/[MITgcm]/MITgcm/pkg/diagnostics/diagnostics_out.F
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revision 1.33 by jmc, Wed Jan 31 21:47:55 2007 UTC revision 1.45 by jmc, Thu Jan 7 23:48:01 2010 UTC
# Line 38  C     myThid  :: my Thread Id number Line 38  C     myThid  :: my Thread Id number
38        INTEGER listId, myIter, myThid        INTEGER listId, myIter, myThid
39  CEOP  CEOP
40    
41    C     !FUNCTIONS:
42          INTEGER ILNBLNK
43          EXTERNAL ILNBLNK
44    #ifdef ALLOW_FIZHI
45          _RL   getcon
46          EXTERNAL getcon
47    #endif
48    
49  C     !LOCAL VARIABLES:  C     !LOCAL VARIABLES:
50  C     i,j,k :: loop indices  C     i,j,k :: loop indices
51  C     lm    :: loop index (averageCycle)  C     lm    :: loop index (averageCycle)
# Line 58  C              diagnostic storage qdiag Line 66  C              diagnostic storage qdiag
66        INTEGER bi, bj        INTEGER bi, bj
67        INTEGER md, ndId, ip, im        INTEGER md, ndId, ip, im
68        INTEGER mate, mVec        INTEGER mate, mVec
69        CHARACTER*8 parms1        CHARACTER*10 gcode
70        _RL undef, getcon        _RL undef
71        _RL tmpLev        _RL tmpLev
       EXTERNAL getcon  
       INTEGER ILNBLNK  
       EXTERNAL ILNBLNK  
72        INTEGER ilen        INTEGER ilen
73    
74        INTEGER ioUnit        INTEGER ioUnit
75        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) fn        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) fn
76        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff
77        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf
78          INTEGER prec, nRec, nTimRec
79          _RL     timeRec(2)
80  #ifdef ALLOW_MDSIO  #ifdef ALLOW_MDSIO
81        LOGICAL glf        LOGICAL glf
       INTEGER nRec  
       INTEGER prec  
82  #endif  #endif
83  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
84        INTEGER ii        INTEGER ll, llMx, jj, jjMx
85          INTEGER ii, klev
86        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn
87        INTEGER CW_DIMS, NLEN        INTEGER CW_DIMS, NLEN
88        PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )        PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )
# Line 89  C              diagnostic storage qdiag Line 95  C              diagnostic storage qdiag
95        CHARACTER*(5) ctmp        CHARACTER*(5) ctmp
96        _RS ztmp(NrMax)        _RS ztmp(NrMax)
97  #endif  #endif
98          LOGICAL useMissingValue, useMisValForThisDiag
99          REAL*8 misvalLoc
100          REAL*8 misval_r8(2)
101          REAL*4 misval_r4(2)
102          INTEGER misvalIntLoc, misval_int(2)
103  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
104    
105  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
106    
107    C---  set file properties
108        ioUnit= standardMessageUnit        ioUnit= standardMessageUnit
109          undef = UNSET_RL
110    #ifdef ALLOW_FIZHI
111    c     IF ( useFIZHI ) undef = getcon('UNDEF')
112        undef = getcon('UNDEF')        undef = getcon('UNDEF')
113    #endif
114        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter
115        ilen = ILNBLNK(fnames(listId))        ilen = ILNBLNK(fnames(listId))
116        WRITE( fn, '(A,A,A)' ) fnames(listId)(1:ilen),'.',suff(1:10)        WRITE( fn, '(A,A,A)' ) fnames(listId)(1:ilen),'.',suff(1:10)
