/[MITgcm]/MITgcm/model/src/dynamics.F
ViewVC logotype

Diff of /MITgcm/model/src/dynamics.F

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Revision Graph Revision Graph | View Patch Patch

revision 1.65 by jmc, Thu Mar 8 20:25:01 2001 UTC revision 1.166 by m_bates, Sun Sep 15 14:28:31 2013 UTC
# Line 1  Line 1 
1  C $Header$  C $Header$
2  C $Name$  C $Name$
3    
4    #include "PACKAGES_CONFIG.h"
5  #include "CPP_OPTIONS.h"  #include "CPP_OPTIONS.h"
6    #ifdef ALLOW_OBCS
7    # include "OBCS_OPTIONS.h"
8    #endif
9    
10    #undef DYNAMICS_GUGV_EXCH_CHECK
11    
12    CBOP
13    C     !ROUTINE: DYNAMICS
14    C     !INTERFACE:
15        SUBROUTINE DYNAMICS(myTime, myIter, myThid)        SUBROUTINE DYNAMICS(myTime, myIter, myThid)
16  C     /==========================================================\  C     !DESCRIPTION: \bv
17  C     | SUBROUTINE DYNAMICS                                      |  C     *==========================================================*
18  C     | o Controlling routine for the explicit part of the model |  C     | SUBROUTINE DYNAMICS
19  C     |   dynamics.                                              |  C     | o Controlling routine for the explicit part of the model
20  C     |==========================================================|  C     |   dynamics.
21  C     | This routine evaluates the "dynamics" terms for each     |  C     *==========================================================*
22  C     | block of ocean in turn. Because the blocks of ocean have |  C     | This routine evaluates the "dynamics" terms for each
23  C     | overlap regions they are independent of one another.     |  C     | block of ocean in turn. Because the blocks of ocean have
24  C     | If terms involving lateral integrals are needed in this  |  C     | overlap regions they are independent of one another.
25  C     | routine care will be needed. Similarly finite-difference |  C     | If terms involving lateral integrals are needed in this
26  C     | operations with stencils wider than the overlap region   |  C     | routine care will be needed. Similarly finite-difference
27  C     | require special consideration.                           |  C     | operations with stencils wider than the overlap region
28  C     | Notes                                                    |  C     | require special consideration.
29  C     | =====                                                    |  C     | The algorithm...
30  C     | C*P* comments indicating place holders for which code is |  C     |
31  C     |      presently being developed.                          |  C     | "Correction Step"
32  C     \==========================================================/  C     | =================
33    C     | Here we update the horizontal velocities with the surface
34    C     | pressure such that the resulting flow is either consistent
35    C     | with the free-surface evolution or the rigid-lid:
36    C     |   U[n] = U* + dt x d/dx P
37    C     |   V[n] = V* + dt x d/dy P
38    C     |   W[n] = W* + dt x d/dz P  (NH mode)
39    C     |
40    C     | "Calculation of Gs"
41    C     | ===================
42    C     | This is where all the accelerations and tendencies (ie.
43    C     | physics, parameterizations etc...) are calculated
44    C     |   rho = rho ( theta[n], salt[n] )
45    C     |   b   = b(rho, theta)
46    C     |   K31 = K31 ( rho )
47    C     |   Gu[n] = Gu( u[n], v[n], wVel, b, ... )
48    C     |   Gv[n] = Gv( u[n], v[n], wVel, b, ... )
49    C     |   Gt[n] = Gt( theta[n], u[n], v[n], wVel, K31, ... )
50    C     |   Gs[n] = Gs( salt[n], u[n], v[n], wVel, K31, ... )
51    C     |
52    C     | "Time-stepping" or "Prediction"
53    C     | ================================
54    C     | The models variables are stepped forward with the appropriate
55    C     | time-stepping scheme (currently we use Adams-Bashforth II)
56    C     | - For momentum, the result is always *only* a "prediction"
57    C     | in that the flow may be divergent and will be "corrected"
58    C     | later with a surface pressure gradient.
59    C     | - Normally for tracers the result is the new field at time
60    C     | level [n+1} *BUT* in the case of implicit diffusion the result
61    C     | is also *only* a prediction.
62    C     | - We denote "predictors" with an asterisk (*).
63    C     |   U* = U[n] + dt x ( 3/2 Gu[n] - 1/2 Gu[n-1] )
64    C     |   V* = V[n] + dt x ( 3/2 Gv[n] - 1/2 Gv[n-1] )
65    C     |   theta[n+1] = theta[n] + dt x ( 3/2 Gt[n] - 1/2 atG[n-1] )
66    C     |   salt[n+1] = salt[n] + dt x ( 3/2 Gt[n] - 1/2 atG[n-1] )
67    C     | With implicit diffusion:
68    C     |   theta* = theta[n] + dt x ( 3/2 Gt[n] - 1/2 atG[n-1] )
69    C     |   salt* = salt[n] + dt x ( 3/2 Gt[n] - 1/2 atG[n-1] )
70    C     |   (1 + dt * K * d_zz) theta[n] = theta*
71    C     |   (1 + dt * K * d_zz) salt[n] = salt*
72    C     |
73    C     *==========================================================*
74    C     \ev
75    C     !USES:
76        IMPLICIT NONE        IMPLICIT NONE
   
