/[MITgcm]/MITgcm/pkg/diagnostics/diagnostics_out.F
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revision 1.17 by molod, Tue Jul 12 20:25:45 2005 UTC revision 1.56 by jmc, Thu Jun 23 15:29:01 2011 UTC
# Line 8  CBOP 0 Line 8  CBOP 0
8  C     !ROUTINE: DIAGNOSTICS_OUT  C     !ROUTINE: DIAGNOSTICS_OUT
9    
10  C     !INTERFACE:  C     !INTERFACE:
11        SUBROUTINE  DIAGNOSTICS_OUT(        SUBROUTINE DIAGNOSTICS_OUT(
12       I     listId,       I     listId,
      I     myIter,  
13       I     myTime,       I     myTime,
14         I     myIter,
15       I     myThid )       I     myThid )
16    
17  C     !DESCRIPTION:  C     !DESCRIPTION:
# Line 26  C     !USES: Line 26  C     !USES:
26  #include "DIAGNOSTICS_SIZE.h"  #include "DIAGNOSTICS_SIZE.h"
27  #include "DIAGNOSTICS.h"  #include "DIAGNOSTICS.h"
28    
29  #ifdef ALLOW_FIZHI        INTEGER NrMax
30  #include "fizhi_SIZE.h"        PARAMETER( NrMax = numLevels )
 #else  
       INTEGER Nrphys  
       PARAMETER (Nrphys=0)  
 #endif  
   
