/[MITgcm]/MITgcm/tools/example_scripts/csail/test_dickens
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Diff of /MITgcm/tools/example_scripts/csail/test_dickens

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revision 1.7 by jmc, Tue Jun 2 17:08:48 2009 UTC revision 1.16 by jmc, Mon Jan 24 14:30:03 2011 UTC
# Line 2  Line 2 
2    
3  # $Header$  # $Header$
4    
 #  Ed Hill  
   
5  #  Test script for MITgcm that should work on most of the csail.mit.edu  #  Test script for MITgcm that should work on most of the csail.mit.edu
6  #  Linux machines.  #  Linux machines.
7    
8  # defaults  # defaults
9  export PATH="$PATH:/usr/local/bin"  export PATH="$PATH:/usr/local/bin"
10    #if [ -d ~/bin ]; then export PATH=$PATH:~/bin ; fi
11    #- to get case insensitive "ls" (and order of tested experiments)
12    export LC_ALL="en_US.UTF-8"
13    #  Turn off stack limit for FIZHI & AD-tests
14    ulimit -s unlimited
15    #  MPI test (for now, only with gfortran)
16    #  export MPI_GCC_DIR=/srv/software/gcc/gcc-packages/gcc-4.4.5/mpich2/mpich2-1.3
17    #  export MPI_INC_DIR=$MPI_GCC_DIR/include
18    #  export PATH="$PATH:$MPI_GCC_DIR/bin"
19    
20    #- method to acces CVS:
21     # export CVSROOT='/u/gcmpack'
22     # export CVSROOT=':ext:@mitgcm.org:/u/gcmpack'
23     # export CVS_RSH='ssh' ; cvs co -P MITgcm > /dev/null
24     # cvs -d :pserver:cvsanon@mitgcm.org:/u/gcmpack co -P MITgcm > /dev/null
25    cmdCVS='cvs -d :pserver:cvsanon@mitgcm.org:/u/gcmpack'
26    cmdCVS='cvs -d /u/gcmpack'
27    
28  TESTDIR="/tmp/jmc/test_"`hostname -s`  TESTDIR="/tmp/jmc/test_"`hostname -s`
29  MC=10  MC=13
30  checkOut=1  checkOut=1
31  sepDir=0  sepDir=0
32  #tst_list='adm g77 pgi gfo ifc mth'  option=
33  tst_list='adm g77 gfo+rs mth'  #tst_list='g7a adm mpa g77 gfo+rs mth mp2+rs mpi ifc'
34    #tst_list='g77 adm gfo ifc mth pgi+rs'
35    tst_list='g77 gfo+rs mth'
36    
37  #  Turn off stack limit for FIZHI  #option="-nc" ; checkOut=0
38  ulimit -s unlimited  #option="-q"  ; checkOut=0
39    
40    TODAY=`date +%d`
41  tdir=$TESTDIR  tdir=$TESTDIR
42  if test $checkOut = '0' ; then  if test $checkOut = '0' ; then
43   if test -e $tdir/MITgcm/CVS ; then    if test -e $tdir/MITgcm/CVS ; then
44    echo $tdir/MITgcm/CVS 'exist'      echo $tdir/MITgcm/CVS 'exist'
45    echo -n "Update the MITgcm code from CVS pserver..."      echo -n "Update the MITgcm code using: $cmdCVS ..."
46    cd $tdir/MITgcm      cd $tdir/MITgcm
47    cvs -d :pserver:cvsanon@mitgcm.org:/u/gcmpack update -P -d > /dev/null      if test $sepDir = 1 ; then
48    echo "  done"        $cmdCVS update -P -d > /dev/null
49    cd $tdir      else
50   else        $cmdCVS update -P -d
51    echo -n $tdir/MITgcm 'missing ; '      fi
52    checkOut=1      echo "  done"
53   fi    else
54        echo -n $tdir/MITgcm 'missing ; '
55        checkOut=1
56      fi
57  fi  fi
58  if test $checkOut = '1' ; then  if test $checkOut = '1' ; then
59    echo -n "Creating a temp directory ..."    if test -e $tdir ; then
60    if test -e $tdir      echo -n "Removing working copy: $tdir/MITgcm ..."
61    then test -e $tdir/MITgcm  &&  rm -rf $tdir/MITgcm      test -e $tdir/MITgcm  &&  rm -rf $tdir/MITgcm
62    else mkdir $tdir    else
63        echo -n "Creating a working dir: $tdir ..."
64        mkdir $tdir
65    fi    fi
66    echo "  done"    echo "  done"
67    echo -n "Downloading the MITgcm code from CVS pserver..."    echo -n "Downloading the MITgcm code using: $cmdCVS ..."
68    cd $tdir    cd $tdir
69   #export CVSROOT='/u/gcmpack'    $cmdCVS co -P MITgcm > /dev/null
  #export CVSROOT=':ext:@mitgcm.org:/u/gcmpack'  
  #export CVS_RSH='ssh'  
  #cvs co -P MITgcm > /dev/null  
   cvs -d :pserver:cvsanon@mitgcm.org:/u/gcmpack co -P MITgcm > /dev/null  
70    echo "  done"    echo "  done"
71    else
72      cd $tdir
73  fi  fi
74    
75  #------------------------------------------------------------------------  #------------------------------------------------------------------------
76    
77    firstTst=`echo $tst_list | awk '{print $1}'`
78    last_Tst=`echo $tst_list | awk '{print $NF}'`
79  for tt in $tst_list  for tt in $tst_list
80  do  do
81    
82   echo "================================================================"    echo "================================================================"
