoptfile=NAME | -adof=NAME | --adof=NAME
31            Use "NAME" as the adoptfile.  By default, the file at            Use "NAME" as the adoptfile.  By default, the file at
32              "tools/adjoint_options/adjoint_oad" (for OpenAD built) or
33            "tools/adjoint_options/adjoint_default" will be used.            "tools/adjoint_options/adjoint_default" will be used.
34    
35      -nooptfile | --nooptfile      -nooptfile | --nooptfile
# Line 1079  EOF Line 1087  EOF
1087  }  }
1088    
1089  check_lapack_libs()  {  check_lapack_libs()  {
1090      if test ! "x$SKIP_LAPACK_CHECK" = x ; then      if test "x$CHECK_FOR_LAPACK" = xf ; then return ; fi
         return  
     fi  
1091      echo >> $LOGFILE      echo >> $LOGFILE
1092      echo "running: check_lapack_libs()" >> $LOGFILE      echo "running: check_lapack_libs()" >> $LOGFILE
1093      cat <<EOF > genmake_tla.F      cat <<EOF > genmake_tla.F
# Line 1277  GSL= Line 1283  GSL=
1283  DEVEL=  DEVEL=
1284  HAVE_TEST_L=  HAVE_TEST_L=
1285    
1286  # comment this line out to enable lapack test  # set this to "t" to enable lapack test
1287  SKIP_LAPACK_CHECK=t  CHECK_FOR_LAPACK=f
1288    
1289  # DEFINES checked by test compilation or command-line  # DEFINES checked by test compilation or command-line
1290  HAVE_SYSTEM=  HAVE_SYSTEM=
# Line 1325  FS= Line 1331  FS=
1331  FS90=  FS90=
1332    
1333  AUTODIFF_PKG_USED=f  AUTODIFF_PKG_USED=f
1334    OPENAD=
1335  AD_OPTFILE=  AD_OPTFILE=
1336    CAT_SRC_FOR_TAF=1
1337  TAF=  TAF=
1338  AD_TAF_FLAGS=  AD_TAF_FLAGS=
1339  FTL_TAF_FLAGS=  FTL_TAF_FLAGS=
# Line 1355  gm_s7="TMP THISHOST THISUSER THISDATE TH Line 1363  gm_s7="TMP THISHOST THISUSER THISDATE TH
1363  gm_s8="HAVE_NETCDF HAVE_SYSTEM HAVE_FDATE HAVE_ETIME HAVE_LAPACK HAVE_FLUSH"  gm_s8="HAVE_NETCDF HAVE_SYSTEM HAVE_FDATE HAVE_ETIME HAVE_LAPACK HAVE_FLUSH"
1364    
1365  #  The following are all related to adjoint/tangent-linear stuff  #  The following are all related to adjoint/tangent-linear stuff
1366  gm_s10="AUTODIFF_PKG_USED AD_OPTFILE TAMC TAF AD_TAMC_FLAGS AD_TAF_FLAGS"  gm_s10="AUTODIFF_PKG_USED AD_OPTFILE OPENAD TAMC TAF AD_TAMC_FLAGS AD_TAF_FLAGS"
1367  gm_s11="FTL_TAMC_FLAGS FTL_TAF_FLAGS SVD_TAMC_FLAGS SVD_TAF_FLAGS"  gm_s11="FTL_TAMC_FLAGS FTL_TAF_FLAGS SVD_TAMC_FLAGS SVD_TAF_FLAGS"
1368  gm_s12="TAF_EXTRA TAMC_EXTRA DIVA MPIINCLUDEDIR MPI_HEADER_FILES"  gm_s12="TAF_EXTRA TAMC_EXTRA DIVA MPIINCLUDEDIR MPI_HEADER_FILES"
1369    
# Line 1407  for ac_option in "$@" ; do Line 1415  for ac_option in "$@" ; do
1415          -optfile=* | --optfile=* | -of=* | --of=*)          -optfile=* | --optfile=* | -of=* | --of=*)
1416              OPTFILE=$ac_optarg ;;              OPTFILE=$ac_optarg ;;
1417    
1418            -oad | --oad)
1419                OPENAD="true" ; ALWAYS_USE_F90=1 ;;
1420            -nocat4ad | -dog4ad | -ncad | -dad)
1421                CAT_SRC_FOR_TAF=0 ;;
