/[MITgcm]/MITgcm/pkg/diagnostics/diagnostics_out.F
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revision 1.8 by jmc, Tue Feb 22 17:50:40 2005 UTC revision 1.38 by mlosch, Thu May 22 09:53:21 2008 UTC
# Line 9  C     !ROUTINE: DIAGNOSTICS_OUT Line 9  C     !ROUTINE: DIAGNOSTICS_OUT
9    
10  C     !INTERFACE:  C     !INTERFACE:
11        SUBROUTINE  DIAGNOSTICS_OUT(        SUBROUTINE  DIAGNOSTICS_OUT(
12       I     listnum,       I     listId,
13       I     myIter,       I     myIter,
14         I     myTime,
15       I     myThid )       I     myThid )
16    
17  C     !DESCRIPTION:  C     !DESCRIPTION:
18  C     Write output for diagnostics fields.  C     Write output for diagnostics fields.
19          
20  C     !USES:  C     !USES:
21        IMPLICIT NONE        IMPLICIT NONE
22  #include "SIZE.h"  #include "SIZE.h"
# Line 25  C     !USES: Line 26  C     !USES:
26  #include "DIAGNOSTICS_SIZE.h"  #include "DIAGNOSTICS_SIZE.h"
27  #include "DIAGNOSTICS.h"  #include "DIAGNOSTICS.h"
28    
29  #ifdef ALLOW_FIZHI        INTEGER NrMax
30  #include "fizhi_SIZE.h"        PARAMETER( NrMax = numLevels )
 #else  
       INTEGER Nrphys  
       PARAMETER (Nrphys=0)  
 #endif  
   
