/[MITgcm]/MITgcm/pkg/diagnostics/diagnostics_out.F
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revision 1.9 by edhill, Mon Feb 28 19:38:30 2005 UTC revision 1.43 by jmc, Sun Jan 3 00:42:45 2010 UTC
# Line 9  C     !ROUTINE: DIAGNOSTICS_OUT Line 9  C     !ROUTINE: DIAGNOSTICS_OUT
9    
10  C     !INTERFACE:  C     !INTERFACE:
11        SUBROUTINE  DIAGNOSTICS_OUT(        SUBROUTINE  DIAGNOSTICS_OUT(
12       I     listnum,       I     listId,
13       I     myIter,       I     myIter,
14         I     myTime,
15       I     myThid )       I     myThid )
16    
17  C     !DESCRIPTION:  C     !DESCRIPTION:
18  C     Write output for diagnostics fields.  C     Write output for diagnostics fields.
19          
20  C     !USES:  C     !USES:
21        IMPLICIT NONE        IMPLICIT NONE
22  #include "SIZE.h"  #include "SIZE.h"
# Line 25  C     !USES: Line 26  C     !USES:
26  #include "DIAGNOSTICS_SIZE.h"  #include "DIAGNOSTICS_SIZE.h"
27  #include "DIAGNOSTICS.h"  #include "DIAGNOSTICS.h"
28    
29  #ifdef ALLOW_FIZHI        INTEGER NrMax
30  #include "fizhi_SIZE.h"        PARAMETER( NrMax = numLevels )
 #else  
       INTEGER Nrphys  
       PARAMETER (Nrphys=0)  
 #endif  
   
31    
32  C     !INPUT PARAMETERS:  C     !INPUT PARAMETERS:
33  C     listnum :: Diagnostics list number being written  C     listId  :: Diagnostics list number being written
34  C     myIter  :: current iteration number  C     myIter  :: current iteration number
35    C     myTime  :: current time of simulation (s)
36  C     myThid  :: my Thread Id number  C     myThid  :: my Thread Id number
37        INTEGER listnum, myIter, myThid        _RL     myTime
38          INTEGER listId, myIter, myThid
39  CEOP  CEOP
40    
41  C     !LOCAL VARIABLES:  C     !FUNCTIONS:
       INTEGER i, j, k, m, n, bi, bj  
       CHARACTER*8 parms1  
       CHARACTER*3 mate_index  
       INTEGER mate, mVec  
       _RL qtmp1(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr+Nrphys,nSx,nSy)  
