/[MITgcm]/MITgcm/pkg/diagnostics/diagnostics_out.F
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Diff of /MITgcm/pkg/diagnostics/diagnostics_out.F

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revision 1.7 by edhill, Tue Feb 8 20:39:58 2005 UTC revision 1.49 by jmc, Mon Jun 6 15:42:58 2011 UTC
# Line 8  CBOP 0 Line 8  CBOP 0
8  C     !ROUTINE: DIAGNOSTICS_OUT  C     !ROUTINE: DIAGNOSTICS_OUT
9    
10  C     !INTERFACE:  C     !INTERFACE:
11        SUBROUTINE  DIAGNOSTICS_OUT(        SUBROUTINE DIAGNOSTICS_OUT(
12       I     listnum,       I     listId,
13       I     myIter,       I     myIter,
14         I     myTime,
15       I     myThid )       I     myThid )
16    
17  C     !DESCRIPTION:  C     !DESCRIPTION:
18  C     Write output for diagnostics fields.  C     Write output for diagnostics fields.
19          
20  C     !USES:  C     !USES:
21        IMPLICIT NONE        IMPLICIT NONE
22  #include "SIZE.h"  #include "SIZE.h"
# Line 25  C     !USES: Line 26  C     !USES:
26  #include "DIAGNOSTICS_SIZE.h"  #include "DIAGNOSTICS_SIZE.h"
27  #include "DIAGNOSTICS.h"  #include "DIAGNOSTICS.h"
28    
29  #ifdef ALLOW_FIZHI        INTEGER NrMax
30  #include "fizhi_SIZE.h"        PARAMETER( NrMax = numLevels )
 #else  
       INTEGER Nrphys  
       PARAMETER (Nrphys=0)  
 #endif  
   
31    
32  C     !INPUT PARAMETERS:  C     !INPUT PARAMETERS:
33  C     listnum :: Diagnostics list number being written  C     listId  :: Diagnostics list number being written
34  C     myIter  :: current iteration number  C     myIter  :: current iteration number
35    C     myTime  :: current time of simulation (s)
36  C     myThid  :: my Thread Id number  C     myThid  :: my Thread Id number
37        INTEGER listnum, myIter, myThid        _RL     myTime
38          INTEGER listId, myIter, myThid
39  CEOP  CEOP
40    
41  C     !LOCAL VARIABLES:  C     !FUNCTIONS:
       INTEGER i, j, k, m, n, bi, bj  
       CHARACTER*8 parms1  
       CHARACTER*3 mate_index  
       INTEGER mate, mVec  
       _RL qtmp1(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr+Nrphys,nSx,nSy)  