31    
32  C     !INPUT PARAMETERS:  C     !INPUT PARAMETERS:
33  C     listnum :: Diagnostics list number being written  C     listId  :: Diagnostics list number being written
34  C     myIter  :: current iteration number  C     myIter  :: current iteration number
35    C     myTime  :: current time of simulation (s)
36  C     myThid  :: my Thread Id number  C     myThid  :: my Thread Id number
37        INTEGER listnum, myIter, myThid        _RL     myTime
38          INTEGER listId, myIter, myThid
39  CEOP  CEOP
40    
41  C     !LOCAL VARIABLES:  C     !LOCAL VARIABLES:
42        INTEGER i, j, k, m, n, bi, bj  C     i,j,k :: loop indices
43        CHARACTER*8 parms1  C     lm    :: loop index (averageCycle)
44        CHARACTER*3 mate_index  C     md    :: field number in the list "listId".
45    C     ndId  :: diagnostics  Id number (in available diagnostics list)
46    C     mate  :: counter mate Id number (in available diagnostics list)
47    C     ip    :: diagnostics  pointer to storage array
48    C     im    :: counter-mate pointer to storage array
49    C
50    C--   COMMON /LOCAL_DIAGNOSTICS_OUT/ local common block (for multi-threaded)
51    C     qtmp1 :: thread-shared temporary array (needs to be in common block):
52    C              to write a diagnostic field to file, copy it first from (big)
53    C              diagnostic storage qdiag into it.
54          COMMON /LOCAL_DIAGNOSTICS_OUT/ qtmp1
55          _RL qtmp1(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,NrMax,nSx,nSy)
56    
57          INTEGER i, j, k, lm, klev
58          INTEGER bi, bj
59          INTEGER md, ndId, ip, im
60        INTEGER mate, mVec        INTEGER mate, mVec
61        _RL qtmp1(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr+Nrphys,nSx,nSy)        CHARACTER*10 gcode
62        _RL undef, getcon        _RL undef, getcon
63          _RL tmpLev
64        EXTERNAL getcon        EXTERNAL getcon
65        INTEGER ILNBLNK        INTEGER ILNBLNK
66        EXTERNAL ILNBLNK        EXTERNAL ILNBLNK
67        INTEGER ilen        INTEGER ilen
68    
69        INTEGER ioUnit        INTEGER ioUnit
70        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) pref        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) fn
71        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff
72        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf        CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) msgBuf
73        CHARACTER*(80) fn        INTEGER prec, nRec
74    #ifdef ALLOW_MDSIO
75        LOGICAL glf        LOGICAL glf
76    #endif
77  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
78        INTEGER ii        INTEGER ii
79        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn        CHARACTER*(MAX_LEN_FNAM) diag_mnc_bn
       CHARACTER*(5) ctmp  
80        INTEGER CW_DIMS, NLEN        INTEGER CW_DIMS, NLEN
81        PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )        PARAMETER ( CW_DIMS = 10 )
82        PARAMETER ( NLEN    = 80 )        PARAMETER ( NLEN    = 80 )
# Line 69  C     !LOCAL VARIABLES: Line 84  C     !LOCAL VARIABLES:
84        CHARACTER*(NLEN) dn(CW_DIMS)        CHARACTER*(NLEN) dn(CW_DIMS)
85        CHARACTER*(NLEN) d_cw_name        CHARACTER*(NLEN) d_cw_name
86        CHARACTER*(NLEN) dn_blnk        CHARACTER*(NLEN) dn_blnk
87        _RS ztmp(Nr+Nrphys)  #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK
88          CHARACTER*(5) ctmp
89          _RS ztmp(NrMax)
90    #endif
91          REAL*8 misvalLoc
92          REAL*8 misval_r8(2)
93          REAL*4 misval_r4(2)
94          INTEGER misvalIntLoc, misval_int(2)
95  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
96    
97  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
98    
99        ioUnit= standardMessageUnit        ioUnit= standardMessageUnit
100        undef = getcon('UNDEF')        undef = getcon('UNDEF')
       glf = globalFiles  
101        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter        WRITE(suff,'(I10.10)') myIter
102        pref = fnames(listnum)        ilen = ILNBLNK(fnames(listId))
103        ilen=ILNBLNK( pref )        WRITE( fn, '(A,A,A)' ) fnames(listId)(1:ilen),'.',suff(1:10)
       WRITE( fn, '(A,A,A)' ) pref(1:ilen),'.',suff(1:10)  
104    
105  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
106        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN        IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
107    #ifdef DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE
108    C     Handle missing value attribute (land points)
109            misvalLoc = undef
110    C     Defaults to UNSET_I
111            misvalIntLoc = UNSET_I
112            DO ii=1,2
113    C        misval_r4(ii)  = UNSET_FLOAT4
114    C        misval_r8(ii)  = UNSET_FLOAT8
115             misval_r4(ii)  = misvalLoc
116             misval_r8(ii)  = misvalLoc
117             misval_int(ii) = UNSET_I
118            ENDDO
119    #endif /* DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE */
120          DO i = 1,MAX_LEN_FNAM          DO i = 1,MAX_LEN_FNAM
121            diag_mnc_bn(i:i) = ' '            diag_mnc_bn(i:i) = ' '
122          ENDDO          ENDDO
123          DO i = 1,NLEN          DO i = 1,NLEN
124            dn_blnk(i:i) = ' '            dn_blnk(i:i) = ' '
125          ENDDO          ENDDO