31    
32  C     !INPUT PARAMETERS:  C     !INPUT PARAMETERS:
33  C     listId  :: Diagnostics list number being written  C     listId  :: Diagnostics list number being written
# Line 43  C     myThid  :: my Thread Id number Line 38  C     myThid  :: my Thread Id number
38        INTEGER listId, myIter, myThid        INTEGER listId, myIter, myThid
39  CEOP  CEOP
40    
41    C     !FUNCTIONS:
42          INTEGER ILNBLNK
43          EXTERNAL ILNBLNK
44    #ifdef ALLOW_FIZHI
45          _RL   getcon
46          EXTERNAL getcon
47    #endif
48    
49  C     !LOCAL VARIABLES:  C     !LOCAL VARIABLES:
50  C     i,j,k :: loop indices  C     i,j,k :: loop indices
51    C     bi,bj :: tile indices
52    C     lm    :: loop index (averageCycle)
53  C     md    :: field number in the list "listId".  C     md    :: field number in the list "listId".
54  C     ndId  :: diagnostics  Id number (in available diagnostics list)  C     ndId  :: diagnostics  Id number (in available diagnostics list)
55  C     mate  :: counter mate Id number (in available diagnostics list)  C     mate  :: counter mate Id number (in available diagnostics list)
56  C     ip    :: diagnostics  pointer to storage array  C     ip    :: diagnostics  pointer to storage array
57  C     im    :: counter-mate pointer to storage array  C     im    :: counter-mate pointer to storage array
58        INTEGER i, j, k  C     nLevOutp :: number of levels to write in output file
59    C
60    C--   COMMON /LOCAL_DIAGNOSTICS_OUT/ local common block (for multi-threaded)
61    C     qtmp1 :: temporary array; used to store a copy of diag. output field.
62    C     qtmp2 :: temporary array; used to store a copy of a 2nd diag. field.
63    C-  Note: local common block no longer needed.
64    c     COMMON /LOCAL_DIAGNOSTICS_OUT/ qtmp1
65          _RL qtmp1(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,NrMax,nSx,nSy)
66          _RL qtmp2(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,NrMax,nSx,nSy)
67    
68          INTEGER i, j, k, lm
69        INTEGER bi, bj        INTEGER bi, bj
70        INTEGER md, ndId, ip, im        INTEGER md, ndId, nn, ip, im
71        INTEGER mate, mVec        INTEGER mate, mDbl, mVec
72        CHARACTER*8 parms1        CHARACTER*10 gcode
73        CHARACTER*3 mate_index        _RL undefRL
74        _RL qtmp1(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr+Nrphys,nSx,nSy)        INTEGER nLevOutp, kLev
       _RL qtmpsrf(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,nSx,nSy)  
       _RL qtmp2(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr+Nrphys,nSx,nSy)  
       _RL undef, getcon  
       EXTERNAL getcon  
       INTEGER ILNBLNK  
       EXTERNAL ILNBLNK  
       INTEGER ilen  
       integer nlevsout,nplevs  
       parameter(nplevs = 16)  
       _RL plevs1(nplevs)  
       data plevs1/ 1000.0 _d 2, 925.0 _d 2, 850.0 _d 2, 700.0 _d 2,  
      .              600.0 _d 2, 500.0 _d 2, 400.0 _d 2, 300.0 _d 2,  
      .              250.0 _d 2, 200.0 _d 2, 150.0 _d 2, 100.0 _d 2,  
      .               70.0 _d 2,  50.0 _d 2,  30.0 _d 2,  20.0 _d 2/  
       _RL plevs2(nplevs)  
       data plevs2/ 1000.0 _d 2, 950.0 _d 2, 900.0 _d 2, 850.0 _d 2,  
      .              800.0 _d 2, 750.0 _d 2, 700.0 _d 2, 600.0 _d 2,  
      .              500.0 _d 2, 400.0 _d 2, 300.0 _d 2, 250.0 _d 2,  
      .              200.0 _d 2, 150.0 _d 2, 100.0 _d 2,  50.0 _d 2/  
       _RL qprs(sNx,sNy,nplevs)  
       _RL qinp(sNx,sNy,Nr+Nrphys)  
       _RL pkz(sNx,sNy,Nr+Nrphys)  
       _RL pksrf(sNx,sNy)  
       _RL p  
       INTEGER jpoint1,ipoint1  
       INTEGER jpoint2,ipoint2  
       _RL kappa  
       logical foundp  
       data foundp /.false./  
75    
76          INTEGER iLen
77        INTEGER ioUnit        INTEGER ioUnit
78        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) fn        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) fn
79        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff
80        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf
81          INTEGER prec, nRec, nTimRec
82          _RL     timeRec(2)
83          _RL     tmpLoc
84    #ifdef ALLOW_MDSIO
85        LOGICAL glf        LOGICAL glf
86    #endif
87  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
       INTEGER ii  
88        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn
89        CHARACTER*(5) ctmp        LOGICAL missingValFillsMask
       INTEGER CW_DIMS, NLEN  
       PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )  
