/[MITgcm]/MITgcm/pkg/diagnostics/diagnostics_out.F
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revision 1.17 by molod, Tue Jul 12 20:25:45 2005 UTC revision 1.52 by jmc, Sun Jun 12 19:16:09 2011 UTC
# Line 8  CBOP 0 Line 8  CBOP 0
8  C     !ROUTINE: DIAGNOSTICS_OUT  C     !ROUTINE: DIAGNOSTICS_OUT
9    
10  C     !INTERFACE:  C     !INTERFACE:
11        SUBROUTINE  DIAGNOSTICS_OUT(        SUBROUTINE DIAGNOSTICS_OUT(
12       I     listId,       I     listId,
      I     myIter,  
13       I     myTime,       I     myTime,
14         I     myIter,
15       I     myThid )       I     myThid )
16    
17  C     !DESCRIPTION:  C     !DESCRIPTION:
# Line 26  C     !USES: Line 26  C     !USES:
26  #include "DIAGNOSTICS_SIZE.h"  #include "DIAGNOSTICS_SIZE.h"
27  #include "DIAGNOSTICS.h"  #include "DIAGNOSTICS.h"
28    
29  #ifdef ALLOW_FIZHI        INTEGER NrMax
30  #include "fizhi_SIZE.h"        PARAMETER( NrMax = numLevels )
 #else  
       INTEGER Nrphys  
       PARAMETER (Nrphys=0)  
 #endif  
   