1422          -adoptfile | --adoptfile | -adof | --adof)          -adoptfile | --adoptfile | -adof | --adof)
1423              ac_prev=AD_OPTFILE ;;              ac_prev=AD_OPTFILE ;;
1424          -adoptfile=* | --adoptfile=* | -adof=* | --adof=*)          -adoptfile=* | --adoptfile=* | -adof=* | --adof=*)
# Line 1576  for ac_option in "$@" ; do Line 1588  for ac_option in "$@" ; do
1588    
1589  done  done
1590    
1591  TMP=./genmk_$$  #TMP=./genmk_$$
1592  #- try to put temporary files in system-local /tmp dir  #- try to put temporary files in system-local /tmp dir
1593  #TMP=/tmp/genmk_$$  TMP=/tmp/genmk_${USER}_$$
1594  #touch $TMP ; retVal=$?  touch $TMP ; retVal=$?
1595  #if [ $retVal -eq 0 ] ; then  if [ $retVal -eq 0 ] ; then
1596  #  if test ! -r $TMP ; then TMP=./genmk_$$ ; fi    if test ! -r $TMP ; then TMP=./genmk_$$ ; fi
1597  #else  else
1598  #  TMP=./genmk_$$    TMP=./genmk_$$
1599  #fi  fi
1600  #rm -f $TMP  rm -f $TMP
1601  ##echo "  temp files: $TMP.*"  #echo "  temp files: $TMP.*"
1602    
1603  printf "  getting local config information:  "  printf "  getting local config information:  "
1604  if test -f $gm_local ; then  if test -f $gm_local ; then
# Line 1680  fi Line 1692  fi
1692    
1693  echo "  getting AD_OPTFILE information:"  echo "  getting AD_OPTFILE information:"
1694  if test "x${AD_OPTFILE}" = x ; then  if test "x${AD_OPTFILE}" = x ; then
1695      if test "x$MITGCM_AD_OF" = x ; then      if test "x$MITGCM_AD_OF" != x ; then
1696            AD_OPTFILE=$MITGCM_AD_OF
1697        elif test "x$OPENAD" = x ; then
1698          AD_OPTFILE=$ROOTDIR/tools/adjoint_options/adjoint_default          AD_OPTFILE=$ROOTDIR/tools/adjoint_options/adjoint_default
1699      else      else
1700          AD_OPTFILE=$MITGCM_AD_OF          AD_OPTFILE=$ROOTDIR/tools/adjoint_options/adjoint_oad
1701      fi      fi
1702  fi  fi
1703  if test "x${AD_OPTFILE}" != xNONE ; then  if test "x${AD_OPTFILE}" != xNONE ; then
# Line 2356  EOF Line 2370  EOF
2370      fi      fi
2371  fi  fi
2372    
2373  #  Check for package RADTRANS: if LAPACK is not available,  #  Make sure the openad package is enabled if using OpenAD
2374  #  then issue a warning that the direct radtrans solver is not available.  if test "x$OPENAD" != x ; then
2375  if test "x$HAVE_LAPACK" != xt ; then      echo " $PACKAGES " | grep ' openad ' > /dev/null 2>&1
     echo " $PACKAGES " | grep ' radtrans ' > /dev/null 2>&1  
2376      RETVAL=$?      RETVAL=$?
2377      if test "x$RETVAL" = x0 ; then      if test "x$RETVAL" != x0 ; then
2378          cat <<EOF          cat <<EOF
 *********************************************************************  
 WARNING: the "radtrans" package was enabled but tests failed to  
   compile LAPACK applications.  This means that the direct radtrans  
   solver is not available and compilation will fail if it is enabled.  
