/[MITgcm]/MITgcm/pkg/diagnostics/diagnostics_out.F
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revision 1.7 by edhill, Tue Feb 8 20:39:58 2005 UTC revision 1.39 by mlosch, Tue May 27 08:37:19 2008 UTC
# Line 9  C     !ROUTINE: DIAGNOSTICS_OUT Line 9  C     !ROUTINE: DIAGNOSTICS_OUT
9    
10  C     !INTERFACE:  C     !INTERFACE:
11        SUBROUTINE  DIAGNOSTICS_OUT(        SUBROUTINE  DIAGNOSTICS_OUT(
12       I     listnum,       I     listId,
13       I     myIter,       I     myIter,
14         I     myTime,
15       I     myThid )       I     myThid )
16    
17  C     !DESCRIPTION:  C     !DESCRIPTION:
18  C     Write output for diagnostics fields.  C     Write output for diagnostics fields.
19          
20  C     !USES:  C     !USES:
21        IMPLICIT NONE        IMPLICIT NONE
22  #include "SIZE.h"  #include "SIZE.h"
# Line 25  C     !USES: Line 26  C     !USES:
26  #include "DIAGNOSTICS_SIZE.h"  #include "DIAGNOSTICS_SIZE.h"
27  #include "DIAGNOSTICS.h"  #include "DIAGNOSTICS.h"
28    
29  #ifdef ALLOW_FIZHI        INTEGER NrMax
30  #include "fizhi_SIZE.h"        PARAMETER( NrMax = numLevels )
 #else  
       INTEGER Nrphys  
       PARAMETER (Nrphys=0)  
 #endif  
   
31    
32  C     !INPUT PARAMETERS:  C     !INPUT PARAMETERS:
33  C     listnum :: Diagnostics list number being written  C     listId  :: Diagnostics list number being written
34  C     myIter  :: current iteration number  C     myIter  :: current iteration number
35    C     myTime  :: current time of simulation (s)
36  C     myThid  :: my Thread Id number  C     myThid  :: my Thread Id number
37        INTEGER listnum, myIter, myThid        _RL     myTime
38          INTEGER listId, myIter, myThid
39  CEOP  CEOP
40    
41  C     !LOCAL VARIABLES:  C     !LOCAL VARIABLES:
42        INTEGER i, j, k, m, n, bi, bj  C     i,j,k :: loop indices
43        CHARACTER*8 parms1  C     lm    :: loop index (averageCycle)
44        CHARACTER*3 mate_index  C     md    :: field number in the list "listId".
45    C     ndId  :: diagnostics  Id number (in available diagnostics list)
46    C     mate  :: counter mate Id number (in available diagnostics list)
47    C     ip    :: diagnostics  pointer to storage array
48    C     im    :: counter-mate pointer to storage array
49    C
50    C--   COMMON /LOCAL_DIAGNOSTICS_OUT/ local common block (for multi-threaded)
51    C     qtmp1 :: thread-shared temporary array (needs to be in common block):
52    C              to write a diagnostic field to file, copy it first from (big)
53    C              diagnostic storage qdiag into it.
54          COMMON /LOCAL_DIAGNOSTICS_OUT/ qtmp1
55          _RL qtmp1(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,NrMax,nSx,nSy)
56    
57          INTEGER i, j, k, lm, klev
58          INTEGER bi, bj
59          INTEGER md, ndId, ip, im
60        INTEGER mate, mVec        INTEGER mate, mVec
61        _RL qtmp1(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr+Nrphys,nSx,nSy)        CHARACTER*10 gcode
62        _RL undef, getcon        _RL undef, getcon
63          _RL tmpLev
64        EXTERNAL getcon        EXTERNAL getcon
65        INTEGER ILNBLNK        INTEGER ILNBLNK
66        EXTERNAL ILNBLNK        EXTERNAL ILNBLNK
67        INTEGER ilen        INTEGER ilen
68    
69        INTEGER ioUnit        INTEGER ioUnit
70        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) pref        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) fn
71        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff
72        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf
73        CHARACTER*(80) fn        INTEGER prec, nRec
74    #ifdef ALLOW_MDSIO
75        LOGICAL glf        LOGICAL glf
76    #endif
77  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
78        INTEGER ii        INTEGER ii
79        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn
       CHARACTER*(5) ctmp  
80        INTEGER CW_DIMS, NLEN        INTEGER CW_DIMS, NLEN
81        PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )        PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )
82        PARAMETER ( NLEN    = 80 )        PARAMETER ( NLEN    = 80 )
# Line 69  C     !LOCAL VARIABLES: Line 84  C     !LOCAL VARIABLES:
84        CHARACTER*(NLEN) dn(CW_DIMS)        CHARACTER*(NLEN) dn(CW_DIMS)
85        CHARACTER*(NLEN) d_cw_name        CHARACTER*(NLEN) d_cw_name
86        CHARACTER*(NLEN) dn_blnk        CHARACTER*(NLEN) dn_blnk
87        _RS ztmp(Nr+Nrphys)  #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK
88          CHARACTER*(5) ctmp
89          _RS ztmp(NrMax)
90    #endif
91          LOGICAL useMissingValue, useMisValForThisDiag
92          REAL*8 misvalLoc
93          REAL*8 misval_r8(2)
94          REAL*4 misval_r4(2)
95          INTEGER misvalIntLoc, misval_int(2)
