/[MITgcm]/MITgcm/pkg/diagnostics/diagnostics_out.F
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revision 1.7 by edhill, Tue Feb 8 20:39:58 2005 UTC revision 1.41 by jmc, Sun Jan 25 20:22:57 2009 UTC
# Line 9  C     !ROUTINE: DIAGNOSTICS_OUT Line 9  C     !ROUTINE: DIAGNOSTICS_OUT
9    
10  C     !INTERFACE:  C     !INTERFACE:
11        SUBROUTINE  DIAGNOSTICS_OUT(        SUBROUTINE  DIAGNOSTICS_OUT(
12       I     listnum,       I     listId,
13       I     myIter,       I     myIter,
14         I     myTime,
15       I     myThid )       I     myThid )
16    
17  C     !DESCRIPTION:  C     !DESCRIPTION:
18  C     Write output for diagnostics fields.  C     Write output for diagnostics fields.
19          
20  C     !USES:  C     !USES:
21        IMPLICIT NONE        IMPLICIT NONE
22  #include "SIZE.h"  #include "SIZE.h"
# Line 25  C     !USES: Line 26  C     !USES:
26  #include "DIAGNOSTICS_SIZE.h"  #include "DIAGNOSTICS_SIZE.h"
27  #include "DIAGNOSTICS.h"  #include "DIAGNOSTICS.h"
28    
29  #ifdef ALLOW_FIZHI        INTEGER NrMax
30  #include "fizhi_SIZE.h"        PARAMETER( NrMax = numLevels )
 #else  
       INTEGER Nrphys  
       PARAMETER (Nrphys=0)  
 #endif  
   
31    
32  C     !INPUT PARAMETERS:  C     !INPUT PARAMETERS:
33  C     listnum :: Diagnostics list number being written  C     listId  :: Diagnostics list number being written
34  C     myIter  :: current iteration number  C     myIter  :: current iteration number
35    C     myTime  :: current time of simulation (s)
36  C     myThid  :: my Thread Id number  C     myThid  :: my Thread Id number
37        INTEGER listnum, myIter, myThid        _RL     myTime
38          INTEGER listId, myIter, myThid
39  CEOP  CEOP
40    
41  C     !LOCAL VARIABLES:  C     !FUNCTIONS:
       INTEGER i, j, k, m, n, bi, bj  
       CHARACTER*8 parms1  
       CHARACTER*3 mate_index  
       INTEGER mate, mVec  
       _RL qtmp1(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr+Nrphys,nSx,nSy)  
