/[MITgcm]/MITgcm/pkg/diagnostics/diagnostics_out.F
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revision 1.33 by jmc, Wed Jan 31 21:47:55 2007 UTC revision 1.46 by jmc, Fri Jan 8 19:19:44 2010 UTC
# Line 38  C     myThid  :: my Thread Id number Line 38  C     myThid  :: my Thread Id number
38        INTEGER listId, myIter, myThid        INTEGER listId, myIter, myThid
39  CEOP  CEOP
40    
41    C     !FUNCTIONS:
42          INTEGER ILNBLNK
43          EXTERNAL ILNBLNK
44    #ifdef ALLOW_FIZHI
45          _RL   getcon
46          EXTERNAL getcon
47    #endif
48    
49  C     !LOCAL VARIABLES:  C     !LOCAL VARIABLES:
50  C     i,j,k :: loop indices  C     i,j,k :: loop indices
51  C     lm    :: loop index (averageCycle)  C     lm    :: loop index (averageCycle)
# Line 58  C              diagnostic storage qdiag Line 66  C              diagnostic storage qdiag
66        INTEGER bi, bj        INTEGER bi, bj
67        INTEGER md, ndId, ip, im        INTEGER md, ndId, ip, im
68        INTEGER mate, mVec        INTEGER mate, mVec
69        CHARACTER*8 parms1        CHARACTER*10 gcode
70        _RL undef, getcon        _RL undef
71        _RL tmpLev        _RL tmpLev
       EXTERNAL getcon  
       INTEGER ILNBLNK  
       EXTERNAL ILNBLNK  
72        INTEGER ilen        INTEGER ilen
73    
74        INTEGER ioUnit        INTEGER ioUnit
75        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) fn        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) fn
76        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff
77        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf
78          INTEGER prec, nRec, nTimRec
79          _RL     timeRec(2)
80  #ifdef ALLOW_MDSIO  #ifdef ALLOW_MDSIO
81        LOGICAL glf        LOGICAL glf
       INTEGER nRec  
       INTEGER prec  
82  #endif  #endif
83  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
84        INTEGER ii        INTEGER ll, llMx, jj, jjMx
85          INTEGER ii, klev
86        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn
87        INTEGER CW_DIMS, NLEN        INTEGER CW_DIMS, NLEN
88        PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )        PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )
# Line 89  C              diagnostic storage qdiag Line 95  C              diagnostic storage qdiag
95        CHARACTER*(5) ctmp        CHARACTER*(5) ctmp
96        _RS ztmp(NrMax)        _RS ztmp(NrMax)
97  #endif  #endif
98          LOGICAL useMissingValue, useMisValForThisDiag
99          REAL*8 misvalLoc
100          REAL*8 misval_r8(2)
101          REAL*4 misval_r4(2)
102          INTEGER misvalIntLoc, misval_int(2)
103  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
104    
105  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
106    
107    C---  set file properties
108        ioUnit= standardMessageUnit        ioUnit= standardMessageUnit
109          undef = UNSET_RL
110    #ifdef ALLOW_FIZHI
111    c     IF ( useFIZHI ) undef = getcon('UNDEF')
112        undef = getcon('UNDEF')        undef = getcon('UNDEF')
113    #endif
114        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter
115        ilen = ILNBLNK(fnames(listId))        ilen = ILNBLNK(fnames(listId))
116        WRITE( fn, '(A,A,A)' ) fnames(listId)(1:ilen),'.',suff(1:10)        WRITE( fn, '(A,A,A)' ) fnames(listId)(1:ilen),'.',suff(1:10)