       _RL undef, getcon  
       EXTERNAL getcon  
42        INTEGER ILNBLNK        INTEGER ILNBLNK
43        EXTERNAL ILNBLNK        EXTERNAL ILNBLNK
44    #ifdef ALLOW_FIZHI
45          _RL   getcon
46          EXTERNAL getcon
47    #endif
48    
49    C     !LOCAL VARIABLES:
50    C     i,j,k :: loop indices
51    C     bi,bj :: tile indices
52    C     lm    :: loop index (averageCycle)
53    C     md    :: field number in the list "listId".
54    C     ndId  :: diagnostics  Id number (in available diagnostics list)
55    C     mate  :: counter mate Id number (in available diagnostics list)
56    C     ip    :: diagnostics  pointer to storage array
57    C     im    :: counter-mate pointer to storage array
58    C     nLevOutp :: number of levels to write in output file
59    C
60    C--   COMMON /LOCAL_DIAGNOSTICS_OUT/ local common block (for multi-threaded)
61    C     qtmp1 :: thread-shared temporary array (needs to be in common block):
62    C              to write a diagnostic field to file, copy it first from (big)
63    C              diagnostic storage qdiag into it.
64          COMMON /LOCAL_DIAGNOSTICS_OUT/ qtmp1
65          _RL qtmp1(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,NrMax,nSx,nSy)
66    
67          INTEGER i, j, k, lm
68          INTEGER bi, bj
69          INTEGER md, ndId, ip, im
70          INTEGER mate, mVec
71          CHARACTER*10 gcode
72          _RL undef
73          _RL tmpLev
74        INTEGER ilen        INTEGER ilen
75          INTEGER nLevOutp
76    
77        INTEGER ioUnit        INTEGER ioUnit
78        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) pref        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) fn
79        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff
80        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf
81        CHARACTER*(80) fn        INTEGER prec, nRec, nTimRec
82          _RL     timeRec(2)
83    #ifdef ALLOW_MDSIO
84        LOGICAL glf        LOGICAL glf
85    #endif
86  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
87        INTEGER ii        INTEGER ll, llMx, jj, jjMx
88          INTEGER ii, klev
89        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn
       CHARACTER*(5) ctmp  
90        INTEGER CW_DIMS, NLEN        INTEGER CW_DIMS, NLEN
91        PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )        PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )
92        PARAMETER ( NLEN    = 80 )        PARAMETER ( NLEN    = 80 )
# Line 69  C     !LOCAL VARIABLES: Line 94  C     !LOCAL VARIABLES:
94        CHARACTER*(NLEN) dn(CW_DIMS)        CHARACTER*(NLEN) dn(CW_DIMS)
95        CHARACTER*(NLEN) d_cw_name        CHARACTER*(NLEN) d_cw_name
96        CHARACTER*(NLEN) dn_blnk        CHARACTER*(NLEN) dn_blnk
97        _RS ztmp(Nr+Nrphys)  #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK
98          CHARACTER*(5) ctmp
99          _RS ztmp(NrMax)
100    #endif
101          LOGICAL useMissingValue, useMisValForThisDiag
102          REAL*8 misvalLoc
103          REAL*8 misval_r8(2)
104          REAL*4 misval_r4(2)
105          INTEGER misvalIntLoc, misval_int(2)
106  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
107    
108  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
109    
110    C---  set file properties
111        ioUnit= standardMessageUnit        ioUnit= standardMessageUnit
112          undef = UNSET_RL
113    #ifdef ALLOW_FIZHI
114    c     IF ( useFIZHI ) undef = getcon('UNDEF')
115        undef = getcon('UNDEF')        undef = getcon('UNDEF')
116        glf = globalFiles  #endif
117        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter
118        pref = fnames(listnum)        ilen = ILNBLNK(fnames(listId))
119        ilen=ILNBLNK( pref )        WRITE( fn, '(A,A,A)' ) fnames(listId)(1:ilen),'.',suff(1:10)
120        WRITE( fn, '(A,A,A)' ) pref(1:ilen),'.',suff(1:10)  C-    for now, if integrate vertically, output field has just 1 level:
121          nLevOutp = nlevels(listId)
122          IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'I' ) nLevOutp = 1
123    
124    C--   Set time information:
125          IF ( freq(listId).LT.0. ) THEN
126    C-    Snap-shot: store a unique time (which is consistent with State-Var timing)
127            nTimRec = 1
128            timeRec(1) = myTime
129          ELSE
130    C-    Time-average: store the 2 edges of the time-averaging interval.
131    C      this time is consitent with intermediate Var (i.e., non-state, e.g, flux,
132    C      tendencies) timing. For State-Var, this is shifted by + halt time-step.
133            nTimRec = 2
134    
135    C-    end of time-averaging interval:
136            timeRec(2) = myTime
137    
138    C-    begining of time-averaging interval:
139    c       timeRec(1) = myTime - freq(listId)
140    C     a) find the time of the previous multiple of output freq:
141            timeRec(1) = myTime-deltaTClock*0.5 _d 0
142            timeRec(1) = (timeRec(1)-phase(listId))/freq(listId)
143            i = INT( timeRec(1) )
144            IF ( timeRec(1).LT.0. ) THEN
145              tmpLev = FLOAT(i)
146              IF ( timeRec(1).NE.tmpLev ) i = i - 1
147            ENDIF
148            timeRec(1) = phase(listId) + freq(listId)*FLOAT(i)
149    c       if ( listId.eq.2 ) write(0,*) 'f',i,timeRec(1)/deltaTClock
150            timeRec(1) = MAX( timeRec(1), startTime )
151    
152    C     b) round off to nearest multiple of time-step:
153            timeRec(1) = (timeRec(1)-baseTime)/deltaTClock
154            i = NINT( timeRec(1) )
155    C     if just half way, NINT will return the next time-step: correct this
156            tmpLev = FLOAT(i) - 0.5 _d 0
157            IF ( timeRec(1).EQ.tmpLev ) i = i - 1
158            timeRec(1) = baseTime + deltaTClock*FLOAT(i)
