/[MITgcm]/MITgcm/adjoint/makefile
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revision 1.16 by heimbach, Thu Sep 27 20:12:10 2001 UTC revision 1.16.4.22 by dimitri, Sat May 24 20:37:57 2003 UTC
# Line 2  SHELL           = /bin/tcsh Line 2  SHELL           = /bin/tcsh
2  RM               = rm -f  RM               = rm -f
3  LOC              = $(PWD)  LOC              = $(PWD)
4  TAMC             = tamc  TAMC             = tamc
5    ###TAMC             = /data43/ralf/tamc/tamc
6    ###TAF              = taf
7  TAF              = ~fastopt/bin/taf  TAF              = ~fastopt/bin/taf
8  DEST             = .  DEST             = .
9  SOURCE_CODE      = ../bin  SOURCE_CODE      = ../bin
10  ADJOINT_SCRIPT   = ../adjoint  ADJOINT_SCRIPT   = ../adjoint
11  BASE             = ..  BASE             = ..
12  PKG             = $(BASE)/pkg  PKG             = $(BASE)/pkg
13  ADTAMCFLAGS      = -reverse -i4 -r4 -admark  ad  #
14  ADTAFFLAGS       = -reverse -i4 -r4 -admark  ad  ADTAMCFLAGS      = -reverse -admark ad -i4 -r4
15  TLTAMCFLAGS      = -forward -i4 -r4 -ftlmark g_  ADTAFFLAGS       = -reverse -admark ad -i4 -r4 \
16  TLTAFFLAGS       = -forward -i4 -r4 -ftlmark g_                          -l taf_ad.log -flow taf_ad_flow.log -nonew_arg
17  # -warn_step -flow taf_flow.log  FTLTAMCFLAGS     = -forward -ftlmark g_ -i4 -r4
18    FTLTAFFLAGS      = -forward -ftlmark g_ -i4 -r4 \
19                            -l taf_ftl.log -flow taf_ftl_flow.log -nonew_arg
20    SVDTAMCFLAGS     = -reverse -forward -pure -i4 -r4
21    SVDTAFFLAGS      = -reverse -forward -pure -i4 -r4 \
22                            -flow taf_flow.log -nonew_arg
23    #
24    # further useful options: -warn_step -flow taf_flow.log
25    # NB: the svd option recommended in the TAMC manual doesn't work.
26    
27  DIFF_FLAGS       = -toplevel the_main_loop              \  DIFF_FLAGS       = -toplevel the_main_loop              \
28                     -input  '    xx_theta_dummy          \                     -input  '    xx_theta_dummy          \
# Line 22  DIFF_FLAGS       = -toplevel the_main_lo Line 32  DIFF_FLAGS       = -toplevel the_main_lo
32                                  xx_sflux_dummy          \                                  xx_sflux_dummy          \
33                                  xx_tauu_dummy           \                                  xx_tauu_dummy           \
34                                  xx_tauv_dummy           \                                  xx_tauv_dummy           \
35                                  xx_sss_dummy            \                                  xx_atemp_dummy          \
36                                  xx_sst_dummy            \                                  xx_aqh_dummy            \
37                                  xx_diffkr_dummy         \                                  xx_uwind_dummy          \
38                                  xx_kapgm_dummy'         \                                  xx_vwind_dummy          \
39                                    xx_obcsn_dummy          \
40                                    xx_obcss_dummy          \
41                                    xx_obcsw_dummy          \
42                                    xx_obcse_dummy          \
43                                    xx_sst_dummy            \
44                                    xx_sss_dummy            \
45                                    xx_diffkr_dummy         \
46                                    xx_kapgm_dummy          \
47                                    xx_efluxy_dummy         \
48                                    xx_efluxp_dummy'        \
49                     -output 'fc'                     -output 'fc'
50    
51  ADTAMCFLAG         = $(ADTAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS)  ADTAMCFLAG         = $(ADTAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS)
52  ADTAFFLAG          = $(ADTAFFLAGS)  $(DIFF_FLAGS)  ADTAFFLAG          = $(ADTAFFLAGS)  $(DIFF_FLAGS)
53    
54  TLTAMCFLAG         = $(TLTAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS)  FTLTAMCFLAG         = $(FTLTAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS)
55  TLTAFFLAG          = $(TLTAFFLAGS)  $(DIFF_FLAGS)  FTLTAFFLAG          = $(FTLTAFFLAGS)  $(DIFF_FLAGS)
56    
57    SVDTAMCFLAG         = $(SVDTAMCFLAGS) $(DIFF_FLAGS)
58    SVDTAFFLAG          = $(SVDTAFFLAGS)  $(DIFF_FLAGS)
59    
60  # Source files for the MITgcmUV  # Source files for the MITgcmUV
61  SRC_MODEL       = \  SRC_MODEL       = \
62                  $(PKG)/autodiff/read_write.flow \                  $(PKG)/autodiff/read_write.flow \
63                  $(PKG)/autodiff/read_write_fld.flow     \                  $(PKG)/autodiff/read_write_fld.flow     \
64                  $(PKG)/autodiff/read_write_rec.flow     \                  $(PKG)/autodiff/read_write_rec.flow     \
                 $(PKG)/autodiff/diags.flow              \  
65                  $(PKG)/autodiff/cg2d.flow               \                  $(PKG)/autodiff/cg2d.flow               \
66                    $(PKG)/autodiff/diags.flow              \
67                  $(PKG)/autodiff/debug.flow              \                  $(PKG)/autodiff/debug.flow              \
68                    $(PKG)/autodiff/do_the_model_io.flow    \