126  c       WRITE( diag_mnc_bn, '(A,A)' ) 'diag.', pref(1:ilen)          WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) fnames(listId)(1:ilen)
         WRITE( diag_mnc_bn, '(A)' ) pref(1:ilen)  
127    
128  C       Update the record dimension by writing the iteration number  C       Update the record dimension by writing the iteration number
129          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, -1, myThid)
130          CALL MNC_CW_I_W_S('I',diag_mnc_bn,0,0,'T',myIter,myThid)          CALL MNC_CW_RL_W_S('D',diag_mnc_bn,0,0,'T',myTime,myThid)
131          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)          CALL MNC_CW_SET_UDIM(diag_mnc_bn, 0, myThid)
132            CALL MNC_CW_I_W_S('I',diag_mnc_bn,0,0,'iter',myIter,myThid)
133    
134    C       NOTE: at some point it would be a good idea to add a time_bounds
135    C       variable that has dimension (2,T) and clearly denotes the
136    C       beginning and ending times for each diagnostics period
137    
138          dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)          dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)
139          WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listnum)          WRITE(dn(1),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)
140          dim(1) = nlevels(listnum)          dim(1) = nlevels(listId)
141          ib(1)  = 1          ib(1)  = 1
142          ie(1)  = nlevels(listnum)          ie(1)  = nlevels(listId)
143    
144          CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,          CALL MNC_CW_ADD_GNAME('diag_levels', 1,
145       &       dim, dn, ib, ie, myThid)       &       dim, dn, ib, ie, myThid)
146          CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',          CALL MNC_CW_ADD_VNAME('diag_levels', 'diag_levels',
147       &       0,0, myThid)       &       0,0, myThid)
148          CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',          CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT('diag_levels','description',
149       &       'Idicies of vertical levels within the source arrays',       &       'Idicies of vertical levels within the source arrays',
150       &       myThid)       &       myThid)
151            #ifdef DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE
152          CALL MNC_CW_RL_W('I',diag_mnc_bn,0,0,          CALL MNC_CW_VATTR_MISSING('diag_levels', 0,
153       &       'diag_levels', levs(1,listnum), myThid)       I       misval_r8, misval_r4, misval_int,
154         I       myThid )
155    #endif /* DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE */
156    
157            CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,
158         &       'diag_levels', levs(1,listId), myThid)
159    
160          CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)          CALL MNC_CW_DEL_VNAME('diag_levels', myThid)
161          CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)          CALL MNC_CW_DEL_GNAME('diag_levels', myThid)
162    
163    #ifdef DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK
164    C       This part has been placed in an #ifdef because, as its currently
165    C       written, it will only work with variables defined on a dynamics
166    C       grid.  As we start using diagnostics for physics grids, ice
167    C       levels, land levels, etc. the different vertical coordinate
168    C       dimensions will have to be taken into account.
169    
170    C       20051021 JMC & EH3 : We need to extend this so that a few
171    C       variables each defined on different grids do not have the same
172    C       vertical dimension names so we should be using a pattern such
173    C       as: Z[uml]td000000 where the 't' is the type as specified by
174    C       gdiag(10)
175    
176  C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx  C       Now define:  Zmdxxxxxx, Zudxxxxxx, Zldxxxxxx
177          ctmp(1:5) = 'mul  '          ctmp(1:5) = 'mul  '
178          DO i = 1,3          DO i = 1,3
179            dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)            dn(1)(1:NLEN) = dn_blnk(1:NLEN)
180            WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listnum)            WRITE(dn(1),'(3a,i6.6)') 'Z',ctmp(i:i),'d',nlevels(listId)
181            CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)            CALL MNC_CW_ADD_GNAME(dn(1), 1, dim, dn, ib, ie, myThid)
182            CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)            CALL MNC_CW_ADD_VNAME(dn(1), dn(1), 0,0, myThid)
183            DO j = 1,nlevels(listnum)  
184              IF (i .EQ. 1) THEN  C         The following three ztmp() loops should eventually be modified
185                ztmp(j) = rC(levs(j,listnum))  C         to reflect the fractional nature of levs(j,l) -- they should
186                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',  C         do something like:
187       &             'Dimensional coordinate value at the mid point',  C            ztmp(j) = rC(INT(FLOOR(levs(j,l))))
188       &             myThid)  C                      + ( rC(INT(FLOOR(levs(j,l))))
189              ELSEIF (i .EQ. 2) THEN  C                          + rC(INT(CEIL(levs(j,l)))) )
190                ztmp(j) = rF(levs(j,listnum) + 1)  C                        / ( levs(j,l) - FLOOR(levs(j,l)) )
191                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',  C         for averaged levels.