96  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
97    
98  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
99    
100        ioUnit= standardMessageUnit        ioUnit= standardMessageUnit
101        undef = getcon('UNDEF')        undef = getcon('UNDEF')
       glf = globalFiles  
102        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter
103        pref = fnames(listnum)        ilen = ILNBLNK(fnames(listId))
104        ilen=ILNBLNK( pref )        WRITE( fn, '(A,A,A)' ) fnames(listId)(1:ilen),'.',suff(1:10)
       WRITE( fn, '(A,A,A)' ) pref(1:ilen),'.',suff(1:10)  
105    
106  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
107        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
108    C     Handle missing value attribute (land points)
109           useMissingValue = .FALSE.
110    #ifdef DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE
111           useMissingValue = .TRUE.
112    #endif /* DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE */
113           IF ( misvalFlt(listId) .NE. UNSET_RL ) THEN
114            misvalLoc = misvalFlt(listId)
115           ELSE
116            misvalLoc = undef
117           ENDIF
118    C     Defaults to UNSET_I
119           misvalIntLoc = misvalInt(listId)
120           DO ii=1,2
121    C       misval_r4(ii)  = UNSET_FLOAT4
122    C       misval_r8(ii)  = UNSET_FLOAT8
123            misval_r4(ii)  = misvalLoc
124            misval_r8(ii)  = misvalLoc
125            misval_int(ii) = UNSET_I
126           ENDDO
127          DO i = 1,MAX_LEN_FNAM          DO i = 1,MAX_LEN_FNAM
128            diag_mnc_bn(i:i) = ' '            diag_mnc_bn(i:i) = ' '
129          ENDDO          ENDDO
130          DO i = 1,NLEN          DO i = 1,NLEN
131            dn_blnk(i:i) = ' '            dn_blnk(i:i) = ' '
132          ENDDO          ENDDO
133  c       WRITE( diag_mnc_bn, '(A,A)' ) 'diag.', pref(1:ilen)          WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) fnames(listId)(1:ilen)
         WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) pref(1:ilen)  
134    
135  C       Update the record dimension by writing the iteration number  C       Update the record dimension by writing the iteration number
136          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)
137          CALL MNC_CW_I_W_S('I',diag_mnc_bn,0,0,'T',myIter,myThid)          CALL MNC_CW_RL_W_S('D',diag_mnc_bn,0,0,'T',myTime,myThid)
138          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)
139            CALL MNC_CW_I_W_S('I',diag_mnc_bn,0,0,'iter',myIter,myThid)
140    
141    C       NOTE: at some point it would be a good idea to add a time_bounds
142    C       variable that has dimension (2,T) and clearly denotes the
143    C       beginning and ending times for each diagnostics period
144    
145          dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)          dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)
146          WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listnum)          WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)
147          dim(1) = nlevels(listnum)          dim(1) = nlevels(listId)
148          ib(1)  = 1          ib(1)  = 1
149          ie(1)  = nlevels(listnum)          ie(1)  = nlevels(listId)
150    
151          CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,          CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,
152       &       dim, dn, ib, ie, myThid)       &       dim, dn, ib, ie, myThid)
153          CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',          CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',
154       &       0,0, myThid)       &       0,0, myThid)
155          CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',          CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',
156       &       'Idicies of vertical levels within the source arrays',       &       'Idicies of vertical levels within the source arrays',
157       &       myThid)       &       myThid)
158            C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
159          CALL MNC_CW_RL_W('I',diag_mnc_bn,0,0,          IF (useMissingValue)
160       &       'diag_levels', levs(1,listnum), myThid)       &       CALL MNC_CW_VATTR_MISSING('diag_levels', 0,
161         I       misval_r8, misval_r4, misval_int,
162         I       myThid )
163    
164            CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,
165         &       'diag_levels', levs(1,listId), myThid)
166    
167          CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)          CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)
168          CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)          CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)
