/[MITgcm]/MITgcm/pkg/diagnostics/diagnostics_out.F
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revision 1.34 by jmc, Tue Nov 13 19:43:44 2007 UTC revision 1.44 by jmc, Thu Jan 7 01:09:40 2010 UTC
# Line 38  C     myThid  :: my Thread Id number Line 38  C     myThid  :: my Thread Id number
38        INTEGER listId, myIter, myThid        INTEGER listId, myIter, myThid
39  CEOP  CEOP
40    
41    C     !FUNCTIONS:
42          INTEGER ILNBLNK
43          EXTERNAL ILNBLNK
44    #ifdef ALLOW_FIZHI
45          _RL   getcon
46          EXTERNAL getcon
47    #endif
48    
49  C     !LOCAL VARIABLES:  C     !LOCAL VARIABLES:
50  C     i,j,k :: loop indices  C     i,j,k :: loop indices
51  C     lm    :: loop index (averageCycle)  C     lm    :: loop index (averageCycle)
# Line 58  C              diagnostic storage qdiag Line 66  C              diagnostic storage qdiag
66        INTEGER bi, bj        INTEGER bi, bj
67        INTEGER md, ndId, ip, im        INTEGER md, ndId, ip, im
68        INTEGER mate, mVec        INTEGER mate, mVec
69        CHARACTER*8 parms1        CHARACTER*10 gcode
70        _RL undef, getcon        _RL undef
71        _RL tmpLev        _RL tmpLev
       EXTERNAL getcon  
       INTEGER ILNBLNK  
       EXTERNAL ILNBLNK  
72        INTEGER ilen        INTEGER ilen
73    
74        INTEGER ioUnit        INTEGER ioUnit
75        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) fn        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) fn
76        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff
77        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf
78        INTEGER prec, nRec        INTEGER prec, nRec, nTimRec
79          _RL     timeRec(2)
80  #ifdef ALLOW_MDSIO  #ifdef ALLOW_MDSIO
81        LOGICAL glf        LOGICAL glf
82  #endif  #endif
83  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
84        INTEGER ii        INTEGER ll, llMx, jj, jjMx
85          INTEGER ii, klev
86        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn
87        INTEGER CW_DIMS, NLEN        INTEGER CW_DIMS, NLEN
88        PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )        PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )
# Line 88  C              diagnostic storage qdiag Line 95  C              diagnostic storage qdiag
95        CHARACTER*(5) ctmp        CHARACTER*(5) ctmp
96        _RS ztmp(NrMax)        _RS ztmp(NrMax)
97  #endif  #endif
98          LOGICAL useMissingValue, useMisValForThisDiag
99          REAL*8 misvalLoc
100          REAL*8 misval_r8(2)
101          REAL*4 misval_r4(2)
102          INTEGER misvalIntLoc, misval_int(2)
103  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
104    
105  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
106    
107    C---  set file properties
108        ioUnit= standardMessageUnit        ioUnit= standardMessageUnit
109          undef = UNSET_RL
110    #ifdef ALLOW_FIZHI
111    c     IF ( useFIZHI ) undef = getcon('UNDEF')
112        undef = getcon('UNDEF')        undef = getcon('UNDEF')
113    #endif
114        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter
115        ilen = ILNBLNK(fnames(listId))        ilen = ILNBLNK(fnames(listId))
116        WRITE( fn, '(A,A,A)' ) fnames(listId)(1:ilen),'.',suff(1:10)        WRITE( fn, '(A,A,A)' ) fnames(listId)(1:ilen),'.',suff(1:10)
