/[MITgcm]/MITgcm/pkg/diagnostics/diagnostics_fill_state.F
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revision 1.9 by jmc, Thu Jul 1 18:40:40 2004 UTC revision 1.43 by rpa, Tue Jun 9 16:31:45 2015 UTC
# Line 1  Line 1 
1  C $Header$  C $Header$
2  C $Name$  C $Name$
3    
4  #include "PACKAGES_CONFIG.h"  #include "DIAG_OPTIONS.h"
 #include "CPP_OPTIONS.h"  
5    
6         subroutine diagnostics_fill_state(myThid)  CBOP
7         implicit none  C     !ROUTINE: DIAGNOSTICS_FILL_STATE
8    C     !INTERFACE:
9          SUBROUTINE DIAGNOSTICS_FILL_STATE( selectVars, myIter, myThid )
10    
11    C     !DESCRIPTION: \bv
12    C     *==========================================================*
13    C     | SUBROUTINE DIAGNOSTICS_FILL_STATE
14    C     | o Fill-in main code, state-variables diagnostics
15    C     *==========================================================*
16    C     \ev
17    
18    C     !USES:
19          IMPLICIT NONE
20    C     == Global variables ===
21  #include "SIZE.h"  #include "SIZE.h"
22  #include "EEPARAMS.h"  #include "EEPARAMS.h"
23    #include "PARAMS.h"
24  #include "GRID.h"  #include "GRID.h"
25    #include "SURFACE.h"
26  #include "DYNVARS.h"  #include "DYNVARS.h"
27    #include "NH_VARS.h"
28        integer myThid  #ifdef ALLOW_GENERIC_ADVDIFF
29    # include "GAD.h"
30    #endif
31    
32    C     !INPUT/OUTPUT PARAMETERS:
33    C     == Routine arguments ==
34    C     selectVars :: select which group of dianostics variables to fill-in
35    C            = 1 :: fill-in diagnostics for tracer   variables only
36    C            = 2 :: fill-in diagnostics for momentum variables only
37    C            = 3 :: fill-in diagnostics for momentum & tracer variables
38    C            = 4 :: fill-in state variable tendency diagnostics the second time
39    C     myIter     :: current Iteration number
40    C     myThid     :: my Thread Id number
41          INTEGER selectVars
42          INTEGER myIter
43          INTEGER myThid
44    
45  #ifdef ALLOW_DIAGNOSTICS  #ifdef ALLOW_DIAGNOSTICS
46        _RL dummy(1-OLx:sNx+Olx,1-Oly:sNy+Oly,Nr,nSx,nSy)  C     !LOCAL VARIABLES:
47        _RL dummys(1-OLx:sNx+Olx,1-Oly:sNy+Oly,nSx,nSy)  C     == Local variables ==
48        integer i,j,K,bi,bj        LOGICAL  DIAGNOSTICS_IS_ON
49        integer km1        EXTERNAL DIAGNOSTICS_IS_ON
50          _RL tmpMk(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr,nSx,nSy)
51          call fill_diagnostics(myThid,'ETAN    ',0,1,0,1,1,etaN)        _RL tmp1k(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,nSx,nSy)
52          _RL tmpU (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
53          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)        _RL tmpV (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
54          do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)        _RL tmpFac, uBarC, vBarC
55            do j = 1,sNy  #ifdef ALLOW_FIZHI
56            do i = 1,sNx        _RL dummy1, dummy2, dummy3, dummy4, kappa, getcon
57             dummys(i,j,bi,bj) = etaN(i,j,bi,bj)*etaN(i,j,bi,bj)  #endif
58            enddo  #ifdef ALLOW_ADAMSBASHFORTH_3
59            enddo        INTEGER m1
60          enddo  #endif
61          enddo        INTEGER i,j,k,bi,bj
62          call fill_diagnostics(myThid,'ETANSQ  ',0,1,0,1,1,dummys)        INTEGER km1
63    
64          call fill_diagnostics(myThid,'UVEL    ',0,Nr,0,1,1,uVel)        IF ( selectVars.EQ.2 .OR. selectVars.EQ.3 ) THEN
65          call fill_diagnostics(myThid,'VVEL    ',0,Nr,0,1,1,vVel)  C--   fill momentum state-var diagnostics:
66          call fill_diagnostics(myThid,'WVEL    ',0,Nr,0,1,1,wVel)  
67          call fill_diagnostics(myThid,'THETA   ',0,Nr,0,1,1,theta)          CALL DIAGNOSTICS_FILL(etaN, 'ETAN    ',0, 1,0,1,1,myThid)
68          call fill_diagnostics(myThid,'SALT    ',0,Nr,0,1,1,salt)  
69            IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('RSURF   ',myThid) ) THEN
70          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)           DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
71          do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)            DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
72           do K=1,Nr             DO j = 1,sNy
73            do j = 1,sNy              DO i = 1,sNx
74            do i = 1,sNx                tmp1k(i,j,bi,bj) = Ro_surf(i,j,bi,bj) + etaH(i,j,bi,bj)
75             dummy(i,j,K,bi,bj) = uVel(i,j,K,bi,bj)*uVel(i,j,K,bi,bj)              ENDDO
76            enddo             ENDDO
77            enddo            ENDDO
78           enddo           ENDDO
79          enddo           CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmp1k,'RSURF   ',0,1,0,1,1,myThid)
80          enddo          ENDIF
81          call fill_diagnostics(myThid,'UVELSQ  ',0,Nr,0,1,1,dummy)  
82            CALL DIAGNOSTICS_SCALE_FILL( etaN, oneRL, 2,
83          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)       &                              'ETANSQ  ',0, 1,0,1,1,myThid)
84          do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  