159    c       if ( listId.eq.2 ) write(0,*) i,timeRec(1)/deltaTClock
160          ENDIF
161    C--   Convert time to iteration number (debug)
162    c     DO i=1,nTimRec
163    c       timeRec(i) = timeRec(i)/deltaTClock
164    c     ENDDO
165    
166  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
167    C-- this is a trick to reverse the order of the loops on md (= field)
168    C   and lm (= averagePeriod): binary output: lm loop inside md loop ;
169    C                                 mnc ouput: md loop inside lm loop.
170        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
171          DO i = 1,MAX_LEN_FNAM          jjMx = averageCycle(listId)
172            diag_mnc_bn(i:i) = ' '          llMx = 1
173          ENDDO        ELSE
174          DO i = 1,NLEN          jjMx = 1
175            dn_blnk(i:i) = ' '          llMx = averageCycle(listId)
176          ENDDO        ENDIF
177  c       WRITE( diag_mnc_bn, '(A,A)' ) 'diag.', pref(1:ilen)        DO jj=1,jjMx
         WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) pref(1:ilen)  
178    
179  C       Update the record dimension by writing the iteration number         IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
180          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)  C     Handle missing value attribute (land points)
181          CALL MNC_CW_I_W_S('I',diag_mnc_bn,0,0,'T',myIter,myThid)           useMissingValue = .FALSE.
182          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)  #ifdef DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE
183             useMissingValue = .TRUE.
184          dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)  #endif /* DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE */
185          WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listnum)           IF ( misvalFlt(listId) .NE. UNSET_RL ) THEN
186          dim(1) = nlevels(listnum)            misvalLoc = misvalFlt(listId)
187          ib(1)  = 1           ELSE
188          ie(1)  = nlevels(listnum)            misvalLoc = undef
189             ENDIF
190          CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,  C     Defaults to UNSET_I
191       &       dim, dn, ib, ie, myThid)           misvalIntLoc = misvalInt(listId)
192          CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',           DO ii=1,2
193       &       0,0, myThid)  C         misval_r4(ii)  = UNSET_FLOAT4
194          CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',  C         misval_r8(ii)  = UNSET_FLOAT8
195       &       'Idicies of vertical levels within the source arrays',            misval_r4(ii)  = misvalLoc
196       &       myThid)            misval_r8(ii)  = misvalLoc
197                      misval_int(ii) = UNSET_I
198          CALL MNC_CW_RL_W('I',diag_mnc_bn,0,0,           ENDDO
199       &       'diag_levels', levs(1,listnum), myThid)           DO i = 1,MAX_LEN_FNAM
200               diag_mnc_bn(i:i) = ' '
201             ENDDO
202             DO i = 1,NLEN
203               dn_blnk(i:i) = ' '
204             ENDDO
205             WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) fnames(listId)(1:ilen)
206    
207          CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)  C       Update the record dimension by writing the iteration number
208          CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)           klev = myIter + jj - jjMx
209             tmpLev = myTime + deltaTClock*(jj -jjMx)
210             CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)
211             CALL MNC_CW_RL_W_S('D',diag_mnc_bn,0,0,'T',tmpLev,myThid)
212             CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)
213             CALL MNC_CW_I_W_S('I',diag_mnc_bn,0,0,'iter',klev,myThid)
214    
215    C       NOTE: at some point it would be a good idea to add a time_bounds
216    C       variable that has dimension (2,T) and clearly denotes the
217    C       beginning and ending times for each diagnostics period
218    
219             dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)
220             WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nLevOutp
221             dim(1) = nLevOutp
222             ib(1)  = 1
223             ie(1)  = nLevOutp
224    
225             CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,
226         &        dim, dn, ib, ie, myThid)
227             CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',
228         &        0,0, myThid)
229             CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',
230         &        'Idicies of vertical levels within the source arrays',
231         &        myThid)
232    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
233             IF (useMissingValue)
234         &       CALL MNC_CW_VATTR_MISSING('diag_levels', 0,
235         I       misval_r8, misval_r4, misval_int,
236         I       myThid )
237    
238             CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,
239         &        'diag_levels', levs(1,listId), myThid)