       _RL undef, getcon  
       EXTERNAL getcon  
42        INTEGER ILNBLNK        INTEGER ILNBLNK
43        EXTERNAL ILNBLNK        EXTERNAL ILNBLNK
44    #ifdef ALLOW_FIZHI
45          _RL   getcon
46          EXTERNAL getcon
47    #endif
48    
49    C     !LOCAL VARIABLES:
50    C     i,j,k :: loop indices
51    C     lm    :: loop index (averageCycle)
52    C     md    :: field number in the list "listId".
53    C     ndId  :: diagnostics  Id number (in available diagnostics list)
54    C     mate  :: counter mate Id number (in available diagnostics list)
55    C     ip    :: diagnostics  pointer to storage array
56    C     im    :: counter-mate pointer to storage array
57    C
58    C--   COMMON /LOCAL_DIAGNOSTICS_OUT/ local common block (for multi-threaded)
59    C     qtmp1 :: thread-shared temporary array (needs to be in common block):
60    C              to write a diagnostic field to file, copy it first from (big)
61    C              diagnostic storage qdiag into it.
62          COMMON /LOCAL_DIAGNOSTICS_OUT/ qtmp1
63          _RL qtmp1(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,NrMax,nSx,nSy)
64    
65          INTEGER i, j, k, lm
66          INTEGER bi, bj
67          INTEGER md, ndId, ip, im
68          INTEGER mate, mVec
69          CHARACTER*10 gcode
70          _RL undef
71          _RL tmpLev
72        INTEGER ilen        INTEGER ilen
73    
74        INTEGER ioUnit        INTEGER ioUnit
75        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) pref        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) fn
76        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff
77        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf
78        CHARACTER*(80) fn        INTEGER prec, nRec
79    #ifdef ALLOW_MDSIO
80        LOGICAL glf        LOGICAL glf
81          _RL timeRec(1)
82    #endif
83  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
84        INTEGER ii        INTEGER ll, llMx, jj, jjMx
85          INTEGER ii, klev
86        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn
       CHARACTER*(5) ctmp  
87        INTEGER CW_DIMS, NLEN        INTEGER CW_DIMS, NLEN
88        PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )        PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )
89        PARAMETER ( NLEN    = 80 )        PARAMETER ( NLEN    = 80 )
# Line 69  C     !LOCAL VARIABLES: Line 91  C     !LOCAL VARIABLES:
91        CHARACTER*(NLEN) dn(CW_DIMS)        CHARACTER*(NLEN) dn(CW_DIMS)
92        CHARACTER*(NLEN) d_cw_name        CHARACTER*(NLEN) d_cw_name
93        CHARACTER*(NLEN) dn_blnk        CHARACTER*(NLEN) dn_blnk
94        _RS ztmp(Nr+Nrphys)  #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK
95          CHARACTER*(5) ctmp
96          _RS ztmp(NrMax)
97    #endif
98          LOGICAL useMissingValue, useMisValForThisDiag
99          REAL*8 misvalLoc
100          REAL*8 misval_r8(2)
101          REAL*4 misval_r4(2)
102          INTEGER misvalIntLoc, misval_int(2)
103  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
104    
105  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
106    
107        ioUnit= standardMessageUnit        ioUnit= standardMessageUnit
108          undef = UNSET_RL
109    #ifdef ALLOW_FIZHI
110    c     IF ( useFIZHI ) undef = getcon('UNDEF')
111        undef = getcon('UNDEF')        undef = getcon('UNDEF')
112        glf = globalFiles  #endif
113        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter
114        pref = fnames(listnum)        ilen = ILNBLNK(fnames(listId))
115        ilen=ILNBLNK( pref )        WRITE( fn, '(A,A,A)' ) fnames(listId)(1:ilen),'.',suff(1:10)
       WRITE( fn, '(A,A,A)' ) pref(1:ilen),'.',suff(1:10)  
116    
117  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
118    C-- this is a trick to reverse the order of the loops on md (= field)
119    C   and lm (= averagePeriod): binary output: lm loop inside md loop ;
120    C                                 mnc ouput: md loop inside lm loop.
121        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
122          DO i = 1,MAX_LEN_FNAM          jjMx = averageCycle(listId)
123            diag_mnc_bn(i:i) = ' '          llMx = 1
124          ENDDO        ELSE
125          DO i = 1,NLEN          jjMx = 1
126            dn_blnk(i:i) = ' '          llMx = averageCycle(listId)
127          ENDDO        ENDIF
128  c       WRITE( diag_mnc_bn, '(A,A)' ) 'diag.', pref(1:ilen)        DO jj=1,jjMx
         WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) pref(1:ilen)  
129    
130  C       Update the record dimension by writing the iteration number         IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
131          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)  C     Handle missing value attribute (land points)
132          CALL MNC_CW_I_W_S('I',diag_mnc_bn,0,0,'T',myIter,myThid)           useMissingValue = .FALSE.
133          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)  #ifdef DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE
134             useMissingValue = .TRUE.