       PARAMETER ( NLEN    = 80 )  
       INTEGER dim(CW_DIMS), ib(CW_DIMS), ie(CW_DIMS)  
       CHARACTER*(NLEN) dn(CW_DIMS)  
       CHARACTER*(NLEN) d_cw_name  
       CHARACTER*(NLEN) dn_blnk  
       _RS ztmp(Nr+Nrphys)  
90  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
91    
92  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
93    
94    C---  set file properties
95        ioUnit= standardMessageUnit        ioUnit= standardMessageUnit
96        undef = getcon('UNDEF')        undefRL = UNSET_RL
97        kappa = getcon('KAPPA')  #ifdef ALLOW_FIZHI
98        glf = globalFiles        IF ( useFIZHI ) undefRL = getcon('UNDEF')
99    #endif
100          IF ( misvalFlt(listId).NE.UNSET_RL ) undefRL = misvalFlt(listId)
101    
102        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter
103        ilen = ILNBLNK(fnames(listId))        iLen = ILNBLNK(fnames(listId))
104        WRITE( fn, '(A,A,A)' ) fnames(listId)(1:ilen),'.',suff(1:10)        WRITE( fn, '(A,A,A)' ) fnames(listId)(1:iLen),'.',suff(1:10)
105    C-    for now, if integrate vertically, output field has just 1 level:
106          nLevOutp = nlevels(listId)
107          IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'I' ) nLevOutp = 1
108    
109    C--   Set time information:
110          IF ( freq(listId).LT.0. ) THEN
111    C-    Snap-shot: store a unique time (which is consistent with State-Var timing)
112            nTimRec = 1
113            timeRec(1) = myTime
114          ELSE
115    C-    Time-average: store the 2 edges of the time-averaging interval.
116    C      this time is consitent with intermediate Var (i.e., non-state, e.g, flux,
117    C      tendencies) timing. For State-Var, this is shifted by + halt time-step.
118            nTimRec = 2
119    
120    C-    end of time-averaging interval:
121            timeRec(2) = myTime
122    
123    C-    begining of time-averaging interval:
124    c       timeRec(1) = myTime - freq(listId)
125    C     a) find the time of the previous multiple of output freq:
126            timeRec(1) = myTime-deltaTClock*0.5 _d 0
127            timeRec(1) = (timeRec(1)-phase(listId))/freq(listId)
128            i = INT( timeRec(1) )
129            IF ( timeRec(1).LT.0. ) THEN
130              tmpLoc = FLOAT(i)
131              IF ( timeRec(1).NE.tmpLoc ) i = i - 1
132            ENDIF
133            timeRec(1) = phase(listId) + freq(listId)*FLOAT(i)
134    c       if ( listId.eq.2 ) write(0,*) 'f',i,timeRec(1)/deltaTClock
135            timeRec(1) = MAX( timeRec(1), startTime )
136    
137    C     b) round off to nearest multiple of time-step:
138            timeRec(1) = (timeRec(1)-baseTime)/deltaTClock
139            i = NINT( timeRec(1) )
140    C     if just half way, NINT will return the next time-step: correct this
141            tmpLoc = FLOAT(i) - 0.5 _d 0
142            IF ( timeRec(1).EQ.tmpLoc ) i = i - 1
143            timeRec(1) = baseTime + deltaTClock*FLOAT(i)
144    c       if ( listId.eq.2 ) write(0,*) i,timeRec(1)/deltaTClock
145          ENDIF
146    C--   Convert time to iteration number (debug)
147    c     DO i=1,nTimRec
148    c       timeRec(i) = timeRec(i)/deltaTClock
149    c     ENDDO
150    
151  C Initialize the qtmp1 array to all undefs -- need this for unfilled levels  C--   Place the loop on lm (= averagePeriod) outside the loop on md (= field):
152        DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)        DO lm=1,averageCycle(listId)
         DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  
           DO k = 1,nlevels(listId)  
             DO j = 1-OLy,sNy+OLy  
               DO i = 1-OLx,sNx+OLx  
                 qtmp1(i,j,k,bi,bj) = undef  
               ENDDO  
             ENDDO  
           ENDDO  
         ENDDO  
       ENDDO  
153    
154  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
155        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN         IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
156          DO i = 1,MAX_LEN_FNAM           CALL DIAGNOSTICS_MNC_SET(
157            diag_mnc_bn(i:i) = ' '       I                    nLevOutp, listId, lm,
158          ENDDO       O                    diag_mnc_bn, missingValFillsMask,
159          DO i = 1,NLEN       I                    undefRL, myTime, myIter, myThid )
160            dn_blnk(i:i) = ' '         ENDIF
         ENDDO  
         WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) fnames(listId)(1:ilen)  
   
