/[MITgcm]/MITgcm/pkg/diagnostics/diagnostics_out.F
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revision 1.12 by jmc, Mon Apr 4 22:05:14 2005 UTC revision 1.45 by jmc, Thu Jan 7 23:48:01 2010 UTC
# Line 9  C     !ROUTINE: DIAGNOSTICS_OUT Line 9  C     !ROUTINE: DIAGNOSTICS_OUT
9    
10  C     !INTERFACE:  C     !INTERFACE:
11        SUBROUTINE  DIAGNOSTICS_OUT(        SUBROUTINE  DIAGNOSTICS_OUT(
12       I     listnum,       I     listId,
13       I     myIter,       I     myIter,
14         I     myTime,
15       I     myThid )       I     myThid )
16    
17  C     !DESCRIPTION:  C     !DESCRIPTION:
18  C     Write output for diagnostics fields.  C     Write output for diagnostics fields.
19          
20  C     !USES:  C     !USES:
21        IMPLICIT NONE        IMPLICIT NONE
22  #include "SIZE.h"  #include "SIZE.h"
# Line 25  C     !USES: Line 26  C     !USES:
26  #include "DIAGNOSTICS_SIZE.h"  #include "DIAGNOSTICS_SIZE.h"
27  #include "DIAGNOSTICS.h"  #include "DIAGNOSTICS.h"
28    
29  #ifdef ALLOW_FIZHI        INTEGER NrMax
30  #include "fizhi_SIZE.h"        PARAMETER( NrMax = numLevels )
 #else  
       INTEGER Nrphys  
       PARAMETER (Nrphys=0)  
 #endif  
   
31    
32  C     !INPUT PARAMETERS:  C     !INPUT PARAMETERS:
33  C     listnum :: Diagnostics list number being written  C     listId  :: Diagnostics list number being written
34  C     myIter  :: current iteration number  C     myIter  :: current iteration number
35    C     myTime  :: current time of simulation (s)
36  C     myThid  :: my Thread Id number  C     myThid  :: my Thread Id number
37        INTEGER listnum, myIter, myThid        _RL     myTime
38          INTEGER listId, myIter, myThid
39  CEOP  CEOP
40    
41  C     !LOCAL VARIABLES:  C     !FUNCTIONS:
       INTEGER i, j, k, m, n, bi, bj  
       CHARACTER*8 parms1  
       CHARACTER*3 mate_index  
       INTEGER mate, mVec  
       _RL qtmp1(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr+Nrphys,nSx,nSy)  
