/[MITgcm]/MITgcm/tools/genmake2
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revision 1.1 by edhill, Sat Aug 16 14:01:08 2003 UTC revision 1.15 by edhill, Tue Oct 21 18:35:08 2003 UTC
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8  #   modified by aja 01/00  #   modified by aja 01/00
9  #   rewritten in bash by eh3 08/03  #   rewritten in bash by eh3 08/03
10    
11    # Search for particular CPP #cmds associated with packages
12    # usage: test_for_package_in_cpp_options CPP_file package_name
13    test_for_package_in_cpp_options() {
14        cpp_options=$1
15        pkg=$2
16        grep -i "#define.*ALLOW_$pkg" $cpp_options > /dev/null 2>&1
17        RETVAL=$?
18        if test "x${RETVAL}" = x0 ; then
19            echo "Error: In $cpp_options there is an illegal line: #define ALLOW_$pkg"
20            exit 99
21        fi
22        grep -i "#undef.*ALLOW_$pkg" $cpp_options > /dev/null 2>&1
23        RETVAL=$?
24        if test "x${RETVAL}" = x0 ; then
25            echo "Error: In $cpp_options there is an illegal line: #undef ALLOW_$pkg"
26            exit 99
27        fi
28        grep -i "#define.*DISABLE_$pkg" $cpp_options > /dev/null 2>&1
29        RETVAL=$?
30        if test "x${RETVAL}" = x0 ; then
31            echo "Error: In $cpp_options there is an illegal line: #define DISABLE_$pkg"
32            exit 99
33        fi
34        grep -i "#undef.*DISABLE_$pkg" $cpp_options > /dev/null 2>&1
35        RETVAL=$?
36        if test "x${RETVAL}" = x0 ; then
37            echo "Error: In $cpp_options there is an illegal line: #undef DISABLE_$pkg"
38            exit 99
39       fi
40    }
41    
42    # Read the $ROOTDIR/pkg/pkg_groups file and expand any references to
43    # the package list.
44    expand_pkg_groups() {
45        new_packages=
46        PKG_GROUPS=$ROOTDIR"/pkg/pkg_groups"
47        if test -r $PKG_GROUPS ; then
48            cat $PKG_GROUPS | sed -e 's/#.*$//g' | sed -e 's/:/ : /g' > ./p1.tmp
49            cat ./p1.tmp | $AWK '(NF>2 && $2==":"){ print $0 }' > ./p2.tmp
50            matched=0
51            for i in $PACKAGES ; do
52                line=`grep "^ *$i" ./p2.tmp`
53                RETVAL=$?
54                if test "x$RETVAL" = x0 ; then
55                    matched=1
56                    replace=`echo $line | $AWK '{ $1=""; $2=""; print $0 }'`
57                    echo "    replacing \"$i\" with: $replace"
58                    new_packages="$new_packages $replace"
59                else
60                    new_packages="$new_packages $i"
61                fi
62            done
63            PACKAGES=$new_packages
64            rm -f ./p[1,2].tmp
65        else
66            echo "Warning: can't read package groups definition file: $PKG_GROUPS"
67        fi
68    }
69    
70  # Guess possible config options for this host  # Guess possible config options for this host
71  find_possible_configs()  {  find_possible_configs()  {
72    
73      p_PLATFORM=`uname`"-"`uname -m`      tmp1=`uname`"_"`uname -m`
74      echo "The platform appears to be:"      tmp2=`echo $tmp1 | sed -e 'y/ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ/abcdefghijklmnopqrstuvwxyz/'`
75      echo "  "$p_PLATFORM      PLATFORM=`echo $tmp2 | sed -e 's/i[3-6]86/ia32/' | sed -e 's/athlon/ia32/'`
76        OFLIST=`(cd $ROOTDIR/tools/build_options; ls | grep "^$PLATFORM")`
77      p_LN=      echo "  The platform appears to be:  $PLATFORM"
78    #     if test "x$OFLIST" = x ; then
79    #       echo "  No pre-defined options files were found matching this platform"
80    #       echo "  but examples for other platforms can be found in:"
81    #       echo "    $ROOTDIR/tools/build_options"
82    #     else
83    #       echo "  Options files (located in $ROOTDIR/tools/build_options) that"
84    #       echo "  may work with this machine are:"
85    #       for i in $OFLIST ; do
86    #           echo "    $i"
87    #       done
88    #     fi
89        
90      echo "test" > test      echo "test" > test
91      ln -s ./test link      ln -s ./test link
92      RETVAL=$?      RETVAL=$?
93      if test "x${RETVAL}" = x0 ; then      if test "x${RETVAL}" = x0 ; then
94          p_LN="ln -s"          LN="ln -s"
95        else
96            echo "Error: \"ln -s\" does not appear to work on this system!"
97            echo "  For help, please contact <MITgcm-support@mitgcm.org>."
98            exit 1
99      fi      fi
100      rm -f test link      rm -f test link
101    
102      p_CPP=`which cpp`      if test "x$CPP" = x ; then
103                CPP="cpp -traditional -P"
     RETVAL=$?  
     if test "x${RETVAL}" = x0 ; then  
         p_LN="ln -s"  
104      fi      fi
     rm -f test link  
105    
106      # look for possible fortran compilers      # look for possible fortran compilers
107        tmp="$MITGCM_FC $FC g77 f77 pgf77 pgf95 ifc f90 f95 mpif77 mpf77 mpxlf95"
108      p_FC=      p_FC=
109      for c in f77 g77 pgf77 pgf95 ifc f90 f95 mpif77 mpf77 mpxlf95 ; do      for c in $tmp ; do
110          which $c > /dev/null 2>&1          rm -f ./hello.f ./hello
111            cat >> hello.f <<EOF
112          program hello
113          do i=1,3
114            print *, 'hello world : ', i
115          enddo
116          end
117    EOF
118            $c -o hello hello.f > /dev/null 2>&1
119          RETVAL=$?          RETVAL=$?
120          if test "x${RETVAL}" = x0 ; then          if test "x${RETVAL}" = x0 ; then
121              p_FC="$p_FC $c"              p_FC="$p_FC $c"
122          fi          fi
123      done      done
     echo "Possible FORTRAN compilers appear to be:  "  
124      if test "x${p_FC}" = x ; then      if test "x${p_FC}" = x ; then
125          echo "  None found!!!"          cat 1>&2 <<EOF
126      else  
127          echo "  "$p_FC  Error: No Fortran compilers were found in your path.  Please specify one using:
128      fi  
129        1) an "optfile" on (eg. "-optfile=path/to/OPTFILE"),
130        2) a command-line option (eg. "-fc NAME"), or
131        3) the MITGCM_FC environment variable.
132    
     # look for possible MPI libraries  
     mpi_libs=  
     mpi_fort=`which mpif77 2>/dev/null`  
     RETVAL=$?  
     if test "x${RETVAL}" = x0 ; then  
         cat >>test.f <<EOF  
       PROGRAM HELLO  
       DO 10, I=1,10  
       PRINT *,'Hello World'  
    10 CONTINUE  
       STOP  
       END  
133  EOF  EOF
134          eval "$mpi_fort -showme test.f > out"          exit 1
135          RETVAL=$?      else
136          if test "x${RETVAL}" = x0 ; then          echo "  The possible FORTRAN compilers found in your path are:"
137              a=`cat out`          echo "   "$p_FC
138              for i in $a ; do          if test "x$FC" = x ; then
139                  case $i in              FC=`echo $p_FC | $AWK '{print $1}'`
                     -*)  
                         mpi_libs="$mpi_libs $i" ;;  
                 esac  
             done  
             echo "The MPI libs appear to be:"  
             echo "  "$mpi_libs  
140          fi          fi
         rm -f test.f out  
141      fi      fi
142    
143  }      for i in $p_FC ; do
144            p_OF=$ROOTDIR"/tools/build_options/"$PLATFORM"_"$i
145            if test -r $p_OF ; then
146                OPTFILE=$p_OF
147                echo "  The options file:  $p_OF"
148                echo "    appears to match so we'll use it."
149                break
150            fi
151        done
152        if test "x$OPTFILE" = x ; then
153            cat 1>&2 <<EOF
154    
155  parse_options()  {  Error: No options file was found in:  $ROOTDIR/tools/build_options/
156      that matches this platform ("$PLATFORM") and the compilers found in
157      your path.  Please specify an "optfile" using:
158    
159      ac_prev=      1) the command line (eg. "-optfile=path/to/OPTFILE"), or
160      for ac_option in "${OPTIONS[@]}" ; do      2) the MITGCM_OF environment variable.
161    
162      If you need help, please contact the developers at <MITgcm-support@mitgcm.org>.
163    
164    EOF
165            exit 1
166        fi
167        
168    #     # look for possible MPI libraries
169    #     mpi_libs=
170    #     mpi_fort=`which mpif77 2>/dev/null`
171    #     RETVAL=$?
172    #     if test "x${RETVAL}" = x0 ; then
173    #       cat >>test.f <<EOF
174    #       PROGRAM HELLO
175    #       DO 10, I=1,10
176    #       PRINT *,'Hello World'
177    #    10 CONTINUE
178    #       STOP
179    #       END
180    # EOF
181    #       eval "$mpi_fort -showme test.f > out"
182    #       RETVAL=$?
183    #       if test "x${RETVAL}" = x0 ; then
184    #           a=`cat out`
185    #           for i in $a ; do
186    #               case $i in
187    #                   -*)
188    #                       mpi_libs="$mpi_libs $i" ;;
189    #               esac
190    #           done
191    #           echo "The MPI libs appear to be:"
192    #           echo "  "$mpi_libs
193    #       fi
194    #       rm -f test.f out
195    #     fi
196    
         # echo "ac_option = :$ac_option:"  
           