83   typ=`echo $tt | sed 's/+rs//'`    typ=`echo $tt | sed 's/+rs//'`
84   #- clean-up old output files    #- check day and time:
85   rm -f $tdir/output_${typ}*    curDay=`date +%d` ; curHour=`date +%H`
86   if test $sepDir = 1 ; then    if [ $curDay -ne $TODAY ] ; then
87    new_dir="MITgcm_$typ"      date ; echo "day is over => skip test $typ"
88    test -e $new_dir  &&  rm -rf $new_dir      continue
89    mkdir $new_dir    fi
90    pushd $new_dir    if [ $curHour -ge 18 ] ; then
91    cp -ra ../MITgcm/* .      date ; echo "too late to run test $typ"
92   else      continue
93    pushd MITgcm    fi
94   fi    #- clean-up old output files
95   cd verification    rm -f $tdir/output_${typ}*
96      if test $sepDir = 1 ; then
97   case $typ in      new_dir="MITgcm_$typ"
98    'g77') OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_g77' ;;      if test -d $new_dir/CVS -a $checkOut = '0' ; then
99    'gfo') OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_gfortran' ;;        pushd $new_dir
100    'adm') OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_gfortran' ;;        echo -n "Update the MITgcm code using: $cmdCVS ..."
101    'ifc') OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_ifort' ;;        $cmdCVS update -P -d
102    'pgi') OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_pgf77' ;;        echo "  done"
103    'mth') OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_gfortran'      else
104           export GOMP_STACKSIZE=400m ;;        test -e $new_dir  &&  rm -rf $new_dir
105     *) OPTFILE= ;;        mkdir $new_dir
106   esac        pushd $new_dir
107          cp -ra ../MITgcm/* .
108   if test $typ = 'g77'      fi
109   then    else
110        pushd MITgcm
111    echo "Running testreport using:"    fi
112    comm="./testreport -a jmc@mitgcm.org"    cd verification
113    if test "x$OPTFILE" != x ; then  
114      comm="$comm -of=$OPTFILE"  #-- set the testreport command:
115      nbl='-100'
116      comm="./testreport"
117      if test $typ = 'g7a' -o  $typ = 'adm' -o  $typ = 'mpa' ; then
118        nbl='-60'
119        comm="$comm -adm"
120      elif test $typ = 'mth' -o  $typ = 'mp2' ; then
121        export GOMP_STACKSIZE=400m
122        export OMP_NUM_THREADS=2
123        comm="$comm -mth"
124      fi
125      comm="$comm -a jmc@mitgcm.org"
126    #-- set the optfile (+ mpi & match-precision)
127      MPI=0
128      case $typ in
129       'g77'|'g7a')         OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_g77' ;;
130       'gfo'|'adm'|'mth')   OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_gfortran'
131                            comm="$comm -match $MC" ;;
132       'ifc')               OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_ifort11' ;;
133       'pgi')               OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_pgf77' ;;
134       'mpa'|'mpi'|'mp2')   OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_gfortran+mpi_generic'
135                            comm="$comm -match $MC" ; MPI=1 ;;
136           *)               OPTFILE= ;;
137      esac
138    #-- set MPI command:
139      if test $MPI = 1 ; then
140        if test $typ = 'mpa' ; then
141          EXE="mpirun -np TR_NPROC ./mitgcmuv_ad"
142        else
143          EXE="mpirun -np TR_NPROC ./mitgcmuv"
144        fi
145      fi
146    
147    #-- set specific Env Vars:
148      if test $typ = 'ifc' ; then
149        source /srv/software/intel/intel-11.1.073/bin/ifortvars.sh intel64
150      fi
151      if test $typ = 'pgi' ; then
152        export PGI=/srv/software/pgi/pgi-10.9
153        export PATH="$PATH:$PGI/linux86-64/10.9/bin"
154        export LM_LICENSE_FILE=$PGI/license.dat
155    fi    fi
   echo "  \"$comm\""  
   echo "======================"  
   $comm > $tdir/output_$typ 2>&1  
   tail -100 $tdir/output_$typ  
   echo  
 #-- also test restart (test 2+2=4)  
   if test $tt != $typ  
   then  
    echo "testing restart using:"  
    comm="../tools/do_tst_2+2 -a jmc@mitgcm.org"  
    echo "  \"$comm\""  
    echo "======================"  
    $comm > $tdir/output_2+2 2>&1  
   #tail -100 $tdir/output_2+2  
    echo ; cat tst_2+2_out.txt  
    echo  
   fi  
   
