/[MITgcm]/MITgcm/tools/example_scripts/csail/test_baudelaire
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Diff of /MITgcm/tools/example_scripts/csail/test_baudelaire

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revision 1.1 by jmc, Fri Oct 29 21:13:57 2010 UTC revision 1.6 by jmc, Wed Jan 19 23:48:14 2011 UTC
# Line 14  if [ -d ~/bin ]; then export PATH=$PATH: Line 14  if [ -d ~/bin ]; then export PATH=$PATH:
14  export LC_ALL="en_US.UTF-8"  export LC_ALL="en_US.UTF-8"
15  #  Turn off stack limit for FIZHI & AD-tests  #  Turn off stack limit for FIZHI & AD-tests
16  ulimit -s unlimited  ulimit -s unlimited
17    #  MPI test (for now, only with gfortran)
18       export MPI_GCC_DIR=/srv/software/gcc/gcc-packages/gcc-4.4.5/mpich2/mpich2-1.3
19       export MPI_INC_DIR=$MPI_GCC_DIR/include
20       export PATH="$PATH:$MPI_GCC_DIR/bin"
21    
22  #- method to acces CVS:  #- method to acces CVS:
23   # export CVSROOT='/u/gcmpack'   # export CVSROOT='/u/gcmpack'
# Line 24  cmdCVS='cvs -d :pserver:cvsanon@mitgcm.o Line 28  cmdCVS='cvs -d :pserver:cvsanon@mitgcm.o
28  cmdCVS='cvs -d /u/gcmpack'  cmdCVS='cvs -d /u/gcmpack'
29    
30  TESTDIR="/scratch/jmc/test_"`hostname -s`  TESTDIR="/scratch/jmc/test_"`hostname -s`
31  MC=10  MC=13
32  checkOut=1  checkOut=1
33  sepDir=1  sepDir=1
34  option=  option=
35  tst_list='g77 adm gfo+rs mth ifc'  tst_list='g7a adm mpa g77 gfo+rs mth mp2+rs mpi ifc'
36  #tst_list='g77 adm gfo ifc mth pgi+rs'  #tst_list='g77 adm gfo ifc mth pgi+rs'
37  #tst_list='adm g77 gfo+rs mth'  #tst_list='g77 gfo+rs mth'
38    
39  #option="-nc" ; checkOut=0  #option="-nc" ; checkOut=0
40  #option="-q"  ; checkOut=0  #option="-q"  ; checkOut=0
# Line 77  last_Tst=`echo $tst_list | awk '{print $ Line 81  last_Tst=`echo $tst_list | awk '{print $
81  for tt in $tst_list  for tt in $tst_list
82  do  do
83    
84   echo "================================================================"    echo "================================================================"
85   typ=`echo $tt | sed 's/+rs//'`    typ=`echo $tt | sed 's/+rs//'`
86   #- check day and time:    #- check day and time:
87   curDay=`date +%d` ; curHour=`date +%H`    curDay=`date +%d` ; curHour=`date +%H`
88   if [ $curDay -ne $TODAY ] ; then    if [ $curDay -ne $TODAY ] ; then
89     date ; echo "day is over => skip test $typ"      date ; echo "day is over => skip test $typ"
90     continue      continue
91   fi    fi
92   if [ $curHour -ge 18 ] ; then    if [ $curHour -ge 18 ] ; then
93     date ; echo "too late to run test $typ"      date ; echo "too late to run test $typ"
94     continue      continue
95   fi    fi
96   #- clean-up old output files    #- clean-up old output files
97   rm -f $tdir/output_${typ}*    rm -f $tdir/output_${typ}*
98   if test $sepDir = 1 ; then    if test $sepDir = 1 ; then
99    new_dir="MITgcm_$typ"      new_dir="MITgcm_$typ"
100    if test -d $new_dir/CVS -a $checkOut = '0' ; then      if test -d $new_dir/CVS -a $checkOut = '0' ; then
101      pushd $new_dir        pushd $new_dir
102      echo -n "Update the MITgcm code using: $cmdCVS ..."        echo -n "Update the MITgcm code using: $cmdCVS ..."
103      $cmdCVS update -P -d        $cmdCVS update -P -d
104      echo "  done"        echo "  done"
105        else
106          test -e $new_dir  &&  rm -rf $new_dir
107          mkdir $new_dir
108          pushd $new_dir
109          cp -ra ../MITgcm/* .
110        fi
111    else    else
112      test -e $new_dir  &&  rm -rf $new_dir      pushd MITgcm
     mkdir $new_dir  
     pushd $new_dir  
     cp -ra ../MITgcm/* .  
113    fi    fi
114   else    cd verification
   pushd MITgcm  
  fi  
  cd verification  
115    
116   case $typ in  #-- set the testreport command:
117    'g77') OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_g77' ;;    nbl='-100'
118    'g7a') OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_g77' ;;    comm="./testreport"
119    'gfo') OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_gfortran' ;;    if test $typ = 'g7a' -o  $typ = 'adm' -o  $typ = 'mpa' ; then
120    'adm') OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_gfortran' ;;      nbl='-60'
121    'ifc') OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_ifort' ;;      comm="$comm -adm"
122    'pgi') OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_pgf77' ;;    elif test $typ = 'mth' -o  $typ = 'mp2' ; then
123    'mth') OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_gfortran'      export GOMP_STACKSIZE=400m
124           export GOMP_STACKSIZE=400m ;;      export OMP_NUM_THREADS=2
125     *) OPTFILE= ;;      comm="$comm -mth"
126   esac    fi
127      comm="$comm -a jmc@mitgcm.org"
128    #-- set the optfile (+ mpi & match-precision)
129      MPI=0
130      case $typ in
131       'g77'|'g7a')         OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_g77' ;;
132       'gfo'|'adm'|'mth')   OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_gfortran'
133                            comm="$comm -match $MC" ;;
134       'ifc')               OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_ifort11' ;;
135       'pgi')               OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_pgf77' ;;
136       'mpa'|'mpi'|'mp2')   OPTFILE='../tools/build_options/linux_amd64_gfortran+mpi_generic'
137                            comm="$comm -match $MC" ; MPI=1 ;;
138           *)               OPTFILE= ;;
139      esac
140    #-- set MPI command:
141      if test $MPI = 1 ; then
142        if test $typ = 'mpa' ; then
143          EXE="mpirun -np TR_NPROC ./mitgcmuv_ad"
144        else
145          EXE="mpirun -np TR_NPROC ./mitgcmuv"
146        fi
147      fi
148    
149   if test $sepDir = 0 -a $checkOut = '1' -a  $tt = $firstTst ; then    if test $sepDir = 0 -a $checkOut = '1' -a  $tt = $firstTst ; then
150  #-- cleaning:  #-- cleaning:
151    echo "======================"      echo "======================"
152    echo "Cleaning test directories:"      echo "Cleaning test directories:"
153      cmdCLN="./testreport -clean"      cmdCLN="./testreport -clean"
154      echo " clean dir running: $cmdCLN"      echo " clean dir running: $cmdCLN"
155      $cmdCLN > /dev/null 2>&1      $cmdCLN > /dev/null 2>&1
156    echo "======================"      echo "======================"
157    echo      echo
  fi  
   