       _RL undef, getcon  
       EXTERNAL getcon  
42        INTEGER ILNBLNK        INTEGER ILNBLNK
43        EXTERNAL ILNBLNK        EXTERNAL ILNBLNK
44    #ifdef ALLOW_FIZHI
45          _RL   getcon
46          EXTERNAL getcon
47    #endif
48    
49    C     !LOCAL VARIABLES:
50    C     i,j,k :: loop indices
51    C     lm    :: loop index (averageCycle)
52    C     md    :: field number in the list "listId".
53    C     ndId  :: diagnostics  Id number (in available diagnostics list)
54    C     mate  :: counter mate Id number (in available diagnostics list)
55    C     ip    :: diagnostics  pointer to storage array
56    C     im    :: counter-mate pointer to storage array
57    C
58    C--   COMMON /LOCAL_DIAGNOSTICS_OUT/ local common block (for multi-threaded)
59    C     qtmp1 :: thread-shared temporary array (needs to be in common block):
60    C              to write a diagnostic field to file, copy it first from (big)
61    C              diagnostic storage qdiag into it.
62          COMMON /LOCAL_DIAGNOSTICS_OUT/ qtmp1
63          _RL qtmp1(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,NrMax,nSx,nSy)
64    
65          INTEGER i, j, k, lm, klev
66          INTEGER bi, bj
67          INTEGER md, ndId, ip, im
68          INTEGER mate, mVec
69          CHARACTER*10 gcode
70          _RL undef
71          _RL tmpLev
72        INTEGER ilen        INTEGER ilen
73    
74        INTEGER ioUnit        INTEGER ioUnit
75        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) pref        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) fn
76        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff
77        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf
78        CHARACTER*(80) fn        INTEGER prec, nRec
79    #ifdef ALLOW_MDSIO
80        LOGICAL glf        LOGICAL glf
81    #endif
82  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
83          INTEGER ll, llMx, jj, jjMx
84        INTEGER ii        INTEGER ii
85        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn
       CHARACTER*(5) ctmp  
86        INTEGER CW_DIMS, NLEN        INTEGER CW_DIMS, NLEN
87        PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )        PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )
88        PARAMETER ( NLEN    = 80 )        PARAMETER ( NLEN    = 80 )
# Line 69  C     !LOCAL VARIABLES: Line 90  C     !LOCAL VARIABLES:
90        CHARACTER*(NLEN) dn(CW_DIMS)        CHARACTER*(NLEN) dn(CW_DIMS)
91        CHARACTER*(NLEN) d_cw_name        CHARACTER*(NLEN) d_cw_name
92        CHARACTER*(NLEN) dn_blnk        CHARACTER*(NLEN) dn_blnk
93        _RS ztmp(Nr+Nrphys)  #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK
94          CHARACTER*(5) ctmp
95          _RS ztmp(NrMax)
96    #endif
97          LOGICAL useMissingValue, useMisValForThisDiag
98          REAL*8 misvalLoc
99          REAL*8 misval_r8(2)
100          REAL*4 misval_r4(2)
101          INTEGER misvalIntLoc, misval_int(2)
102  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
103    
104  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
105    
106        ioUnit= standardMessageUnit        ioUnit= standardMessageUnit
107          undef = UNSET_RL
108    #ifdef ALLOW_FIZHI
109    c     IF ( useFIZHI ) undef = getcon('UNDEF')
110        undef = getcon('UNDEF')        undef = getcon('UNDEF')
111        glf = globalFiles  #endif
112        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter
113        pref = fnames(listnum)        ilen = ILNBLNK(fnames(listId))
114        ilen=ILNBLNK( pref )        WRITE( fn, '(A,A,A)' ) fnames(listId)(1:ilen),'.',suff(1:10)
       WRITE( fn, '(A,A,A)' ) pref(1:ilen),'.',suff(1:10)  
115    
116  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
117    C-- this is a trick to reverse the order of the loops on md (= field)
118    C   and lm (= averagePeriod): binary output: lm loop inside md loop ;
119    C                                 mnc ouput: md loop inside lm loop.
120        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
121          DO i = 1,MAX_LEN_FNAM          jjMx = averageCycle(listId)
122            diag_mnc_bn(i:i) = ' '          llMx = 1
123          ENDDO        ELSE
124          DO i = 1,NLEN          jjMx = 1
125            dn_blnk(i:i) = ' '          llMx = averageCycle(listId)
126          ENDDO        ENDIF
127  c       WRITE( diag_mnc_bn, '(A,A)' ) 'diag.', pref(1:ilen)        DO jj=1,jjMx
         WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) pref(1:ilen)  
128    
129  C       Update the record dimension by writing the iteration number         IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
130          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)  C     Handle missing value attribute (land points)
131          CALL MNC_CW_I_W_S('I',diag_mnc_bn,0,0,'T',myIter,myThid)           useMissingValue = .FALSE.
132          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)  #ifdef DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE
133             useMissingValue = .TRUE.