       _RL undef, getcon  
       EXTERNAL getcon  
42        INTEGER ILNBLNK        INTEGER ILNBLNK
43        EXTERNAL ILNBLNK        EXTERNAL ILNBLNK
44    #ifdef ALLOW_FIZHI
45          _RL   getcon
46          EXTERNAL getcon
47    #endif
48    
49    C     !LOCAL VARIABLES:
50    C     i,j,k :: loop indices
51    C     lm    :: loop index (averageCycle)
52    C     md    :: field number in the list "listId".
53    C     ndId  :: diagnostics  Id number (in available diagnostics list)
54    C     mate  :: counter mate Id number (in available diagnostics list)
55    C     ip    :: diagnostics  pointer to storage array
56    C     im    :: counter-mate pointer to storage array
57    C
58    C--   COMMON /LOCAL_DIAGNOSTICS_OUT/ local common block (for multi-threaded)
59    C     qtmp1 :: thread-shared temporary array (needs to be in common block):
60    C              to write a diagnostic field to file, copy it first from (big)
61    C              diagnostic storage qdiag into it.
62          COMMON /LOCAL_DIAGNOSTICS_OUT/ qtmp1
63          _RL qtmp1(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,NrMax,nSx,nSy)
64    
65          INTEGER i, j, k, lm
66          INTEGER bi, bj
67          INTEGER md, ndId, ip, im
68          INTEGER mate, mVec
69          CHARACTER*10 gcode
70          _RL undef
71          _RL tmpLev
72        INTEGER ilen        INTEGER ilen
73    
74        INTEGER ioUnit        INTEGER ioUnit
75        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) fn        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) fn
76        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff
77        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf
78          INTEGER prec, nRec, nTimRec
79          _RL     timeRec(2)
80    #ifdef ALLOW_MDSIO
81        LOGICAL glf        LOGICAL glf
82    #endif
83  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
84        INTEGER ii        INTEGER ll, llMx, jj, jjMx
85          INTEGER ii, klev
86        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn
       CHARACTER*(5) ctmp  
87        INTEGER CW_DIMS, NLEN        INTEGER CW_DIMS, NLEN
88        PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )        PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )
89        PARAMETER ( NLEN    = 80 )        PARAMETER ( NLEN    = 80 )
# Line 68  C     !LOCAL VARIABLES: Line 91  C     !LOCAL VARIABLES:
91        CHARACTER*(NLEN) dn(CW_DIMS)        CHARACTER*(NLEN) dn(CW_DIMS)
92        CHARACTER*(NLEN) d_cw_name        CHARACTER*(NLEN) d_cw_name
93        CHARACTER*(NLEN) dn_blnk        CHARACTER*(NLEN) dn_blnk
94        _RS ztmp(Nr+Nrphys)  #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK
95          CHARACTER*(5) ctmp
96          _RS ztmp(NrMax)
97    #endif
98          LOGICAL useMissingValue, useMisValForThisDiag
99          REAL*8 misvalLoc
100          REAL*8 misval_r8(2)
101          REAL*4 misval_r4(2)
102          INTEGER misvalIntLoc, misval_int(2)
103  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
104    
105  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
106    
107    C---  set file properties
108        ioUnit= standardMessageUnit        ioUnit= standardMessageUnit
109          undef = UNSET_RL
110    #ifdef ALLOW_FIZHI
111    c     IF ( useFIZHI ) undef = getcon('UNDEF')
112        undef = getcon('UNDEF')        undef = getcon('UNDEF')
113        glf = globalFiles  #endif
114        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter
115        ilen = ILNBLNK(fnames(listnum))        ilen = ILNBLNK(fnames(listId))
116        WRITE( fn, '(A,A,A)' ) fnames(listnum)(1:ilen),'.',suff(1:10)        WRITE( fn, '(A,A,A)' ) fnames(listId)(1:ilen),'.',suff(1:10)
117    
118    C--   Set time information:
119          IF ( freq(listId).LT.0. ) THEN
120    C-    Snap-shot: store a unique time (which is consistent with State-Var timing)
121            nTimRec = 1
122            timeRec(1) = myTime
123          ELSE
124    C-    Time-average: store the 2 edges of the time-averaging interval.
125    C      this time is consitent with intermediate Var (i.e., non-state, e.g, flux,
126    C      tendencies) timing. For State-Var, this is shifted by + halt time-step.
127            nTimRec = 2
128    
129    C-    end of time-averaging interval:
130            timeRec(2) = myTime
131    
132    C-    begining of time-averaging interval:
133    c       timeRec(1) = myTime - freq(listId)
134    C     a) find the time of the previous multiple of output freq:
135            timeRec(1) = myTime-deltaTClock*0.5 _d 0
136            timeRec(1) = (timeRec(1)-phase(listId))/freq(listId)
137            i = INT( timeRec(1) )
138            IF ( timeRec(1).LT.0. ) i = i - 1
139            timeRec(1) = phase(listId) + freq(listId)*FLOAT(i)
140    c       if ( listId.eq.2 ) write(0,*) 'f',i,timeRec(1)/deltaTClock
141            timeRec(1) = MAX( timeRec(1), startTime )
142    
143    C     b) round off to nearest multiple of time-step:
144            timeRec(1) = (timeRec(1)-baseTime)/deltaTClock
145            i = NINT( timeRec(1) )
146    C     if just half way, NINT will return the next time-step: correct this
147            tmpLev = FLOAT(i) - 0.5 _d 0
148            IF ( timeRec(1).EQ.tmpLev ) i = i - 1
149            timeRec(1) = baseTime + deltaTClock*FLOAT(i)