77  C     == Global variables ===  C     == Global variables ===
78  #include "SIZE.h"  #include "SIZE.h"
79  #include "EEPARAMS.h"  #include "EEPARAMS.h"
80  #include "PARAMS.h"  #include "PARAMS.h"
 #include "DYNVARS.h"  
81  #include "GRID.h"  #include "GRID.h"
82    #include "DYNVARS.h"
83    #ifdef ALLOW_CD_CODE
84    # include "CD_CODE_VARS.h"
85    #endif
86  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC
87  # include "tamc.h"  # include "tamc.h"
88  # include "tamc_keys.h"  # include "tamc_keys.h"
89  #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  # include "FFIELDS.h"
90    # include "EOS.h"
91  #ifdef ALLOW_KPP  # ifdef ALLOW_KPP
92  # include "KPP.h"  #  include "KPP.h"
93  #endif  # endif
94    # ifdef ALLOW_PTRACERS
95  #ifdef ALLOW_TIMEAVE  #  include "PTRACERS_SIZE.h"
96  #include "TIMEAVE_STATV.h"  #  include "PTRACERS_FIELDS.h"
97  #endif  # endif
98    # ifdef ALLOW_OBCS
99    #  include "OBCS_PARAMS.h"
100    #  include "OBCS_FIELDS.h"
101    #  ifdef ALLOW_PTRACERS
102    #   include "OBCS_PTRACERS.h"
103    #  endif
104    # endif
105    # ifdef ALLOW_MOM_FLUXFORM
106    #  include "MOM_FLUXFORM.h"
107    # endif
108    #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
109    
110    C     !CALLING SEQUENCE:
111    C     DYNAMICS()
112    C      |
113    C      |-- CALC_EP_FORCING
114    C      |
115    C      |-- CALC_GRAD_PHI_SURF
116    C      |
117    C      |-- CALC_VISCOSITY
118    C      |
119    C      |-- CALC_EDDY_STRESS
120    C      |
121    C      |-- CALC_PHI_HYD
122    C      |
123    C      |-- MOM_FLUXFORM
124    C      |
125    C      |-- MOM_VECINV
126    C      |
127    C      |-- TIMESTEP
128    C      |
129    C      |-- MOM_U_IMPLICIT_R
130    C      |-- MOM_V_IMPLICIT_R
131    C      |
132    C      |-- IMPLDIFF
133    C      |
134    C      |-- OBCS_APPLY_UV
135    C      |
136    C      |-- CALC_GW
137    C      |
138    C      |-- DIAGNOSTICS_FILL
139    C      |-- DEBUG_STATS_RL
140    
141    C     !INPUT/OUTPUT PARAMETERS:
142  C     == Routine arguments ==  C     == Routine arguments ==
143  C     myTime - Current time in simulation  C     myTime :: Current time in simulation
144  C     myIter - Current iteration number in simulation  C     myIter :: Current iteration number in simulation
145  C     myThid - Thread number for this instance of the routine.  C     myThid :: Thread number for this instance of the routine.
146        _RL myTime        _RL myTime
147        INTEGER myIter        INTEGER myIter
148        INTEGER myThid        INTEGER myThid
149    
150    C     !FUNCTIONS:
151    #ifdef ALLOW_DIAGNOSTICS
152          LOGICAL  DIAGNOSTICS_IS_ON
153          EXTERNAL DIAGNOSTICS_IS_ON
154    #endif
155    
156    C     !LOCAL VARIABLES:
157  C     == Local variables  C     == Local variables
158  C     xA, yA                 - Per block temporaries holding face areas  C     fVer[UV]               o fVer: Vertical flux term - note fVer
159  C     uTrans, vTrans, rTrans - Per block temporaries holding flow  C                                    is "pipelined" in the vertical
160  C                              transport  C                                    so we need an fVer for each
161  C                              o uTrans: Zonal transport  C                                    variable.
162  C                              o vTrans: Meridional transport  C     phiHydC    :: hydrostatic potential anomaly at cell center
163  C                              o rTrans: Vertical transport  C                   In z coords phiHyd is the hydrostatic potential
164  C     maskC,maskUp             o maskC: land/water mask for tracer cells  C                      (=pressure/rho0) anomaly
165  C                              o maskUp: land/water mask for W points  C                   In p coords phiHyd is the geopotential height anomaly.
166  C     fVer[STUV]               o fVer: Vertical flux term - note fVer  C     phiHydF    :: hydrostatic potential anomaly at middle between 2 centers
167  C                                      is "pipelined" in the vertical  C     dPhiHydX,Y :: Gradient (X & Y directions) of hydrostatic potential anom.
168  C                                      so we need an fVer for each  C     phiSurfX,  ::  gradient of Surface potential (Pressure/rho, ocean)
169  C                                      variable.  C     phiSurfY             or geopotential (atmos) in X and Y direction
170  C     rhoK, rhoKM1   - Density at current level, and level above  C     guDissip   :: dissipation tendency (all explicit terms), u component
171  C     phiHyd         - Hydrostatic part of the potential phiHydi.  C     gvDissip   :: dissipation tendency (all explicit terms), v component
172  C                      In z coords phiHydiHyd is the hydrostatic  C     KappaRU    :: vertical viscosity for velocity U-component
173  C                      Potential (=pressure/rho0) anomaly  C     KappaRV    :: vertical viscosity for velocity V-component
174  C                      In p coords phiHydiHyd is the geopotential  C     iMin, iMax :: Ranges and sub-block indices on which calculations
175  C                      surface height anomaly.  C     jMin, jMax    are applied.
176  C     phiSurfX, - gradient of Surface potentiel (Pressure/rho, ocean)  C     bi, bj     :: tile indices
177  C     phiSurfY             or geopotentiel (atmos) in X and Y direction  C     k          :: current level index
178  C     KappaRT,       - Total diffusion in vertical for T and S.  C     km1, kp1   :: index of level above (k-1) and below (k+1)
179  C     KappaRS          (background + spatially varying, isopycnal term).  C     kUp, kDown :: Index for interface above and below. kUp and kDown are
180  C     iMin, iMax     - Ranges and sub-block indices on which calculations  C                   are switched with k to be the appropriate index into fVerU,V
 C     jMin, jMax       are applied.  
 C     bi, bj  
 C     k, kup,        - Index for layer above and below. kup and kDown  
 C     kDown, km1       are switched with layer to be the appropriate  
 C                      index into fVerTerm.  
       _RS xA      (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)  
       _RS yA      (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)  
       _RL uTrans  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)  
       _RL vTrans  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)  
       _RL rTrans  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)  
       _RS maskC   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)  
       _RS maskUp  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)  
       _RL fVerT   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)  
       _RL fVerS   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)  
181        _RL fVerU   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)        _RL fVerU   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)
182        _RL fVerV   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)        _RL fVerV   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)
183        _RL phiHyd  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)        _RL phiHydF (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
184        _RL rhokm1  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)        _RL phiHydC (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
185        _RL rhok    (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)        _RL dPhiHydX(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
186          _RL dPhiHydY(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
187        _RL phiSurfX(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)        _RL phiSurfX(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
188        _RL phiSurfY(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)        _RL phiSurfY(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
189        _RL KappaRT (1-Olx:sNx+Olx,1-Oly:sNy+Oly,Nr)        _RL guDissip(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
190        _RL KappaRS (1-Olx:sNx+Olx,1-Oly:sNy+Oly,Nr)        _RL gvDissip(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
191        _RL KappaRU (1-Olx:sNx+Olx,1-Oly:sNy+Oly,Nr)        _RL KappaRU (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)
192        _RL KappaRV (1-Olx:sNx+Olx,1-Oly:sNy+Oly,Nr)        _RL KappaRV (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)
       _RL sigmaX  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)  
       _RL sigmaY  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)  
       _RL sigmaR  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)  
   