 C       Update the record dimension by writing the iteration number  
         CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)  
         CALL MNC_CW_RL_W_S('D',diag_mnc_bn,0,0,'T',myTime,myThid)  
         CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)  
   
         dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)  
         WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)  
         dim(1) = nlevels(listId)  
         ib(1)  = 1  
         ie(1)  = nlevels(listId)  
   
         CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,  
      &       dim, dn, ib, ie, myThid)  
         CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',  
      &       0,0, myThid)  
         CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',  
      &       'Idicies of vertical levels within the source arrays',  
      &       myThid)  
           
         CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,  
      &       'diag_levels', levs(1,listId), myThid)  
   
         CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)  
         CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)  
   
 #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  
 C       This part has been placed in an #ifdef because, as its currently  
 C       written, it will only work with variables defined on a dynamics  
 C       grid.  As we start using diagnostics for physics grids, ice  
 C       levels, land levels, etc. the different vertical coordinate  
 C       dimensions will have to be taken into account.  
   
 C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx  
         ctmp(1:5) = 'mul  '  
         DO i = 1,3  
           dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)  
           WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listId)  
           CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)  
           CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)  
   
 C         The following three ztmp() loops should eventually be modified  
 C         to reflect the fractional nature of levs(j,l) -- they should  
 C         do something like:  
 C            ztmp(j) = rC(INT(FLOOR(levs(j,l))))  
 C                      + ( rC(INT(FLOOR(levs(j,l))))  
 C                          + rC(INT(CEIL(levs(j,l)))) )  
 C                        / ( levs(j,l) - FLOOR(levs(j,l)) )  
 C         for averaged levels.  
           IF (i .EQ. 1) THEN  
             DO j = 1,nlevels(listId)  
               ztmp(j) = rC(NINT(levs(j,listId)))  
             ENDDO  
             CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',  
      &           'Dimensional coordinate value at the mid point',  
      &           myThid)  
           ELSEIF (i .EQ. 2) THEN  
             DO j = 1,nlevels(listId)  
               ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)) + 1)  
             ENDDO  
             CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',  
      &           'Dimensional coordinate value at the upper point',  
      &           myThid)  
           ELSEIF (i .EQ. 3) THEN  
             DO j = 1,nlevels(listId)  
               ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)))  
             ENDDO  
             CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',  
      &           'Dimensional coordinate value at the lower point',  
      &           myThid)  
           ENDIF  
           CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)  
           CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)  
           CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)  
         ENDDO  
 #endif /*  DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  */  
   