150    c       if ( listId.eq.2 ) write(0,*) i,timeRec(1)/deltaTClock
151          ENDIF
152    
153  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
154    C-- this is a trick to reverse the order of the loops on md (= field)
155    C   and lm (= averagePeriod): binary output: lm loop inside md loop ;
156    C                                 mnc ouput: md loop inside lm loop.
157        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
158          DO i = 1,MAX_LEN_FNAM          jjMx = averageCycle(listId)
159            diag_mnc_bn(i:i) = ' '          llMx = 1
160          ENDDO        ELSE
161          DO i = 1,NLEN          jjMx = 1
162            dn_blnk(i:i) = ' '          llMx = averageCycle(listId)
163          ENDDO        ENDIF
164          WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) fnames(listnum)(1:ilen)        DO jj=1,jjMx
165    
166  C       Update the record dimension by writing the iteration number         IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
167          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)  C     Handle missing value attribute (land points)
168          CALL MNC_CW_I_W_S('I',diag_mnc_bn,0,0,'T',myIter,myThid)           useMissingValue = .FALSE.
169          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)  #ifdef DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE
170             useMissingValue = .TRUE.
171          dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)  #endif /* DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE */
172          WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listnum)           IF ( misvalFlt(listId) .NE. UNSET_RL ) THEN
173          dim(1) = nlevels(listnum)            misvalLoc = misvalFlt(listId)
174          ib(1)  = 1           ELSE
175          ie(1)  = nlevels(listnum)            misvalLoc = undef
176             ENDIF
177          CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,  C     Defaults to UNSET_I
178       &       dim, dn, ib, ie, myThid)           misvalIntLoc = misvalInt(listId)
179          CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',           DO ii=1,2
180       &       0,0, myThid)  C         misval_r4(ii)  = UNSET_FLOAT4
181          CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',  C         misval_r8(ii)  = UNSET_FLOAT8
182       &       'Idicies of vertical levels within the source arrays',            misval_r4(ii)  = misvalLoc
183       &       myThid)            misval_r8(ii)  = misvalLoc
184                      misval_int(ii) = UNSET_I
185          CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,           ENDDO
186       &       'diag_levels', levs(1,listnum), myThid)           DO i = 1,MAX_LEN_FNAM
187               diag_mnc_bn(i:i) = ' '
188             ENDDO
189             DO i = 1,NLEN
190               dn_blnk(i:i) = ' '
191             ENDDO
192             WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) fnames(listId)(1:ilen)
193    
194          CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)  C       Update the record dimension by writing the iteration number
195          CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)           klev = myIter + jj - jjMx
196             tmpLev = myTime + deltaTClock*(jj -jjMx)
197             CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)
198             CALL MNC_CW_RL_W_S('D',diag_mnc_bn,0,0,'T',tmpLev,myThid)
199             CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)
200             CALL MNC_CW_I_W_S('I',diag_mnc_bn,0,0,'iter',klev,myThid)
201    
202    C       NOTE: at some point it would be a good idea to add a time_bounds
203    C       variable that has dimension (2,T) and clearly denotes the
204    C       beginning and ending times for each diagnostics period
205    
206             dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)
207             WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)
208             dim(1) = nlevels(listId)
209             ib(1)  = 1
210             ie(1)  = nlevels(listId)
211    
212             CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,
213         &        dim, dn, ib, ie, myThid)
214             CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',
215         &        0,0, myThid)
216             CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',
217         &        'Idicies of vertical levels within the source arrays',
218         &        myThid)
219    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
220             IF (useMissingValue)
221         &       CALL MNC_CW_VATTR_MISSING('diag_levels', 0,
222         I       misval_r8, misval_r4, misval_int,
223         I       myThid )
224    
225             CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,
226         &        'diag_levels', levs(1,listId), myThid)
