--- MITgcm/tools/adjoint_options/adjoint_default	2008/02/02 02:30:42	1.18
+++ MITgcm/tools/adjoint_options/adjoint_default	2010/10/01 14:40:04	1.22
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 #!/bin/bash
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-#  $Header: /home/ubuntu/mnt/e9_copy/MITgcm/tools/adjoint_options/adjoint_default,v 1.18 2008/02/02 02:30:42 gforget Exp $
+#  $Header: /home/ubuntu/mnt/e9_copy/MITgcm/tools/adjoint_options/adjoint_default,v 1.22 2010/10/01 14:40:04 heimbach Exp $
 #  $Name:  $
 #
 
@@ -15,13 +15,12 @@
 TAF=staf
 TAMC=tamc
 
-AD_TAMC_FLAGS='-reverse -admark ad -i4 -r4 -l tamc_ad.log'
-#AD_TAF_FLAGS='-z -reverse -admark ad -i4 -r4 -l taf_ad.log -flow taf_ad_flow.log -nonew_arg'
-AD_TAF_FLAGS="-z -reverse -admark ad -i4 -r4 -l taf_ad.log -flow taf_ad_flow.log -nonew_arg $AD_TAF_FLAGS"
-FTL_TAMC_FLAGS='-forward -ftlmark g_ -i4 -r4 -l tamc_ftl.log'
-FTL_TAF_FLAGS='-z -forward -ftlmark g_ -i4 -r4 -l taf_ftl.log -flow taf_ftl_flow.log -nonew_arg'
-SVD_TAMC_FLAGS='-reverse -forward -pure -i4 -r4 -l tamc_svd.log'
-SVD_TAF_FLAGS='-z -reverse -forward -pure -i4 -r4 -l taf_svd.log -flow taf_flow.log -nonew_arg'
+AD_TAMC_FLAGS="-reverse -admark ad -i4 -r4 -l tamc_ad.log $AD_TAMC_FLAGS"
+AD_TAF_FLAGS="-v1 -reverse -admark ad -i4 -r4 -l taf_ad.log -flow taf_ad_flow.log $AD_TAF_FLAGS"
+FTL_TAMC_FLAGS="-forward -ftlmark g_ -i4 -r4 -l tamc_ftl.log $FTL_TAMC_FLAGS"
+FTL_TAF_FLAGS="-v1 -forward -ftlmark g_ -i4 -r4 -l taf_ftl.log -flow taf_ftl_flow.log$FTL_TAF_FLAGS"
+SVD_TAMC_FLAGS="-reverse -forward -pure -i4 -r4 -l tamc_svd.log $SVD_TAMC_FLAGS"
+SVD_TAF_FLAGS="-v1 -reverse -forward -pure -i4 -r4 -l taf_svd.log -flow taf_flow.log $SVD_TAF_FLAGS"
 
 DIFF_FLAGS="-toplevel 'the_main_loop'    \
             -input 'xx_theta_dummy       \