/[MITgcm]/MITgcm/model/src/dynamics.F
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revision 1.65.2.2 by jmc, Mon Apr 9 16:08:34 2001 UTC revision 1.77 by heimbach, Mon Aug 13 23:26:56 2001 UTC
# Line 29  C     == Global variables === Line 29  C     == Global variables ===
29  #include "PARAMS.h"  #include "PARAMS.h"
30  #include "DYNVARS.h"  #include "DYNVARS.h"
31  #include "GRID.h"  #include "GRID.h"
32    #ifdef ALLOW_PASSIVE_TRACER
33    #include "TR1.h"
34    #endif
35    
36  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC
37  # include "tamc.h"  # include "tamc.h"
38  # include "tamc_keys.h"  # include "tamc_keys.h"
39    # include "FFIELDS.h"
40    # ifdef ALLOW_KPP
41    #  include "KPP.h"
42    # endif
43    # ifdef ALLOW_GMREDI
44    #  include "GMREDI.h"
45    # endif
46  #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
47    
 #ifdef ALLOW_KPP  
 # include "KPP.h"  
 #endif  
   
48  #ifdef ALLOW_TIMEAVE  #ifdef ALLOW_TIMEAVE
49  #include "TIMEAVE_STATV.h"  #include "TIMEAVE_STATV.h"
50  #endif  #endif
# Line 52  C     myThid - Thread number for this in Line 58  C     myThid - Thread number for this in
58        INTEGER myThid        INTEGER myThid
59    
60  C     == Local variables  C     == Local variables
 C     xA, yA                 - Per block temporaries holding face areas  
 C     uTrans, vTrans, rTrans - Per block temporaries holding flow  
 C                              transport  
 C                              o uTrans: Zonal transport  
 C                              o vTrans: Meridional transport  
 C                              o rTrans: Vertical transport  
 C     maskUp                   o maskUp: land/water mask for W points  
61  C     fVer[STUV]               o fVer: Vertical flux term - note fVer  C     fVer[STUV]               o fVer: Vertical flux term - note fVer
62  C                                      is "pipelined" in the vertical  C                                      is "pipelined" in the vertical
63  C                                      so we need an fVer for each  C                                      so we need an fVer for each
# Line 71  C                      In p coords phiHy Line 70  C                      In p coords phiHy
70  C                      surface height anomaly.  C                      surface height anomaly.
71  C     phiSurfX, - gradient of Surface potentiel (Pressure/rho, ocean)  C     phiSurfX, - gradient of Surface potentiel (Pressure/rho, ocean)
72  C     phiSurfY             or geopotentiel (atmos) in X and Y direction  C     phiSurfY             or geopotentiel (atmos) in X and Y direction
 C     KappaRT,       - Total diffusion in vertical for T and S.  
 C     KappaRS          (background + spatially varying, isopycnal term).  
73  C     iMin, iMax     - Ranges and sub-block indices on which calculations  C     iMin, iMax     - Ranges and sub-block indices on which calculations
74  C     jMin, jMax       are applied.  C     jMin, jMax       are applied.
75  C     bi, bj  C     bi, bj
# Line 80  C     k, kup,        - Index for layer a Line 77  C     k, kup,        - Index for layer a
77  C     kDown, km1       are switched with layer to be the appropriate  C     kDown, km1       are switched with layer to be the appropriate
78  C                      index into fVerTerm.  C                      index into fVerTerm.
79  C     tauAB - Adams-Bashforth timestepping weight: 0=forward ; 1/2=Adams-Bashf.  C     tauAB - Adams-Bashforth timestepping weight: 0=forward ; 1/2=Adams-Bashf.
       _RS xA      (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)  
       _RS yA      (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)  
       _RL uTrans  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)  
       _RL vTrans  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)  
       _RL rTrans  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)  
       _RS maskUp  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)  
       _RL fVerT   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)  
       _RL fVerS   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)  
80        _RL fVerU   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)        _RL fVerU   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)
81        _RL fVerV   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)        _RL fVerV   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)
82        _RL phiHyd  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)        _RL phiHyd  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)
# Line 95  C     tauAB - Adams-Bashforth timesteppi Line 84  C     tauAB - Adams-Bashforth timesteppi
84        _RL rhok    (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)        _RL rhok    (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
85        _RL phiSurfX(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)        _RL phiSurfX(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
86        _RL phiSurfY(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)        _RL phiSurfY(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
       _RL KappaRT (1-Olx:sNx+Olx,1-Oly:sNy+Oly,Nr)  
       _RL KappaRS (1-Olx:sNx+Olx,1-Oly:sNy+Oly,Nr)  
87        _RL KappaRU (1-Olx:sNx+Olx,1-Oly:sNy+Oly,Nr)        _RL KappaRU (1-Olx:sNx+Olx,1-Oly:sNy+Oly,Nr)
88        _RL KappaRV (1-Olx:sNx+Olx,1-Oly:sNy+Oly,Nr)        _RL KappaRV (1-Olx:sNx+Olx,1-Oly:sNy+Oly,Nr)
89        _RL sigmaX  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)        _RL sigmaX  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)
# Line 111  C This is currently used by IVDC and Dia Line 98  C This is currently used by IVDC and Dia
98        INTEGER jMin, jMax        INTEGER jMin, jMax
99        INTEGER bi, bj        INTEGER bi, bj
100        INTEGER i, j        INTEGER i, j
101        INTEGER k, km1, kup, kDown        INTEGER k, km1, kp1, kup, kDown
102    
103  Cjmc : add for phiHyd output <- but not working if multi tile per CPU  Cjmc : add for phiHyd output <- but not working if multi tile per CPU
104  c     CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff  c     CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff
# Line 119  c     LOGICAL  DIFFERENT_MULTIPLE Line 106  c     LOGICAL  DIFFERENT_MULTIPLE
106  c     EXTERNAL DIFFERENT_MULTIPLE  c     EXTERNAL DIFFERENT_MULTIPLE
107  Cjmc(end)  Cjmc(end)
108    
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
       INTEGER    isbyte  
       PARAMETER( isbyte = 4 )  
   