  if test $typ = 'g77'  
  then  
   
   echo "Running testreport using:"  
   comm="./testreport -a jmc@mitgcm.org"  
 # comm="$comm -match $MC"  
   if test "x$OPTFILE" != x ; then  
     comm="$comm -of=$OPTFILE"  
158    fi    fi
   if test "x$option" != x ; then comm="$comm $option" ; fi  
   echo "  \"$comm\""  
   echo "======================"  
   $comm > $tdir/output_$typ 2>&1  
   tail -100 $tdir/output_$typ  
   echo  
   
  fi  
   
  if test $typ = 'gfo'  
  then  
159    
160    echo "Running testreport using:"  #-- set specific Env Vars:
161    comm="./testreport -a jmc@mitgcm.org"    if test $typ = 'ifc' ; then
162    comm="$comm -match $MC"      source /srv/software/intel/intel-11.1.073/bin/ifortvars.sh intel64
   if test "x$OPTFILE" != x ; then  
     comm="$comm -of=$OPTFILE"  
163    fi    fi
164    if test "x$option" != x ; then comm="$comm $option" ; fi    if test $typ = 'pgi' ; then
165    echo "  \"$comm\""      export PGI=/srv/software/pgi/pgi-10.9
166    echo "======================"      export PATH="$PATH:$PGI/linux86-64/10.9/bin"
167    $comm > $tdir/output_$typ 2>&1      export LM_LICENSE_FILE=$PGI/license.dat
   tail -100 $tdir/output_$typ  
   echo  
   
  fi  
   
  if test $typ = 'adm'  
  then  
   
   echo "Running testreport using:"  
   comm="./testreport -adm -a jmc@mitgcm.org"  
   comm="$comm -match $MC"  
   if test "x$OPTFILE" != x ; then  
     comm="$comm -of=$OPTFILE"  
168    fi    fi
   if test "x$option" != x ; then comm="$comm $option" ; fi  
   echo "  \"$comm\""  
   echo "======================"  
   $comm > $tdir/output_$typ 2>&1  
   tail -60 $tdir/output_$typ  
   echo  
   
  fi  
169    
170   if test $typ = 'ifc'  #-- run the testreport command:
171   then    echo -n "Running testreport using:"
   