117    
118    C--   Set time information:
119          IF ( freq(listId).LT.0. ) THEN
120    C-    Snap-shot: store a unique time (which is consistent with State-Var timing)
121            nTimRec = 1
122            timeRec(1) = myTime
123          ELSE
124    C-    Time-average: store the 2 edges of the time-averaging interval.
125    C      this time is consitent with intermediate Var (i.e., non-state, e.g, flux,
126    C      tendencies) timing. For State-Var, this is shifted by + halt time-step.
127            nTimRec = 2
128    
129    C-    end of time-averaging interval:
130            timeRec(2) = myTime
131    
132    C-    begining of time-averaging interval:
133    c       timeRec(1) = myTime - freq(listId)
134    C     a) find the time of the previous multiple of output freq:
135            timeRec(1) = myTime-deltaTClock*0.5 _d 0
136            timeRec(1) = (timeRec(1)-phase(listId))/freq(listId)
137            i = INT( timeRec(1) )
138            timeRec(1) = phase(listId) + freq(listId)*FLOAT(i)
139    c       if ( listId.eq.2 ) write(0,*) 'f',i,timeRec(1)/deltaTClock
140            timeRec(1) = MAX( timeRec(1), startTime )
141    
142    C     b) round off to nearest multiple of time-step:
143            timeRec(1) = (timeRec(1)-baseTime)/deltaTClock
144            i = NINT( timeRec(1) )
145    C     if just half way, NINT will return the next time-step: correct this
146            tmpLev = FLOAT(i) - 0.5 _d 0
147            IF ( timeRec(1).EQ.tmpLev ) i = i - 1
148            timeRec(1) = baseTime + deltaTClock*FLOAT(i)
149    c       if ( listId.eq.2 ) write(0,*) i,timeRec(1)/deltaTClock
150          ENDIF
151    
152  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
153    C-- this is a trick to reverse the order of the loops on md (= field)
154    C   and lm (= averagePeriod): binary output: lm loop inside md loop ;
155    C                                 mnc ouput: md loop inside lm loop.
156        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
157          DO i = 1,MAX_LEN_FNAM          jjMx = averageCycle(listId)
158            diag_mnc_bn(i:i) = ' '          llMx = 1
159          ENDDO        ELSE
160          DO i = 1,NLEN          jjMx = 1
161            dn_blnk(i:i) = ' '          llMx = averageCycle(listId)
162          ENDDO        ENDIF
163          WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) fnames(listId)(1:ilen)        DO jj=1,jjMx
164    
165           IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
166    C     Handle missing value attribute (land points)
167             useMissingValue = .FALSE.
168    #ifdef DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE
169             useMissingValue = .TRUE.
170    #endif /* DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE */
171             IF ( misvalFlt(listId) .NE. UNSET_RL ) THEN
172              misvalLoc = misvalFlt(listId)
173             ELSE
174              misvalLoc = undef
175             ENDIF
176    C     Defaults to UNSET_I
177             misvalIntLoc = misvalInt(listId)
178             DO ii=1,2
179    C         misval_r4(ii)  = UNSET_FLOAT4
180    C         misval_r8(ii)  = UNSET_FLOAT8
181              misval_r4(ii)  = misvalLoc
182              misval_r8(ii)  = misvalLoc
183              misval_int(ii) = UNSET_I
184             ENDDO
185             DO i = 1,MAX_LEN_FNAM
186               diag_mnc_bn(i:i) = ' '
187             ENDDO
188             DO i = 1,NLEN
189               dn_blnk(i:i) = ' '
190             ENDDO
191             WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) fnames(listId)(1:ilen)
192    
193  C       Update the record dimension by writing the iteration number  C       Update the record dimension by writing the iteration number
194          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)           klev = myIter + jj - jjMx
195          CALL MNC_CW_RL_W_S('D',diag_mnc_bn,0,0,'T',myTime,myThid)           tmpLev = myTime + deltaTClock*(jj -jjMx)
196          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)           CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)
197          CALL MNC_CW_I_W_S('I',diag_mnc_bn,0,0,'iter',myIter,myThid)           CALL MNC_CW_RL_W_S('D',diag_mnc_bn,0,0,'T',tmpLev,myThid)
198             CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)
199             CALL MNC_CW_I_W_S('I',diag_mnc_bn,0,0,'iter',klev,myThid)
200    
201  C       NOTE: at some point it would be a good idea to add a time_bounds  C       NOTE: at some point it would be a good idea to add a time_bounds
202  C       variable that has dimension (2,T) and clearly denotes the  C       variable that has dimension (2,T) and clearly denotes the
203  C       beginning and ending times for each diagnostics period  C       beginning and ending times for each diagnostics period
204    
205          dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)           dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)
206          WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)           WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)
207          dim(1) = nlevels(listId)           dim(1) = nlevels(listId)
208          ib(1)  = 1           ib(1)  = 1
209          ie(1)  = nlevels(listId)           ie(1)  = nlevels(listId)
210    
211          CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,           CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,