       INTEGER act1, act2, act3, act4  
       INTEGER max1, max2, max3  
       INTEGER iikey, kkey  
       INTEGER maximpl  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
   
109  C---    The algorithm...  C---    The algorithm...
110  C  C
111  C       "Correction Step"  C       "Correction Step"
# Line 173  C         (1 + dt * K * d_zz) theta[n] = Line 150  C         (1 + dt * K * d_zz) theta[n] =
150  C         (1 + dt * K * d_zz) salt[n] = salt*  C         (1 + dt * K * d_zz) salt[n] = salt*
151  C---  C---
152    
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 C--   dummy statement to end declaration part  
       ikey = 1  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
   
153  C--   Set up work arrays with valid (i.e. not NaN) values  C--   Set up work arrays with valid (i.e. not NaN) values
154  C     These inital values do not alter the numerical results. They  C     These inital values do not alter the numerical results. They
155  C     just ensure that all memory references are to valid floating  C     just ensure that all memory references are to valid floating
# Line 185  C     point numbers. This prevents spuri Line 157  C     point numbers. This prevents spuri
157  C     uninitialised but inert locations.  C     uninitialised but inert locations.
158        DO j=1-OLy,sNy+OLy        DO j=1-OLy,sNy+OLy
159         DO i=1-OLx,sNx+OLx         DO i=1-OLx,sNx+OLx
         xA(i,j)      = 0. _d 0  
         yA(i,j)      = 0. _d 0  
         uTrans(i,j)  = 0. _d 0  
         vTrans(i,j)  = 0. _d 0  
160          DO k=1,Nr          DO k=1,Nr
161           phiHyd(i,j,k)  = 0. _d 0           phiHyd(i,j,k)  = 0. _d 0
162           KappaRU(i,j,k) = 0. _d 0  cph         KappaRU(i,j,k) = 0. _d 0
163           KappaRV(i,j,k) = 0. _d 0  cph         KappaRV(i,j,k) = 0. _d 0
164           sigmaX(i,j,k) = 0. _d 0           sigmaX(i,j,k) = 0. _d 0
165           sigmaY(i,j,k) = 0. _d 0           sigmaY(i,j,k) = 0. _d 0
166           sigmaR(i,j,k) = 0. _d 0           sigmaR(i,j,k) = 0. _d 0
# Line 204  C     uninitialised but inert locations. Line 172  C     uninitialised but inert locations.
172         ENDDO         ENDDO
173        ENDDO        ENDDO
174    
   