   If you want to use the direct solver, please check that:  
2379    
   1) LAPACK is correctly installed for this compiler and  
   2) the LIBS variable (within the "optfile") specifies the correct  
      LAPACK library to link against.  
2380  *********************************************************************  *********************************************************************
2381    ERROR: when generating an adjoint with OpenAD, the openad package
2382      must be enabled.  Please add it to packages.conf.
2383    *********************************************************************
2384    
2385  EOF  EOF
2386            exit 1
2387      fi      fi
2388  fi  fi
2389    
# Line 2628  if test "x$OPENAD" != x ; then Line 2638  if test "x$OPENAD" != x ; then
2638      OAD_CB2M_FILES="/dev/null"      OAD_CB2M_FILES="/dev/null"
2639      OADTOOLS="$TOOLSDIR/OAD_support"      OADTOOLS="$TOOLSDIR/OAD_support"
2640      echo "  looking for dontCompile file:  "      echo "  looking for dontCompile file:  "
2641      for i in "." $MODS ; do      for i in "." $MODS $OADTOOLS ; do
2642          if test -r $i"/dontCompile" ; then          if test -r $i"/dontCompile" ; then
2643              OAD_DONT_COMPILE=$i"/dontCompile"              OAD_DONT_COMPILE=$i"/dontCompile"
2644              echo "     found $OAD_DONT_COMPILE"              echo "     found $OAD_DONT_COMPILE"
# Line 2636  if test "x$OPENAD" != x ; then Line 2646  if test "x$OPENAD" != x ; then
2646          fi          fi
2647      done      done
2648      echo "  looking for dontTransform file:  "      echo "  looking for dontTransform file:  "
2649      for i in "." $MODS ; do      for i in "." $MODS $OADTOOLS ; do
2650          if test -r $i"/dontTransform" ; then          if test -r $i"/dontTransform" ; then
2651              OAD_DONT_TRANSFORM=$i"/dontTransform"              OAD_DONT_TRANSFORM=$i"/dontTransform"
2652              echo "     found $OAD_DONT_TRANSFORM"              echo "     found $OAD_DONT_TRANSFORM"
# Line 2644  if test "x$OPENAD" != x ; then Line 2654  if test "x$OPENAD" != x ; then
2654          fi          fi
2655      done      done
2656      echo "  looking for keepOriginal file:  "      echo "  looking for keepOriginal file:  "
2657      for i in "." $MODS ; do      for i in "." $MODS $OADTOOLS ; do
2658          if test -r $i"/keepOriginal" ; then          if test -r $i"/keepOriginal" ; then
2659              OAD_KEEP_ORIGINAL=$i"/keepOriginal"              OAD_KEEP_ORIGINAL=$i"/keepOriginal"
2660              echo "     found $OAD_KEEP_ORIGINAL"              echo "     found $OAD_KEEP_ORIGINAL"
# Line 2652  if test "x$OPENAD" != x ; then Line 2662  if test "x$OPENAD" != x ; then
2662          fi          fi
2663      done      done
2664      echo "  looking for cb2mFiles:  "      echo "  looking for cb2mFiles:  "
2665      for i in "." $MODS ; do      for i in "." $MODS $OADTOOLS ; do
2666          if test -r $i"/cb2mFiles" ; then          if test -r $i"/cb2mFiles" ; then
2667              OAD_CB2M_FILES=$i"/cb2mFiles"              OAD_CB2M_FILES=$i"/cb2mFiles"
2668              echo "     found $OAD_CB2M_FILES"              echo "     found $OAD_CB2M_FILES"
# Line 2968  links: \$(F77_SRC_FILES) \$(C_SRC_FILES) Line 2978  links: \$(F77_SRC_FILES) \$(C_SRC_FILES)
2978    
2979  small_f: \$(F77_PP_SRC_FILES) \$(F90_PP_SRC_FILES)  small_f: \$(F77_PP_SRC_FILES) \$(F90_PP_SRC_FILES)
2980    
 output.txt: \$(EXECUTABLE)  
         @printf 'running ... '  
         @\$(EXECUTABLE) > \$@  
   
2981  # remove most of the files that "make" generates  # remove most of the files that "make" generates
2982  clean:  clean:
2983          -rm -rf *.p *.$FS90 *.mod ${RMFILES} work.{pc,pcl} *.template          -rm -rf *.p *.$FS90 *.mod ${RMFILES} work.{pc,pcl} *.template
# Line 3123  done Line 3129  done
3129  echo >> $MAKEFILE  echo >> $MAKEFILE
3130  rm -f $TMP.adSrcFiles  rm -f $TMP.adSrcFiles
3131    
3132    if test $CAT_SRC_FOR_TAF = 0 ; then
3133    cat >>$MAKEFILE <<EOF
3134    
3135    # ... Utilities ...