135          dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)  #endif /* DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE */
136          WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listnum)           IF ( misvalFlt(listId) .NE. UNSET_RL ) THEN
137          dim(1) = nlevels(listnum)            misvalLoc = misvalFlt(listId)
138          ib(1)  = 1           ELSE
139          ie(1)  = nlevels(listnum)            misvalLoc = undef
140             ENDIF
141          CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,  C     Defaults to UNSET_I
142       &       dim, dn, ib, ie, myThid)           misvalIntLoc = misvalInt(listId)
143          CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',           DO ii=1,2
144       &       0,0, myThid)  C         misval_r4(ii)  = UNSET_FLOAT4
145          CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',  C         misval_r8(ii)  = UNSET_FLOAT8
146       &       'Idicies of vertical levels within the source arrays',            misval_r4(ii)  = misvalLoc
147       &       myThid)            misval_r8(ii)  = misvalLoc
148                      misval_int(ii) = UNSET_I
149          CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,           ENDDO
150       &       'diag_levels', levs(1,listnum), myThid)           DO i = 1,MAX_LEN_FNAM
151               diag_mnc_bn(i:i) = ' '
152             ENDDO
153             DO i = 1,NLEN
154               dn_blnk(i:i) = ' '
155             ENDDO
156             WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) fnames(listId)(1:ilen)
157    
158          CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)  C       Update the record dimension by writing the iteration number
159          CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)           klev = myIter + jj - jjMx
160             tmpLev = myTime + deltaTClock*(jj -jjMx)
161             CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)
162             CALL MNC_CW_RL_W_S('D',diag_mnc_bn,0,0,'T',tmpLev,myThid)
163             CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)
164             CALL MNC_CW_I_W_S('I',diag_mnc_bn,0,0,'iter',klev,myThid)
165    
166    C       NOTE: at some point it would be a good idea to add a time_bounds
167    C       variable that has dimension (2,T) and clearly denotes the
168    C       beginning and ending times for each diagnostics period
169    
170             dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)
171             WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)
172             dim(1) = nlevels(listId)
173             ib(1)  = 1
174             ie(1)  = nlevels(listId)
175    
176             CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,
177         &        dim, dn, ib, ie, myThid)
178             CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',
179         &        0,0, myThid)
180             CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',
181         &        'Idicies of vertical levels within the source arrays',
182         &        myThid)
183    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
184             IF (useMissingValue)
185         &       CALL MNC_CW_VATTR_MISSING('diag_levels', 0,
186         I       misval_r8, misval_r4, misval_int,
187         I       myThid )
188    
189             CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,
190         &        'diag_levels', levs(1,listId), myThid)
191    
192             CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)
193             CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)
194    
195    #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK
196    C       This part has been placed in an #ifdef because, as its currently
197    C       written, it will only work with variables defined on a dynamics
198    C       grid.  As we start using diagnostics for physics grids, ice
199    C       levels, land levels, etc. the different vertical coordinate
200    C       dimensions will have to be taken into account.
201    
202    C       20051021 JMC & EH3 : We need to extend this so that a few
203    C       variables each defined on different grids do not have the same
204    C       vertical dimension names so we should be using a pattern such
205    C       as: Z[uml]td000000 where the 't' is the type as specified by
206    C       gdiag(10)
207    
208  C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx  C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx
209          ctmp(1:5) = 'mul  '           ctmp(1:5) = 'mul  '
210          DO i = 1,3           DO i = 1,3
211            dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)             dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)
212            WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listnum)             WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listId)
213            CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)             CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)
214            CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)             CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)
215            DO j = 1,nlevels(listnum)  
216              IF (i .EQ. 1) THEN  C         The following three ztmp() loops should eventually be modified
217                ztmp(j) = rC(levs(j,listnum))  C         to reflect the fractional nature of levs(j,l) -- they should
218                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',  C         do something like:
219       &             'Dimensional coordinate value at the mid point',  C            ztmp(j) = rC(INT(FLOOR(levs(j,l))))
220       &             myThid)  C                      + ( rC(INT(FLOOR(levs(j,l))))
221              ELSEIF (i .EQ. 2) THEN  C                          + rC(INT(CEIL(levs(j,l)))) )
222                ztmp(j) = rF(levs(j,listnum) + 1)  C                        / ( levs(j,l) - FLOOR(levs(j,l)) )
223                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',  C         for averaged levels.