134          dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)  #endif /* DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE */
135          WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listnum)           IF ( misvalFlt(listId) .NE. UNSET_RL ) THEN
136          dim(1) = nlevels(listnum)            misvalLoc = misvalFlt(listId)
137          ib(1)  = 1           ELSE
138          ie(1)  = nlevels(listnum)            misvalLoc = undef
139             ENDIF
140          CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,  C     Defaults to UNSET_I
141       &       dim, dn, ib, ie, myThid)           misvalIntLoc = misvalInt(listId)
142          CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',           DO ii=1,2
143       &       0,0, myThid)  C         misval_r4(ii)  = UNSET_FLOAT4
144          CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',  C         misval_r8(ii)  = UNSET_FLOAT8
145       &       'Idicies of vertical levels within the source arrays',            misval_r4(ii)  = misvalLoc
146       &       myThid)            misval_r8(ii)  = misvalLoc
147                      misval_int(ii) = UNSET_I
148          CALL MNC_CW_RL_W('I',diag_mnc_bn,0,0,           ENDDO
149       &       'diag_levels', levs(1,listnum), myThid)           DO i = 1,MAX_LEN_FNAM
150               diag_mnc_bn(i:i) = ' '
151             ENDDO
152             DO i = 1,NLEN
153               dn_blnk(i:i) = ' '
154             ENDDO
155             WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) fnames(listId)(1:ilen)
156    
157          CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)  C       Update the record dimension by writing the iteration number
158          CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)           klev = myIter + jj - jjMx
159             tmpLev = myTime + deltaTClock*(jj -jjMx)
160             CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)
161             CALL MNC_CW_RL_W_S('D',diag_mnc_bn,0,0,'T',tmpLev,myThid)
162             CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)
163             CALL MNC_CW_I_W_S('I',diag_mnc_bn,0,0,'iter',klev,myThid)
164    
165    C       NOTE: at some point it would be a good idea to add a time_bounds
166    C       variable that has dimension (2,T) and clearly denotes the
167    C       beginning and ending times for each diagnostics period
168    
169             dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)
170             WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)
171             dim(1) = nlevels(listId)
172             ib(1)  = 1
173             ie(1)  = nlevels(listId)
174    
175             CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,
176         &        dim, dn, ib, ie, myThid)
177             CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',
178         &        0,0, myThid)
179             CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',
180         &        'Idicies of vertical levels within the source arrays',
181         &        myThid)
182    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
183             IF (useMissingValue)
184         &       CALL MNC_CW_VATTR_MISSING('diag_levels', 0,
185         I       misval_r8, misval_r4, misval_int,
186         I       myThid )
187    
188             CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,
189         &        'diag_levels', levs(1,listId), myThid)
190    
191             CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)
192             CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)
193    
194    #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK
195    C       This part has been placed in an #ifdef because, as its currently
196    C       written, it will only work with variables defined on a dynamics
197    C       grid.  As we start using diagnostics for physics grids, ice
198    C       levels, land levels, etc. the different vertical coordinate
199    C       dimensions will have to be taken into account.
200    
201    C       20051021 JMC & EH3 : We need to extend this so that a few
202    C       variables each defined on different grids do not have the same
203    C       vertical dimension names so we should be using a pattern such
204    C       as: Z[uml]td000000 where the 't' is the type as specified by
205    C       gdiag(10)
206    
207  C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx  C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx
208          ctmp(1:5) = 'mul  '           ctmp(1:5) = 'mul  '
209          DO i = 1,3           DO i = 1,3
210            dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)             dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)
211            WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listnum)             WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listId)
212            CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)             CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)
213            CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)             CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)
214            DO j = 1,nlevels(listnum)  
215              IF (i .EQ. 1) THEN  C         The following three ztmp() loops should eventually be modified
216                ztmp(j) = rC(levs(j,listnum))  C         to reflect the fractional nature of levs(j,l) -- they should
217                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',  C         do something like:
218       &             'Dimensional coordinate value at the mid point',  C            ztmp(j) = rC(INT(FLOOR(levs(j,l))))
219       &             myThid)  C                      + ( rC(INT(FLOOR(levs(j,l))))
220              ELSEIF (i .EQ. 2) THEN  C                          + rC(INT(CEIL(levs(j,l)))) )
221                ztmp(j) = rF(levs(j,listnum))  C                        / ( levs(j,l) - FLOOR(levs(j,l)) )
222                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',  C         for averaged levels.
