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revision 1.62 by jmc, Wed Feb 14 22:51:27 2001 UTC revision 1.75 by adcroft, Fri Aug 3 19:06:11 2001 UTC
# Line 26  C     \================================= Line 26  C     \=================================
26  C     == Global variables ===  C     == Global variables ===
27  #include "SIZE.h"  #include "SIZE.h"
28  #include "EEPARAMS.h"  #include "EEPARAMS.h"
 #include "CG2D.h"  
29  #include "PARAMS.h"  #include "PARAMS.h"
30  #include "DYNVARS.h"  #include "DYNVARS.h"
31  #include "GRID.h"  #include "GRID.h"
32    #ifdef ALLOW_PASSIVE_TRACER
33    #include "TR1.h"
34    #endif
35    
36  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC
37  # include "tamc.h"  # include "tamc.h"
38  # include "tamc_keys.h"  # include "tamc_keys.h"
39    # include "FFIELDS.h"
40    # ifdef ALLOW_KPP
41    #  include "KPP.h"
42    # endif
43    # ifdef ALLOW_GMREDI
44    #  include "GMREDI.h"
45    # endif
46  #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
47    
48  #ifdef ALLOW_KPP  #ifdef ALLOW_TIMEAVE
49  # include "KPP.h"  #include "TIMEAVE_STATV.h"
 #endif  
   
 #ifdef INCLUDE_DIAGNOSTICS_INTERFACE_CODE  
 #include "AVER.h"  
50  #endif  #endif
51    
52  C     == Routine arguments ==  C     == Routine arguments ==
# Line 59  C                              transport Line 64  C                              transport
64  C                              o uTrans: Zonal transport  C                              o uTrans: Zonal transport
65  C                              o vTrans: Meridional transport  C                              o vTrans: Meridional transport
66  C                              o rTrans: Vertical transport  C                              o rTrans: Vertical transport
67  C     maskC,maskUp             o maskC: land/water mask for tracer cells  C     maskUp                   o maskUp: land/water mask for W points
 C                              o maskUp: land/water mask for W points  
68  C     fVer[STUV]               o fVer: Vertical flux term - note fVer  C     fVer[STUV]               o fVer: Vertical flux term - note fVer
69  C                                      is "pipelined" in the vertical  C                                      is "pipelined" in the vertical
70  C                                      so we need an fVer for each  C                                      so we need an fVer for each
# Line 68  C                                      v Line 72  C                                      v
72  C     rhoK, rhoKM1   - Density at current level, and level above  C     rhoK, rhoKM1   - Density at current level, and level above
73  C     phiHyd         - Hydrostatic part of the potential phiHydi.  C     phiHyd         - Hydrostatic part of the potential phiHydi.
74  C                      In z coords phiHydiHyd is the hydrostatic  C                      In z coords phiHydiHyd is the hydrostatic
75  C                      pressure anomaly  C                      Potential (=pressure/rho0) anomaly
76  C                      In p coords phiHydiHyd is the geopotential  C                      In p coords phiHydiHyd is the geopotential
77  C                      surface height  C                      surface height anomaly.
78  C                      anomaly.  C     phiSurfX, - gradient of Surface potentiel (Pressure/rho, ocean)
79  C     etaSurfX,      - Holds surface elevation gradient in X and Y.  C     phiSurfY             or geopotentiel (atmos) in X and Y direction
 C     etaSurfY  
80  C     KappaRT,       - Total diffusion in vertical for T and S.  C     KappaRT,       - Total diffusion in vertical for T and S.
81  C     KappaRS          (background + spatially varying, isopycnal term).  C     KappaRS          (background + spatially varying, isopycnal term).
82  C     iMin, iMax     - Ranges and sub-block indices on which calculations  C     iMin, iMax     - Ranges and sub-block indices on which calculations
# Line 82  C     bi, bj Line 85  C     bi, bj
85  C     k, kup,        - Index for layer above and below. kup and kDown  C     k, kup,        - Index for layer above and below. kup and kDown
86  C     kDown, km1       are switched with layer to be the appropriate  C     kDown, km1       are switched with layer to be the appropriate
87  C                      index into fVerTerm.  C                      index into fVerTerm.
88    C     tauAB - Adams-Bashforth timestepping weight: 0=forward ; 1/2=Adams-Bashf.
89        _RS xA      (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)        _RS xA      (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
90        _RS yA      (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)        _RS yA      (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
91        _RL uTrans  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)        _RL uTrans  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
92        _RL vTrans  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)        _RL vTrans  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
93        _RL rTrans  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)        _RL rTrans  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
       _RS maskC   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)  
94        _RS maskUp  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)        _RS maskUp  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
95        _RL fVerT   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)        _RL fVerT   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)
96        _RL fVerS   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)        _RL fVerS   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)
97          _RL fVerTr1 (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)
98        _RL fVerU   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)        _RL fVerU   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)
99        _RL fVerV   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)        _RL fVerV   (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,2)
100        _RL phiHyd  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)        _RL phiHyd  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)
101        _RL rhokm1  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)        _RL rhokm1  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
102        _RL rhok    (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)        _RL rhok    (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
103          _RL phiSurfX(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
104          _RL phiSurfY(1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy)
105        _RL KappaRT (1-Olx:sNx+Olx,1-Oly:sNy+Oly,Nr)        _RL KappaRT (1-Olx:sNx+Olx,1-Oly:sNy+Oly,Nr)
106        _RL KappaRS (1-Olx:sNx+Olx,1-Oly:sNy+Oly,Nr)        _RL KappaRS (1-Olx:sNx+Olx,1-Oly:sNy+Oly,Nr)
107        _RL KappaRU (1-Olx:sNx+Olx,1-Oly:sNy+Oly,Nr)        _RL KappaRU (1-Olx:sNx+Olx,1-Oly:sNy+Oly,Nr)
# Line 103  C                      index into fVerTe Line 109  C                      index into fVerTe
109        _RL sigmaX  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)        _RL sigmaX  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)
110        _RL sigmaY  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)        _RL sigmaY  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)
111        _RL sigmaR  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)        _RL sigmaR  (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)
112          _RL tauAB
113    
114  C This is currently used by IVDC and Diagnostics  C This is currently used by IVDC and Diagnostics
115        _RL ConvectCount (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)        _RL ConvectCount (1-OLx:sNx+OLx,1-OLy:sNy+OLy,Nr)
# Line 119  c     LOGICAL  DIFFERENT_MULTIPLE Line 126  c     LOGICAL  DIFFERENT_MULTIPLE
126  c     EXTERNAL DIFFERENT_MULTIPLE  c     EXTERNAL DIFFERENT_MULTIPLE
127  Cjmc(end)  Cjmc(end)
128    
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
       INTEGER    isbyte  
       PARAMETER( isbyte = 4 )  
   