117    
118    C--   Set time information:
119          IF ( freq(listId).LT.0. ) THEN
120    C-    Snap-shot: store a unique time (which is consistent with State-Var timing)
121            nTimRec = 1
122            timeRec(1) = myTime
123          ELSE
124    C-    Time-average: store the 2 edges of the time-averaging interval.
125    C      this time is consitent with intermediate Var (i.e., non-state, e.g, flux,
126    C      tendencies) timing. For State-Var, this is shifted by + halt time-step.
127            nTimRec = 2
128    
129    C-    end of time-averaging interval:
130            timeRec(2) = myTime
131    
132    C-    begining of time-averaging interval:
133    c       timeRec(1) = myTime - freq(listId)
134    C     a) find the time of the previous multiple of output freq:
135            timeRec(1) = myTime-deltaTClock*0.5 _d 0
136            timeRec(1) = (timeRec(1)-phase(listId))/freq(listId)
137            i = INT( timeRec(1) )
138            IF ( timeRec(1).LT.0. ) i = i - 1
139            timeRec(1) = phase(listId) + freq(listId)*FLOAT(i)
140    c       if ( listId.eq.2 ) write(0,*) 'f',i,timeRec(1)/deltaTClock
141            timeRec(1) = MAX( timeRec(1), startTime )
142    
143    C     b) round off to nearest multiple of time-step:
144            timeRec(1) = (timeRec(1)-baseTime)/deltaTClock
145            i = NINT( timeRec(1) )
146    C     if just half way, NINT will return the next time-step: correct this
147            tmpLev = FLOAT(i) - 0.5 _d 0
148            IF ( timeRec(1).EQ.tmpLev ) i = i - 1
149            timeRec(1) = baseTime + deltaTClock*FLOAT(i)
150    c       if ( listId.eq.2 ) write(0,*) i,timeRec(1)/deltaTClock
151          ENDIF
152    
153  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
154    C-- this is a trick to reverse the order of the loops on md (= field)
155    C   and lm (= averagePeriod): binary output: lm loop inside md loop ;
156    C                                 mnc ouput: md loop inside lm loop.
157        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
158          DO i = 1,MAX_LEN_FNAM          jjMx = averageCycle(listId)
159            diag_mnc_bn(i:i) = ' '          llMx = 1
160          ENDDO        ELSE
161          DO i = 1,NLEN          jjMx = 1
162            dn_blnk(i:i) = ' '          llMx = averageCycle(listId)
163          ENDDO        ENDIF
164          WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) fnames(listId)(1:ilen)        DO jj=1,jjMx
165    
166           IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
167    C     Handle missing value attribute (land points)
168             useMissingValue = .FALSE.
169    #ifdef DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE
170             useMissingValue = .TRUE.
171    #endif /* DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE */
172             IF ( misvalFlt(listId) .NE. UNSET_RL ) THEN
173              misvalLoc = misvalFlt(listId)
174             ELSE
175              misvalLoc = undef
176             ENDIF
177    C     Defaults to UNSET_I
178             misvalIntLoc = misvalInt(listId)
179             DO ii=1,2
180    C         misval_r4(ii)  = UNSET_FLOAT4
181    C         misval_r8(ii)  = UNSET_FLOAT8
182              misval_r4(ii)  = misvalLoc
183              misval_r8(ii)  = misvalLoc
184              misval_int(ii) = UNSET_I
185             ENDDO
186             DO i = 1,MAX_LEN_FNAM
187               diag_mnc_bn(i:i) = ' '
188             ENDDO
189             DO i = 1,NLEN
190               dn_blnk(i:i) = ' '
191             ENDDO
192             WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) fnames(listId)(1:ilen)
193    
194  C       Update the record dimension by writing the iteration number  C       Update the record dimension by writing the iteration number
195          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)           klev = myIter + jj - jjMx
196          CALL MNC_CW_RL_W_S('D',diag_mnc_bn,0,0,'T',myTime,myThid)           tmpLev = myTime + deltaTClock*(jj -jjMx)
197          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)           CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)
198          CALL MNC_CW_I_W_S('I',diag_mnc_bn,0,0,'iter',myIter,myThid)           CALL MNC_CW_RL_W_S('D',diag_mnc_bn,0,0,'T',tmpLev,myThid)
199             CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)
200             CALL MNC_CW_I_W_S('I',diag_mnc_bn,0,0,'iter',klev,myThid)
201    
202  C       NOTE: at some point it would be a good idea to add a time_bounds  C       NOTE: at some point it would be a good idea to add a time_bounds
203  C       variable that has dimension (2,T) and clearly denotes the  C       variable that has dimension (2,T) and clearly denotes the
204  C       beginning and ending times for each diagnostics period  C       beginning and ending times for each diagnostics period