192       &             'Dimensional coordinate value at the upper point',            IF (i .EQ. 1) THEN
193       &             myThid)              DO j = 1,nlevels(listId)
194              ELSEIF (i .EQ. 3) THEN                ztmp(j) = rC(NINT(levs(j,listId)))
195                ztmp(j) = rF(levs(j,listnum))              ENDDO
196                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
197       &             'Dimensional coordinate value at the lower point',       &           'Dimensional coordinate value at the mid point',
198       &             myThid)       &           myThid)
199              ENDIF            ELSEIF (i .EQ. 2) THEN
200            ENDDO              DO j = 1,nlevels(listId)
201                  ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)) + 1)
202                ENDDO
203                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
204         &           'Dimensional coordinate value at the upper point',
205         &           myThid)
206              ELSEIF (i .EQ. 3) THEN
207                DO j = 1,nlevels(listId)
208                  ztmp(j) = rF(NINT(levs(j,listId)))
209                ENDDO
210                CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(dn(1),'description',
211         &           'Dimensional coordinate value at the lower point',
212         &           myThid)
213              ENDIF
214    #ifdef DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE
215              CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(dn(1), 0,
216         I         misval_r8, misval_r4, misval_int,
217         I         myThid )
218    #endif /* DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE */
219            CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)            CALL MNC_CW_RS_W('D',diag_mnc_bn,0,0, dn(1), ztmp, myThid)
220            CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)            CALL MNC_CW_DEL_VNAME(dn(1), myThid)
221            CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)            CALL MNC_CW_DEL_GNAME(dn(1), myThid)
222          ENDDO          ENDDO
223    #endif /*  DIAG_MNC_COORD_NEEDSWORK  */
224    
225        ENDIF        ENDIF
226  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
227    
228        DO n = 1,nfields(listnum)  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
229          m = jdiag(n,listnum)  
230          parms1 = gdiag(m)(1:8)        DO md = 1,nfields(listId)
231          IF ( idiag(m).NE.0 .AND. parms1(5:5).NE.'D' ) THEN          ndId = jdiag(md,listId)
232            gcode = gdiag(ndId)(1:10)
233            mate = 0
234            mVec = 0
235            IF ( gcode(5:5).EQ.'C' ) THEN
236    C-      Check for Mate of a Counter Diagnostic
237               mate = hdiag(ndId)
238            ELSEIF ( gcode(1:1).EQ.'U' .OR. gcode(1:1).EQ.'V' ) THEN
239    C-      Check for Mate of a Vector Diagnostic
240               mVec = hdiag(ndId)
241            ENDIF
242            IF ( idiag(md,listId).NE.0 .AND. gcode(5:5).NE.'D' ) THEN
243  C--     Start processing 1 Fld :  C--     Start processing 1 Fld :
244             DO lm=1,averageCycle(listId)
245    
246            IF ( ndiag(m).EQ.0 ) THEN            ip = ABS(idiag(md,listId)) + kdiag(ndId)*(lm-1)
247              im = mdiag(md,listId)
248              IF (mate.GT.0) im = im + kdiag(mate)*(lm-1)
249              IF (mVec.GT.0) im = im + kdiag(mVec)*(lm-1)
250    
251              IF ( ndiag(ip,1,1).EQ.0 ) THEN
252  C-        Empty diagnostics case :  C-        Empty diagnostics case :
253    
254              _BEGIN_MASTER( myThid )              _BEGIN_MASTER( myThid )
255              WRITE(msgBuf,'(A,I10)')              WRITE(msgBuf,'(A,I10)')
256       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter       &        '- WARNING - from DIAGNOSTICS_OUT at iter=', myIter
257              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
258       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
259              WRITE(msgBuf,'(A,I4,3A,I3,2A)')              WRITE(msgBuf,'(A,I6,3A,I4,2A)')
260       &       '- WARNING -   diag.#',m, ' : ',flds(n,listnum),       &       '- WARNING -   diag.#',ndId, ' : ',flds(md,listId),
261       &       ' (#',n,' ) in outp.Stream: ',fnames(listnum)       &       ' (#',md,' ) in outp.Stream: ',fnames(listId)
262              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
263       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
264              WRITE(msgBuf,'(A,I2,A)')              IF ( averageCycle(listId).GT.1 ) THEN
265       &       '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',ndiag(m),' )'               WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
266              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,       &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag(lm=',lm,')=',