  fi  
156    
157   if test $typ = 'gfo'    if test $sepDir = 0 -a $checkOut = '1' -a  $tt = $firstTst ; then
158   then  #-- cleaning:
159        echo "======================"
160    echo "Running testreport using:"      echo "Cleaning test directories:"
161    comm="./testreport -match $MC -a jmc@mitgcm.org"      cmdCLN="./testreport -clean"
162    if test "x$OPTFILE" != x ; then      echo " clean dir running: $cmdCLN"
163      comm="$comm -of=$OPTFILE"      $cmdCLN > /dev/null 2>&1
164    fi      echo "======================"
165    echo "  \"$comm\""      echo
   echo "======================"  
   $comm > $tdir/output_$typ 2>&1  
   tail -100 $tdir/output_$typ  
   echo  
 #-- also test restart (test 2+2=4)  
   if test $tt != $typ  
   then  
    echo "testing restart using:"  
    comm="../tools/do_tst_2+2 -a jmc@mitgcm.org"  
    echo "  \"$comm\""  
    echo "======================"  
    $comm > $tdir/output_2+2 2>&1  
   #tail -100 $tdir/output_2+2  
    echo ; cat tst_2+2_out.txt  
    echo  
166    fi    fi
167    
168   fi  #-- run the testreport command:
169      echo -n "Running testreport using:"
  if test $typ = 'adm'  
  then  
   
   echo "Running testreport using:"  
   comm="./testreport -adm -match $MC -a jmc@mitgcm.org"  
170    if test "x$OPTFILE" != x ; then    if test "x$OPTFILE" != x ; then
171      comm="$comm -of=$OPTFILE"      comm="$comm -of=$OPTFILE"
172    fi    fi
173    echo "  \"$comm\""    if test $MPI = 1 ; then echo " (EXE='$EXE')"
174        comm="$comm -MPI 6 -command \"\$EXE\""
175      else echo '' ; fi
176      if test "x$option" != x ; then comm="$comm $option" ; fi
177     #if test $typ = 'pgi' ; then comm="$comm -skd tutorial_advection_in_gyre" ; fi
178      echo "  \"eval $comm\""
179    echo "======================"    echo "======================"
180    $comm > $tdir/output_$typ 2>&1    eval $comm > $tdir/output_$typ 2>&1
181    tail -60 $tdir/output_$typ    tail $nbl $tdir/output_$typ
182    echo    echo
183    
  fi  
   
  if test $typ = 'ifc'  
  then  
   
   echo "Running testreport using:"  
   comm="./testreport -match $MC -a jmc@mitgcm.org"  
   if test "x$OPTFILE" != x ; then  
     comm="$comm -of=$OPTFILE"  
   fi  
   echo "  \"$comm\""  
   echo "======================"  
   $comm > $tdir/output_$typ 2>&1  
   tail -100 $tdir/output_$typ  
   echo  
 #-- also test restart (test 2+2=4)  
   if test $tt != $typ  
   then  
    echo "testing restart using:"  
    comm="../tools/do_tst_2+2 -a jmc@mitgcm.org"  
    echo "  \"$comm\""  
    echo "======================"  
    $comm > $tdir/output_2+2 2>&1  
   #tail -100 $tdir/output_2+2  
    echo ; cat tst_2+2_out.txt  
    echo  
   fi  
   