205    
206          dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)           dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)
207          WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)           WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)
208          dim(1) = nlevels(listId)           dim(1) = nlevels(listId)
209          ib(1)  = 1           ib(1)  = 1
210          ie(1)  = nlevels(listId)           ie(1)  = nlevels(listId)
211    
212          CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,           CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,
213       &       dim, dn, ib, ie, myThid)       &        dim, dn, ib, ie, myThid)
214          CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',           CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',
215       &       0,0, myThid)       &        0,0, myThid)
216          CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',           CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',
217       &       'Idicies of vertical levels within the source arrays',       &        'Idicies of vertical levels within the source arrays',
218       &       myThid)       &        myThid)
219    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
220             IF (useMissingValue)
221         &       CALL MNC_CW_VATTR_MISSING('diag_levels', 0,
222         I       misval_r8, misval_r4, misval_int,
223         I       myThid )
224    
225          CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,           CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,
226       &       'diag_levels', levs(1,listId), myThid)       &        'diag_levels', levs(1,listId), myThid)
227    
228          CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)           CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)
229          CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)           CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)
230    
231  #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK
232  C       This part has been placed in an #ifdef because, as its currently  C       This part has been placed in an #ifdef because, as its currently
# Line 153  C       as: Z[uml]td000000 where the 't' Line 242  C       as: Z[uml]td000000 where the 't'
242  C       gdiag(10)  C       gdiag(10)
243    
244  C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx  C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx
245          ctmp(1:5) = 'mul  '           ctmp(1:5) = 'mul  '
246          DO i = 1,3           DO i = 1,3
247            dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)             dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)
248            WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listId)             WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listId)
249            CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)             CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)
250            CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)             CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)
251    
252  C         The following three ztmp() loops should eventually be modified  C         The following three ztmp() loops should eventually be modified
253  C         to reflect the fractional nature of levs(j,l) -- they should  C         to reflect the fractional nature of levs(j,l) -- they should
# Line 168  C                      + ( rC(INT(FLOOR( Line 257  C                      + ( rC(INT(FLOOR(
257  C                          + rC(INT(CEIL(levs(j,l)))) )  C                          + rC(INT(CEIL(levs(j,l)))) )
258  C                        / ( levs(j,l) - FLOOR(levs(j,l)) )  C                        / ( levs(j,l) - FLOOR(levs(j,l)) )
259  C         for averaged levels.  C         for averaged levels.
260            IF (i .EQ. 1) THEN             IF (i .EQ. 1) THEN
261              DO j = 1,nlevels(listId)               DO j = 1,nlevels(listId)
262                ztmp(j) = rC(NINT(levs(j,listId)))                 ztmp(j) = rC(NINT(levs(j,listId)))
263              ENDDO               ENDDO
264              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',               CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
265       &           'Dimensional coordinate value at the mid point',       &            'Dimensional coordinate value at the mid point',
266       &           myThid)       &            myThid)
267            ELSEIF (i .EQ. 2) THEN             ELSEIF (i .EQ. 2) THEN
268              DO j = 1,nlevels(listId)               DO j = 1,nlevels(listId)
269                ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)) + 1)                 ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)) + 1)
270              ENDDO               ENDDO