31    
32  C     !INPUT PARAMETERS:  C     !INPUT PARAMETERS:
33  C     listId  :: Diagnostics list number being written  C     listId  :: Diagnostics list number being written
# Line 43  C     myThid  :: my Thread Id number Line 38  C     myThid  :: my Thread Id number
38        INTEGER listId, myIter, myThid        INTEGER listId, myIter, myThid
39  CEOP  CEOP
40    
41    C     !FUNCTIONS:
42          INTEGER ILNBLNK
43          EXTERNAL ILNBLNK
44    #ifdef ALLOW_FIZHI
45          _RL   getcon
46          EXTERNAL getcon
47    #endif
48    
49  C     !LOCAL VARIABLES:  C     !LOCAL VARIABLES:
50  C     i,j,k :: loop indices  C     i,j,k :: loop indices
51    C     bi,bj :: tile indices
52    C     lm    :: loop index (averageCycle)
53  C     md    :: field number in the list "listId".  C     md    :: field number in the list "listId".
54  C     ndId  :: diagnostics  Id number (in available diagnostics list)  C     ndId  :: diagnostics  Id number (in available diagnostics list)
55  C     mate  :: counter mate Id number (in available diagnostics list)  C     mate  :: counter mate Id number (in available diagnostics list)
56  C     ip    :: diagnostics  pointer to storage array  C     ip    :: diagnostics  pointer to storage array
57  C     im    :: counter-mate pointer to storage array  C     im    :: counter-mate pointer to storage array
58        INTEGER i, j, k  C     nLevOutp :: number of levels to write in output file
59    C
60    C--   COMMON /LOCAL_DIAGNOSTICS_OUT/ local common block (for multi-threaded)
61    C     qtmp1 :: temporary array; used to store a copy of diag. output field.
62    C     qtmp2 :: temporary array; used to store a copy of a 2nd diag. field.
63    C-  Note: local common block no longer needed.
64    c     COMMON /LOCAL_DIAGNOSTICS_OUT/ qtmp1
65          _RL qtmp1(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,NrMax,nSx,nSy)
66          _RL qtmp2(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,NrMax,nSx,nSy)
67    
68          INTEGER i, j, k, lm
69        INTEGER bi, bj        INTEGER bi, bj
70        INTEGER md, ndId, ip, im        INTEGER md, ndId, ip, im
71        INTEGER mate, mVec        INTEGER mate, mVec
72        CHARACTER*8 parms1        CHARACTER*10 gcode
73        CHARACTER*3 mate_index        _RL undefRL
74        _RL qtmp1(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr+Nrphys,nSx,nSy)        INTEGER nLevOutp, kLev
       _RL qtmpsrf(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,nSx,nSy)  
       _RL qtmp2(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr+Nrphys,nSx,nSy)  
       _RL undef, getcon  
       EXTERNAL getcon  
       INTEGER ILNBLNK  
       EXTERNAL ILNBLNK  
       INTEGER ilen  
       integer nlevsout,nplevs  
       parameter(nplevs = 16)  
       _RL plevs1(nplevs)  
       data plevs1/ 1000.0 _d 2, 925.0 _d 2, 850.0 _d 2, 700.0 _d 2,  
      .              600.0 _d 2, 500.0 _d 2, 400.0 _d 2, 300.0 _d 2,  
      .              250.0 _d 2, 200.0 _d 2, 150.0 _d 2, 100.0 _d 2,  
      .               70.0 _d 2,  50.0 _d 2,  30.0 _d 2,  20.0 _d 2/  
       _RL plevs2(nplevs)  
       data plevs2/ 1000.0 _d 2, 950.0 _d 2, 900.0 _d 2, 850.0 _d 2,  
      .              800.0 _d 2, 750.0 _d 2, 700.0 _d 2, 600.0 _d 2,  
      .              500.0 _d 2, 400.0 _d 2, 300.0 _d 2, 250.0 _d 2,  
      .              200.0 _d 2, 150.0 _d 2, 100.0 _d 2,  50.0 _d 2/  
       _RL qprs(sNx,sNy,nplevs)  
       _RL qinp(sNx,sNy,Nr+Nrphys)  
       _RL pkz(sNx,sNy,Nr+Nrphys)  
       _RL pksrf(sNx,sNy)  
       _RL p  
       INTEGER jpoint1,ipoint1  
       INTEGER jpoint2,ipoint2  
       _RL kappa  
       logical foundp  
       data foundp /.false./  
75    
76          INTEGER iLen
77        INTEGER ioUnit        INTEGER ioUnit
78        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) fn        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) fn
79        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff
80        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf
81          INTEGER prec, nRec, nTimRec
82          _RL     timeRec(2)
83          _RL     tmpLoc
84    #ifdef ALLOW_MDSIO
85        LOGICAL glf        LOGICAL glf
86    #endif
87  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
88        INTEGER ii        INTEGER ll, llMx, jj, jjMx
89        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn
90        CHARACTER*(5) ctmp        LOGICAL useMissingValue