69                  $(PKG)/autodiff/dummy_in_stepping.flow  \                  $(PKG)/autodiff/dummy_in_stepping.flow  \
                 $(PKG)/autodiff/external_fields_load.flow       \  
70                  $(PKG)/autodiff/eesupp.flow             \                  $(PKG)/autodiff/eesupp.flow             \
71                  $(PKG)/autodiff/active_file.flow        \                  $(PKG)/autodiff/active_file.flow        \
72                  $(PKG)/autodiff/write_state.flow        \                  $(PKG)/autodiff/write_state.flow        \
# Line 56  SRC_MODEL      = \ Line 79  SRC_MODEL      = \
79                  $(PKG)/autodiff/initialisation.flow     \                  $(PKG)/autodiff/initialisation.flow     \
80                  $(PKG)/autodiff/mdsio.flow              \                  $(PKG)/autodiff/mdsio.flow              \
81                  $(PKG)/autodiff/monitor.flow            \                  $(PKG)/autodiff/monitor.flow            \
82                    $(PKG)/autodiff/obcs.flow               \
83                  $(PKG)/autodiff/checkpoint.flow         \                  $(PKG)/autodiff/checkpoint.flow         \
84                  $(PKG)/autodiff/print_message.flow      \                  $(PKG)/autodiff/print_message.flow      \
85                  $(PKG)/autodiff/open_copy_data_file.flow\                  $(PKG)/autodiff/open_copy_data_file.flow\
# Line 73  SRC_MODEL      = \ Line 97  SRC_MODEL      = \
97                  $(SOURCE_CODE)/calc_ivdc.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/calc_ivdc.f                      \
98                  $(SOURCE_CODE)/calc_phi_hyd.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/calc_phi_hyd.f                   \
99                  $(SOURCE_CODE)/calc_viscosity.f                 \                  $(SOURCE_CODE)/calc_viscosity.f                 \
                 $(SOURCE_CODE)/comm_stats.f                     \  
100                  $(SOURCE_CODE)/convect.f                        \                  $(SOURCE_CODE)/convect.f                        \
101                  $(SOURCE_CODE)/convective_adjustment.f          \                  $(SOURCE_CODE)/convective_adjustment.f          \
102                  $(SOURCE_CODE)/convective_adjustment_ini.f      \                  $(SOURCE_CODE)/convective_adjustment_ini.f      \
# Line 81  SRC_MODEL      = \ Line 104  SRC_MODEL      = \
104                  $(SOURCE_CODE)/cycle_tracer.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/cycle_tracer.f                   \
105                  $(SOURCE_CODE)/different_multiple.f             \                  $(SOURCE_CODE)/different_multiple.f             \
106                  $(SOURCE_CODE)/do_fields_blocking_exchanges.f   \                  $(SOURCE_CODE)/do_fields_blocking_exchanges.f   \
                 $(SOURCE_CODE)/do_the_model_io.f                \  
107                  $(SOURCE_CODE)/dynamics.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/dynamics.f                       \
108                  $(SOURCE_CODE)/external_forcing.f               \                  $(SOURCE_CODE)/external_forcing.f               \
109                  $(SOURCE_CODE)/external_forcing_surf.f          \                  $(SOURCE_CODE)/external_forcing_surf.f          \
110                  $(SOURCE_CODE)/find_alpha.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/find_alpha.f                     \
111                  $(SOURCE_CODE)/find_rho.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/find_rho.f                       \
                 $(SOURCE_CODE)/forward_step.f                   \  
112                  $(SOURCE_CODE)/freeze.f                         \                  $(SOURCE_CODE)/freeze.f                         \
113                                                                  \                                                                  \
114                    $(SOURCE_CODE)/calc_grad_phi_hyd.f              \
115                    $(SOURCE_CODE)/comm_stats.f                     \
116                    $(SOURCE_CODE)/convective_weights.f             \
117                    $(SOURCE_CODE)/convectively_mixtracer.f         \
118                    $(SOURCE_CODE)/diags_phi_hyd.f                  \
119                    $(SOURCE_CODE)/diags_phi_rlow.f                 \
120                    $(SOURCE_CODE)/do_stagger_fields_exchanges.f    \
121                    $(SOURCE_CODE)/external_fields_load.f           \
122                    $(SOURCE_CODE)/integr_continuity.f              \
123                                                                    \
124                  $(SOURCE_CODE)/gad_advection.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/gad_advection.f                  \
125                  $(SOURCE_CODE)/gad_biharm_x.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/gad_biharm_x.f                   \
126                  $(SOURCE_CODE)/gad_biharm_y.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/gad_biharm_y.f                   \
# Line 121  SRC_MODEL      = \ Line 152  SRC_MODEL      = \
152                                                                  \                                                                  \