271              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',               CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
272       &           'Dimensional coordinate value at the upper point',       &            'Dimensional coordinate value at the upper point',
273       &           myThid)       &            myThid)
274            ELSEIF (i .EQ. 3) THEN             ELSEIF (i .EQ. 3) THEN
275              DO j = 1,nlevels(listId)               DO j = 1,nlevels(listId)
276                ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)))                 ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)))
277              ENDDO               ENDDO
278              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',               CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
279       &           'Dimensional coordinate value at the lower point',       &            'Dimensional coordinate value at the lower point',
280       &           myThid)       &            myThid)
281            ENDIF             ENDIF
282            CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)  C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
283            CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)             IF (useMissingValue)
284            CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)       &          CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(dn(1), 0,
285          ENDDO       I          misval_r8, misval_r4, misval_int,
286         I          myThid )
287               CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)
288               CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)
289               CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)
290             ENDDO
291  #endif /*  DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  */  #endif /*  DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  */
292    
293        ENDIF         ENDIF
294  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
295    
296  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
297    
298        DO md = 1,nfields(listId)         DO md = 1,nfields(listId)
299          ndId = jdiag(md,listId)          ndId = jdiag(md,listId)
300          parms1 = gdiag(ndId)(1:8)          gcode = gdiag(ndId)(1:10)
301          mate = 0          mate = 0
302          mVec = 0          mVec = 0
303          IF ( parms1(5:5).EQ.'C' ) THEN          IF ( gcode(5:5).EQ.'C' ) THEN
304  C-      Check for Mate of a Counter Diagnostic  C-      Check for Mate of a Counter Diagnostic
305             READ(parms1,'(5X,I3)') mate             mate = hdiag(ndId)
306          ELSEIF ( parms1(1:1).EQ.'U' .OR. parms1(1:1).EQ.'V' ) THEN          ELSEIF ( gcode(1:1).EQ.'U' .OR. gcode(1:1).EQ.'V' ) THEN
307  C-      Check for Mate of a Vector Diagnostic  C-      Check for Mate of a Vector Diagnostic
308             READ(parms1,'(5X,I3)') mVec             mVec = hdiag(ndId)
309          ENDIF          ENDIF
310          IF ( idiag(md,listId).NE.0 .AND. parms1(5:5).NE.'D' ) THEN          IF ( idiag(md,listId).NE.0 .AND. gcode(5:5).NE.'D' ) THEN
311  C--     Start processing 1 Fld :  C--     Start processing 1 Fld :
312    #ifdef ALLOW_MNC
313             DO ll=1,llMx
314              lm = jj+ll-1
315    #else
316           DO lm=1,averageCycle(listId)           DO lm=1,averageCycle(listId)
317    #endif
318    
319            ip = ABS(idiag(md,listId)) + kdiag(ndId)*(lm-1)            ip = ABS(idiag(md,listId)) + kdiag(ndId)*(lm-1)
320            im = mdiag(md,listId)            im = mdiag(md,listId)
# Line 230  C-        Empty diagnostics case : Line 329  C-        Empty diagnostics case :
329       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter
330              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
331       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
332              WRITE(msgBuf,'(A,I4,3A,I3,2A)')              WRITE(msgBuf,'(A,I6,3A,I4,2A)')
333       &       '- WARNING -   diag.#',ndId, ' : ',flds(md,listId),       &       '- WARNING -   diag.#',ndId, ' : ',flds(md,listId),
334       &       ' (#',md,' ) in outp.Stream: ',fnames(listId)       &       ' (#',md,' ) in outp.Stream: ',fnames(listId)
335              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
336       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
337              IF ( averageCycle(listId).GT.1 ) THEN              IF ( averageCycle(listId).GT.1 ) THEN
338               WRITE(msgBuf,'(A,2(I2,A))')               WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
339       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag(lm=',lm,')=',       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag(lm=',lm,')=',
340       &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'       &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