240    
241             CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)
242             CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)
243    
244    #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK
245    C       This part has been placed in an #ifdef because, as its currently
246    C       written, it will only work with variables defined on a dynamics
247    C       grid.  As we start using diagnostics for physics grids, ice
248    C       levels, land levels, etc. the different vertical coordinate
249    C       dimensions will have to be taken into account.
250    
251    C       20051021 JMC & EH3 : We need to extend this so that a few
252    C       variables each defined on different grids do not have the same
253    C       vertical dimension names so we should be using a pattern such
254    C       as: Z[uml]td000000 where the 't' is the type as specified by
255    C       gdiag(10)
256    
257  C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx  C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx
258          ctmp(1:5) = 'mul  '           ctmp(1:5) = 'mul  '
259          DO i = 1,3           DO i = 1,3
260            dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)             dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)
261            WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listnum)             WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listId)
262            CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)             CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)
263            CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)             CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)
264            DO j = 1,nlevels(listnum)  
265              IF (i .EQ. 1) THEN  C         The following three ztmp() loops should eventually be modified
266                ztmp(j) = rC(levs(j,listnum))  C         to reflect the fractional nature of levs(j,l) -- they should
267                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',  C         do something like:
268       &             'Dimensional coordinate value at the mid point',  C            ztmp(j) = rC(INT(FLOOR(levs(j,l))))
269       &             myThid)  C                      + ( rC(INT(FLOOR(levs(j,l))))
270              ELSEIF (i .EQ. 2) THEN  C                          + rC(INT(CEIL(levs(j,l)))) )
271                ztmp(j) = rF(levs(j,listnum))  C                        / ( levs(j,l) - FLOOR(levs(j,l)) )
272                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',  C         for averaged levels.
273       &             'Dimensional coordinate value at the upper point',             IF (i .EQ. 1) THEN
274       &             myThid)               DO j = 1,nlevels(listId)
275              ELSEIF (i .EQ. 3) THEN                 ztmp(j) = rC(NINT(levs(j,listId)))
276                ztmp(j) = rF(levs(j,listnum) + 1)               ENDDO
277                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',               CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
278       &             'Dimensional coordinate value at the lower point',       &            'Dimensional coordinate value at the mid point',
279       &             myThid)       &            myThid)
280              ENDIF             ELSEIF (i .EQ. 2) THEN
281            ENDDO               DO j = 1,nlevels(listId)
282            CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)                 ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)) + 1)
283            CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)               ENDDO
284            CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)               CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
285          ENDDO       &            'Dimensional coordinate value at the upper point',
286         &            myThid)
287               ELSEIF (i .EQ. 3) THEN
288                 DO j = 1,nlevels(listId)
289                   ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)))
290                 ENDDO
291                 CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
292         &            'Dimensional coordinate value at the lower point',
293         &            myThid)
294               ENDIF
295    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
296               IF (useMissingValue)
297         &          CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(dn(1), 0,
298         I          misval_r8, misval_r4, misval_int,
299         I          myThid )
300               CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)
301               CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)
302               CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)
303             ENDDO
304    #endif /*  DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  */
305    
306        ENDIF         ENDIF
307  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
308    
309        DO n = 1,nfields(listnum)  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
310          m = jdiag(n,listnum)  
311          parms1 = gdiag(m)(1:8)         DO md = 1,nfields(listId)
312          IF ( idiag(m).NE.0 .AND. parms1(5:5).NE.'D' ) THEN          ndId = jdiag(md,listId)
313            gcode = gdiag(ndId)(1:10)
314            mate = 0
315            mVec = 0
316            IF ( gcode(5:5).EQ.'C' ) THEN
317    C-      Check for Mate of a Counter Diagnostic
318               mate = hdiag(ndId)
319            ELSEIF ( gcode(1:1).EQ.'U' .OR. gcode(1:1).EQ.'V' ) THEN
320    C-      Check for Mate of a Vector Diagnostic
321               mVec = hdiag(ndId)