227    
228             CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)
229             CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)
230    
231    #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK
232    C       This part has been placed in an #ifdef because, as its currently
233    C       written, it will only work with variables defined on a dynamics
234    C       grid.  As we start using diagnostics for physics grids, ice
235    C       levels, land levels, etc. the different vertical coordinate
236    C       dimensions will have to be taken into account.
237    
238    C       20051021 JMC & EH3 : We need to extend this so that a few
239    C       variables each defined on different grids do not have the same
240    C       vertical dimension names so we should be using a pattern such
241    C       as: Z[uml]td000000 where the 't' is the type as specified by
242    C       gdiag(10)
243    
244  C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx  C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx
245          ctmp(1:5) = 'mul  '           ctmp(1:5) = 'mul  '
246          DO i = 1,3           DO i = 1,3
247            dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)             dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)
248            WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listnum)             WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listId)
249            CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)             CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)
250            CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)             CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)
251    
252  C         The following three ztmp() loops should eventually be modified  C         The following three ztmp() loops should eventually be modified
253  C         to reflect the fractional nature of levs(j,l) -- they should  C         to reflect the fractional nature of levs(j,l) -- they should
254  C         do something like:  C         do something like:
255  C            ztmp(j) = rC(INT(FLOOR(levs(j,l))))  C            ztmp(j) = rC(INT(FLOOR(levs(j,l))))
256  C                      + ( rC(INT(FLOOR(levs(j,l))))  C                      + ( rC(INT(FLOOR(levs(j,l))))
257  C                          + rC(INT(CEIL(levs(j,l)))) )  C                          + rC(INT(CEIL(levs(j,l)))) )
258  C                        / ( levs(j,l) - FLOOR(levs(j,l)) )  C                        / ( levs(j,l) - FLOOR(levs(j,l)) )
259  C         for averaged levels.  C         for averaged levels.
260            IF (i .EQ. 1) THEN             IF (i .EQ. 1) THEN
261              DO j = 1,nlevels(listnum)               DO j = 1,nlevels(listId)
262                ztmp(j) = rC(NINT(levs(j,listnum)))                 ztmp(j) = rC(NINT(levs(j,listId)))
263              ENDDO               ENDDO
264              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',               CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
265       &           'Dimensional coordinate value at the mid point',       &            'Dimensional coordinate value at the mid point',
266       &           myThid)       &            myThid)
267            ELSEIF (i .EQ. 2) THEN             ELSEIF (i .EQ. 2) THEN
268              DO j = 1,nlevels(listnum)               DO j = 1,nlevels(listId)
269                ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listnum)) + 1)                 ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)) + 1)
270              ENDDO               ENDDO
271              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',               CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
272       &           'Dimensional coordinate value at the upper point',       &            'Dimensional coordinate value at the upper point',
273       &           myThid)       &            myThid)
274            ELSEIF (i .EQ. 3) THEN             ELSEIF (i .EQ. 3) THEN
275              DO j = 1,nlevels(listnum)               DO j = 1,nlevels(listId)
276                ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listnum)))                 ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)))
277              ENDDO               ENDDO
278              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',               CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
279       &           'Dimensional coordinate value at the lower point',       &            'Dimensional coordinate value at the lower point',
280       &           myThid)       &            myThid)
281            ENDIF             ENDIF
282            CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)  C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
283            CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)             IF (useMissingValue)
284            CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)       &          CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(dn(1), 0,
285          ENDDO       I          misval_r8, misval_r4, misval_int,
286         I          myThid )
287               CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)
288               CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)
289               CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)
290             ENDDO
291    #endif /*  DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  */
292    
293        ENDIF         ENDIF
294  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
295    
296        DO n = 1,nfields(listnum)  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
297          m = jdiag(n,listnum)  