117    
118    C--   Set time information:
119          IF ( freq(listId).LT.0. ) THEN
120    C-    Snap-shot: store a unique time (which is consistent with State-Var timing)
121            nTimRec = 1
122            timeRec(1) = myTime
123          ELSE
124    C-    Time-average: store the 2 edges of the time-averaging interval.
125    C      this time is consitent with intermediate Var (i.e., non-state, e.g, flux,
126    C      tendencies) timing. For State-Var, this is shifted by + halt time-step.
127            nTimRec = 2
128    
129    C-    end of time-averaging interval:
130            timeRec(2) = myTime
131    
132    C-    begining of time-averaging interval:
133    c       timeRec(1) = myTime - freq(listId)
134    C     a) find the time of the previous multiple of output freq:
135            timeRec(1) = myTime-deltaTClock*0.5 _d 0
136            timeRec(1) = (timeRec(1)-phase(listId))/freq(listId)
137            i = INT( timeRec(1) )
138            IF ( timeRec(1).LT.0. ) THEN
139              tmpLev = FLOAT(i)
140              IF ( timeRec(1).NE.tmpLev ) i = i - 1
141            ENDIF
142            timeRec(1) = phase(listId) + freq(listId)*FLOAT(i)
143    c       if ( listId.eq.2 ) write(0,*) 'f',i,timeRec(1)/deltaTClock
144            timeRec(1) = MAX( timeRec(1), startTime )
145    
146    C     b) round off to nearest multiple of time-step:
147            timeRec(1) = (timeRec(1)-baseTime)/deltaTClock
148            i = NINT( timeRec(1) )
149    C     if just half way, NINT will return the next time-step: correct this
150            tmpLev = FLOAT(i) - 0.5 _d 0
151            IF ( timeRec(1).EQ.tmpLev ) i = i - 1
152            timeRec(1) = baseTime + deltaTClock*FLOAT(i)
153    c       if ( listId.eq.2 ) write(0,*) i,timeRec(1)/deltaTClock
154          ENDIF
155    C--   Convert time to iteration number (debug)
156    c     DO i=1,nTimRec
157    c       timeRec(i) = timeRec(i)/deltaTClock
158    c     ENDDO
159    
160  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
161    C-- this is a trick to reverse the order of the loops on md (= field)
162    C   and lm (= averagePeriod): binary output: lm loop inside md loop ;
163    C                                 mnc ouput: md loop inside lm loop.
164        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
165          DO i = 1,MAX_LEN_FNAM          jjMx = averageCycle(listId)
166            diag_mnc_bn(i:i) = ' '          llMx = 1
167          ENDDO        ELSE
168          DO i = 1,NLEN          jjMx = 1
169            dn_blnk(i:i) = ' '          llMx = averageCycle(listId)
170          ENDDO        ENDIF
171          WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) fnames(listId)(1:ilen)        DO jj=1,jjMx
172    
173           IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
174    C     Handle missing value attribute (land points)
175             useMissingValue = .FALSE.
176    #ifdef DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE
177             useMissingValue = .TRUE.
178    #endif /* DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE */
179             IF ( misvalFlt(listId) .NE. UNSET_RL ) THEN
180              misvalLoc = misvalFlt(listId)
181             ELSE
182              misvalLoc = undef
183             ENDIF
184    C     Defaults to UNSET_I
185             misvalIntLoc = misvalInt(listId)
186             DO ii=1,2
187    C         misval_r4(ii)  = UNSET_FLOAT4
188    C         misval_r8(ii)  = UNSET_FLOAT8
189              misval_r4(ii)  = misvalLoc
190              misval_r8(ii)  = misvalLoc
191              misval_int(ii) = UNSET_I
192             ENDDO
193             DO i = 1,MAX_LEN_FNAM
194               diag_mnc_bn(i:i) = ' '
195             ENDDO
196             DO i = 1,NLEN
197               dn_blnk(i:i) = ' '
198             ENDDO
199             WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) fnames(listId)(1:ilen)
200    
201  C       Update the record dimension by writing the iteration number  C       Update the record dimension by writing the iteration number
202          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)           klev = myIter + jj - jjMx
203          CALL MNC_CW_RL_W_S('D',diag_mnc_bn,0,0,'T',myTime,myThid)           tmpLev = myTime + deltaTClock*(jj -jjMx)
204          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)           CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)
205          CALL MNC_CW_I_W_S('I',diag_mnc_bn,0,0,'iter',myIter,myThid)           CALL MNC_CW_RL_W_S('D',diag_mnc_bn,0,0,'T',tmpLev,myThid)
206             CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)
207             CALL MNC_CW_I_W_S('I',diag_mnc_bn,0,0,'iter',klev,myThid)
208    
209  C       NOTE: at some point it would be a good idea to add a time_bounds  C       NOTE: at some point it would be a good idea to add a time_bounds