         # If the previous option needs an argument, assign it.  
         if test -n "$ac_prev"; then  
             eval "$ac_prev=\$ac_option"  
             ac_prev=  
             continue  
         fi  
           
         ac_optarg=`expr "x$ac_option" : 'x[^=]*=\(.*\)'`  
           
         case $ac_option in  
               
             -help | --help | -h | --h)  
                 usage ;;  
               
             -nooptfile | --nooptfile)  
                 OPTFILE="NONE" ;;  
             -optfile | --optfile | -of | --of)  
                 ac_prev=optfile ;;  
             -optfile=* | --optfile=* | -of=* | --of=*)  
                 OPTFILE=$ac_optarg ;;  
               
             -pdepend | --pdepend)  
                 ac_prev=pdepend ;;  
             -pdepend=* | --pdepend=*)  
                 PDEPEND=$ac_optarg ;;  
               
             -pdefault | --pdefault)  
                 ac_prev=pdefault ;;  
             -pdefault=* | --pdefault=*)  
                 PDEFAULT=$ac_optarg ;;  
               
             -makefile | -ma)  
                 ac_prev=makefile ;;  
             --makefile=* | -ma=*)  
                 MAKEFILE=$ac_optarg ;;  
               
             -platform | --platform | -pl | --pl)  
                 ac_prev=platform ;;  
             -platform=* | --platform=* | -pl=* | --pl=*)  
                 PLATFORM=$ac_optarg ;;  
   
             -rootdir | --rootdir | -rd | --rd)  
                 ac_prev=rootdir ;;  
             -rootdir=* | --rootdir=* | -rd=* | --rd=*)  
                 ROOTDIR=$ac_optarg ;;  
               
             -mods | --mods | -mo | --mo)  
                 ac_prev=mods ;;  
             -mods=* | --mods=* | -mo=* | --mo=*)  
                 MODS=$ac_optarg ;;  
               
             -disable | --disable)  
                 ac_prev=disable ;;  
             -disable=* | --disable=*)  
                 DISABLE=$ac_optarg ;;  
               
             -enable | --enable)  
                 ac_prev=enable ;;  
             -enable=* | --enable=*)  
                 ENABLE=$ac_optarg ;;  
               
             -noopt | --noopt)  
                 ac_prev=noopt ;;  
             -noopt=* | --noopt=*)  
                 NOOPT=$ac_optarg ;;  
               
 #           -cpp | --cpp)  
 #               ac_prev=cpp ;;  
 #           -cpp=* | --cpp=*)  
 #               CPP=$ac_optarg ;;  
               
             -fortran | --fortran | -fc | --fc)  
                 ac_prev=fc ;;  
             -fc=* | --fc=*)  
                 FC=$ac_optarg ;;  
               
             -ieee | --ieee)  
                 IEEE=1 ;;  
             -noieee | --noieee)  
                 IEEE=0 ;;  
               
             -mpi | --mpi)  
                 MPI=1 ;;  
             -nompi | --nompi)  
                 MPI=0 ;;  
               
             -jam | --jam)  
                 JAM=1 ;;  
             -nojam | --nojam)  
                 JAM=0 ;;  
               
             -*)  
                 echo "Error: unrecognized option: "$ac_option  
                 usage  
                 ;;  
               
             *)  
                 echo "Error: unrecognized argument: "$ac_option  
                 usage  
                 ;;  
               
         esac  
           
     done  
197  }  }
198    
199  #  Parse the package dependency information  #  Parse the package dependency information
# Line 199  get_pdepend_list()  { Line 202  get_pdepend_list()  {
202      #  strip the comments and then convert the dependency file into      #  strip the comments and then convert the dependency file into
203      #  two arrays: PNAME, DNAME      #  two arrays: PNAME, DNAME
204      cat $1 | sed -e 's/#.*$//g' \      cat $1 | sed -e 's/#.*$//g' \
205          | awk 'BEGIN{nn=0;} (NF>0){ for(i=2;i<=NF;i++){nn++; print "PNAME["nn"]="$1"\nDNAME["nn"]="$i} }' \          | $AWK 'BEGIN{nn=0;} (NF>0){ for(i=2;i<=NF;i++){nn++; print "PNAME["nn"]="$1"\nDNAME["nn"]="$i} }' \
206          > ./.pd_tmp          > ./.pd_tmp
207      source ./.pd_tmp      source ./.pd_tmp
208      rm -f ./.pd_tmp      rm -f ./.pd_tmp
# Line 210  get_pdepend_list()  { Line 213  get_pdepend_list()  {
213    
214  #  Explain usage  #  Explain usage
215  usage()  {  usage()  {
216      echo ""      echo
217      echo "Usage: "$0" [OPTIONS]"      echo "Usage: "$0" [OPTIONS]"
218      echo "  where [OPTIONS] can be:"$'\n'      echo "  where [OPTIONS] can be:"
219        echo
220      echo "    -help | --help | -h | --h"      echo "    -help | --help | -h | --h"
221      echo "    -nooptfile | --nooptfile"      echo "    -nooptfile | --nooptfile"
222      echo "      -optfile NAME | --optfile NAME | -of NAME | --of NAME"      echo "      -optfile NAME | --optfile NAME | -of NAME | --of NAME"
# Line 221  usage()  { Line 225  usage()  {
225      echo "      -pdepend=NAME | --pdepend=NAME"      echo "      -pdepend=NAME | --pdepend=NAME"
226      echo "    -pdefault NAME | --pdefault NAME"      echo "    -pdefault NAME | --pdefault NAME"
227      echo "      -pdefault=NAME | --pdefault=NAME"      echo "      -pdefault=NAME | --pdefault=NAME"
228      echo "    -makefile NAME | -ma NAME"      echo "    -make NAME | -m NAME"
229      echo "      --makefile=NAME | -ma=NAME"      echo "      --make=NAME | -m=NAME"
230        echo "    -makefile NAME | -mf NAME"
231        echo "      --makefile=NAME | -mf=NAME"
232      echo "    -platform NAME | --platform NAME | -pl NAME | --pl NAME"      echo "    -platform NAME | --platform NAME | -pl NAME | --pl NAME"
233      echo "      -platform=NAME | --platform=NAME | -pl=NAME | --pl=NAME"      echo "      -platform=NAME | --platform=NAME | -pl=NAME | --pl=NAME"
234      echo "    -rootdir NAME | --rootdir NAME | -rd NAME | --rd NAME"      echo "    -rootdir NAME | --rootdir NAME | -rd NAME | --rd NAME"
# Line 233  usage()  { Line 239  usage()  {
239      echo "      -disable=NAME | --disable=NAME"      echo "      -disable=NAME | --disable=NAME"
240      echo "    -enable NAME | --enable NAME"      echo "    -enable NAME | --enable NAME"
241      echo "      -enable=NAME | --enable=NAME"      echo "      -enable=NAME | --enable=NAME"
242        echo "    -standarddirs NAME | --standarddirs NAME"
243        echo "      -standarddirs=NAME | --standarddirs=NAME"
244      echo "    -noopt NAME | --noopt NAME"      echo "    -noopt NAME | --noopt NAME"
245      echo "      -noopt=NAME | --noopt=NAME"      echo "      -noopt=NAME | --noopt=NAME"
246  #    echo "    -cpp NAME | --cpp NAME"  #    echo "    -cpp NAME | --cpp NAME"
# Line 241  usage()  { Line 249  usage()  {
249      echo "      -fc=NAME | --fc=NAME"      echo "      -fc=NAME | --fc=NAME"
250      echo "    -[no]ieee | --[no]ieee"      echo "    -[no]ieee | --[no]ieee"
251      echo "    -[no]mpi | --[no]mpi"      echo "    -[no]mpi | --[no]mpi"
252      echo "    -[no]jam | --[no]jam"$'\n'      echo "    -[no]jam | --[no]jam"
253      echo "  and NAME is a string such as:"$'\n'      echo
254        echo "  and NAME is a string such as:"
255        echo
256      echo "    --enable pkg1   --enable 'pkg1 pkg2'   --enable 'pkg1 pkg2 pkg3'"      echo "    --enable pkg1   --enable 'pkg1 pkg2'   --enable 'pkg1 pkg2 pkg3'"
257      echo "    -mods=dir1   -mods='dir1'   -mods='dir1 dir2 dir3'"      echo "    -mods=dir1   -mods='dir1'   -mods='dir1 dir2 dir3'"
258      echo "    -foptim='-Mvect=cachesize:512000,transform -xtypemap=real:64,double:64,integer:32'"$'\n'      echo "    -foptim='-Mvect=cachesize:512000,transform -xtypemap=real:64,double:64,integer:32'"
259        echo
260      echo "  which, depending upon your shell, may need to be single-quoted"      echo "  which, depending upon your shell, may need to be single-quoted"
261      echo "  if it contains spaces, dashes, or other special characters."      echo "  if it contains spaces, dashes, or other special characters."
262      exit 1      exit 1
263  }  }
264    
 # Dump all important state  
 dump_state()  {  
     fname=$1  
     echo " " > $fname  
     RETVAL=$?  
     if test "x${RETVAL}" = x ; then  
         echo "Error: cannot write to $fname"  
         exit 1  
     fi  
     echo "makefile "$makefile > $fname  
 }  
   