169    
170    #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK
171    C       This part has been placed in an #ifdef because, as its currently
172    C       written, it will only work with variables defined on a dynamics
173    C       grid.  As we start using diagnostics for physics grids, ice
174    C       levels, land levels, etc. the different vertical coordinate
175    C       dimensions will have to be taken into account.
176    
177    C       20051021 JMC & EH3 : We need to extend this so that a few
178    C       variables each defined on different grids do not have the same
179    C       vertical dimension names so we should be using a pattern such
180    C       as: Z[uml]td000000 where the 't' is the type as specified by
181    C       gdiag(10)
182    
183  C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx  C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx
184          ctmp(1:5) = 'mul  '          ctmp(1:5) = 'mul  '
185          DO i = 1,3          DO i = 1,3
186            dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)            dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)
187            WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listnum)            WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listId)
188            CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)            CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)
189            CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)            CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)
190            DO j = 1,nlevels(listnum)  
191              IF (i .EQ. 1) THEN  C         The following three ztmp() loops should eventually be modified
192                ztmp(j) = rC(levs(j,listnum))  C         to reflect the fractional nature of levs(j,l) -- they should
193                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',  C         do something like:
194       &             'Dimensional coordinate value at the mid point',  C            ztmp(j) = rC(INT(FLOOR(levs(j,l))))
195       &             myThid)  C                      + ( rC(INT(FLOOR(levs(j,l))))
196              ELSEIF (i .EQ. 2) THEN  C                          + rC(INT(CEIL(levs(j,l)))) )
197                ztmp(j) = rF(levs(j,listnum))  C                        / ( levs(j,l) - FLOOR(levs(j,l)) )
198                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',  C         for averaged levels.
199       &             'Dimensional coordinate value at the upper point',            IF (i .EQ. 1) THEN
200       &             myThid)              DO j = 1,nlevels(listId)
201              ELSEIF (i .EQ. 3) THEN                ztmp(j) = rC(NINT(levs(j,listId)))
202                ztmp(j) = rF(levs(j,listnum) + 1)              ENDDO
203                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
204       &             'Dimensional coordinate value at the lower point',       &           'Dimensional coordinate value at the mid point',
205       &             myThid)       &           myThid)
206              ENDIF            ELSEIF (i .EQ. 2) THEN
207            ENDDO              DO j = 1,nlevels(listId)
208                  ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)) + 1)
209                ENDDO
210                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
211         &           'Dimensional coordinate value at the upper point',
212         &           myThid)
213              ELSEIF (i .EQ. 3) THEN
214                DO j = 1,nlevels(listId)
215                  ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)))
216                ENDDO
217                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
218         &           'Dimensional coordinate value at the lower point',
219         &           myThid)
220              ENDIF
221    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
222              IF (useMissingValue)
223         &         CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(dn(1), 0,
224         I         misval_r8, misval_r4, misval_int,
225         I         myThid )
226            CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)            CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)
227            CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)            CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)
228            CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)            CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)
229          ENDDO          ENDDO
230    #endif /*  DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  */
231    
232        ENDIF        ENDIF
233  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
234    
235        DO n = 1,nfields(listnum)  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
236          m = jdiag(n,listnum)  
237          parms1 = gdiag(m)(1:8)        DO md = 1,nfields(listId)
238          IF ( idiag(m).NE.0 .AND. parms1(5:5).NE.'D' ) THEN          ndId = jdiag(md,listId)
239            gcode = gdiag(ndId)(1:10)
240            mate = 0
241            mVec = 0
242            IF ( gcode(5:5).EQ.'C' ) THEN
243    C-      Check for Mate of a Counter Diagnostic
244               mate = hdiag(ndId)
245            ELSEIF ( gcode(1:1).EQ.'U' .OR. gcode(1:1).EQ.'V' ) THEN
246    C-      Check for Mate of a Vector Diagnostic