3136    remove_comments:
3137            sed -i.bak -f \$(TOOLSDIR)/remove_comments_sed \$(AD_FILES)
3138            @-rm -f \$(AD_FILES:.$FS=.$FS.bak)
3139    adj_sed:
3140            sed -i.bak -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed \$(AD_FILES:.$FS=_ad.$FS)
3141            @-rm -f \$(AD_FILES:.$FS=_ad.$FS.bak)
3142    ftl_sed:
3143            sed -i.bak -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed \$(AD_FILES:.$FS=_tl.$FS)
3144            @-rm -f \$(AD_FILES:.$FS=_tl.$FS.bak)
3145    adobjfiles: \$(AD_FILES:.$FS=_ad.o)
3146    ftlobjfiles: \$(AD_FILES:.$FS=_tl.o)
3147    EOF
3148    fi
3149    
3150  cat >>$MAKEFILE <<EOF  cat >>$MAKEFILE <<EOF
3151    
3152  # ... AD ...  # ... AD ...
# Line 3145  ad_input_code.$FS: \$(AD_FILES) \$(AD_FL Line 3169  ad_input_code.$FS: \$(AD_FILES) \$(AD_FL
3169          @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(FLOWFILES)          @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(FLOWFILES)
3170          cat \$(FLOWFILES) \$(AD_FILES) | sed -f \$(TOOLSDIR)/remove_comments_sed > ad_input_code.$FS          cat \$(FLOWFILES) \$(AD_FILES) | sed -f \$(TOOLSDIR)/remove_comments_sed > ad_input_code.$FS
3171    
3172  ad_taf_output.$FS: ad_input_code.$FS  adtafonly:
         @-rm -f ad_input_code_ad.$FS ; echo ''  
3173          \$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ad_input_code.$FS          \$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ad_input_code.$FS
3174          ls -l ad_input_code_ad.$FS          ls -l ad_input_code_ad.$FS
3175          cat ad_input_code_ad.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_taf_output.$FS          cat ad_input_code_ad.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_taf_output.$FS
3176    
3177  adtafonly:  EOF
3178    
3179    if test $CAT_SRC_FOR_TAF = 1 ; then
3180    cat >>$MAKEFILE <<EOF
3181    # ... send 1 file to TAF ...