223       &             'Dimensional coordinate value at the upper point',             IF (i .EQ. 1) THEN
224       &             myThid)               DO j = 1,nlevels(listId)
225              ELSEIF (i .EQ. 3) THEN                 ztmp(j) = rC(NINT(levs(j,listId)))
226                ztmp(j) = rF(levs(j,listnum) + 1)               ENDDO
227                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',               CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
228       &             'Dimensional coordinate value at the lower point',       &            'Dimensional coordinate value at the mid point',
229       &             myThid)       &            myThid)
230              ENDIF             ELSEIF (i .EQ. 2) THEN
231            ENDDO               DO j = 1,nlevels(listId)
232            CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)                 ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)) + 1)
233            CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)               ENDDO
234            CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)               CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
235          ENDDO       &            'Dimensional coordinate value at the upper point',
236         &            myThid)
237               ELSEIF (i .EQ. 3) THEN
238                 DO j = 1,nlevels(listId)
239                   ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)))
240                 ENDDO
241                 CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
242         &            'Dimensional coordinate value at the lower point',
243         &            myThid)
244               ENDIF
245    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
246               IF (useMissingValue)
247         &          CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(dn(1), 0,
248         I          misval_r8, misval_r4, misval_int,
249         I          myThid )
250               CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)
251               CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)
252               CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)
253             ENDDO
254    #endif /*  DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  */
255    
256        ENDIF         ENDIF
257  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
258    
259        DO n = 1,nfields(listnum)  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
260          m = jdiag(n,listnum)  
261          parms1 = gdiag(m)(1:8)         DO md = 1,nfields(listId)
262          IF ( idiag(m).NE.0 .AND. parms1(5:5).NE.'D' ) THEN          ndId = jdiag(md,listId)
263            gcode = gdiag(ndId)(1:10)
264            mate = 0
265            mVec = 0
266            IF ( gcode(5:5).EQ.'C' ) THEN
267    C-      Check for Mate of a Counter Diagnostic
268               mate = hdiag(ndId)
269            ELSEIF ( gcode(1:1).EQ.'U' .OR. gcode(1:1).EQ.'V' ) THEN
270    C-      Check for Mate of a Vector Diagnostic
271               mVec = hdiag(ndId)
272            ENDIF
273            IF ( idiag(md,listId).NE.0 .AND. gcode(5:5).NE.'D' ) THEN
274  C--     Start processing 1 Fld :  C--     Start processing 1 Fld :
275    #ifdef ALLOW_MNC
276             DO ll=1,llMx
277              lm = jj+ll-1
278    #else
279             DO lm=1,averageCycle(listId)
280    #endif
281    
282            IF ( ndiag(m).EQ.0 ) THEN            ip = ABS(idiag(md,listId)) + kdiag(ndId)*(lm-1)
283              im = mdiag(md,listId)
284              IF (mate.GT.0) im = im + kdiag(mate)*(lm-1)
285              IF (mVec.GT.0) im = im + kdiag(mVec)*(lm-1)
286    
287              IF ( ndiag(ip,1,1).EQ.0 ) THEN
288  C-        Empty diagnostics case :  C-        Empty diagnostics case :
289    
290              _BEGIN_MASTER( myThid )              _BEGIN_MASTER( myThid )
291              WRITE(msgBuf,'(A,I10)')              WRITE(msgBuf,'(A,I10)')
292       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter
293              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
294       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
295              WRITE(msgBuf,'(A,I4,3A,I3,2A)')              WRITE(msgBuf,'(A,I6,3A,I4,2A)')
296       &       '- WARNING -   diag.#',m, ' : ',flds(n,listnum),       &       '- WARNING -   diag.#',ndId, ' : ',flds(md,listId),
297       &       ' (#',n,' ) in outp.Stream: ',fnames(listnum)       &       ' (#',md,' ) in outp.Stream: ',fnames(listId)
298              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
299       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