 C This is currently used by IVDC and Diagnostics  
       _RL ConvectCount (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)  
193    
194        INTEGER iMin, iMax        INTEGER iMin, iMax
195        INTEGER jMin, jMax        INTEGER jMin, jMax
196        INTEGER bi, bj        INTEGER bi, bj
197        INTEGER i, j        INTEGER i, j
198        INTEGER k, km1, kup, kDown        INTEGER k, km1, kp1, kUp, kDown
199    
200  Cjmc : add for phiHyd output <- but not working if multi tile per CPU  #ifdef ALLOW_DIAGNOSTICS
201  c     CHARACTER*(MAX_LEN_MBUF) suff        LOGICAL dPhiHydDiagIsOn
202  c     LOGICAL  DIFFERENT_MULTIPLE        _RL tmpFac
203  c     EXTERNAL DIFFERENT_MULTIPLE  #endif /* ALLOW_DIAGNOSTICS */
 Cjmc(end)  
   
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
       INTEGER    isbyte  
       PARAMETER( isbyte = 4 )  
   
       INTEGER act1, act2, act3, act4  
       INTEGER max1, max2, max3  
       INTEGER iikey, kkey  
       INTEGER maximpl  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
204    
205  C---    The algorithm...  C---    The algorithm...
206  C  C
# Line 172  C         salt* = salt[n] + dt x ( 3/2 G Line 245  C         salt* = salt[n] + dt x ( 3/2 G
245  C         (1 + dt * K * d_zz) theta[n] = theta*  C         (1 + dt * K * d_zz) theta[n] = theta*
246  C         (1 + dt * K * d_zz) salt[n] = salt*  C         (1 + dt * K * d_zz) salt[n] = salt*
247  C---  C---
248    CEOP
249    
250  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef ALLOW_DEBUG
251  C--   dummy statement to end declaration part        IF (debugMode) CALL DEBUG_ENTER( 'DYNAMICS', myThid )
252        ikey = 1  #endif
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
253    
254  C--   Set up work arrays with valid (i.e. not NaN) values  #ifdef ALLOW_DIAGNOSTICS
255  C     These inital values do not alter the numerical results. They        dPhiHydDiagIsOn = .FALSE.
256  C     just ensure that all memory references are to valid floating        IF ( useDiagnostics )
257  C     point numbers. This prevents spurious hardware signals due to       &  dPhiHydDiagIsOn = DIAGNOSTICS_IS_ON( 'Um_dPHdx', myThid )
258  C     uninitialised but inert locations.       &               .OR. DIAGNOSTICS_IS_ON( 'Vm_dPHdy', myThid )
259        DO j=1-OLy,sNy+OLy  #endif
        DO i=1-OLx,sNx+OLx  
         xA(i,j)      = 0. _d 0  
         yA(i,j)      = 0. _d 0  
         uTrans(i,j)  = 0. _d 0  
         vTrans(i,j)  = 0. _d 0  
         DO k=1,Nr  
          phiHyd(i,j,k)  = 0. _d 0  
          KappaRU(i,j,k) = 0. _d 0  
          KappaRV(i,j,k) = 0. _d 0  
          sigmaX(i,j,k) = 0. _d 0  
          sigmaY(i,j,k) = 0. _d 0  
          sigmaR(i,j,k) = 0. _d 0  
         ENDDO  
         rhoKM1 (i,j) = 0. _d 0  
         rhok   (i,j) = 0. _d 0  
         maskC  (i,j) = 0. _d 0  
         phiSurfX(i,j) = 0. _d 0  
         phiSurfY(i,j) = 0. _d 0  
        ENDDO  
       ENDDO  
260    
261    C-- Call to routine for calculation of Eliassen-Palm-flux-forced
262    C    U-tendency, if desired:
263    #ifdef INCLUDE_EP_FORCING_CODE
264          CALL CALC_EP_FORCING(myThid)
265    #endif
266    
267    #ifdef ALLOW_AUTODIFF_MONITOR_DIAG
268          CALL DUMMY_IN_DYNAMICS( myTime, myIter, myThid )
269    #endif
270    
271  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC
272  C--   HPF directive to help TAMC  C--   HPF directive to help TAMC
# Line 215  CHPF$ INDEPENDENT Line 277  CHPF$ INDEPENDENT
277    
278  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC
279  C--    HPF directive to help TAMC  C--    HPF directive to help TAMC
280  CHPF$  INDEPENDENT, NEW (rTrans,fVerT,fVerS,fVerU,fVerV  CHPF$  INDEPENDENT, NEW (fVerU,fVerV
281  CHPF$&                  ,phiHyd,utrans,vtrans,maskc,xA,yA  CHPF$&                  ,phiHydF
282  CHPF$&                  ,KappaRT,KappaRS,KappaRU,KappaRV  CHPF$&                  ,KappaRU,KappaRV
283  CHPF$&                  )  CHPF$&                  )
284  #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
285    
# Line 226  CHPF$&                  ) Line 288  CHPF$&                  )
288  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC
289            act1 = bi - myBxLo(myThid)            act1 = bi - myBxLo(myThid)
290            max1 = myBxHi(myThid) - myBxLo(myThid) + 1            max1 = myBxHi(myThid) - myBxLo(myThid) + 1
   
291            act2 = bj - myByLo(myThid)            act2 = bj - myByLo(myThid)
292            max2 = myByHi(myThid) - myByLo(myThid) + 1            max2 = myByHi(myThid) - myByLo(myThid) + 1
   
293            act3 = myThid - 1            act3 = myThid - 1
294            max3 = nTx*nTy            max3 = nTx*nTy
   
295            act4 = ikey_dynamics - 1            act4 = ikey_dynamics - 1
296              idynkey = (act1 + 1) + act2*max1
           ikey = (act1 + 1) + act2*max1  
297       &                      + act3*max1*max2       &                      + act3*max1*max2
298       &                      + act4*max1*max2*max3       &                      + act4*max1*max2*max3
299  #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
300    
301  C--     Set up work arrays that need valid initial values  C--   Set up work arrays with valid (i.e. not NaN) values
302          DO j=1-OLy,sNy+OLy  C     These initial values do not alter the numerical results. They
303           DO i=1-OLx,sNx+OLx  C     just ensure that all memory references are to valid floating
304            rTrans(i,j)   = 0. _d 0  C     point numbers. This prevents spurious hardware signals due to
305            fVerT (i,j,1) = 0. _d 0  C     uninitialised but inert locations.
           fVerT (i,j,2) = 0. _d 0  
           fVerS (i,j,1) = 0. _d 0  
           fVerS (i,j,2) = 0. _d 0  
           fVerU (i,j,1) = 0. _d 0  
           fVerU (i,j,2) = 0. _d 0  
           fVerV (i,j,1) = 0. _d 0  
           fVerV (i,j,2) = 0. _d 0  
          ENDDO  
         ENDDO  
306    
307    #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC
308          DO k=1,Nr          DO k=1,Nr
309           DO j=1-OLy,sNy+OLy           DO j=1-OLy,sNy+OLy
310            DO i=1-OLx,sNx+OLx            DO i=1-OLx,sNx+OLx
311  C This is currently also used by IVDC and Diagnostics  cph(
312             ConvectCount(i,j,k) = 0.  c--   need some re-initialisation here to break dependencies
313             KappaRT(i,j,k) = 0. _d 0  cph)
314             KappaRS(i,j,k) = 0. _d 0             gU(i,j,k,bi,bj) = 0. _d 0
315               gV(i,j,k,bi,bj) = 0. _d 0
316            ENDDO            ENDDO
317           ENDDO           ENDDO
318          ENDDO          ENDDO
   
         iMin = 1-OLx+1  
         iMax = sNx+OLx  
         jMin = 1-OLy+1  
         jMax = sNy+OLy  
   