   
265  #eh3 # This is the generic configuration.  #eh3 # This is the generic configuration.
266  #eh3 set LN         = ( 'ln -s' )  #eh3 set LN         = ( 'ln -s' )
267  #eh3 set CPP        = ( '/lib/cpp -P' )  #eh3 set CPP        = ( '/lib/cpp -P' )
# Line 284  dump_state()  { Line 282  dump_state()  {
282  #eh3 if (! $?NOOPTFLAGS ) set NOOPTFLAGS = (  )  #eh3 if (! $?NOOPTFLAGS ) set NOOPTFLAGS = (  )
283    
284  #  Set defaults here  #  Set defaults here
285    COMMANDL="$0 $@"
286    
287  PLATFORM=  PLATFORM=
288  LN=  LN=
289  S64=  S64=
290  KPP=  KPP=
291  FC=  FC=
292  LINK=  LINK=
293    DEFINES="-DWORDLENGTH=4"
294  PACKAGES=  PACKAGES=
295  ENABLE=  ENABLE=
296  DISABLE=  DISABLE=
297  MAKEFILE=  MAKEFILE=
298  MAKEDEPEND=  MAKEDEPEND=
299  PDEPEND=  PDEPEND=
300    DUMPSTATE=t
301  PDEFAULT=  PDEFAULT=
302  OPTFILE=  OPTFILE=
303  INCLUDES=-I.  INCLUDES="-I."
304  FFLAGS=  FFLAGS=
305  FOPTIM=  FOPTIM=
306  CFLAGS=  CFLAGS=
# Line 313  MODS= Line 315  MODS=
315  TOOLSDIR=  TOOLSDIR=
316  SOURCEDIRS=  SOURCEDIRS=
317  INCLUDEDIRS=  INCLUDEDIRS=
318    STANDARDDIRS=
319    
320  PWD=`pwd`  PWD=`pwd`
321  MAKE=make  MAKE=make
322    AWK=awk
323  THISHOSTNAME=`hostname`  THISHOSTNAME=`hostname`
324  THISCWD=`pwd`  THISCWD=`pwd`
325  THISDATE=`date`  THISDATE=`date`
326  MACHINE=`uname -a`  MACHINE=`uname -a`
327    EXECUTABLE=
328    EXEHOOK=
329    EXEDIR=
330    PACKAGES_CONF=
331    IEEE=
332    if test "x$MITGCM_IEEE" != x ; then
333        IEEE=$MITGCM_IEEE
334    fi
335    
336  echo $'\n'"===  Processing options files and arguments  ==="  AUTODIFF_PKG_USED=f
337  gm_local="./gm_local"  AD_OPTFILE=
338    
339    #  The following state can be set directly by command-line switches
340    gm_s1="OPTFILE PDEPEND PDEFAULT MAKEFILE PLATFORM ROOTDIR MODS DISABLE ENABLE NOOPT"
341    gm_s2="FC IEEE MPI JAM DUMPSTATE STANDARDDIRS"
342    
343    #  The following state is not directly set by command-line switches
344    gm_s3="LN S64 KPP LINK PACKAGES MAKEDEPEND PDEPEND PDEFAULT INCLUDES FFLAGS FOPTIM "
345    gm_s4="CFLAGS KFLAGS1 KFLAGS2 LIBS KPPFILES NOOPTFILES NOOPTFLAGS"
346    gm_s5="TOOLSDIR SOURCEDIRS INCLUDEDIRS PWD MAKE THISHOSTNAME THISDATE MACHINE"
347    gm_s6="EXECUTABLE EXEHOOK EXEDIR PACKAGES_CONF"
348    
349    #  The following are all related to adjoint/tangent-linear stuff
350    gm_s7="AUTODIFF_PKG_USED AD_OPTFILE TAMC TAF DIFF_FLAGS AD_TAMC_FLAGS AD_TAF_FLAGS"
351    gm_s8="FTL_TAMC_FLAGS FTL_TAF_FLAGS SVD_TAMC_FLAGS SVD_TAF_FLAGS"
352    gm_s9=""
353    
354    gm_state="COMMANDL $gm_s1 $gm_s2 $gm_s3 $gm_s4 $gm_s5 $gm_s6 $gm_s7 $gm_s8"
355    
356    
357    echo
358    echo "===  Processing options files and arguments  ==="
359    gm_local="genmake_local"
360    for i in . $MODS ; do
361        if test -r $i/$gm_local ; then
362            source $i/$gm_local
363            break
364        fi
365    done
366  echo -n "  getting local config information:  "  echo -n "  getting local config information:  "
367  if test -e $gm_local ; then  if test -e $gm_local ; then
368      echo "using $gm_local"      echo "using $gm_local"
369      source $gm_local      source $gm_local
370      echo "DISABLE=$DISABLE"$'\n'"ENABLE=$ENABLE"      # echo "DISABLE=$DISABLE"
371        # echo "ENABLE=$ENABLE"
372  else  else
373      echo "none found"      echo "none found"
374  fi  fi
375    
376  #  echo "$0::$1:$2:$3:$4:$5:$6:$7:"  #  echo "$0::$1:$2:$3:$4:$5:$6:$7:"
377  OPTIONS=()  #OPTIONS=
378  n=0  #n=0
379  for i ; do  #for i ; do
380     setvar="OPTIONS[$n]='$i'"  #   echo "$i  $n"
381     #  echo "  $setvar"  #   setvar="OPTIONS[$n]='$i'"
382     eval "$setvar"  #   #  echo "  $setvar"
383     n=$(( $n + 1 ))  #   eval "$setvar"
384  done  #   n=$(( $n + 1 ))
385  parse_options  #done
386    #parse_options
387  echo "  getting OPTFILE information:  "  ac_prev=
388  if test "x${OPTFILE}" = x ; then  for ac_option ; do
389      echo "Warning: no OPTFILE specified so we'll look for possible settings"  
390      echo $'\n'"===  Searching for possible settings for OPTFILE  ==="      # If the previous option needs an argument, assign it.
391      find_possible_configs      if test -n "$ac_prev"; then
392  else          eval "$ac_prev=\$ac_option"
393      if test "x$OPTFILE" = xNONE ; then          ac_prev=
394          echo "    OPTFILE=NONE so we'll try to use default settings"          continue
     else  
         if test -f "$OPTFILE" -a -r "$OPTFILE" ; then  
             echo "    using OPTFILE=\"$OPTFILE\""  
             source "$OPTFILE"  
             RETVAL=$?  
             if test "x$RETVAL" != x0 ; then  
                 echo -n "Error: failed to source OPTFILE \"$OPTFILE\""  
                 echo "--please check that variable syntax is bash-compatible"  
                 exit 1  
             fi  
         else  
             echo "Error: can't read OPTFILE=\"$OPTFILE\""  
             exit 1  
         fi  
     fi  
 fi  
   