322            ENDIF
323            IF ( idiag(md,listId).NE.0 .AND. gcode(5:5).NE.'D' ) THEN
324  C--     Start processing 1 Fld :  C--     Start processing 1 Fld :
325    #ifdef ALLOW_MNC
326             DO ll=1,llMx
327              lm = jj+ll-1
328    #else
329             DO lm=1,averageCycle(listId)
330    #endif
331    
332              ip = ABS(idiag(md,listId)) + kdiag(ndId)*(lm-1)
333              im = mdiag(md,listId)
334              IF (mate.GT.0) im = im + kdiag(mate)*(lm-1)
335              IF (mVec.GT.0) im = im + kdiag(mVec)*(lm-1)
336    
337            IF ( ndiag(m).EQ.0 ) THEN            IF ( ndiag(ip,1,1).EQ.0 ) THEN
338  C-        Empty diagnostics case :  C-        Empty diagnostics case :
339    
340              _BEGIN_MASTER( myThid )              _BEGIN_MASTER( myThid )
341              WRITE(msgBuf,'(A,I10)')              WRITE(msgBuf,'(A,I10)')
342       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter
343              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
344       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
345              WRITE(msgBuf,'(A,I4,3A,I3,2A)')              WRITE(msgBuf,'(A,I6,3A,I4,2A)')
346       &       '- WARNING -   diag.#',m, ' : ',flds(n,listnum),       &       '- WARNING -   diag.#',ndId, ' : ',flds(md,listId),
347       &       ' (#',n,' ) in outp.Stream: ',fnames(listnum)       &       ' (#',md,' ) in outp.Stream: ',fnames(listId)
348              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
349       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
350              WRITE(msgBuf,'(A,I2,A)')              IF ( averageCycle(listId).GT.1 ) THEN
351       &       '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',ndiag(m),' )'               WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
352              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag(lm=',lm,')=',
353         &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
354                ELSE
355                 WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
356         &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',
357         &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
358                ENDIF
359                CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
360       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
361              WRITE(msgBuf,'(A)')              WRITE(msgBuf,'(A)')
362       &       'WARNING DIAGNOSTICS_OUT  => write ZEROS instead'       &       'WARNING DIAGNOSTICS_OUT  => write ZEROS instead'
363              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
364       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
365              _END_MASTER( myThid )              _END_MASTER( myThid )
366              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
367                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
368                  DO k = 1,nlevels(listnum)                  DO k = 1,nLevOutp
369                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy
370                      DO i = 1-OLx,sNx+OLx                      DO i = 1-OLx,sNx+OLx
371                        qtmp1(i,j,k,bi,bj) = 0. _d 0                        qtmp1(i,j,k,bi,bj) = 0. _d 0
# Line 194  C-        Empty diagnostics case : Line 378  C-        Empty diagnostics case :
378            ELSE            ELSE
379  C-        diagnostics is not empty :  C-        diagnostics is not empty :
380    
381              IF ( myThid.EQ.1 )              IF ( debugLevel.GE.debLevB .AND. myThid.EQ.1 ) THEN
382       &             WRITE(ioUnit,2000) m,cdiag(m),ndiag(m),gdiag(m)                WRITE(ioUnit,'(A,I6,3A,I8,2A)')
383         &         ' Computing Diagnostic # ', ndId, '  ', cdiag(ndId),
384              IF ( parms1(5:5).EQ.'C' ) THEN       &         '     Counter:',ndiag(ip,1,1),'   Parms: ',gdiag(ndId)
385  C             Check for Mate of a Counter Diagnostic                IF ( mate.GT.0 ) THEN
386  C             --------------------------------------                 WRITE(ioUnit,'(3A,I6,2A)')
387                mate_index = parms1(6:8)       &         '       use Counter Mate for  ', cdiag(ndId),
388                READ (mate_index,'(I3)') mate       &         '     Diagnostic # ',mate, '  ', cdiag(mate)
389                IF ( myThid.EQ.1 )                ELSEIF ( mVec.GT.0 ) THEN
390       &                 WRITE(ioUnit,2003) cdiag(m),mate,cdiag(mate)                  IF ( im.GT.0 .AND. ndiag(MAX(1,im),1,1).GT.0 ) THEN
391              ELSE                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
392                mate = 0       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
393         &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
394  C             Check for Mate of a Vector Diagnostic       &             ' exists '
 C             -------------------------------------  
               IF ( parms1(1:1).EQ.'U' .OR. parms1(1:1).EQ.'V' ) THEN  
                 mate_index = parms1(6:8)  
                 READ (mate_index,'(I3)') mVec  
                 IF ( idiag(mVec).NE.0 ) THEN  
                   IF ( myThid.EQ.1 )  
      &                 WRITE(ioUnit,2001) cdiag(m),mVec,cdiag(mVec)  
395                  ELSE                  ELSE
396                    IF ( myThid.EQ.1 )                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
397       &                 WRITE(ioUnit,2002) cdiag(m),mVec,cdiag(mVec)       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
398         &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
399         &             ' not enabled'
400                  ENDIF                  ENDIF