153                  $(SOURCE_CODE)/grad_sigma.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/grad_sigma.f                     \
154                  $(SOURCE_CODE)/impldiff.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/impldiff.f                       \
155                    $(SOURCE_CODE)/ini_autodiff.f                   \
156                  $(SOURCE_CODE)/ini_cartesian_grid.f             \                  $(SOURCE_CODE)/ini_cartesian_grid.f             \
157                  $(SOURCE_CODE)/ini_cg2d.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_cg2d.f                       \
158                  $(SOURCE_CODE)/ini_communication_patterns.f     \                  $(SOURCE_CODE)/ini_communication_patterns.f     \
159                  $(SOURCE_CODE)/ini_cori.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_cori.f                       \
160                  $(SOURCE_CODE)/ini_curvilinear_grid.f           \                  $(SOURCE_CODE)/ini_curvilinear_grid.f           \
161                  $(SOURCE_CODE)/ini_depths.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/ini_depths.f                     \
# Line 135  SRC_MODEL      = \ Line 167  SRC_MODEL      = \
167                  $(SOURCE_CODE)/ini_mixing.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/ini_mixing.f                     \
168                  $(SOURCE_CODE)/ini_p_ground.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/ini_p_ground.f                   \
169                  $(SOURCE_CODE)/ini_pnh.f                        \                  $(SOURCE_CODE)/ini_pnh.f                        \
170                  $(SOURCE_CODE)/ini_procs.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/ini_pressure.f                   \
171                  $(SOURCE_CODE)/ini_psurf.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/ini_psurf.f                      \
172                  $(SOURCE_CODE)/ini_salt.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_salt.f                       \
173                  $(SOURCE_CODE)/ini_spherical_polar_grid.f       \                  $(SOURCE_CODE)/ini_spherical_polar_grid.f       \
# Line 153  SRC_MODEL      = \ Line 185  SRC_MODEL      = \
185                  $(SOURCE_CODE)/mom_vecinv.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/mom_vecinv.f                     \
186                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_hfacz.f                 \                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_hfacz.f                 \
187                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_ke.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_ke.f                    \
188                    $(SOURCE_CODE)/mom_calc_rtrans.f                \
189                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_strain.f                \                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_strain.f                \
190                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_tension.f               \                  $(SOURCE_CODE)/mom_calc_tension.f               \
191                  $(SOURCE_CODE)/mom_cdscheme.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_cdscheme.f                   \
# Line 160  SRC_MODEL      = \ Line 193  SRC_MODEL      = \
193                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_vu.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_vu.f                   \
194                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_wu.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_adv_wu.f                   \
195                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_bottomdrag.f               \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_bottomdrag.f               \
196                    $(SOURCE_CODE)/mom_u_coriolis.f                 \
197                    $(SOURCE_CODE)/mom_u_coriolis_nh.f              \
198                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_del2u.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_del2u.f                    \
199                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_nh.f                \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_nh.f                \
200                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_sphere.f            \                  $(SOURCE_CODE)/mom_u_metric_sphere.f            \
# Line 171  SRC_MODEL      = \ Line 206  SRC_MODEL      = \
206                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_vv.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_vv.f                   \
207                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_wv.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_adv_wv.f                   \
208                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_bottomdrag.f               \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_bottomdrag.f               \
209                    $(SOURCE_CODE)/mom_v_coriolis.f                 \
210                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_del2v.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_del2v.f                    \
211                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_metric_nh.f                \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_metric_nh.f                \