       INTEGER act1, act2, act3, act4  
       INTEGER max1, max2, max3  
       INTEGER iikey, kkey  
       INTEGER maximpl  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
   
129  C---    The algorithm...  C---    The algorithm...
130  C  C
131  C       "Correction Step"  C       "Correction Step"
# Line 173  C         (1 + dt * K * d_zz) theta[n] = Line 170  C         (1 + dt * K * d_zz) theta[n] =
170  C         (1 + dt * K * d_zz) salt[n] = salt*  C         (1 + dt * K * d_zz) salt[n] = salt*
171  C---  C---
172    
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 C--   dummy statement to end declaration part  
       ikey = 1  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
   
 C--   Set up work arrays with valid (i.e. not NaN) values  
 C     These inital values do not alter the numerical results. They  
 C     just ensure that all memory references are to valid floating  
 C     point numbers. This prevents spurious hardware signals due to  
 C     uninitialised but inert locations.  
       DO j=1-OLy,sNy+OLy  
        DO i=1-OLx,sNx+OLx  
         xA(i,j)      = 0. _d 0  
         yA(i,j)      = 0. _d 0  
         uTrans(i,j)  = 0. _d 0  
         vTrans(i,j)  = 0. _d 0  
         DO k=1,Nr  
          phiHyd(i,j,k)  = 0. _d 0  
          KappaRU(i,j,k) = 0. _d 0  
          KappaRV(i,j,k) = 0. _d 0  
          sigmaX(i,j,k) = 0. _d 0  
          sigmaY(i,j,k) = 0. _d 0  
          sigmaR(i,j,k) = 0. _d 0  
         ENDDO  
         rhoKM1 (i,j) = 0. _d 0  
         rhok   (i,j) = 0. _d 0  
         maskC  (i,j) = 0. _d 0  
        ENDDO  
       ENDDO  
   