300              WRITE(msgBuf,'(A,I2,A)')              IF ( averageCycle(listId).GT.1 ) THEN
301       &       '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',ndiag(m),' )'               WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
302              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag(lm=',lm,')=',
303         &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
304                ELSE
305                 WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
306         &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',
307         &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
308                ENDIF
309                CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
310       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
311              WRITE(msgBuf,'(A)')              WRITE(msgBuf,'(A)')
312       &       'WARNING DIAGNOSTICS_OUT  => write ZEROS instead'       &       'WARNING DIAGNOSTICS_OUT  => write ZEROS instead'
313              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
314       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
315              _END_MASTER( myThid )              _END_MASTER( myThid )
316              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
317                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
318                  DO k = 1,nlevels(listnum)                  DO k = 1,nlevels(listId)
319                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy
320                      DO i = 1-OLx,sNx+OLx                      DO i = 1-OLx,sNx+OLx
321                        qtmp1(i,j,k,bi,bj) = 0. _d 0                        qtmp1(i,j,k,bi,bj) = 0. _d 0
# Line 194  C-        Empty diagnostics case : Line 328  C-        Empty diagnostics case :
328            ELSE            ELSE
329  C-        diagnostics is not empty :  C-        diagnostics is not empty :
330    
331              IF ( myThid.EQ.1 )              IF ( debugLevel.GE.debLevA .AND. myThid.EQ.1 ) THEN
332       &             WRITE(ioUnit,2000) m,cdiag(m),ndiag(m),gdiag(m)                WRITE(ioUnit,'(A,I6,3A,I8,2A)')
333         &         ' Computing Diagnostic # ', ndId, '  ', cdiag(ndId),
334              IF ( parms1(5:5).EQ.'C' ) THEN       &         '     Counter:',ndiag(ip,1,1),'   Parms: ',gdiag(ndId)
335  C             Check for Mate of a Counter Diagnostic                IF ( mate.GT.0 ) THEN
336  C             --------------------------------------                 WRITE(ioUnit,'(3A,I6,2A)')
337                mate_index = parms1(6:8)       &         '       use Counter Mate for  ', cdiag(ndId),
338                READ (mate_index,'(I3)') mate       &         '     Diagnostic # ',mate, '  ', cdiag(mate)
339                IF ( myThid.EQ.1 )                ELSEIF ( mVec.GT.0 ) THEN
340       &                 WRITE(ioUnit,2003) cdiag(m),mate,cdiag(mate)                  IF ( im.GT.0 .AND. ndiag(MAX(1,im),1,1).GT.0 ) THEN
341              ELSE                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
342                mate = 0       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
343         &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
344  C             Check for Mate of a Vector Diagnostic       &             ' exists '
 C             -------------------------------------  
               IF ( parms1(1:1).EQ.'U' .OR. parms1(1:1).EQ.'V' ) THEN  
                 mate_index = parms1(6:8)  
                 READ (mate_index,'(I3)') mVec  
                 IF ( idiag(mVec).NE.0 ) THEN  
                   IF ( myThid.EQ.1 )  
      &                 WRITE(ioUnit,2001) cdiag(m),mVec,cdiag(mVec)  
345                  ELSE                  ELSE
346                    IF ( myThid.EQ.1 )                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
347       &                 WRITE(ioUnit,2002) cdiag(m),mVec,cdiag(mVec)       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
348         &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
349         &             ' not enabled'
350                  ENDIF                  ENDIF
351                ENDIF                ENDIF
352              ENDIF              ENDIF
353    
354              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'P' ) THEN
355               DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  C-       get all the levels (for vertical interpolation)
356                DO k = 1,nlevels(listnum)                DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
357                  CALL GETDIAG(                 DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