175  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC
176  C--   HPF directive to help TAMC  C--   HPF directive to help TAMC
177  CHPF$ INDEPENDENT  CHPF$ INDEPENDENT
# Line 214  CHPF$ INDEPENDENT Line 181  CHPF$ INDEPENDENT
181    
182  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC
183  C--    HPF directive to help TAMC  C--    HPF directive to help TAMC
184  CHPF$  INDEPENDENT, NEW (rTrans,fVerT,fVerS,fVerU,fVerV  CHPF$  INDEPENDENT, NEW (fVerU,fVerV
185  CHPF$&                  ,phiHyd,utrans,vtrans,xA,yA  CHPF$&                  ,phiHyd
186  CHPF$&                  ,KappaRT,KappaRS,KappaRU,KappaRV  CHPF$&                  ,KappaRU,KappaRV
187  CHPF$&                  )  CHPF$&                  )
188  #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
189    
# Line 242  CHPF$&                  ) Line 209  CHPF$&                  )
209  C--     Set up work arrays that need valid initial values  C--     Set up work arrays that need valid initial values
210          DO j=1-OLy,sNy+OLy          DO j=1-OLy,sNy+OLy
211           DO i=1-OLx,sNx+OLx           DO i=1-OLx,sNx+OLx
212            rTrans(i,j)   = 0. _d 0            fVerU  (i,j,1) = 0. _d 0
213            fVerT (i,j,1) = 0. _d 0            fVerU  (i,j,2) = 0. _d 0
214            fVerT (i,j,2) = 0. _d 0            fVerV  (i,j,1) = 0. _d 0
215            fVerS (i,j,1) = 0. _d 0            fVerV  (i,j,2) = 0. _d 0
           fVerS (i,j,2) = 0. _d 0  
           fVerU (i,j,1) = 0. _d 0  
           fVerU (i,j,2) = 0. _d 0  
           fVerV (i,j,1) = 0. _d 0  
           fVerV (i,j,2) = 0. _d 0  
          ENDDO  
         ENDDO  
   
         DO k=1,Nr  
          DO j=1-OLy,sNy+OLy  
           DO i=1-OLx,sNx+OLx  
 C This is currently also used by IVDC and Diagnostics  
            ConvectCount(i,j,k) = 0.  
            KappaRT(i,j,k) = 0. _d 0  
            KappaRS(i,j,k) = 0. _d 0  
           ENDDO  
216           ENDDO           ENDDO
217          ENDDO          ENDDO
218    
         iMin = 1-OLx+1  
         iMax = sNx+OLx  
         jMin = 1-OLy+1  
         jMax = sNy+OLy  
   
   
 C--     Start of diagnostic loop  
         DO k=Nr,1,-1  
   
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 C? Patrick, is this formula correct now that we change the loop range?  
 C? Do we still need this?  
          kkey = (ikey-1)*(Nr-2+1) + (k-2) + 1  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
   
 C--       Integrate continuity vertically for vertical velocity  
           CALL INTEGRATE_FOR_W(  
      I                         bi, bj, k, uVel, vVel,  
      O                         wVel,  
      I                         myThid )  
   