   
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 C--   HPF directive to help TAMC  
 CHPF$ INDEPENDENT  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
   
173        DO bj=myByLo(myThid),myByHi(myThid)        DO bj=myByLo(myThid),myByHi(myThid)
   
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 C--    HPF directive to help TAMC  
 CHPF$  INDEPENDENT, NEW (rTrans,fVerT,fVerS,fVerU,fVerV  
 CHPF$&                  ,phiHyd,utrans,vtrans,maskc,xA,yA  
 CHPF$&                  ,KappaRT,KappaRS,KappaRU,KappaRV  
 CHPF$&                  )  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
   
174         DO bi=myBxLo(myThid),myBxHi(myThid)         DO bi=myBxLo(myThid),myBxHi(myThid)
175    Ccs-
176    
177  #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  C--     Start computation of dynamics
178            act1 = bi - myBxLo(myThid)          iMin = 1-OLx+2
179            max1 = myBxHi(myThid) - myBxLo(myThid) + 1          iMax = sNx+OLx-1
180            jMin = 1-OLy+2
181            act2 = bj - myByLo(myThid)          jMax = sNy+OLy-1
182            max2 = myByHi(myThid) - myByLo(myThid) + 1  
183    C--     Explicit part of the Surface Potentiel Gradient (add in TIMESTEP)
184            act3 = myThid - 1  C       (note: this loop will be replaced by CALL CALC_GRAD_ETA)
185            max3 = nTx*nTy          IF (implicSurfPress.NE.1.) THEN
186              CALL CALC_GRAD_PHI_SURF(
187            act4 = ikey_dynamics - 1       I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,
188         I         etaN,
189            ikey = (act1 + 1) + act2*max1       O         phiSurfX,phiSurfY,
190       &                      + act3*max1*max2       I         myThid )                        
      &                      + act4*max1*max2*max3  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
   
 C--     Set up work arrays that need valid initial values  
         DO j=1-OLy,sNy+OLy  
          DO i=1-OLx,sNx+OLx  
           rTrans(i,j)   = 0. _d 0  
           fVerT (i,j,1) = 0. _d 0  
           fVerT (i,j,2) = 0. _d 0  
           fVerS (i,j,1) = 0. _d 0  
           fVerS (i,j,2) = 0. _d 0  
           fVerU (i,j,1) = 0. _d 0  
           fVerU (i,j,2) = 0. _d 0  
           fVerV (i,j,1) = 0. _d 0  
           fVerV (i,j,2) = 0. _d 0  
          ENDDO  
         ENDDO  
   
         DO k=1,Nr  
          DO j=1-OLy,sNy+OLy  
           DO i=1-OLx,sNx+OLx  
 C This is currently also used by IVDC and Diagnostics  
            ConvectCount(i,j,k) = 0.  
            KappaRT(i,j,k) = 0. _d 0  
            KappaRS(i,j,k) = 0. _d 0  
           ENDDO  
          ENDDO  
         ENDDO  
   
         iMin = 1-OLx+1  
         iMax = sNx+OLx  
         jMin = 1-OLy+1  
         jMax = sNy+OLy  
   
   
 C--     Start of diagnostic loop  
         DO k=Nr,1,-1  
   
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 C? Patrick, is this formula correct now that we change the loop range?  
 C? Do we still need this?  
          kkey = (ikey-1)*(Nr-2+1) + (k-2) + 1  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
   
 C--       Integrate continuity vertically for vertical velocity  
           CALL INTEGRATE_FOR_W(  
      I                         bi, bj, k, uVel, vVel,  
      O                         wVel,  
      I                         myThid )  
   