341              ELSE              ELSE
342               WRITE(msgBuf,'(A,2(I2,A))')               WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
343       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',
344       &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'       &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
345              ENDIF              ENDIF
# Line 267  C-        Empty diagnostics case : Line 366  C-        Empty diagnostics case :
366  C-        diagnostics is not empty :  C-        diagnostics is not empty :
367    
368              IF ( debugLevel.GE.debLevA .AND. myThid.EQ.1 ) THEN              IF ( debugLevel.GE.debLevA .AND. myThid.EQ.1 ) THEN
369                WRITE(ioUnit,'(A,I3,3A,I8,2A)')                WRITE(ioUnit,'(A,I6,3A,I8,2A)')
370       &         ' Computing Diagnostic # ', ndId, '  ', cdiag(ndId),       &         ' Computing Diagnostic # ', ndId, '  ', cdiag(ndId),
371       &         '     Counter:',ndiag(ip,1,1),'   Parms: ',gdiag(ndId)       &         '     Counter:',ndiag(ip,1,1),'   Parms: ',gdiag(ndId)
372                IF ( mate.GT.0 ) THEN                IF ( mate.GT.0 ) THEN
373                 WRITE(ioUnit,'(3A,I3,2A)')                 WRITE(ioUnit,'(3A,I6,2A)')
374       &         '       use Counter Mate for  ', cdiag(ndId),       &         '       use Counter Mate for  ', cdiag(ndId),
375       &         '     Diagnostic # ',mate, '  ', cdiag(mate)       &         '     Diagnostic # ',mate, '  ', cdiag(mate)
376                ELSEIF ( mVec.GT.0 ) THEN                ELSEIF ( mVec.GT.0 ) THEN
377                  IF ( im.GT.0 .AND. ndiag(MAX(1,im),1,1).GT.0 ) THEN                  IF ( im.GT.0 .AND. ndiag(MAX(1,im),1,1).GT.0 ) THEN
378                   WRITE(ioUnit,'(3A,I3,3A)')                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
379       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
380       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
381       &             ' exists '       &             ' exists '
382                  ELSE                  ELSE
383                   WRITE(ioUnit,'(3A,I3,3A)')                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
384       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
385       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
386       &             ' not enabled'       &             ' not enabled'
# Line 340  C jmc: for now, this can only work in an Line 439  C jmc: for now, this can only work in an
439    
440  C--    Ready to write field "md", element "lm" in averageCycle(listId)  C--    Ready to write field "md", element "lm" in averageCycle(listId)
441    
 #ifdef ALLOW_MDSIO  
442  C-        write to binary file, using MDSIO pkg:  C-        write to binary file, using MDSIO pkg:
443            IF (diag_mdsio) THEN            IF ( diag_mdsio ) THEN
             glf = globalFiles  
444              nRec = lm + (md-1)*averageCycle(listId)              nRec = lm + (md-1)*averageCycle(listId)
445  C           default precision for output files  C           default precision for output files
446              prec = writeBinaryPrec              prec = writeBinaryPrec
447  C           fFlag(1)=R(or D): force it to be 32-bit(or 64) precision  C           fFlag(1)=R(or D): force it to be 32-bit(or 64) precision
448              IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'R' ) prec = precFloat32              IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'R' ) prec = precFloat32
449              IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'D' ) prec = precFloat64              IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'D' ) prec = precFloat64
450  c           CALL MDS_WRITE_FIELD(fn,prec,glf,.FALSE.,'RL',  C         a hack not to write meta files now: pass -nRec < 0 to MDS_WRITE S/R
451  c    &              NrMax,nlevels(listId),qtmp1,nRec,myIter,myThid)              CALL WRITE_REC_LEV_RL(
452  C         a hack not to write meta files now:       I                            fn, prec,
453              CALL MDS_WRITE_FIELD(fn,prec,glf,.FALSE.,'RL',       I                            NrMax, 1, nlevels(listId),
454       &              NrMax,nlevels(listId),qtmp1,-nRec,myIter,myThid)       I                            qtmp1, -nRec, myIter, myThid )
455            ENDIF            ENDIF
 #endif /*  ALLOW_MDSIO  */  
456    
457  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
458            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
# Line 437  C           Time dimension Line 533  C           Time dimension
533              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'units',              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'units',
534       &             udiag(ndId),myThid)       &             udiag(ndId),myThid)
535    