212                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_metric_sphere.f            \                  $(SOURCE_CODE)/mom_v_metric_sphere.f            \
# Line 194  SRC_MODEL      = \ Line 230  SRC_MODEL      = \
230                                                                  \                                                                  \
231                  $(SOURCE_CODE)/packages_init_variables.f        \                  $(SOURCE_CODE)/packages_init_variables.f        \
232                  $(SOURCE_CODE)/plot_field.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/plot_field.f                     \
233                    $(SOURCE_CODE)/pressure_for_eos.f               \
234                    $(SOURCE_CODE)/quasihydrostaticterms.f          \
235                  $(SOURCE_CODE)/solve_for_pressure.f             \                  $(SOURCE_CODE)/solve_for_pressure.f             \
236                  $(SOURCE_CODE)/state_summary.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/state_summary.f                  \
237                  $(SOURCE_CODE)/timestep.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/timestep.f                       \
238                  $(SOURCE_CODE)/the_correction_step.f            \                  $(SOURCE_CODE)/the_correction_step.f            \
                 $(SOURCE_CODE)/the_main_loop.f                  \  
239                  $(SOURCE_CODE)/thermodynamics.f                 \                  $(SOURCE_CODE)/thermodynamics.f                 \
240                  $(SOURCE_CODE)/timestep_tracer.f                \                  $(SOURCE_CODE)/timestep_tracer.f                \
241                  $(SOURCE_CODE)/swfrac.f                         \                  $(SOURCE_CODE)/swfrac.f                         \
242                    $(SOURCE_CODE)/update_etah.f                    \
243                                                                  \                                                                  \
244                  $(SOURCE_CODE)/kpp_calc.f                       \                  $(SOURCE_CODE)/kpp_calc.f                       \
245                  $(SOURCE_CODE)/kpp_calc_diff.f                  \                  $(SOURCE_CODE)/kpp_calc_diff.f                  \
# Line 214  SRC_MODEL      = \ Line 252  SRC_MODEL      = \
252                  $(SOURCE_CODE)/kpp_transport_t.f                \                  $(SOURCE_CODE)/kpp_transport_t.f                \
253                                                                  \                                                                  \
254                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_diff.f               \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_diff.f               \
255                    $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_psi_b.f              \
256                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_tensor.f             \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_tensor.f             \
257                    $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_uvflow.f             \
258                    $(SOURCE_CODE)/gmredi_calc_wflow.f              \
259                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_diags.f                   \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_diags.f                   \
260                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_init.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_init.f                    \
261                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_rtransport.f              \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_rtransport.f              \
262                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_slope_limit.f             \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_slope_limit.f             \
263                    $(SOURCE_CODE)/gmredi_slope_psi.f               \
264                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_xtransport.f              \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_xtransport.f              \
265                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_ytransport.f              \                  $(SOURCE_CODE)/gmredi_ytransport.f              \
266                                                                  \                                                                  \
                 $(SOURCE_CODE)/ctrl_map_ini.f                   \  
                 $(SOURCE_CODE)/ctrl_map_forcing.f               \  
267                                                                  \                                                                  \
268                    $(SOURCE_CODE)/cost_aqh.f                       \
269                    $(SOURCE_CODE)/cost_argo_salt.f                 \
270                    $(SOURCE_CODE)/cost_argo_theta.f                \
271                    $(SOURCE_CODE)/cost_atemp.f                     \
272                    $(SOURCE_CODE)/cost_atlantic.f                  \
273                    $(SOURCE_CODE)/cost_averagesfields.f            \