 #ifdef    ALLOW_OBCS  
 #ifdef    ALLOW_NONHYDROSTATIC  
 C--       Apply OBC to W if in N-H mode  
           IF (useOBCS.AND.nonHydrostatic) THEN  
             CALL OBCS_APPLY_W( bi, bj, k, wVel, myThid )  
           ENDIF  
 #endif    /* ALLOW_NONHYDROSTATIC */  
 #endif    /* ALLOW_OBCS */  
   
 C--       Calculate gradients of potential density for isoneutral  
 C         slope terms (e.g. GM/Redi tensor or IVDC diffusivity)  
 c         IF ( k.GT.1 .AND. (useGMRedi.OR.ivdc_kappa.NE.0.) ) THEN  
           IF ( useGMRedi .OR. (k.GT.1 .AND. ivdc_kappa.NE.0.) ) THEN  
             CALL FIND_RHO(  
      I        bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k, k, eosType,  
      I        theta, salt,  
      O        rhoK,  
      I        myThid )  
             IF (k.GT.1) CALL FIND_RHO(  
      I        bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k-1, k, eosType,  
      I        theta, salt,  
      O        rhoKm1,  
      I        myThid )  
             CALL GRAD_SIGMA(  
      I             bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k,  
      I             rhoK, rhoKm1, rhoK,  
      O             sigmaX, sigmaY, sigmaR,  
      I             myThid )  
           ENDIF  
   
 C--       Implicit Vertical Diffusion for Convection  
 c ==> should use sigmaR !!!  
           IF (k.GT.1 .AND. ivdc_kappa.NE.0.) THEN  
             CALL CALC_IVDC(  
      I        bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k,  
      I        rhoKm1, rhoK,  
      U        ConvectCount, KappaRT, KappaRS,  
      I        myTime, myIter, myThid)  
           ENDIF  
   
 C--     end of diagnostic k loop (Nr:1)  
         ENDDO  
   
 #ifdef  ALLOW_OBCS  
 C--     Calculate future values on open boundaries  
         IF (useOBCS) THEN  
           CALL OBCS_CALC( bi, bj, myTime+deltaT,  
      I            uVel, vVel, wVel, theta, salt,  
      I            myThid )  
         ENDIF  
 #endif  /* ALLOW_OBCS */  
   
 C--     Determines forcing terms based on external fields  
 C       relaxation terms, etc.  
         CALL EXTERNAL_FORCING_SURF(  
      I             bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,  
      I             myThid )  
   
 #ifdef  ALLOW_GMREDI  
 C--     Calculate iso-neutral slopes for the GM/Redi parameterisation  
         IF (useGMRedi) THEN  
           DO k=1,Nr  
             CALL GMREDI_CALC_TENSOR(  
      I             bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k,  
      I             sigmaX, sigmaY, sigmaR,  
      I             myThid )  
           ENDDO  
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
         ELSE  
           DO k=1, Nr  
             CALL GMREDI_CALC_TENSOR_DUMMY(  
      I             bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k,  
      I             sigmaX, sigmaY, sigmaR,  
      I             myThid )  
           ENDDO  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
191          ENDIF          ENDIF
 #endif  /* ALLOW_GMREDI */  
   
 #ifdef  ALLOW_KPP  
 C--     Compute KPP mixing coefficients  
         IF (useKPP) THEN  
           CALL KPP_CALC(  
      I                  bi, bj, myTime, myThid )  
         ENDIF  
 #endif  /* ALLOW_KPP */  
   
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 CADJ STORE KappaRT(:,:,:)     = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte  
 CADJ STORE KappaRS(:,:,:)     = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte  
 CADJ STORE theta(:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte  
 CADJ STORE salt (:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte  
 CADJ STORE uvel (:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte  
 CADJ STORE vvel (:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj, key = ikey, byte = isbyte  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
   
 #ifdef ALLOW_AIM  
 C       AIM - atmospheric intermediate model, physics package code.  
 C note(jmc) : phiHyd=0 at this point but is not really used in Molteni Physics  
         IF ( useAIM ) THEN  
          CALL TIMER_START('AIM_DO_ATMOS_PHYS      [DYNAMICS]', myThid)  
          CALL AIM_DO_ATMOS_PHYSICS( phiHyd, myTime, myThid )  
          CALL TIMER_STOP ('AIM_DO_ATMOS_PHYS      [DYNAMICS]', myThid)  
         ENDIF  
 #endif /* ALLOW_AIM */  
   