298          parms1 = gdiag(m)(1:8)         DO md = 1,nfields(listId)
299          IF ( idiag(m).NE.0 .AND. parms1(5:5).NE.'D' ) THEN          ndId = jdiag(md,listId)
300            gcode = gdiag(ndId)(1:10)
301            mate = 0
302            mVec = 0
303            IF ( gcode(5:5).EQ.'C' ) THEN
304    C-      Check for Mate of a Counter Diagnostic
305               mate = hdiag(ndId)
306            ELSEIF ( gcode(1:1).EQ.'U' .OR. gcode(1:1).EQ.'V' ) THEN
307    C-      Check for Mate of a Vector Diagnostic
308               mVec = hdiag(ndId)
309            ENDIF
310            IF ( idiag(md,listId).NE.0 .AND. gcode(5:5).NE.'D' ) THEN
311  C--     Start processing 1 Fld :  C--     Start processing 1 Fld :
312    #ifdef ALLOW_MNC
313             DO ll=1,llMx
314              lm = jj+ll-1
315    #else
316             DO lm=1,averageCycle(listId)
317    #endif
318    
319              ip = ABS(idiag(md,listId)) + kdiag(ndId)*(lm-1)
320              im = mdiag(md,listId)
321              IF (mate.GT.0) im = im + kdiag(mate)*(lm-1)
322              IF (mVec.GT.0) im = im + kdiag(mVec)*(lm-1)
323    
324            IF ( ndiag(m).EQ.0 ) THEN            IF ( ndiag(ip,1,1).EQ.0 ) THEN
325  C-        Empty diagnostics case :  C-        Empty diagnostics case :
326    
327              _BEGIN_MASTER( myThid )              _BEGIN_MASTER( myThid )
328              WRITE(msgBuf,'(A,I10)')              WRITE(msgBuf,'(A,I10)')
329       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter
330              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
331       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
332              WRITE(msgBuf,'(A,I4,3A,I3,2A)')              WRITE(msgBuf,'(A,I6,3A,I4,2A)')
333       &       '- WARNING -   diag.#',m, ' : ',flds(n,listnum),       &       '- WARNING -   diag.#',ndId, ' : ',flds(md,listId),
334       &       ' (#',n,' ) in outp.Stream: ',fnames(listnum)       &       ' (#',md,' ) in outp.Stream: ',fnames(listId)
335              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
336       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
337              WRITE(msgBuf,'(A,I2,A)')              IF ( averageCycle(listId).GT.1 ) THEN
338       &       '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',ndiag(m),' )'               WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
339              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag(lm=',lm,')=',
340         &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
341                ELSE
342                 WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
343         &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',
344         &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
345                ENDIF
346                CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
347       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
348              WRITE(msgBuf,'(A)')              WRITE(msgBuf,'(A)')
349       &       'WARNING DIAGNOSTICS_OUT  => write ZEROS instead'       &       'WARNING DIAGNOSTICS_OUT  => write ZEROS instead'
350              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
351       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
352              _END_MASTER( myThid )              _END_MASTER( myThid )
353              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
354                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
355                  DO k = 1,nlevels(listnum)                  DO k = 1,nlevels(listId)
356                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy
357                      DO i = 1-OLx,sNx+OLx                      DO i = 1-OLx,sNx+OLx
358                        qtmp1(i,j,k,bi,bj) = 0. _d 0                        qtmp1(i,j,k,bi,bj) = 0. _d 0
# Line 204  C-        Empty diagnostics case : Line 365  C-        Empty diagnostics case :
365            ELSE            ELSE
366  C-        diagnostics is not empty :  C-        diagnostics is not empty :
367    
368              IF ( myThid.EQ.1 )              IF ( debugLevel.GE.debLevA .AND. myThid.EQ.1 ) THEN
369       &             WRITE(ioUnit,2000) m,cdiag(m),ndiag(m),gdiag(m)                WRITE(ioUnit,'(A,I6,3A,I8,2A)')
370         &         ' Computing Diagnostic # ', ndId, '  ', cdiag(ndId),
371              IF ( parms1(5:5).EQ.'C' ) THEN       &         '     Counter:',ndiag(ip,1,1),'   Parms: ',gdiag(ndId)
372  C             Check for Mate of a Counter Diagnostic                IF ( mate.GT.0 ) THEN
373  C             --------------------------------------                 WRITE(ioUnit,'(3A,I6,2A)')
374                mate_index = parms1(6:8)       &         '       use Counter Mate for  ', cdiag(ndId),
375                READ (mate_index,'(I3)') mate       &         '     Diagnostic # ',mate, '  ', cdiag(mate)
376                IF ( myThid.EQ.1 )                ELSEIF ( mVec.GT.0 ) THEN
377       &                 WRITE(ioUnit,2003) cdiag(m),mate,cdiag(mate)                  IF ( im.GT.0 .AND. ndiag(MAX(1,im),1,1).GT.0 ) THEN
378              ELSE                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
379                mate = 0       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
380         &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
381  C             Check for Mate of a Vector Diagnostic       &             ' exists '
 C             -------------------------------------  
               IF ( parms1(1:1).EQ.'U' .OR. parms1(1:1).EQ.'V' ) THEN  
                 mate_index = parms1(6:8)  
                 READ (mate_index,'(I3)') mVec  
                 IF ( idiag(mVec).NE.0 ) THEN  