274                    $(SOURCE_CODE)/cost_averagesfinal.f             \
275                    $(SOURCE_CODE)/cost_averagesflags.f             \
276                    $(SOURCE_CODE)/cost_averagesinit.f              \
277                    $(SOURCE_CODE)/cost_ctds.f                      \
278                    $(SOURCE_CODE)/cost_ctdt.f                      \
279                    $(SOURCE_CODE)/cost_drift.f                     \
280                    $(SOURCE_CODE)/cost_drifter.f                   \
281                    $(SOURCE_CODE)/cost_driftw.f                    \
282                  $(SOURCE_CODE)/cost_final.f                     \                  $(SOURCE_CODE)/cost_final.f                     \
283                  $(SOURCE_CODE)/cost_init.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/cost_forcing.f                   \
284                  $(SOURCE_CODE)/cost_tile.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/cost_geoid.f                     \
285                  $(SOURCE_CODE)/cost_test.f                      \                  $(SOURCE_CODE)/cost_heatflux.f                  \
286                  $(SOURCE_CODE)/cost_tracer.f                    \                  $(SOURCE_CODE)/cost_hyd.f                       \
287                    $(SOURCE_CODE)/cost_initvaria.f                 \
288                    $(SOURCE_CODE)/cost_mean_heatflux.f             \
289                    $(SOURCE_CODE)/cost_mean_saltflux.f             \
290                    $(SOURCE_CODE)/cost_merstress.f                 \
291                    $(SOURCE_CODE)/cost_readers.f                   \
292                    $(SOURCE_CODE)/cost_readsssfields.f             \
293                    $(SOURCE_CODE)/cost_readsstfields.f             \
294                    $(SOURCE_CODE)/cost_readscatxfields.f           \
295                    $(SOURCE_CODE)/cost_readscatyfields.f           \
296                    $(SOURCE_CODE)/cost_readtopex.f                 \
297                    $(SOURCE_CODE)/cost_readtopexmean.f             \
298                    $(SOURCE_CODE)/cost_salt.f                      \
299                    $(SOURCE_CODE)/cost_salt0.f                     \
300                    $(SOURCE_CODE)/cost_saltflux.f                  \
301                    $(SOURCE_CODE)/cost_scat.f                      \
302                    $(SOURCE_CODE)/cost_ssh.f                       \
303                    $(SOURCE_CODE)/cost_ssh_mean.f                  \
304                    $(SOURCE_CODE)/cost_sss.f                       \
305                    $(SOURCE_CODE)/cost_sst.f                       \
306                    $(SOURCE_CODE)/cost_theta.f                     \
307                    $(SOURCE_CODE)/cost_theta0.f                    \
308                    $(SOURCE_CODE)/cost_uwind.f                     \
309                    $(SOURCE_CODE)/cost_vwind.f                     \
310                    $(SOURCE_CODE)/cost_xbt.f                       \
311                    $(SOURCE_CODE)/cost_zonstress.f                 \
312                    $(SOURCE_CODE)/cost_obcs.f                      \
313                    $(SOURCE_CODE)/cost_obcsn.f                     \
314                    $(SOURCE_CODE)/cost_obcss.f                     \
315                    $(SOURCE_CODE)/cost_obcsw.f                     \
316                    $(SOURCE_CODE)/cost_obcse.f                     \
317                    $(SOURCE_CODE)/cost_theta_ini_fin.f             \
318                    $(SOURCE_CODE)/cost_salt_ini_fin.f              \
319                    $(SOURCE_CODE)/cost_ice.f                       \
320                    $(SOURCE_CODE)/sw_ptmp.f                        \
321                    $(SOURCE_CODE)/sw_adtg.f                        \
322                                                                  \                                                                  \
323                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getheatflux.f               \
324                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getsaltflux.f               \
325                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getzonstress.f              \
326                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getmerstress.f              \
327                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getatemp.f                  \
328                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getaqh.f                    \
329                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getuwind.f                  \
330                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getvwind.f                  \
331                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getobcsn.f                  \
332                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getobcss.f                  \
333                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getobcsw.f                  \
334                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getobcse.f                  \
335                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_getrec.f                    \