91        INTEGER CW_DIMS, NLEN        REAL*8 misValLoc
       PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )  
       PARAMETER ( NLEN    = 80 )  
       INTEGER dim(CW_DIMS), ib(CW_DIMS), ie(CW_DIMS)  
       CHARACTER*(NLEN) dn(CW_DIMS)  
       CHARACTER*(NLEN) d_cw_name  
       CHARACTER*(NLEN) dn_blnk  
       _RS ztmp(Nr+Nrphys)  
92  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
93    
94  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
95    
96    C---  set file properties
97        ioUnit= standardMessageUnit        ioUnit= standardMessageUnit
98        undef = getcon('UNDEF')        undefRL = UNSET_RL
99        kappa = getcon('KAPPA')  #ifdef ALLOW_FIZHI
100        glf = globalFiles        IF ( useFIZHI ) undefRL = getcon('UNDEF')
101    #endif
102        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter
103        ilen = ILNBLNK(fnames(listId))        iLen = ILNBLNK(fnames(listId))
104        WRITE( fn, '(A,A,A)' ) fnames(listId)(1:ilen),'.',suff(1:10)        WRITE( fn, '(A,A,A)' ) fnames(listId)(1:iLen),'.',suff(1:10)
105    C-    for now, if integrate vertically, output field has just 1 level:
106  C Initialize the qtmp1 array to all undefs -- need this for unfilled levels        nLevOutp = nlevels(listId)
107        DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)        IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'I' ) nLevOutp = 1
108          DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  
109            DO k = 1,nlevels(listId)  C--   Set time information:
110              DO j = 1-OLy,sNy+OLy        IF ( freq(listId).LT.0. ) THEN
111                DO i = 1-OLx,sNx+OLx  C-    Snap-shot: store a unique time (which is consistent with State-Var timing)
112                  qtmp1(i,j,k,bi,bj) = undef          nTimRec = 1
113                ENDDO          timeRec(1) = myTime
114              ENDDO        ELSE
115            ENDDO  C-    Time-average: store the 2 edges of the time-averaging interval.
116          ENDDO  C      this time is consitent with intermediate Var (i.e., non-state, e.g, flux,
117        ENDDO  C      tendencies) timing. For State-Var, this is shifted by + halt time-step.
118            nTimRec = 2
119    
120    C-    end of time-averaging interval:
121            timeRec(2) = myTime
122    
123    C-    begining of time-averaging interval:
124    c       timeRec(1) = myTime - freq(listId)
125    C     a) find the time of the previous multiple of output freq:
126            timeRec(1) = myTime-deltaTClock*0.5 _d 0
127            timeRec(1) = (timeRec(1)-phase(listId))/freq(listId)
128            i = INT( timeRec(1) )
129            IF ( timeRec(1).LT.0. ) THEN
130              tmpLoc = FLOAT(i)
131              IF ( timeRec(1).NE.tmpLoc ) i = i - 1
132            ENDIF
133            timeRec(1) = phase(listId) + freq(listId)*FLOAT(i)
134    c       if ( listId.eq.2 ) write(0,*) 'f',i,timeRec(1)/deltaTClock
135            timeRec(1) = MAX( timeRec(1), startTime )
136    
137    C     b) round off to nearest multiple of time-step:
138            timeRec(1) = (timeRec(1)-baseTime)/deltaTClock
139            i = NINT( timeRec(1) )
140    C     if just half way, NINT will return the next time-step: correct this
141            tmpLoc = FLOAT(i) - 0.5 _d 0
142            IF ( timeRec(1).EQ.tmpLoc ) i = i - 1
143            timeRec(1) = baseTime + deltaTClock*FLOAT(i)
144    c       if ( listId.eq.2 ) write(0,*) i,timeRec(1)/deltaTClock
145          ENDIF
146    C--   Convert time to iteration number (debug)
147    c     DO i=1,nTimRec
148    c       timeRec(i) = timeRec(i)/deltaTClock
149    c     ENDDO
150    
151  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
152    C-- this is a trick to reverse the order of the loops on md (= field)
153    C   and lm (= averagePeriod): binary output: lm loop inside md loop ;
154    C                                 mnc ouput: md loop inside lm loop.
155        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
156          DO i = 1,MAX_LEN_FNAM          jjMx = averageCycle(listId)
157            diag_mnc_bn(i:i) = ' '          llMx = 1
158          ENDDO        ELSE
159          DO i = 1,NLEN          jjMx = 1
160            dn_blnk(i:i) = ' '          llMx = averageCycle(listId)
         ENDDO  
         WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) fnames(listId)(1:ilen)  
   