85           do K=1,Nr  #ifdef EXACT_CONSERV
86            do j = 1,sNy          CALL DIAGNOSTICS_SCALE_FILL( dEtaHdt, oneRL, 2,
87            do i = 1,sNx       &                              'DETADT2 ',0, 1,0,1,1,myThid)
88             dummy(i,j,K,bi,bj) = vVel(i,j,K,bi,bj)*vVel(i,j,K,bi,bj)  #endif
89            enddo  #ifdef ALLOW_NONHYDROSTATIC
90            enddo          IF ( use3Dsolver ) THEN
91           enddo            CALL DIAGNOSTICS_FILL( phi_nh,'PHI_NH  ',0,Nr,0,1,1,myThid )
92          enddo          ENDIF
93          enddo  #endif
94          call fill_diagnostics(myThid,'VVELSQ  ',0,Nr,0,1,1,dummy)  
95            CALL DIAGNOSTICS_FILL(uVel, 'UVEL    ',0,Nr,0,1,1,myThid)
96          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)          CALL DIAGNOSTICS_FILL(vVel, 'VVEL    ',0,Nr,0,1,1,myThid)
97          do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)          CALL DIAGNOSTICS_FILL(wVel, 'WVEL    ',0,Nr,0,1,1,myThid)
98           do K=1,Nr  
99            do j = 1,sNy          CALL DIAGNOSTICS_SCALE_FILL( uVel, oneRL, 2,
100            do i = 1,sNx       &                              'UVELSQ  ',0,Nr,0,1,1,myThid)
101             dummy(i,j,K,bi,bj) = wVel(i,j,K,bi,bj)*wVel(i,j,K,bi,bj)          CALL DIAGNOSTICS_SCALE_FILL( vVel, oneRL, 2,
102            enddo       &                              'VVELSQ  ',0,Nr,0,1,1,myThid)
103            enddo          CALL DIAGNOSTICS_SCALE_FILL( wVel, oneRL, 2,
104           enddo       &                              'WVELSQ  ',0,Nr,0,1,1,myThid)
105          enddo  
106          enddo  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
107          call fill_diagnostics(myThid,'WVELSQ  ',0,Nr,0,1,1,dummy)  
108            IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('UE_VEL_C',myThid) .OR.
109          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)       &       DIAGNOSTICS_IS_ON('VN_VEL_C',myThid) .OR.
110          do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)       &       DIAGNOSTICS_IS_ON('UV_VEL_C',myThid) ) THEN
111           do K=1,Nr           DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
112            do j = 1,sNy            DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
113            do i = 1,sNx             DO k=1,Nr
114             dummy(i,j,K,bi,bj) = theta(i,j,K,bi,bj)*theta(i,j,K,bi,bj)              DO j = 1,sNy
115            enddo               DO i = 1,sNx
116            enddo                uBarC = 0.5 _d 0
117           enddo       &           *(uVel(i,j,k,bi,bj)+uVel(i+1,j,k,bi,bj))
118          enddo                vBarC = 0.5 _d 0
119          enddo       &           *(vVel(i,j,k,bi,bj)+vVel(i,j+1,k,bi,bj))
120          call fill_diagnostics(myThid,'THETASQ ',0,Nr,0,1,1,dummy)                tmpU(i,j) = angleCosC(i,j,bi,bj)*uBarC
121         &                   -angleSinC(i,j,bi,bj)*vBarC
122          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)                tmpV(i,j) = angleSinC(i,j,bi,bj)*uBarC
123          do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)       &                   +angleCosC(i,j,bi,bj)*vBarC
124           do K=1,Nr                tmpMk(i,j,k,bi,bj) = tmpU(i,j)*tmpV(i,j)
125            do j = 1,sNy               ENDDO
126            do i = 1,sNx              ENDDO
127             dummy(i,j,K,bi,bj) = salt(i,j,K,bi,bj)*salt(i,j,K,bi,bj)              CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpU,'UE_VEL_C',k,1,2,bi,bj,myThid)
128            enddo              CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpV,'VN_VEL_C',k,1,2,bi,bj,myThid)
129            enddo             ENDDO
130           enddo            ENDDO
131          enddo           ENDDO
132          enddo           CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'UV_VEL_C',0,Nr,0,1,1,myThid)
133          call fill_diagnostics(myThid,'SALTSQ  ',0,Nr,0,1,1,dummy)          ENDIF
134    
135          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)          IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('UV_VEL_Z',myThid) ) THEN
136          do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)           DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
137           do K=1,Nr            DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
138            do j = 1,sNy             DO k=1,Nr
139            do i = 1,sNx              DO j = 1,sNy+1
140             dummy(i,j,K,bi,bj) = uVel(i,j,K,bi,bj)*vVel(i,j,K,bi,bj)               DO i = 1,sNx+1
141            enddo                tmpMk(i,j,k,bi,bj) = 0.25 _d 0
142            enddo       &           *(uVel(i,j-1,k,bi,bj)+uVel(i,j,k,bi,bj))
143           enddo       &           *(vVel(i-1,j,k,bi,bj)+vVel(i,j,k,bi,bj))
144          enddo               ENDDO
145          enddo              ENDDO
146          call fill_diagnostics(myThid,'UVELVVEL',0,Nr,0,1,1,dummy)             ENDDO
147              ENDDO
148          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)           ENDDO
149          do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)           CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'UV_VEL_Z',0,Nr,0,1,1,myThid)