224       &             'Dimensional coordinate value at the upper point',             IF (i .EQ. 1) THEN
225       &             myThid)               DO j = 1,nlevels(listId)
226              ELSEIF (i .EQ. 3) THEN                 ztmp(j) = rC(NINT(levs(j,listId)))
227                ztmp(j) = rF(levs(j,listnum))               ENDDO
228                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',               CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
229       &             'Dimensional coordinate value at the lower point',       &            'Dimensional coordinate value at the mid point',
230       &             myThid)       &            myThid)
231              ENDIF             ELSEIF (i .EQ. 2) THEN
232            ENDDO               DO j = 1,nlevels(listId)
233            CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)                 ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)) + 1)
234            CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)               ENDDO
235            CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)               CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
236          ENDDO       &            'Dimensional coordinate value at the upper point',
237         &            myThid)
238               ELSEIF (i .EQ. 3) THEN
239                 DO j = 1,nlevels(listId)
240                   ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)))
241                 ENDDO
242                 CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
243         &            'Dimensional coordinate value at the lower point',
244         &            myThid)
245               ENDIF
246    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
247               IF (useMissingValue)
248         &          CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(dn(1), 0,
249         I          misval_r8, misval_r4, misval_int,
250         I          myThid )
251               CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)
252               CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)
253               CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)
254             ENDDO
255    #endif /*  DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  */
256    
257        ENDIF         ENDIF
258  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
259    
260        DO n = 1,nfields(listnum)  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
261          m = jdiag(n,listnum)  
262          parms1 = gdiag(m)(1:8)         DO md = 1,nfields(listId)
263          IF ( idiag(m).NE.0 .AND. parms1(5:5).NE.'D' ) THEN          ndId = jdiag(md,listId)
264            gcode = gdiag(ndId)(1:10)
265            mate = 0
266            mVec = 0
267            IF ( gcode(5:5).EQ.'C' ) THEN
268    C-      Check for Mate of a Counter Diagnostic
269               mate = hdiag(ndId)
270            ELSEIF ( gcode(1:1).EQ.'U' .OR. gcode(1:1).EQ.'V' ) THEN
271    C-      Check for Mate of a Vector Diagnostic
272               mVec = hdiag(ndId)
273            ENDIF
274            IF ( idiag(md,listId).NE.0 .AND. gcode(5:5).NE.'D' ) THEN
275  C--     Start processing 1 Fld :  C--     Start processing 1 Fld :
276    #ifdef ALLOW_MNC
277             DO ll=1,llMx
278              lm = jj+ll-1
279    #else
280             DO lm=1,averageCycle(listId)
281    #endif
282    
283            IF ( ndiag(m).EQ.0 ) THEN            ip = ABS(idiag(md,listId)) + kdiag(ndId)*(lm-1)
284              im = mdiag(md,listId)
285              IF (mate.GT.0) im = im + kdiag(mate)*(lm-1)
286              IF (mVec.GT.0) im = im + kdiag(mVec)*(lm-1)
287    
288              IF ( ndiag(ip,1,1).EQ.0 ) THEN
289  C-        Empty diagnostics case :  C-        Empty diagnostics case :
290    
291              _BEGIN_MASTER( myThid )              _BEGIN_MASTER( myThid )
292              WRITE(msgBuf,'(A,I10)')              WRITE(msgBuf,'(A,I10)')
293       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter
294              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
295       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
296              WRITE(msgBuf,'(A,I4,3A,I3,2A)')              WRITE(msgBuf,'(A,I6,3A,I4,2A)')
297       &       '- WARNING -   diag.#',m, ' : ',flds(n,listnum),       &       '- WARNING -   diag.#',ndId, ' : ',flds(md,listId),
298       &       ' (#',n,' ) in outp.Stream: ',fnames(listnum)       &       ' (#',md,' ) in outp.Stream: ',fnames(listId)
299              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
300       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