  fi  
   
  if test $typ = 'mth'  
  then  
   
   export OMP_NUM_THREADS=2  
   echo "Running testreport using:"  
   comm="./testreport -mth -match $MC -a jmc@mitgcm.org"  
   if test "x$OPTFILE" != x ; then  
     comm="$comm -of=$OPTFILE"  
   fi  
   echo "  \"$comm\""  
   echo "======================"  
   $comm > $tdir/output_$typ 2>&1  
   tail -100 $tdir/output_$typ  
   echo  
184  #-- also test restart (test 2+2=4)  #-- also test restart (test 2+2=4)
185    if test $tt != $typ    if test $tt != $typ
186    then    then
187     echo "testing restart using:"      echo "testing restart using:"
188     comm="../tools/do_tst_2+2 -a jmc@mitgcm.org"      comm="../tools/do_tst_2+2 -a jmc@mitgcm.org"
189     echo "  \"$comm\""      if test $MPI = 1 ; then
190     echo "======================"        echo "  \"$comm -mpi -exe $EXE\""
191     $comm > $tdir/output_2+2 2>&1        echo "======================"
192    #tail -100 $tdir/output_2+2        $comm -mpi -exe "$EXE" > $tdir/output_2+2 2>&1
193     echo ; cat tst_2+2_out.txt      else
194     echo        echo "  \"$comm\""
195          echo "======================"
196          $comm > $tdir/output_2+2 2>&1
197        fi
198       #tail $nbl $tdir/output_2+2
199        echo ; cat tst_2+2_out.txt
200        echo
201    fi    fi
202    export OMP_NUM_THREADS=1    export OMP_NUM_THREADS=1
203    
204   fi    if test $sepDir = 0 ; then
   
  if test $typ = 'pgi'  
  then  
   
   export PGI=/usr/local/pkg/pgi/pgi-6.1-5  
   echo "Running testreport using:"  
   comm="./testreport -match $MC -dd"  
   if test "x$OPTFILE" != x ; then  
     comm="$comm -of=$OPTFILE"  
   fi  
   echo "  \"$comm\""  
   echo "======================"  
   $comm > $tdir/output_${typ}_1 2>&1  
   tail -100 $tdir/output_${typ}_1  
   echo  
   echo "Running testreport using:"  
   comm="./testreport -match $MC -q -a jmc@mitgcm.org"  
   if test "x$OPTFILE" != x ; then  
     comm="$comm -of=$OPTFILE"  
   fi  
   echo "  \"$comm\""  
   echo "======================"  
   $comm > $tdir/output_${typ}_2 2>&1  
   tail -100 $tdir/output_${typ}_2  
   echo  
 #-- also test restart (test 2+2=4)  
   if test $tt != $typ  
   then  
    echo "testing restart using:"  
    comm="../tools/do_tst_2+2 -a jmc@mitgcm.org"  
    echo "  \"$comm\""  
    echo "======================"  
    $comm > $tdir/output_2+2 2>&1  
   #tail -100 $tdir/output_2+2  
    echo ; cat tst_2+2_out.txt  
    echo  
   fi  
   
  fi  
   
  if test $sepDir = 0 ; then  
205  #-- cleaning:  #-- cleaning:
206    echo "======================"      echo "======================"
207    echo "Cleaning test directories:"      echo "Cleaning test directories:"
208    if test $tt != $typ ; then      if test $tt != $typ ; then
209      cmdCLN="../tools/do_tst_2+2 -clean"        cmdCLN="../tools/do_tst_2+2 -clean"
210      echo " clean tst_2+2 running: $cmdCLN"        echo " clean tst_2+2 running: $cmdCLN"
211      $cmdCLN >> $tdir/output_2+2 2>&1        $cmdCLN >> $tdir/output_2+2 2>&1
212        fi
213        if test $tt != $last_Tst ; then
214          cmdCLN="./testreport -clean"
215          echo " clean dir running: $cmdCLN"
216          $cmdCLN > /dev/null 2>&1
217        fi
218        echo "======================"
219        echo
220    fi    fi
221      cmdCLN="./testreport -clean"    popd
     echo " clean dir running: $cmdCLN"  
     $cmdCLN > /dev/null 2>&1  
   echo "======================"  
   echo  
  fi  
  popd  
222    
223  done  done
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