267         &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
268                ELSE
269                 WRITE(msgBuf,'(A,2(I3,A))')
270         &        '- WARNING -   has not been filled (ndiag=',
271         &                                            ndiag(ip,1,1), ' )'
272                ENDIF
273                CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
274       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
275              WRITE(msgBuf,'(A)')              WRITE(msgBuf,'(A)')
276       &       'WARNING DIAGNOSTICS_OUT  => write ZEROS instead'       &       'WARNING DIAGNOSTICS_OUT  => write ZEROS instead'
277              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,              CALL PRINT_MESSAGE( msgBuf, errorMessageUnit,
278       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)       &                          SQUEEZE_RIGHT, myThid)
279              _END_MASTER( myThid )              _END_MASTER( myThid )
280              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
281                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)                DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
282                  DO k = 1,nlevels(listnum)                  DO k = 1,nlevels(listId)
283                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy
284                      DO i = 1-OLx,sNx+OLx                      DO i = 1-OLx,sNx+OLx
285                        qtmp1(i,j,k,bi,bj) = 0. _d 0                        qtmp1(i,j,k,bi,bj) = 0. _d 0
# Line 194  C-        Empty diagnostics case : Line 292  C-        Empty diagnostics case :
292            ELSE            ELSE
293  C-        diagnostics is not empty :  C-        diagnostics is not empty :
294    
295              IF ( myThid.EQ.1 )              IF ( debugLevel.GE.debLevA .AND. myThid.EQ.1 ) THEN
296       &             WRITE(ioUnit,2000) m,cdiag(m),ndiag(m),gdiag(m)                WRITE(ioUnit,'(A,I6,3A,I8,2A)')
297         &         ' Computing Diagnostic # ', ndId, '  ', cdiag(ndId),
298              IF ( parms1(5:5).EQ.'C' ) THEN       &         '     Counter:',ndiag(ip,1,1),'   Parms: ',gdiag(ndId)
299  C             Check for Mate of a Counter Diagnostic                IF ( mate.GT.0 ) THEN
300  C             --------------------------------------                 WRITE(ioUnit,'(3A,I6,2A)')
301                mate_index = parms1(6:8)       &         '       use Counter Mate for  ', cdiag(ndId),
302                READ (mate_index,'(I3)') mate       &         '     Diagnostic # ',mate, '  ', cdiag(mate)
303                IF ( myThid.EQ.1 )                ELSEIF ( mVec.GT.0 ) THEN
304       &                 WRITE(ioUnit,2003) cdiag(m),mate,cdiag(mate)                  IF ( im.GT.0 .AND. ndiag(MAX(1,im),1,1).GT.0 ) THEN
305              ELSE                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
306                mate = 0       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
307         &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
308  C             Check for Mate of a Vector Diagnostic       &             ' exists '
 C             -------------------------------------  
               IF ( parms1(1:1).EQ.'U' .OR. parms1(1:1).EQ.'V' ) THEN  
                 mate_index = parms1(6:8)  
                 READ (mate_index,'(I3)') mVec  
                 IF ( idiag(mVec).NE.0 ) THEN  
                   IF ( myThid.EQ.1 )  
      &                 WRITE(ioUnit,2001) cdiag(m),mVec,cdiag(mVec)  
309                  ELSE                  ELSE
310                    IF ( myThid.EQ.1 )                   WRITE(ioUnit,'(3A,I6,3A)')
311       &                 WRITE(ioUnit,2002) cdiag(m),mVec,cdiag(mVec)       &             '           Vector  Mate for  ', cdiag(ndId),
312         &             '     Diagnostic # ',mVec, '  ', cdiag(mVec),
313         &             ' not enabled'
314                  ENDIF                  ENDIF
315                ENDIF                ENDIF
316              ENDIF              ENDIF
317    
318              DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'P' ) THEN
319               DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  C-       get all the levels (for vertical interpolation)
320                DO k = 1,nlevels(listnum)                DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
321                  CALL GETDIAG(                 DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
322       I                       levs(k,listnum),undef,                  DO k = 1,kdiag(ndId)
323       O                       qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),                    tmpLev = k
324       I                       m,mate,bi,bj,myThid)                    CALL GETDIAG(
325         I                         tmpLev,undef,
326         O                         qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),