 echo $'\n'"===  Setting defaults  ==="  
 echo -n "  Adding MODS directories:  "  
 for d in $MODS ; do  
     if test ! -d $d ; then  
         echo $'\n\n'"Error: MODS directory \"$d\" not found!"  
         exit 1  
     else  
         echo -n " $d"  
         SOURCEDIRS="$SOURCEDIRS $d"  
         INCLUDEDIRS="$INCLUDEDIRS $d"  
395      fi      fi
396        
397        ac_optarg=`expr "x$ac_option" : 'x[^=]*=\(.*\)'`
398        
399        case $ac_option in
400            
401            -help | --help | -h | --h)
402                usage ;;
403            
404            -nooptfile | --nooptfile)
405                OPTFILE="NONE" ;;
406            -optfile | --optfile | -of | --of)
407                ac_prev=OPTFILE ;;
408            -optfile=* | --optfile=* | -of=* | --of=*)
409                OPTFILE=$ac_optarg ;;
410            
411            -adoptfile | --adoptfile | -ad | --ad)
412                ac_prev=AD_OPTFILE ;;
413            -adoptfile=* | --adoptfile=* | -adof=* | --adof=*)
414                AD_OPTFILE=$ac_optarg ;;
415            
416            -pdepend | --pdepend)
417                ac_prev=PDEPEND ;;
418            -pdepend=* | --pdepend=*)
419                PDEPEND=$ac_optarg ;;
420            
421            -pdefault | --pdefault)
422                ac_prev=PDEFAULT ;;
423            -pdefault=* | --pdefault=*)
424                PDEFAULT=$ac_optarg ;;
425            
426            -make | --make | -m | --m)
427                ac_prev=MAKE ;;
428            -make=* | --make=* | -m=* | --m=*)
429                MAKE=$ac_optarg ;;
430            
431            -makefile | --makefile | -ma | --ma)
432                ac_prev=MAKEFILE ;;
433            -makefile=* | --makefile=* | -ma=* | --ma=*)
434                MAKEFILE=$ac_optarg ;;
435            
436            -platform | --platform | -pl | --pl)
437                ac_prev=PLATFORM ;;
438            -platform=* | --platform=* | -pl=* | --pl=*)
439                PLATFORM=$ac_optarg ;;
440            
441            -rootdir | --rootdir | -rd | --rd)
442                ac_prev=ROOTDIR ;;
443            -rootdir=* | --rootdir=* | -rd=* | --rd=*)
444                ROOTDIR=$ac_optarg ;;
445            
446            -mods | --mods | -mo | --mo)
447                ac_prev=MODS ;;
448            -mods=* | --mods=* | -mo=* | --mo=*)
449                MODS=$ac_optarg ;;
450            
451            -disable | --disable)
452                ac_prev=DISABLE ;;
453            -disable=* | --disable=*)
454                DISABLE=$ac_optarg ;;
455            
456            -enable | --enable)
457                ac_prev=ENABLE ;;
458            -enable=* | --enable=*)
459                ENABLE=$ac_optarg ;;
460            
461            -standarddirs | --standarddirs)
462                ac_prev=STANDARDDIRS ;;
463            -standarddirs=* | --standarddirs=*)
464                STANDARDDIRS=$ac_optarg ;;
465    
466            -noopt | --noopt)
467                ac_prev=NOOPT ;;
468            -noopt=* | --noopt=*)
469                NOOPT=$ac_optarg ;;
470            
471    #           -cpp | --cpp)
472    #               ac_prev=cpp ;;
473    #           -cpp=* | --cpp=*)
474    #               CPP=$ac_optarg ;;
475                
476            -fortran | --fortran | -fc | --fc)
477                ac_prev=FC ;;
478            -fc=* | --fc=*)
479                FC=$ac_optarg ;;
480            
481            -ieee | --ieee)
482                IEEE=true ;;
483            -noieee | --noieee)
484                IEEE= ;;
485            
486            -mpi | --mpi)
487                MPI=true ;;
488            -nompi | --nompi)
489                MPI= ;;
490            
491            -jam | --jam)
492                JAM=1 ;;
493            -nojam | --nojam)
494                JAM=0 ;;
495            
496            -ds | --ds)
497                DUMPSTATE=t ;;
498            
499            -*)
500                echo "Error: unrecognized option: "$ac_option
501                usage
502                ;;
503            
504            *)
505                echo "Error: unrecognized argument: "$ac_option
506                usage
507                ;;
508            
509        esac
510        
511  done  done
 echo  
512    
513  if test "x$MAKEFILE" = x ; then  if test -f ./.genmakerc ; then
514      MAKEFILE="Makefile"      echo
515  fi      echo "WARNING: genmake2 has detected a copy of the old-style \"./.genmakerc\""
516  if test "x${PLATFORM}" = x ; then      echo "  file.  This file format is no longer supported.  Please see:"
517      PLATFORM=$p_PLATFORM      echo
518        echo "    http://mitgcm.org/devel_HOWTO/"
519        echo
520        echo "  for directions on how to setup and use the new \"genmake2\" input"
521        echo "  files and send an email to MITgcm-support@mitgcm.org if you want help."
522        echo
523  fi  fi
524    
525  if test "x${ROOTDIR}" = x ; then  if test "x${ROOTDIR}" = x ; then
# Line 414  if test ! -d ${ROOTDIR} ; then Line 547  if test ! -d ${ROOTDIR} ; then
547      exit 1      exit 1
548  fi  fi
549    
550    echo "  getting OPTFILE information:  "
551    if test "x${OPTFILE}" = x ; then
552        if test "x$MITGCM_OF" = x ; then
553            echo "Warning: no OPTFILE specified so we'll look for possible settings"
554            printf "\n===  Searching for possible settings for OPTFILE  ===\n"
555            find_possible_configs
556        else
557            OPTFILE=$MITGCM_OF
558        fi
559    fi
560    if test "x$OPTFILE" != xNONE ; then
561        if test -f "$OPTFILE" -a -r "$OPTFILE" ; then
562            echo "    using OPTFILE=\"$OPTFILE\""
563            source "$OPTFILE"
564            RETVAL=$?
565            if test "x$RETVAL" != x0 ; then
566                echo -n "Error: failed to source OPTFILE \"$OPTFILE\""
567                echo "--please check that variable syntax is bash-compatible"
568                exit 1
569            fi
570            if test "x$DUMPSTATE" != xf ; then
571                cp -f $OPTFILE "genmake_optfile"
572            fi
573        else
574            echo "Error: can't read OPTFILE=\"$OPTFILE\""
575            exit 1
576        fi
577    fi
578    
579    echo "  getting AD_OPTFILE information:  "
580    if test "x${AD_OPTFILE}" = x ; then
581        if test "x$MITGCM_AD_OF" = x ; then
582            AD_OPTFILE=$ROOTDIR/tools/adjoint_options/adjoint_default
583        else
584            AD_OPTFILE=$MITGCM_AD_OF
585        fi
586    fi
587    if test "x${AD_OPTFILE}" != xNONE ; then
588        if test -f "$AD_OPTFILE" -a -r "$AD_OPTFILE" ; then
589            echo "    using AD_OPTFILE=\"$AD_OPTFILE\""
590            source "$AD_OPTFILE"
591            RETVAL=$?
592            if test "x$RETVAL" != x0 ; then
593                echo -n "Error: failed to source AD_OPTFILE \"$AD_OPTFILE\""
594                echo "--please check that variable syntax is bash-compatible"
595                exit 1
596            fi
597            if test "x$DUMPSTATE" != xf ; then
598                cp -f $AD_OPTFILE "genmake_ad_optfile"
599            fi
600        else
601            echo "Error: can't read AD_OPTFILE=\"$AD_OPTFILE\""
602            exit 1
603        fi
604    fi
605    
606    #  Check that FC, LINK, CPP, and S64 are defined.  If not, complain
607    #  and abort!
608    if test "x$FC" = x ; then
609        cat <<EOF 1>&2
610    
611    Error: no Fortran compiler: please specify using one of the following:
612      1) within the options file ("FC=...") as specified by "-of=OPTFILE"
613      2) the "-fc=XXX" command-line option