   source /srv/software/intel/intel-11.1.073/bin/ifortvars.sh intel64  
   echo "Running testreport using:"  
   comm="./testreport -a jmc@mitgcm.org"  
   comm="$comm -match $MC"  
172    if test "x$OPTFILE" != x ; then    if test "x$OPTFILE" != x ; then
173      comm="$comm -of=$OPTFILE"      comm="$comm -of=$OPTFILE"
174    fi    fi
175      if test $MPI = 1 ; then echo " (EXE='$EXE')"
176        comm="$comm -MPI 6 -command \"\$EXE\""
177      else echo '' ; fi
178    if test "x$option" != x ; then comm="$comm $option" ; fi    if test "x$option" != x ; then comm="$comm $option" ; fi
179    echo "  \"$comm\""   #if test $typ = 'pgi' ; then comm="$comm -skd tutorial_advection_in_gyre" ; fi
180      echo "  \"eval $comm\""
181    echo "======================"    echo "======================"
182    $comm > $tdir/output_$typ 2>&1    eval $comm > $tdir/output_$typ 2>&1
183    tail -100 $tdir/output_$typ    tail $nbl $tdir/output_$typ
184    echo    echo
185    
186   fi  #-- also test restart (test 2+2=4)
187      if test $tt != $typ
188   if test $typ = 'mth'    then
189   then      echo "testing restart using:"
190        comm="../tools/do_tst_2+2 -a jmc@mitgcm.org"
191    export OMP_NUM_THREADS=2      if test $MPI = 1 ; then
192    echo "Running testreport using:"        echo "  \"$comm -mpi -exe $EXE\""
193    comm="./testreport -mth -a jmc@mitgcm.org"        echo "======================"
194    comm="$comm -match $MC"        $comm -mpi -exe "$EXE" > $tdir/output_2+2 2>&1
195    if test "x$OPTFILE" != x ; then      else
196      comm="$comm -of=$OPTFILE"        echo "  \"$comm\""
197    fi        echo "======================"
198    if test "x$option" != x ; then comm="$comm $option" ; fi        $comm > $tdir/output_2+2 2>&1
199    echo "  \"$comm\""      fi
200    echo "======================"     #tail $nbl $tdir/output_2+2
201    $comm > $tdir/output_$typ 2>&1      echo ; cat tst_2+2_out.txt
202    tail -100 $tdir/output_$typ      echo
   echo  
   
  fi  
   
  if test $typ = 'pgi'  
  then  
   
   export PGI=/srv/software/pgi/pgi-10.9  
   export PATH=$PGI/linux86-64/10.9/bin:$PATH  
   export LM_LICENSE_FILE=$PGI/license.dat  
   echo "Running testreport using:"  
   comm="./testreport -dd"  
   comm="$comm -match $MC"  
   #comm="$comm -skd tutorial_advection_in_gyre"  
   if test "x$OPTFILE" != x ; then  
     comm="$comm -of=$OPTFILE"  
   fi  
   if test "x$option" != x ; then comm="$comm $option" ; fi  
   echo "  \"$comm\""  
   echo "======================"  
   $comm > $tdir/output_${typ}_1 2>&1  
   tail -100 $tdir/output_${typ}_1  
   echo  
   echo "Running testreport using:"  
   comm="./testreport -q -a jmc@mitgcm.org"  
   comm="$comm -match $MC"  
   #comm="$comm -skd tutorial_advection_in_gyre"  
   if test "x$OPTFILE" != x ; then  
     comm="$comm -of=$OPTFILE"  
203    fi    fi
204    echo "  \"$comm\""    export OMP_NUM_THREADS=1
   echo "======================"  
   $comm > $tdir/output_${typ}_2 2>&1  
   tail -100 $tdir/output_${typ}_2  
   echo  
   
  fi  
205    
206  #-- also test restart (test 2+2=4)    if test $sepDir = 0 ; then
207   if test $tt != $typ  #-- cleaning:
208   then     echo "======================"
209     echo "testing restart using:"     echo "Cleaning test directories:"
210     comm="../tools/do_tst_2+2 -a jmc@mitgcm.org"     if test $tt != $typ ; then
211     echo "  \"$comm\""       cmdCLN="../tools/do_tst_2+2 -clean"
212         echo " clean tst_2+2 running: $cmdCLN"
213         $cmdCLN >> $tdir/output_2+2 2>&1
214       fi
215       if test $tt != $last_Tst ; then
216         cmdCLN="./testreport -clean"
217         echo " clean dir running: $cmdCLN"
218         $cmdCLN > /dev/null 2>&1
219       fi
220     echo "======================"     echo "======================"
    $comm > $tdir/output_2+2 2>&1  
   #tail -100 $tdir/output_2+2  
    echo ; cat tst_2+2_out.txt  
221     echo     echo
222   fi   fi
  export OMP_NUM_THREADS=1  
   
  if test $sepDir = 0 ; then  
 #-- cleaning:  
   echo "======================"  
   echo "Cleaning test directories:"  
   if test $tt != $typ ; then  
     cmdCLN="../tools/do_tst_2+2 -clean"  
     echo " clean tst_2+2 running: $cmdCLN"  
     $cmdCLN >> $tdir/output_2+2 2>&1  
   fi  
   if test $tt != $last_Tst ; then  
     cmdCLN="./testreport -clean"  
     echo " clean dir running: $cmdCLN"  
     $cmdCLN > /dev/null 2>&1  
   fi  
   echo "======================"  
   echo  
  fi  
223   popd   popd
224    
225  done  done
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