       ENDIF  
161  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
162    
163        DO md = 1,nfields(listId)  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
164    
165           DO md = 1,nfields(listId)
166          ndId = jdiag(md,listId)          ndId = jdiag(md,listId)
167          parms1 = gdiag(ndId)(1:8)          gcode = gdiag(ndId)(1:10)
168          IF ( idiag(md,listId).NE.0 .AND. parms1(5:5).NE.'D' ) THEN          mate = 0
169            mVec = 0
170            mDbl = 0
171            IF ( gcode(5:5).EQ.'C' ) THEN
172    C-      Check for Mate of a Counter Diagnostic
173               mate = hdiag(ndId)
174            ELSEIF ( gcode(5:5).EQ.'P' ) THEN
175    C-      Also load the mate (if stored) for Post-Processing
176               nn = ndId
177               DO WHILE ( gdiag(nn)(5:5).EQ.'P' )
178                 nn = hdiag(nn)
179               ENDDO
180               IF ( mdiag(md,listId).NE.0 ) mDbl = hdiag(nn)
181            ELSEIF ( gcode(1:1).EQ.'U' .OR. gcode(1:1).EQ.'V' ) THEN
182    C-      Check for Mate of a Vector Diagnostic
183               mVec = hdiag(ndId)
184            ENDIF
185            IF ( idiag(md,listId).NE.0 .AND. gcode(5:5).NE.'D' ) THEN
186  C--     Start processing 1 Fld :  C--     Start processing 1 Fld :
187    
188            ip = ABS(idiag(md,listId))            ip = ABS(idiag(md,listId)) + kdiag(ndId)*(lm-1)
189            im = mdiag(md,listId)            im = mdiag(md,listId)
190              IF (mate.GT.0) im = im + kdiag(mate)*(lm-1)
191              IF (mDbl.GT.0) im = im + kdiag(mDbl)*(lm-1)
192              IF (mVec.GT.0) im = im + kdiag(mVec)*(lm-1)
193    
194            IF ( ndiag(ip,1,1).EQ.0 ) THEN            IF ( ndiag(ip,1,1).EQ.0 ) THEN
195  C-        Empty diagnostics case :  C-        Empty diagnostics case :
196    
# Line 234  C-        Empty diagnostics case : Line 199  C-        Empty diagnostics case :
199       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter
200              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
201       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
202              WRITE(msgBuf,'(A,I4,3A,I3,2A)')              WRITE(msgBuf,'(A,I6,3A,I4,2A)')
203       &       '- WARNING -   diag.#',ndId, ' : ',flds(md,listId),       &       '- WARNING -   diag.#',ndId, ' : ',flds(md,listId),
204       &       ' (#',md,' ) in outp.Stream: ',fnames(listId)       &       ' (#',md,' ) in outp.Stream: ',fnames(listId)
205              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
206       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
207              WRITE(msgBuf,'(A,I2,A)')              IF ( averageCycle(listId).GT.1 ) THEN
208       &       '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',               WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
209       &       ndiag(ip,1,1), ' )'       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag(lm=',lm,')=',
210         &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
211                ELSE
212                 WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
213         &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',
214         &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
215                ENDIF
216              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
217       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
218              WRITE(msgBuf,'(A)')              WRITE(msgBuf,'(A)')
# Line 251  C-        Empty diagnostics case : Line 222  C-        Empty diagnostics case :
222              _END_MASTER( myThid )              _END_MASTER( myThid )
223              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
224                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
225                  DO k = 1,nlevels(listId)                  DO k = 1,nLevOutp
226                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy
227                      DO i = 1-OLx,sNx+OLx                      DO i = 1-OLx,sNx+OLx
228                        qtmp1(i,j,k,bi,bj) = 0. _d 0                        qtmp1(i,j,k,bi,bj) = 0. _d 0
# Line 264  C-        Empty diagnostics case : Line 235  C-        Empty diagnostics case :
235            ELSE            ELSE
236  C-        diagnostics is not empty :  C-        diagnostics is not empty :
237    
238              IF ( myThid.EQ.1 ) WRITE(ioUnit,'(A,I3,3A,I8,2A)')              IF ( debugLevel.GE.debLevB .AND. myThid.EQ.1 ) THEN
239                  IF ( gcode(5:5).EQ.'P' ) THEN
240                   WRITE(ioUnit,'(A,I6,7A,I8,2A)')
241         &         ' Post-Processing Diag # ', ndId, '  ', cdiag(ndId),
242         &         '   Parms: ',gdiag(ndId)
243                   IF ( mDbl.EQ.0 ) THEN
244                    WRITE(ioUnit,'(2(3A,I6,A,I8))') '   from diag: ',
245         &            cdiag(nn), ' (#', nn, ') Cnt=', ndiag(ip,1,1)
246                   ELSE
247                    WRITE(ioUnit,'(2(3A,I6,A,I8))') '   from diag: ',
248         &            cdiag(nn), ' (#', nn, ') Cnt=', ndiag(ip,1,1),
249         &          ' and diag: ',
250         &            cdiag(mDbl),' (#',mDbl,') Cnt=',ndiag(im,1,1)
251                   ENDIF
252                  ELSE
253                   WRITE(ioUnit,'(A,I6,3A,I8,2A)')
254       &         ' Computing Diagnostic # ', ndId, '  ', cdiag(ndId),       &         ' Computing Diagnostic # ', ndId, '  ', cdiag(ndId),
255       &         '     Counter:',ndiag(ip,1,1),'   Parms: ',gdiag(ndId)       &         '     Counter:',ndiag(ip,1,1),'   Parms: ',gdiag(ndId)
256                  ENDIF
257              IF ( parms1(5:5).EQ.'C' ) THEN                IF ( mate.GT.0 ) THEN
258  C             Check for Mate of a Counter Diagnostic                 WRITE(ioUnit,'(3A,I6,2A)')
 C             --------------------------------------  
               mate_index = parms1(6:8)  
               READ (mate_index,'(I3)') mate  
               IF ( myThid.EQ.1 ) WRITE(ioUnit,'(3A,I3,2A)')  
259       &         '       use Counter Mate for  ', cdiag(ndId),       &         '       use Counter Mate for  ', cdiag(ndId),
260       &         '     Diagnostic # ',mate, '  ', cdiag(mate)       &         '     Diagnostic # ',mate, '  ', cdiag(mate)
261                  ELSEIF ( mVec.GT.0 ) THEN
             ELSE  
               mate = 0  
   