 #ifdef    ALLOW_OBCS  
 #ifdef    ALLOW_NONHYDROSTATIC  
 C--       Apply OBC to W if in N-H mode  
           IF (useOBCS.AND.nonHydrostatic) THEN  
             CALL OBCS_APPLY_W( bi, bj, k, wVel, myThid )  
           ENDIF  
 #endif    /* ALLOW_NONHYDROSTATIC */  
 #endif    /* ALLOW_OBCS */  
   
 C--       Calculate gradients of potential density for isoneutral  
 C         slope terms (e.g. GM/Redi tensor or IVDC diffusivity)  
 c         IF ( k.GT.1 .AND. (useGMRedi.OR.ivdc_kappa.NE.0.) ) THEN  
           IF ( useGMRedi .OR. (k.GT.1 .AND. ivdc_kappa.NE.0.) ) THEN  
             CALL FIND_RHO(  
      I        bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k, k, eosType,  
      I        theta, salt,  
      O        rhoK,  
      I        myThid )  
             IF (k.GT.1) CALL FIND_RHO(  
      I        bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k-1, k, eosType,  
      I        theta, salt,  
      O        rhoKm1,  
      I        myThid )  
             CALL GRAD_SIGMA(  
      I             bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k,  
      I             rhoK, rhoKm1, rhoK,  
      O             sigmaX, sigmaY, sigmaR,  
      I             myThid )  
           ENDIF  
   
 C--       Implicit Vertical Diffusion for Convection  
 c ==> should use sigmaR !!!  
           IF (k.GT.1 .AND. ivdc_kappa.NE.0.) THEN  
             CALL CALC_IVDC(  
      I        bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k,  
      I        rhoKm1, rhoK,  
      U        ConvectCount, KappaRT, KappaRS,  
      I        myTime, myIter, myThid)  
           ENDIF  
   
 C--     end of diagnostic k loop (Nr:1)  
         ENDDO  
   
 #ifdef  ALLOW_OBCS  
 C--     Calculate future values on open boundaries  
         IF (useOBCS) THEN  
           CALL OBCS_CALC( bi, bj, myTime+deltaT,  
      I            uVel, vVel, wVel, theta, salt,  
      I            myThid )  
         ENDIF  
 #endif  /* ALLOW_OBCS */  
   
 C--     Determines forcing terms based on external fields  
 C       relaxation terms, etc.  
         CALL EXTERNAL_FORCING_SURF(  
      I             bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,  
      I             myThid )  
   
 #ifdef  ALLOW_GMREDI  
 C--     Calculate iso-neutral slopes for the GM/Redi parameterisation  
         IF (useGMRedi) THEN  
           DO k=1,Nr  
             CALL GMREDI_CALC_TENSOR(  
      I             bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k,  
      I             sigmaX, sigmaY, sigmaR,  
      I             myThid )  
           ENDDO  
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
         ELSE  
           DO k=1, Nr  
             CALL GMREDI_CALC_TENSOR_DUMMY(  
      I             bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k,  
      I             sigmaX, sigmaY, sigmaR,  
      I             myThid )  
           ENDDO  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
         ENDIF  
 #endif  /* ALLOW_GMREDI */  
   
 #ifdef  ALLOW_KPP  
 C--     Compute KPP mixing coefficients  
         IF (useKPP) THEN  
           CALL KPP_CALC(  
      I                  bi, bj, myTime, myThid )  
         ENDIF  
 #endif  /* ALLOW_KPP */  
   
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 CADJ STORE KappaRT(:,:,:)     = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte  
 CADJ STORE KappaRS(:,:,:)     = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte  
 CADJ STORE theta(:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte  
 CADJ STORE salt (:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte  
 CADJ STORE uvel (:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte  
 CADJ STORE vvel (:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
   