   
 C--     Start of diagnostic loop  
         DO k=Nr,1,-1  
   
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 C? Patrick, is this formula correct now that we change the loop range?  
 C? Do we still need this?  
          kkey = (ikey-1)*(Nr-2+1) + (k-2) + 1  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
   
 C--       Integrate continuity vertically for vertical velocity  
           CALL INTEGRATE_FOR_W(  
      I                         bi, bj, k, uVel, vVel,  
      O                         wVel,  
      I                         myThid )  
   
 #ifdef    ALLOW_OBCS  
 #ifdef    ALLOW_NONHYDROSTATIC  
 C--       Apply OBC to W if in N-H mode  
           IF (useOBCS.AND.nonHydrostatic) THEN  
             CALL OBCS_APPLY_W( bi, bj, k, wVel, myThid )  
           ENDIF  
 #endif    /* ALLOW_NONHYDROSTATIC */  
 #endif    /* ALLOW_OBCS */  
   
 C--       Calculate gradients of potential density for isoneutral  
 C         slope terms (e.g. GM/Redi tensor or IVDC diffusivity)  
 c         IF ( k.GT.1 .AND. (useGMRedi.OR.ivdc_kappa.NE.0.) ) THEN  
           IF ( useGMRedi .OR. (k.GT.1 .AND. ivdc_kappa.NE.0.) ) THEN  
             CALL FIND_RHO(  
      I        bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k, k, eosType,  
      I        theta, salt,  
      O        rhoK,  
      I        myThid )  
             IF (k.GT.1) CALL FIND_RHO(  
      I        bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k-1, k, eosType,  
      I        theta, salt,  
      O        rhoKm1,  
      I        myThid )  
             CALL GRAD_SIGMA(  
      I             bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k,  
      I             rhoK, rhoKm1, rhoK,  
      O             sigmaX, sigmaY, sigmaR,  
      I             myThid )  
           ENDIF  
   
 C--       Implicit Vertical Diffusion for Convection  
 c ==> should use sigmaR !!!  
           IF (k.GT.1 .AND. ivdc_kappa.NE.0.) THEN  
             CALL CALC_IVDC(  
      I        bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k,  
      I        rhoKm1, rhoK,  
      U        ConvectCount, KappaRT, KappaRS,  
      I        myTime, myIter, myThid)  
           ENDIF  
   
 C--     end of diagnostic k loop (Nr:1)  
         ENDDO  
   
 #ifdef  ALLOW_OBCS  
 C--     Calculate future values on open boundaries  
         IF (useOBCS) THEN  
           CALL OBCS_CALC( bi, bj, myTime+deltaT,  
      I            uVel, vVel, wVel, theta, salt,  
      I            myThid )  
         ENDIF  
 #endif  /* ALLOW_OBCS */  
   
 C--     Determines forcing terms based on external fields  
 C       relaxation terms, etc.  
         CALL EXTERNAL_FORCING_SURF(  
      I             bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,  
      I             myThid )  
   
 #ifdef  ALLOW_GMREDI  
 C--     Calculate iso-neutral slopes for the GM/Redi parameterisation  
         IF (useGMRedi) THEN  
           DO k=1,Nr  
             CALL GMREDI_CALC_TENSOR(  
      I             bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k,  
      I             sigmaX, sigmaY, sigmaR,  
      I             myThid )  
           ENDDO  
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
         ELSE  
           DO k=1, Nr  
             CALL GMREDI_CALC_TENSOR_DUMMY(  
      I             bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k,  
      I             sigmaX, sigmaY, sigmaR,  
      I             myThid )  
           ENDDO  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
         ENDIF  
 #endif  /* ALLOW_GMREDI */  
   
 #ifdef  ALLOW_KPP  
 C--     Compute KPP mixing coefficients  
         IF (useKPP) THEN  
           CALL KPP_CALC(  
      I                  bi, bj, myTime, myThid )  
         ENDIF  
 #endif  /* ALLOW_KPP */  
   
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 CADJ STORE KappaRT(:,:,:)     = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte  
 CADJ STORE KappaRS(:,:,:)     = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte  
 CADJ STORE theta(:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte  
 CADJ STORE salt (:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte  
 CADJ STORE uvel (:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte  
 CADJ STORE vvel (:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
   
 #ifdef ALLOW_AIM  
 C       AIM - atmospheric intermediate model, physics package code.  
 C note(jmc) : phiHyd=0 at this point but is not really used in Molteni Physics  
         IF ( useAIM ) THEN  
          CALL TIMER_START('AIM_DO_ATMOS_PHYS      [DYNAMICS]', myThid)  
          CALL AIM_DO_ATMOS_PHYSICS( phiHyd, myTime, myThid )  
          CALL TIMER_STOP ('AIM_DO_ATMOS_PHYS      [DYNAMICS]', myThid)  
         ENDIF  
 #endif /* ALLOW_AIM */  
   
   
 C--     Start of thermodynamics loop  
         DO k=Nr,1,-1  
   
 C--       km1    Points to level above k (=k-1)  
 C--       kup    Cycles through 1,2 to point to layer above  
 C--       kDown  Cycles through 2,1 to point to current layer  
   
           km1  = MAX(1,k-1)  
           kup  = 1+MOD(k+1,2)  
           kDown= 1+MOD(k,2)  
   
           iMin = 1-OLx+2  
           iMax = sNx+OLx-1  
           jMin = 1-OLy+2  
           jMax = sNy+OLy-1  
   