614      3) the "./genmake_local" file
615    EOF
616        exit 1
617    fi
618    if test "x$LINK" = x ; then
619        LINK=$FC
620    fi
621    if test "x$CPP" = x ; then
622        CPP="cpp"
623    fi
624    echo "#define A a" | $CPP > test_cpp 2>&1
625    RETVAL=$?
626    if test "x$RETVAL" != x0 ; then
627        cat <<EOF 1>&2
628    
629    Error: C pre-processor "$CPP" failed the test case: please specify using:
630    
631      1) within the options file ("CPP=...") as specified by "-of=OPTFILE"
632      2) the "./genmake_local" file
633    
634    EOF
635        exit 1
636    else
637        rm -f test_cpp
638    fi
639    if test "x$MAKEDEPEND" = x ; then
640        MAKEDEPEND=makedepend
641    fi
642    
643    printf "\n===  Setting defaults  ===\n"
644    echo -n "  Adding MODS directories:  "
645    for d in $MODS ; do
646        if test ! -d $d ; then
647            echo
648            echo "Error: MODS directory \"$d\" not found!"
649            exit 1
650        else
651            echo -n " $d"
652            SOURCEDIRS="$SOURCEDIRS $d"
653            INCLUDEDIRS="$INCLUDEDIRS $d"
654        fi
655    done
656    echo
657    
658    if test "x$MAKEFILE" = x ; then
659        MAKEFILE="Makefile"
660    fi
661    if test "x${PLATFORM}" = x ; then
662        PLATFORM=$p_PLATFORM
663    fi
664    
665  if test "x${EXEDIR}" = x ; then  if test "x${EXEDIR}" = x ; then
666      if test "${PWD##/*/}" = "bin" -a -d ../exe -a $ROOTDIR = .. ; then      if test "${PWD##/*/}" = "bin" -a -d ../exe -a $ROOTDIR = .. ; then
667          EXEDIR=../exe          EXEDIR=../exe
# Line 433  if test ! -d ${TOOLSDIR} ; then Line 681  if test ! -d ${TOOLSDIR} ; then
681      echo "Error: the specified $TOOLSDIR (\"$TOOLSDIR\") does not exist!"      echo "Error: the specified $TOOLSDIR (\"$TOOLSDIR\") does not exist!"
682      exit 1      exit 1
683  fi  fi
684    if test "x$S64" = x ; then
685        S64='$(TOOLSDIR)/set64bitConst.sh'
686    fi
687    
688  EXECUTABLE=${EXECUTABLE:-mitgcmuv}  EXECUTABLE=${EXECUTABLE:-mitgcmuv}
689    
# Line 443  if test -r $ROOTDIR"/eesupp/src/Makefile Line 694  if test -r $ROOTDIR"/eesupp/src/Makefile
694      echo "  Making source files in eesupp from templates"      echo "  Making source files in eesupp from templates"
695      $MAKE -C $ROOTDIR"/eesupp/src/" > make_eesupp.errors 2>&1      $MAKE -C $ROOTDIR"/eesupp/src/" > make_eesupp.errors 2>&1
696      RETVAL=$?      RETVAL=$?
697      if test "x${RETVAL}" == "x0" ; then      if test "x${RETVAL}" = x0 ; then
698          rm -f make_eesupp.errors          rm -f make_eesupp.errors
699      else      else
700          echo "Error: problem encountered while building source files in eesupp:"          echo "Error: problem encountered while building source files in eesupp:"
# Line 452  if test -r $ROOTDIR"/eesupp/src/Makefile Line 703  if test -r $ROOTDIR"/eesupp/src/Makefile
703      fi      fi
704  fi  fi
705    
706  echo $'\n'"===  Determining package settings  ==="  printf "\n===  Determining package settings  ===\n"
707  if  test "x${PDEPEND}" = x ; then  if  test "x${PDEPEND}" = x ; then
708      tmp=$ROOTDIR"/pkg/pkg_depend"      tmp=$ROOTDIR"/pkg/pkg_depend"
709      if test -r $tmp ; then      if test -r $tmp ; then
# Line 471  echo "  getting package dependency info Line 722  echo "  getting package dependency info
722  #  Strip the comments and then convert the dependency file into  #  Strip the comments and then convert the dependency file into
723  #  two arrays: PNAME, DNAME  #  two arrays: PNAME, DNAME
724  cat $PDEPEND | sed -e 's/#.*$//g' \  cat $PDEPEND | sed -e 's/#.*$//g' \
725      | awk 'BEGIN{nn=-1;} (NF>0){ for(i=2;i<=NF;i++){nn++; print "PNAME["nn"]="$1"\nDNAME["nn"]="$i} }' \      | $AWK 'BEGIN{nn=-1;} (NF>0){ for(i=2;i<=NF;i++){nn++; print "PNAME_"nn"="$1"\nDNAME_"nn"="$i}} END{print "nname="nn}' \
726      > ./.pd_tmp      > ./.pd_tmp
727  RETVAL=$?  RETVAL=$?
728  if test ! "x${RETVAL}" = x0 ; then  if test ! "x${RETVAL}" = x0 ; then
# Line 481  fi Line 732  fi
732  source ./.pd_tmp  source ./.pd_tmp
733  rm -f ./.pd_tmp  rm -f ./.pd_tmp
734    
735    #  Search for default packages.  Note that a "$ROOTDIR/pkg/pkg_groups"
736    #  file should eventually be added so that, for convenience, one can
737    #  specify groups of packages using names like "ocean" and "atmosphere".
738  echo  -n "  checking default package list:  "  echo  -n "  checking default package list:  "
739  if test "x${PDEFAULT}" = x ; then  if test "x${PDEFAULT}" = x ; then
740        for i in "." $MODS ; do
741            if test -r $i"/packages.conf" ; then
742                    PDEFAULT=$i"/packages.conf"
743                    break
744            fi
745        done
746    fi
747    if test "x${PDEFAULT}" = x ; then
748      PDEFAULT="$ROOTDIR/pkg/pkg_default"      PDEFAULT="$ROOTDIR/pkg/pkg_default"
749  fi  fi
750  if test "x${PDEFAULT}" = xNONE ; then  if test "x${PDEFAULT}" = xNONE ; then
# Line 494  else Line 756  else
756      else      else
757          echo "  using PDEFAULT=\"$PDEFAULT\""          echo "  using PDEFAULT=\"$PDEFAULT\""
758          #  Strip the comments and add all the names          #  Strip the comments and add all the names
759          def=`cat $PDEFAULT | sed -e 's/#.*$//g' | awk '(NF>0){print $0}'`          def=`cat $PDEFAULT | sed -e 's/#.*$//g' | $AWK '(NF>0){print $0}'`
760          RETVAL=$?          RETVAL=$?
761          if test "x${RETVAL}" != x0 ; then          if test "x${RETVAL}" != x0 ; then
762              echo -n "Error: can't parse default package list "              echo -n "Error: can't parse default package list "
# Line 504  else Line 766  else
766          for i in $def ; do          for i in $def ; do
767              PACKAGES="$PACKAGES $i"              PACKAGES="$PACKAGES $i"
768          done          done
769          echo "    packages are:  $PACKAGES"          echo "    before group expansion packages are: $PACKAGES"
770            expand_pkg_groups
771            echo "    after group expansion packages are:  $PACKAGES"
772      fi      fi
773  fi  fi
774    
# Line 523  for p in $PACKAGES ; do Line 787  for p in $PACKAGES ; do
787  done  done
788  PACKAGES="$pack"  PACKAGES="$pack"
789  echo "  applying ENABLE settings"  echo "  applying ENABLE settings"
790  rm -f ./.tmp_pack  echo "" > ./.tmp_pack
791  PACKAGES="$PACKAGES $ENABLE"  PACKAGES="$PACKAGES $ENABLE"
792  for i in $PACKAGES ; do  for i in $PACKAGES ; do
793      if test ! -d "$ROOTDIR/pkg/$i" ; then      if test ! -d "$ROOTDIR/pkg/$i" ; then
# Line 544  echo "  applying package dependency rule Line 808  echo "  applying package dependency rule
808  ck=  ck=
809  while test "x$ck" != xtt ; do  while test "x$ck" != xtt ; do
810      i=0      i=0
811      rtot=${#PNAME[@]}      # rtot=${#PNAME[@]}
812        rtot=$nname
813      while test $i -lt $rtot ; do      while test $i -lt $rtot ; do
814    
815          #  Is $pname in the current $PACKAGES list?          #  Is $pname in the current $PACKAGES list?
816          pname=${PNAME[$i]}          #  pname=${PNAME[$i]}
817            tmp="pname=\"\$PNAME_$i\""
818            eval $tmp
819          pin="f"          pin="f"
820          for p in $PACKAGES ; do          for p in $PACKAGES ; do
821              if test "x$p" = "x$pname" ; then              if test "x$p" = "x$pname" ; then
# Line 557  while test "x$ck" != xtt ; do Line 824  while test "x$ck" != xtt ; do
824          done          done
825    
826          #  Is the DNAME entry a (+) or (-) rule ?          #  Is the DNAME entry a (+) or (-) rule ?
827            tmp="dname=\"\$DNAME_$i\""