 #ifdef ALLOW_AIM  
 C       AIM - atmospheric intermediate model, physics package code.  
 C note(jmc) : phiHyd=0 at this point but is not really used in Molteni Physics  
         IF ( useAIM ) THEN  
          CALL TIMER_START('AIM_DO_ATMOS_PHYS      [DYNAMICS]', myThid)  
          CALL AIM_DO_ATMOS_PHYSICS( phiHyd, myTime, myThid )  
          CALL TIMER_STOP ('AIM_DO_ATMOS_PHYS      [DYNAMICS]', myThid)  
         ENDIF  
 #endif /* ALLOW_AIM */  
   
   
 C--     Start of thermodynamics loop  
         DO k=Nr,1,-1  
   
 C--       km1    Points to level above k (=k-1)  
 C--       kup    Cycles through 1,2 to point to layer above  
 C--       kDown  Cycles through 2,1 to point to current layer  
   
           km1  = MAX(1,k-1)  
           kup  = 1+MOD(k+1,2)  
           kDown= 1+MOD(k,2)  
   
           iMin = 1-OLx+2  
           iMax = sNx+OLx-1  
           jMin = 1-OLy+2  
           jMax = sNy+OLy-1  
   
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 CPatrick Is this formula correct?  
          kkey = (ikey-1)*(Nr-1+1) + (k-1) + 1  
 CADJ STORE rTrans(:,:)       = comlev1_bibj_k, key = kkey, byte = isbyte  
 CADJ STORE KappaRT(:,:,:)    = comlev1_bibj_k, key = kkey, byte = isbyte  
 CADJ STORE KappaRS(:,:,:)    = comlev1_bibj_k, key = kkey, byte = isbyte  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
   
 C--      Get temporary terms used by tendency routines  
          CALL CALC_COMMON_FACTORS (  
      I        bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,  
      O        xA,yA,uTrans,vTrans,rTrans,maskUp,  
      I        myThid)  
   
 #ifdef  INCLUDE_CALC_DIFFUSIVITY_CALL  
 C--      Calculate the total vertical diffusivity  
          CALL CALC_DIFFUSIVITY(  
      I        bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,  
      I        maskUp,  
      O        KappaRT,KappaRS,KappaRU,KappaRV,  
      I        myThid)  
 #endif  
   
 C--      Calculate active tracer tendencies (gT,gS,...)  
 C        and step forward storing result in gTnm1, gSnm1, etc.  
          IF ( tempStepping ) THEN  
            CALL CALC_GT(  
      I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax, k,km1,kup,kDown,  
      I         xA,yA,uTrans,vTrans,rTrans,maskUp,  
      I         KappaRT,  
      U         fVerT,  
      I         myTime, myThid)  
            tauAB = 0.5d0 + abEps  
            CALL TIMESTEP_TRACER(  
      I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,tauAB,  
      I         theta, gT,  
      U         gTnm1,  
      I         myIter, myThid)  
          ENDIF  
          IF ( saltStepping ) THEN  
            CALL CALC_GS(  
      I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax, k,km1,kup,kDown,  
      I         xA,yA,uTrans,vTrans,rTrans,maskUp,  
      I         KappaRS,  
      U         fVerS,  
      I         myTime, myThid)  
            tauAB = 0.5d0 + abEps  
            CALL TIMESTEP_TRACER(  
      I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,tauAB,  
      I         salt, gS,  
      U         gSnm1,  
      I         myIter, myThid)  
          ENDIF  
   
 #ifdef   ALLOW_OBCS  
 C--      Apply open boundary conditions  
          IF (useOBCS) THEN  
            CALL OBCS_APPLY_TS( bi, bj, k, gTnm1, gSnm1, myThid )  
          END IF  
 #endif   /* ALLOW_OBCS */  
   
 C--      Freeze water  
          IF (allowFreezing) THEN  
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 CADJ STORE gTNm1(:,:,k,bi,bj) = comlev1_bibj_k  
 CADJ &   , key = kkey, byte = isbyte  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
             CALL FREEZE( bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k, myThid )  
          END IF  
   