358       I                       levs(k,listnum),undef,                  DO k = 1,kdiag(ndId)
359       O                       qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),                    tmpLev = k
360       I                       m,mate,bi,bj,myThid)                    CALL GETDIAG(
361         I                         tmpLev,undef,
362         O                         qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),
363         I                         ndId,mate,ip,im,bi,bj,myThid)
364                    ENDDO
365                   ENDDO
366                ENDDO                ENDDO
367               ENDDO              ELSE
368              ENDDO  C-       get only selected levels:
369                  DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
370                   DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
371                    DO k = 1,nlevels(listId)
372                      CALL GETDIAG(
373         I                         levs(k,listId),undef,
374         O                         qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),
375         I                         ndId,mate,ip,im,bi,bj,myThid)
376                    ENDDO
377                   ENDDO
378                  ENDDO
379                ENDIF
380    
381  C-        end of empty diag / not empty block  C-        end of empty diag / not empty block
382            ENDIF            ENDIF
383    
384  #ifdef ALLOW_MDSIO  C-----------------------------------------------------------------------
385  C         Prepare for mdsio optionality  C         Check to see if we need to interpolate before output
386            IF (diag_mdsio) THEN  C-----------------------------------------------------------------------
387              CALL mdswritefield_new(fn,writeBinaryPrec,glf,'RL',            IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'P' ) THEN
388       &           Nr+Nrphys,nlevels(listnum),qtmp1,n,myIter,myThid)  C-        Do vertical interpolation:
389               IF ( fluidIsAir ) THEN
390    C jmc: for now, this can only work in an atmospheric set-up (fluidIsAir);
391                CALL DIAGNOSTICS_INTERP_VERT(
392         I                     listId, md, ndId, ip, im, lm,
393         U                     qtmp1,
394         I                     undef, myTime, myIter, myThid )
395               ELSE
396                 WRITE(msgBuf,'(2A)') 'DIAGNOSTICS_OUT: ',
397         &         'INTERP_VERT not allowed in this config'
398                 CALL PRINT_ERROR( msgBuf , myThid )
399                 STOP 'ABNORMAL END: S/R DIAGNOSTICS_OUT'
400               ENDIF
401              ENDIF
402    
403    C--    Ready to write field "md", element "lm" in averageCycle(listId)
404    
405    C-        write to binary file, using MDSIO pkg:
406              IF ( diag_mdsio ) THEN
407                nRec = lm + (md-1)*averageCycle(listId)
408    C           default precision for output files
409                prec = writeBinaryPrec
410    C           fFlag(1)=R(or D): force it to be 32-bit(or 64) precision
411                IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'R' ) prec = precFloat32
412                IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'D' ) prec = precFloat64
413    C         a hack not to write meta files now: pass -nRec < 0 to MDS_WRITE S/R
414                CALL WRITE_REC_LEV_RL(
415         I                            fn, prec,
416         I                            NrMax, 1, nlevels(listId),
417         I                            qtmp1, -nRec, myIter, myThid )
418            ENDIF            ENDIF
 #endif /*  ALLOW_MDSIO  */  
419    
420  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
421            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
# Line 259  C           subtlety within MNC.  Basica Line 432  C           subtlety within MNC.  Basica
432  C           caching its own concept of what each "grid name" (that is, a  C           caching its own concept of what each "grid name" (that is, a
433  C           dimension group name) means.  So one cannot re-use the same  C           dimension group name) means.  So one cannot re-use the same
434  C           "grid" name for different collections of dimensions within a  C           "grid" name for different collections of dimensions within a
435  C           given file.  By appending the "m" values to each name, we  C           given file.  By appending the "ndId" values to each name, we
436  C           guarantee uniqueness within each MNC-produced file.  C           guarantee uniqueness within each MNC-produced file.