247               mVec = hdiag(ndId)
248            ENDIF
249            IF ( idiag(md,listId).NE.0 .AND. gcode(5:5).NE.'D' ) THEN
250  C--     Start processing 1 Fld :  C--     Start processing 1 Fld :
251             DO lm=1,averageCycle(listId)
252    
253            IF ( ndiag(m).EQ.0 ) THEN            ip = ABS(idiag(md,listId)) + kdiag(ndId)*(lm-1)
254              im = mdiag(md,listId)
255              IF (mate.GT.0) im = im + kdiag(mate)*(lm-1)
256              IF (mVec.GT.0) im = im + kdiag(mVec)*(lm-1)
257    
258              IF ( ndiag(ip,1,1).EQ.0 ) THEN
259  C-        Empty diagnostics case :  C-        Empty diagnostics case :
260    
261              _BEGIN_MASTER( myThid )              _BEGIN_MASTER( myThid )
262              WRITE(msgBuf,'(A,I10)')              WRITE(msgBuf,'(A,I10)')
263       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter
264              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
265       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
266              WRITE(msgBuf,'(A,I4,3A,I3,2A)')              WRITE(msgBuf,'(A,I6,3A,I4,2A)')
267       &       '- WARNING -   diag.#',m, ' : ',flds(n,listnum),       &       '- WARNING -   diag.#',ndId, ' : ',flds(md,listId),
268       &       ' (#',n,' ) in outp.Stream: ',fnames(listnum)       &       ' (#',md,' ) in outp.Stream: ',fnames(listId)
269              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
270       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
271              WRITE(msgBuf,'(A,I2,A)')              IF ( averageCycle(listId).GT.1 ) THEN
272       &       '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',ndiag(m),' )'               WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
273              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag(lm=',lm,')=',
274         &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
275                ELSE
276                 WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
277         &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',
278         &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
279                ENDIF
280                CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
281       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
282              WRITE(msgBuf,'(A)')              WRITE(msgBuf,'(A)')
283       &       'WARNING DIAGNOSTICS_OUT  => write ZEROS instead'       &       'WARNING DIAGNOSTICS_OUT  => write ZEROS instead'
284              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
285       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
286              _END_MASTER( myThid )              _END_MASTER( myThid )
287              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
288                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
289                  DO k = 1,nlevels(listnum)                  DO k = 1,nlevels(listId)
290                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy
291                      DO i = 1-OLx,sNx+OLx                      DO i = 1-OLx,sNx+OLx
292                        qtmp1(i,j,k,bi,bj) = 0. _d 0                        qtmp1(i,j,k,bi,bj) = 0. _d 0
# Line 194  C-        Empty diagnostics case : Line 299  C-        Empty diagnostics case :
299            ELSE            ELSE
300  C-        diagnostics is not empty :  C-        diagnostics is not empty :
301    
302              IF ( myThid.EQ.1 )              IF ( debugLevel.GE.debLevA .AND. myThid.EQ.1 ) THEN
303       &             WRITE(ioUnit,2000) m,cdiag(m),ndiag(m),gdiag(m)                WRITE(ioUnit,'(A,I6,3A,I8,2A)')
304         &         ' Computing Diagnostic # ', ndId, '  ', cdiag(ndId),
305              IF ( parms1(5:5).EQ.'C' ) THEN       &         '     Counter:',ndiag(ip,1,1),'   Parms: ',gdiag(ndId)
306  C             Check for Mate of a Counter Diagnostic                IF ( mate.GT.0 ) THEN
307  C             --------------------------------------                 WRITE(ioUnit,'(3A,I6,2A)')
308                mate_index = parms1(6:8)       &         '       use Counter Mate for  ', cdiag(ndId),
309                READ (mate_index,'(I3)') mate       &         '     Diagnostic # ',mate, '  ', cdiag(mate)
310                IF ( myThid.EQ.1 )                ELSEIF ( mVec.GT.0 ) THEN
311       &                 WRITE(ioUnit,2003) cdiag(m),mate,cdiag(mate)                  IF ( im.GT.0 .AND. ndiag(MAX(1,im),1,1).GT.0 ) THEN
312              ELSE                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
313                mate = 0       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
314         &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
315  C             Check for Mate of a Vector Diagnostic       &             ' exists '
 C             -------------------------------------  
               IF ( parms1(1:1).EQ.'U' .OR. parms1(1:1).EQ.'V' ) THEN  
                 mate_index = parms1(6:8)  
                 READ (mate_index,'(I3)') mVec  
                 IF ( idiag(mVec).NE.0 ) THEN  
                   IF ( myThid.EQ.1 )  
      &                 WRITE(ioUnit,2001) cdiag(m),mVec,cdiag(mVec)  
316                  ELSE                  ELSE
317                    IF ( myThid.EQ.1 )                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