150           do K=1,Nr          ENDIF
151            do j = 1,sNy  
152            do i = 1,sNx          IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('WU_VEL  ',myThid) ) THEN
153             dummy(i,j,K,bi,bj) = uVel(i,j,K,bi,bj)*           DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
154       &         0.5*(theta(i,j,K,bi,bj)+theta(i-1,j,K,bi,bj))            DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
155            enddo             DO k=1,Nr
156            enddo              km1 = MAX(k-1,1)
157           enddo              DO j = 1,sNy
158          enddo               DO i = 1,sNx+1
159          enddo                tmpMk(i,j,k,bi,bj) = 0.25 _d 0
160          call fill_diagnostics(myThid,'UVELTH  ',0,Nr,0,1,1,dummy)       &           *(uVel(i,j,km1,bi,bj)+uVel(i,j,k,bi,bj))
161         &           *(wVel(i-1,j,k,bi,bj)*rA(i-1,j,bi,bj)
162          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)       &            +wVel( i ,j,k,bi,bj)*rA( i ,j,bi,bj)
163          do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)       &            )*recip_rAw(i,j,bi,bj)
164           do K=1,Nr               ENDDO
165            do j = 1,sNy              ENDDO
166            do i = 1,sNx             ENDDO
167             dummy(i,j,K,bi,bj) = vVel(i,j,K,bi,bj)*            ENDDO
168       &         0.5*(theta(i,j,K,bi,bj)+theta(i,j-1,K,bi,bj))           ENDDO
169            enddo           CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'WU_VEL  ',0,Nr,0,1,1,myThid)
170            enddo          ENDIF
171           enddo  
172          enddo          IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('WV_VEL  ',myThid) ) THEN
173          enddo           DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
174          call fill_diagnostics(myThid,'VVELTH  ',0,Nr,0,1,1,dummy)            DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
175               DO k=1,Nr
176          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              km1 = MAX(k-1,1)
177           do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)              DO j = 1,sNy+1
178            do K=1,Nr               DO i = 1,sNx
179             km1 = MAX(k-1,1)                tmpMk(i,j,k,bi,bj) = 0.25 _d 0
180             do j = 1,sNy       &           *(vVel(i,j,km1,bi,bj)+vVel(i,j,k,bi,bj))
181              do i = 1,sNx       &           *(wVel(i,j-1,k,bi,bj)*rA(i,j-1,bi,bj)
182               dummy(i,j,K,bi,bj) = wVel(i,j,K,bi,bj)*0.5*       &            +wVel(i, j ,k,bi,bj)*rA(i, j ,bi,bj)
183       &                 (theta(i,j,K,bi,bj)+theta(i,j,km1,bi,bj))       &            )*recip_rAs(i,j,bi,bj)
184              enddo               ENDDO
185             enddo              ENDDO
186            enddo             ENDDO
187           enddo            ENDDO
188          enddo           ENDDO
189          call fill_diagnostics(myThid,'WVELTH  ',0,Nr,0,1,1,dummy)           CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'WV_VEL  ',0,Nr,0,1,1,myThid)
190            ENDIF
191          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)  
192          do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
193           do K=1,Nr  
194            do j = 1,sNy          IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('UVELTH  ',myThid) ) THEN
195            do i = 1,sNx           DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
196             dummy(i,j,K,bi,bj) = uVel(i,j,K,bi,bj)*            DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
197       &         0.5*(salt(i,j,K,bi,bj)+salt(i-1,j,K,bi,bj))             DO k=1,Nr
198            enddo              DO j = 1,sNy
199            enddo               DO i = 1,sNx+1
200           enddo                 tmpMk(i,j,k,bi,bj) = uVel(i,j,k,bi,bj)*0.5 _d 0
201          enddo       &                  *(theta(i,j,k,bi,bj)+theta(i-1,j,k,bi,bj))
202          enddo               ENDDO
203          call fill_diagnostics(myThid,'UVELSLT ',0,Nr,0,1,1,dummy)              ENDDO
204               ENDDO
205          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)            ENDDO
206          do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)           ENDDO
207           do K=1,Nr           CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'UVELTH  ',0,Nr,0,1,1,myThid)
208            do j = 1,sNy          ENDIF
209            do i = 1,sNx  
210             dummy(i,j,K,bi,bj) = vVel(i,j,K,bi,bj)*          IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('VVELTH  ',myThid) ) THEN
211       &         0.5*(salt(i,j,K,bi,bj)+salt(i,j-1,K,bi,bj))           DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
212            enddo            DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
213            enddo             DO k=1,Nr
214           enddo              DO j = 1,sNy+1
215          enddo               DO i = 1,sNx
216          enddo                 tmpMk(i,j,k,bi,bj) = vVel(i,j,k,bi,bj)*0.5 _d 0
217          call fill_diagnostics(myThid,'VVELSLT ',0,Nr,0,1,1,dummy)       &                  *(theta(i,j,k,bi,bj)+theta(i,j-1,k,bi,bj))