828            eval $tmp
829          plus="-"          plus="-"
830          echo "${DNAME[$i]}" | grep '^+' > /dev/null 2>&1          echo $dname | grep '^+' > /dev/null 2>&1
831          RETVAL=$?          RETVAL=$?
832          if test "x$RETVAL" = x0 ; then          if test "x$RETVAL" = x0 ; then
833              plus="+"              plus="+"
834          fi          fi
835    
836          #  Is $dname in the current $PACKAGES list?          #  Is $dname in the current $PACKAGES list?
837          dname=`echo ${DNAME[$i]} | sed -e 's/^[+-]//'`          dname=`echo $dname | sed -e 's/^[+-]//'`
838          din="f"          din="f"
839          for p in $PACKAGES ; do          for p in $PACKAGES ; do
840              if test "x$p" = "x$dname" ; then              if test "x$p" = "x$dname" ; then
# Line 609  for i in $PACKAGES ; do Line 878  for i in $PACKAGES ; do
878      if test -d $adr ; then      if test -d $adr ; then
879          SOURCEDIRS="$SOURCEDIRS $adr"          SOURCEDIRS="$SOURCEDIRS $adr"
880          INCLUDEDIRS="$INCLUDEDIRS $adr"          INCLUDEDIRS="$INCLUDEDIRS $adr"
881            if test "x$i" = xautodiff ; then
882                AUTODIFF_PKG_USED=t
883            fi
884      else      else
885          echo "Error: the directory \"$adr\" for package $i doesn't exist"          echo "Error: the directory \"$adr\" for package $i doesn't exist"
886          exit 1          exit 1
# Line 634  done Line 906  done
906  # done  # done
907  # echo  # echo
908    
909  echo "  Setting package-specific CPP flags in CPP_OPTIONS.h:"  # Create a list of #define and #undef to enable/disable packages
910  CPP_OPTIONS=  PACKAGES_DOT_H=PACKAGES_CONFIG.h
911  spaths=". $SOURCEDIRS"  cat <<EOF >$PACKAGES_DOT_H".tmp"
 for i in $spaths ; do  
     try="$i/CPP_OPTIONS.h"  
     #  echo -n "    trying $try : "  
     if test -f $try -a -r $try ; then  
         echo "    found CPP_OPTIONS=\"$try\""  
         CPP_OPTIONS="$try"  
         if test "x$i" != "x." ; then  
             cp -f $CPP_OPTIONS .  
         fi  
         break  
     fi  
 done  
 if test "x$CPP_OPTIONS" = x ; then  
     echo "Error: can't find \"CPP_OPTIONS.h\" in the path list: $spaths"  
     exit 1  
 fi  
 if test -e CPP_OPTIONS.h ; then  
     if test ! -e CPP_OPTIONS.h.bak ; then  
         cp -f CPP_OPTIONS.h CPP_OPTIONS.h.bak  
     fi  
     cat CPP_OPTIONS.h \  
         | awk 'BEGIN{p=1;} ($1=="C===" && $2=="GENMAKE"){p=0;} {if (p==1) print $0}' \  
         > CPP_OPTIONS.h.tmp  
 fi  
 cat <<EOF >>CPP_OPTIONS.h.tmp  
912  C=== GENMAKE v2 ===  C=== GENMAKE v2 ===
913  C  The following defines have been set by GENMAKE, so please edit  C  The following defines have been set by GENMAKE, so please do not
914  C  them only if you know what you're doing.  In general, you should  C  edit anything below these comments.  In general, you should
915  C  add or remove packages by re-running genmake with different  C  add or remove packages by re-running genmake with different
916  C  "-enable" and/or "-disable" options.  C  "-enable" and/or "-disable" options.
917    
918    #ifndef PACKAGES_H
919    #define PACKAGES_H
920    
921  C  Packages disabled by genmake:  C  Packages disabled by genmake:
922  EOF  EOF
923  #  The following UGLY HACK sets multiple "#undef"s and it needs to go  #  The following UGLY HACK sets multiple "#undef"s and it needs to go
# Line 686  for n in $names ; do Line 936  for n in $names ; do
936              fi              fi
937          done          done
938          if test "x$has_pack" = xf ; then          if test "x$has_pack" = xf ; then
939              undef=`echo "ALLOW_$n" | awk '{print toupper($0)}'`              undef=`echo "ALLOW_$n" | $AWK '{print toupper($0)}'`
940              echo "#undef $undef" >> CPP_OPTIONS.h.tmp              echo "#undef $undef" >> $PACKAGES_DOT_H".tmp"
941    #           DEFINES="$DEFINES -U$undef"
942    
943  #EH3  WARNING :  This is an UGLY HACK that needs to be removed!!!  #EH3  WARNING :  This is an UGLY HACK that needs to be removed!!!
944              case $n in              case $n in
# Line 697  for n in $names ; do Line 948  for n in $names ; do
948                  mom_vecinv)                  mom_vecinv)
949                      DEFINES="$DEFINES -DDISABLE_MOM_VECINV"                      DEFINES="$DEFINES -DDISABLE_MOM_VECINV"
950                      ;;                      ;;
                 generic_advdiff)  
                     DEFINES="$DEFINES -DDISABLE_GENERIC_ADVDIFF"  
                     ;;  
951                  debug)                  debug)
952                      DEFINES="$DEFINES -DDISABLE_DEBUGMODE"                      DEFINES="$DEFINES -DDISABLE_DEBUGMODE"
953                      ;;                      ;;
# Line 709  for n in $names ; do Line 957  for n in $names ; do
957          fi          fi
958      fi      fi
959  done  done
960  cat <<EOF >>CPP_OPTIONS.h.tmp  cat <<EOF >>$PACKAGES_DOT_H".tmp"
961    
962  C  Packages enabled by genmake:  C  Packages enabled by genmake:
963  EOF  EOF
964  for i in $PACKAGES ; do  for i in $PACKAGES ; do
965      def=`echo "ALLOW_$i" | awk '{print toupper($0)}'`      def=`echo "ALLOW_$i" | $AWK '{print toupper($0)}'`
966      echo "#define $def" >> CPP_OPTIONS.h.tmp      echo "#define $def" >> $PACKAGES_DOT_H".tmp"
967    #eh3 DEFINES="$DEFINES -D$def"
968    
969  #EH3  WARNING :  This is an UGLY HACK that needs to be removed!!!  #EH3  WARNING :  This is an UGLY HACK that needs to be removed!!!
970      case $i in      case $i in
971          aim_v23)          aim_v23)
972              echo "#define   ALLOW_AIM" >> CPP_OPTIONS.h.tmp              echo "#define   ALLOW_AIM" >> $PACKAGES_DOT_H".tmp"
973                DEFINES="$DEFINES -DALLOW_AIM"
974                echo "Warning: ALLOW_AIM is set to enable aim_v23. This is REALLY ugly Jean-Michel :-)"
975              ;;              ;;
976      esac      esac
977  #EH3  WARNING :  This is an UGLY HACK that needs to be removed!!!  #EH3  WARNING :  This is an UGLY HACK that needs to be removed!!!
978    
979  done  done
980  mv -f CPP_OPTIONS.h.tmp CPP_OPTIONS.h  cat <<EOF >>$PACKAGES_DOT_H".tmp"
981    
982    #endif /* PACKAGES_H */
983    EOF
984    
985    if test ! -f $PACKAGES_DOT_H ; then
986        mv -f $PACKAGES_DOT_H".tmp" $PACKAGES_DOT_H
987    else
988        cmp $PACKAGES_DOT_H".tmp" $PACKAGES_DOT_H
989        RETVAL=$?
990        if test "x$RETVAL" = x0 ; then
991            rm -f $PACKAGES_DOT_H".tmp"
992        else
993            mv -f $PACKAGES_DOT_H $PACKAGES_DOT_H".bak"
994            mv -f $PACKAGES_DOT_H".tmp" $PACKAGES_DOT_H
995        fi
996    fi
997    
998  echo "  Adding STANDARDDIRS"  echo "  Adding STANDARDDIRS"
999  BUILDDIR=${BUILDDIR:-.}  BUILDDIR=${BUILDDIR:-.}
1000  STANDARDDIRS=${STANDARDDIRS:-"eesupp model"}  if test "x$STANDARDDIRS" = x ; then
1001        STANDARDDIRS="eesupp model"
1002    fi
1003  for d in $STANDARDDIRS ; do  for d in $STANDARDDIRS ; do
1004      adr="$ROOTDIR/$d/src"      adr="$ROOTDIR/$d/src"
1005      if test ! -d $adr ; then      if test ! -d $adr ; then
# Line 750  for d in $STANDARDDIRS ; do Line 1019  for d in $STANDARDDIRS ; do
1019      fi      fi
1020  done  done
1021    
1022    echo " Searching for CPP_OPTIONS.h in order to warn about the presence"
1023    echo " of \"#define ALLOW_PKGNAME\"-type statements:"
1024    CPP_OPTIONS=
1025    spaths=". $INCLUDEDIRS"
1026    for i in $spaths ; do
1027        try="$i/CPP_OPTIONS.h"
1028        #  echo -n "    trying $try : "
1029        if test -f $try -a -r $try ; then
1030            echo "    found CPP_OPTIONS=\"$try\""