301              WRITE(msgBuf,'(A,I2,A)')              IF ( averageCycle(listId).GT.1 ) THEN
302       &       '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',ndiag(m),' )'               WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
303              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag(lm=',lm,')=',
304         &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
305                ELSE
306                 WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
307         &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',
308         &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
309                ENDIF
310                CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
311       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
312              WRITE(msgBuf,'(A)')              WRITE(msgBuf,'(A)')
313       &       'WARNING DIAGNOSTICS_OUT  => write ZEROS instead'       &       'WARNING DIAGNOSTICS_OUT  => write ZEROS instead'
314              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
315       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
316              _END_MASTER( myThid )              _END_MASTER( myThid )
317              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
318                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
319                  DO k = 1,nlevels(listnum)                  DO k = 1,nlevels(listId)
320                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy
321                      DO i = 1-OLx,sNx+OLx                      DO i = 1-OLx,sNx+OLx
322                        qtmp1(i,j,k,bi,bj) = 0. _d 0                        qtmp1(i,j,k,bi,bj) = 0. _d 0
# Line 194  C-        Empty diagnostics case : Line 329  C-        Empty diagnostics case :
329            ELSE            ELSE
330  C-        diagnostics is not empty :  C-        diagnostics is not empty :
331    
332              IF ( myThid.EQ.1 )              IF ( debugLevel.GE.debLevA .AND. myThid.EQ.1 ) THEN
333       &             WRITE(ioUnit,2000) m,cdiag(m),ndiag(m),gdiag(m)                WRITE(ioUnit,'(A,I6,3A,I8,2A)')
334         &         ' Computing Diagnostic # ', ndId, '  ', cdiag(ndId),
335              IF ( parms1(5:5).EQ.'C' ) THEN       &         '     Counter:',ndiag(ip,1,1),'   Parms: ',gdiag(ndId)
336  C             Check for Mate of a Counter Diagnostic                IF ( mate.GT.0 ) THEN
337  C             --------------------------------------                 WRITE(ioUnit,'(3A,I6,2A)')
338                mate_index = parms1(6:8)       &         '       use Counter Mate for  ', cdiag(ndId),
339                READ (mate_index,'(I3)') mate       &         '     Diagnostic # ',mate, '  ', cdiag(mate)
340                IF ( myThid.EQ.1 )                ELSEIF ( mVec.GT.0 ) THEN
341       &                 WRITE(ioUnit,2003) cdiag(m),mate,cdiag(mate)                  IF ( im.GT.0 .AND. ndiag(MAX(1,im),1,1).GT.0 ) THEN
342              ELSE                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
343                mate = 0       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
344         &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
345  C             Check for Mate of a Vector Diagnostic       &             ' exists '
 C             -------------------------------------  
               IF ( parms1(1:1).EQ.'U' .OR. parms1(1:1).EQ.'V' ) THEN  
                 mate_index = parms1(6:8)  
                 READ (mate_index,'(I3)') mVec  
                 IF ( idiag(mVec).NE.0 ) THEN  
                   IF ( myThid.EQ.1 )  
      &                 WRITE(ioUnit,2001) cdiag(m),mVec,cdiag(mVec)  
346                  ELSE                  ELSE
347                    IF ( myThid.EQ.1 )                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
348       &                 WRITE(ioUnit,2002) cdiag(m),mVec,cdiag(mVec)       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
349         &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
350         &             ' not enabled'
351                  ENDIF                  ENDIF
352                ENDIF                ENDIF
353              ENDIF              ENDIF
354    
355              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'P' ) THEN
356               DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  C-       get all the levels (for vertical interpolation)
357                DO k = 1,nlevels(listnum)                DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
358                  CALL GETDIAG(                 DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