210  C       variable that has dimension (2,T) and clearly denotes the  C       variable that has dimension (2,T) and clearly denotes the
211  C       beginning and ending times for each diagnostics period  C       beginning and ending times for each diagnostics period
212    
213          dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)           dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)
214          WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)           WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)
215          dim(1) = nlevels(listId)           dim(1) = nlevels(listId)
216          ib(1)  = 1           ib(1)  = 1
217          ie(1)  = nlevels(listId)           ie(1)  = nlevels(listId)
218    
219          CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,           CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,
220       &       dim, dn, ib, ie, myThid)       &        dim, dn, ib, ie, myThid)
221          CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',           CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',
222       &       0,0, myThid)       &        0,0, myThid)
223          CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',           CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',
224       &       'Idicies of vertical levels within the source arrays',       &        'Idicies of vertical levels within the source arrays',
225       &       myThid)       &        myThid)
226    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
227             IF (useMissingValue)
228         &       CALL MNC_CW_VATTR_MISSING('diag_levels', 0,
229         I       misval_r8, misval_r4, misval_int,
230         I       myThid )
231    
232          CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,           CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,
233       &       'diag_levels', levs(1,listId), myThid)       &        'diag_levels', levs(1,listId), myThid)
234    
235          CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)           CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)
236          CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)           CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)
237    
238  #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK
239  C       This part has been placed in an #ifdef because, as its currently  C       This part has been placed in an #ifdef because, as its currently
# Line 153  C       as: Z[uml]td000000 where the 't' Line 249  C       as: Z[uml]td000000 where the 't'
249  C       gdiag(10)  C       gdiag(10)
250    
251  C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx  C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx
252          ctmp(1:5) = 'mul  '           ctmp(1:5) = 'mul  '
253          DO i = 1,3           DO i = 1,3
254            dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)             dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)
255            WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listId)             WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listId)
256            CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)             CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)
257            CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)             CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)
258    
259  C         The following three ztmp() loops should eventually be modified  C         The following three ztmp() loops should eventually be modified
260  C         to reflect the fractional nature of levs(j,l) -- they should  C         to reflect the fractional nature of levs(j,l) -- they should
# Line 168  C                      + ( rC(INT(FLOOR( Line 264  C                      + ( rC(INT(FLOOR(
264  C                          + rC(INT(CEIL(levs(j,l)))) )  C                          + rC(INT(CEIL(levs(j,l)))) )
265  C                        / ( levs(j,l) - FLOOR(levs(j,l)) )  C                        / ( levs(j,l) - FLOOR(levs(j,l)) )
266  C         for averaged levels.  C         for averaged levels.
267            IF (i .EQ. 1) THEN             IF (i .EQ. 1) THEN
268              DO j = 1,nlevels(listId)               DO j = 1,nlevels(listId)
269                ztmp(j) = rC(NINT(levs(j,listId)))                 ztmp(j) = rC(NINT(levs(j,listId)))
270              ENDDO               ENDDO
271              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',               CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
272       &           'Dimensional coordinate value at the mid point',       &            'Dimensional coordinate value at the mid point',
273       &           myThid)       &            myThid)
274            ELSEIF (i .EQ. 2) THEN             ELSEIF (i .EQ. 2) THEN
275              DO j = 1,nlevels(listId)               DO j = 1,nlevels(listId)