3182    ad_taf_output.$FS: ad_input_code.$FS
3183            @-rm -f ad_input_code_ad.$FS ; echo ''
3184          \$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ad_input_code.$FS          \$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ad_input_code.$FS
3185          ls -l ad_input_code_ad.$FS          ls -l ad_input_code_ad.$FS
3186          cat ad_input_code_ad.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_taf_output.$FS          cat ad_input_code_ad.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_taf_output.$FS
# Line 3159  adtafonly: Line 3188  adtafonly:
3188  \$(EXE_AD): \$(SPECIAL_FILES) \$(H_SRC_FILES) ad_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(EMBEDDED_FILES)  \$(EXE_AD): \$(SPECIAL_FILES) \$(H_SRC_FILES) ad_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(EMBEDDED_FILES)
3189          \$(LINK) -o \${EXE_AD} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) ad_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(LIBS)          \$(LINK) -o \${EXE_AD} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) ad_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(LIBS)
3190    
3191  ad_tamc_output.$FS: ad_input_code.$FS  adobj: ad_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o)
         \$(TAMC) \$(AD_TAMC_FLAGS) \$(TAMC_EXTRA) ad_input_code.$FS  
         cat ad_input_code_ad.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_tamc_output.$FS  
3192    
3193  ad_tamc: ad_tamc_output.o \$(OBJFILES)  EOF
         \$(LINK) -o ${EXE_AD} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) \$(OBJFILES) ad_tamc_output.o \$(LIBS)  
3194    
3195    else
3196    cat >>$MAKEFILE <<EOF
3197    # ... send multiple files to TAF ...
3198    ad_taf_output.$FS: \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES)
3199            @$BASH\$(TOOLSDIR)/convert_cpp_cmd2defines "Adjoint version" -bAD_CONFIG_H -DALLOW_ADJOINT_RUN -UALLOW_TANGENTLINEAR_RUN > ad_config.template
3200            cmp ad_config.template AD_CONFIG.h || cat ad_config.template > AD_CONFIG.h
3201            @-rm -f ad_config.template
3202            @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(F77_PP_SRC_FILES)
3203            @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(FLOWFILES)
3204            @-rm -f \$(AD_FILES:.$FS=_ad.$FS) \$(AD_FILES:.$FS=_ad.o); echo ''
3205            \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) remove_comments
3206            \$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) \$(FLOWFILES) \$(AD_FILES)
3207            \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) adj_sed
3208            cat \$(AD_FILES:.$FS=_ad.$FS) > ad_taf_output.$FS
3209    
3210    \$(EXE_AD): \$(SPECIAL_FILES) \$(H_SRC_FILES) ad_taf_output.$FS \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(EMBEDDED_FILES)
3211            \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) adobjfiles
3212            \$(LINK) -o \${EXE_AD} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) \$(AD_FILES:.$FS=_ad.o) \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(LIBS)
3213    
3214    adobj: ad_taf_output.$FS \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o)
3215            \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) adobjfiles
3216    
3217    EOF
3218    fi
3219    
3220    cat >>$MAKEFILE <<EOF
3221  adonlyfwd:  adonlyfwd:
3222          patch < \$(TOOLSDIR)/ad_taf_output.f.onlyfwd.diff          patch < \$(TOOLSDIR)/ad_taf_output.f.onlyfwd.diff
3223    
3224  adtrick:  adtrick:
3225          patch < \$(TOOLSDIR)/ad_taf_output.f.adtrick.diff          patch < \$(TOOLSDIR)/ad_taf_output.f.adtrick.diff
3226    
3227  adobj: ad_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o)  ad_tamc_output.$FS: ad_input_code.$FS
3228            \$(TAMC) \$(AD_TAMC_FLAGS) \$(TAMC_EXTRA) ad_input_code.$FS
3229            cat ad_input_code_ad.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ad_tamc_output.$FS
3230    
3231    ad_tamc: ad_tamc_output.o \$(OBJFILES)
3232            \$(LINK) -o ${EXE_AD} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) \$(OBJFILES) ad_tamc_output.o \$(LIBS)
3233    
3234  # ... FTL ...  # ... FTL ...