336                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_init_variables.f            \
337                    $(SOURCE_CODE)/ctrl_map.f                       \
338                                                                    \
339                    $(SOURCE_CODE)/ecco_init.f                      \
340                    $(SOURCE_CODE)/ecco_the_main_loop.f             \
341                                                                    \
342                    $(SOURCE_CODE)/exf_init.f                       \
343                    $(SOURCE_CODE)/exf_init_runoff.f                \
344                    $(SOURCE_CODE)/exf_readparms.f                  \
345                    $(SOURCE_CODE)/exf_summary.f                    \
346                    $(SOURCE_CODE)/exf_bulkformulae.f               \
347                    $(SOURCE_CODE)/exf_bulkcdn.f                    \
348                    $(SOURCE_CODE)/exf_bulkqsat.f                   \
349                    $(SOURCE_CODE)/exf_bulkrhn.f                    \
350                    $(SOURCE_CODE)/exf_getffields.f                 \
351                    $(SOURCE_CODE)/exf_getffieldrec.f               \
352                    $(SOURCE_CODE)/exf_getforcing.f                 \
353                    $(SOURCE_CODE)/exf_mapfields.f                  \
354                    $(SOURCE_CODE)/exf_getobcs.f                    \
355                    $(SOURCE_CODE)/exf_getsurfacefluxes.f           \
356                    $(SOURCE_CODE)/exf_swapffields.f                \
357                    $(SOURCE_CODE)/exf_filter_rl.f                  \
358                    $(SOURCE_CODE)/exf_filter_rs.f                  \
359                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_gen.f                    \
360                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_obcs.f                   \
361                                                                    \
362                    $(SOURCE_CODE)/exf_clim_init.f                  \
363                    $(SOURCE_CODE)/exf_clim_readparms.f             \
364                    $(SOURCE_CODE)/exf_clim_summary.f               \
365                    $(SOURCE_CODE)/exf_getclim.f                    \
366                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_climsalt.f               \
367                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_climtemp.f               \
368                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_climsss.f                \
369                    $(SOURCE_CODE)/exf_set_climsst.f                \
370                                                                    \
371                    $(SOURCE_CODE)/cal_addtime.f                    \
372                    $(SOURCE_CODE)/cal_checkdate.f                  \
373                    $(SOURCE_CODE)/cal_compdates.f                  \
374                    $(SOURCE_CODE)/cal_convdate.f                   \
375                    $(SOURCE_CODE)/cal_copydate.f                   \
376                    $(SOURCE_CODE)/cal_daysformonth.f               \
377                    $(SOURCE_CODE)/cal_dayspermonth.f               \
378                    $(SOURCE_CODE)/cal_fulldate.f                   \
379                    $(SOURCE_CODE)/cal_getdate.f                    \
380                    $(SOURCE_CODE)/cal_getmonthsrec.f               \
381                    $(SOURCE_CODE)/cal_intdays.f                    \
382                    $(SOURCE_CODE)/cal_intmonths.f                  \
383                    $(SOURCE_CODE)/cal_intsteps.f                   \
384                    $(SOURCE_CODE)/cal_intyears.f                   \
385                    $(SOURCE_CODE)/cal_isleap.f                     \
386                    $(SOURCE_CODE)/cal_monthsforyear.f              \
387                    $(SOURCE_CODE)/cal_monthsperyear.f              \
388                    $(SOURCE_CODE)/cal_nstepday.f                   \
389                    $(SOURCE_CODE)/cal_numints.f                    \
390                    $(SOURCE_CODE)/cal_printdate.f                  \
391                    $(SOURCE_CODE)/cal_printerror.f                 \
392                    $(SOURCE_CODE)/cal_stepsforday.f                \
393                    $(SOURCE_CODE)/cal_stepsperday.f                \
394                    $(SOURCE_CODE)/cal_subdates.f                   \
395                    $(SOURCE_CODE)/cal_timeinterval.f               \
396                    $(SOURCE_CODE)/cal_timepassed.f                 \
397                    $(SOURCE_CODE)/cal_timestamp.f                  \
398                    $(SOURCE_CODE)/cal_toseconds.f                  \
399                    $(SOURCE_CODE)/cal_weekday.f                    \
400    
401    
402    #               $(SOURCE_CODE)/obcs_apply_sloc.f                \
403    #               $(SOURCE_CODE)/obcs_apply_tloc.f                \
404    #               $(SOURCE_CODE)/obcs_apply_ts.f                  \
405    #               $(SOURCE_CODE)/obcs_apply_uv.f                  \
406    #               $(SOURCE_CODE)/obcs_calc.f                      \
407    #               $(SOURCE_CODE)/obcs_init_variables.f            \