                   IF ( myThid.EQ.1 )  
      &                 WRITE(ioUnit,2001) cdiag(m),mVec,cdiag(mVec)  
382                  ELSE                  ELSE
383                    IF ( myThid.EQ.1 )                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
384       &                 WRITE(ioUnit,2002) cdiag(m),mVec,cdiag(mVec)       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
385         &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
386         &             ' not enabled'
387                  ENDIF                  ENDIF
388                ENDIF                ENDIF
389              ENDIF              ENDIF
390    
391              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'P' ) THEN
392               DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  C-       get all the levels (for vertical interpolation)
393                DO k = 1,nlevels(listnum)                DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
394                  CALL GETDIAG(                 DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
395       I                       levs(k,listnum),undef,                  DO k = 1,kdiag(ndId)
396       O                       qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),                    tmpLev = k
397       I                       m,mate,bi,bj,myThid)                    CALL GETDIAG(
398         I                         tmpLev,undef,
399         O                         qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),
400         I                         ndId,mate,ip,im,bi,bj,myThid)
401                    ENDDO
402                   ENDDO
403                ENDDO                ENDDO
404               ENDDO              ELSE
405              ENDDO  C-       get only selected levels:
406                  DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
407                   DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
408                    DO k = 1,nlevels(listId)
409                      CALL GETDIAG(
410         I                         levs(k,listId),undef,
411         O                         qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),
412         I                         ndId,mate,ip,im,bi,bj,myThid)
413                    ENDDO
414                   ENDDO
415                  ENDDO
416                ENDIF
417    
418  C-        end of empty diag / not empty block  C-        end of empty diag / not empty block
419            ENDIF            ENDIF
420    
421  #ifdef ALLOW_MDSIO  C-----------------------------------------------------------------------
422  C         Prepare for mdsio optionality  C         Check to see if we need to interpolate before output
423            IF (diag_mdsio) THEN  C-----------------------------------------------------------------------
424              CALL mdswritefield_new(fn,writeBinaryPrec,glf,'RL',            IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'P' ) THEN
425       &           Nr+Nrphys,nlevels(listnum),qtmp1,n,myIter,myThid)  C-        Do vertical interpolation:
426               IF ( fluidIsAir ) THEN
427    C jmc: for now, this can only work in an atmospheric set-up (fluidIsAir);
428                CALL DIAGNOSTICS_INTERP_VERT(
429         I                     listId, md, ndId, ip, im, lm,
430         U                     qtmp1,
431         I                     undef, myTime, myIter, myThid )
432               ELSE
433                 WRITE(msgBuf,'(2A)') 'DIAGNOSTICS_OUT: ',
434         &         'INTERP_VERT not allowed in this config'
435                 CALL PRINT_ERROR( msgBuf , myThid )
436                 STOP 'ABNORMAL END: S/R DIAGNOSTICS_OUT'
437               ENDIF
438              ENDIF
439    
440    C--    Ready to write field "md", element "lm" in averageCycle(listId)
441    
442    C-        write to binary file, using MDSIO pkg:
443              IF ( diag_mdsio ) THEN
444                nRec = lm + (md-1)*averageCycle(listId)
445    C           default precision for output files
446                prec = writeBinaryPrec
447    C           fFlag(1)=R(or D): force it to be 32-bit(or 64) precision
448                IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'R' ) prec = precFloat32
449                IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'D' ) prec = precFloat64
450    C         a hack not to write meta files now: pass -nRec < 0 to MDS_WRITE S/R
451                CALL WRITE_REC_LEV_RL(
452         I                            fn, prec,
453         I                            NrMax, 1, nlevels(listId),
454         I                            qtmp1, -nRec, myIter, myThid )
455            ENDIF            ENDIF
 #endif /*  ALLOW_MDSIO  */  
456    
457  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
458            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
# Line 269  C           subtlety within MNC.  Basica Line 469  C           subtlety within MNC.  Basica
469  C           caching its own concept of what each "grid name" (that is, a  C           caching its own concept of what each "grid name" (that is, a
470  C           dimension group name) means.  So one cannot re-use the same  C           dimension group name) means.  So one cannot re-use the same
471  C           "grid" name for different collections of dimensions within a  C           "grid" name for different collections of dimensions within a
472  C           given file.  By appending the "m" values to each name, we  C           given file.  By appending the "ndId" values to each name, we
473  C           guarantee uniqueness within each MNC-produced file.  C           guarantee uniqueness within each MNC-produced file.