 C             Check for Mate of a Vector Diagnostic  
 C             -------------------------------------  
               IF ( parms1(1:1).EQ.'U' .OR. parms1(1:1).EQ.'V' ) THEN  
                 mate_index = parms1(6:8)  
                 READ (mate_index,'(I3)') mVec  
262                  IF ( im.GT.0 .AND. ndiag(MAX(1,im),1,1).GT.0 ) THEN                  IF ( im.GT.0 .AND. ndiag(MAX(1,im),1,1).GT.0 ) THEN
263                   IF ( myThid.EQ.1 ) WRITE(ioUnit,'(3A,I3,3A)')                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
264       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
265       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
266       &             ' exists '       &             ' exists '
267                  ELSE                  ELSE
268                   IF ( myThid.EQ.1 ) WRITE(ioUnit,'(3A,I3,3A)')                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
269       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
270       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
271       &             ' not enabled'       &             ' not enabled'
# Line 299  C             -------------------------- Line 273  C             --------------------------
273                ENDIF                ENDIF
274              ENDIF              ENDIF
275    
276              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.' ' ) THEN
277               DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  C-       get only selected levels:
278                DO k = 1,nlevels(listId)                DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
279                  CALL GETDIAG(                 DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
280       I                       levs(k,listId),undef,                  DO k = 1,nlevels(listId)
281       O                       qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),                    kLev = NINT(levs(k,listId))
282       I                       ndId,mate,ip,im,bi,bj,myThid)                    CALL DIAGNOSTICS_GET_DIAG(
283         I                         kLev, undefRL,
284         O                         qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),
285         I                         ndId, mate, ip, im, bi, bj, myThid )
286                    ENDDO
287                   ENDDO
288                ENDDO                ENDDO
289               ENDDO                IF ( mDbl.GT.0 ) THEN
290              ENDDO                 DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
291                    DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
292  C-        end of empty diag / not empty block                   DO k = 1,nlevels(listId)
293            ENDIF                    kLev = NINT(levs(k,listId))
294                      CALL DIAGNOSTICS_GET_DIAG(
295            nlevsout = nlevels(listId)       I                         kLev, undefRL,
296         O                         qtmp2(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),
297         I                         mDbl, 0, im, 0, bi, bj, myThid )
298                     ENDDO
299                    ENDDO
300                   ENDDO
301                  ENDIF
302                ELSE
303    C-       get all the levels (for vertical post-processing)
304                  DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
305                   DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
306                      CALL DIAGNOSTICS_GET_DIAG(
307         I                         0, undefRL,
308         O                         qtmp1(1-OLx,1-OLy,1,bi,bj),
309         I                         ndId, mate, ip, im, bi, bj, myThid )
310                   ENDDO
311                  ENDDO
312                  IF ( mDbl.GT.0 ) THEN
313                   DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
314                    DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
315                     DO k = 1,nlevels(listId)
316                      CALL DIAGNOSTICS_GET_DIAG(
317         I                         0, undefRL,
318         O                         qtmp2(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),
319         I                         mDbl, 0, im, 0, bi, bj, myThid )
320                     ENDDO
321                    ENDDO
322                   ENDDO
323                  ENDIF
324                ENDIF
325    
326  C-----------------------------------------------------------------------  C-----------------------------------------------------------------------
327  C             Check to see if we need to interpolate before output  C--     Apply specific post-processing (e.g., interpolate) before output
328  C-----------------------------------------------------------------------  C-----------------------------------------------------------------------
329  C  (we are still inside field exist if sequence and field do loop)              IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'P' ) THEN
330  C  C-          Do vertical interpolation:
331                 IF ( fluidIsAir ) THEN
332           if(fflags(listId)(2:2).eq.'P') then  C jmc: for now, this can only work in an atmospheric set-up (fluidIsAir);
333                  CALL DIAGNOSTICS_INTERP_VERT(
334  c If nonlinear free surf is active, need averaged pressures       I                         listId, md, ndId, ip, im, lm,
335  #ifdef NONLIN_FRSURF       U                         qtmp1, qtmp2,
336            if(select_rStar.GT.0)then       I                         undefRL, myTime, myIter, myThid )
337             call diagnostics_get_pointers('RSURF   ',ipoint1,jpoint1,               ELSE
338       .                                                           myThid)                 WRITE(msgBuf,'(2A)') 'DIAGNOSTICS_OUT: ',
339             call diagnostics_get_pointers('PRESSURE',ipoint2,jpoint2,       &           'INTERP_VERT not allowed in this config'
340       .                                                           myThid)                 CALL PRINT_ERROR( msgBuf , myThid )
341  C if fizhi is being  used, may need to get physics grid pressures                 STOP 'ABNORMAL END: S/R DIAGNOSTICS_OUT'
342  #ifdef ALLOW_FIZHI               ENDIF
343             if(gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'L')then              ENDIF
344             call diagnostics_get_pointers('FIZPRES ',ipoint2,jpoint2,              IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'I' ) THEN
345       .                                                           myThid)  C-          Integrate vertically: for now, output field has just 1 level:
346             endif                CALL DIAGNOSTICS_SUM_LEVELS(
347  #endif       I                         listId, md, ndId, ip, im, lm,
348             if( jpoint1.ne.0 .and. jpoint2.ne.0) foundp = .true.       U                         qtmp1,
349         I                         undefRL, myTime, myIter, myThid )
350             if(.not. foundp) then              ENDIF
351              WRITE(msgBuf,'(3A)') 'DIAGNOSTICS_OUT: ',              IF ( gcode(5:5).EQ.'P' ) THEN
352       .    ' Have asked for pressure interpolation but have not ',  C-          Do Post-Processing:
353       .    ' Activated surface and 3D pressure diagnostic, ',               IF ( flds(md,listId).EQ.'PhiVEL  '
354       .    ' RSURF and PRESSURE'  c    &       .OR. flds(md,listId).EQ.'PsiVEL  '
355              CALL PRINT_ERROR( msgBuf , myThid )       &          ) THEN
356              STOP 'ABNORMAL END: S/R DIAGNOSTICS_OUT'                CALL DIAGNOSTICS_CALC_PHIVEL(
357             endif       I                         listId, md, ndId, ip, im, lm,
358         U                         qtmp1, qtmp2,
359             DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)       I                         myTime, myIter, myThid )
360              DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)               ELSE
361               call getdiag(1,undef,qtmpsrf(1-OLx,1-OLy,bi,bj),                 WRITE(msgBuf,'(2A)') 'DIAGNOSTICS_OUT: ',
362       .                       jpoint1,0,ipoint1,0,bi,bj,myThid)       &           'unknown Processing method for diag="',cdiag(ndId),'"'
363              ENDDO                 CALL PRINT_ERROR( msgBuf , myThid )
364             ENDDO                 STOP 'ABNORMAL END: S/R DIAGNOSTICS_OUT'
365             DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)               ENDIF
366              DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)              ENDIF
              DO k = 1,nlevels(listId)  
               call getdiag(levs(k,listId),undef,  
      .          qtmp2(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),jpoint2,0,ipoint2,0,  
      .          bi,bj,myThid)  
              ENDDO  
             ENDDO  
            ENDDO  
           endif  
 #else  
 C If nonlinear free surf is off, get pressures from rC and rF arrays  
           DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)  
            DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  
             DO j = 1-OLy,sNy+OLy  
              DO i = 1-OLx,sNx+OLx  
               qtmpsrf(i,j,bi,bj) = rF(1)  
              ENDDO  
             ENDDO  
             DO j = 1-OLy,sNy+OLy  
              DO i = 1-OLx,sNx+OLx  
               DO k = 1,nlevels(listId)  
                qtmp2(i,j,k,bi,bj) = rC(k)  
               ENDDO  
              ENDDO  
             ENDDO  
            ENDDO  
           ENDDO  
 #endif  
 C Load p to the kappa into a temporary array  
           nlevsout = nplevs  
           DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)  
            DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  
             DO j = 1,sNy  
              DO i = 1,sNx  
               pksrf(i,j) = qtmpsrf(i,j,bi,bj) ** kappa  
               DO k = 1,nlevels(listId)  
                if(gdiag(ndId)(10:10).eq.'R') then  
                 if(hFacC(i,j,nlevels(listId)-k+1,bi,bj).ne.0.) then  
                  qinp(i,j,k) =  qtmp1(i,j,nlevels(listId)-k+1,bi,bj)  
                 else  
                  qinp(i,j,k) =  undef  
                 endif  
                 pkz(i,j,k) = qtmp2(i,j,nlevels(listId)-k+1,bi,bj)**kappa  
                elseif(gdiag(ndId)(10:10).eq.'L') then  
                 qinp(i,j,k) =  qtmp1(i,j,k,bi,bj)  
                 pkz(i,j,k) = qtmp2(i,j,k,bi,bj)**kappa  
                endif  
               ENDDO  
              ENDDO  
             ENDDO  
   