276                ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)) + 1)                 ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)) + 1)
277              ENDDO               ENDDO
278              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',               CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
279       &           'Dimensional coordinate value at the upper point',       &            'Dimensional coordinate value at the upper point',
280       &           myThid)       &            myThid)
281            ELSEIF (i .EQ. 3) THEN             ELSEIF (i .EQ. 3) THEN
282              DO j = 1,nlevels(listId)               DO j = 1,nlevels(listId)
283                ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)))                 ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)))
284              ENDDO               ENDDO
285              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',               CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
286       &           'Dimensional coordinate value at the lower point',       &            'Dimensional coordinate value at the lower point',
287       &           myThid)       &            myThid)
288            ENDIF             ENDIF
289            CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)  C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
290            CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)             IF (useMissingValue)
291            CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)       &          CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(dn(1), 0,
292          ENDDO       I          misval_r8, misval_r4, misval_int,
293         I          myThid )
294               CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)
295               CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)
296               CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)
297             ENDDO
298  #endif /*  DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  */  #endif /*  DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  */
299    
300        ENDIF         ENDIF
301  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
302    
303  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
304    
305        DO md = 1,nfields(listId)         DO md = 1,nfields(listId)
306          ndId = jdiag(md,listId)          ndId = jdiag(md,listId)
307          parms1 = gdiag(ndId)(1:8)          gcode = gdiag(ndId)(1:10)
308          mate = 0          mate = 0
309          mVec = 0          mVec = 0
310          IF ( parms1(5:5).EQ.'C' ) THEN          IF ( gcode(5:5).EQ.'C' ) THEN
311  C-      Check for Mate of a Counter Diagnostic  C-      Check for Mate of a Counter Diagnostic
312             READ(parms1,'(5X,I3)') mate             mate = hdiag(ndId)
313          ELSEIF ( parms1(1:1).EQ.'U' .OR. parms1(1:1).EQ.'V' ) THEN          ELSEIF ( gcode(1:1).EQ.'U' .OR. gcode(1:1).EQ.'V' ) THEN
314  C-      Check for Mate of a Vector Diagnostic  C-      Check for Mate of a Vector Diagnostic
315             READ(parms1,'(5X,I3)') mVec             mVec = hdiag(ndId)
316          ENDIF          ENDIF
317          IF ( idiag(md,listId).NE.0 .AND. parms1(5:5).NE.'D' ) THEN          IF ( idiag(md,listId).NE.0 .AND. gcode(5:5).NE.'D' ) THEN
318  C--     Start processing 1 Fld :  C--     Start processing 1 Fld :
319    #ifdef ALLOW_MNC
320             DO ll=1,llMx
321              lm = jj+ll-1
322    #else
323           DO lm=1,averageCycle(listId)           DO lm=1,averageCycle(listId)
324    #endif
325    
326            ip = ABS(idiag(md,listId)) + kdiag(ndId)*(lm-1)            ip = ABS(idiag(md,listId)) + kdiag(ndId)*(lm-1)
327            im = mdiag(md,listId)            im = mdiag(md,listId)
# Line 230  C-        Empty diagnostics case : Line 336  C-        Empty diagnostics case :
336       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter
337              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
338       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
339              WRITE(msgBuf,'(A,I4,3A,I3,2A)')              WRITE(msgBuf,'(A,I6,3A,I4,2A)')
340       &       '- WARNING -   diag.#',ndId, ' : ',flds(md,listId),       &       '- WARNING -   diag.#',ndId, ' : ',flds(md,listId),
341       &       ' (#',md,' ) in outp.Stream: ',fnames(listId)       &       ' (#',md,' ) in outp.Stream: ',fnames(listId)
342              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
343       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
344              IF ( averageCycle(listId).GT.1 ) THEN              IF ( averageCycle(listId).GT.1 ) THEN
345               WRITE(msgBuf,'(A,2(I2,A))')               WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
346       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag(lm=',lm,')=',       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag(lm=',lm,')=',