474              WRITE(d_cw_name,'(a,i6.6)') 'd_cw_',m              WRITE(d_cw_name,'(a,i6.6)') 'd_cw_',ndId
475    
476  C           XY dimensions  C           XY dimensions
477              dim(1)       = sNx + 2*OLx              dim(1)       = sNx + 2*OLx
478              dim(2)       = sNy + 2*OLy              dim(2)       = sNy + 2*OLy
479              ib(1)        = OLx + 1              ib(1)        = OLx + 1
480              ib(2)        = OLy + 1              ib(2)        = OLy + 1
481              IF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'M') THEN              IF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'M') THEN
482                dn(1)(1:2) = 'X'                dn(1)(1:2) = 'X'
483                ie(1)      = OLx + sNx                ie(1)      = OLx + sNx
484                dn(2)(1:2) = 'Y'                dn(2)(1:2) = 'Y'
485                ie(2)      = OLy + sNy                ie(2)      = OLy + sNy
486              ELSEIF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'U') THEN              ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'U') THEN
487                dn(1)(1:3) = 'Xp1'                dn(1)(1:3) = 'Xp1'
488                ie(1)      = OLx + sNx + 1                ie(1)      = OLx + sNx + 1
489                dn(2)(1:2) = 'Y'                dn(2)(1:2) = 'Y'
490                ie(2)      = OLy + sNy                ie(2)      = OLy + sNy
491              ELSEIF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'V') THEN              ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'V') THEN
492                dn(1)(1:2) = 'X'                dn(1)(1:2) = 'X'
493                ie(1)      = OLx + sNx                ie(1)      = OLx + sNx
494                dn(2)(1:3) = 'Yp1'                dn(2)(1:3) = 'Yp1'
495                ie(2)      = OLy + sNy + 1                ie(2)      = OLy + sNy + 1
496              ELSEIF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'Z') THEN              ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'Z') THEN
497                dn(1)(1:3) = 'Xp1'                dn(1)(1:3) = 'Xp1'
498                ie(1)      = OLx + sNx + 1                ie(1)      = OLx + sNx + 1
499                dn(2)(1:3) = 'Yp1'                dn(2)(1:3) = 'Yp1'
500                ie(2)      = OLy + sNy + 1                ie(2)      = OLy + sNy + 1
501              ENDIF              ENDIF
502                
503  C           Z is special since it varies  C           Z is special since it varies
504              WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zd', nlevels(listnum)              WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zd', nlevels(listId)
505              IF ( (gdiag(m)(10:10) .EQ. 'R')              IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')
506       &           .AND. (gdiag(m)(9:9) .EQ. 'M') ) THEN       &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'M') ) THEN
507                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listnum)                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)
508              ENDIF              ENDIF
509              IF ( (gdiag(m)(10:10) .EQ. 'R')              IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')
510       &           .AND. (gdiag(m)(9:9) .EQ. 'L') ) THEN       &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'L') ) THEN
511                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zld', nlevels(listnum)                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zld', nlevels(listId)
512              ENDIF              ENDIF
513              IF ( (gdiag(m)(10:10) .EQ. 'R')              IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')
514       &           .AND. (gdiag(m)(9:9) .EQ. 'U') ) THEN       &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'U') ) THEN
515                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zud', nlevels(listnum)                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zud', nlevels(listId)
516              ENDIF              ENDIF
517              dim(3) = Nr+Nrphys              dim(3) = NrMax
518              ib(3)  = 1              ib(3)  = 1
519              ie(3)  = nlevels(listnum)              ie(3)  = nlevels(listId)
520    
521  C           Time dimension  C           Time dimension
522              dn(4)(1:1) = 'T'              dn(4)(1:1) = 'T'
# Line 324  C           Time dimension Line 524  C           Time dimension
524              ib(4)  = 1              ib(4)  = 1
525              ie(4)  = 1              ie(4)  = 1
526    
527              CALL MNC_CW_ADD_GNAME(d_cw_name, 4,              CALL MNC_CW_ADD_GNAME(d_cw_name, 4,
528       &             dim, dn, ib, ie, myThid)       &             dim, dn, ib, ie, myThid)
529              CALL MNC_CW_ADD_VNAME(cdiag(m), d_cw_name,              CALL MNC_CW_ADD_VNAME(cdiag(ndId), d_cw_name,
530       &             4,5, myThid)       &             4,5, myThid)
531              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(m),'description',              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'description',