318       &                 WRITE(ioUnit,2002) cdiag(m),mVec,cdiag(mVec)       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
319         &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
320         &             ' not enabled'
321                  ENDIF                  ENDIF
322                ENDIF                ENDIF
323              ENDIF              ENDIF
324    
325              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'P' ) THEN
326               DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  C-       get all the levels (for vertical interpolation)
327                DO k = 1,nlevels(listnum)                DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
328                  CALL GETDIAG(                 DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
329       I                       levs(k,listnum),undef,                  DO k = 1,kdiag(ndId)
330       O                       qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),                    tmpLev = k
331       I                       m,mate,bi,bj,myThid)                    CALL GETDIAG(
332         I                         tmpLev,undef,
333         O                         qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),
334         I                         ndId,mate,ip,im,bi,bj,myThid)
335                    ENDDO
336                   ENDDO
337                ENDDO                ENDDO
338               ENDDO              ELSE
339              ENDDO  C-       get only selected levels:
340                  DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
341                   DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
342                    DO k = 1,nlevels(listId)
343                      CALL GETDIAG(
344         I                         levs(k,listId),undef,
345         O                         qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),
346         I                         ndId,mate,ip,im,bi,bj,myThid)
347                    ENDDO
348                   ENDDO
349                  ENDDO
350                ENDIF
351    
352  C-        end of empty diag / not empty block  C-        end of empty diag / not empty block
353            ENDIF            ENDIF
354    
355  #ifdef ALLOW_MDSIO  C-----------------------------------------------------------------------
356  C         Prepare for mdsio optionality  C         Check to see if we need to interpolate before output
357            IF (diag_mdsio) THEN  C-----------------------------------------------------------------------
358              CALL mdswritefield_new(fn,writeBinaryPrec,glf,'RL',            IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'P' ) THEN
359       &           Nr+Nrphys,nlevels(listnum),qtmp1,n,myIter,myThid)  C-        Do vertical interpolation:
360               IF ( fluidIsAir ) THEN
361    C jmc: for now, this can only work in an atmospheric set-up (fluidIsAir);
362                CALL DIAGNOSTICS_INTERP_VERT(
363         I                     listId, md, ndId, ip, im, lm,
364         U                     qtmp1,
365         I                     undef, myTime, myIter, myThid )
366               ELSE
367                 WRITE(msgBuf,'(2A)') 'DIAGNOSTICS_OUT: ',
368         &         'INTERP_VERT not allowed in this config'
369                 CALL PRINT_ERROR( msgBuf , myThid )
370                 STOP 'ABNORMAL END: S/R DIAGNOSTICS_OUT'
371               ENDIF
372              ENDIF
373    
374    C--    Ready to write field "md", element "lm" in averageCycle(listId)
375    
376    C-        write to binary file, using MDSIO pkg:
377              IF ( diag_mdsio ) THEN
378                nRec = lm + (md-1)*averageCycle(listId)
379    C           default precision for output files
380                prec = writeBinaryPrec
381    C           fFlag(1)=R(or D): force it to be 32-bit(or 64) precision
382                IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'R' ) prec = precFloat32
383                IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'D' ) prec = precFloat64
384    C         a hack not to write meta files now: pass -nRec < 0 to MDS_WRITE S/R
385                CALL WRITE_REC_LEV_RL(
386         I                            fn, prec,
387         I                            NrMax, 1, nlevels(listId),
388         I                            qtmp1, -nRec, myIter, myThid )
389            ENDIF            ENDIF
 #endif /*  ALLOW_MDSIO  */  
390    
391  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
392            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
# Line 259  C           subtlety within MNC.  Basica Line 403  C           subtlety within MNC.  Basica
403  C           caching its own concept of what each "grid name" (that is, a  C           caching its own concept of what each "grid name" (that is, a
404  C           dimension group name) means.  So one cannot re-use the same  C           dimension group name) means.  So one cannot re-use the same
405  C           "grid" name for different collections of dimensions within a  C           "grid" name for different collections of dimensions within a
406  C           given file.  By appending the "m" values to each name, we  C           given file.  By appending the "ndId" values to each name, we
407  C           guarantee uniqueness within each MNC-produced file.  C           guarantee uniqueness within each MNC-produced file.