401                ENDIF                ENDIF
402              ENDIF              ENDIF
403    
404              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              IF ( fflags(listId)(2:2).NE.' ' ) THEN
405               DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  C-       get all the levels (for vertical post-processing)
406                DO k = 1,nlevels(listnum)                DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
407                  CALL GETDIAG(                 DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
408       I                       levs(k,listnum),undef,                  DO k = 1,kdiag(ndId)
409       O                       qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),                    tmpLev = k
410       I                       m,mate,bi,bj,myThid)                    CALL GETDIAG(
411         I                         tmpLev,undef,
412         O                         qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),
413         I                         ndId,mate,ip,im,bi,bj,myThid)
414                    ENDDO
415                   ENDDO
416                ENDDO                ENDDO
417               ENDDO              ELSE
418              ENDDO  C-       get only selected levels:
419                  DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
420                   DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
421                    DO k = 1,nlevels(listId)
422                      CALL GETDIAG(
423         I                         levs(k,listId),undef,
424         O                         qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),
425         I                         ndId,mate,ip,im,bi,bj,myThid)
426                    ENDDO
427                   ENDDO
428                  ENDDO
429                ENDIF
430    
431  C-        end of empty diag / not empty block  C-----------------------------------------------------------------------
432    C--     Apply specific post-processing (e.g., interpolate) before output
433    C-----------------------------------------------------------------------
434                IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'P' ) THEN
435    C-          Do vertical interpolation:
436                 IF ( fluidIsAir ) THEN
437    C jmc: for now, this can only work in an atmospheric set-up (fluidIsAir);
438                  CALL DIAGNOSTICS_INTERP_VERT(
439         I                         listId, md, ndId, ip, im, lm,
440         U                         qtmp1,
441         I                         undef, myTime, myIter, myThid )
442                 ELSE
443                   WRITE(msgBuf,'(2A)') 'DIAGNOSTICS_OUT: ',
444         &           'INTERP_VERT not allowed in this config'
445                   CALL PRINT_ERROR( msgBuf , myThid )
446                   STOP 'ABNORMAL END: S/R DIAGNOSTICS_OUT'
447                 ENDIF
448                ENDIF
449                IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'I' ) THEN
450    C-          Integrate vertically: for now, output field has just 1 level:
451                  CALL DIAGNOSTICS_SUM_LEVELS(
452         I                         listId, md, ndId, ip, im, lm,
453         U                         qtmp1,
454         I                         undef, myTime, myIter, myThid )
455                ENDIF
456    
457    C--     End of empty diag / not-empty diag block
458            ENDIF            ENDIF
459    
460  #ifdef ALLOW_MDSIO  C--     Ready to write field "md", element "lm" in averageCycle(listId)
461  C         Prepare for mdsio optionality  
462            IF (diag_mdsio) THEN  C-        write to binary file, using MDSIO pkg:
463              CALL mdswritefield_new(fn,writeBinaryPrec,glf,'RL',            IF ( diag_mdsio ) THEN
464       &           Nr+Nrphys,nlevels(listnum),qtmp1,n,myIter,myThid)              nRec = lm + (md-1)*averageCycle(listId)
465    C           default precision for output files
466                prec = writeBinaryPrec
467    C           fFlag(1)=R(or D): force it to be 32-bit(or 64) precision
468                IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'R' ) prec = precFloat32
469                IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'D' ) prec = precFloat64
470    C         a hack not to write meta files now: pass -nRec < 0 to MDS_WRITE S/R
471                CALL WRITE_REC_LEV_RL(
472         I                            fn, prec,
473         I                            NrMax, 1, nLevOutp,
474         I                            qtmp1, -nRec, myIter, myThid )
475            ENDIF            ENDIF
 #endif /*  ALLOW_MDSIO  */  
476    
477  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
478            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
# Line 259  C           subtlety within MNC.  Basica Line 489  C           subtlety within MNC.  Basica
489  C           caching its own concept of what each "grid name" (that is, a  C           caching its own concept of what each "grid name" (that is, a
490  C           dimension group name) means.  So one cannot re-use the same  C           dimension group name) means.  So one cannot re-use the same
491  C           "grid" name for different collections of dimensions within a  C           "grid" name for different collections of dimensions within a
492  C           given file.  By appending the "m" values to each name, we  C           given file.  By appending the "ndId" values to each name, we
493  C           guarantee uniqueness within each MNC-produced file.  C           guarantee uniqueness within each MNC-produced file.