218                 ENDDO
219          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              ENDDO
220           do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)             ENDDO
221            do K=1,Nr            ENDDO
222             km1 = MAX(k-1,1)           ENDDO
223             do j = 1,sNy           CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'VVELTH  ',0,Nr,0,1,1,myThid)
224              do i = 1,sNx          ENDIF
225               dummy(i,j,K,bi,bj) = wVel(i,j,K,bi,bj)*0.5*  
226       &                 (salt(i,j,K,bi,bj)+salt(i,j,km1,bi,bj))          IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('WVELTH  ',myThid) ) THEN
227              enddo           DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
228             enddo            DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
229            enddo             DO k=1,Nr
230           enddo              km1 = MAX(k-1,1)
231          enddo              DO j = 1,sNy
232          call fill_diagnostics(myThid,'WVELSLT ',0,Nr,0,1,1,dummy)               DO i = 1,sNx
233                   tmpMk(i,j,k,bi,bj) = wVel(i,j,k,bi,bj)*0.5 _d 0
234          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)       &                  *(theta(i,j,k,bi,bj)+theta(i,j,km1,bi,bj))
235          do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)               ENDDO
236           do K=1,Nr              ENDDO
237            do j = 1,sNy             ENDDO
238            do i = 1,sNx            ENDDO
239             dummy(i,j,K,bi,bj) = uVel(i,j,K,bi,bj)*hFacW(i,j,K,bi,bj)           ENDDO
240            enddo           CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'WVELTH  ',0,Nr,0,1,1,myThid)
241            enddo          ENDIF
242           enddo  
243          enddo          IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('UVELSLT ',myThid) ) THEN
244          enddo           DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
245          call fill_diagnostics(myThid,'UVELMASS',0,Nr,0,1,1,dummy)            DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
246               DO k=1,Nr
247          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)              DO j = 1,sNy
248          do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)               DO i = 1,sNx+1
249           do K=1,Nr                 tmpMk(i,j,k,bi,bj) = uVel(i,j,k,bi,bj)*0.5 _d 0
250            do j = 1,sNy       &                  *(salt(i,j,k,bi,bj)+salt(i-1,j,k,bi,bj))
251            do i = 1,sNx               ENDDO
252             dummy(i,j,K,bi,bj) = vVel(i,j,K,bi,bj)*hFacS(i,j,K,bi,bj)              ENDDO
253            enddo             ENDDO
254            enddo            ENDDO
255           enddo           ENDDO
256          enddo           CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'UVELSLT ',0,Nr,0,1,1,myThid)
257          enddo          ENDIF
258          call fill_diagnostics(myThid,'VVELMASS',0,Nr,0,1,1,dummy)  
259            IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('VVELSLT ',myThid) ) THEN
260          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)           DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
261          do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)            DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
262           do K=1,Nr             DO k=1,Nr
263            do j = 1,sNy              DO j = 1,sNy+1
264            do i = 1,sNx               DO i = 1,sNx
265             dummy(i,j,K,bi,bj) = uVel(i,j,K,bi,bj)*                 tmpMk(i,j,k,bi,bj) = vVel(i,j,k,bi,bj)*0.5 _d 0
266       .         0.5*(theta(i,j,K,bi,bj)+theta(i-1,j,K,bi,bj))       &                  *(salt(i,j,k,bi,bj)+salt(i,j-1,k,bi,bj))
267       .                                * hFacW(i,j,K,bi,bj)               ENDDO
268            enddo              ENDDO
269            enddo             ENDDO
270           enddo            ENDDO
271          enddo           ENDDO
272          enddo           CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'VVELSLT ',0,Nr,0,1,1,myThid)
273          call fill_diagnostics(myThid,'UTHMASS ',0,Nr,0,1,1,dummy)          ENDIF
274    
275          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)          IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('WVELSLT ',myThid) ) THEN
276          do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)           DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
277           do K=1,Nr            DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
278            do j = 1,sNy             DO k=1,Nr
279            do i = 1,sNx              km1 = MAX(k-1,1)
280             dummy(i,j,K,bi,bj) = vVel(i,j,K,bi,bj)*              DO j = 1,sNy
281       .         0.5*(theta(i,j,K,bi,bj)+theta(i,j-1,K,bi,bj))               DO i = 1,sNx
282       .                                * hFacS(i,j,K,bi,bj)                 tmpMk(i,j,k,bi,bj) = wVel(i,j,k,bi,bj)*0.5 _d 0
283            enddo       &                  *(salt(i,j,k,bi,bj)+salt(i,j,km1,bi,bj))