347       &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'       &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
348              ELSE              ELSE
349               WRITE(msgBuf,'(A,2(I2,A))')               WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
350       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',
351       &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'       &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
352              ENDIF              ENDIF
# Line 267  C-        Empty diagnostics case : Line 373  C-        Empty diagnostics case :
373  C-        diagnostics is not empty :  C-        diagnostics is not empty :
374    
375              IF ( debugLevel.GE.debLevA .AND. myThid.EQ.1 ) THEN              IF ( debugLevel.GE.debLevA .AND. myThid.EQ.1 ) THEN
376                WRITE(ioUnit,'(A,I3,3A,I8,2A)')                WRITE(ioUnit,'(A,I6,3A,I8,2A)')
377       &         ' Computing Diagnostic # ', ndId, '  ', cdiag(ndId),       &         ' Computing Diagnostic # ', ndId, '  ', cdiag(ndId),
378       &         '     Counter:',ndiag(ip,1,1),'   Parms: ',gdiag(ndId)       &         '     Counter:',ndiag(ip,1,1),'   Parms: ',gdiag(ndId)
379                IF ( mate.GT.0 ) THEN                IF ( mate.GT.0 ) THEN
380                 WRITE(ioUnit,'(3A,I3,2A)')                 WRITE(ioUnit,'(3A,I6,2A)')
381       &         '       use Counter Mate for  ', cdiag(ndId),       &         '       use Counter Mate for  ', cdiag(ndId),
382       &         '     Diagnostic # ',mate, '  ', cdiag(mate)       &         '     Diagnostic # ',mate, '  ', cdiag(mate)
383                ELSEIF ( mVec.GT.0 ) THEN                ELSEIF ( mVec.GT.0 ) THEN
384                  IF ( im.GT.0 .AND. ndiag(MAX(1,im),1,1).GT.0 ) THEN                  IF ( im.GT.0 .AND. ndiag(MAX(1,im),1,1).GT.0 ) THEN
385                   WRITE(ioUnit,'(3A,I3,3A)')                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
386       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
387       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
388       &             ' exists '       &             ' exists '
389                  ELSE                  ELSE
390                   WRITE(ioUnit,'(3A,I3,3A)')                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
391       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
392       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),       &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
393       &             ' not enabled'       &             ' not enabled'
# Line 340  C jmc: for now, this can only work in an Line 446  C jmc: for now, this can only work in an
446    
447  C--    Ready to write field "md", element "lm" in averageCycle(listId)  C--    Ready to write field "md", element "lm" in averageCycle(listId)
448    
 #ifdef ALLOW_MDSIO  
449  C-        write to binary file, using MDSIO pkg:  C-        write to binary file, using MDSIO pkg:
450            IF (diag_mdsio) THEN            IF ( diag_mdsio ) THEN
             glf = globalFiles  
451              nRec = lm + (md-1)*averageCycle(listId)              nRec = lm + (md-1)*averageCycle(listId)
452  C           default precision for output files  C           default precision for output files
453              prec = writeBinaryPrec              prec = writeBinaryPrec
454  C           fFlag(1)=R(or D): force it to be 32-bit(or 64) precision  C           fFlag(1)=R(or D): force it to be 32-bit(or 64) precision
455              IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'R' ) prec = precFloat32              IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'R' ) prec = precFloat32
456              IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'D' ) prec = precFloat64              IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'D' ) prec = precFloat64
457  c           CALL MDS_WRITE_FIELD(fn,prec,glf,.FALSE.,'RL',  C         a hack not to write meta files now: pass -nRec < 0 to MDS_WRITE S/R
458  c    &              NrMax,nlevels(listId),qtmp1,nRec,myIter,myThid)              CALL WRITE_REC_LEV_RL(
459  C         a hack not to write meta files now:       I                            fn, prec,
460              CALL MDS_WRITE_FIELD(fn,prec,glf,.FALSE.,'RL',       I                            NrMax, 1, nlevels(listId),
461       &              NrMax,nlevels(listId),qtmp1,-nRec,myIter,myThid)       I                            qtmp1, -nRec, myIter, myThid )
462            ENDIF            ENDIF
 #endif /*  ALLOW_MDSIO  */  
463    
464  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
465            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
# Line 437  C           Time dimension Line 540  C           Time dimension
540              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'units',              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'units',