 C       Update the record dimension by writing the iteration number  
         CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)  
         CALL MNC_CW_RL_W_S('D',diag_mnc_bn,0,0,'T',myTime,myThid)  
         CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)  
   
         dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)  
         WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)  
         dim(1) = nlevels(listId)  
         ib(1)  = 1  
         ie(1)  = nlevels(listId)  
   
         CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,  
      &       dim, dn, ib, ie, myThid)  
         CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',  
      &       0,0, myThid)  
         CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',  
      &       'Idicies of vertical levels within the source arrays',  
      &       myThid)  
           
         CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,  
      &       'diag_levels', levs(1,listId), myThid)  
   
         CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)  
         CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)  
   
 #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  
 C       This part has been placed in an #ifdef because, as its currently  
 C       written, it will only work with variables defined on a dynamics  
 C       grid.  As we start using diagnostics for physics grids, ice  
 C       levels, land levels, etc. the different vertical coordinate  
 C       dimensions will have to be taken into account.  
   
 C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx  
         ctmp(1:5) = 'mul  '  
         DO i = 1,3  
           dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)  
           WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listId)  
           CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)  
           CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)  
   
 C         The following three ztmp() loops should eventually be modified  
 C         to reflect the fractional nature of levs(j,l) -- they should  
 C         do something like:  
 C            ztmp(j) = rC(INT(FLOOR(levs(j,l))))  
 C                      + ( rC(INT(FLOOR(levs(j,l))))  
 C                          + rC(INT(CEIL(levs(j,l)))) )  
 C                        / ( levs(j,l) - FLOOR(levs(j,l)) )  
 C         for averaged levels.  
           IF (i .EQ. 1) THEN  
             DO j = 1,nlevels(listId)  
               ztmp(j) = rC(NINT(levs(j,listId)))  
             ENDDO  
             CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',  
      &           'Dimensional coordinate value at the mid point',  
      &           myThid)  
           ELSEIF (i .EQ. 2) THEN  
             DO j = 1,nlevels(listId)  
               ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)) + 1)  
             ENDDO  
             CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',  
      &           'Dimensional coordinate value at the upper point',  
      &           myThid)  
           ELSEIF (i .EQ. 3) THEN  
             DO j = 1,nlevels(listId)  
               ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)))  
             ENDDO  
             CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',  
      &           'Dimensional coordinate value at the lower point',  
      &           myThid)  
           ENDIF  
           CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)  
           CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)  
           CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)  
         ENDDO  
 #endif /*  DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  */  
   
161        ENDIF        ENDIF
162          DO jj=1,jjMx
163    
164           IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
165             misValLoc = undefRL
166             IF ( misvalFlt(listId).NE.UNSET_RL )
167         &        misValLoc = misvalFlt(listId)
168             CALL DIAGNOSTICS_MNC_SET(
169         I                    nLevOutp, listId, jj,
170         O                    diag_mnc_bn, useMissingValue,
171         I                    misValLoc, myTime, myIter, myThid )
172           ENDIF
173  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
174    
175        DO md = 1,nfields(listId)  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
176    
177           DO md = 1,nfields(listId)
178          ndId = jdiag(md,listId)          ndId = jdiag(md,listId)
179          parms1 = gdiag(ndId)(1:8)          gcode = gdiag(ndId)(1:10)
180          IF ( idiag(md,listId).NE.0 .AND. parms1(5:5).NE.'D' ) THEN          mate = 0
181            mVec = 0
182            IF ( gcode(5:5).EQ.'C' ) THEN
183    C-      Check for Mate of a Counter Diagnostic
184               mate = hdiag(ndId)
185            ELSEIF ( gcode(1:1).EQ.'U' .OR. gcode(1:1).EQ.'V' ) THEN
186    C-      Check for Mate of a Vector Diagnostic
187               mVec = hdiag(ndId)
188            ENDIF
189            IF ( idiag(md,listId).NE.0 .AND. gcode(5:5).NE.'D' ) THEN
190  C--     Start processing 1 Fld :  C--     Start processing 1 Fld :
191    #ifdef ALLOW_MNC
192             DO ll=1,llMx
193              lm = jj+ll-1
194    #else
195             DO lm=1,averageCycle(listId)
196    #endif
197    
198            ip = ABS(idiag(md,listId))            ip = ABS(idiag(md,listId)) + kdiag(ndId)*(lm-1)
199            im = mdiag(md,listId)            im = mdiag(md,listId)
200              IF (mate.GT.0) im = im + kdiag(mate)*(lm-1)
201              IF (mVec.GT.0) im = im + kdiag(mVec)*(lm-1)
202    
203            IF ( ndiag(ip,1,1).EQ.0 ) THEN            IF ( ndiag(ip,1,1).EQ.0 ) THEN
204  C-        Empty diagnostics case :  C-        Empty diagnostics case :
205    
# Line 234  C-        Empty diagnostics case : Line 208  C-        Empty diagnostics case :
208       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter
209              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
210       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
211              WRITE(msgBuf,'(A,I4,3A,I3,2A)')              WRITE(msgBuf,'(A,I6,3A,I4,2A)')
212       &       '- WARNING -   diag.#',ndId, ' : ',flds(md,listId),       &       '- WARNING -   diag.#',ndId, ' : ',flds(md,listId),
213       &       ' (#',md,' ) in outp.Stream: ',fnames(listId)       &       ' (#',md,' ) in outp.Stream: ',fnames(listId)
214              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
215       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
216              WRITE(msgBuf,'(A,I2,A)')              IF ( averageCycle(listId).GT.1 ) THEN
217       &       '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',               WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
218       &       ndiag(ip,1,1), ' )'       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag(lm=',lm,')=',
219         &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
220                ELSE
221                 WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
222         &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',
223         &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
224                ENDIF
225              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
226       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
227              WRITE(msgBuf,'(A)')              WRITE(msgBuf,'(A)')
# Line 251  C-        Empty diagnostics case : Line 231  C-        Empty diagnostics case :
231              _END_MASTER( myThid )              _END_MASTER( myThid )
232              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
233                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
234                  DO k = 1,nlevels(listId)                  DO k = 1,nLevOutp
235                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy
236                      DO i = 1-OLx,sNx+OLx                      DO i = 1-OLx,sNx+OLx
237                        qtmp1(i,j,k,bi,bj) = 0. _d 0                        qtmp1(i,j,k,bi,bj) = 0. _d 0
# Line 264  C-        Empty diagnostics case : Line 244  C-        Empty diagnostics case :
244            ELSE            ELSE
245  C-        diagnostics is not empty :  C-        diagnostics is not empty :
246    
247              IF ( myThid.EQ.1 ) WRITE(ioUnit,'(A,I3,3A,I8,2A)')              IF ( debugLevel.GE.debLevB .AND. myThid.EQ.1 ) THEN
248                  WRITE(ioUnit,'(A,I6,3A,I8,2A)')
249       &         ' Computing Diagnostic # ', ndId, '  ', cdiag(ndId),       &         ' Computing Diagnostic # ', ndId, '  ', cdiag(ndId),
250       &         '     Counter:',ndiag(ip,1,1),'   Parms: ',gdiag(ndId)       &         '     Counter:',ndiag(ip,1,1),'   Parms: ',gdiag(ndId)
251                  IF ( mate.GT.0 ) THEN
252              IF ( parms1(5:5).EQ.'C' ) THEN                 WRITE(ioUnit,'(3A,I6,2A)')
 C             Check for Mate of a Counter Diagnostic  
 C             --------------------------------------  
               mate_index = parms1(6:8)  
               READ (mate_index,'(I3)') mate  
               IF ( myThid.EQ.1 ) WRITE(ioUnit,'(3A,I3,2A)')  
253       &         '       use Counter Mate for  ', cdiag(ndId),       &         '       use Counter Mate for  ', cdiag(ndId),
254       &         '     Diagnostic # ',mate, '  ', cdiag(mate)       &         '     Diagnostic # ',mate, '  ', cdiag(mate)
255                  ELSEIF ( mVec.GT.0 ) THEN
             ELSE  
               mate = 0  
   