359       I                       levs(k,listnum),undef,                  DO k = 1,kdiag(ndId)
360       O                       qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),                    tmpLev = k
361       I                       m,mate,bi,bj,myThid)                    CALL GETDIAG(
362         I                         tmpLev,undef,
363         O                         qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),
364         I                         ndId,mate,ip,im,bi,bj,myThid)
365                    ENDDO
366                   ENDDO
367                ENDDO                ENDDO
368               ENDDO              ELSE
369              ENDDO  C-       get only selected levels:
370                  DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
371                   DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
372                    DO k = 1,nlevels(listId)
373                      CALL GETDIAG(
374         I                         levs(k,listId),undef,
375         O                         qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),
376         I                         ndId,mate,ip,im,bi,bj,myThid)
377                    ENDDO
378                   ENDDO
379                  ENDDO
380                ENDIF
381    
382  C-        end of empty diag / not empty block  C-        end of empty diag / not empty block
383            ENDIF            ENDIF
384    
385  #ifdef ALLOW_MDSIO  C-----------------------------------------------------------------------
386  C         Prepare for mdsio optionality  C         Check to see if we need to interpolate before output
387            IF (diag_mdsio) THEN  C-----------------------------------------------------------------------
388              CALL mdswritefield_new(fn,writeBinaryPrec,glf,'RL',            IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'P' ) THEN
389       &           Nr+Nrphys,nlevels(listnum),qtmp1,n,myIter,myThid)  C-        Do vertical interpolation:
390               IF ( fluidIsAir ) THEN
391    C jmc: for now, this can only work in an atmospheric set-up (fluidIsAir);
392                CALL DIAGNOSTICS_INTERP_VERT(
393         I                     listId, md, ndId, ip, im, lm,
394         U                     qtmp1,
395         I                     undef, myTime, myIter, myThid )
396               ELSE
397                 WRITE(msgBuf,'(2A)') 'DIAGNOSTICS_OUT: ',
398         &         'INTERP_VERT not allowed in this config'
399                 CALL PRINT_ERROR( msgBuf , myThid )
400                 STOP 'ABNORMAL END: S/R DIAGNOSTICS_OUT'
401               ENDIF
402              ENDIF
403    
404    C--    Ready to write field "md", element "lm" in averageCycle(listId)
405    
406    C-        write to binary file, using MDSIO pkg:
407              IF ( diag_mdsio ) THEN
408                nRec = lm + (md-1)*averageCycle(listId)
409    C           default precision for output files
410                prec = writeBinaryPrec
411    C           fFlag(1)=R(or D): force it to be 32-bit(or 64) precision
412                IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'R' ) prec = precFloat32
413                IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'D' ) prec = precFloat64
414    C         a hack not to write meta files now: pass -nRec < 0 to MDS_WRITE S/R
415                CALL WRITE_REC_LEV_RL(
416         I                            fn, prec,
417         I                            NrMax, 1, nlevels(listId),
418         I                            qtmp1, -nRec, myIter, myThid )
419            ENDIF            ENDIF
 #endif /*  ALLOW_MDSIO  */  
420    
421  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
422            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
# Line 259  C           subtlety within MNC.  Basica Line 433  C           subtlety within MNC.  Basica
433  C           caching its own concept of what each "grid name" (that is, a  C           caching its own concept of what each "grid name" (that is, a
434  C           dimension group name) means.  So one cannot re-use the same  C           dimension group name) means.  So one cannot re-use the same
435  C           "grid" name for different collections of dimensions within a  C           "grid" name for different collections of dimensions within a
436  C           given file.  By appending the "m" values to each name, we  C           given file.  By appending the "ndId" values to each name, we
437  C           guarantee uniqueness within each MNC-produced file.  C           guarantee uniqueness within each MNC-produced file.