284            enddo               ENDDO
285           enddo              ENDDO
286          enddo             ENDDO
287          enddo            ENDDO
288          call fill_diagnostics(myThid,'VTHMASS ',0,Nr,0,1,1,dummy)           ENDDO
289             CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'WVELSLT ',0,Nr,0,1,1,myThid)
290          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)          ENDIF
291          do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)  
292           do K=1,Nr          IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('UVELPHI ',myThid) ) THEN
293            do j = 1,sNy           DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
294            do i = 1,sNx            DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
295             dummy(i,j,K,bi,bj) = uVel(i,j,K,bi,bj)*             DO k=1,Nr
296       .         0.5*(salt(i,j,K,bi,bj)+salt(i-1,j,K,bi,bj))              DO j = 1,sNy
297       .                                * hFacW(i,j,K,bi,bj)               DO i = 1,sNx+1
298            enddo                 tmpMk(i,j,k,bi,bj) = uVel(i,j,k,bi,bj)*hFacW(i,j,k,bi,bj)
299            enddo       &       *0.5 _d 0*(totPhiHyd(i,j,k,bi,bj)+totPhiHyd(i-1,j,k,bi,bj))
300           enddo               ENDDO
301          enddo              ENDDO
302          enddo             ENDDO
303          call fill_diagnostics(myThid,'USLTMASS',0,Nr,0,1,1,dummy)            ENDDO
304             ENDDO
305          do bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)           CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'UVELPHI ',0,Nr,0,1,1,myThid)
306          do bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)          ENDIF
307           do K=1,Nr  
308            do j = 1,sNy          IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('VVELPHI ',myThid) ) THEN
309            do i = 1,sNx           DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
310             dummy(i,j,K,bi,bj) = vVel(i,j,K,bi,bj)*            DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
311       .         0.5*(salt(i,j,K,bi,bj)+salt(i,j-1,K,bi,bj))             DO k=1,Nr
312       .                                * hFacS(i,j,K,bi,bj)              DO j = 1,sNy+1
313            enddo               DO i = 1,sNx
314            enddo                 tmpMk(i,j,k,bi,bj) = vVel(i,j,k,bi,bj)*hFacS(i,j,k,bi,bj)
315           enddo       &       *0.5 _d 0*(totPhiHyd(i,j,k,bi,bj)+totPhiHyd(i,j-1,k,bi,bj))
316          enddo               ENDDO
317          enddo              ENDDO
318          call fill_diagnostics(myThid,'VSLTMASS',0,Nr,0,1,1,dummy)             ENDDO
319              ENDDO
320             ENDDO
321             CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'VVELPHI ',0,Nr,0,1,1,myThid)
322            ENDIF
323    
324            IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('RCENTER ',myThid) ) THEN
325             DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
326              DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
327               DO j = 1,sNy
328                DO i = 1,sNx
329                  tmp1k(i,j,bi,bj) = R_low(i,j,bi,bj)
330                ENDDO
331               ENDDO
332               DO k = Nr,1,-1
333                DO j = 1,sNy
334                 DO i = 1,sNx
335                  tmpMk(i,j,k,bi,bj) = tmp1k(i,j,bi,bj)
336         &             + (rF(k+1)-rC(k))*hFacC(i,j,k,bi,bj)*rkSign
337    C         above: more general (setInterFDr/setCenterDr) than line below
338    c    &                      + drF(k)*hFacC(i,j,k,bi,bj)*0.5 _d 0
339                  tmp1k(i,j,bi,bj) =   tmp1k(i,j,bi,bj)
340         &                      + drF(k)*hFacC(i,j,k,bi,bj)
341                 ENDDO
342                ENDDO
343               ENDDO
344              ENDDO
345             ENDDO
346             CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'RCENTER ',0,Nr,0,1,1,myThid)
347            ENDIF
348    
349    C First fill sequence for state variable tendency diagnostics: subtract state variable
350    C NOTE: send a '0' for the bibjflag and allow counter to be incremented
351    C     (next fill for these diagnostics will NOT allow counter to be incremented)
352    
353            tmpFac = -86400. _d 0/deltaTMom
354            CALL DIAGNOSTICS_SCALE_FILL( uVel, tmpFac, 1,
355         &                              'TOTUTEND',0,Nr,0,1,1,myThid )
356            CALL DIAGNOSTICS_SCALE_FILL( vVel, tmpFac, 1,
357         &                              'TOTVTEND',0,Nr,0,1,1,myThid )
358    
359            IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('TOTTTEND',myThid) ) THEN
360             DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
361              DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
362               DO k=1,Nr
363                tmpFac = -86400. _d 0/dTtracerLev(k)
364                DO j = 1,sNy
365                 DO i = 1,sNx
366                   tmpMk(i,j,k,bi,bj) = tmpFac*theta(i,j,k,bi,bj)
367                 ENDDO
368                ENDDO
369               ENDDO