   
 C--     Start of thermodynamics loop  
         DO k=Nr,1,-1  
   
 C--       km1    Points to level above k (=k-1)  
 C--       kup    Cycles through 1,2 to point to layer above  
 C--       kDown  Cycles through 2,1 to point to current layer  
   
           km1  = MAX(1,k-1)  
           kup  = 1+MOD(k+1,2)  
           kDown= 1+MOD(k,2)  
   
           iMin = 1-OLx+2  
           iMax = sNx+OLx-1  
           jMin = 1-OLy+2  
           jMax = sNy+OLy-1  
   
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 CPatrick Is this formula correct?  
          kkey = (ikey-1)*(Nr-1+1) + (k-1) + 1  
 CADJ STORE rTrans(:,:)       = comlev1_bibj_k, key = kkey, byte = isbyte  
 CADJ STORE KappaRT(:,:,:)    = comlev1_bibj_k, key = kkey, byte = isbyte  
 CADJ STORE KappaRS(:,:,:)    = comlev1_bibj_k, key = kkey, byte = isbyte  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
   
 C--      Get temporary terms used by tendency routines  
          CALL CALC_COMMON_FACTORS (  
      I        bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,km1,kup,kDown,  
      O        xA,yA,uTrans,vTrans,rTrans,maskC,maskUp,  
      I        myThid)  
   
 #ifdef  INCLUDE_CALC_DIFFUSIVITY_CALL  
 C--      Calculate the total vertical diffusivity  
          CALL CALC_DIFFUSIVITY(  
      I        bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,  
      I        maskC,maskup,  
      O        KappaRT,KappaRS,KappaRU,KappaRV,  
      I        myThid)  
 #endif  
   
 C--      Calculate active tracer tendencies (gT,gS,...)  
 C        and step forward storing result in gTnm1, gSnm1, etc.  
          IF ( tempStepping ) THEN  
            CALL CALC_GT(  
      I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax, k,km1,kup,kDown,  
      I         xA,yA,uTrans,vTrans,rTrans,maskUp,maskC,  
      I         KappaRT,  
      U         fVerT,  
      I         myTime, myThid)  
            CALL TIMESTEP_TRACER(  
      I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,  
      I         theta, gT,  
      U         gTnm1,  
      I         myIter, myThid)  
          ENDIF  
          IF ( saltStepping ) THEN  
            CALL CALC_GS(  
      I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax, k,km1,kup,kDown,  
      I         xA,yA,uTrans,vTrans,rTrans,maskUp,maskC,  
      I         KappaRS,  
      U         fVerS,  
      I         myTime, myThid)  
            CALL TIMESTEP_TRACER(  
      I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,  
      I         salt, gS,  
      U         gSnm1,  
      I         myIter, myThid)  
          ENDIF  
   
 #ifdef   ALLOW_OBCS  
 C--      Apply open boundary conditions  
          IF (useOBCS) THEN  
            CALL OBCS_APPLY_TS( bi, bj, k, gTnm1, gSnm1, myThid )  
          END IF  
 #endif   /* ALLOW_OBCS */  
   
 C--      Freeze water  
          IF (allowFreezing) THEN  
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 CADJ STORE gTNm1(:,:,k,bi,bj) = comlev1_bibj_k  
 CADJ &   , key = kkey, byte = isbyte  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
             CALL FREEZE( bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax, k, myThid )  
          END IF  
   
 C--     end of thermodynamic k loop (Nr:1)  
         ENDDO  
   
   
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
 CPatrick? What about this one?  
            maximpl = 6  
            iikey = (ikey-1)*maximpl  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
   
 C--     Implicit diffusion  
         IF (implicitDiffusion) THEN  
   
          IF (tempStepping) THEN  
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
             idkey = iikey + 1  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
             CALL IMPLDIFF(  
      I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,  
      I         deltaTtracer, KappaRT, recip_HFacC,  
      U         gTNm1,  
      I         myThid )  
          ENDIF  
   