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 CPatrick Is this formula correct?  
          kkey = (ikey-1)*(Nr-1+1) + (k-1) + 1  
 CADJ STORE rTrans(:,:)       = comlev1_bibj_k, key = kkey, byte = isbyte  
 CADJ STORE KappaRT(:,:,:)    = comlev1_bibj_k, key = kkey, byte = isbyte  
 CADJ STORE KappaRS(:,:,:)    = comlev1_bibj_k, key = kkey, byte = isbyte  
319  #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
320            DO j=1-OLy,sNy+OLy
321  C--      Get temporary terms used by tendency routines           DO i=1-OLx,sNx+OLx
322           CALL CALC_COMMON_FACTORS (            fVerU  (i,j,1) = 0. _d 0
323       I        bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,km1,kup,kDown,            fVerU  (i,j,2) = 0. _d 0
324       O        xA,yA,uTrans,vTrans,rTrans,maskC,maskUp,            fVerV  (i,j,1) = 0. _d 0
325       I        myThid)            fVerV  (i,j,2) = 0. _d 0
326              phiHydF (i,j)  = 0. _d 0
327  #ifdef  INCLUDE_CALC_DIFFUSIVITY_CALL            phiHydC (i,j)  = 0. _d 0
328  C--      Calculate the total vertical diffusivity  #ifndef INCLUDE_PHIHYD_CALCULATION_CODE
329           CALL CALC_DIFFUSIVITY(            dPhiHydX(i,j)  = 0. _d 0
330       I        bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,            dPhiHydY(i,j)  = 0. _d 0
      I        maskC,maskup,  
      O        KappaRT,KappaRS,KappaRU,KappaRV,  
      I        myThid)  
331  #endif  #endif
332              phiSurfX(i,j)  = 0. _d 0
333  C--      Calculate active tracer tendencies (gT,gS,...)            phiSurfY(i,j)  = 0. _d 0
334  C        and step forward storing result in gTnm1, gSnm1, etc.            guDissip(i,j)  = 0. _d 0
335           IF ( tempStepping ) THEN            gvDissip(i,j)  = 0. _d 0
336             CALL CALC_GT(  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC
337       I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax, k,km1,kup,kDown,            phiHydLow(i,j,bi,bj) = 0. _d 0
338       I         xA,yA,uTrans,vTrans,rTrans,maskUp,maskC,  # if (defined NONLIN_FRSURF) && (defined ALLOW_MOM_FLUXFORM)
339       I         KappaRT,  #  ifndef DISABLE_RSTAR_CODE
340       U         fVerT,  #   ifndef ALLOW_AUTODIFF_OPENAD
341       I         myTime, myThid)            dWtransC(i,j,bi,bj) = 0. _d 0
342             CALL TIMESTEP_TRACER(            dWtransU(i,j,bi,bj) = 0. _d 0
343       I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,            dWtransV(i,j,bi,bj) = 0. _d 0
344       I         theta, gT,  #   endif
345       U         gTnm1,  #  endif
346       I         myIter, myThid)  # endif
347           ENDIF  #endif
348           IF ( saltStepping ) THEN           ENDDO
            CALL CALC_GS(  
      I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax, k,km1,kup,kDown,  
      I         xA,yA,uTrans,vTrans,rTrans,maskUp,maskC,  
      I         KappaRS,  
      U         fVerS,  
      I         myTime, myThid)  
            CALL TIMESTEP_TRACER(  
      I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,  
      I         salt, gS,  
      U         gSnm1,  
      I         myIter, myThid)  
          ENDIF  
   
 #ifdef   ALLOW_OBCS  
 C--      Apply open boundary conditions  
          IF (useOBCS) THEN  
            CALL OBCS_APPLY_TS( bi, bj, k, gTnm1, gSnm1, myThid )  
          END IF  
 #endif   /* ALLOW_OBCS */  
   
 C--      Freeze water  
          IF (allowFreezing) THEN  
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 CADJ STORE gTNm1(:,:,k,bi,bj) = comlev1_bibj_k  
 CADJ &   , key = kkey, byte = isbyte  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
             CALL FREEZE( bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k, myThid )  
          END IF  
   