437              WRITE(d_cw_name,'(a,i6.6)') 'd_cw_',m              WRITE(d_cw_name,'(a,i6.6)') 'd_cw_',ndId
438    
439  C           XY dimensions  C           XY dimensions
440              dim(1)       = sNx + 2*OLx              dim(1)       = sNx + 2*OLx
441              dim(2)       = sNy + 2*OLy              dim(2)       = sNy + 2*OLy
442              ib(1)        = OLx + 1              ib(1)        = OLx + 1
443              ib(2)        = OLy + 1              ib(2)        = OLy + 1
444              IF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'M') THEN              IF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'M') THEN
445                dn(1)(1:2) = 'X'                dn(1)(1:2) = 'X'
446                ie(1)      = OLx + sNx                ie(1)      = OLx + sNx
447                dn(2)(1:2) = 'Y'                dn(2)(1:2) = 'Y'
448                ie(2)      = OLy + sNy                ie(2)      = OLy + sNy
449              ELSEIF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'U') THEN              ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'U') THEN
450                dn(1)(1:3) = 'Xp1'                dn(1)(1:3) = 'Xp1'
451                ie(1)      = OLx + sNx + 1                ie(1)      = OLx + sNx + 1
452                dn(2)(1:2) = 'Y'                dn(2)(1:2) = 'Y'
453                ie(2)      = OLy + sNy                ie(2)      = OLy + sNy
454              ELSEIF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'V') THEN              ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'V') THEN
455                dn(1)(1:2) = 'X'                dn(1)(1:2) = 'X'
456                ie(1)      = OLx + sNx                ie(1)      = OLx + sNx
457                dn(2)(1:3) = 'Yp1'                dn(2)(1:3) = 'Yp1'
458                ie(2)      = OLy + sNy + 1                ie(2)      = OLy + sNy + 1
459              ELSEIF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'Z') THEN              ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'Z') THEN
460                dn(1)(1:3) = 'Xp1'                dn(1)(1:3) = 'Xp1'
461                ie(1)      = OLx + sNx + 1                ie(1)      = OLx + sNx + 1
462                dn(2)(1:3) = 'Yp1'                dn(2)(1:3) = 'Yp1'
463                ie(2)      = OLy + sNy + 1                ie(2)      = OLy + sNy + 1
464              ENDIF              ENDIF
465                
466  C           Z is special since it varies  C           Z is special since it varies
467              WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zd', nlevels(listnum)              WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zd', nlevels(listId)
468              IF ( (gdiag(m)(10:10) .EQ. 'R')              IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')
469       &           .AND. (gdiag(m)(9:9) .EQ. 'M') ) THEN       &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'M') ) THEN
470                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listnum)                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)
471              ENDIF              ENDIF
472              IF ( (gdiag(m)(10:10) .EQ. 'R')              IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')
473       &           .AND. (gdiag(m)(9:9) .EQ. 'L') ) THEN       &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'L') ) THEN
474                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zld', nlevels(listnum)                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zld', nlevels(listId)
475              ENDIF              ENDIF
476              IF ( (gdiag(m)(10:10) .EQ. 'R')              IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')
477       &           .AND. (gdiag(m)(9:9) .EQ. 'U') ) THEN       &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'U') ) THEN
478                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zud', nlevels(listnum)                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zud', nlevels(listId)
479              ENDIF              ENDIF
480              dim(3) = Nr+Nrphys              dim(3) = NrMax
481              ib(3)  = 1              ib(3)  = 1
482              ie(3)  = nlevels(listnum)              ie(3)  = nlevels(listId)
483    
484  C           Time dimension  C           Time dimension
485              dn(4)(1:1) = 'T'              dn(4)(1:1) = 'T'
# Line 314  C           Time dimension Line 487  C           Time dimension
487              ib(4)  = 1              ib(4)  = 1
488              ie(4)  = 1              ie(4)  = 1
489    
490              CALL MNC_CW_ADD_GNAME(d_cw_name, 4,              CALL MNC_CW_ADD_GNAME(d_cw_name, 4,
491       &             dim, dn, ib, ie, myThid)       &             dim, dn, ib, ie, myThid)
492              CALL MNC_CW_ADD_VNAME(cdiag(m), d_cw_name,              CALL MNC_CW_ADD_VNAME(cdiag(ndId), d_cw_name,
493       &             4,5, myThid)       &             4,5, myThid)
494              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(m),'description',              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'description',