438              WRITE(d_cw_name,'(a,i6.6)') 'd_cw_',m              WRITE(d_cw_name,'(a,i6.6)') 'd_cw_',ndId
439    
440  C           XY dimensions  C           XY dimensions
441              dim(1)       = sNx + 2*OLx              dim(1)       = sNx + 2*OLx
442              dim(2)       = sNy + 2*OLy              dim(2)       = sNy + 2*OLy
443              ib(1)        = OLx + 1              ib(1)        = OLx + 1
444              ib(2)        = OLy + 1              ib(2)        = OLy + 1
445              IF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'M') THEN              IF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'M') THEN
446                dn(1)(1:2) = 'X'                dn(1)(1:2) = 'X'
447                ie(1)      = OLx + sNx                ie(1)      = OLx + sNx
448                dn(2)(1:2) = 'Y'                dn(2)(1:2) = 'Y'
449                ie(2)      = OLy + sNy                ie(2)      = OLy + sNy
450              ELSEIF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'U') THEN              ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'U') THEN
451                dn(1)(1:3) = 'Xp1'                dn(1)(1:3) = 'Xp1'
452                ie(1)      = OLx + sNx + 1                ie(1)      = OLx + sNx + 1
453                dn(2)(1:2) = 'Y'                dn(2)(1:2) = 'Y'
454                ie(2)      = OLy + sNy                ie(2)      = OLy + sNy
455              ELSEIF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'V') THEN              ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'V') THEN
456                dn(1)(1:2) = 'X'                dn(1)(1:2) = 'X'
457                ie(1)      = OLx + sNx                ie(1)      = OLx + sNx
458                dn(2)(1:3) = 'Yp1'                dn(2)(1:3) = 'Yp1'
459                ie(2)      = OLy + sNy + 1                ie(2)      = OLy + sNy + 1
460              ELSEIF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'Z') THEN              ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'Z') THEN
461                dn(1)(1:3) = 'Xp1'                dn(1)(1:3) = 'Xp1'
462                ie(1)      = OLx + sNx + 1                ie(1)      = OLx + sNx + 1
463                dn(2)(1:3) = 'Yp1'                dn(2)(1:3) = 'Yp1'
464                ie(2)      = OLy + sNy + 1                ie(2)      = OLy + sNy + 1
465              ENDIF              ENDIF
466                
467  C           Z is special since it varies  C           Z is special since it varies
468              WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zd', nlevels(listnum)              WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zd', nlevels(listId)
469              IF ( (gdiag(m)(10:10) .EQ. 'R')              IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')
470       &           .AND. (gdiag(m)(9:9) .EQ. 'M') ) THEN       &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'M') ) THEN
471                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listnum)                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)
472              ENDIF              ENDIF
473              IF ( (gdiag(m)(10:10) .EQ. 'R')              IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')
474       &           .AND. (gdiag(m)(9:9) .EQ. 'L') ) THEN       &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'L') ) THEN
475                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zld', nlevels(listnum)                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zld', nlevels(listId)
476              ENDIF              ENDIF
477              IF ( (gdiag(m)(10:10) .EQ. 'R')              IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')
478       &           .AND. (gdiag(m)(9:9) .EQ. 'U') ) THEN       &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'U') ) THEN
479                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zud', nlevels(listnum)                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zud', nlevels(listId)
480              ENDIF              ENDIF
481              dim(3) = Nr+Nrphys              dim(3) = NrMax
482              ib(3)  = 1              ib(3)  = 1
483              ie(3)  = nlevels(listnum)              ie(3)  = nlevels(listId)
484    
485  C           Time dimension  C           Time dimension
486              dn(4)(1:1) = 'T'              dn(4)(1:1) = 'T'
# Line 314  C           Time dimension Line 488  C           Time dimension
488              ib(4)  = 1              ib(4)  = 1
489              ie(4)  = 1              ie(4)  = 1
490    
491              CALL MNC_CW_ADD_GNAME(d_cw_name, 4,              CALL MNC_CW_ADD_GNAME(d_cw_name, 4,
492       &             dim, dn, ib, ie, myThid)       &             dim, dn, ib, ie, myThid)
493              CALL MNC_CW_ADD_VNAME(cdiag(m), d_cw_name,              CALL MNC_CW_ADD_VNAME(cdiag(ndId), d_cw_name,
494       &             4,5, myThid)       &             4,5, myThid)
495              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(m),'description',              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'description',