536  C           Per the observations of Baylor, this has been commented out  C     Missing values only for scalar diagnostics at mass points (so far)
537  C           until we have code that can write missing_value attributes              useMisValForThisDiag = useMissingValue
538  C           in a way thats compatible with most of the more popular       &           .AND.gdiag(ndId)(1:2).EQ.'SM'
539  C           netCDF tools including ferret.  Using all-zeros completely              IF ( useMisValForThisDiag ) THEN
540  C           breaks ferret.  C     assign missing values and set flag for adding the netCDF atttibute
541                 CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(cdiag(ndId), 2,
542  C           CALL MNC_CW_ADD_VATTR_DBL(cdiag(ndId),'missing_value',       I            misval_r8, misval_r4, misval_int,
543  C           &             0.0 _d 0,myThid)       I            myThid )
544    C     and now use the missing values for masking out the land points
545              IF ( ( (writeBinaryPrec .EQ. precFloat32)               DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
546       &           .AND. (fflags(listId)(1:1) .NE. 'D')                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
547       &           .AND. (fflags(listId)(1:1) .NE. 'R') )                 DO k = 1,nlevels(listId)
548       &           .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'R')) THEN                  klev = NINT(levs(k,listId))
549                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy
550                     DO i = 1-OLx,sNx+OLx
551                      IF ( maskC(i,j,klev,bi,bj) .EQ. 0. )
552         &                 qtmp1(i,j,k,bi,bj) = misvalLoc
553                     ENDDO
554                    ENDDO
555                   ENDDO
556                  ENDDO
557                 ENDDO
558                ELSE
559    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
560    C     Note: We have to call the following subroutine for each mnc that has
561    C     been created "on the fly" by mnc_cw_add_vname and will be deleted
562    C     by mnc_cw_del_vname, because all of these variables use the same
563    C     identifier so that mnc_cw_vfmv(indv) needs to be overwritten for
564    C     each of these variables
565                 CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(cdiag(ndId), 0,
566         I            misval_r8, misval_r4, misval_int,
567         I            myThid )
568                ENDIF
569    
570                IF (  ((writeBinaryPrec .EQ. precFloat32)
571         &            .AND. (fflags(listId)(1:1) .NE. 'D'))
572         &             .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'R') ) THEN
573                CALL MNC_CW_RL_W('R',diag_mnc_bn,0,0,                CALL MNC_CW_RL_W('R',diag_mnc_bn,0,0,
574       &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)       &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)
575              ELSEIF ( (writeBinaryPrec .EQ. precFloat64)              ELSEIF ( (writeBinaryPrec .EQ. precFloat64)
# Line 466  C           &             0.0 _d 0,myThi Line 586  C           &             0.0 _d 0,myThi
586            ENDIF            ENDIF
587  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
588    
589    C--      end loop on lm (or ll if ALLOW_MNC) counter
590           ENDDO           ENDDO
591  C--     end of Processing Fld # md  C--     end of Processing Fld # md
592          ENDIF          ENDIF
593           ENDDO
594    
595    #ifdef ALLOW_MNC
596    C--   end loop on jj counter
597        ENDDO        ENDDO
598    #endif
599    
600  #ifdef ALLOW_MDSIO  #ifdef ALLOW_MDSIO
601        IF (diag_mdsio) THEN        IF (diag_mdsio) THEN
602  C-    Note: temporary: since it's a pain to add more arguments to  C-    Note: temporary: since it's a pain to add more arguments to
603  C     all MDSIO S/R, uses instead this specific S/R to write only  C     all MDSIO S/R, uses instead this specific S/R to write only
604  C     meta files but with more informations in it.  C     meta files but with more informations in it.
605                glf = globalFiles
606              nRec = nfields(listId)*averageCycle(listId)              nRec = nfields(listId)*averageCycle(listId)
607              CALL MDS_WR_METAFILES(fn, prec, glf, .FALSE.,              CALL MDS_WR_METAFILES(fn, prec, glf, .FALSE.,
608       &              0, 0, nlevels(listId), ' ',       &              0, 0, nlevels(listId), ' ',
609       &              nfields(listId), flds(1,listId), 1, myTime,       &              nfields(listId), flds(1,listId), nTimRec, timeRec,
610       &              nRec, myIter, myThid)       &              nRec, myIter, myThid)
611        ENDIF        ENDIF
612  #endif /*  ALLOW_MDSIO  */  #endif /*  ALLOW_MDSIO  */
Legend:
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