532       &             tdiag(m),myThid)       &             tdiag(ndId),myThid)
533              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(m),'units',              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'units',
534       &             udiag(m),myThid)       &             udiag(ndId),myThid)
535    
536    C     Missing values only for scalar diagnostics at mass points (so far)
537                useMisValForThisDiag = useMissingValue
538         &           .AND.gdiag(ndId)(1:2).EQ.'SM'
539                IF ( useMisValForThisDiag ) THEN
540    C     assign missing values and set flag for adding the netCDF atttibute
541                 CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(cdiag(ndId), 2,
542         I            misval_r8, misval_r4, misval_int,
543         I            myThid )
544    C     and now use the missing values for masking out the land points
545                 DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
546                  DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
547                   DO k = 1,nlevels(listId)
548                    klev = NINT(levs(k,listId))
549                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy
550                     DO i = 1-OLx,sNx+OLx
551                      IF ( maskC(i,j,klev,bi,bj) .EQ. 0. )
552         &                 qtmp1(i,j,k,bi,bj) = misvalLoc
553                     ENDDO
554                    ENDDO
555                   ENDDO
556                  ENDDO
557                 ENDDO
558                ELSE
559    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
560    C     Note: We have to call the following subroutine for each mnc that has
561    C     been created "on the fly" by mnc_cw_add_vname and will be deleted
562    C     by mnc_cw_del_vname, because all of these variables use the same
563    C     identifier so that mnc_cw_vfmv(indv) needs to be overwritten for
564    C     each of these variables
565                 CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(cdiag(ndId), 0,
566         I            misval_r8, misval_r4, misval_int,
567         I            myThid )
568                ENDIF
569    
570              CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,              IF (  ((writeBinaryPrec .EQ. precFloat32)
571       &             cdiag(m), qtmp1, myThid)       &            .AND. (fflags(listId)(1:1) .NE. 'D'))
572         &             .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'R') ) THEN
573                  CALL MNC_CW_RL_W('R',diag_mnc_bn,0,0,
574         &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)
575                ELSEIF ( (writeBinaryPrec .EQ. precFloat64)
576         &             .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'D') ) THEN
577                  CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,
578         &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)
579                ENDIF
580    
581              CALL MNC_CW_DEL_VNAME(cdiag(m), myThid)              CALL MNC_CW_DEL_VNAME(cdiag(ndId), myThid)
582              CALL MNC_CW_DEL_GNAME(d_cw_name, myThid)              CALL MNC_CW_DEL_GNAME(d_cw_name, myThid)
583    
584              _END_MASTER( myThid )              _END_MASTER( myThid )
# Line 344  C           Time dimension Line 586  C           Time dimension
586            ENDIF            ENDIF
587  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
588    
589  C--     end of Processing Fld # n  C--      end loop on lm (or ll if ALLOW_MNC) counter
590             ENDDO
591    C--     end of Processing Fld # md
592          ENDIF          ENDIF
593           ENDDO
594    
595    #ifdef ALLOW_MNC
596    C--   end loop on jj counter
597        ENDDO        ENDDO
598    #endif
599    
600   2000 format(1x,'Computing Diagnostic # ',i3,2x,a8,5x,  #ifdef ALLOW_MDSIO
601       &     'Counter:',i8,3x,'Parms: ',a16)        IF (diag_mdsio) THEN
602   2001 format(1x,'          Vector  Mate for  ',a8,5x,  C-    Note: temporary: since it's a pain to add more arguments to
603       &     'Diagnostic # ',i3,2x,a8,' exists ')  C     all MDSIO S/R, uses instead this specific S/R to write only
604   2002 format(1x,'          Vector  Mate for  ',a8,5x,  C     meta files but with more informations in it.
605       &     'Diagnostic # ',i3,2x,a8,' not enabled')              glf = globalFiles
606   2003 format(1x,'      use Counter Mate for  ',a8,5x,              nRec = nfields(listId)*averageCycle(listId)
607       &     'Diagnostic # ',i3,2x,a8)              CALL MDS_WR_METAFILES(fn, prec, glf, .FALSE.,
608               &              0, 0, nlevels(listId), ' ',
609        RETURN       &              nfields(listId), flds(1,listId), nTimRec, timeRec,
610         &              nRec, myIter, myThid)
611          ENDIF
612    #endif /*  ALLOW_MDSIO  */
613    
614          RETURN
615        END        END
616                                                                        
617  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
Legend:
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changed lines
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