212       &       dim, dn, ib, ie, myThid)       &        dim, dn, ib, ie, myThid)
213          CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',           CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',
214       &       0,0, myThid)       &        0,0, myThid)
215          CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',           CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',
216       &       'Idicies of vertical levels within the source arrays',       &        'Idicies of vertical levels within the source arrays',
217       &       myThid)       &        myThid)
218    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
219             IF (useMissingValue)
220         &       CALL MNC_CW_VATTR_MISSING('diag_levels', 0,
221         I       misval_r8, misval_r4, misval_int,
222         I       myThid )
223    
224          CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,           CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,
225       &       'diag_levels', levs(1,listId), myThid)       &        'diag_levels', levs(1,listId), myThid)
226    
227          CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)           CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)
228          CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)           CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)
229    
230  #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK
231  C       This part has been placed in an #ifdef because, as its currently  C       This part has been placed in an #ifdef because, as its currently
# Line 152  C       as: Z[uml]td000000 where the 't' Line 241  C       as: Z[uml]td000000 where the 't'
241  C       gdiag(10)  C       gdiag(10)
242    
243  C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx  C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx
244          ctmp(1:5) = 'mul  '           ctmp(1:5) = 'mul  '
245          DO i = 1,3           DO i = 1,3
246            dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)             dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)
247            WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listId)             WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listId)
248            CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)             CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)
249            CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)             CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)
250    
251  C         The following three ztmp() loops should eventually be modified  C         The following three ztmp() loops should eventually be modified
252  C         to reflect the fractional nature of levs(j,l) -- they should  C         to reflect the fractional nature of levs(j,l) -- they should
# Line 167  C                      + ( rC(INT(FLOOR( Line 256  C                      + ( rC(INT(FLOOR(
256  C                          + rC(INT(CEIL(levs(j,l)))) )  C                          + rC(INT(CEIL(levs(j,l)))) )
257  C                        / ( levs(j,l) - FLOOR(levs(j,l)) )  C                        / ( levs(j,l) - FLOOR(levs(j,l)) )
258  C         for averaged levels.  C         for averaged levels.
259            IF (i .EQ. 1) THEN             IF (i .EQ. 1) THEN
260              DO j = 1,nlevels(listId)               DO j = 1,nlevels(listId)
261                ztmp(j) = rC(NINT(levs(j,listId)))                 ztmp(j) = rC(NINT(levs(j,listId)))
262              ENDDO               ENDDO
263              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',               CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
264       &           'Dimensional coordinate value at the mid point',       &            'Dimensional coordinate value at the mid point',
265       &           myThid)       &            myThid)
266            ELSEIF (i .EQ. 2) THEN             ELSEIF (i .EQ. 2) THEN
267              DO j = 1,nlevels(listId)               DO j = 1,nlevels(listId)
268                ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)) + 1)                 ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)) + 1)
269              ENDDO               ENDDO
270              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',               CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
271       &           'Dimensional coordinate value at the upper point',       &            'Dimensional coordinate value at the upper point',
272       &           myThid)       &            myThid)
273            ELSEIF (i .EQ. 3) THEN             ELSEIF (i .EQ. 3) THEN
274              DO j = 1,nlevels(listId)               DO j = 1,nlevels(listId)
275                ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)))                 ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)))
276              ENDDO               ENDDO
277              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',               CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
278       &           'Dimensional coordinate value at the lower point',       &            'Dimensional coordinate value at the lower point',
279       &           myThid)       &            myThid)
280            ENDIF             ENDIF
281            CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)  C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
282            CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)             IF (useMissingValue)