495       &             tdiag(m),myThid)       &             tdiag(ndId),myThid)
496              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(m),'units',              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'units',
497       &             udiag(m),myThid)       &             udiag(ndId),myThid)
498    
499    C     Missing values only for scalar diagnostics at mass points (so far)
500                useMisValForThisDiag = useMissingValue
501         &           .AND.gdiag(ndId)(1:2).EQ.'SM'
502                IF ( useMisValForThisDiag ) THEN
503    C     assign missing values and set flag for adding the netCDF atttibute
504                 CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(cdiag(ndId), 2,
505         I            misval_r8, misval_r4, misval_int,
506         I            myThid )
507    C     and now use the missing values for masking out the land points
508                 DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
509                  DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
510                   DO k = 1,nlevels(listId)
511                    klev = NINT(levs(k,listId))
512                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy
513                     DO i = 1-OLx,sNx+OLx
514                      IF ( _hFacC(I,J,klev,bi,bj) .EQ. 0. )
515         &                 qtmp1(i,j,k,bi,bj) = misvalLoc
516                     ENDDO
517                    ENDDO
518                   ENDDO
519                  ENDDO
520                 ENDDO
521                ELSE
522    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
523    C     Note: We have to call the following subroutine for each mnc that has
524    C     been created "on the fly" by mnc_cw_add_vname and will be deleted
525    C     by mnc_cw_del_vname, because all of these variables use the same
526    C     identifier so that mnc_cw_vfmv(indv) needs to be overwritten for
527    C     each of these variables
528                 CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(cdiag(ndId), 0,
529         I            misval_r8, misval_r4, misval_int,
530         I            myThid )
531                ENDIF
532    
533              CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,              IF (  ((writeBinaryPrec .EQ. precFloat32)
534       &             cdiag(m), qtmp1, myThid)       &            .AND. (fflags(listId)(1:1) .NE. 'D'))
535         &             .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'R') ) THEN
536                  CALL MNC_CW_RL_W('R',diag_mnc_bn,0,0,
537         &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)
538                ELSEIF ( (writeBinaryPrec .EQ. precFloat64)
539         &             .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'D') ) THEN
540                  CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,
541         &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)
542                ENDIF
543    
544              CALL MNC_CW_DEL_VNAME(cdiag(m), myThid)              CALL MNC_CW_DEL_VNAME(cdiag(ndId), myThid)
545              CALL MNC_CW_DEL_GNAME(d_cw_name, myThid)              CALL MNC_CW_DEL_GNAME(d_cw_name, myThid)
546    
547              _END_MASTER( myThid )              _END_MASTER( myThid )
# Line 334  C           Time dimension Line 549  C           Time dimension
549            ENDIF            ENDIF
550  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
551    
552  C--     end of Processing Fld # n  C--      end loop on lm (or ll if ALLOW_MNC) counter
553             ENDDO
554    C--     end of Processing Fld # md
555          ENDIF          ENDIF
556           ENDDO
557    
558    #ifdef ALLOW_MNC
559    C--   end loop on jj counter
560        ENDDO        ENDDO
561    #endif
562    
563    #ifdef ALLOW_MDSIO
564          IF (diag_mdsio) THEN
565    C-    Note: temporary: since it's a pain to add more arguments to
566    C     all MDSIO S/R, uses instead this specific S/R to write only
567    C     meta files but with more informations in it.
568                glf = globalFiles
569                nRec = nfields(listId)*averageCycle(listId)
570                CALL MDS_WR_METAFILES(fn, prec, glf, .FALSE.,
571         &              0, 0, nlevels(listId), ' ',
572         &              nfields(listId), flds(1,listId), 1, myTime,
573         &              nRec, myIter, myThid)
574          ENDIF
575    #endif /*  ALLOW_MDSIO  */
576    
577   2000 format(1x,'Computing Diagnostic # ',i3,2x,a8,5x,'Counter: ',        RETURN
      &     i4,6x,'Parms: ',a16)  
  2001 format(1x,'          Vector  Mate for  ',a8,5x,  
      &     'Diagnostic # ',i3,2x,a8,' exists ')  
  2002 format(1x,'        Vector  Mate for  ',a8,5x,  
      &     'Diagnostic # ',i3,2x,a8,' not enabled')  
  2003 format(1x,'      use Counter Mate for  ',a8,5x,  
      &     'Diagnostic # ',i3,2x,a8)  
         
       RETURN  
578        END        END
579                                                                        
580  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
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