          IF (saltStepping) THEN  
 #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC  
          idkey = iikey + 2  
 #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  
             CALL IMPLDIFF(  
      I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,  
      I         deltaTtracer, KappaRS, recip_HFacC,  
      U         gSNm1,  
      I         myThid )  
          ENDIF  
   
 #ifdef   ALLOW_OBCS  
 C--      Apply open boundary conditions  
          IF (useOBCS) THEN  
            DO K=1,Nr  
              CALL OBCS_APPLY_TS( bi, bj, k, gTnm1, gSnm1, myThid )  
            ENDDO  
          END IF  
 #endif   /* ALLOW_OBCS */  
   
 C--     End If implicitDiffusion  
         ENDIF  
   
   
192    
193  C--     Start of dynamics loop  C--     Start of dynamics loop
194          DO k=1,Nr          DO k=1,Nr
# Line 536  C--       kDown  Cycles through 2,1 to p Line 201  C--       kDown  Cycles through 2,1 to p
201            kup  = 1+MOD(k+1,2)            kup  = 1+MOD(k+1,2)
202            kDown= 1+MOD(k,2)            kDown= 1+MOD(k,2)
203    
           iMin = 1-OLx+2  
           iMax = sNx+OLx-1  
           jMin = 1-OLy+2  
           jMax = sNy+OLy-1  
   