283            CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)       &          CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(dn(1), 0,
284          ENDDO       I          misval_r8, misval_r4, misval_int,
285         I          myThid )
286               CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)
287               CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)
288               CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)
289             ENDDO
290  #endif /*  DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  */  #endif /*  DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  */
291    
292        ENDIF         ENDIF
293  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
294    
295  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
296    
297        DO md = 1,nfields(listId)         DO md = 1,nfields(listId)
298          ndId = jdiag(md,listId)          ndId = jdiag(md,listId)
299          parms1 = gdiag(ndId)(1:8)          gcode = gdiag(ndId)(1:10)
300          mate = 0          mate = 0
301          mVec = 0          mVec = 0
302          IF ( parms1(5:5).EQ.'C' ) THEN          IF ( gcode(5:5).EQ.'C' ) THEN
303  C-      Check for Mate of a Counter Diagnostic  C-      Check for Mate of a Counter Diagnostic
304             READ(parms1,'(5X,I3)') mate             mate = hdiag(ndId)
305          ELSEIF ( parms1(1:1).EQ.'U' .OR. parms1(1:1).EQ.'V' ) THEN          ELSEIF ( gcode(1:1).EQ.'U' .OR. gcode(1:1).EQ.'V' ) THEN
306  C-      Check for Mate of a Vector Diagnostic  C-      Check for Mate of a Vector Diagnostic
307             READ(parms1,'(5X,I3)') mVec             mVec = hdiag(ndId)
308          ENDIF          ENDIF
309          IF ( idiag(md,listId).NE.0 .AND. parms1(5:5).NE.'D' ) THEN          IF ( idiag(md,listId).NE.0 .AND. gcode(5:5).NE.'D' ) THEN
310  C--     Start processing 1 Fld :  C--     Start processing 1 Fld :
311    #ifdef ALLOW_MNC
312             DO ll=1,llMx
313              lm = jj+ll-1
314    #else
315           DO lm=1,averageCycle(listId)           DO lm=1,averageCycle(listId)
316    #endif
317    
318            ip = ABS(idiag(md,listId)) + kdiag(ndId)*(lm-1)            ip = ABS(idiag(md,listId)) + kdiag(ndId)*(lm-1)
319            im = mdiag(md,listId)            im = mdiag(md,listId)
# Line 229  C-        Empty diagnostics case : Line 328  C-        Empty diagnostics case :
328       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter
329              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
330       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
331              WRITE(msgBuf,'(A,I4,3A,I3,2A)')              WRITE(msgBuf,'(A,I6,3A,I4,2A)')
332       &       '- WARNING -   diag.#',ndId, ' : ',flds(md,listId),       &       '- WARNING -   diag.#',ndId, ' : ',flds(md,listId),
333       &       ' (#',md,' ) in outp.Stream: ',fnames(listId)       &       ' (#',md,' ) in outp.Stream: ',fnames(listId)
334              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
335       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
336              IF ( averageCycle(listId).GT.1 ) THEN              IF ( averageCycle(listId).GT.1 ) THEN
337               WRITE(msgBuf,'(A,2(I2,A))')               WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
338       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag(lm=',lm,')=',       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag(lm=',lm,')=',
339       &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'       &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
340              ELSE              ELSE
341               WRITE(msgBuf,'(A,2(I2,A))')               WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
342       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',
343       &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'       &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
344              ENDIF              ENDIF
# Line 266  C-        Empty diagnostics case : Line 365  C-        Empty diagnostics case :
365  C-        diagnostics is not empty :  C-        diagnostics is not empty :
366    
367              IF ( debugLevel.GE.debLevA .AND. myThid.EQ.1 ) THEN              IF ( debugLevel.GE.debLevA .AND. myThid.EQ.1 ) THEN
368                WRITE(ioUnit,'(A,I3,3A,I8,2A)')                WRITE(ioUnit,'(A,I6,3A,I8,2A)')
369       &         ' Computing Diagnostic # ', ndId, '  ', cdiag(ndId),       &         ' Computing Diagnostic # ', ndId, '  ', cdiag(ndId),
370       &         '     Counter:',ndiag(ip,1,1),'   Parms: ',gdiag(ndId)       &         '     Counter:',ndiag(ip,1,1),'   Parms: ',gdiag(ndId)
371                IF ( mate.GT.0 ) THEN                IF ( mate.GT.0 ) THEN
372                 WRITE(ioUnit,'(3A,I3,2A)')                 WRITE(ioUnit,'(3A,I6,2A)')
373       &         '       use Counter Mate for  ', cdiag(ndId),       &         '       use Counter Mate for  ', cdiag(ndId),
374       &         '     Diagnostic # ',mate, '  ', cdiag(mate)       &         '     Diagnostic # ',mate, '  ', cdiag(mate)
375                ELSEIF ( mVec.GT.0 ) THEN                ELSEIF ( mVec.GT.0 ) THEN
376                  IF ( im.GT.0 .AND. ndiag(MAX(1,im),1,1).GT.0 ) THEN                  IF ( im.GT.0 .AND. ndiag(MAX(1,im),1,1).GT.0 ) THEN
377                   WRITE(ioUnit,'(3A,I3,3A)')                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