             DO k = 1,nplevs  
              if(fflags(listId)(3:3).eq.'1') then  
               p = plevs1(k)  
              elseif(fflags(listId)(3:3).eq.'2')then  
               p = plevs2(k)  
              endif  
              call prestopres(qprs(1,1,k),qinp,pkz,pksrf,0.,p,sNx,sNy,  
      .                                                 nlevels(listId) )  
             ENDDO  
367    
368              DO j = 1,sNy  C--     End of empty diag / not-empty diag block
369               DO i = 1,sNx            ENDIF
               DO k = 1,nlevsout  
                qtmp1(i,j,k,bi,bj) =  qprs(i,j,k)  
                if(qtmp1(i,j,k,bi,bj).eq.undef) qtmp1(i,j,k,bi,bj) = 0.  
               ENDDO  
              ENDDO  
             ENDDO  
            ENDDO  
           ENDDO  
370    
371           endif  C--     Ready to write field "md", element "lm" in averageCycle(listId)
372    
373  #ifdef ALLOW_MDSIO  C-        write to binary file, using MDSIO pkg:
374  C         Prepare for mdsio optionality            IF ( diag_mdsio ) THEN
375            IF (diag_mdsio) THEN  c           nRec = lm + (md-1)*averageCycle(listId)
376              IF (fflags(listId)(1:1) .EQ. ' ') THEN              nRec = md + (lm-1)*nfields(listId)
377  C             This is the old default behavior  C           default precision for output files
378                CALL MDSWRITEFIELD_NEW(fn,writeBinaryPrec,glf,'RL',              prec = writeBinaryPrec
379       &             Nr+Nrphys,nlevsout,qtmp1,md,myIter,myThid)  C           fFlag(1)=R(or D): force it to be 32-bit(or 64) precision
380              ELSEIF (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'R') THEN              IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'R' ) prec = precFloat32
381  C             Force it to be 32-bit precision              IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'D' ) prec = precFloat64
382                CALL MDSWRITEFIELD_NEW(fn,precFloat32,glf,'RL',  C         a hack not to write meta files now: pass -nRec < 0 to MDS_WRITE S/R
383       &             Nr+Nrphys,nlevsout,qtmp1,md,myIter,myThid)              CALL WRITE_REC_LEV_RL(
384              ELSEIF (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'D') THEN       I                            fn, prec,
385  C             Force it to be 64-bit precision       I                            NrMax, 1, nLevOutp,
386                CALL MDSWRITEFIELD_NEW(fn,precFloat64,glf,'RL',       I                            qtmp1, -nRec, myIter, myThid )
      &             Nr+Nrphys,nlevsout,qtmp1,md,myIter,myThid)  
             ENDIF  
387            ENDIF            ENDIF
 #endif /*  ALLOW_MDSIO  */  
388    
389  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
390            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
391                CALL DIAGNOSTICS_MNC_OUT(
392              _BEGIN_MASTER( myThid )       I                       NrMax, nLevOutp, listId, ndId, mate,
393         I                       diag_mnc_bn,
394              DO ii = 1,CW_DIMS       I                       missingValFillsMask, undefRL,
395                d_cw_name(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)       I                       qtmp1,
396                dn(ii)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)       I                       myTime, myIter, myThid )
             ENDDO  
   