1031            CPP_OPTIONS="$try"
1032            break
1033        fi
1034    done
1035    if test "x$CPP_OPTIONS" = x ; then
1036        echo "Error: can't find \"CPP_OPTIONS.h\" in the path list: $spaths"
1037        exit 1
1038    fi
1039    # New safety test: make sure packages are not mentioned in CPP_OPTIONS.h
1040    names=`ls -1 "$ROOTDIR/pkg"`
1041    for n in $names ; do
1042        test_for_package_in_cpp_options $CPP_OPTIONS $n
1043    done
1044    
1045    
1046    #  Here, we build the list of files to be "run through" the adjoint
1047    #  compiler.
1048    if test -f ./ad_files ; then
1049        rm -f ./ad_files
1050    fi
1051    echo "  Creating the list of files for the adjoint compiler."
1052    for i in $SOURCEDIRS ; do
1053        list_files=`( cd $i && ls -1 *.list 2>/dev/null )`
1054        for j in $list_files ; do
1055            cat $i/$j >> ad_files
1056        done
1057    done
1058    
1059    cat <<EOF > adjoint_sed
1060    s/call adopen(/call adopen ( mythid,\\
1061         \&           /g
1062    s/call adclose(/call adclose( mythid,\\
1063         \&           /g
1064    s/call adread(/call adread ( mythid,\\
1065         \&           /g
1066    s/call adwrite(/call adwrite( mythid,\\
1067         \&           /g
1068    
1069  echo $'\n'"===  Creating the Makefile  ==="  EOF
1070    
1071    echo
1072    echo "===  Creating the Makefile  ==="
1073  echo "  setting INCLUDES"  echo "  setting INCLUDES"
1074  for i in $INCLUDEDIRS ; do  for i in $INCLUDEDIRS ; do
1075      if test -d $i ; then      if ! test -d $i ; then
1076          INCLUDES="$INCLUDES -I$i"  #       INCLUDES="$INCLUDES -I$i"
1077      else  #   else
1078          echo "Warning: can't find INCLUDEDIRS=\"$i\""          echo "Warning: can't find INCLUDEDIRS=\"$i\""
1079      fi      fi
1080  done  done
# Line 766  rm -rf .links.tmp Line 1084  rm -rf .links.tmp
1084  mkdir .links.tmp  mkdir .links.tmp
1085  echo "# This section creates symbolic links" > srclinks.tmp  echo "# This section creates symbolic links" > srclinks.tmp
1086  echo "" >> srclinks.tmp  echo "" >> srclinks.tmp
1087  echo -n 'SRCFILES = ' > srclist.inc  echo -n 'SRCFILES = '    > srclist.inc
1088  echo -n 'CSRCFILES = ' > csrclist.inc  echo -n 'CSRCFILES = '   > csrclist.inc
1089    echo -n 'F90SRCFILES = ' > f90srclist.inc
1090  echo -n 'HEADERFILES = ' > hlist.inc  echo -n 'HEADERFILES = ' > hlist.inc
1091  alldirs=". $SOURCEDIRS $INCLUDEDIRS"  echo -n 'AD_FLOW_FILES = ' > ad_flow_files.inc
1092    alldirs="$SOURCEDIRS $INCLUDEDIRS ."
1093  for d in $alldirs ; do  for d in $alldirs ; do
1094      deplist=      deplist=
1095      sfiles=`( cd $d; echo *.[h,c,F] )`      sfiles=`( cd $d; echo *.[h,c,F] *.flow )`
1096        sfiles=`( echo $sfiles; cd $d; echo *.F90 )`
1097      for sf in $sfiles ; do      for sf in $sfiles ; do
1098          if test ! -r ".links.tmp/$sf" ; then          if test ! -r ".links.tmp/$sf" ; then
1099              if test -f "$d/$sf" ; then              if test -f "$d/$sf" ; then
1100                  extn=`echo $sf | awk -F '.' '{print $NF}'`                  extn=`echo $sf | $AWK -F '.' '{print $NF}'`
1101                  touch .links.tmp/$sf                  touch .links.tmp/$sf
1102                  deplist="$deplist $sf"                  deplist="$deplist $sf"
1103                  case $extn in                  case $extn in
# Line 784  for d in $alldirs ; do Line 1105  for d in $alldirs ; do
1105                          echo    " \\"  >> srclist.inc                          echo    " \\"  >> srclist.inc
1106                          echo -n " $sf" >> srclist.inc                          echo -n " $sf" >> srclist.inc
1107                          ;;                          ;;
1108                        F90)
1109                            echo    " \\"  >> f90srclist.inc
1110                            echo -n " $sf" >> f90srclist.inc
1111                            ;;
1112                      c)                      c)
1113                          echo    " \\"  >> csrclist.inc                          echo    " \\"  >> csrclist.inc
1114                          echo -n " $sf" >> csrclist.inc                          echo -n " $sf" >> csrclist.inc
# Line 792  for d in $alldirs ; do Line 1117  for d in $alldirs ; do
1117                          echo    " \\"  >> hlist.inc                          echo    " \\"  >> hlist.inc
1118                          echo -n " $sf" >> hlist.inc                          echo -n " $sf" >> hlist.inc
1119                          ;;                          ;;
1120                        flow)
1121                            echo    " \\"  >> ad_flow_files.inc
1122                            echo -n " $sf" >> ad_flow_files.inc
1123                            ;;
1124                  esac                  esac
1125              fi              fi
1126          fi          fi
1127      done      done
1128      if test "x$deplist" != x ; then      if test "x$deplist" != x ; then
1129          echo $'\n'"#  These files are linked from $d" >> srclinks.tmp          echo "" >> srclinks.tmp
1130            echo "#  These files are linked from $d" >> srclinks.tmp
1131          echo "$deplist :" >> srclinks.tmp          echo "$deplist :" >> srclinks.tmp
1132          echo $'\t$(LN) '$d'/$@ $@' >> srclinks.tmp          printf "\t\$(LN) %s/\$@ \$@\n" $d >> srclinks.tmp
1133      fi      fi
1134  done  done
1135  rm -rf .links.tmp  rm -rf .links.tmp
1136  echo "" >> srclist.inc  echo "" >> srclist.inc
1137  echo "" >> csrclist.inc  echo "" >> csrclist.inc
1138    echo "" >> f90srclist.inc
1139  echo "" >> hlist.inc  echo "" >> hlist.inc
1140    echo "" >> ad_flow_files.inc
1141    
1142  if test -e $MAKEFILE ; then  if test -e $MAKEFILE ; then
1143      mv -f $MAKEFILE "$MAKEFILE.bak"      mv -f $MAKEFILE "$MAKEFILE.bak"
# Line 847  EXEDIR      = ${EXEDIR} Line 1179  EXEDIR      = ${EXEDIR}
1179  EXECUTABLE  = \$(EXEDIR)/${EXECUTABLE}  EXECUTABLE  = \$(EXEDIR)/${EXECUTABLE}
1180  TOOLSDIR    = ${TOOLSDIR}  TOOLSDIR    = ${TOOLSDIR}
1181    
1182    #eh3  new defines for the adjoint work
1183    AUTODIFF    = ${ROOTDIR}/pkg/autodiff
1184    
1185  EOF  EOF
1186    
1187  #  Note: figure out some way to add Hyades JAM libraries here  #  Note: figure out some way to add Hyades JAM libraries here
# Line 862  MAKEDEPEND = ${MAKEDEPEND} Line 1197  MAKEDEPEND = ${MAKEDEPEND}
1197  KPP = ${KPP}  KPP = ${KPP}
1198  # Fortran compiler  # Fortran compiler
1199  FC = ${FC}  FC = ${FC}
1200    # Fortran compiler
1201    F90C = ${F90C}
1202  # Link editor  # Link editor
1203  LINK = ${LINK}  LINK = ${LINK}
1204    
# Line 875  KFLAGS2 = ${KFLAGS2} Line 1212  KFLAGS2 = ${KFLAGS2}
1212  # Optim./debug for FC  # Optim./debug for FC
1213  FFLAGS = ${FFLAGS}  FFLAGS = ${FFLAGS}
1214  FOPTIM = ${FOPTIM}  FOPTIM = ${FOPTIM}
1215    # Optim./debug for FC
1216    F90FLAGS = ${F90FLAGS}
1217    F90OPTIM = ${F90OPTIM}
1218  # Flags for CC  # Flags for CC
1219  CFLAGS = ${CFLAGS}  CFLAGS = ${CFLAGS}
1220  # Files that should not be optimized  # Files that should not be optimized
# Line 882  NOOPTFILES = ${NOOPTFILES} Line 1222  NOOPTFILES = ${NOOPTFILES}
1222  NOOPTFLAGS = ${NOOPTFLAGS}  NOOPTFLAGS = ${NOOPTFLAGS}
1223  # Flags and libraries needed for linking  # Flags and libraries needed for linking
1224  LIBS = ${LIBS} \$(XLIBS)  LIBS = ${LIBS} \$(XLIBS)
1225    # Name of the Mekfile
1226    MAKEFILE=${MAKEFILE}
1227    
1228  EOF  EOF
1229    
1230  cat srclist.inc  >> $MAKEFILE  cat srclist.inc       >> $MAKEFILE
1231  cat csrclist.inc >> $MAKEFILE  cat csrclist.inc      >> $MAKEFILE