 C--     end of thermodynamic k loop (Nr:1)  
         ENDDO  
   
   
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 CPatrick? What about this one?  
            maximpl = 6  
            iikey = (ikey-1)*maximpl  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
   
 C--     Implicit diffusion  
         IF (implicitDiffusion) THEN  
   
          IF (tempStepping) THEN  
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
             idkey = iikey + 1  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
             CALL IMPLDIFF(  
      I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,  
      I         deltaTtracer, KappaRT, recip_HFacC,  
      U         gTNm1,  
      I         myThid )  
          ENDIF  
   
          IF (saltStepping) THEN  
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
          idkey = iikey + 2  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
             CALL IMPLDIFF(  
      I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,  
      I         deltaTtracer, KappaRS, recip_HFacC,  
      U         gSNm1,  
      I         myThid )  
          ENDIF  
   
 #ifdef   ALLOW_OBCS  
 C--      Apply open boundary conditions  
          IF (useOBCS) THEN  
            DO K=1,Nr  
              CALL OBCS_APPLY_TS( bi, bj, k, gTnm1, gSnm1, myThid )  
            ENDDO  
          END IF  
 #endif   /* ALLOW_OBCS */  
   
 C--     End If implicitDiffusion  
         ENDIF  
   
219  C--     Start computation of dynamics  C--     Start computation of dynamics
220          iMin = 1-OLx+2          iMin = 1-OLx+2
221          iMax = sNx+OLx-1          iMax = sNx+OLx-1
222          jMin = 1-OLy+2          jMin = 1-OLy+2
223          jMax = sNy+OLy-1          jMax = sNy+OLy-1
224    
225    #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC
226    CADJ STORE uvel (:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte
227    CADJ STORE vvel (:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte
228    CADJ STORE wvel (:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte
229    #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
230    
231  C--     Explicit part of the Surface Potentiel Gradient (add in TIMESTEP)  C--     Explicit part of the Surface Potentiel Gradient (add in TIMESTEP)
232  C       (note: this loop will be replaced by CALL CALC_GRAD_ETA)  C       (note: this loop will be replaced by CALL CALC_GRAD_ETA)
233          IF (implicSurfPress.NE.1.) THEN          IF (implicSurfPress.NE.1.) THEN
# Line 542  C       (note: this loop will be replace Line 238  C       (note: this loop will be replace
238       I         myThid )                               I         myThid )                        
239          ENDIF          ENDIF
240    
241    #ifdef  INCLUDE_CALC_DIFFUSIVITY_CALL
242    C--      Calculate the total vertical diffusivity
243            DO k=1,Nr
244             CALL CALC_VISCOSITY(
245         I        bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,
246         O        KappaRU,KappaRV,
247         I        myThid)
248           ENDDO
249    #endif
250    
251  C--     Start of dynamics loop  C--     Start of dynamics loop
252          DO k=1,Nr          DO k=1,Nr
253    
# Line 550  C--       kup    Cycles through 1,2 to p Line 256  C--       kup    Cycles through 1,2 to p
256  C--       kDown  Cycles through 2,1 to point to current layer  C--       kDown  Cycles through 2,1 to point to current layer
257    
258            km1  = MAX(1,k-1)            km1  = MAX(1,k-1)
259              kp1  = MIN(k+1,Nr)
260            kup  = 1+MOD(k+1,2)            kup  = 1+MOD(k+1,2)
261            kDown= 1+MOD(k,2)            kDown= 1+MOD(k,2)
262    
263    #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC
264             kkey = (ikey-1)*Nr + k
265    #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
266    
267  C--      Integrate hydrostatic balance for phiHyd with BC of  C--      Integrate hydrostatic balance for phiHyd with BC of
268  C        phiHyd(z=0)=0  C        phiHyd(z=0)=0
269  C        distinguishe between Stagger and Non Stagger time stepping  C        distinguishe between Stagger and Non Stagger time stepping
# Line 613  C--     Implicit viscosity Line 324  C--     Implicit viscosity
324          IF (implicitViscosity.AND.momStepping) THEN          IF (implicitViscosity.AND.momStepping) THEN