327         I                         ndId,mate,ip,im,bi,bj,myThid)
328                    ENDDO
329                   ENDDO
330                ENDDO                ENDDO
331               ENDDO              ELSE
332              ENDDO  C-       get only selected levels:
333                  DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
334                   DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
335                    DO k = 1,nlevels(listId)
336                      CALL GETDIAG(
337         I                         levs(k,listId),undef,
338         O                         qtmp1(1-OLx,1-OLy,k,bi,bj),
339         I                         ndId,mate,ip,im,bi,bj,myThid)
340                    ENDDO
341                   ENDDO
342                  ENDDO
343                ENDIF
344    
345  C-        end of empty diag / not empty block  C-        end of empty diag / not empty block
346            ENDIF            ENDIF
347    
348  #ifdef ALLOW_MDSIO  C-----------------------------------------------------------------------
349  C         Prepare for mdsio optionality  C         Check to see if we need to interpolate before output
350            IF (diag_mdsio) THEN  C-----------------------------------------------------------------------
351              CALL mdswritefield_new(fn,writeBinaryPrec,glf,'RL',            IF ( fflags(listId)(2:2).EQ.'P' ) THEN
352       &           Nr+Nrphys,nlevels(listnum),qtmp1,n,myIter,myThid)  C-        Do vertical interpolation:
353               IF ( fluidIsAir ) THEN
354    C jmc: for now, this can only work in an atmospheric set-up (fluidIsAir);
355                CALL DIAGNOSTICS_INTERP_VERT(
356         I                     listId, md, ndId, ip, im, lm,
357         U                     qtmp1,
358         I                     undef, myTime, myIter, myThid )
359               ELSE
360                 WRITE(msgBuf,'(2A)') 'DIAGNOSTICS_OUT: ',
361         &         'INTERP_VERT not allowed in this config'
362                 CALL PRINT_ERROR( msgBuf , myThid )
363                 STOP 'ABNORMAL END: S/R DIAGNOSTICS_OUT'
364               ENDIF
365              ENDIF
366    
367    C--    Ready to write field "md", element "lm" in averageCycle(listId)
368    
369    C-        write to binary file, using MDSIO pkg:
370              IF ( diag_mdsio ) THEN
371                nRec = lm + (md-1)*averageCycle(listId)
372    C           default precision for output files
373                prec = writeBinaryPrec
374    C           fFlag(1)=R(or D): force it to be 32-bit(or 64) precision
375                IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'R' ) prec = precFloat32
376                IF ( fflags(listId)(1:1).EQ.'D' ) prec = precFloat64
377    C         a hack not to write meta files now: pass -nRec < 0 to MDS_WRITE S/R
378                CALL WRITE_REC_LEV_RL(
379         I                            fn, prec,
380         I                            NrMax, 1, nlevels(listId),
381         I                            qtmp1, -nRec, myIter, myThid )
382            ENDIF            ENDIF
 #endif /*  ALLOW_MDSIO  */  
383    
384  #ifdef ALLOW_MNC  #ifdef ALLOW_MNC
385            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN            IF (useMNC .AND. diag_mnc) THEN
# Line 259  C           subtlety within MNC.  Basica Line 396  C           subtlety within MNC.  Basica
396  C           caching its own concept of what each "grid name" (that is, a  C           caching its own concept of what each "grid name" (that is, a
397  C           dimension group name) means.  So one cannot re-use the same  C           dimension group name) means.  So one cannot re-use the same
398  C           "grid" name for different collections of dimensions within a  C           "grid" name for different collections of dimensions within a
399  C           given file.  By appending the "m" values to each name, we  C           given file.  By appending the "ndId" values to each name, we
400  C           guarantee uniqueness within each MNC-produced file.  C           guarantee uniqueness within each MNC-produced file.
401              WRITE(d_cw_name,'(a,i6.6)') 'd_cw_',m              WRITE(d_cw_name,'(a,i6.6)') 'd_cw_',ndId
402    
403  C           XY dimensions  C           XY dimensions
404              dim(1)       = sNx + 2*OLx              dim(1)       = sNx + 2*OLx
405              dim(2)       = sNy + 2*OLy              dim(2)       = sNy + 2*OLy
406              ib(1)        = OLx + 1              ib(1)        = OLx + 1
407              ib(2)        = OLy + 1              ib(2)        = OLy + 1
408              IF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'M') THEN              IF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'M') THEN
409                dn(1)(1:2) = 'X'                dn(1)(1:2) = 'X'
410                ie(1)      = OLx + sNx                ie(1)      = OLx + sNx