 C           Note that the "d_cw_name" variable is a hack that hides a  
 C           subtlety within MNC.  Basically, each MNC-wrapped file is  
 C           caching its own concept of what each "grid name" (that is, a  
 C           dimension group name) means.  So one cannot re-use the same  
 C           "grid" name for different collections of dimensions within a  
 C           given file.  By appending the "ndId" values to each name, we  
 C           guarantee uniqueness within each MNC-produced file.  
             WRITE(d_cw_name,'(a,i6.6)') 'd_cw_',ndId  
   
 C           XY dimensions  
             dim(1)       = sNx + 2*OLx  
             dim(2)       = sNy + 2*OLy  
             ib(1)        = OLx + 1  
             ib(2)        = OLy + 1  
             IF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'M') THEN  
               dn(1)(1:2) = 'X'  
               ie(1)      = OLx + sNx  
               dn(2)(1:2) = 'Y'  
               ie(2)      = OLy + sNy  
             ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'U') THEN  
               dn(1)(1:3) = 'Xp1'  
               ie(1)      = OLx + sNx + 1  
               dn(2)(1:2) = 'Y'  
               ie(2)      = OLy + sNy  
             ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'V') THEN  
               dn(1)(1:2) = 'X'  
               ie(1)      = OLx + sNx  
               dn(2)(1:3) = 'Yp1'  
               ie(2)      = OLy + sNy + 1  
             ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'Z') THEN  
               dn(1)(1:3) = 'Xp1'  
               ie(1)      = OLx + sNx + 1  
               dn(2)(1:3) = 'Yp1'  
               ie(2)      = OLy + sNy + 1  
             ENDIF  
               
 C           Z is special since it varies  
             WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zd', nlevels(listId)  
             IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')  
      &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'M') ) THEN  
               WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)  
             ENDIF  
             IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')  
      &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'L') ) THEN  
               WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zld', nlevels(listId)  
             ENDIF  
             IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')  
      &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'U') ) THEN  
               WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zud', nlevels(listId)  
             ENDIF  
             dim(3) = Nr+Nrphys  
             ib(3)  = 1  
             ie(3)  = nlevels(listId)  
   
 C           Time dimension  
             dn(4)(1:1) = 'T'  
             dim(4) = -1  
             ib(4)  = 1  
             ie(4)  = 1  
   
             CALL MNC_CW_ADD_GNAME(d_cw_name, 4,  
      &             dim, dn, ib, ie, myThid)  
             CALL MNC_CW_ADD_VNAME(cdiag(ndId), d_cw_name,  
      &             4,5, myThid)  
             CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'description',  
      &             tdiag(ndId),myThid)  
             CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'units',  
      &             udiag(ndId),myThid)  
   
             IF ((fflags(listId)(1:1) .EQ. ' ')  
      &           .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'R')) THEN  
               CALL MNC_CW_RL_W('R',diag_mnc_bn,0,0,  
      &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)  
             ELSEIF (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'D') THEN  
               CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,  
      &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)  
             ENDIF  
               
             CALL MNC_CW_DEL_VNAME(cdiag(ndId), myThid)  
             CALL MNC_CW_DEL_GNAME(d_cw_name, myThid)  
   
             _END_MASTER( myThid )  
   
397            ENDIF            ENDIF
398  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
399    
400  C--     end of Processing Fld # md  C--     end of Processing Fld # md
401          ENDIF          ENDIF
402           ENDDO
403    
404    C--   end loop on lm counter (= averagePeriod)
405        ENDDO        ENDDO
406    
407    #ifdef ALLOW_MDSIO
408          IF (diag_mdsio) THEN
409    C-    Note: temporary: since it is a pain to add more arguments to
410    C     all MDSIO S/R, uses instead this specific S/R to write only
411    C     meta files but with more informations in it.
412                glf = globalFiles
413                nRec = averageCycle(listId)*nfields(listId)
414                CALL MDS_WR_METAFILES(fn, prec, glf, .FALSE.,
415         &              0, 0, nLevOutp, ' ',
416         &              nfields(listId), flds(1,listId), nTimRec, timeRec,
417         &              nRec, myIter, myThid)
418          ENDIF
419    #endif /*  ALLOW_MDSIO  */
420    
421        RETURN        RETURN
422        END        END
423    
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