408              WRITE(d_cw_name,'(a,i6.6)') 'd_cw_',m              WRITE(d_cw_name,'(a,i6.6)') 'd_cw_',ndId
409    
410  C           XY dimensions  C           XY dimensions
411              dim(1)       = sNx + 2*OLx              dim(1)       = sNx + 2*OLx
412              dim(2)       = sNy + 2*OLy              dim(2)       = sNy + 2*OLy
413              ib(1)        = OLx + 1              ib(1)        = OLx + 1
414              ib(2)        = OLy + 1              ib(2)        = OLy + 1
415              IF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'M') THEN              IF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'M') THEN
416                dn(1)(1:2) = 'X'                dn(1)(1:2) = 'X'
417                ie(1)      = OLx + sNx                ie(1)      = OLx + sNx
418                dn(2)(1:2) = 'Y'                dn(2)(1:2) = 'Y'
419                ie(2)      = OLy + sNy                ie(2)      = OLy + sNy
420              ELSEIF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'U') THEN              ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'U') THEN
421                dn(1)(1:3) = 'Xp1'                dn(1)(1:3) = 'Xp1'
422                ie(1)      = OLx + sNx + 1                ie(1)      = OLx + sNx + 1
423                dn(2)(1:2) = 'Y'                dn(2)(1:2) = 'Y'
424                ie(2)      = OLy + sNy                ie(2)      = OLy + sNy
425              ELSEIF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'V') THEN              ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'V') THEN
426                dn(1)(1:2) = 'X'                dn(1)(1:2) = 'X'
427                ie(1)      = OLx + sNx                ie(1)      = OLx + sNx
428                dn(2)(1:3) = 'Yp1'                dn(2)(1:3) = 'Yp1'
429                ie(2)      = OLy + sNy + 1                ie(2)      = OLy + sNy + 1
430              ELSEIF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'Z') THEN              ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'Z') THEN
431                dn(1)(1:3) = 'Xp1'                dn(1)(1:3) = 'Xp1'
432                ie(1)      = OLx + sNx + 1                ie(1)      = OLx + sNx + 1
433                dn(2)(1:3) = 'Yp1'                dn(2)(1:3) = 'Yp1'
434                ie(2)      = OLy + sNy + 1                ie(2)      = OLy + sNy + 1
435              ENDIF              ENDIF
436                
437  C           Z is special since it varies  C           Z is special since it varies
438              WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zd', nlevels(listnum)              WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zd', nlevels(listId)
439              IF ( (gdiag(m)(10:10) .EQ. 'R')              IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')
440       &           .AND. (gdiag(m)(9:9) .EQ. 'M') ) THEN       &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'M') ) THEN
441                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listnum)                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)
442              ENDIF              ENDIF
443              IF ( (gdiag(m)(10:10) .EQ. 'R')              IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')
444       &           .AND. (gdiag(m)(9:9) .EQ. 'L') ) THEN       &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'L') ) THEN
445                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zld', nlevels(listnum)                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zld', nlevels(listId)
446              ENDIF              ENDIF
447              IF ( (gdiag(m)(10:10) .EQ. 'R')              IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')
448       &           .AND. (gdiag(m)(9:9) .EQ. 'U') ) THEN       &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'U') ) THEN
449                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zud', nlevels(listnum)                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zud', nlevels(listId)
450              ENDIF              ENDIF
451              dim(3) = Nr+Nrphys              dim(3) = NrMax
452              ib(3)  = 1              ib(3)  = 1
453              ie(3)  = nlevels(listnum)              ie(3)  = nlevels(listId)
454    
455  C           Time dimension  C           Time dimension
456              dn(4)(1:1) = 'T'              dn(4)(1:1) = 'T'
# Line 314  C           Time dimension Line 458  C           Time dimension
458              ib(4)  = 1              ib(4)  = 1
459              ie(4)  = 1              ie(4)  = 1
460    
461              CALL MNC_CW_ADD_GNAME(d_cw_name, 4,              CALL MNC_CW_ADD_GNAME(d_cw_name, 4,
462       &             dim, dn, ib, ie, myThid)       &             dim, dn, ib, ie, myThid)
463              CALL MNC_CW_ADD_VNAME(cdiag(m), d_cw_name,              CALL MNC_CW_ADD_VNAME(cdiag(ndId), d_cw_name,
464       &             4,5, myThid)       &             4,5, myThid)