 C             Check for Mate of a Vector Diagnostic  
 C             -------------------------------------  
               IF ( parms1(1:1).EQ.'U' .OR. parms1(1:1).EQ.'V' ) THEN  
                 mate_index = parms1(6:8)  
                 READ (mate_index,'(I3)') mVec  
256                  IF ( im.GT.0 .AND. ndiag(MAX(1,im),1,1).GT.0 ) THEN                  IF ( im.GT.0 .AND. ndiag(MAX(1,im),1,1).GT.0 ) THEN
257                   IF ( myThid.EQ.1 ) WRITE(ioUnit,'(3A,I3,3A)')                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
258       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
259       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
260       &             ' exists '       &             ' exists '
261                  ELSE                  ELSE
262                   IF ( myThid.EQ.1 ) WRITE(ioUnit,'(3A,I3,3A)')                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
263       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
264       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
265       &             ' not enabled'       &             ' not enabled'
# Line 299  C             -------------------------- Line 267  C             --------------------------
267                ENDIF                ENDIF
268              ENDIF              ENDIF
269    
270              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.' ' ) THEN
271               DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  C-       get only selected levels:
272                DO k = 1,nlevels(listId)                DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
273                  CALL GETDIAG(                 DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
274       I                       levs(k,listId),undef,                  DO k = 1,nlevels(listId)
275       O                       qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),                    kLev = NINT(levs(k,listId))
276       I                       ndId,mate,ip,im,bi,bj,myThid)                    CALL DIAGNOSTICS_GET_DIAG(
277         I                         kLev, undefRL,
278         O                         qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),
279         I                         ndId,mate,ip,im,bi,bj,myThid)
280                    ENDDO
281                   ENDDO
282                ENDDO                ENDDO
283               ENDDO              ELSE
284              ENDDO  C-       get all the levels (for vertical post-processing)
285                  DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
286  C-        end of empty diag / not empty block                 DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
287            ENDIF                    CALL DIAGNOSTICS_GET_DIAG(
288         I                         0, undefRL,
289            nlevsout = nlevels(listId)       O                         qtmp1(1-OLx,1-OLy,1,bi,bj),
290         I                         ndId,mate,ip,im,bi,bj,myThid)
291                   ENDDO
292                  ENDDO
293                ENDIF
294    
295  C-----------------------------------------------------------------------  C-----------------------------------------------------------------------
296  C             Check to see if we need to interpolate before output  C--     Apply specific post-processing (e.g., interpolate) before output
297  C-----------------------------------------------------------------------  C-----------------------------------------------------------------------
298  C  (we are still inside field exist if sequence and field do loop)              IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'P' ) THEN
299  C  C-          Do vertical interpolation:
300                 IF ( fluidIsAir ) THEN
301           if(fflags(listId)(2:2).eq.'P') then  C jmc: for now, this can only work in an atmospheric set-up (fluidIsAir);
302                  CALL DIAGNOSTICS_INTERP_VERT(
303  c If nonlinear free surf is active, need averaged pressures       I                         listId, md, ndId, ip, im, lm,
304  #ifdef NONLIN_FRSURF       U                         qtmp1, qtmp2,
305            if(select_rStar.GT.0)then       I                         undefRL, myTime, myIter, myThid )
306             call diagnostics_get_pointers('RSURF   ',ipoint1,jpoint1,               ELSE
307       .                                                           myThid)                 WRITE(msgBuf,'(2A)') 'DIAGNOSTICS_OUT: ',
308             call diagnostics_get_pointers('PRESSURE',ipoint2,jpoint2,       &           'INTERP_VERT not allowed in this config'
309       .                                                           myThid)                 CALL PRINT_ERROR( msgBuf , myThid )
310  C if fizhi is being  used, may need to get physics grid pressures                 STOP 'ABNORMAL END: S/R DIAGNOSTICS_OUT'
311  #ifdef ALLOW_FIZHI               ENDIF
312             if(gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'L')then              ENDIF
313             call diagnostics_get_pointers('FIZPRES ',ipoint2,jpoint2,              IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'I' ) THEN
314       .                                                           myThid)  C-          Integrate vertically: for now, output field has just 1 level:
315             endif                CALL DIAGNOSTICS_SUM_LEVELS(
316  #endif       I                         listId, md, ndId, ip, im, lm,
317             if( jpoint1.ne.0 .and. jpoint2.ne.0) foundp = .true.       U                         qtmp1,
318         I                         undefRL, myTime, myIter, myThid )
319             if(.not. foundp) then              ENDIF
             WRITE(msgBuf,'(3A)') 'DIAGNOSTICS_OUT: ',  
      .    ' Have asked for pressure interpolation but have not ',  
      .    ' Activated surface and 3D pressure diagnostic, ',  
      .    ' RSURF and PRESSURE'  
             CALL PRINT_ERROR( msgBuf , myThid )  
             STOP 'ABNORMAL END: S/R DIAGNOSTICS_OUT'  
            endif  
   
            DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)  
             DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  
              call getdiag(1,undef,qtmpsrf(1-OLx,1-OLy,bi,bj),  
      .                       jpoint1,0,ipoint1,0,bi,bj,myThid)  
             ENDDO  
            ENDDO  
            DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)  
             DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  
              DO k = 1,nlevels(listId)  
               call getdiag(levs(k,listId),undef,  
      .          qtmp2(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),jpoint2,0,ipoint2,0,  
      .          bi,bj,myThid)  
              ENDDO  
             ENDDO  
            ENDDO  
           endif  
 #else  
 C If nonlinear free surf is off, get pressures from rC and rF arrays  
           DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)  
            DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  
             DO j = 1-OLy,sNy+OLy  
              DO i = 1-OLx,sNx+OLx  
               qtmpsrf(i,j,bi,bj) = rF(1)  
              ENDDO  
             ENDDO  
             DO j = 1-OLy,sNy+OLy  
              DO i = 1-OLx,sNx+OLx  
               DO k = 1,nlevels(listId)  
                qtmp2(i,j,k,bi,bj) = rC(k)  
               ENDDO  
              ENDDO  
             ENDDO  
            ENDDO  
           ENDDO  
 #endif  
 C Load p to the kappa into a temporary array  
           nlevsout = nplevs  
           DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)  
            DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  
             DO j = 1,sNy  
              DO i = 1,sNx  
               pksrf(i,j) = qtmpsrf(i,j,bi,bj) ** kappa  
               DO k = 1,nlevels(listId)  
                if(gdiag(ndId)(10:10).eq.'R') then  
                 if(hFacC(i,j,nlevels(listId)-k+1,bi,bj).ne.0.) then  
                  qinp(i,j,k) =  qtmp1(i,j,nlevels(listId)-k+1,bi,bj)  
                 else  
                  qinp(i,j,k) =  undef  
                 endif  
                 pkz(i,j,k) = qtmp2(i,j,nlevels(listId)-k+1,bi,bj)**kappa  
                elseif(gdiag(ndId)(10:10).eq.'L') then  
                 qinp(i,j,k) =  qtmp1(i,j,k,bi,bj)  
                 pkz(i,j,k) = qtmp2(i,j,k,bi,bj)**kappa  
                endif  
               ENDDO  
              ENDDO  
             ENDDO  
   