3235  ftlall: ftl_exe_target  ftlall: ftl_exe_target
# Line 3194  ftl_input_code.$FS: \$(AD_FILES) Line 3251  ftl_input_code.$FS: \$(AD_FILES)
3251          @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(AD_FLOW_FILES)          @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(AD_FLOW_FILES)
3252          cat \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES) | sed -f \$(TOOLSDIR)/remove_comments_sed > ftl_input_code.$FS          cat \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES) | sed -f \$(TOOLSDIR)/remove_comments_sed > ftl_input_code.$FS
3253    
3254  ftl_taf_output.$FS: ftl_input_code.$FS  ftltafonly:
         @-rm -f ftl_input_code_tl.$FS ; echo ''  
3255          \$(TAF) \$(FTL_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ftl_input_code.$FS          \$(TAF) \$(FTL_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ftl_input_code.$FS
3256          ls -l ftl_input_code_tl.$FS          ls -l ftl_input_code_tl.$FS
3257          cat ftl_input_code_tl.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_taf_output.$FS          cat ftl_input_code_tl.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_taf_output.$FS
3258    
3259  ftltafonly:  EOF
3260    
3261    if test $CAT_SRC_FOR_TAF = 1 ; then
3262    cat >>$MAKEFILE <<EOF
3263    # ... send 1 file to TAF ...
3264    ftl_taf_output.$FS: ftl_input_code.$FS
3265            @-rm -f ftl_input_code_tl.$FS ; echo ''
3266          \$(TAF) \$(FTL_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ftl_input_code.$FS          \$(TAF) \$(FTL_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) ftl_input_code.$FS
3267          ls -l ftl_input_code_tl.$FS          ls -l ftl_input_code_tl.$FS
3268          cat ftl_input_code_tl.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_taf_output.$FS          cat ftl_input_code_tl.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_taf_output.$FS
# Line 3208  ftltafonly: Line 3270  ftltafonly:
3270  \$(EXE_FTL): \$(SPECIAL_FILES) \$(H_SRC_FILES) ftl_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(EMBEDDED_FILES)  \$(EXE_FTL): \$(SPECIAL_FILES) \$(H_SRC_FILES) ftl_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(EMBEDDED_FILES)
3271          \$(LINK) -o \${EXE_FTL} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) ftl_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(LIBS)          \$(LINK) -o \${EXE_FTL} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) ftl_taf_output.o \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(LIBS)
3272    
3273    EOF
3274    
3275    else
3276    cat >>$MAKEFILE <<EOF
3277    # ... send multiple files to TAF ...
3278    ftl_taf_output.$FS: \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES)
3279            @$BASH\$(TOOLSDIR)/convert_cpp_cmd2defines "TangLin version" -bAD_CONFIG_H -UALLOW_ADJOINT_RUN -DALLOW_TANGENTLINEAR_RUN > ad_config.template
3280            cmp ad_config.template AD_CONFIG.h || cat ad_config.template > AD_CONFIG.h
3281            @-rm -f ad_config.template
3282            @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(F77_PP_SRC_FILES)
3283            @\$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(AD_FLOW_FILES)
3284            @-rm -f \$(AD_FILES:.$FS=_tl.$FS) \$(AD_FILES:.$FS=_tl.o); echo ''
3285            \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) remove_comments
3286            \$(TAF) \$(FTL_TAF_FLAGS) \$(TAF_EXTRA) \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES)
3287            \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) ftl_sed
3288            cat \$(AD_FILES:.$FS=_tl.$FS) > ftl_taf_output.$FS
3289    
3290    \$(EXE_FTL): \$(SPECIAL_FILES) \$(H_SRC_FILES) ftl_taf_output.$FS \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(EMBEDDED_FILES)
3291            \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) ftlobjfiles
3292            \$(LINK) -o \${EXE_FTL} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) \$(AD_FILES:.$FS=_tl.o) \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=.o) \$(F90_SRC_FILES:.F90=.o) \$(C_SRC_FILES:.c=.o) \$(LIBS)
3293    
3294    EOF
3295    fi
3296    
3297    cat >>$MAKEFILE <<EOF
3298  ftl_tamc_output.$FS: ftl_input_code.$FS  ftl_tamc_output.$FS: ftl_input_code.$FS
3299          \$(TAMC) \$(FTL_TAMC_FLAGS) \$(TAMC_EXTRA) ftl_input_code.$FS          \$(TAMC) \$(FTL_TAMC_FLAGS) \$(TAMC_EXTRA) ftl_input_code.$FS
3300          cat ftl_input_code_ftl.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_tamc_output.$FS          cat ftl_input_code_ftl.$FS | sed -f \$(TOOLSDIR)/adjoint_sed > ftl_tamc_output.$FS
# Line 3250  if test "x$OPENAD" != x ; then Line 3337  if test "x$OPENAD" != x ; then
3337  # ============ begin OpenAD specific section ==============  # ============ begin OpenAD specific section ==============
3338    
3339  cat >>$MAKEFILE <<EOF  cat >>$MAKEFILE <<EOF
3340    # ... OpenAD ...