465              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(m),'description',              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'description',
466       &             tdiag(m),myThid)       &             tdiag(ndId),myThid)
467              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(m),'units',              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'units',
468       &             udiag(m),myThid)       &             udiag(ndId),myThid)
469    
470    C     Missing values only for scalar diagnostics at mass points (so far)
471                useMisValForThisDiag = useMissingValue
472         &           .AND.gdiag(ndId)(1:2).EQ.'SM'
473                IF ( useMisValForThisDiag ) THEN
474    C     assign missing values and set flag for adding the netCDF atttibute
475                 CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(cdiag(ndId), 2,
476         I            misval_r8, misval_r4, misval_int,
477         I            myThid )
478    C     and now use the missing values for masking out the land points
479                 DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
480                  DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
481                   DO k = 1,nlevels(listId)
482                    klev = NINT(levs(k,listId))
483                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy
484                     DO i = 1-OLx,sNx+OLx
485                      IF ( _hFacC(I,J,klev,bi,bj) .EQ. 0. )
486         &                 qtmp1(i,j,k,bi,bj) = misvalLoc
487                     ENDDO
488                    ENDDO
489                   ENDDO
490                  ENDDO
491                 ENDDO
492                ELSE
493    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
494    C     Note: We have to call the following subroutine for each mnc that has
495    C     been created "on the fly" by mnc_cw_add_vname and will be deleted
496    C     by mnc_cw_del_vname, because all of these variables use the same
497    C     identifier so that mnc_cw_vfmv(indv) needs to be overwritten for
498    C     each of these variables
499                 CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(cdiag(ndId), 0,
500         I            misval_r8, misval_r4, misval_int,
501         I            myThid )
502                ENDIF
503    
504              CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,              IF ( ( (writeBinaryPrec .EQ. precFloat32)
505       &             cdiag(m), qtmp1, myThid)       &           .AND. (fflags(listId)(1:1) .NE. 'D')
506         &           .AND. (fflags(listId)(1:1) .NE. 'R') )
507         &           .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'R')) THEN
508                  CALL MNC_CW_RL_W('R',diag_mnc_bn,0,0,
509         &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)
510                ELSEIF ( (writeBinaryPrec .EQ. precFloat64)
511         &             .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'D') ) THEN
512                  CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,
513         &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)
514                ENDIF
515    
516              CALL MNC_CW_DEL_VNAME(cdiag(m), myThid)              CALL MNC_CW_DEL_VNAME(cdiag(ndId), myThid)
517              CALL MNC_CW_DEL_GNAME(d_cw_name, myThid)              CALL MNC_CW_DEL_GNAME(d_cw_name, myThid)
518    
519              _END_MASTER( myThid )              _END_MASTER( myThid )
# Line 334  C           Time dimension Line 521  C           Time dimension
521            ENDIF            ENDIF
522  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
523    
524  C--     end of Processing Fld # n           ENDDO
525    C--     end of Processing Fld # md
526          ENDIF          ENDIF
527        ENDDO        ENDDO
528    
529   2000 format(1x,'Computing Diagnostic # ',i3,2x,a8,5x,'Counter: ',  #ifdef ALLOW_MDSIO
530       &     i4,6x,'Parms: ',a16)        IF (diag_mdsio) THEN
531   2001 format(1x,'          Vector  Mate for  ',a8,5x,  C-    Note: temporary: since it's a pain to add more arguments to
532       &     'Diagnostic # ',i3,2x,a8,' exists ')  C     all MDSIO S/R, uses instead this specific S/R to write only
533   2002 format(1x,'        Vector  Mate for  ',a8,5x,  C     meta files but with more informations in it.
534       &     'Diagnostic # ',i3,2x,a8,' not enabled')              glf = globalFiles
535   2003 format(1x,'      use Counter Mate for  ',a8,5x,              nRec = nfields(listId)*averageCycle(listId)
536       &     'Diagnostic # ',i3,2x,a8)              CALL MDS_WR_METAFILES(fn, prec, glf, .FALSE.,
537               &              0, 0, nlevels(listId), ' ',
538        RETURN       &              nfields(listId), flds(1,listId), 1, myTime,
539         &              nRec, myIter, myThid)
540          ENDIF
541    #endif /*  ALLOW_MDSIO  */
542    
543          RETURN
544        END        END
545                                                                        
546  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
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