411                dn(2)(1:2) = 'Y'                dn(2)(1:2) = 'Y'
412                ie(2)      = OLy + sNy                ie(2)      = OLy + sNy
413              ELSEIF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'U') THEN              ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'U') THEN
414                dn(1)(1:3) = 'Xp1'                dn(1)(1:3) = 'Xp1'
415                ie(1)      = OLx + sNx + 1                ie(1)      = OLx + sNx + 1
416                dn(2)(1:2) = 'Y'                dn(2)(1:2) = 'Y'
417                ie(2)      = OLy + sNy                ie(2)      = OLy + sNy
418              ELSEIF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'V') THEN              ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'V') THEN
419                dn(1)(1:2) = 'X'                dn(1)(1:2) = 'X'
420                ie(1)      = OLx + sNx                ie(1)      = OLx + sNx
421                dn(2)(1:3) = 'Yp1'                dn(2)(1:3) = 'Yp1'
422                ie(2)      = OLy + sNy + 1                ie(2)      = OLy + sNy + 1
423              ELSEIF (gdiag(m)(2:2) .EQ. 'Z') THEN              ELSEIF (gdiag(ndId)(2:2) .EQ. 'Z') THEN
424                dn(1)(1:3) = 'Xp1'                dn(1)(1:3) = 'Xp1'
425                ie(1)      = OLx + sNx + 1                ie(1)      = OLx + sNx + 1
426                dn(2)(1:3) = 'Yp1'                dn(2)(1:3) = 'Yp1'
427                ie(2)      = OLy + sNy + 1                ie(2)      = OLy + sNy + 1
428              ENDIF              ENDIF
429                
430  C           Z is special since it varies  C           Z is special since it varies
431              WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zd', nlevels(listnum)              WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zd', nlevels(listId)
432              IF ( (gdiag(m)(10:10) .EQ. 'R')              IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')
433       &           .AND. (gdiag(m)(9:9) .EQ. 'M') ) THEN       &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'M') ) THEN
434                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listnum)                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zmd', nlevels(listId)
435              ENDIF              ENDIF
436              IF ( (gdiag(m)(10:10) .EQ. 'R')              IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')
437       &           .AND. (gdiag(m)(9:9) .EQ. 'L') ) THEN       &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'L') ) THEN
438                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zld', nlevels(listnum)                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zld', nlevels(listId)
439              ENDIF              ENDIF
440              IF ( (gdiag(m)(10:10) .EQ. 'R')              IF ( (gdiag(ndId)(10:10) .EQ. 'R')
441       &           .AND. (gdiag(m)(9:9) .EQ. 'U') ) THEN       &           .AND. (gdiag(ndId)(9:9) .EQ. 'U') ) THEN
442                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zud', nlevels(listnum)                WRITE(dn(3),'(a,i6.6)') 'Zud', nlevels(listId)
443              ENDIF              ENDIF
444              dim(3) = Nr+Nrphys              dim(3) = NrMax
445              ib(3)  = 1              ib(3)  = 1
446              ie(3)  = nlevels(listnum)              ie(3)  = nlevels(listId)
447    
448  C           Time dimension  C           Time dimension
449              dn(4)(1:1) = 'T'              dn(4)(1:1) = 'T'
# Line 314  C           Time dimension Line 451  C           Time dimension
451              ib(4)  = 1              ib(4)  = 1
452              ie(4)  = 1              ie(4)  = 1
453    
454              CALL MNC_CW_ADD_GNAME(d_cw_name, 4,              CALL MNC_CW_ADD_GNAME(d_cw_name, 4,
455       &             dim, dn, ib, ie, myThid)       &             dim, dn, ib, ie, myThid)
456              CALL MNC_CW_ADD_VNAME(cdiag(m), d_cw_name,              CALL MNC_CW_ADD_VNAME(cdiag(ndId), d_cw_name,
457       &             4,5, myThid)       &             4,5, myThid)
458              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(m),'description',              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'description',
459       &             tdiag(m),myThid)       &             tdiag(ndId),myThid)
460              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(m),'units',              CALL MNC_CW_ADD_VATTR_TEXT(cdiag(ndId),'units',
461       &             udiag(m),myThid)       &             udiag(ndId),myThid)
462    
463    #ifdef DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE
464    C     Handle missing value attribute (land points)
465                IF ( misvalFlt(listId) .NE. UNSET_RL ) THEN
466                 misvalLoc = misvalFlt(listId)
467                ELSE
468                 misvalLoc = undef