 C--     end of thermodynamic k loop (Nr:1)  
349          ENDDO          ENDDO
350    
351    C--     Start computation of dynamics
352            iMin = 0
353            iMax = sNx+1
354            jMin = 0
355            jMax = sNy+1
356    
357  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC
358  CPatrick? What about this one?  CADJ STORE wVel (:,:,:,bi,bj) =
359             maximpl = 6  CADJ &     comlev1_bibj, key=idynkey, byte=isbyte
            iikey = (ikey-1)*maximpl  
360  #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
361    
362  C--     Implicit diffusion  C--     Explicit part of the Surface Potential Gradient (add in TIMESTEP)
363          IF (implicitDiffusion) THEN  C       (note: this loop will be replaced by CALL CALC_GRAD_ETA)
364            IF (implicSurfPress.NE.1.) THEN
365           IF (tempStepping) THEN            CALL CALC_GRAD_PHI_SURF(
366  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC       I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,
367              idkey = iikey + 1       I         etaN,
368  #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */       O         phiSurfX,phiSurfY,
             CALL IMPLDIFF(  
      I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,  
      I         deltaTtracer, KappaRT, recip_HFacC,  
      U         gTNm1,  
369       I         myThid )       I         myThid )
370           ENDIF          ENDIF
371    
          IF (saltStepping) THEN  
372  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC
373           idkey = iikey + 2  CADJ STORE uVel (:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj, key=idynkey, byte=isbyte
374    CADJ STORE vVel (:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj, key=idynkey, byte=isbyte
375    #ifdef ALLOW_KPP
376    CADJ STORE KPPviscAz (:,:,:,bi,bj)
377    CADJ &                 = comlev1_bibj, key=idynkey, byte=isbyte
378    #endif /* ALLOW_KPP */
379  #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
             CALL IMPLDIFF(  
      I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,  
      I         deltaTtracer, KappaRS, recip_HFacC,  
      U         gSNm1,  
      I         myThid )  
          ENDIF  
380    
381  #ifdef   ALLOW_OBCS  #if (defined INCLUDE_CALC_DIFFUSIVITY_CALL) && !(defined ALLOW_AUTODIFF)
382  C--      Apply open boundary conditions          IF ( .NOT.momViscosity ) THEN
383           IF (useOBCS) THEN  #endif /* INCLUDE_CALC_DIFFUSIVITY_CALL and not ALLOW_AUTODIFF */
384             DO K=1,Nr            DO k=1,Nr
385               CALL OBCS_APPLY_TS( bi, bj, k, gTnm1, gSnm1, myThid )             DO j=1-OLy,sNy+OLy
386                DO i=1-OLx,sNx+OLx
387                 KappaRU(i,j,k) = 0. _d 0
388                 KappaRV(i,j,k) = 0. _d 0
389                ENDDO
390             ENDDO             ENDDO
391           END IF            ENDDO
392  #endif   /* ALLOW_OBCS */  #ifdef INCLUDE_CALC_DIFFUSIVITY_CALL
393    C--     Calculate the total vertical viscosity
394  C--     End If implicitDiffusion  #ifdef ALLOW_AUTODIFF
395            IF ( momViscosity ) THEN
396    #else
397            ELSE
398    #endif
399              CALL CALC_VISCOSITY(
400         I            bi,bj, iMin,iMax,jMin,jMax,
401         O            KappaRU, KappaRV,
402         I            myThid )
403          ENDIF          ENDIF
404    #endif /* INCLUDE_CALC_DIFFUSIVITY_CALL */
405    
406  C--     Start computation of dynamics  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC
407          iMin = 1-OLx+2  CADJ STORE KappaRU(:,:,:)
408          iMax = sNx+OLx-1  CADJ &     = comlev1_bibj, key=idynkey, byte=isbyte
409          jMin = 1-OLy+2  CADJ STORE KappaRV(:,:,:)
410          jMax = sNy+OLy-1  CADJ &     = comlev1_bibj, key=idynkey, byte=isbyte
411    #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
412  C--     Explicit part of the Surface Potentiel Gradient (add in TIMESTEP)  
413  C       (note: this loop will be replaced by CALL CALC_GRAD_ETA)  #ifdef ALLOW_OBCS
414          IF (implicSurfPress.NE.1.) THEN  C--   For Stevens boundary conditions velocities need to be extrapolated
415            CALL CALC_GRAD_PHI_SURF(  C     (copied) to a narrow strip outside the domain
416       I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,          IF ( useOBCS ) THEN
417       I         etaN,            CALL OBCS_COPY_UV_N(
418       O         phiSurfX,phiSurfY,       U         uVel(1-OLx,1-OLy,1,bi,bj),
419       I         myThid )                               U         vVel(1-OLx,1-OLy,1,bi,bj),
420         I         Nr, bi, bj, myThid )
421          ENDIF          ENDIF
422    #endif /* ALLOW_OBCS */
423    
424    #ifdef ALLOW_EDDYPSI
425            CALL CALC_EDDY_STRESS(bi,bj,myThid)
426    #endif
427    
428  C--     Start of dynamics loop  C--     Start of dynamics loop
429          DO k=1,Nr          DO k=1,Nr
# Line 549  C--       kup    Cycles through 1,2 to p Line 433  C--       kup    Cycles through 1,2 to p
433  C--       kDown  Cycles through 2,1 to point to current layer  C--       kDown  Cycles through 2,1 to point to current layer
434    
435            km1  = MAX(1,k-1)            km1  = MAX(1,k-1)
436              kp1  = MIN(k+1,Nr)
437            kup  = 1+MOD(k+1,2)            kup  = 1+MOD(k+1,2)
438            kDown= 1+MOD(k,2)            kDown= 1+MOD(k,2)
439    
440  C--      Integrate hydrostatic balance for phiHyd with BC of  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC
441  C        phiHyd(z=0)=0           kkey = (idynkey-1)*Nr + k
442  C        distinguishe between Stagger and Non Stagger time stepping  c
443           IF (staggerTimeStep) THEN  CADJ STORE totPhiHyd (:,:,k,bi,bj)
444    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
445    CADJ STORE phiHydLow (:,:,bi,bj)
446    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
447    CADJ STORE theta (:,:,k,bi,bj)
448    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
449    CADJ STORE salt  (:,:,k,bi,bj)
450    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
451    CADJ STORE gT(:,:,k,bi,bj)
452    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
453    CADJ STORE gS(:,:,k,bi,bj)
454    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
455    # ifdef NONLIN_FRSURF
456    cph-test
457    CADJ STORE  phiHydC (:,:)
458    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
459    CADJ STORE  phiHydF (:,:)