370              ENDDO
371             ENDDO
372             CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'TOTTTEND',0,Nr,0,1,1,myThid)
373    #ifdef ALLOW_LAYERS
374             IF ( useLayers ) THEN
375               CALL LAYERS_FILL(tmpMk,1,'TOT',0,Nr,0,1,1,myThid)
376             ENDIF
377    #endif /* ALLOW_LAYERS */        
378            ENDIF
379    
380            IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('TOTSTEND',myThid) ) THEN
381             DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
382              DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
383               DO k=1,Nr
384                tmpFac = -86400. _d 0/dTtracerLev(k)
385                DO j = 1,sNy
386                 DO i = 1,sNx
387                   tmpMk(i,j,k,bi,bj) = tmpFac*salt(i,j,k,bi,bj)
388                 ENDDO
389                ENDDO
390               ENDDO
391              ENDDO
392             ENDDO
393             CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'TOTSTEND',0,Nr,0,1,1,myThid)
394    #ifdef ALLOW_LAYERS
395             IF ( useLayers ) THEN
396               CALL LAYERS_FILL(tmpMk,2,'TOT',0,Nr,0,1,1,myThid)
397             ENDIF
398    #endif /* ALLOW_LAYERS */
399            ENDIF
400    
401    C--   fill momentum state-var diagnostics: end
402          ENDIF
403    
404    C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
405    
406          IF ( selectVars.EQ.1 .OR. selectVars.EQ.3 ) THEN
407    C--   fill tracer state-var diagnostics:
408    
409            CALL DIAGNOSTICS_FILL(theta,'THETA   ',0,Nr,0,1,1,myThid)
410            CALL DIAGNOSTICS_FILL(salt, 'SALT    ',0,Nr,0,1,1,myThid)
411    
412    #ifdef ALLOW_FIZHI
413          IF ( useFIZHI .AND. DIAGNOSTICS_IS_ON('RELHUM  ',myThid) ) THEN
414           kappa = getcon('KAPPA')
415           DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
416            DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
417             DO j = 1,sNy
418              DO i = 1,sNx
419               DO k = 1,Nr
420                dummy1 = theta(i,j,k,bi,bj) * ((rC(k)/100.)/1000.)**kappa
421                dummy2 = rC(k) / 100.
422                CALL QSAT(dummy1,dummy2,dummy3,dummy4,.false.)
423                tmpMk(i,j,k,bi,bj) = hFacC(i,j,k,bi,bj)
424         &                          *salt(i,j,k,bi,bj)*100. / dummy3
425               ENDDO
426              ENDDO
427             ENDDO
428            ENDDO
429           ENDDO
430           CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk, 'RELHUM  ',0,Nr,0,1,1,myThid)
431          ENDIF
432    #endif /* ALLOW_FIZHI */
433    
434            CALL DIAGNOSTICS_SCALE_FILL( theta, oneRL, 2,
435         &                              'THETASQ ',0,Nr,0,1,1,myThid)
436            CALL DIAGNOSTICS_SCALE_FILL( salt, oneRL, 2,
437         &                              'SALTSQ  ',0,Nr,0,1,1,myThid)
438    
439    #ifdef ALLOW_GENERIC_ADVDIFF
440    # ifdef ALLOW_ADAMSBASHFORTH_3
441          IF ( selectVars.EQ.1 ) THEN
442    C-    stagger time-step: fill diags after updating myIter
443            m1 = 1 + MOD(myIter,2)
444          ELSE
445    C-    synchronous time-step: fill diags before updating myIter
446            m1 = 1 + MOD(myIter+1,2)
447          ENDIF
448          IF ( AdamsBashforthGt )
449         & CALL DIAGNOSTICS_FILL( gtNm(1-OLx,1-OLy,1,1,1,m1),
450         &                        'gTinAB  ',0,Nr,0,1,1,myThid )
451          IF ( AdamsBashforthGs )
452         & CALL DIAGNOSTICS_FILL( gsNm(1-OLx,1-OLy,1,1,1,m1),
453         &                        'gSinAB  ',0,Nr,0,1,1,myThid )
454    # else /* ALLOW_ADAMSBASHFORTH_3 */
455          IF ( AdamsBashforthGt )
456         & CALL DIAGNOSTICS_FILL( gtNm1,'gTinAB  ',0,Nr,0,1,1,myThid )
457          IF ( AdamsBashforthGs )
458         & CALL DIAGNOSTICS_FILL( gsNm1,'gSinAB  ',0,Nr,0,1,1,myThid )
459    # endif /* ALLOW_ADAMSBASHFORTH_3 */
460    #endif /* ALLOW_GENERIC_ADVDIFF */
461    
462    c       IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('SST     ',myThid) ) THEN
463    c        DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
464    c         DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
465    c          DO j = 1,sNy
466    c           DO i = 1,sNx
467    c             tmp1k(i,j,bi,bj) = THETA(i,j,1,bi,bj)
468    c           ENDDO
469    c          ENDDO
470    c         ENDDO
471    c        ENDDO
472    c        CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmp1k,'SST     ',0,1,0,1,1,myThid)
473    c       ENDIF
474    
475    c       IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('SSS     ',myThid) ) THEN
476    c        DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
477    c         DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
478    c          DO j = 1,sNy
479    c           DO i = 1,sNx
480    c             tmp1k(i,j,bi,bj) = SALT(i,j,1,bi,bj)
481    c           ENDDO
482    c          ENDDO
483    c         ENDDO
484    c        ENDDO
485    c        CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmp1k,'SSS     ',0,1,0,1,1,myThid)