494              WRITE(d_cw_name,'(a,i6.6)') 'd_cw_',m              WRITE(d_cw_name,'(a,i6.6)') 'd_cw_',ndId
495    
496  C           XY dimensions  C           XY dimensions
497              dim(1)       = sNx + 2*OLx              dim(1)       = sNx + 2*OLx
498              dim(2)       = sNy + 2*OLy              dim(2)       = sNy + 2*OLy
499              ib(1)        = OLx + 1              ib(1)        = OLx + 1
500              ib(2)        = OLy + 1              ib(2)        = OLy + 1
501              IF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'M') THEN              IF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'M') THEN
502                dn(1)(1:2) = 'X'                dn(1)(1:2) = 'X'
503                ie(1)      = OLx + sNx                ie(1)      = OLx + sNx
504                dn(2)(1:2) = 'Y'                dn(2)(1:2) = 'Y'
505                ie(2)      = OLy + sNy                ie(2)      = OLy + sNy
506              ELSEIF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'U') THEN              ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'U') THEN
507                dn(1)(1:3) = 'Xp1'                dn(1)(1:3) = 'Xp1'
508                ie(1)      = OLx + sNx + 1                ie(1)      = OLx + sNx + 1
509                dn(2)(1:2) = 'Y'                dn(2)(1:2) = 'Y'
510                ie(2)      = OLy + sNy                ie(2)      = OLy + sNy
511              ELSEIF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'V') THEN              ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'V') THEN
512                dn(1)(1:2) = 'X'                dn(1)(1:2) = 'X'
513                ie(1)      = OLx + sNx                ie(1)      = OLx + sNx
514                dn(2)(1:3) = 'Yp1'                dn(2)(1:3) = 'Yp1'
515                ie(2)      = OLy + sNy + 1                ie(2)      = OLy + sNy + 1
516              ELSEIF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'Z') THEN              ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'Z') THEN
517                dn(1)(1:3) = 'Xp1'                dn(1)(1:3) = 'Xp1'
518                ie(1)      = OLx + sNx + 1                ie(1)      = OLx + sNx + 1
519                dn(2)(1:3) = 'Yp1'                dn(2)(1:3) = 'Yp1'
520                ie(2)      = OLy + sNy + 1                ie(2)      = OLy + sNy + 1
521              ENDIF              ENDIF
522                
523  C           Z is special since it varies  C           Z is special since it varies
524              WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zd', nlevels(listnum)              WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zd', nLevOutp
525              IF ( (gdiag(m)(10:10) .EQ. 'R')              IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')
526       &           .AND. (gdiag(m)(9:9) .EQ. 'M') ) THEN       &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'M') ) THEN
527                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listnum)                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zmd', nLevOutp
528              ENDIF              ENDIF
529              IF ( (gdiag(m)(10:10) .EQ. 'R')              IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')
530       &           .AND. (gdiag(m)(9:9) .EQ. 'L') ) THEN       &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'L') ) THEN
531                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zld', nlevels(listnum)                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zld', nLevOutp
532              ENDIF              ENDIF
533              IF ( (gdiag(m)(10:10) .EQ. 'R')              IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')
534       &           .AND. (gdiag(m)(9:9) .EQ. 'U') ) THEN       &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'U') ) THEN
535                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zud', nlevels(listnum)                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zud', nLevOutp
536              ENDIF              ENDIF
537              dim(3) = Nr+Nrphys              dim(3) = NrMax
538              ib(3)  = 1              ib(3)  = 1
539              ie(3)  = nlevels(listnum)              ie(3)  = nLevOutp
540    
541  C           Time dimension  C           Time dimension
542              dn(4)(1:1) = 'T'              dn(4)(1:1) = 'T'
# Line 314  C           Time dimension Line 544  C           Time dimension
544              ib(4)  = 1              ib(4)  = 1
545              ie(4)  = 1              ie(4)  = 1
546    
547              CALL MNC_CW_ADD_GNAME(d_cw_name, 4,              CALL MNC_CW_ADD_GNAME(d_cw_name, 4,
548       &             dim, dn, ib, ie, myThid)       &             dim, dn, ib, ie, myThid)
549              CALL MNC_CW_ADD_VNAME(cdiag(m), d_cw_name,              CALL MNC_CW_ADD_VNAME(cdiag(ndId), d_cw_name,
550       &             4,5, myThid)       &             4,5, myThid)
551              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(m),'description',              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'description',
552       &             tdiag(m),myThid)       &             tdiag(ndId),myThid)