378       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
379       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
380       &             ' exists '       &             ' exists '
381                  ELSE                  ELSE
382                   WRITE(ioUnit,'(3A,I3,3A)')                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
383       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
384       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
385       &             ' not enabled'       &             ' not enabled'
# Line 433  C           Time dimension Line 532  C           Time dimension
532              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'units',              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'units',
533       &             udiag(ndId),myThid)       &             udiag(ndId),myThid)
534    
535  C           Per the observations of Baylor, this has been commented out  C     Missing values only for scalar diagnostics at mass points (so far)
536  C           until we have code that can write missing_value attributes              useMisValForThisDiag = useMissingValue
537  C           in a way thats compatible with most of the more popular       &           .AND.gdiag(ndId)(1:2).EQ.'SM'
538  C           netCDF tools including ferret.  Using all-zeros completely              IF ( useMisValForThisDiag ) THEN
539  C           breaks ferret.  C     assign missing values and set flag for adding the netCDF atttibute
540                 CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(cdiag(ndId), 2,
541  C           CALL MNC_CW_ADD_VATTR_DBL(cdiag(ndId),'missing_value',       I            misval_r8, misval_r4, misval_int,
542  C           &             0.0 _d 0,myThid)       I            myThid )
543    C     and now use the missing values for masking out the land points
544              IF ( ( (writeBinaryPrec .EQ. precFloat32)               DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
545       &           .AND. (fflags(listId)(1:1) .NE. 'D')                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
546       &           .AND. (fflags(listId)(1:1) .NE. 'R') )                 DO k = 1,nlevels(listId)
547       &           .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'R')) THEN                  klev = NINT(levs(k,listId))
548                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy
549                     DO i = 1-OLx,sNx+OLx
550                      IF ( maskC(i,j,klev,bi,bj) .EQ. 0. )
551         &                 qtmp1(i,j,k,bi,bj) = misvalLoc
552                     ENDDO
553                    ENDDO
554                   ENDDO
555                  ENDDO
556                 ENDDO
557                ELSE
558    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
559    C     Note: We have to call the following subroutine for each mnc that has
560    C     been created "on the fly" by mnc_cw_add_vname and will be deleted
561    C     by mnc_cw_del_vname, because all of these variables use the same
562    C     identifier so that mnc_cw_vfmv(indv) needs to be overwritten for
563    C     each of these variables
564                 CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(cdiag(ndId), 0,
565         I            misval_r8, misval_r4, misval_int,
566         I            myThid )
567                ENDIF
568    
569                IF (  ((writeBinaryPrec .EQ. precFloat32)
570         &            .AND. (fflags(listId)(1:1) .NE. 'D'))
571         &             .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'R') ) THEN
572                CALL MNC_CW_RL_W('R',diag_mnc_bn,0,0,                CALL MNC_CW_RL_W('R',diag_mnc_bn,0,0,
573       &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)       &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)
574              ELSEIF ( (writeBinaryPrec .EQ. precFloat64)              ELSEIF ( (writeBinaryPrec .EQ. precFloat64)
# Line 462  C           &             0.0 _d 0,myThi Line 585  C           &             0.0 _d 0,myThi
585            ENDIF            ENDIF
586  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
587    
588    C--      end loop on lm (or ll if ALLOW_MNC) counter
589           ENDDO           ENDDO
590  C--     end of Processing Fld # md  C--     end of Processing Fld # md
591          ENDIF          ENDIF
592           ENDDO
593    
594    #ifdef ALLOW_MNC
595    C--   end loop on jj counter
596        ENDDO        ENDDO
597    #endif
598    
599  #ifdef ALLOW_MDSIO  #ifdef ALLOW_MDSIO
600        IF (diag_mdsio) THEN        IF (diag_mdsio) THEN
# Line 476  C     meta files but with more informati Line 605  C     meta files but with more informati
605              nRec = nfields(listId)*averageCycle(listId)              nRec = nfields(listId)*averageCycle(listId)
606              CALL MDS_WR_METAFILES(fn, prec, glf, .FALSE.,              CALL MDS_WR_METAFILES(fn, prec, glf, .FALSE.,
607       &              0, 0, nlevels(listId), ' ',       &              0, 0, nlevels(listId), ' ',
608       &              nfields(listId), flds(1,listId), 1, myTime,       &              nfields(listId), flds(1,listId), nTimRec, timeRec,
609       &              nRec, myIter, myThid)       &              nRec, myIter, myThid)
610        ENDIF        ENDIF
611  #endif /*  ALLOW_MDSIO  */  #endif /*  ALLOW_MDSIO  */
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