             DO k = 1,nplevs  
              if(fflags(listId)(3:3).eq.'1') then  
               p = plevs1(k)  
              elseif(fflags(listId)(3:3).eq.'2')then  
               p = plevs2(k)  
              endif  
              call prestopres(qprs(1,1,k),qinp,pkz,pksrf,0.,p,sNx,sNy,  
      .                                                 nlevels(listId) )  
             ENDDO  
320    
321              DO j = 1,sNy  C--     End of empty diag / not-empty diag block
322               DO i = 1,sNx            ENDIF
               DO k = 1,nlevsout  
                qtmp1(i,j,k,bi,bj) =  qprs(i,j,k)  
                if(qtmp1(i,j,k,bi,bj).eq.undef) qtmp1(i,j,k,bi,bj) = 0.  
               ENDDO  
              ENDDO  
             ENDDO  
            ENDDO  
           ENDDO  
323    
324           endif  C--     Ready to write field "md", element "lm" in averageCycle(listId)
325    
326  #ifdef ALLOW_MDSIO  C-        write to binary file, using MDSIO pkg:
327  C         Prepare for mdsio optionality            IF ( diag_mdsio ) THEN
328            IF (diag_mdsio) THEN              nRec = lm + (md-1)*averageCycle(listId)
329              IF (fflags(listId)(1:1) .EQ. ' ') THEN  C           default precision for output files
330  C             This is the old default behavior              prec = writeBinaryPrec
331                CALL MDSWRITEFIELD_NEW(fn,writeBinaryPrec,glf,'RL',  C           fFlag(1)=R(or D): force it to be 32-bit(or 64) precision
332       &             Nr+Nrphys,nlevsout,qtmp1,md,myIter,myThid)              IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'R' ) prec = precFloat32
333              ELSEIF (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'R') THEN              IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'D' ) prec = precFloat64
334  C             Force it to be 32-bit precision  C         a hack not to write meta files now: pass -nRec < 0 to MDS_WRITE S/R
335                CALL MDSWRITEFIELD_NEW(fn,precFloat32,glf,'RL',              CALL WRITE_REC_LEV_RL(
336       &             Nr+Nrphys,nlevsout,qtmp1,md,myIter,myThid)       I                            fn, prec,
337              ELSEIF (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'D') THEN       I                            NrMax, 1, nLevOutp,
338  C             Force it to be 64-bit precision       I                            qtmp1, -nRec, myIter, myThid )
               CALL MDSWRITEFIELD_NEW(fn,precFloat64,glf,'RL',  
      &             Nr+Nrphys,nlevsout,qtmp1,md,myIter,myThid)  
             ENDIF  
339            ENDIF            ENDIF
 #endif /*  ALLOW_MDSIO  */  
340    
341  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
342            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
343                CALL DIAGNOSTICS_MNC_OUT(
344              _BEGIN_MASTER( myThid )       I                       NrMax, nLevOutp, listId, ndId,
345         I                       diag_mnc_bn,
346              DO ii = 1,CW_DIMS       I                       useMissingValue, misValLoc,
347                d_cw_name(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)       I                       qtmp1,
348                dn(ii)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)       I                       myTime, myIter, myThid )
             ENDDO  
   