553              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(m),'units',              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'units',
554       &             udiag(m),myThid)       &             udiag(ndId),myThid)
555    
556    C     Missing values only for scalar diagnostics at mass points (so far)
557                useMisValForThisDiag = useMissingValue
558         &           .AND.gdiag(ndId)(1:2).EQ.'SM'
559                IF ( useMisValForThisDiag ) THEN
560    C     assign missing values and set flag for adding the netCDF atttibute
561                 CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(cdiag(ndId), 2,
562         I            misval_r8, misval_r4, misval_int,
563         I            myThid )
564    C     and now use the missing values for masking out the land points
565    C     note: better to use 2-D mask if kdiag <> Nr or vert.integral
566                 DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
567                  DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
568                   DO k = 1,nLevOutp
569                    klev = NINT(levs(k,listId))
570                    IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'I' ) kLev = 1
571                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy
572                     DO i = 1-OLx,sNx+OLx
573                      IF ( maskC(i,j,klev,bi,bj) .EQ. 0. )
574         &                 qtmp1(i,j,k,bi,bj) = misvalLoc
575                     ENDDO
576                    ENDDO
577                   ENDDO
578                  ENDDO
579                 ENDDO
580                ELSE
581    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
582    C     Note: We have to call the following subroutine for each mnc that has
583    C     been created "on the fly" by mnc_cw_add_vname and will be deleted
584    C     by mnc_cw_del_vname, because all of these variables use the same
585    C     identifier so that mnc_cw_vfmv(indv) needs to be overwritten for
586    C     each of these variables
587                 CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(cdiag(ndId), 0,
588         I            misval_r8, misval_r4, misval_int,
589         I            myThid )
590                ENDIF
591    
592              CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,              IF (  ((writeBinaryPrec .EQ. precFloat32)
593       &             cdiag(m), qtmp1, myThid)       &            .AND. (fflags(listId)(1:1) .NE. 'D'))
594         &             .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'R') ) THEN
595                  CALL MNC_CW_RL_W('R',diag_mnc_bn,0,0,
596         &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)
597                ELSEIF ( (writeBinaryPrec .EQ. precFloat64)
598         &             .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'D') ) THEN
599                  CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,
600         &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)
601                ENDIF
602    
603              CALL MNC_CW_DEL_VNAME(cdiag(m), myThid)              CALL MNC_CW_DEL_VNAME(cdiag(ndId), myThid)
604              CALL MNC_CW_DEL_GNAME(d_cw_name, myThid)              CALL MNC_CW_DEL_GNAME(d_cw_name, myThid)
605    
606              _END_MASTER( myThid )              _END_MASTER( myThid )
# Line 334  C           Time dimension Line 608  C           Time dimension
608            ENDIF            ENDIF
609  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
610    
611  C--     end of Processing Fld # n  C--      end loop on lm (or ll if ALLOW_MNC) counter
612             ENDDO
613    C--     end of Processing Fld # md
614          ENDIF          ENDIF
615           ENDDO
616    
617    #ifdef ALLOW_MNC
618    C--   end loop on jj counter
619        ENDDO        ENDDO
620    #endif
621    
622   2000 format(1x,'Computing Diagnostic # ',i3,2x,a8,5x,'Counter: ',  #ifdef ALLOW_MDSIO
623       &     i4,6x,'Parms: ',a16)        IF (diag_mdsio) THEN
624   2001 format(1x,'          Vector  Mate for  ',a8,5x,  C-    Note: temporary: since it is a pain to add more arguments to
625       &     'Diagnostic # ',i3,2x,a8,' exists ')  C     all MDSIO S/R, uses instead this specific S/R to write only
626   2002 format(1x,'        Vector  Mate for  ',a8,5x,  C     meta files but with more informations in it.
627       &     'Diagnostic # ',i3,2x,a8,' not enabled')              glf = globalFiles
628   2003 format(1x,'      use Counter Mate for  ',a8,5x,              nRec = nfields(listId)*averageCycle(listId)
629       &     'Diagnostic # ',i3,2x,a8)              CALL MDS_WR_METAFILES(fn, prec, glf, .FALSE.,
630               &              0, 0, nLevOutp, ' ',
631        RETURN       &              nfields(listId), flds(1,listId), nTimRec, timeRec,
632         &              nRec, myIter, myThid)
633          ENDIF
634    #endif /*  ALLOW_MDSIO  */
635    
636          RETURN
637        END        END
638                                                                        
639  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
Legend:
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