460    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
461    CADJ STORE  guDissip (:,:)
462    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
463    CADJ STORE  gvDissip (:,:)
464    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
465    CADJ STORE  fVerU (:,:,:)
466    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
467    CADJ STORE  fVerV (:,:,:)
468    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
469    CADJ STORE gU(:,:,k,bi,bj)
470    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
471    CADJ STORE gV(:,:,k,bi,bj)
472    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
473    #  ifndef ALLOW_ADAMSBASHFORTH_3
474    CADJ STORE guNm1(:,:,k,bi,bj)
475    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
476    CADJ STORE gvNm1(:,:,k,bi,bj)
477    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
478    #  else
479    CADJ STORE guNm(:,:,k,bi,bj,1)
480    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
481    CADJ STORE guNm(:,:,k,bi,bj,2)
482    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
483    CADJ STORE gvNm(:,:,k,bi,bj,1)
484    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
485    CADJ STORE gvNm(:,:,k,bi,bj,2)
486    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
487    #  endif
488    #  ifdef ALLOW_CD_CODE
489    CADJ STORE uNM1(:,:,k,bi,bj)
490    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
491    CADJ STORE vNM1(:,:,k,bi,bj)
492    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
493    CADJ STORE uVelD(:,:,k,bi,bj)
494    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
495    CADJ STORE vVelD(:,:,k,bi,bj)
496    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
497    #  endif
498    # endif
499    # ifdef ALLOW_DEPTH_CONTROL
500    CADJ STORE  fVerU (:,:,:)
501    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
502    CADJ STORE  fVerV (:,:,:)
503    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
504    # endif
505    #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
506    
507    C--      Integrate hydrostatic balance for phiHyd with BC of phiHyd(z=0)=0
508             IF ( implicitIntGravWave ) THEN
509             CALL CALC_PHI_HYD(             CALL CALC_PHI_HYD(
510       I        bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,       I        bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,
511       I        gTnm1, gSnm1,       I        gT, gS,
512       U        phiHyd,       U        phiHydF,
513       I        myThid )       O        phiHydC, dPhiHydX, dPhiHydY,
514         I        myTime, myIter, myThid )
515           ELSE           ELSE
516             CALL CALC_PHI_HYD(             CALL CALC_PHI_HYD(
517       I        bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,       I        bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,
518       I        theta, salt,       I        theta, salt,
519       U        phiHyd,       U        phiHydF,
520       I        myThid )       O        phiHydC, dPhiHydX, dPhiHydY,
521         I        myTime, myIter, myThid )
522             ENDIF
523    #ifdef ALLOW_DIAGNOSTICS
524             IF ( dPhiHydDiagIsOn ) THEN
525               tmpFac = -1. _d 0
526               CALL DIAGNOSTICS_SCALE_FILL( dPhiHydX, tmpFac, 1,
527         &                           'Um_dPHdx', k, 1, 2, bi, bj, myThid )
528               CALL DIAGNOSTICS_SCALE_FILL( dPhiHydY, tmpFac, 1,
529         &                           'Vm_dPHdy', k, 1, 2, bi, bj, myThid )
530           ENDIF           ENDIF
531    #endif /* ALLOW_DIAGNOSTICS */
532    
533  C--      Calculate accelerations in the momentum equations (gU, gV, ...)  C--      Calculate accelerations in the momentum equations (gU, gV, ...)
534  C        and step forward storing the result in gUnm1, gVnm1, etc...  C        and step forward storing the result in gU, gV, etc...
535           IF ( momStepping ) THEN           IF ( momStepping ) THEN
536             CALL CALC_MOM_RHS(  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC
537       I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,kup,kDown,  # ifdef NONLIN_FRSURF
538       I         phiHyd,KappaRU,KappaRV,  #  if (defined ALLOW_MOM_FLUXFORM) && !(defined DISABLE_RSTAR_CODE)
539       U         fVerU, fVerV,  CADJ STORE dWtransC(:,:,bi,bj)
540       I         myTime, myThid)  CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
541    CADJ STORE dWtransU(:,:,bi,bj)
542    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
543    CADJ STORE dWtransV(:,:,bi,bj)
544    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
545    #  endif
546    CADJ STORE fVerU(:,:,:)
547    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
548    CADJ STORE fVerV(:,:,:)
549    CADJ &     = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
550    # endif /* NONLIN_FRSURF */
551    #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
552               IF (.NOT. vectorInvariantMomentum) THEN
553    #ifdef ALLOW_MOM_FLUXFORM
554                  CALL MOM_FLUXFORM(
555         I         bi,bj,k,iMin,iMax,jMin,jMax,
556         I         KappaRU, KappaRV,
557         U         fVerU(1-OLx,1-OLy,kUp),   fVerV(1-OLx,1-OLy,kUp),
558         O         fVerU(1-OLx,1-OLy,kDown), fVerV(1-OLx,1-OLy,kDown),
559         O         guDissip, gvDissip,
560         I         myTime, myIter, myThid)
561    #endif
562               ELSE
563    #ifdef ALLOW_MOM_VECINV
564                 CALL MOM_VECINV(
565         I         bi,bj,k,iMin,iMax,jMin,jMax,
566         I         KappaRU, KappaRV,
567         I         fVerU(1-OLx,1-OLy,kUp),   fVerV(1-OLx,1-OLy,kUp),
568         O         fVerU(1-OLx,1-OLy,kDown), fVerV(1-OLx,1-OLy,kDown),
569         O         guDissip, gvDissip,
570         I         myTime, myIter, myThid)
571    #endif
572               ENDIF
573    
574             CALL TIMESTEP(             CALL TIMESTEP(
575       I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,       I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,
576       I         phiHyd, phiSurfX, phiSurfY,       I         dPhiHydX,dPhiHydY, phiSurfX, phiSurfY,
577       I         myIter, myThid)       I         guDissip, gvDissip,
578         I         myTime, myIter, myThid)
579    
 #ifdef   ALLOW_OBCS  
 C--      Apply open boundary conditions  
          IF (useOBCS) THEN  
            CALL OBCS_APPLY_UV( bi, bj, k, gUnm1, gVnm1, myThid )  
          END IF  
 #endif   /* ALLOW_OBCS */  
   