204  C--      Integrate hydrostatic balance for phiHyd with BC of  C--      Integrate hydrostatic balance for phiHyd with BC of
205  C        phiHyd(z=0)=0  C        phiHyd(z=0)=0
206  C        distinguishe between Stagger and Non Stagger time stepping  C        distinguishe between Stagger and Non Stagger time stepping
# Line 558  C        distinguishe between Stagger an Line 218  C        distinguishe between Stagger an
218       I        myThid )       I        myThid )
219           ENDIF           ENDIF
220    
221    #ifdef ALLOW_AUTODIFF_TAMC
222    CADJ STORE KappaRT(:,:,k)    = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
223    CADJ STORE KappaRS(:,:,k)    = comlev1_bibj_k, key=kkey, byte=isbyte
224    #endif /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
225    
226    #ifdef  INCLUDE_CALC_DIFFUSIVITY_CALL
227    C--      Calculate the total vertical diffusivity
228             CALL CALC_DIFFUSIVITY(
229         I        bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,
230         I        maskUp,
231         O        KappaRT,KappaRS,KappaRU,KappaRV,
232         I        myThid)
233    #endif
234    
235  C--      Calculate accelerations in the momentum equations (gU, gV, ...)  C--      Calculate accelerations in the momentum equations (gU, gV, ...)
236  C        and step forward storing the result in gUnm1, gVnm1, etc...  C        and step forward storing the result in gUnm1, gVnm1, etc...
237           IF ( momStepping ) THEN           IF ( momStepping ) THEN
# Line 567  C        and step forward storing the re Line 241  C        and step forward storing the re
241       U         fVerU, fVerV,       U         fVerU, fVerV,
242       I         myTime, myThid)       I         myTime, myThid)
243             CALL TIMESTEP(             CALL TIMESTEP(
244       I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,phiHyd,       I         bi,bj,iMin,iMax,jMin,jMax,k,
245         I         phiHyd, phiSurfX, phiSurfY,
246       I         myIter, myThid)       I         myIter, myThid)
247    
248  #ifdef   ALLOW_OBCS  #ifdef   ALLOW_OBCS
# Line 600  C--     Implicit viscosity Line 275  C--     Implicit viscosity
275          IF (implicitViscosity.AND.momStepping) THEN          IF (implicitViscosity.AND.momStepping) THEN
276  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC
277            idkey = iikey + 3            idkey = iikey + 3
278    CADJ STORE gUNm1(:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj , key=ikey, byte=isbyte
279  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
280            CALL IMPLDIFF(            CALL IMPLDIFF(
281       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,
# Line 608  C--     Implicit viscosity Line 284  C--     Implicit viscosity
284       I         myThid )       I         myThid )
285  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC
286            idkey = iikey + 4            idkey = iikey + 4
287    CADJ STORE gVNm1(:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj , key=ikey, byte=isbyte
288  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
289            CALL IMPLDIFF(            CALL IMPLDIFF(
290       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,
# Line 627  C--      Apply open boundary conditions Line 304  C--      Apply open boundary conditions
304  #ifdef    INCLUDE_CD_CODE  #ifdef    INCLUDE_CD_CODE
305  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC
306            idkey = iikey + 5            idkey = iikey + 5
307    CADJ STORE vVelD(:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj , key=ikey, byte=isbyte
308  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
309            CALL IMPLDIFF(            CALL IMPLDIFF(
310       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,
# Line 635  C--      Apply open boundary conditions Line 313  C--      Apply open boundary conditions
313       I         myThid )       I         myThid )
314  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC  #ifdef    ALLOW_AUTODIFF_TAMC
315            idkey = iikey + 6            idkey = iikey + 6
316    CADJ STORE uVelD(:,:,:,bi,bj) = comlev1_bibj , key=ikey, byte=isbyte
317  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */  #endif    /* ALLOW_AUTODIFF_TAMC */
318            CALL IMPLDIFF(            CALL IMPLDIFF(
319       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,       I         bi, bj, iMin, iMax, jMin, jMax,
# Line 653  c         CALL WRITE_FLD_XYZ_RL('PH.',su Line 332  c         CALL WRITE_FLD_XYZ_RL('PH.',su
332  c       ENDIF  c       ENDIF
333  Cjmc(end)  Cjmc(end)
334    
335  #ifdef INCLUDE_DIAGNOSTICS_INTERFACE_CODE  #ifdef ALLOW_TIMEAVE
336          IF (taveFreq.GT.0.) THEN          IF (taveFreq.GT.0.) THEN
337           DO K=1,Nr            CALL TIMEAVE_CUMUL_1T(phiHydtave, phiHyd, Nr,
338            CALL TIMEAVER_1FLD_XYZ(phiHyd, phiHydtave,       I                              deltaTclock, bi, bj, myThid)
      I                              deltaTclock, bi, bj, K, myThid)  
339            IF (ivdc_kappa.NE.0.) THEN            IF (ivdc_kappa.NE.0.) THEN
340              CALL TIMEAVER_1FLD_XYZ(ConvectCount, ConvectCountTave,              CALL TIMEAVE_CUMULATE(ConvectCountTave, ConvectCount, Nr,
341       I                              deltaTclock, bi, bj, K, myThid)       I                              deltaTclock, bi, bj, myThid)
342            ENDIF            ENDIF
          ENDDO  
343          ENDIF          ENDIF
344  #endif /* INCLUDE_DIAGNOSTICS_INTERFACE_CODE */  #endif /* ALLOW_TIMEAVE */
345    
346         ENDDO         ENDDO
347        ENDDO        ENDDO
348    
349    #ifndef EXCLUDE_DEBUGMODE
350          If (debugMode) THEN
351           CALL DEBUG_STATS_RL(1,EtaN,'EtaN (DYNAMICS)',myThid)
352           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,uVel,'Uvel (DYNAMICS)',myThid)
353           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,vVel,'Vvel (DYNAMICS)',myThid)
354           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,wVel,'Wvel (DYNAMICS)',myThid)
355           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,theta,'Theta (DYNAMICS)',myThid)
356           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,salt,'Salt (DYNAMICS)',myThid)
357           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,Gu,'Gu (DYNAMICS)',myThid)
358           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,Gv,'Gv (DYNAMICS)',myThid)
359           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,Gt,'Gt (DYNAMICS)',myThid)
360           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,Gs,'Gs (DYNAMICS)',myThid)
361           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,GuNm1,'GuNm1 (DYNAMICS)',myThid)
362           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,GvNm1,'GvNm1 (DYNAMICS)',myThid)
363           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,GtNm1,'GtNm1 (DYNAMICS)',myThid)
364           CALL DEBUG_STATS_RL(Nr,GsNm1,'GsNm1 (DYNAMICS)',myThid)
365          ENDIF
366    #endif
367    
368        RETURN        RETURN
369        END        END
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