1232  cat hlist.inc >> $MAKEFILE  cat f90srclist.inc    >> $MAKEFILE
1233  echo 'F77FILES =  $(SRCFILES:.F=.f)'                    >> $MAKEFILE  cat hlist.inc         >> $MAKEFILE
1234  echo 'OBJFILES =  $(SRCFILES:.F=.o) $(CSRCFILES:.c=.o)' >> $MAKEFILE  cat ad_flow_files.inc >> $MAKEFILE
1235    echo               >> $MAKEFILE
1236    echo 'F77FILES =  $(SRCFILES:.F=.f)'                                           >> $MAKEFILE
1237    echo 'F90FILES =  $(F90SRCFILES:.F90=.f90)'                                    >> $MAKEFILE
1238    echo 'OBJFILES =  $(SRCFILES:.F=.o) $(CSRCFILES:.c=.o) $(F90SRCFILES:.F90=.o)' >> $MAKEFILE
1239    
1240  rm -f srclist.inc csrclist.inc hlist.inc flist.tmp clist.tmp  rm -f srclist.inc csrclist.inc hlist.inc flist.tmp clist.tmp f90srclist.inc
1241    rm -f ad_flow_files.inc
1242    
1243  cat >>$MAKEFILE <<EOF  cat >>$MAKEFILE <<EOF
1244    
1245  .SUFFIXES:  .SUFFIXES:
1246  .SUFFIXES: .o .f .p .F .c  .SUFFIXES: .o .f .p .F .c .F90 .f90
1247    
1248  all: \$(EXECUTABLE)  all: \$(EXECUTABLE)
1249  \$(EXECUTABLE): \$(OBJFILES)  \$(EXECUTABLE): \$(OBJFILES)
# Line 904  all: \$(EXECUTABLE) Line 1251  all: \$(EXECUTABLE)
1251  depend:  depend:
1252          @make links          @make links
1253          \$(MAKEDEPEND) -o .f \$(DEFINES) \$(INCLUDES) \$(SRCFILES)          \$(MAKEDEPEND) -o .f \$(DEFINES) \$(INCLUDES) \$(SRCFILES)
1254            ${TOOLSDIR}/f90mkdepend >> \$(MAKEFILE)
1255    
1256  links: \$(SRCFILES) \$(CSRCFILES) \$(HEADERFILES)  links: \$(SRCFILES) \$(CSRCFILES) \$(HEADERFILES) \$(F90SRCFILES)
1257    
1258  small_f: \$(F77FILES)  small_f: \$(F77FILES) \$(F90FILES)
1259    
1260  output.txt: \$(EXECUTABLE)  output.txt: \$(EXECUTABLE)
1261          @printf 'running ... '          @printf 'running ... '
1262          @\$(EXECUTABLE) > \$@          @\$(EXECUTABLE) > \$@
1263    
1264  clean:  clean:
1265          -rm -rf *.o *.f *.p ${RMFILES} work.{pc,pcl}          -rm -rf *.o *.f *.p *.f90 *.mod ${RMFILES} work.{pc,pcl}
1266  Clean:  Clean:
1267          @make clean          @make clean
1268          @make cleanlinks          @make cleanlinks
1269          -rm -f Makefile.bak          -rm -f Makefile.bak genmake_state genmake_optfile make.log
1270  CLEAN:  CLEAN:
1271          @make Clean          @make Clean
1272          -find \$(EXEDIR) -name "*.meta" -exec rm {} \;          -find \$(EXEDIR) -name "*.meta" -exec rm {} \;
1273          -find \$(EXEDIR) -name "*.data" -exec rm {} \;          -find \$(EXEDIR) -name "*.data" -exec rm {} \;
1274          -find \$(EXEDIR) -name "fort.*" -exec rm {} \;          -find \$(EXEDIR) -name "fort.*" -exec rm {} \;
1275          -rm -f \$(EXECUTABLE)          -rm -f \$(EXECUTABLE) output.txt
1276    
1277    Makefile: makefile
1278  makefile:  makefile:
1279          ${0} $@          ${0} $@
1280  cleanlinks:  cleanlinks:
# Line 936  cleanlinks: Line 1285  cleanlinks:
1285          \$(CPP) \$(DEFINES) \$(INCLUDES) > \$@          \$(CPP) \$(DEFINES) \$(INCLUDES) > \$@
1286  .f.o:  .f.o:
1287          \$(FC) \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) -c \$<          \$(FC) \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) -c \$<
1288    .F90.f90:
1289            \$(CPP) \$(DEFINES) \$(INCLUDES) > \$@
1290    .f90.o:
1291            \$(F90C) \$(F90FLAGS) \$(F90OPTIM) -c \$<
1292  .c.o:  .c.o:
1293          \$(CC) \$(CFLAGS) -c \$<          \$(CC) \$(CFLAGS) -c \$<
1294    
# Line 945  cleanlinks: Line 1298  cleanlinks:
1298  .p.f:  .p.f:
1299          \$(KPP) \$(KFLAGS1)\$@ \$(KFLAGS2) \$<          \$(KPP) \$(KFLAGS1)\$@ \$(KFLAGS2) \$<
1300    
1301    #=========================================
1302    #===  Automatic Differentiation Rules  ===
1303    
1304    TAMC           = ${TAMC}
1305    TAF            = ${TAF}
1306    
1307  EOF  EOF
1308    
1309    ad_vars="AD_TAMC_FLAGS AD_TAF_FLAGS"
1310    ad_vars="$ad_vars FTL_TAMC_FLAGS FTL_TAF_FLAGS"
1311    ad_vars="$ad_vars SVD_TAMC_FLAGS SVD_TAF_FLAGS"
1312    for i in $ad_vars ; do
1313        name=$i
1314        t1="t2=\$"`echo $i`
1315        eval $t1
1316        printf "%-20s = " $name >> $MAKEFILE
1317        echo $t2 >> $MAKEFILE
1318    done
1319    
1320    echo "  Add the source list for AD code generation"
1321    echo >> $MAKEFILE
1322    echo -n "AD_FILES = " >> $MAKEFILE
1323    AD_FILES=`cat ad_files`
1324    for i in $AD_FILES ; do
1325        echo    " \\" >> $MAKEFILE
1326        echo -n " $i" >> $MAKEFILE
1327    done
1328    echo >> $MAKEFILE
1329    
1330    cat >>$MAKEFILE <<EOF
1331    
1332    
1333    ad_input_code.f: \$(F77FILES)
1334            @make \$(AD_FLOW_FILES)
1335            cat \$(AD_FLOW_FILES) \$(AD_FILES) > ad_input_code.f
1336    
1337    
1338    ad_taf_output.f: ad_input_code.f
1339            \$(TAF) \$(AD_TAF_FLAGS) ad_input_code.f
1340            cat ad_input_code_ad.f | sed -f adjoint_sed > ad_taf_output.f
1341    
1342    ad_taf: ad_taf_output.o \$(OBJFILES)
1343            \$(LINK) -o ${EXECUTABLE} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) \$(OBJFILES) ad_taf_output.o \$(LIBS)
1344    
1345    
1346    ad_tamc_output.f: ad_input_code.f
1347            \$(TAMC) \$(AD_TAMC_FLAGS) ad_input_code.f
1348            cat ad_input_code_ad.f | sed -f adjoint_sed > ad_taf_output.f
1349    
1350    ad_tamc: ad_tamc_output.o \$(OBJFILES)
1351            \$(LINK) -o ${EXECUTABLE} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) \$(OBJFILES) ad_tamc_output.o \$(LIBS)
1352    
1353    
1354    flt_taf_output.f: ad_input_code.f
1355            \$(TAF) \$(FTL_TAF_FLAGS) ad_input_code.f
1356            cat ad_input_code_ad.f | sed -f adjoint_sed > flt_taf_output.f
1357    
1358    flt_taf: flt_taf_output.o \$(OBJFILES)
1359            \$(LINK) -o ${EXECUTABLE} \$(FFLAGS) \$(FOPTIM) \$(OBJFILES) flt_taf_output.o \$(LIBS)
1360    
1361    
1362    
1363    #=========================================
1364    
1365    EOF
1366    
1367    if test "x$EXEHOOK" != x ; then
1368        printf "\nexehook:\n\t%s\n" $EXEHOOK >> $MAKEFILE
1369    fi
1370    
1371  echo "  Making list of \"exceptions\" that need \".p\" files"  echo "  Making list of \"exceptions\" that need \".p\" files"
1372  for i in $KPPFILES ; do  for i in $KPPFILES ; do
1373      base=`echo $i | sed -e 's/\/.*\///g' | sed -e 's/\..*$//g'`      base=`echo $i | sed -e 's/\/.*\///g' | sed -e 's/\..*$//g'`
# Line 965  for i in $NOOPTFILES ; do Line 1386  for i in $NOOPTFILES ; do
1386          echo "Error: unable to add file \"$i\" to the exceptions list"          echo "Error: unable to add file \"$i\" to the exceptions list"
1387      fi      fi
1388      echo "$base.o: $base.f" >> $MAKEFILE      echo "$base.o: $base.f" >> $MAKEFILE
1389      echo $'\t$(FC) $(FFLAGS) $(NOOPTFLAGS) -c $<' >> $MAKEFILE      printf "\t\$(FC) \$(FFLAGS) \$(NOOPTFLAGS) -c \$<\n" >> $MAKEFILE
1390  done  done
1391    
1392  echo "  Add rules for links"  echo "  Add rules for links"
# Line 973  cat srclinks.tmp >> $MAKEFILE Line 1394  cat srclinks.tmp >> $MAKEFILE
1394  rm -f srclinks.tmp  rm -f srclinks.tmp
1395    
1396  echo "  Adding makedepend marker"  echo "  Adding makedepend marker"
1397  echo $'\n\n'"# DO NOT DELETE" >> $MAKEFILE  printf "\n\n# DO NOT DELETE\n" >> $MAKEFILE
1398    
1399  echo $'\n'"===  Done  ==="  printf "\n===  Done  ===\n"
1400    
1401    
1402    #  Write the "state" for future records
1403    if test "x$DUMPSTATE" != xf ; then
1404        echo -n "" > genmake_state
1405        for i in $gm_state ; do
1406            t1="t2=\$$i"
1407            eval $t1
1408            echo "$i='$t2'" >> genmake_state
1409        done
1410    fi

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