469                ENDIF
470    C     Defaults to UNSET_I
471                misvalIntLoc = misvalInt(listId)
472                DO ii=1,2
473    C            misval_r4(ii)  = UNSET_FLOAT4
474    C            misval_r8(ii)  = UNSET_FLOAT8
475                 misval_r4(ii)  = misvalLoc
476                 misval_r8(ii)  = misvalLoc
477                 misval_int(ii) = UNSET_I
478                ENDDO
479    C     Missing values only for scalar diagnostics at mass points (so far)
480                IF ( gdiag(ndId)(1:2) .EQ. 'SM' ) THEN
481    C     assign missing values and set flag for adding the netCDF atttibute
482                 CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(cdiag(ndId), 2,
483         I            misval_r8, misval_r4, misval_int,
484         I            myThid )
485    C     and now use the missing values for masking out the land points
486                 DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
487                  DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
488                   DO k = 1,nlevels(listId)
489                    klev = NINT(levs(k,listId))
490                    DO j = 1-OLy,sNy+OLy
491                     DO i = 1-OLx,sNx+OLx
492                      IF ( _hFacC(I,J,klev,bi,bj) .EQ. 0. )
493         &                 qtmp1(i,j,k,bi,bj) = misvalLoc
494                     ENDDO
495                    ENDDO
496                   ENDDO
497                  ENDDO
498                 ENDDO
499                ELSE
500    C     suppress the missing value attribute (iflag = 0)
501    C     Note: We have to call the following subroutine for each mnc that has
502    C     been created "on the fly" by mnc_cw_add_vname and will be deleted
503    C     by mnc_cw_del_vname, because all of these variables use the same
504    C     identifier so that mnc_cw_vfmv(indv) needs to be overwritten for
505    C     each of these variables
506                 CALL MNC_CW_VATTR_MISSING(cdiag(ndId), 0,
507         I            misval_r8, misval_r4, misval_int,
508         I            myThid )
509                ENDIF
510    #endif /* DIAGNOSTICS_MISSING_VALUE */
511    
512              CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,              IF ( ( (writeBinaryPrec .EQ. precFloat32)
513       &             cdiag(m), qtmp1, myThid)       &           .AND. (fflags(listId)(1:1) .NE. 'D')
514         &           .AND. (fflags(listId)(1:1) .NE. 'R') )
515         &           .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'R')) THEN
516                  CALL MNC_CW_RL_W('R',diag_mnc_bn,0,0,
517         &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)
518                ELSEIF ( (writeBinaryPrec .EQ. precFloat64)
519         &             .OR. (fflags(listId)(1:1) .EQ. 'D') ) THEN
520                  CALL MNC_CW_RL_W('D',diag_mnc_bn,0,0,
521         &             cdiag(ndId), qtmp1, myThid)
522                ENDIF
523    
524              CALL MNC_CW_DEL_VNAME(cdiag(m), myThid)              CALL MNC_CW_DEL_VNAME(cdiag(ndId), myThid)
525              CALL MNC_CW_DEL_GNAME(d_cw_name, myThid)              CALL MNC_CW_DEL_GNAME(d_cw_name, myThid)
526    
527              _END_MASTER( myThid )              _END_MASTER( myThid )
# Line 334  C           Time dimension Line 529  C           Time dimension
529            ENDIF            ENDIF
530  #endif /*  ALLOW_MNC  */  #endif /*  ALLOW_MNC  */
531    
532  C--     end of Processing Fld # n           ENDDO
533    C--     end of Processing Fld # md
534          ENDIF          ENDIF
535        ENDDO        ENDDO
536    
537   2000 format(1x,'Computing Diagnostic # ',i3,2x,a8,5x,'Counter: ',  #ifdef ALLOW_MDSIO
538       &     i4,6x,'Parms: ',a16)        IF (diag_mdsio) THEN
539   2001 format(1x,'          Vector  Mate for  ',a8,5x,  C-    Note: temporary: since it's a pain to add more arguments to
540       &     'Diagnostic # ',i3,2x,a8,' exists ')  C     all MDSIO S/R, uses instead this specific S/R to write only
541   2002 format(1x,'        Vector  Mate for  ',a8,5x,  C     meta files but with more informations in it.
542       &     'Diagnostic # ',i3,2x,a8,' not enabled')              glf = globalFiles
543   2003 format(1x,'      use Counter Mate for  ',a8,5x,              nRec = nfields(listId)*averageCycle(listId)
544       &     'Diagnostic # ',i3,2x,a8)              CALL MDS_WR_METAFILES(fn, prec, glf, .FALSE.,
545               &              0, 0, nlevels(listId), ' ',
546        RETURN       &              nfields(listId), flds(1,listId), 1, myTime,
547         &              nRec, myIter, myThid)
548          ENDIF
549    #endif /*  ALLOW_MDSIO  */
550    
551          RETURN
552        END        END
553                                                                        
554  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
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