325  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC
326            idkey = iikey + 3            idkey = iikey + 3
327    CADJ STORE gUNm1(:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj , key=ikey, byte=isbyte
328  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
329            CALL IMPLDIFF(            CALL IMPLDIFF(
330       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,
# Line 621  C--     Implicit viscosity Line 333  C--     Implicit viscosity
333       I         myThid )       I         myThid )
334  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC
335            idkey = iikey + 4            idkey = iikey + 4
336    CADJ STORE gVNm1(:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj , key=ikey, byte=isbyte
337  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
338            CALL IMPLDIFF(            CALL IMPLDIFF(
339       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,
# Line 640  C--      Apply open boundary conditions Line 353  C--      Apply open boundary conditions
353  #ifdef    INCLUDE_CD_CODE  #ifdef    INCLUDE_CD_CODE
354  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC
355            idkey = iikey + 5            idkey = iikey + 5
356    CADJ STORE vVelD(:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj , key=ikey, byte=isbyte
357  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
358            CALL IMPLDIFF(            CALL IMPLDIFF(
359       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,
# Line 648  C--      Apply open boundary conditions Line 362  C--      Apply open boundary conditions
362       I         myThid )       I         myThid )
363  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC
364            idkey = iikey + 6            idkey = iikey + 6
365    CADJ STORE uVelD(:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj , key=ikey, byte=isbyte
366  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
367            CALL IMPLDIFF(            CALL IMPLDIFF(
368       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,
# Line 668  Cjmc(end) Line 383  Cjmc(end)
383    
384  #ifdef ALLOW_TIMEAVE  #ifdef ALLOW_TIMEAVE
385          IF (taveFreq.GT.0.) THEN          IF (taveFreq.GT.0.) THEN
386            CALL TIMEAVE_CUMULATE(phiHydtave, phiHyd, Nr,            CALL TIMEAVE_CUMUL_1T(phiHydtave, phiHyd, Nr,
387       I                              deltaTclock, bi, bj, myThid)       I                              deltaTclock, bi, bj, myThid)
388            IF (ivdc_kappa.NE.0.) THEN            IF (ivdc_kappa.NE.0.) THEN
389              CALL TIMEAVE_CUMULATE(ConvectCountTave, ConvectCount, Nr,              CALL TIMEAVE_CUMULATE(ConvectCountTave, ConvectCount, Nr,
# Line 680  Cjmc(end) Line 395  Cjmc(end)
395         ENDDO         ENDDO
396        ENDDO        ENDDO
397    
398    #ifndef EXCLUDE_DEBUGMODE
399          If (debugMode) THEN
400           CALL DEBUG_STATS_RL(1,EtaN,'EtaN (DYNAMICS)',myThid)
401           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,uVel,'Uvel (DYNAMICS)',myThid)
402           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,vVel,'Vvel (DYNAMICS)',myThid)
403           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,wVel,'Wvel (DYNAMICS)',myThid)
404           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,theta,'Theta (DYNAMICS)',myThid)
405           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,salt,'Salt (DYNAMICS)',myThid)
406           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,Gu,'Gu (DYNAMICS)',myThid)
407           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,Gv,'Gv (DYNAMICS)',myThid)
408           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,Gt,'Gt (DYNAMICS)',myThid)
409           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,Gs,'Gs (DYNAMICS)',myThid)
410           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,GuNm1,'GuNm1 (DYNAMICS)',myThid)
411           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,GvNm1,'GvNm1 (DYNAMICS)',myThid)
412           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,GtNm1,'GtNm1 (DYNAMICS)',myThid)
413           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,GsNm1,'GsNm1 (DYNAMICS)',myThid)
414          ENDIF
415    #endif
416    
417        RETURN        RETURN
418        END        END
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