3341    
3342  # all the source files linked from the various locations:  # all the source files linked from the various locations:
3343  ALL_LINKED_FILES= \  ALL_LINKED_FILES= \
# Line 3303  rm -f $TMP.adSrcFiles Line 3391  rm -f $TMP.adSrcFiles
3391    
3392  cat >>$MAKEFILE <<EOF  cat >>$MAKEFILE <<EOF
3393    
3394  adAll: \$(EXE_AD)  adAll: ad_exe_target
3395  .PHONY: adAll  .PHONY: adAll
3396    
3397    ad_exe_target:
3398            @echo Update AD_CONFIG.h and make \$(EXE_AD)
3399            @$BASH\$(TOOLSDIR)/convert_cpp_cmd2defines "Adjoint version" -bAD_CONFIG_H -DALLOW_ADJOINT_RUN -UALLOW_TANGENTLINEAR_RUN > ad_config.template
3400            @cmp ad_config.template AD_CONFIG.h || cat ad_config.template > AD_CONFIG.h
3401            @-rm -f ad_config.template
3402            \$(MAKE) -f \$(MAKEFILE) \$(EXE_AD)
3403    
3404  CB2M_F90_PP_SRC_FILES=\$(addsuffix _mod.f$FS90, \$(CB2M_F90_SRC_NAMES))  CB2M_F90_PP_SRC_FILES=\$(addsuffix _mod.f$FS90, \$(CB2M_F90_SRC_NAMES))
3405    
3406  .PRECIOUS: \$(CB2M_F90_PP_SRC_FILES) \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=_cb2m.f$FS90)  .PRECIOUS: \$(CB2M_F90_PP_SRC_FILES) \$(NON_AD_F77_SRC_FILES:.F=_cb2m.f$FS90)
# Line 3363  AD_OBJ_FILES_S2=\$(AD_OBJ_FILES_S1) \$(N Line 3458  AD_OBJ_FILES_S2=\$(AD_OBJ_FILES_S1) \$(N
3458  small_f: \$(CB2M_F90_PP_SRC_FILES)  small_f: \$(CB2M_F90_PP_SRC_FILES)
3459  .PHONY: small_f  .PHONY: small_f
3460    
 ad_output.txt: \$(EXE_AD)  
         @printf 'linking data files ... '  
         \$(LN) -f ../input_ad/data* ../input_ad/eedata .  
         \$(LN) -f ../../global_ocean.90x40x15/input/*.bin .  
         @printf 'running ... '  
         @./\$(EXE_AD) > \$@  
   
3461  ad_input_code.f$FS90:  \$(CB2M_AD_FILES)  ad_input_code.f$FS90:  \$(CB2M_AD_FILES)
3462          cat \$^ > \$@          cat \$^ > \$@
3463    

Legend:
Removed from v.1.260  
changed lines
  Added in v.1.270

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.22