486    c       ENDIF
487    
488            IF ( fluidIsWater .AND.
489         &       ( DIAGNOSTICS_IS_ON('SALTanom',myThid)
490         &     .OR.DIAGNOSTICS_IS_ON('SALTSQan',myThid) ) ) THEN
491             DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
492              DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
493               DO k=1,Nr
494                DO j = 1,sNy
495                 DO i = 1,sNx
496                   tmpMk(i,j,k,bi,bj) = salt(i,j,k,bi,bj)-35. _d 0
497                 ENDDO
498                ENDDO
499               ENDDO
500              ENDDO
501             ENDDO
502             CALL DIAGNOSTICS_FILL( tmpMk,'SALTanom',0,Nr,0,1,1,myThid)
503             CALL DIAGNOSTICS_SCALE_FILL( tmpMk, oneRL, 2,
504         &                                'SALTSQan',0,Nr,0,1,1,myThid)
505            ENDIF
506    
507    C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
508    
509            IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('UVELMASS',myThid) ) THEN
510             DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
511              DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
512               DO k=1,Nr
513                DO j = 1,sNy
514                  DO i = 1,sNx+1
515                    tmpMk(i,j,k,bi,bj)
516         &               = uVel(i,j,k,bi,bj)*hFacW(i,j,k,bi,bj)
517                  ENDDO
518                ENDDO
519               ENDDO
520              ENDDO
521             ENDDO
522             CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'UVELMASS',0,Nr,0,1,1,myThid)
523            ENDIF
524    
525            IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('VVELMASS',myThid) ) THEN
526             DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
527              DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
528               DO k=1,Nr
529                DO j = 1,sNy+1
530                  DO i = 1,sNx
531                    tmpMk(i,j,k,bi,bj)
532         &               = vVel(i,j,k,bi,bj)*hFacS(i,j,k,bi,bj)
533                  ENDDO
534                ENDDO
535               ENDDO
536              ENDDO
537             ENDDO
538             CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'VVELMASS',0,Nr,0,1,1,myThid)
539            ENDIF
540    
541            CALL DIAGNOSTICS_FILL(wVel, 'WVELMASS',0,Nr,0,1,1,myThid)
542    
543            IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('UTHMASS ',myThid) ) THEN
544             DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
545              DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
546               DO k=1,Nr
547                DO j = 1,sNy
548                 DO i = 1,sNx+1
549                   tmpMk(i,j,k,bi,bj) = uVel(i,j,k,bi,bj)*0.5 _d 0
550         &                  *(theta(i,j,k,bi,bj)+theta(i-1,j,k,bi,bj))
551         &                  * hFacW(i,j,k,bi,bj)
552                 ENDDO
553                ENDDO
554               ENDDO
555              ENDDO
556             ENDDO
557             CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'UTHMASS ',0,Nr,0,1,1,myThid)
558            ENDIF
559    
560            IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('VTHMASS ',myThid) ) THEN
561             DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
562              DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
563               DO k=1,Nr
564                DO j = 1,sNy+1
565                 DO i = 1,sNx
566                   tmpMk(i,j,k,bi,bj) = vVel(i,j,k,bi,bj)*0.5 _d 0
567         &                  *(theta(i,j,k,bi,bj)+theta(i,j-1,k,bi,bj))
568         &                  * hFacS(i,j,k,bi,bj)
569                 ENDDO
570                ENDDO
571               ENDDO
572              ENDDO
573             ENDDO
574             CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'VTHMASS ',0,Nr,0,1,1,myThid)
575            ENDIF
576    
577            IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('WTHMASS ',myThid) ) THEN
578             DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
579              DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
580               DO k=1,Nr
581                km1 = MAX(k-1,1)
582                DO j = 1,sNy
583                 DO i = 1,sNx
584                   tmpMk(i,j,k,bi,bj) = wVel(i,j,k,bi,bj)*0.5 _d 0
585         &                  *(theta(i,j,k,bi,bj)+theta(i,j,km1,bi,bj))
586                 ENDDO
587                ENDDO
588               ENDDO
589              ENDDO
590             ENDDO
591             CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'WTHMASS ',0,Nr,0,1,1,myThid)
592            ENDIF
593    
594            IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('USLTMASS',myThid) ) THEN
595             DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
596              DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