541       &             udiag(ndId),myThid)       &             udiag(ndId),myThid)
542    
543  C           Per the observations of Baylor, this has been commented out  C     Missing values only for scalar diagnostics at mass points (so far)
544  C           until we have code that can write missing_value attributes              useMisValForThisDiag = useMissingValue
545  C           in a way thats compatible with most of the more popular       &           .AND.gdiag(ndId)(1:2).EQ.'SM'
546  C           netCDF tools including ferret.  Using all-zeros completely              IF ( useMisValForThisDiag ) THEN
547  C           breaks ferret.  C     assign missing values and set flag for adding the netCDF atttibute
548                 CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(cdiag(ndId), 2,
549  C           CALL MNC_CW_ADD_VATTR_DBL(cdiag(ndId),'missing_value',       I            misval_r8, misval_r4, misval_int,
550  C           &             0.0 _d 0,myThid)       I            myThid )
551    C     and now use the missing values for masking out the land points
552              IF ( ( (writeBinaryPrec .EQ. precFloat32)               DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
553       &           .AND. (fflags(listId)(1:1) .NE. 'D')                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
554       &           .AND. (fflags(listId)(1:1) .NE. 'R') )                 DO k = 1,nlevels(listId)
555       &           .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'R')) THEN                  klev = NINT(levs(k,listId))
556                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy
557                     DO i = 1-OLx,sNx+OLx
558                      IF ( maskC(i,j,klev,bi,bj) .EQ. 0. )
559         &                 qtmp1(i,j,k,bi,bj) = misvalLoc
560                     ENDDO
561                    ENDDO
562                   ENDDO
563                  ENDDO
564                 ENDDO
565                ELSE
566    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
567    C     Note: We have to call the following subroutine for each mnc that has
568    C     been created "on the fly" by mnc_cw_add_vname and will be deleted
569    C     by mnc_cw_del_vname, because all of these variables use the same
570    C     identifier so that mnc_cw_vfmv(indv) needs to be overwritten for
571    C     each of these variables
572                 CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(cdiag(ndId), 0,
573         I            misval_r8, misval_r4, misval_int,
574         I            myThid )
575                ENDIF
576    
577                IF (  ((writeBinaryPrec .EQ. precFloat32)
578         &            .AND. (fflags(listId)(1:1) .NE. 'D'))
579         &             .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'R') ) THEN
580                CALL MNC_CW_RL_W('R',diag_mnc_bn,0,0,                CALL MNC_CW_RL_W('R',diag_mnc_bn,0,0,
581       &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)       &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)
582              ELSEIF ( (writeBinaryPrec .EQ. precFloat64)              ELSEIF ( (writeBinaryPrec .EQ. precFloat64)
# Line 466  C           &             0.0 _d 0,myThi Line 593  C           &             0.0 _d 0,myThi
593            ENDIF            ENDIF
594  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
595    
596    C--      end loop on lm (or ll if ALLOW_MNC) counter
597           ENDDO           ENDDO
598  C--     end of Processing Fld # md  C--     end of Processing Fld # md
599          ENDIF          ENDIF
600           ENDDO
601    
602    #ifdef ALLOW_MNC
603    C--   end loop on jj counter
604        ENDDO        ENDDO
605    #endif
606    
607  #ifdef ALLOW_MDSIO  #ifdef ALLOW_MDSIO
608        IF (diag_mdsio) THEN        IF (diag_mdsio) THEN
609  C-    Note: temporary: since it's a pain to add more arguments to  C-    Note: temporary: since it's a pain to add more arguments to
610  C     all MDSIO S/R, uses instead this specific S/R to write only  C     all MDSIO S/R, uses instead this specific S/R to write only
611  C     meta files but with more informations in it.  C     meta files but with more informations in it.
612                glf = globalFiles
613              nRec = nfields(listId)*averageCycle(listId)              nRec = nfields(listId)*averageCycle(listId)
614              CALL MDS_WR_METAFILES(fn, prec, glf, .FALSE.,              CALL MDS_WR_METAFILES(fn, prec, glf, .FALSE.,
615       &              0, 0, nlevels(listId), ' ',       &              0, 0, nlevels(listId), ' ',
616       &              nfields(listId), flds(1,listId), 1, myTime,       &              nfields(listId), flds(1,listId), nTimRec, timeRec,
617       &              nRec, myIter, myThid)       &              nRec, myIter, myThid)
618        ENDIF        ENDIF
619  #endif /*  ALLOW_MDSIO  */  #endif /*  ALLOW_MDSIO  */
Legend:
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