496       &             tdiag(m),myThid)       &             tdiag(ndId),myThid)
497              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(m),'units',              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'units',
498       &             udiag(m),myThid)       &             udiag(ndId),myThid)
499    
500    C     Missing values only for scalar diagnostics at mass points (so far)
501                useMisValForThisDiag = useMissingValue
502         &           .AND.gdiag(ndId)(1:2).EQ.'SM'
503                IF ( useMisValForThisDiag ) THEN
504    C     assign missing values and set flag for adding the netCDF atttibute
505                 CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(cdiag(ndId), 2,
506         I            misval_r8, misval_r4, misval_int,
507         I            myThid )
508    C     and now use the missing values for masking out the land points
509                 DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
510                  DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
511                   DO k = 1,nlevels(listId)
512                    klev = NINT(levs(k,listId))
513                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy
514                     DO i = 1-OLx,sNx+OLx
515                      IF ( maskC(i,j,klev,bi,bj) .EQ. 0. )
516         &                 qtmp1(i,j,k,bi,bj) = misvalLoc
517                     ENDDO
518                    ENDDO
519                   ENDDO
520                  ENDDO
521                 ENDDO
522                ELSE
523    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
524    C     Note: We have to call the following subroutine for each mnc that has
525    C     been created "on the fly" by mnc_cw_add_vname and will be deleted
526    C     by mnc_cw_del_vname, because all of these variables use the same
527    C     identifier so that mnc_cw_vfmv(indv) needs to be overwritten for
528    C     each of these variables
529                 CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(cdiag(ndId), 0,
530         I            misval_r8, misval_r4, misval_int,
531         I            myThid )
532                ENDIF
533    
534              CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,              IF (  ((writeBinaryPrec .EQ. precFloat32)
535       &             cdiag(m), qtmp1, myThid)       &            .AND. (fflags(listId)(1:1) .NE. 'D'))
536         &             .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'R') ) THEN
537                  CALL MNC_CW_RL_W('R',diag_mnc_bn,0,0,
538         &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)
539                ELSEIF ( (writeBinaryPrec .EQ. precFloat64)
540         &             .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'D') ) THEN
541                  CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,
542         &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)
543                ENDIF
544    
545              CALL MNC_CW_DEL_VNAME(cdiag(m), myThid)              CALL MNC_CW_DEL_VNAME(cdiag(ndId), myThid)
546              CALL MNC_CW_DEL_GNAME(d_cw_name, myThid)              CALL MNC_CW_DEL_GNAME(d_cw_name, myThid)
547    
548              _END_MASTER( myThid )              _END_MASTER( myThid )
# Line 334  C           Time dimension Line 550  C           Time dimension
550            ENDIF            ENDIF
551  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
552    
553  C--     end of Processing Fld # n  C--      end loop on lm (or ll if ALLOW_MNC) counter
554             ENDDO
555    C--     end of Processing Fld # md
556          ENDIF          ENDIF
557           ENDDO
558    
559    #ifdef ALLOW_MNC
560    C--   end loop on jj counter
561        ENDDO        ENDDO
562    #endif
563    
564    #ifdef ALLOW_MDSIO
565          IF (diag_mdsio) THEN
566    C-    Note: temporary: since it's a pain to add more arguments to
567    C     all MDSIO S/R, uses instead this specific S/R to write only
568    C     meta files but with more informations in it.
569                glf = globalFiles
570                nRec = nfields(listId)*averageCycle(listId)
571                timeRec(1) = myTime
572                CALL MDS_WR_METAFILES(fn, prec, glf, .FALSE.,
573         &              0, 0, nlevels(listId), ' ',
574         &              nfields(listId), flds(1,listId), 1, timeRec,
575         &              nRec, myIter, myThid)
576          ENDIF
577    #endif /*  ALLOW_MDSIO  */
578    
579   2000 format(1x,'Computing Diagnostic # ',i3,2x,a8,5x,'Counter: ',        RETURN
      &     i4,6x,'Parms: ',a16)  
  2001 format(1x,'          Vector  Mate for  ',a8,5x,  
      &     'Diagnostic # ',i3,2x,a8,' exists ')  
  2002 format(1x,'        Vector  Mate for  ',a8,5x,  
      &     'Diagnostic # ',i3,2x,a8,' not enabled')  
  2003 format(1x,'      use Counter Mate for  ',a8,5x,  
      &     'Diagnostic # ',i3,2x,a8)  
         
       RETURN  
580        END        END
581                                                                        
582  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
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