 C           Note that the "d_cw_name" variable is a hack that hides a  
 C           subtlety within MNC.  Basically, each MNC-wrapped file is  
 C           caching its own concept of what each "grid name" (that is, a  
 C           dimension group name) means.  So one cannot re-use the same  
 C           "grid" name for different collections of dimensions within a  
 C           given file.  By appending the "ndId" values to each name, we  
 C           guarantee uniqueness within each MNC-produced file.  
             WRITE(d_cw_name,'(a,i6.6)') 'd_cw_',ndId  
   
 C           XY dimensions  
             dim(1)       = sNx + 2*OLx  
             dim(2)       = sNy + 2*OLy  
             ib(1)        = OLx + 1  
             ib(2)        = OLy + 1  
             IF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'M') THEN  
               dn(1)(1:2) = 'X'  
               ie(1)      = OLx + sNx  
               dn(2)(1:2) = 'Y'  
               ie(2)      = OLy + sNy  
             ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'U') THEN  
               dn(1)(1:3) = 'Xp1'  
               ie(1)      = OLx + sNx + 1  
               dn(2)(1:2) = 'Y'  
               ie(2)      = OLy + sNy  
             ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'V') THEN  
               dn(1)(1:2) = 'X'  
               ie(1)      = OLx + sNx  
               dn(2)(1:3) = 'Yp1'  
               ie(2)      = OLy + sNy + 1  
             ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'Z') THEN  
               dn(1)(1:3) = 'Xp1'  
               ie(1)      = OLx + sNx + 1  
               dn(2)(1:3) = 'Yp1'  
               ie(2)      = OLy + sNy + 1  
             ENDIF  
               
 C           Z is special since it varies  
             WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zd', nlevels(listId)  
             IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')  
      &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'M') ) THEN  
               WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)  
             ENDIF  
             IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')  
      &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'L') ) THEN  
               WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zld', nlevels(listId)  
             ENDIF  
             IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')  
      &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'U') ) THEN  
               WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zud', nlevels(listId)  
             ENDIF  
             dim(3) = Nr+Nrphys  
             ib(3)  = 1  
             ie(3)  = nlevels(listId)  
   
 C           Time dimension  
             dn(4)(1:1) = 'T'  
             dim(4) = -1  
             ib(4)  = 1  
             ie(4)  = 1  
   
             CALL MNC_CW_ADD_GNAME(d_cw_name, 4,  
      &             dim, dn, ib, ie, myThid)  
             CALL MNC_CW_ADD_VNAME(cdiag(ndId), d_cw_name,  
      &             4,5, myThid)  
             CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'description',  
      &             tdiag(ndId),myThid)  
             CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'units',  
      &             udiag(ndId),myThid)  
   
             IF ((fflags(listId)(1:1) .EQ. ' ')  
      &           .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'R')) THEN  
               CALL MNC_CW_RL_W('R',diag_mnc_bn,0,0,  
      &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)  
             ELSEIF (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'D') THEN  
               CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,  
      &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)  
             ENDIF  
               
             CALL MNC_CW_DEL_VNAME(cdiag(ndId), myThid)  
             CALL MNC_CW_DEL_GNAME(d_cw_name, myThid)  
   
             _END_MASTER( myThid )  
   
349            ENDIF            ENDIF
350  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
351    
352    C--      end loop on lm (or ll if ALLOW_MNC) counter
353             ENDDO
354  C--     end of Processing Fld # md  C--     end of Processing Fld # md
355          ENDIF          ENDIF
356           ENDDO
357    
358    #ifdef ALLOW_MNC
359    C--   end loop on jj counter
360        ENDDO        ENDDO
361    #endif
362    
363    #ifdef ALLOW_MDSIO
364          IF (diag_mdsio) THEN
365    C-    Note: temporary: since it is a pain to add more arguments to
366    C     all MDSIO S/R, uses instead this specific S/R to write only
367    C     meta files but with more informations in it.
368                glf = globalFiles
369                nRec = nfields(listId)*averageCycle(listId)
370                CALL MDS_WR_METAFILES(fn, prec, glf, .FALSE.,
371         &              0, 0, nLevOutp, ' ',
372         &              nfields(listId), flds(1,listId), nTimRec, timeRec,
373         &              nRec, myIter, myThid)
374          ENDIF
375    #endif /*  ALLOW_MDSIO  */
376    
377        RETURN        RETURN
378        END        END
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