408    #               $(SOURCE_CODE)/obcs_sponge.f                    \
409    
410    #               $(SOURCE_CODE)/adi.f                            \
411    #               $(SOURCE_CODE)/lsr.f                            \
412    #               $(SOURCE_CODE)/advect.f                         \
413    #               $(SOURCE_CODE)/budget.f                         \
414    #               $(SOURCE_CODE)/diffus.f                         \
415    #               $(SOURCE_CODE)/dynsolver.f                      \
416    #               $(SOURCE_CODE)/groatb.f                         \
417    #               $(SOURCE_CODE)/growth.f                         \
418    #               $(SOURCE_CODE)/ostres.f                         \
419    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_check.f                   \
420    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_do_diags.f                \
421    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_get_forcing.f             \
422    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_init.f                    \
423    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_model.f                   \
424    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_pickup.f                  \
425    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_readparms.f               \
426    #               $(SOURCE_CODE)/seaice_exch.f
427    
428  #--------------------------------------------------------  #--------------------------------------------------------
429  # rules  # rules
430  #--------------------------------------------------------  #--------------------------------------------------------
431    
432    small_f:
433            cd $(SOURCE_CODE); $(MAKE) depend; $(MAKE) small_f
434    
435  allcode:  allcode:
436          cd $(DEST) ; cat $(SRC_MODEL) >! tamc_code_ecco.f          cd $(DEST) ; cat $(SRC_MODEL) >! tamc_code_ecco.f
437    
# Line 247  admodeltamc: Line 442  admodeltamc:
442  admodeltaf:  admodeltaf:
443          cd $(DEST) ; $(TAF) $(ADTAFFLAG) tamc_code_ecco.f          cd $(DEST) ; $(TAF) $(ADTAFFLAG) tamc_code_ecco.f
444    
445  tlmodeltamc:  ftlmodeltamc:
446          cd $(DEST) ; $(TAMC) $(TLTAMCFLAG) tamc_code_ecco.f     \          cd $(DEST) ; $(TAMC) $(FTLTAMCFLAG) tamc_code_ecco.f    \
447             >! tamc_code_ecco_tl.prot             >! tamc_code_ecco_ftl.prot
448    
449  tlmodeltaf:  ftlmodeltaf:
450          cd $(DEST) ; $(TAF) $(TLTAFFLAG) tamc_code_ecco.f          cd $(DEST) ; $(TAF) $(FTLTAFFLAG) tamc_code_ecco.f
451    
452    svdmodeltaf:
453            cd $(DEST) ; $(TAF) $(SVDTAFFLAG) tamc_code_ecco.f
454    
455  adchange:  adchange:
456          ${ADJOINT_SCRIPT}/adjoint_ecco_sed.com \          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_template     \
457             >! tamc_code_ecco_sed_ad.f ;  \             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F ;            \
458            ${ADJOINT_SCRIPT}/adjoint_sed.com               \
459               >! tamc_code_ecco_sed_ad.f ;                         \
460          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F              \          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F              \
461             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_old ;        \             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_old ;        \
462          cat tamc_code_ecco_sed_ad.f >> $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F          cat tamc_code_ecco_sed_ad.f >> $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F
463    
464    ftlchange:
465            cp $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F_template       \
466               $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F ;              \
467            cp $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F                \
468               $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F_old ;          \
469            cat tamc_code_ecco_ftl.f >> $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F
470    
471    bothchange:   adchange ftlchange
472    
473  adrestore:  adrestore:
474          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_template     \          cp $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F_template     \
475             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F             $(PKG)/autodiff/adjoint_model.F
476    
477  tltamc:  allcode tlmodeltamc  ftlrestore:
478            cp $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F_template       \
479               $(PKG)/autodiff/tangentlinear_model.F
480    
481    bothrestore: adrestore ftlrestore
482    
483    adtamc:  adrestore ftlrestore small_f allcode admodeltamc
484    
485    adtaf:  adrestore ftlrestore small_f allcode admodeltaf
486    
487    ftltamc:  adrestore ftlrestore small_f allcode ftlmodeltamc
488    
489    ftltaf:  adrestore ftlrestore small_f allcode ftlmodeltaf
490    
491  tltaf:  allcode tlmodeltaf  bothtaf:  bothrestore small_f allcode admodeltaf ftlmodeltaf
492    
493  adtamc:  adrestore allcode admodeltamc  svdtaf:  adrestore ftlrestore small_f allcode svdmodeltaf
494    
 adtaf:  adrestore allcode admodeltaf  
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