 #ifdef   ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 #ifdef   INCLUDE_CD_CODE  
          ELSE  
            DO j=1-OLy,sNy+OLy  
              DO i=1-OLx,sNx+OLx  
                guCD(i,j,k,bi,bj) = 0.0  
                gvCD(i,j,k,bi,bj) = 0.0  
              END DO  
            END DO  
 #endif   /* INCLUDE_CD_CODE */  
 #endif   /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
580           ENDIF           ENDIF
581    
   
582  C--     end of dynamics k loop (1:Nr)  C--     end of dynamics k loop (1:Nr)
583          ENDDO          ENDDO
584    
585    C--     Implicit Vertical advection & viscosity
586    #if (defined (INCLUDE_IMPLVERTADV_CODE) && \
587  C--     Implicit viscosity       defined (ALLOW_MOM_COMMON) && !(defined ALLOW_AUTODIFF_TAMC))
588          IF (implicitViscosity.AND.momStepping) THEN          IF ( momImplVertAdv ) THEN
589              CALL MOM_U_IMPLICIT_R( kappaRU,
590         I                           bi, bj, myTime, myIter, myThid )
591              CALL MOM_V_IMPLICIT_R( kappaRV,
592         I                           bi, bj, myTime, myIter, myThid )
593            ELSEIF ( implicitViscosity ) THEN
594    #else /* INCLUDE_IMPLVERTADV_CODE */
595            IF     ( implicitViscosity ) THEN
596    #endif /* INCLUDE_IMPLVERTADV_CODE */
597  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC
598            idkey = iikey + 3  CADJ STORE KappaRU(:,:,:) = comlev1_bibj , key=idynkey, byte=isbyte
599    CADJ STORE gU(:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj , key=idynkey, byte=isbyte
600  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
601            CALL IMPLDIFF(            CALL IMPLDIFF(
602       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,
603       I         deltaTmom, KappaRU,recip_HFacW,       I         -1, KappaRU, recip_hFacW(1-OLx,1-OLy,1,bi,bj),
604       U         gUNm1,       U         gU,
605       I         myThid )       I         myThid )
606  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC
607            idkey = iikey + 4  CADJ STORE KappaRV(:,:,:) = comlev1_bibj , key=idynkey, byte=isbyte
608    CADJ STORE gV(:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj , key=idynkey, byte=isbyte
609  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
610            CALL IMPLDIFF(            CALL IMPLDIFF(
611       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,
612       I         deltaTmom, KappaRV,recip_HFacS,       I         -2, KappaRV, recip_hFacS(1-OLx,1-OLy,1,bi,bj),
613       U         gVNm1,       U         gV,
614       I         myThid )       I         myThid )
615            ENDIF
616    
617  #ifdef   ALLOW_OBCS  #ifdef ALLOW_OBCS
618  C--      Apply open boundary conditions  C--      Apply open boundary conditions
619           IF (useOBCS) THEN          IF ( useOBCS ) THEN
620             DO K=1,Nr  C--      but first save intermediate velocities to be used in the
621               CALL OBCS_APPLY_UV( bi, bj, k, gUnm1, gVnm1, myThid )  C        next time step for the Stevens boundary conditions
622             ENDDO            CALL OBCS_SAVE_UV_N(
623           END IF       I        bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, 0,
624  #endif   /* ALLOW_OBCS */       I        gU, gV, myThid )
625              CALL OBCS_APPLY_UV( bi, bj, 0, gU, gV, myThid )
626            ENDIF
627    #endif /* ALLOW_OBCS */
628    
629  #ifdef    INCLUDE_CD_CODE  #ifdef    ALLOW_CD_CODE
630            IF (implicitViscosity.AND.useCDscheme) THEN
631  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC
632            idkey = iikey + 5  CADJ STORE vVelD(:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj , key=idynkey, byte=isbyte
633  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
634            CALL IMPLDIFF(            CALL IMPLDIFF(
635       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,
636       I         deltaTmom, KappaRU,recip_HFacW,       I         0, KappaRU, recip_hFacW(1-OLx,1-OLy,1,bi,bj),
637       U         vVelD,       U         vVelD,
638       I         myThid )       I         myThid )
639  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC
640            idkey = iikey + 6  CADJ STORE uVelD(:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj , key=idynkey, byte=isbyte
641  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
642            CALL IMPLDIFF(            CALL IMPLDIFF(
643       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,
644       I         deltaTmom, KappaRV,recip_HFacS,       I         0, KappaRV, recip_hFacS(1-OLx,1-OLy,1,bi,bj),
645       U         uVelD,       U         uVelD,
646       I         myThid )       I         myThid )
 #endif    /* INCLUDE_CD_CODE */  
 C--     End If implicitViscosity.AND.momStepping  
647          ENDIF          ENDIF
648    #endif    /* ALLOW_CD_CODE */
649  Cjmc : add for phiHyd output <- but not working if multi tile per CPU  C--     End implicit Vertical advection & viscosity
650  c       IF ( DIFFERENT_MULTIPLE(dumpFreq,myTime+deltaTClock,myTime)  
651  c    &  .AND. buoyancyRelation .eq. 'ATMOSPHERIC' ) THEN  C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
652  c         WRITE(suff,'(I10.10)') myIter+1  
653  c         CALL WRITE_FLD_XYZ_RL('PH.',suff,phiHyd,myIter+1,myThid)  #ifdef ALLOW_NONHYDROSTATIC
654  c       ENDIF  C--   Step forward W field in N-H algorithm
655  Cjmc(end)          IF ( nonHydrostatic ) THEN
656    #ifdef ALLOW_DEBUG
657  #ifdef ALLOW_TIMEAVE           IF (debugMode) CALL DEBUG_CALL('CALC_GW', myThid )
658          IF (taveFreq.GT.0.) THEN  #endif
659            CALL TIMEAVE_CUMULATE(phiHydtave, phiHyd, Nr,           CALL TIMER_START('CALC_GW          [DYNAMICS]',myThid)
660       I                              deltaTclock, bi, bj, myThid)           CALL CALC_GW(
661            IF (ivdc_kappa.NE.0.) THEN       I                 bi,bj, KappaRU, KappaRV,
662              CALL TIMEAVE_CUMULATE(ConvectCountTave, ConvectCount, Nr,       I                 myTime, myIter, myThid )
      I                              deltaTclock, bi, bj, myThid)  
           ENDIF  
663          ENDIF          ENDIF
664  #endif /* ALLOW_TIMEAVE */          IF ( nonHydrostatic.OR.implicitIntGravWave )
665         &   CALL TIMESTEP_WVEL( bi,bj, myTime, myIter, myThid )
666            IF ( nonHydrostatic )
667         &   CALL TIMER_STOP ('CALC_GW          [DYNAMICS]',myThid)
668    #endif
669    
670    C---+----1----+----2----+----3----+----4----+----5----+----6----+----7-|--+----|
671    
672    C-    end of bi,bj loops
673         ENDDO         ENDDO
674        ENDDO        ENDDO
675    
676    #ifdef ALLOW_OBCS
677          IF (useOBCS) THEN
678            CALL OBCS_EXCHANGES( myThid )
679          ENDIF
680    #endif
681    
682    Cml(
683    C     In order to compare the variance of phiHydLow of a p/z-coordinate
684    C     run with etaH of a z/p-coordinate run the drift of phiHydLow
685    C     has to be removed by something like the following subroutine:
686    C      CALL REMOVE_MEAN_RL( 1, phiHydLow, maskInC, maskInC, rA, drF,
687    C     &                     'phiHydLow', myTime, myThid )
688    Cml)
689    
690    #ifdef ALLOW_DIAGNOSTICS
691          IF ( useDiagnostics ) THEN
692    
693           CALL DIAGNOSTICS_FILL(totPhihyd,'PHIHYD  ',0,Nr,0,1,1,myThid)
694           CALL DIAGNOSTICS_FILL(phiHydLow,'PHIBOT  ',0, 1,0,1,1,myThid)
695    
696           tmpFac = 1. _d 0
697           CALL DIAGNOSTICS_SCALE_FILL(totPhihyd,tmpFac,2,
698         &                                 'PHIHYDSQ',0,Nr,0,1,1,myThid)
699    
700           CALL DIAGNOSTICS_SCALE_FILL(phiHydLow,tmpFac,2,
701         &                                 'PHIBOTSQ',0, 1,0,1,1,myThid)
702    
703          ENDIF
704    #endif /* ALLOW_DIAGNOSTICS */
705    
706    #ifdef ALLOW_DEBUG
707          IF ( debugLevel .GE. debLevD ) THEN
708           CALL DEBUG_STATS_RL(1,EtaN,'EtaN (DYNAMICS)',myThid)
709           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,uVel,'Uvel (DYNAMICS)',myThid)
710           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,vVel,'Vvel (DYNAMICS)',myThid)
711           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,wVel,'Wvel (DYNAMICS)',myThid)
712           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,theta,'Theta (DYNAMICS)',myThid)
713           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,salt,'Salt (DYNAMICS)',myThid)
714           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,gU,'Gu (DYNAMICS)',myThid)
715           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,gV,'Gv (DYNAMICS)',myThid)
716           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,gT,'Gt (DYNAMICS)',myThid)
717           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,gS,'Gs (DYNAMICS)',myThid)
718    #ifndef ALLOW_ADAMSBASHFORTH_3
719           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,guNm1,'GuNm1 (DYNAMICS)',myThid)
720           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,gvNm1,'GvNm1 (DYNAMICS)',myThid)
721           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,gtNm1,'GtNm1 (DYNAMICS)',myThid)
722           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,gsNm1,'GsNm1 (DYNAMICS)',myThid)
723    #endif
724          ENDIF
725    #endif
726    
727    #ifdef DYNAMICS_GUGV_EXCH_CHECK
728    C- jmc: For safety checking only: This Exchange here should not change
729    C       the solution. If solution changes, it means something is wrong,
730    C       but it does not mean that it is less wrong with this exchange.
731          IF ( debugLevel .GE. debLevE ) THEN
732           CALL EXCH_UV_XYZ_RL(gU,gV,.TRUE.,myThid)
733          ENDIF
734    #endif
735    
736    #ifdef ALLOW_DEBUG
737          IF (debugMode) CALL DEBUG_LEAVE( 'DYNAMICS', myThid )
738    #endif
739    
740        RETURN        RETURN
741        END        END
Legend:
Removed from v.1.65  
changed lines
  Added in v.1.166
  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.22