597               DO k=1,Nr
598                DO j = 1,sNy
599                 DO i = 1,sNx+1
600                   tmpMk(i,j,k,bi,bj) = uVel(i,j,k,bi,bj)*0.5 _d 0
601         &                  *(salt(i,j,k,bi,bj)+salt(i-1,j,k,bi,bj))
602         &                  * hFacW(i,j,k,bi,bj)
603                 ENDDO
604                ENDDO
605               ENDDO
606              ENDDO
607             ENDDO
608             CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'USLTMASS',0,Nr,0,1,1,myThid)
609            ENDIF
610    
611            IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('VSLTMASS',myThid) ) THEN
612             DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
613              DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
614               DO k=1,Nr
615                DO j = 1,sNy+1
616                 DO i = 1,sNx
617                   tmpMk(i,j,k,bi,bj) = vVel(i,j,k,bi,bj)*0.5 _d 0
618         &                  *(salt(i,j,k,bi,bj)+salt(i,j-1,k,bi,bj))
619         &                  * hFacS(i,j,k,bi,bj)
620                 ENDDO
621                ENDDO
622               ENDDO
623              ENDDO
624             ENDDO
625             CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'VSLTMASS',0,Nr,0,1,1,myThid)
626            ENDIF
627    
628            IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('WSLTMASS',myThid) ) THEN
629             DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
630              DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
631               DO k=1,Nr
632                km1 = MAX(k-1,1)
633                DO j = 1,sNy
634                 DO i = 1,sNx
635                   tmpMk(i,j,k,bi,bj) = wVel(i,j,k,bi,bj)*0.5 _d 0
636         &                  *(salt(i,j,k,bi,bj)+salt(i,j,km1,bi,bj))
637                 ENDDO
638                ENDDO
639               ENDDO
640              ENDDO
641             ENDDO
642             CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'WSLTMASS',0,Nr,0,1,1,myThid)
643            ENDIF
644    
645    C--   fill tracer state-var diagnostics: end
646          ENDIF
647    
648          IF ( selectVars.EQ.4 ) THEN
649    C Second fill sequence for state variable tendency diagnostics: add state variable
650    C NOTE: send a '-1' for the bibjflag and do not increment counter
651    C     (previous fill for these diagnostics DID allow counter to be incremented)
652    
653            tmpFac = 86400. _d 0/deltaTMom
654            DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
655             DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
656              CALL DIAGNOSTICS_SCALE_FILL( uVel, tmpFac, 1,
657         &                           'TOTUTEND',0,Nr,-1,bi,bj,myThid )
658              CALL DIAGNOSTICS_SCALE_FILL( vVel, tmpFac, 1,
659         &                           'TOTVTEND',0,Nr,-1,bi,bj,myThid )
660             ENDDO
661            ENDDO
662    
663            IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('TOTTTEND',myThid) ) THEN
664             DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
665              DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
666               DO k=1,Nr
667                tmpFac = 86400. _d 0/dTtracerLev(k)
668                DO j = 1,sNy
669                 DO i = 1,sNx
670                   tmpMk(i,j,k,bi,bj) = tmpFac*theta(i,j,k,bi,bj)
671                 ENDDO
672                ENDDO
673               ENDDO
674               CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'TOTTTEND',0,Nr,-1,bi,bj,myThid)
675    #ifdef ALLOW_LAYERS
676               IF ( useLayers ) THEN
677                 CALL LAYERS_FILL(tmpMk,1,'TOT',0,Nr,-1,bi,bj,myThid)
678               ENDIF
679    #endif /* ALLOW_LAYERS */    
680              ENDDO
681             ENDDO
682            ENDIF
683    
684            IF ( DIAGNOSTICS_IS_ON('TOTSTEND',myThid) ) THEN
685             DO bj = myByLo(myThid), myByHi(myThid)
686              DO bi = myBxLo(myThid), myBxHi(myThid)
687               DO k=1,Nr
688                tmpFac = 86400. _d 0/dTtracerLev(k)
689                DO j = 1,sNy
690                 DO i = 1,sNx
691                   tmpMk(i,j,k,bi,bj) = tmpFac*salt(i,j,k,bi,bj)
692                 ENDDO
693                ENDDO
694               ENDDO
695               CALL DIAGNOSTICS_FILL(tmpMk,'TOTSTEND',0,Nr,-1,bi,bj,myThid)
696    #ifdef ALLOW_LAYERS
697               IF ( useLayers ) THEN
698                CALL LAYERS_FILL(tmpMk,2,'TOT',0,Nr,-1,bi,bj,myThid)
699               ENDIF
700    #endif /* ALLOW_LAYERS */    
701              ENDDO
702             ENDDO
703            ENDIF
704    
705    C--   fill state tendency diagnostics the second time: end
706          ENDIF
707    
708  #endif /* ALLOW_DIAGNOSTICS */  #endif /* ALLOW_DIAGNOSTICS */
709    
710        return        RETURN
711        end        END
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